PDXK

PDXK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AJP, 2F7K, 2YXT, 2YXU, 3FHX, 3FHY, 3KEU, 4EN4, 4EOH
Ідентифікатори
Символи	PDXK, C21orf124, C21orf97, HEL-S-1a, PKH, PNK, PRED79, pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) kinase, pyridoxal kinase, HMSN6C
Зовнішні ІД	OMIM: 179020 MGI: 1351869 HomoloGene: 2731 GeneCards: PDXK
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein homodimerization activity • pyridoxal kinase activity • zinc ion binding • potassium ion binding • sodium ion binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • lithium ion binding • pyridoxal phosphate binding • ATP binding • magnesium ion binding Клітинна компонента • гіалоплазма • екзосома • клітинне ядро • extracellular region • цитоплазма • secretory granule lumen • specific granule lumen • нуклеоплазма Біологічний процес • pyridoxal phosphate biosynthetic process • фосфорилювання • pyridoxal 5'-phosphate salvage • проліферація • neutrophil degranulation • vitamin B6 metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8566	216134
Ensembl	ENSG00000160209	ENSMUSG00000032788
UniProt	O00764	Q8K183
RefSeq (мРНК)	NM_003681 NM_021941 NM_001331030	NM_172134
RefSeq (білок)	NP_001317959 NP_003672	NP_742146
Локус (UCSC)	Хр. 21: 43.72 – 43.76 Mb	Хр. 10: 78.27 – 78.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDXK (англ. Pyridoxal kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 312 амінокислот, а молекулярна маса — 35 102.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEECRVLSI		QSHVIRGYVG		NRAATFPLQV		LGFEIDAVNS		VQFSNHTGYA
HWKGQVLNSD		ELQELYEGLR		LNNMNKYDYV		LTGYTRDKSF		LAMVVDIVQE
LKQQNPRLVY		VCDPVLGDKW		DGEGSMYVPE		DLLPVYKEKV		VPLADIITPN
QFEAELLSGR		KIHSQEEALR		VMDMLHSMGP		DTVVITSSDL		PSPQGSNYLI
VLGSQRRRNP		AGSVVMERIR		MDIRKVDAVF		VGTGDLFAAM		LLAWTHKHPN
NLKVACEKTV		STLHHVLQRT		IQCAKAQAGE		GVRPSPMQLE		LRMVQSKRDI
EDPEIVVQAT		VL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Hanna M.C., Turner A.J., Kirkness E.F. (1997). Human pyridoxal kinase. cDNA cloning, expression, and modulation by ligands of the benzodiazepine receptor. J. Biol. Chem. 272: 10756—10760. PMID 9099727 DOI:10.1074/jbc.272.16.10756
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee H.-S., Moon B.J., Choi S.Y., Kwon O.-S. (2000). Human pyridoxal kinase: overexpression and properties of the recombinant enzyme. Mol. Cells. 10: 452—459. PMID 10987144

Див. також

• Хромосома 21