Фармакофор

Фармакофор је апстрактни опис молекулских особина које су неопходне за молекулско препознавање лиганда од стране биолошких макромолекула. ИУПАЦ дефинише фармакофор као „ансамбл стерних и електронских особина које су неопходне како би се осигурала оптимална супрамолекулска интеракција са специфичним биолошким циљем и иницирала активација (или блокада) његовог биолошког одговора“.^[1]

Фармакофоре је успоставио Лемонт Киер, који је први поменуо овај концепт 1967^[2], и накнадно га користио у књизи о теоријским аспектима развоја лекова.^[3] Развој овог концепта се често погрешно приписује Полу Ерлиху^[4], мада га он у свом раду није користио.^[5]

У модерној рачунарској хемији, фармакофори се користе за дефинисање есенцијалних особина једног или више молекула са истом биолошким дејством. Базе података с великим бројем хемијских једињења се затим могу претраживати да би се нашли додатни молекули који поседују исту групу особина лоцираних на сличном међусобном растојању, усмерених у приближно истом правцу, и са сличним свеукупним обликом молекула.

Типичне фармакофорне особине су хидрофобност, ароматичност, прималац водоничне везе, давалац водоничне везе, катјон, и ањон. Ове особине морају да се преклопе са различитим хемијским групама сличних особина, да би се идентификовали нови лиганди. Интеракције рецепторских лиганда су типично „поларно позитивне“, „поларно негативне“ или „хидрофобне“. Добро дефинисан фармакофорни модел садржи хидрофобне просторе и векторе водоничних веза.

Референце

↑ Wермутх, C.Г.; Ганеллин, C.Р.; Линдберг, П.; Митсцхер, L.А. (1998). „Глоссарy оф термс усед ин медицинал цхемистрy”. Пуре Аппл. Цхем. (Интернатионал Унион оф Пуре анд Апплиед Цхемистрy).
↑ L.Б. Киер (1967). „Молецулар Орбитал Цалцулатион оф Преферред Цонформатионс оф Ацетyлцхолине, Мусцарине, анд Мусцароне”. Молецулар Пхармацологy 3: 487–494. ПМИД 6052710.
↑ L.Б. Киер (1971). МО Тхеорy ин Друг Ресеарцх. Неw Yорк: Ацадемиц Пресс. стр. 164–169.
↑ П. Ехрлицх (1909). „Üбер ден јетзиген Станд дер Цхемотхерапие”. Бер. Дтсцх. Цхем. Гес. 42: 17–47.
↑ Ј.Х. ван Дрие (2007). „Монтy Киер анд тхе Оригин оф тхе Пхармацопхоре Цонцепт”. Интернет Елецтрониц Јоурнал оф Молецулар Десигн 6: 271–279.

Литература

Гнер, Осман Ф. (2000). Пхармацопхоре перцептион, девелопмент, анд усе ин друг десигн. Ла Јолла, Цалиф: Интернатионал Университy Лине.
Герд Фолкерс; Тхиеррy Лангер; Ремy D. Хоффманн; Раимунд Маннхолд; Хуго Кубинyи (2006). Пхармацопхорес анд Пхармацопхоре Сеарцхес (Метходс анд Принциплес ин Медицинал Цхемистрy). Цхицхестер: Јохн Wилеy & Сонс.
L.Б. Киер (1971). МО Тхеорy ин Друг Ресеарцх. Неw Yорк: Ацадемиц Пресс. стр. 164–169.

Повезано

Спољашње везе

Постоји више рачунарских програма који омогућавају дефинисање фармакофора користећи низ метода рачунарске хемије. Неки од њих су:

Дисцоверy Студио Архивирано 2010-12-12 на Wаyбацк Мацхине-у
ЛигандСцоут
Пхасе Архивирано 2008-12-06 на Wаyбацк Мацхине-у
МОЕ Архивирано 2012-03-08 на Wаyбацк Мацхине-у

[IUPAC_definition-1] Wермутх, C.Г.; Ганеллин, C.Р.; Линдберг, П.; Митсцхер, L.А. (1998). „Глоссарy оф термс усед ин медицинал цхемистрy”. Пуре Аппл. Цхем. (Интернатионал Унион оф Пуре анд Апплиед Цхемистрy).

[2] L.Б. Киер (1967). „Молецулар Орбитал Цалцулатион оф Преферред Цонформатионс оф Ацетyлцхолине, Мусцарине, анд Мусцароне”. Молецулар Пхармацологy 3: 487–494. ПМИД 6052710.

[3] L.Б. Киер (1971). МО Тхеорy ин Друг Ресеарцх. Неw Yорк: Ацадемиц Пресс. стр. 164–169.

[4] П. Ехрлицх (1909). „Üбер ден јетзиген Станд дер Цхемотхерапие”. Бер. Дтсцх. Цхем. Гес. 42: 17–47.

[5] Ј.Х. ван Дрие (2007). „Монтy Киер анд тхе Оригин оф тхе Пхармацопхоре Цонцепт”. Интернет Елецтрониц Јоурнал оф Молецулар Десигн 6: 271–279.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]