PDE12

PDE12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4Z0V, 4Z2B, 4ZKF
Ідентифікатори
Символи	PDE12, 2'-PDE, 2-PDE, phosphodiesterase 12
Зовнішні ІД	OMIM: 616519 MGI: 2443226 HomoloGene: 14272 GeneCards: PDE12
шифр КФ	3.1.13.4
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A)-specific ribonuclease activity • nuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • 3'-5'-exoribonuclease activity • exonuclease activity • oligoribonucleotidase activity Клітинна компонента • мітохондрія • мітохондріальний матрикс • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA processing • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • mitochondrial mRNA catabolic process • cellular response to interferon-alpha • regulation of mitochondrial mRNA stability • positive regulation of viral genome replication • negative regulation of cell death • cellular response to interferon-gamma • cellular response to dsRNA • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • negative regulation of oxidative phosphorylation • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	201626	211948
Ensembl	ENSG00000174840	ENSMUSG00000043702
UniProt	Q6L8Q7	Q3TIU4
RefSeq (мРНК)	NM_177966 NM_001322176 NM_001322177	NM_178668
RefSeq (білок)	NP_001309105 NP_001309106 NP_808881	NP_848783
Локус (UCSC)	Хр. 3: 57.56 – 57.57 Mb	Хр. 14: 26.38 – 26.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDE12 (англ. Phosphodiesterase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 609 амінокислот, а молекулярна маса — 67 352.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWRLPGARAA		LRVIRTAVEK		LSRAEAGSQT		AAGAMERAVV		RCVPSEPKLS
LSFALADGSH		KNMQRDQSEP		LGRVLSRIAT		NALKGHAKAA		AAKKSRKSRP
NASGGAACSG		PGPEPAVFCE		PVVKLYYREE		AVAEDVLNVD		AWQDGAVLQI
GDVKYKVERN		PPAFTELQLP		RYIMAGFPVC		PKLSLEFGDP		ASSLFRWYKE
AKPGAAEPEV		GVPSSLSPSS		PSSSWTETDV		EERVYTPSNA		DIGLRLKLHC
TPGDGQRFGH		SRELESVCVV		EAGPGTCTFD		HRHLYTKKVT		EDALIRTVSY
NILADTYAQT		EFSRTVLYPY		CAPYALELDY		RQNLIQKELT		GYNADVICLQ
EVDRAVFSDS		LVPALEAFGL		EGVFRIKQHE		GLATFYRKSK		FSLLSQHDIS
FYEALESDPL		HKELLEKLVL		YPSAQEKVLQ		RSSVLQVSVL		QSTKDSSKRI
CVANTHLYWH		PKGGYIRLIQ		MAVALAHIRH		VSCDLYPGIP		VIFCGDFNST
PSTGMYHFVI		NGSIPEDHED		WASNGEEERC		NMSLTHFFKL		KSACGEPAYT
NYVGGFHGCL		DYIFIDLNAL		EVEQVIPLPS		HEEVTTHQAL		PSVSHPSDHI
ALVCDLKWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Rorbach J., Nicholls T.J., Minczuk M. (2011). PDE12 removes mitochondrial RNA poly(A) tails and controls translation in human mitochondria. Nucleic Acids Res. 39: 7750—7763. PMID 21666256 DOI:10.1093/nar/gkr470

Див. також

• Хромосома 3