PLOD3: відмінності між версіями

PLOD3
Ідентифікатори
Символи	PLOD3, LH3, procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603066 MGI: 1347008 HomoloGene: 843 GeneCards: PLOD3
Пов'язані генетичні захворювання
	connective tissue disorder due to lysyl hydroxylase-3 deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding; • L-ascorbic acid binding; • dioxygenase activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; • procollagen galactosyltransferase activity; • oxidoreductase activity; • procollagen-lysine 5-dioxygenase activity; • procollagen glucosyltransferase activity; • каталітична активність; • transferase activity; • glycosyltransferase activity;
Клітинна компонента	• rough endoplasmic reticulum membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • екзосома; • ендоплазматичний ретикулум; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • міжклітинний простір; • endoplasmic reticulum lumen; • rough endoplasmic reticulum; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• GO:0034613 protein localization; • lung morphogenesis; • collagen fibril organization; • epidermis morphogenesis; • endothelial cell morphogenesis; • вазодилатація; • in utero embryonic development; • basement membrane assembly; • cellular response to hormone stimulus; • neural tube development; • protein O-linked glycosylation; • hydroxylysine biosynthetic process; • peptidyl-lysine hydroxylation; • collagen metabolic process; • обмін речовин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8985
	26433
	ENSG00000106397
	ENSMUSG00000004846
	O60568
	Q9R0E1
	NM_001084
	NM_011962
	NP_001075
	NP_036092
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Інтерактивний перегляд історії

[перевірена версія]

[очікує на перевірку]

← Попереднє редагування

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Поточна версія на 11:26, 11 травня 2022

PLOD3 (англ. Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 амінокислот, а молекулярна маса — 84 785^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSSGPGPRF	LLLLPLLLPP	AASASDRPRG	RDPVNPEKLL	VITVATAETE
GYLRFLRSAE	FFNYTVRTLG	LGEEWRGGDV	ARTVGGGQKV	RWLKKEMEKY
ADREDMIIMF	VDSYDVILAG	SPTELLKKFV	QSGSRLLFSA	ESFCWPEWGL
AEQYPEVGTG	KRFLNSGGFI	GFATTIHQIV	RQWKYKDDDD	DQLFYTRLYL
DPGLREKLSL	NLDHKSRIFQ	NLNGALDEVV	LKFDRNRVRI	RNVAYDTLPI
VVHGNGPTKL	QLNYLGNYVP	NGWTPEGGCG	FCNQDRRTLP	GGQPPPRVFL
AVFVEQPTPF	LPRFLQRLLL	LDYPPDRVTL	FLHNNEVFHE	PHIADSWPQL
QDHFSAVKLV	GPEEALSPGE	ARDMAMDLCR	QDPECEFYFS	LDADAVLTNL
QTLRILIEEN	RKVIAPMLSR	HGKLWSNFWG	ALSPDEYYAR	SEDYVELVQR
KRVGVWNVPY	ISQAYVIRGD	TLRMELPQRD	VFSGSDTDPD	MAFCKSFRDK
GIFLHLSNQH	EFGRLLATSR	YDTEHLHPDL	WQIFDNPVDW	KEQYIHENYS
RALEGEGIVE	QPCPDVYWFP	LLSEQMCDEL	VAEMEHYGQW	SGGRHEDSRL
AGGYENVPTV	DIHMKQVGYE	DQWLQLLRTY	VGPMTESLFP	GYHTKARAVM
NFVVRYRPDE	QPSLRPHHDS	STFTLNVALN	HKGLDYEGGG	CRFLRYDCVI
SSPRKGWALL	HPGRLTHYHE	GLPTTWGTRY	IMVSFVDP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Valtavaara M., Szpirer C., Szpirer J., Myllylae R. (1998). Primary structure, tissue distribution, and chromosomal localization of a novel isoform of lysyl hydroxylase (lysyl hydroxylase 3). J. Biol. Chem. 273: 12881—12886. PMID 9582318 DOI:10.1074/jbc.273.21.12881
Passoja K., Rautavuoma K., Ala-Kokko L., Kosonen T., Kivirikko K.I. (1998). Cloning and characterization of a third human lysyl hydroxylase isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10482—10486. PMID 9724729 DOI:10.1073/pnas.95.18.10482
Rautavuoma K., Passoja K., Helaakoski T., Kivirikko K.I. (2000). Complete exon-intron organization of the gene for human lysyl hydroxylase 3 (LH3). Matrix Biol. 19: 73—79. PMID 10686427 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00058-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PLOD3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9083 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O60568 (англ.) . Архів оригіналу за 13 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PLOD3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9083 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O60568 (англ.) . Архів оригіналу за 13 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

@@ Рядок 1: / Рядок 1: @@
 {{Картка гена}}
-'''PLOD3''' ({{lang-en|Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web|url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:9083 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9083 |language=англ. |accessdate=7 вересня 2017}}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 84 785<ref name="UniProt">{{cite web|url=http://www.uniprot.org/uniprot/O60568#sequences |title=UniProt, O60568 |language=англ. |accessdate=7 вересня 2017}}</ref>.
+'''PLOD3''' ({{lang-en|Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web |url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:9083 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9083 |language=англ. |accessdate=7 вересня 2017 |archive-date=4 квітня 2016 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160404031412/http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:9083 }}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 84 785<ref name="UniProt">{{cite web |url=http://www.uniprot.org/uniprot/O60568#sequences |title=UniProt, O60568 |language=англ. |accessdate=7 вересня 2017 |archive-date=13 січня 2018 |archive-url=https://web.archive.org/web/20180113045718/http://www.uniprot.org/uniprot/O60568#sequences }}</ref>.
 {{hidden

PLOD3: відмінності між версіями

Поточна версія на 11:26, 11 травня 2022

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук