Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HES1
Ідентифікатори
Символи
HES1 , HES-1, HHL, HRY, bHLHb39, hes family bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 139605 MGI: 104853 HomoloGene: 38067 GeneCards: HES1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • histone deacetylase binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • chaperone binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • N-box binding • protein homodimerization activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • E-box binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• pattern specification process • auditory receptor cell fate determination • midbrain-hindbrain boundary morphogenesis • inner ear receptor cell stereocilium organization • negative regulation of neuron differentiation • metanephric nephron tubule morphogenesis • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • lateral inhibition • cardiac neural crest cell development involved in outflow tract morphogenesis • negative regulation of stem cell differentiation • inner ear auditory receptor cell differentiation • negative regulation of pro-B cell differentiation • negative regulation of inner ear receptor cell differentiation • regulation of neurogenesis • positive regulation of Notch signaling pathway • cochlea development • cell fate commitment • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung development • negative regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • negative regulation of cell differentiation • labyrinthine layer blood vessel development • in utero embryonic development • cell maturation • adenohypophysis development • regulation of timing of neuron differentiation • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • telencephalon development • positive regulation of T cell proliferation • neural tube development • pancreas development • hindbrain morphogenesis • smoothened signaling pathway • negative regulation of stomach neuroendocrine cell differentiation • ureteric bud morphogenesis • regulation of inner ear auditory receptor cell differentiation • oculomotor nerve development • regulation of timing of cell differentiation • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • positive regulation of BMP signaling pathway • midbrain development • establishment of epithelial cell polarity • pituitary gland development • comma-shaped body morphogenesis • somatic stem cell population maintenance • trochlear nerve development • aorta morphogenesis • negative regulation of forebrain neuron differentiation • negative regulation of pancreatic A cell differentiation • regulation of secondary heart field cardioblast proliferation • common bile duct development • renal interstitial fibroblast development • forebrain radial glial cell differentiation • S-shaped body morphogenesis • glomerulus vasculature development • liver development • regulation of epithelial cell proliferation • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ventricular septum morphogenesis • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • ascending aorta morphogenesis • outflow tract morphogenesis • positive regulation of astrocyte differentiation • ventricular septum development • vascular associated smooth muscle cell development • embryonic heart tube morphogenesis • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • Сигнальний шлях Notch • positive regulation of mitotic cell cycle, embryonic • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • thymus development • positive regulation of DNA binding • negative regulation of glial cell proliferation • neuronal stem cell population maintenance • positive regulation of cell population proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • artery morphogenesis • pharyngeal arch artery morphogenesis • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • GO:0034622 protein-containing complex assembly • regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • somitogenesis • диференціація клітин • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of cell fate determination
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 194.14 – 194.14 Mb
Хр. 16: 29.88 – 29.89 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HES1 (англ. Hes family bHLH transcription factor 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 280 амінокислот , а молекулярна маса — 29 541[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MPADIMEKNS SSPVAATPAS VNTTPDKPKT ASEHRKSSKP IMEKRRRARI
NESLSQLKTL ILDALKKDSS RHSKLEKADI LEMTVKHLRN LQRAQMTAAL
STDPSVLGKY RAGFSECMNE VTRFLSTCEG VNTEVRTRLL GHLANCMTQI
NAMTYPGQPH PALQAPPPPP PGPGGPQHAP FAPPPPLVPI PGGAAPPPGG
APCKLGSQAG EAAKVFGGFQ VVPAPDGQFA FLIPNGAFAH SGPVIPVYTS
NSGTSVGPNA VSPSSGPSLT ADSMWRPWRN
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Feder J.N., Li L., Jan L.Y., Jan Y.-N. (1994). Genomic cloning and chromosomal localization of HRY, the human homolog to the Drosophila segmentation gene, hairy. Genomics . 20 : 56—61. PMID 8020957 DOI :10.1006/geno.1994.1126
Takata T., Ishikawa F. (2003). Human Sir2-related protein SIRT1 associates with the bHLH repressors HES1 and HEY2 and is involved in HES1- and HEY2-mediated transcriptional repression. Biochem. Biophys. Res. Commun . 301 : 250—257. PMID 12535671 DOI :10.1016/S0006-291X(02)03020-6
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші