PDGFA

PDGFA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MJK
Ідентифікатори
Символи	PDGFA, PDGF-A, PDGF1, platelet derived growth factor subunit A
Зовнішні ІД	OMIM: 173430 MGI: 97527 HomoloGene: 32055 GeneCards: PDGFA
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • protein homodimerization activity • platelet-derived growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • platelet-derived growth factor binding • protein heterodimerization activity • growth factor activity • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity • identical protein binding Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • Golgi membrane • extracellular region • Мікроворсинки • cell surface • platelet alpha granule lumen • міжклітинний простір • Golgi lumen Біологічний процес • hair follicle development • embryonic lung development • positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration by platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • negative chemotaxis • regulation of actin cytoskeleton organization • positive regulation of MAP kinase activity • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis by epithelial-mesenchymal signaling • positive regulation of cell migration • positive regulation of fibroblast proliferation • cell-cell signaling • platelet degranulation • extracellular matrix organization • regulation of DNA biosynthetic process • cell activation • MAPK cascade • negative regulation of platelet activation • multicellular organism development • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • response to wounding • cell projection assembly • negative regulation of phosphatidylinositol biosynthetic process • Ангіогенез • positive regulation of protein autophosphorylation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of smooth muscle cell migration • animal organ morphogenesis • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • lung alveolus development • positive regulation of cell division • actin cytoskeleton organization • positive regulation of MAPK cascade • skin development • regulation of glomerular mesangial cell proliferation • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • Загоєння ран • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • positive regulation of cell population proliferation • regulation of signaling receptor activity • positive regulation of protein kinase B signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5154	18590
Ensembl	ENSG00000197461	ENSMUSG00000025856
UniProt	P04085	P20033
RefSeq (мРНК)	NM_002607 NM_033023 NM_001395363 NM_001395364 NM_001395365 NM_001395366	NM_008808 NM_001363271
RefSeq (білок)	NP_002598 NP_148983	NP_032834 NP_001350200
Локус (UCSC)	Хр. 7: 0.5 – 0.52 Mb	Хр. 5: 138.96 – 138.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDGFA (англ. Platelet derived growth factor subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 043.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTLACLLLL		GCGYLAHVLA		EEAEIPREVI		ERLARSQIHS		IRDLQRLLEI
DSVGSEDSLD		TSLRAHGVHA		TKHVPEKRPL		PIRRKRSIEE		AVPAVCKTRT
VIYEIPRSQV		DPTSANFLIW		PPCVEVKRCT		GCCNTSSVKC		QPSRVHHRSV
KVAKVEYVRK		KPKLKEVQVR		LEEHLECACA		TTSLNPDYRE		EDTGRPRESG
KKRKRKRLKP		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Bonthron D.T., Morton C.C., Orkin S.H., Collins T. (1988). Platelet-derived growth factor A chain: gene structure, chromosomal location, and basis for alternative mRNA splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 1492—1496. PMID 3422746 DOI:10.1073/pnas.85.5.1492
• Rorsman F., Bywater M., Knott T.J., Scott J., Betsholtz C. (1988). Structural characterization of the human platelet-derived growth factor A-chain cDNA and gene: alternative exon usage predicts two different precursor proteins. Mol. Cell. Biol. 8: 571—577. PMID 2832727 DOI:10.1128/MCB.8.2.571
• Hoppe J., Schumacher L., Eichner W., Weich H.A. (1987). The long 3'-untranslated regions of the PDGF-A and -B mRNAs are only distantly related. FEBS Lett. 223: 243—246. PMID 3666150 DOI:10.1016/0014-5793(87)80297-1
• Bonthron D., Collins T., Grzeschik K.H., van Roy N., Speleman F. (1992). Platelet-derived growth factor A chain: confirmation of localization of PDGFA to chromosome 7p22 and description of an unusual minisatellite. Genomics. 13: 257—263. PMID 1612586 DOI:10.1016/0888-7543(92)90240-S
• Collins T., Bonthron D.T., Orkin S.H. (1987). Alternative RNA splicing affects function of encoded platelet-derived growth factor A chain. Nature. 328: 621—624. PMID 3614364 DOI:10.1038/328621a0
• Goretzki L., Burg M.A., Grako K.A., Stallcup W.B. (1999). High-affinity binding of basic fibroblast growth factor and platelet-derived growth factor-AA to the core protein of the NG2 proteoglycan. J. Biol. Chem. 274: 16831—16837. PMID 10358027 DOI:10.1074/jbc.274.24.16831

Див. також

• Хромосома 7