LCK

LCK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: E9PI33 PDBe E9PI33 RCSB Список кодів PDB 1BHF, 1BHH, 1CWD, 1CWE, 1FBZ, 1H92, 1IJR, 1KIK, 1LCJ, 1LCK, 1LKK, 1LKL, 1Q68, 1Q69, 1QPC, 1QPD, 1QPE, 1QPJ, 1X27, 2IIM, 2OF2, 2OF4, 2OFU, 2OFV, 2OG8, 2PL0, 2ZM1, 2ZM4, 2ZYB, 3AC1, 3AC2, 3AC3, 3AC4, 3AC5, 3AC8, 3ACJ, 3ACK, 3AD4, 3AD5, 3AD6, 3B2W, 3BRH, 3BYM, 3BYO, 3BYS, 3BYU, 3KMM, 3KXZ, 3LCK, 3MPM, 4D8K, 4C3F
Ідентифікатори
Символи	LCK, LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, IMD22, LSK, YT16, p56lck, pp58lck
Зовнішні ІД	OMIM: 153390 MGI: 96756 HomoloGene: 3911 GeneCards: LCK
Пов'язані генетичні захворювання
severe combined immunodeficiency due to LCK deficiency
Реагує на сполуку
saracatinib, SU6656
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • CD4 receptor binding • ATPase binding • SH2 domain binding • CD8 receptor binding • phosphatidylinositol 3-kinase binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein phosphatase binding • ATP binding • protein kinase binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine phosphatase activity • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity • phosphotyrosine residue binding • protein tyrosine kinase activity • T cell receptor binding • signaling receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • immunological synapse • екзосома • pericentriolar material • membrane raft • клітинна мембрана Біологічний процес • B cell receptor signaling pathway • release of sequestered calcium ion into cytosol • кровотворення • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of T cell receptor signaling pathway • T cell costimulation • GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus • platelet activation • T cell differentiation • regulation of cell population proliferation • cellular zinc ion homeostasis • regulation of lymphocyte activation • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • leukocyte migration • positive regulation of T cell activation • GO:0016576 protein dephosphorylation • вроджений імунітет • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • GO:0022415 viral process • protein phosphorylation • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cell migration • peptidyl-tyrosine phosphorylation • interleukin-7-mediated signaling pathway • positive regulation of protein kinase B signaling • диференціація клітин • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3932	16818
Ensembl	ENSG00000182866	ENSMUSG00000000409
UniProt	P06239	P06240
RefSeq (мРНК)	NM_001042771 NM_005356 NM_001330468	NM_001162432 NM_001162433 NM_010693
RefSeq (білок)	NP_001036236 NP_001317397 NP_005347	NP_001155904 NP_001155905 NP_034823
Локус (UCSC)	Хр. 1: 32.25 – 32.29 Mb	Хр. 4: 129.44 – 129.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LCK (англ. LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 001.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCGCSSHPE		DDWMENIDVC		ENCHYPIVPL		DGKGTLLIRN		GSEVRDPLVT
YEGSNPPASP		LQDNLVIALH		SYEPSHDGDL		GFEKGEQLRI		LEQSGEWWKA
QSLTTGQEGF		IPFNFVAKAN		SLEPEPWFFK		NLSRKDAERQ		LLAPGNTHGS
FLIRESESTA		GSFSLSVRDF		DQNQGEVVKH		YKIRNLDNGG		FYISPRITFP
GLHELVRHYT		NASDGLCTRL		SRPCQTQKPQ		KPWWEDEWEV		PRETLKLVER
LGAGQFGEVW		MGYYNGHTKV		AVKSLKQGSM		SPDAFLAEAN		LMKQLQHQRL
VRLYAVVTQE		PIYIITEYME		NGSLVDFLKT		PSGIKLTINK		LLDMAAQIAE
GMAFIEERNY		IHRDLRAANI		LVSDTLSCKI		ADFGLARLIE		DNEYTAREGA
KFPIKWTAPE		AINYGTFTIK		SDVWSFGILL		TEIVTHGRIP		YPGMTNPEVI
QNLERGYRMV		RPDNCPEELY		QLMRLCWKER		PEDRPTFDYL		RSVLEDFFTA
TEGQYQPQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі.

Література

• Wright D.D., Sefton B.M., Kamps M.P. (1994). Oncogenic activation of the Lck protein accompanies translocation of the LCK gene in the human HSB2 T-cell leukemia. Mol. Cell. Biol. 14: 2429—2437. PMID 8139546 DOI:10.1128/MCB.14.4.2429
• Vogel L.B., Arthur R., Fujita D.J. (1995). An aberrant lck mRNA in two human T-cell lines. Biochim. Biophys. Acta. 1264: 168—172. PMID 7495859 DOI:10.1016/0167-4781(95)00162-A
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garvin A.M., Pawar S., Marth J.D., Perlmutter R.M. (1988). Structure of the murine lck gene and its rearrangement in a murine lymphoma cell line. Mol. Cell. Biol. 8: 3058—3064. PMID 2850479 DOI:10.1128/MCB.8.8.3058
• Vogel L.B., Fujita D.J. (1993). The SH3 domain of p56lck is involved in binding to phosphatidylinositol 3'-kinase from T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 13: 7408—7417. PMID 7504174 DOI:10.1128/MCB.13.12.7408
• Vogel L.B., Fujita D.J. (1995). p70 phosphorylation and binding to p56lck is an early event in interleukin-2-induced onset of cell cycle progression in T-lymphocytes. J. Biol. Chem. 270: 2506—2511. PMID 7852312 DOI:10.1074/jbc.270.6.2506

Див. також

• Хромосома 1