GALNT2

GALNT2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FFU, 2FFV, 4D0T, 4D0Z, 4D11, 5AJN, 5AJO, 5AJP, 5FV9
Ідентифікатори
Символи	GALNT2, GalNAc-T2, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, CDG2T
Зовнішні ІД	OMIM: 602274 MGI: 894694 HomoloGene: 3297 GeneCards: GALNT2
Пов'язані генетичні захворювання
метаболічні захворювання
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • manganese ion binding • glycosyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • extracellular region • Golgi cisterna membrane • perinuclear region of cytoplasm • Golgi stack • екзосома • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • protein O-linked glycosylation via serine • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein O-linked glycosylation via threonine • O-glycan processing • protein O-linked glycosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2590	108148
Ensembl	ENSG00000143641	ENSMUSG00000089704
UniProt	Q10471	Q6PB93
RefSeq (мРНК)	NM_001291866 NM_004481	NM_139272
RefSeq (білок)	NP_001278795 NP_004472	NP_644678
Локус (UCSC)	Хр. 1: 230.06 – 230.28 Mb	Хр. 8: 124.96 – 125.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GALNT2 (англ. Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 571 амінокислот, а молекулярна маса — 64 733.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRRSRMLLC		FAFLWVLGIA		YYMYSGGGSA		LAGGAGGGAG		RKEDWNEIDP
IKKKDLHHSN		GEEKAQSMET		LPPGKVRWPD		FNQEAYVGGT		MVRSGQDPYA
RNKFNQVESD		KLRMDRAIPD		TRHDQCQRKQ		WRVDLPATSV		VITFHNEARS
ALLRTVVSVL		KKSPPHLIKE		IILVDDYSND		PEDGALLGKI		EKVRVLRNDR
REGLMRSRVR		GADAAQAKVL		TFLDSHCECN		EHWLEPLLER		VAEDRTRVVS
PIIDVINMDN		FQYVGASADL		KGGFDWNLVF		KWDYMTPEQR		RSRQGNPVAP
IKTPMIAGGL		FVMDKFYFEE		LGKYDMMMDV		WGGENLEISF		RVWQCGGSLE
IIPCSRVGHV		FRKQHPYTFP		GGSGTVFARN		TRRAAEVWMD		EYKNFYYAAV
PSARNVPYGN		IQSRLELRKK		LSCKPFKWYL		ENVYPELRVP		DHQDIAFGAL
QQGTNCLDTL		GHFADGVVGV		YECHNAGGNQ		EWALTKEKSV		KHMDLCLTVV
DRAPGSLIKL		QGCRENDSRQ		KWEQIEGNSK		LRHVGSNLCL		DSRTAKSGGL
SVEVCGPALS		QQWKFTLNLQ		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fritz T.A., Raman J., Tabak L.A. (2006). Dynamic association between the catalytic and lectin domains of human UDP-GalNAc:polypeptide alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase-2. J. Biol. Chem. 281: 8613—8619. PMID 16434399 DOI:10.1074/jbc.M513590200

Див. також

• Хромосома 1