OPN5

OPN5 (англ. Opsin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 39 727.

OPN5
Ідентифікатори
Символи	OPN5, GPR136, GRP136, PGR12, TMEM13, opsin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 609042 MGI: 2662912 HomoloGene: 72341 GeneCards: OPN5
Онтологія гена Молекулярна функція • 11-cis retinal binding • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • integral component of plasma membrane Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • відповідь на стимул • G protein-coupled receptor signaling pathway • phototransduction • detection of visible light • cellular response to light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221391	353344
Ensembl	ENSG00000124818	ENSMUSG00000043972
UniProt	Q6U736	Q6VZZ7
RefSeq (мРНК)	NM_001030051 NM_181744	NM_181753
RefSeq (білок)	NP_859528	NP_861418
Локус (UCSC)	Хр. 6: 47.78 – 47.83 Mb	Хр. 17: 42.87 – 42.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALNHTALPQ		DERLPHYLRD		GDPFASKLSW		EADLVAGFYL		TIIGILSTFG
NGYVLYMSSR		RKKKLRPAEI		MTINLAVCDL		GISVVGKPFT		IISCFCHRWV
FGWIGCRWYG		WAGFFFGCGS		LITMTAVSLD		RYLKICYLSY		GVWLKRKHAY
ICLAAIWAYA		SFWTTMPLVG		LGDYVPEPFG		TSCTLDWWLA		QASVGGQVFI
LNILFFCLLL		PTAVIVFSYV		KIIAKVKSSS		KEVAHFDSRI		HSSHVLEMKL
TKVAMLICAG		FLIAWIPYAV		VSVWSAFGRP		DSIPIQLSVV		PTLLAKSAAM
YNPIIYQVID		YKFACCQTGG		LKATKKKSLE		GFRLHTVTTV		RKSSAVLEIH
EEWE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

• Tarttelin E.E., Bellingham J., Hankins M.W., Foster R.G., Lucas R.J. (2003). Neuropsin (Opn5): a novel opsin identified in mammalian neural tissue. FEBS Lett. 554: 410—416. PMID 14623103 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01212-2
• Fredriksson R., Hoeglund P.J., Gloriam D.E.I., Lagerstroem M.C., Schioeth H.B. (2003). Seven evolutionarily conserved human rhodopsin G protein-coupled receptors lacking close relatives. FEBS Lett. 554: 381—388. PMID 14623098 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01196-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6