POP1

POP1
Ідентифікатори
Символи	POP1, POP1 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, ANXD2
Зовнішні ІД	OMIM: 602486 MGI: 1914974 HomoloGene: 41000 GeneCards: POP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ribonuclease P activity • hydrolase activity • ribonuclease MRP activity • RNA binding Клітинна компонента • nucleolar ribonuclease P complex • клітинне ядро • ribonuclease MRP complex • нуклеоплазма • міжклітинний простір • ядерце • мітохондрія • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • multimeric ribonuclease P complex Біологічний процес • tRNA catabolic process • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA processing • tRNA 5'-leader removal Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10940	67724
Ensembl	ENSG00000104356	ENSMUSG00000022325
UniProt	Q99575 Q96F88	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001145860 NM_001145861 NM_015029	NM_026340 NM_152894
RefSeq (білок)	NP_001139332 NP_001139333 NP_055844 NP_055844.2	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 8: 98.12 – 98.16 Mb	Хр. 15: 34.5 – 34.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POP1 (англ. POP1 homolog, ribonuclease P/MRP subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 114 709.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSNAKERKHA		KKMRNQPTNV		TLSSGFVADR		GVKHHSGGEK		PFQAQKQEPH
PGTSRQRQTR		VNPHSLPDPE		VNEQSSSKGM		FRKKGGWKAG		PEGTSQEIPK
YITASTFAQA		RAAEISAMLK		AVTQKSSNSL		VFQTLPRHMR		RRAMSHNVKR
LPRRLQEIAQ		KEAEKAVHQK		KEHSKNKCHK		ARRCHMNRTL		EFNRRQKKNI
WLETHIWHAK		RFHMVKKWGY		CLGERPTVKS		HRACYRAMTN		RCLLQDLSYY
CCLELKGKEE		EILKALSGMC		NIDTGLTFAA		VHCLSGKRQG		SLVLYRVNKY
PREMLGPVTF		IWKSQRTPGD		PSESRQLWIW		LHPTLKQDIL		EEIKAACQCV
EPIKSAVCIA		DPLPTPSQEK		SQTELPDEKI		GKKRKRKDDG		ENAKPIKKII
GDGTRDPCLP		YSWISPTTGI		IISDLTMEMN		RFRLIGPLSH		SILTEAIKAA
SVHTVGEDTE		ETPHRWWIET		CKKPDSVSLH		CRQEAIFELL		GGITSPAEIP
AGTILGLTVG		DPRINLPQKK		SKALPNPEKC		QDNEKVRQLL		LEGVPVECTH
SFIWNQDICK		SVTENKISDQ		DLNRMRSELL		VPGSQLILGP		HESKIPILLI
QQPGKVTGED		RLGWGSGWDV		LLPKGWGMAF		WIPFIYRGVR		VGGLKESAVH
SQYKRSPNVP		GDFPDCPAGM		LFAEEQAKNL		LEKYKRRPPA		KRPNYVKLGT
LAPFCCPWEQ		LTQDWESRVQ		AYEEPSVASS		PNGKESDLRR		SEVPCAPMPK
KTHQPSDEVG		TSIEHPREAE		EVMDAGCQES		AGPERITDQE		ASENHVAATG
SHLCVLRSRK		LLKQLSAWCG		PSSEDSRGGR		RAPGRGQQGL		TREACLSILG
HFPRALVWVS		LSLLSKGSPE		PHTMICVPAK		EDFLQLHEDW		HYCGPQESKH
SDPFRSKILK		QKEKKKREKR		QKPGRASSDG		PAGEEPVAGQ		EALTLGLWSG
PLPRVTLHCS		RTLLGFVTQG		DFSMAVGCGE		ALGFVSLTGL		LDMLSSQPAA
QRGLVLLRPP		ASLQYRFARI		AIEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг тРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lygerou Z., Pluk H., Van Venrooij W.J., Seraphin B. (1996). hPop1: an autoantigenic protein subunit shared by the human RNase P and RNase MRP ribonucleoproteins. EMBO J. 15: 5936—5948. PMID 8918471

Див. також

• Хромосома 8