TMC3

TMC3 (англ. Transmembrane channel like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 125 685.

TMC3
Ідентифікатори
Символи	TMC3, transmembrane channel like 3
Зовнішні ІД	OMIM: 617196 MGI: 2669033 HomoloGene: 45588 GeneCards: TMC3
Онтологія гена Молекулярна функція • ion channel activity • mechanosensitive ion channel activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane Біологічний процес • ion transport • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	342125	233424
Ensembl	ENSG00000188869	ENSMUSG00000038540
UniProt	Q7Z5M5	Q7TQ69
RefSeq (мРНК)	NM_001080532 NM_181841	NM_177695
RefSeq (білок)	NP_001074001	NP_808363
Локус (UCSC)	Хр. 15: 81.33 – 81.37 Mb	Хр. 7: 83.23 – 83.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKTSKASQRY		RGIRRNASQC		YLYQESLLLS		NLDDSFSADE		TGDSNDPEQI
FQNIQFQKDL		MANIRCRPWT		MGQKLRALRQ		AKNIVLKFEG		RLTRTRGYQA
AGAELWRKFA		RLACNFVVIF		IPWEMRIKKI		ESHFGSGVAS		YFIFLRWLFG
INIVLTIMTG		AFIVIPELIA		GQPFGSTARK		TIPKEQVSSA		QDLDTVWSLG
GYLQYSVLFY		GYYGRERKIG		RAGYRLPLAY		FLVGMAVFAY		SFIILLKKMA
KNSRTSLASA		SNENYTFCWR		VFCAWDYLIG		NPEAAESKTA		AIVNSIREAI
LEEQEKKKSK		NLAVTICLRI		IANILVLLSL		AGSIYLIYFV		VDRSQKLEQS
KKELTLWEKN		EVSVVVSLVT		MIAPSAFDLI		AALEMYHPRT		TLRFQLARVL
VLYLGNLYSL		IIALLDKVNS		MSIEEMATKN		NTSHWIDSTT		FFATRTAPEE
EKWSTSRPGM		GLRRNNTWAL		EETSISAYTM		PLIKANKTSL		HTQSPQDQCW
ETYVGQEMLK		LSIIDMLFTV		ASILLIDFFR		GLFVRYLSDY		WCWDLESKFP
EYGEFKIAEN		VLHLVYNQGM		IWMGAFFSPC		LPAFNVLKLI		GLMYLRSWAV
LTCNVPHQQV		FRASRSNNFY		LAMLLFMLFL		CMLPTIFAIV		RYKPSLNCGP
FSGQEKIYDI		VSETIEKDFP		VWFGSVVGHI		SSPVVILPAV		LLLFMLIYYL
QSIARSLKLS		NHQLKMQIQN		ARSEDKKKVA		QMVEARIQTQ		EESTKKLPND
SDLTSQLSSA		HSGTPQNNGN		VAHFDSGSSK		SGRIETVAQS		MPQSPRPGDR
APSSPLPGVP		KSRLEHETNR		YLHGLCASTS		DLHRNRSRTP		MTFTTHIEDV
HSEPLFRKDF		QQINPPHRGP		QASTLLAQGP		RPHAPRYYVI		NECDSYKKKH
LNVWPERHFK		IDASGDIVEL		YPRNVRQYAS		RVPRQPPSPQ		LSEEEEETPS
RDWIKRSLPP		RSLIDLRRAP		HFYIGERSES		QTRDPEHQGR		VHYKSWNEDF
EGHLERPAYV		PRKPRSRNFQ		YPQPPLKPRG		KPRFEPSLTE		SDSVSAASSS
DQQNSSADQY		LQVTHSQGRF		PRSVGQPSRR		KAKSGQELTV		DLDDLICSDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Keresztes G., Mutai H., Heller S. (2003). TMC and EVER genes belong to a larger novel family, the TMC gene family encoding transmembrane proteins. BMC Genomics. 4: 24—24. PMID 12812529 DOI:10.1186/1471-2164-4-24
• Kurima K., Yang Y., Sorber K., Griffith A.J. (2003). Characterization of the transmembrane channel-like (TMC) gene family: functional clues from hearing loss and epidermodysplasia verruciformis. Genomics. 82: 300—308. PMID 12906855 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00154-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15