NR1D2

NR1D2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4N73, 2V0V, 2V7C, 3CQV
Ідентифікатори
Символи	NR1D2, BD73, EAR-1R, RVR, nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, REVERBB, REVERBbeta
Зовнішні ІД	OMIM: 602304 MGI: 2449205 HomoloGene: 3763 GeneCards: NR1D2
Реагує на сполуку
SR-9009, SR-9011
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • цитоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of skeletal muscle cell differentiation • ритмічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of lipid metabolic process • regulation of circadian rhythm • regulation of inflammatory response • lipid homeostasis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • energy homeostasis • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • response to lipid • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • circadian behavior • negative regulation of inflammatory response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9975	353187
Ensembl	ENSG00000174738	ENSMUSG00000021775
UniProt	Q14995 Q6NSM0	Q60674
RefSeq (мРНК)	NM_001145425 NM_005126	NM_011584
RefSeq (білок)	NP_001138897 NP_005117	NP_035714
Локус (UCSC)	Хр. 3: 23.95 – 23.98 Mb	Хр. 14: 18.2 – 18.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NR1D2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот, а молекулярна маса — 64 625.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVNAGGVIA		YISSSSSASS		PASCHSEGSE		NSFQSSSSSV		PSSPNSSNSD
TNGNPKNGDL		ANIEGILKND		RIDCSMKTSK		SSAPGMTKSH		SGVTKFSGMV
LLCKVCGDVA		SGFHYGVHAC		EGCKGFFRRS		IQQNIQYKKC		LKNENCSIMR
MNRNRCQQCR		FKKCLSVGMS		RDAVRFGRIP		KREKQRMLIE		MQSAMKTMMN
SQFSGHLQND		TLVEHHEQTA		LPAQEQLRPK		PQLEQENIKS		SSPPSSDFAK
EEVIGMVTRA		HKDTFMYNQE		QQENSAESMQ		PQRGERIPKN		MEQYNLNHDH
CGNGLSSHFP		CSESQQHLNG		QFKGRNIMHY		PNGHAICIAN		GHCMNFSNAY
TQRVCDRVPI		DGFSQNENKN		SYLCNTGGRM		HLVCPLSKSP		YVDPHKSGHE
IWEEFSMSFT		PAVKEVVEFA		KRIPGFRDLS		QHDQVNLLKA		GTFEVLMVRF
ASLFDAKERT		VTFLSGKKYS		VDDLHSMGAG		DLLNSMFEFS		EKLNALQLSD
EEMSLFTAVV		LVSADRSGIE		NVNSVEALQE		TLIRALRTLI		MKNHPNEASI
FTKLLLKLPD		LRSLNNMHSE		ELLAFKVHP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, гемом. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gupta N., Ragsdale S.W. (2011). Thiol-disulfide redox dependence of heme binding and heme ligand switching in nuclear hormone receptor rev-erb{beta}. J. Biol. Chem. 286: 4392—4403. PMID 21123168 DOI:10.1074/jbc.M110.193466
• Stratmann M., Schibler U. (2012). REV-ERBs: more than the sum of the individual parts. Cell Metab. 15: 791—793. PMID 22682217 DOI:10.1016/j.cmet.2012.05.006
• Ripperger J.A., Albrecht U. (2012). REV-ERB-erating nuclear receptor functions in circadian metabolism and physiology. Cell Res. 22: 1319—1321. PMID 22613952 DOI:10.1038/cr.2012.81

Див. також

• Хромосома 3