RHOU

RHOU
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Q3H
Ідентифікатори
Символи	RHOU, ARHU, CDC42L1, G28K, WRCH1, hG28K, ras homolog family member U
Зовнішні ІД	OMIM: 606366 MGI: 1916831 HomoloGene: 49663 GeneCards: RHOU
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • focal adhesion • Golgi membrane • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • podosome • внутрішньоклітинний Біологічний процес • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • Rac protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • actin cytoskeleton organization • small GTPase mediated signal transduction • G1/S transition of mitotic cell cycle • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58480	69581
Ensembl	ENSG00000116574	ENSMUSG00000039960
UniProt	Q7L0Q8	Q9EQT3
RefSeq (мРНК)	NM_021205	NM_133955
RefSeq (білок)	NP_067028 NP_067028.1	NP_598716
Локус (UCSC)	Хр. 1: 228.74 – 228.75 Mb	Хр. 8: 124.38 – 124.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RHOU (англ. Ras homolog family member U) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 28 218.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPPQQGDPAF		PDRCEAPPVP		PRRERGGRGG		RGPGEPGGRG		RAGGAEGRGV
KCVLVGDGAV		GKTSLVVSYT		TNGYPTEYIP		TAFDNFSAVV		SVDGRPVRLQ
LCDTAGQDEF		DKLRPLCYTN		TDIFLLCFSV		VSPSSFQNVS		EKWVPEIRCH
CPKAPIILVG		TQSDLREDVK		VLIELDKCKE		KPVPEEAAKL		CAEEIKAASY
IECSALTQKN		LKEVFDAAIV		AGIQYSDTQQ		QPKKSKSRTP		DKMKNLSKSW
WKKYCCFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, апараті гольджі.

Література

• Tao W., Pennica D., Xu L., Kalejta R.F., Levine A.J. (2001). Wrch-1, a novel member of the Rho gene family that is regulated by Wnt-1. Genes Dev. 15: 1796—1807. PMID 11459829 DOI:10.1101/gad.894301
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shutes A., Berzat A.C., Chenette E.J., Cox A.D., Der C.J. (2006). Biochemical analyses of the Wrch atypical Rho family GTPases. Methods Enzymol. 406: 11—26. PMID 16472646 DOI:10.1016/S0076-6879(06)06002-2
• Ory S., Brazier H., Blangy A. (2007). Identification of a bipartite focal adhesion localization signal in RhoU/Wrch-1, a Rho family GTPase that regulates cell adhesion and migration. Biol. Cell. 99: 701—716. PMID 17620058 DOI:10.1042/BC20070058
• Ruusala A., Aspenstrom P. (2008). The atypical Rho GTPase Wrch1 collaborates with the nonreceptor tyrosine kinases Pyk2 and Src in regulating cytoskeletal dynamics. Mol. Cell. Biol. 28: 1802—1814. PMID 18086875 DOI:10.1128/MCB.00201-07
• Naji L., Pacholsky D., Aspenstrom P. (2011). ARHGAP30 is a Wrch-1-interacting protein involved in actin dynamics and cell adhesion. Biochem. Biophys. Res. Commun. 409: 96—102. PMID 21565175 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.04.116

Див. також

• Хромосома 1