YY1

YY1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UBD, 1ZNM, 4C5I
Ідентифікатори
Символи	YY1, DELTA, INO80S, NF-E1, UCRBP, YIN-YANG-1, YY1 transcription factor, GADEVS
Зовнішні ІД	OMIM: 600013 MGI: 99150 HomoloGene: 2556 GeneCards: YY1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • four-way junction DNA binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • SMAD binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding Клітинна компонента • Ino80 complex • nuclear matrix • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription regulator complex • цитоплазма • PcG protein complex Біологічний процес • диференціація клітин • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to UV • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair via homologous recombination • Сперматогенез • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • negative regulation of interferon-beta production • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA localization • anterior/posterior pattern specification • response to UV-C • GO:1901313 positive regulation of gene expression • response to prostaglandin F • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • camera-type eye morphogenesis • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • cellular response to interleukin-1 • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7528	22632
Ensembl	ENSG00000100811	ENSMUSG00000021264
UniProt	P25490	Q00899
RefSeq (мРНК)	NM_003403	NM_009537
RefSeq (білок)	NP_003394	NP_033563
Локус (UCSC)	Хр. 14: 100.24 – 100.28 Mb	Хр. 12: 108.76 – 108.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

YY1 (англ. YY1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 713.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGDTLYIA		TDGSEMPAEI		VELHEIEVET		IPVETIETTV		VGEEEEEDDD
DEDGGGGDHG		GGGGHGHAGH		HHHHHHHHHH		PPMIALQPLV		TDDPTQVHHH
QEVILVQTRE		EVVGGDDSDG		LRAEDGFEDQ		ILIPVPAPAG		GDDDYIEQTL
VTVAAAGKSG		GGGSSSSGGG		RVKKGGGKKS		GKKSYLSGGA		GAAGGGGADP
GNKKWEQKQV		QIKTLEGEFS		VTMWSSDEKK		DIDHETVVEE		QIIGENSPPD
YSEYMTGKKL		PPGGIPGIDL		SDPKQLAEFA		RMKPRKIKED		DAPRTIACPH
KGCTKMFRDN		SAMRKHLHTH		GPRVHVCAEC		GKAFVESSKL		KRHQLVHTGE
KPFQCTFEGC		GKRFSLDFNL		RTHVRIHTGD		RPYVCPFDGC		NKKFAQSTNL
KSHILTHAKA		KNNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, Рекомбінація ДНК, диференціація клітин, сперматогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Shi Y., Seto E., Chang L.-S., Shenk T. (1991). Transcriptional repression by YY1, a human GLI-Kruppel-related protein, and relief of repression by adenovirus E1A protein. Cell. 67: 377—388. PMID 1655281 DOI:10.1016/0092-8674(91)90189-6
• Park K., Atchison M. (1991). Isolation of a candidate repressor/activator, NF-E1 (YY-1, delta), that binds to the immunoglobulin kappa 3' enhancer and the immunoglobulin heavy-chain mu E1 site. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 9804—9808. PMID 1946405 DOI:10.1073/pnas.88.21.9804
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.-J., Lee T.-C. (1997). Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1. Nucleic Acids Res. 25: 843—849. PMID 9016636 DOI:10.1093/nar/25.4.843
• Oei S.L., Shi Y. (2001). Poly(ADP-ribosyl)ation of transcription factor Yin Yang 1 under conditions of DNA damage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 285: 27—31. PMID 11437367 DOI:10.1006/bbrc.2001.5115
• Satijn D.P.E., Hamer K.M., den Blaauwen J., Otte A.P. (2001). The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos. Mol. Cell. Biol. 21: 1360—1369. PMID 11158321 DOI:10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001

Див. також

• Хромосома 14