Coevolution of A Generalist Pathogen With Many Hosts - The Case of The Amphibian Chytrid Batrachochytrium Dendrobatidis - ScienceDirect 2

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Opinião Atual em Microbiologia


Volume 78, abril de 2024, 102435

Análise

Coevolução de um patógeno generalista com muitos hospedeiros: o


caso do anfíbio quitrídeo Batrachochytrium dendrobatidis ÿ
1 2 3 1
Tamilie Carvalho*, Anat M Belasen*, L Felipe Toledo , Timothy e James

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https://doi.org/10.1016/j.mib.2024.102435
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Os patógenos generalistas mantêm a infectividade em numerosos hospedeiros; como esse amplo nicho ecológico impacta a coevolução hospedeiro-patógeno ainda precisa ser

amplamente explorado. Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) é um fungo patogênico altamente generalista que causou declínios devastadores em centenas de espécies

de anfíbios em todo o mundo. Esta revisão examina as interações hospedeiro-patógeno da quitridiomicose anfíbia e as evidências disponíveis para a coevolução entre o Bd e seus

numerosos hospedeiros. Resumimos evidências recentes mostrando que os genótipos de Bd variam em distribuição geográfica e virulência, e que as espécies de anfíbios também

variam em suscetibilidade ao Bd de acordo com sua distribuição geográfica. Quanta variação pode ser explicada pela plasticidade fenotípica ou diferenças genéticas permanece

incerta.

Pesquisas recentes sugerem que os genótipos de Bd apresentam preferências por hospedeiros específicos e que alguns hospedeiros estão em evolução à medida que as

populações se recuperam de surtos de Bd. Tomadas em conjunto, estas descobertas sugerem o potencial para a coevolução ocorrer e iluminam um caminho para abordar questões em

aberto através da integração de dados genéticos históricos e contemporâneos.

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Opinião Atual em Microbiologia 2024, 78:102435

Esta revisão vem de uma edição temática sobre Interações Hospedeiro-Microbe: Fungos

Editado por Sheng Sun, Joseph Heitman e Tim James

https://doi.org/10.1016/j.mib.2024.102435

1369–5274/© 2024 Elsevier Ltd. Todos os direitos reservados.

Introdução

Corridas armamentistas coevolutivas, nas quais os patógenos e seus hospedeiros se adaptam constantemente para atacar e fugir uns dos outros, podem levar à especificidade

patógeno-hospedeiro 1, 2. Isso ocorre porque patógenos especializados (hospedeiro único) colhem benefícios ao infectar hospedeiros aos quais se adaptaram. explorar. Quando os

patógenos infectam uma grande diversidade de espécies ou genótipos hospedeiros, as compensações de aptidão podem estar associadas a diferentes nichos de hospedeiros (o

paradigma do pau para toda obra), onde as adaptações a um hospedeiro são antagonicamente pleiotrópicas para outros hospedeiros [3]. A existência destas compensações,

embora raramente medidas, sugeriria que a especificidade e a especialização dos agentes patogénicos deveriam ser comuns.

No entanto, em vez disso, os agentes patogénicos generalistas (multi-hospedeiros) são a norma e não a excepção. Apesar de serem comuns, os patógenos generalistas que podem

infectar uma ampla diversidade de espécies permanecem enigmáticos. A capacidade desses patógenos de explorar numerosos hospedeiros provavelmente requer um kit de

ferramentas de patogenicidade que facilite a plasticidade, flexibilidade e robustez [4]. No entanto, estes kits de ferramentas não estão bem caracterizados para a maioria dos

patógenos generalistas. Além disso, como e quando os patógenos generalistas sofrem coevolução com seus hospedeiros é complicado pela natureza multidimensional das interações

patógeno-hospedeiro, o que pode limitar a capacidade do patógeno de se adaptar simultaneamente a


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hospedeiros diversos.

Para prever a probabilidade de coevolução, primeiro precisamos caracterizar os padrões existentes de interações hospedeiro-patógeno (ou seja, quais
genótipos de patógenos infectam quais hospedeiros) e o kit de ferramentas que os patógenos usam para desbloquear essa patogenicidade.
Especificamente, os principais determinantes para saber se um patógeno pode ser generalista residem em genes que programam a plasticidade (agindo
como uma chave única capaz de desbloquear o acesso a muitas espécies hospedeiras), ou na manutenção de uma diversidade de estratégias de
infecção (consistindo em múltiplas chaves, cada desbloqueio de acesso a um tipo de host)? No primeiro cenário, os patógenos que encontram fortes defesas
do hospedeiro podem mudar para hospedeiros alternativos, evitando forças seletivas nas estratégias de infecção. A última estratégia prevê um maior
potencial para dinâmica coevolutiva entre hospedeiro e patógeno [4].

Os fungos fornecem sistemas excelentes para explorar as características que facilitam o generalismo do hospedeiro e testar as compensações previstas no
modelo pau para toda obra. Exemplos bem conhecidos de patógenos fúngicos altamente generalistas incluem o patógeno de insetos Beauveria bassiana, que
ataca mais de 700 espécies de artrópodes, e o patógeno de plantas Botrytis cinerea, que infecta mais de 500 espécies de monocotiledôneas e
dicotiledôneas. Patógenos fúngicos generalistas estão atualmente causando doenças emergentes de importância para a saúde humana, da vida selvagem
e do meio ambiente [5]. Para esta revisão, focamos nossas lentes em um patógeno fúngico altamente generalista, o patógeno anfíbio Batrachochytrium
dendrobatidis (Bd), explorando quais características o tornam um generalista de sucesso e as evidências e o escopo para a coevolução com seus hospedeiros.

O agente causador da doença quitridiomicose em anfíbios, Bd, é um patógeno extremamente generalista, infectando pelo menos 1.375 das 2.525 (55%)
espécies de anfíbios até agora amostradas para infecções por Bd [6]. Embora o Bd seja reconhecido por seu papel no declínio e extinção de anuros em
todo o mundo [7], ele também pode infectar salamandras e cecílias [6]. Esta ampla gama de hospedeiros é particularmente impressionante considerando a
enorme diversidade dos seus hospedeiros em termos de ecologia, fisiologia, uso de habitat e tolerância climática, particularmente no contexto das
aparentemente estreitas tolerâncias ambientais ideais do patógeno. O Bd é um patógeno da pele sensível a altas temperaturas, condições secas e
estressores ambientais, incluindo salinidade [8]. No entanto, o Bd consegue infectar espécies de anfíbios com adaptações físicas e fisiológicas a ambientes
extremos, desde desertos até costas de água salgada; espécies que toleram produtos químicos agrícolas e habitats degradados; e espécies que só emergem
de tocas subterrâneas uma vez por ano para procriar (Figura 1). Esse generalismo também se aplica às rotas de transmissão do Bd, que incluem a transmissão
indireta através de zoósporos que nadam livremente e a transmissão direta, onde os zoósporos são transmitidos diretamente através do contato entre
hospedeiros. Além disso, o Bd foi detectado em invertebrados, incluindo nemátodos, crustáceos e ectoparasitas anfíbios 9, 10, bem como em vertebrados
não anfíbios, incluindo aves e répteis 11, 12; no entanto, não está claro se esses organismos realmente representam verdadeiros reservatórios ou vetores. O
Bd também pode ser facilmente detectado em lagos, riachos, solo/folhas úmidas e até mesmo em neblina e chuva [13]. Embora a viabilidade do Bd fora dos
hospedeiros anfíbios ainda exija uma investigação mais aprofundada, é provável que aspectos generalistas da história de vida do Bd, combinados com o
comércio global, tenham facilitado a rápida propagação do patógeno pelo mundo [14].

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Figura 1. Espécies de anfíbios nos seus diversos habitats. (a) Telmatobius culeus (foto: Arturo Muñoz), (b) Rana sylvatica (foto: AZ Andis Arietta), (c)
Microkayla illimani (foto: Arturo Muñoz), (d) Aplastodiscus leucopygius (foto: Guilherme Becker), ( e) Phyllodytes gyrinaethes (foto: Pedro Peloso), (f) Thoropa
taophora (foto: Fernanda Paiva), (g) Telmatobius sp. (foto: Arturo Muñoz), e (h)
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Hylodes sazimai (foto: Pedro Peloso).

Nos últimos 25 anos, a comunidade das doenças dos anfíbios tem questionado o que desencadeou a panzoótica em curso e como podemos prever quais as
espécies e populações que serão mais vulneráveis no futuro. Grande progresso foi feito na compreensão dos fatores ecológicos, características relevantes da
história de vida do hospedeiro e do patógeno, respostas imunes dos anfíbios e o microbioma associado ao hospedeiro na determinação do resultado da infecção
[15]. As evidências provenientes de esforços generalizados de monitorização mostram que, embora o Bd possa ser encontrado em quase todo o lado na Terra,
existem pontos críticos de surtos de doenças graves e pontos frios de menor prevalência de Bd e gravidade da doença.
A pesquisa genômica aprofundou nossa compreensão da diversidade, origens e modos de dispersão do Bd, e evidências de pesquisas em andamento
os esforços de monitorização mostram que algumas populações estão a recuperar e a evoluir em resposta às epizootias de Bd. Embora seja claro que o
genótipo é importante tanto para os hospedeiros como para o agente patogénico, permanecem questões sobre os mecanismos associados às diferentes relações
genótipo-doença e sobre se a evolução pode operar com rapidez suficiente para reduzir os declínios. Felizmente, os avanços tecnológicos e a utilização
de dados históricos (ou seja, amostras de museus) são uma grande promessa para a identificação de mecanismos de evolução. Nesta revisão, discutiremos as
lacunas de compreensão e conhecimento em torno dos patógenos generalistas, o estado atual do que se sabe sobre a evolução dos anfíbios e do Bd no
contexto das interações hospedeiro-patógeno, e como o avanço desta pesquisa pode ajudar a prever
resultados da doença.

Patógenos generalistas: projetados para destruição?


Os declínios causados por Bd, bem como por patógenos fúngicos generalistas de morcegos (Pseudogymnoascus destructans) e cobras (Ophidiomyces
ophiodiicola) levantam a questão: os patógenos generalistas são mais propensos a causar epizootias catastróficas na vida selvagem? Uma série de pontos
em comum surgem quando se consideram patógenos generalistas. Primeiro, os patógenos generalistas podem atingir e manter níveis mais elevados de virulência
porque os generalistas podem não sofrer as mesmas restrições na evolução da virulência que são esperadas em especialistas, permitindo-lhes potencialmente
levar certos hospedeiros à extinção enquanto persistem em outros hospedeiros ou em estágios ambientais de repouso [5 ]. Em segundo lugar, os patógenos
fúngicos generalistas geralmente apresentam virulência diferencial entre os hospedeiros 16, 17, como é o caso do Bd. Terceiro, os patógenos generalistas têm maior
probabilidade de serem assexuados do que os patógenos especializados quando as vantagens reprodutivas da assexualidade, como a segurança
reprodutiva, superam os custos 18, 19. Quarto, os generalistas também diferem dos especialistas no local onde ocorrem ao longo do espectro de doenças
obrigatórias-facultativas. historia de vida; fundamentalmente, os patógenos especializados parecem desenvolver dependências metabólicas complexas com seus
hospedeiros (patógenos obrigatórios), enquanto os generalistas têm maior probabilidade de serem necrotróficos, isto é, se alimentarem de tecido morto do
hospedeiro, ou terem uma fase saprotrófica. Isto facilita a transmissão ambiental em agentes patogénicos generalistas, o que pode aumentar a
transmissão entre espécies e os saltos de hospedeiros, alargando ainda mais o nicho ecológico do agente patogénico e potencialmente conduzindo a
repercussões em espécies hospedeiras ingénuas.

Apesar dessas diferenças ecológicas e evolutivas entre generalistas e especialistas, elas estão frequentemente intimamente relacionadas, mostrando como a
especificidade pode ser gerada em algumas etapas evolutivas [20]. No entanto, a gama de hospedeiros não precisa necessariamente diminuir de tamanho ao
longo do tempo através do aumento da especialização. Por exemplo, a família Sclerotiniaceae, patogênica para plantas, passou por numerosas expansões
recentes de hospedeiros [21]. Os saltos de hospedeiros não ocorrem apenas entre espécies hospedeiras intimamente relacionadas, mas também podem
envolver grandes mudanças no nicho. Por exemplo, patógenos animais generalistas, de Bd a Metarhizium (em insetos), evoluíram de outros nichos,
especificamente, saprotróficos, endófitos ou patógenos de plantas 22, 23, 24. Vistos em escalas de tempo profundas, as transições entre os nichos ecológicos de
saprotrofia e a patogenicidade ocorreu múltiplas vezes dentro do maior grupo de fungos filamentosos (Pezizomycotina); ainda assim, as transições da saprotrofia
para a patogenicidade são menos comuns do que as transições entre tipos simbióticos, por exemplo, de endófito para patógeno de planta [25]. Tomados em
conjunto, notamos que há evidências crescentes de que os patógenos fúngicos generalistas emergentes da vida selvagem parecem não ter coevolução profunda
com seus hospedeiros, um processo que muitas vezes leva à especificidade.

Bd é um patógeno global com efeitos dramáticos limitados a hospedeiros e regiões específicas


A origem do Bd tem sido uma questão central desde a descrição do patógeno. Este conhecimento é vital para compreender a história do surgimento da
quitridiomicose, identificar áreas onde a recuperação (e coevolução) está a ocorrer e utilizar este conhecimento nos esforços para mitigar e prevenir futuras
mortes de anfíbios. As evidências atuais apoiam a Ásia como uma origem potencial do fungo quitrídeo porque o Bd na Ásia mostra alta diversidade genética e
uma estrutura populacional altamente recombinada [26]. Presumivelmente, numerosas linhagens clonais de Bd emergiram da Ásia através de translocações
assistidas por humanos. Essas linhagens incluem a linhagem panzoótica global virulenta e infecciosa (Bd-GPL), uma linhagem emergente recentemente que
está implicada no declínio e extinções da população de anfíbios em todo o mundo [14]. Em contraste, cinco linhagens atualmente restritas geograficamente
ocorrem em um estágio de infecção presumivelmente enzoótica com hospedeiros locais: Bd-Asia-1 na Coréia, Bd-Asia-2/Brasil (doravante Bd-Brasil) no Brasil, Coréia
e Japão, Bd-ASIA-3 nas Filipinas, Indonésia e China, Bd-CAPE na Europa e África, e Bd-CH na Europa 26, 27. Embora haja apoio para diferenças na
virulência entre Bd-GPL e as linhagens enzoóticas, os resultados da quitridiomicose pode ser afetado por vários outros fatores.
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Numerosas condições ambientais desempenham papéis importantes nas interações anfíbios-Bd. Por exemplo, está bem estabelecido que a temperatura,
o pH, a salinidade e a precipitação podem mediar significativamente tanto a ocorrência de Bd como a gravidade da quitridiomicose 6, 8, 28. Em algumas
regiões, a desflorestação está provavelmente na vanguarda do aumento da susceptibilidade do hospedeiro e da transmissão de Bd. Belasen et al. [29]
identificaram que os anfíbios selvagens que habitam florestas fragmentadas foram erodidos imunogeneticamente e apresentaram maior carga e
prevalência de infecção por Bd quando comparados com seus equivalentes em habitats florestais intactos. Becker et al. [30] demonstraram que a divisão do
habitat (onde os ambientes terrestres naturais e os locais de reprodução aquáticos estão desconectados) estava ligada ao aumento da intensidade
da infecção por Bd em anfíbios durante a época de reprodução. As alterações climáticas globais também podem alterar a dinâmica das doenças e aumentar
o risco de mortalidade dos hospedeiros, provavelmente devido à sensibilidade térmica e hídrica do Bd e dos seus hospedeiros anfíbios. Uma meta-análise
conduzida por Sauer et al. [31] mostraram que os hospedeiros testados em ambientes laboratoriais onde a temperatura era significativamente mais quente
ou mais fria do que o seu ótimo térmico experimentaram maior mortalidade induzida por Bd, apoiando a 'hipótese de incompatibilidade térmica' dos autores.
Também foi descoberto que uma incompatibilidade térmica aumenta a suscetibilidade ao Bd em anfíbios neotropicais amostrados ao longo de um período de
50 anos, sugerindo que uma interação sinérgica entre anomalias climáticas e Bd pode ter desencadeado surtos pós-enzoóticos de quitridiomicose
no Brasil, levando ao declínio de vários anfíbios. populações no Brasil [85]. Moura-Campos et al. [32] descobriram que, numa comunidade de anfíbios
tropicais selvagens, períodos anormalmente secos tiveram efeitos indiretos na mortalidade de rãs através do aumento da prevalência de Bd e das
cargas de infecção. Além disso, a dispersão facilitada pelo homem de anfíbios Bd ou infectados por Bd permite a coinfecção da comunidade de anfíbios
receptores por novas linhagens ou genótipos, o que pode alterar as taxas de transmissão de Bd, favorecer genótipos mais virulentos, alterar o
microbioma associado ao hospedeiro e facilitar a emergência de genótipos híbridos 33, 34. Juntos, estes factores afectam a dinâmica da doença e estão
provavelmente envolvidos na inclinação da balança em direcção às epizootias em muitas regiões do mundo. No entanto, a Ásia não está isenta de tais
questões ambientais e os anfíbios na Ásia não sofrem declínios relacionados com o Bd [7]. Por que os anfíbios na Ásia escaparam da panzoótica? Voltamo-
nos para a coevolução hospedeiro-patógeno como uma possível explicação.

Evidências crescentes de respostas plásticas e adaptação evolutiva em Bd


Em geral, espera-se que patógenos e hospedeiros com uma longa história de coexistência exibam características que permitam a persistência de
ambos os organismos, como virulência de patógenos intermediários e tolerância do hospedeiro [35]. No sistema anfíbio-Bd, as epizootias ocorrem devido
à alta virulência do patógeno e à baixa tolerância ou resistência do hospedeiro (alta suscetibilidade). Isto sugere que, em vez de uma história de
coexistência, cepas virulentas do patógeno foram recentemente introduzidas em populações hospedeiras ingênuas. Contudo, hospedeiros e patógenos
não precisam demonstrar características compatíveis em todos os lugares simultaneamente para que a coevolução tenha ocorrido ou esteja ocorrendo;
mosaicos geográficos de características relevantes para a doença correspondentes e incompatíveis podem, na verdade, ser mais comuns [36]. O padrão de
declínio de espécies de anfíbios devido à quitridiomicose mostra pontos geográficos quentes e frios da doença (Figura 2), com pontos quentes muitas vezes
coincidindo com condições ideais para o patógeno e provável ausência de coevolução hospedeiro-patógeno. Dentro destes pontos críticos, no entanto,
algumas espécies parecem ser naturalmente tolerantes, tais como espécies introduzidas localmente, incluindo a rã africana Xenopus laevis e a rã-touro
norte-americana, Lithobates catesbeianus. Assim, podemos esperar que os hospedeiros sem exposição prévia ao Bd sejam os mais suscetíveis, mas a
suscetibilidade também pode depender de uma série de fatores bióticos e abióticos.

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Figura 2. Distribuição global de genótipos de Bd, declínio de anfíbios devido à quitridiomicose e riqueza de anfíbios. Os dados de genotipagem Bd são das
referências 26, 27, 33, 39, 40••, 59, 71, 80, 81, 82, 83. Os dados de declínio de anfíbios são de Scheele et al., 2019 [7]; e o shapefile de riqueza de
espécies de anfíbios (resolução de 0,25 graus) é de Jetz et al. [84]. O mapa foi construído no QGIS versão 3.24.0-Tisler. Devido à indisponibilidade de
coordenadas geográficas, os dados de genotipagem do Japão foram agrupados por ilhas, e os dados de genotipagem do México de Basanta et al. [71]
foram agrupados em um único diagrama (diagrama maior no México); portanto, estes diagramas não representam a localização exata dos locais de
amostragem. Os pontos pretos no centro dos diagramas indicam genótipos Bd isolados ou genotipados
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de animais em cativeiro.

Como a diversidade da comunidade anfitriã impacta a seleção no Bd e/ou na dinâmica coevolutiva permanecem questões em aberto. Embora os efeitos de diluição tenham sido

demonstrados em laboratório [37], na natureza, a diversidade pode, na verdade, mostrar uma relação positiva com declínios e escala geográfica (Figura 2). Melhorias na genotipagem

genômica do patógeno a partir de esfregaços de pele [38] permitiram uma exploração mais profunda das relações entre o genótipo Bd e a identidade ou genótipo do hospedeiro.

Se a coevolução estiver ocorrendo, esperaríamos encontrar associações entre os genótipos de Bd e tipos de hospedeiros específicos se as linhagens assexuadas de Bd exibissem

preferências de nicho divergentes

congelado por clonalidade, por exemplo, o modelo de variação de nicho congelado [18]. Na verdade, há evidências de que este pode ser o caso. Bd-Brasil existe

na Coréia, mas foi restrito ao L. catesbeianus introduzido [26]. Da mesma forma, os genótipos Bd-Brasil estão super-representados em L. catesbeianus no Japão em comparação com

espécies nativas [39]. A relação entre o genótipo Bd e as espécies hospedeiras foi cuidadosamente explorada por Byrne et al. [40] que mostraram que a identidade das espécies

hospedeiras em duas comunidades de anfíbios norte-americanas era o melhor preditor do genótipo do patógeno: dentro de comunidades com múltiplas espécies hospedeiras, alguns

genótipos de patógenos estavam restritos a hospedeiros específicos. Estas associações podem estar relacionadas com a transmissão interespecífica limitada do patógeno ou

com a adaptação das linhagens clonais a hospedeiros específicos.

A evidência de que o Bd não vê todos os hospedeiros como iguais é clara com base em alguns estudos fundamentais da expressão do gene Bd em diferentes espécies de hospedeiros.

Ellison et al. [41] usaram microdissecção por varredura a laser para mostrar a expressão diferencial de mais de 500 genes Bd após inoculação experimental de dois hospedeiros,

Atelopus zeteki e lêmure Hylomantis. Usando uma grande meta-análise de 137 perfis de RNA-Seq de condições in vitro e in vivo , Torres-Sanchéz et al. [42] mostraram variabilidade nas

transcrições de acordo com a espécie hospedeira; curiosamente, os perfis de transcritos de Bd de hospedeiros suscetíveis eram mais semelhantes aos perfis de condições in

vitro . Estes estudos demonstram claramente as respostas plásticas do fungo de acordo com a espécie hospedeira.

As tentativas de determinar a direção da evolução da virulência do Bd mostram resultados contrastantes. Uma meta-análise de experimentos de infecção por múltiplas cepas de Bd

descobriu que linhagens endêmicas apresentavam menor risco de mortalidade geral do que Bd-GPL, independentemente de os hospedeiros coexistirem historicamente com

linhagens endêmicas de Bd, sugerindo que linhagens ancestrais exibem hipovirulência (43). Em contraste, as descobertas de que (1)

O Bd-Asia1 foi mais virulento que o Bd-GPL para hospedeiros com os quais não coexistiu historicamente [44] e (2) o declínio dos anfíbios em África pode ter sido desencadeado pela

propagação da linhagem ancestral Bd-CAPE 45, 46• sugerem que linhagens endêmicas não são universalmente hipovirulentas e o resultado da doença também depende do

hospedeiro e potencialmente de outros fatores. No entanto, faltam estudos que comparem experimentalmente o resultado da doença com linhagens endêmicas e Bd-GPL especificamente

em hospedeiros asiáticos [43]. Mais estudos envolvendo esses hospedeiros que vivenciaram coexistência de longo prazo com o Bd podem contribuir para uma melhor compreensão

da evolução do Bd
virulência.

A evolução dos genótipos Bd pode assumir a forma de mudanças na tolerância ambiental ou diferenças na taxa de crescimento entre as cepas, mas há mais evidências de plasticidade

ampla e sobreposta nas características (47). A coevolução pode ainda estar a acontecer a um nível muito mais profundo, o que pode obscurecer a sua acção na escala de tempo

mais curta da panzoótica em curso. Por exemplo, Bd tem uma história filogenética profunda incorporada entre os quitrídeos saprotróficos [23]; mas como o único patógeno vertebrado do

filo Chytridiomycota, o Bd desenvolveu vários traços genéticos que são mecanismos prováveis de patogenicidade em anfíbios. Estes incluem o enriquecimento de metaloproteases

M36 e proteínas da parede celular CBM18, que são conhecidas por serem reguladas positivamente durante a invasão da pele dos anfíbios [42]. Dado que o Bd pode infectar

uma diversidade de sapos e que este salto evolutivo pode ter sido relativamente recente, pode ser que o seu genoma esteja limitado a vias limitadas de reconhecimento do hospedeiro e

possa utilizar sinais grosseiros para identificar hospedeiros. Uma opção para um sinal molecular é a mucina, um componente da pele dos anfíbios que é conhecido por levar ao

encistamento de zoósporos [48]. Outra opção poderia ser o microbioma da rã, que é conhecido por conter algumas espécies bacterianas centrais consistentes que podem produzir

sinais químicos que indicam possíveis hospedeiros 49, 50.

Evolução adaptativa e variação na resposta imune entre hospedeiros


A investigação relacionou a ampla variação intraespecífica na susceptibilidade à quitridiomicose entre espécies de anfíbios a factores que incluem a ecologia do hospedeiro, a diversidade

do microbioma da pele e a genética do hospedeiro 51, 52, 53. Embora múltiplos factores estejam provavelmente em jogo em hospedeiros que mostram variação na susceptibilidade ao

Bd, tanto teóricos como estudos empíricos demonstraram seleção de genótipos hospedeiros por parasitas. Estudos da diversidade genética do hospedeiro permitem a avaliação da

coevolução hospedeiro-patógeno, mas as perspectivas sobre quais e quantos loci são relevantes expandiram-se nos últimos anos.

Mais de 10 anos de estudos em uma variedade de espécies hospedeiras de todo o mundo mostraram que um locus de classe II do complexo principal de histocompatibilidade (MHC)

de anfíbios está associado às respostas do hospedeiro ao Bd. Acredita-se que uma porção variável do Éxon 2 do MHC II impacta a ligação e apresentação do antígeno para recrutar

células imunes para um local de infecção, tornando este um alvo lógico para seleção por um patógeno.

No entanto, estudos em todo o transcriptoma apontam para uma variedade de regiões genéticas que provavelmente contribuem para as respostas do hospedeiro às infecções por Bd.

Estes incluem genes de integridade da pele e de reparação de feridas, loci envolvidos na apoptose e uma variedade de loci imunogenéticos, incluindo MHC classe I e classe II, regiões

associadas a receptores CD4 e toll-like e genes da via do complemento 54, 55, 56•• . Tornando-se
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está claro que múltiplas regiões genéticas contribuem para as respostas às infecções por Bd.

Dadas estas associações, poderíamos esperar que a robustez da resposta imunitária de um hospedeiro ao Bd correspondesse à susceptibilidade. No
entanto, estudos comparativos entre espécies ou indivíduos que variam na sua susceptibilidade ao Bd mostraram que hospedeiros com respostas imunitárias mais
precoces ou reduzidas (níveis mais baixos de expressão imunogénica) são frequentemente mais propensos a resistir e sobreviver a infecções, enquanto
hospedeiros que apresentam respostas imunitárias relativamente mais fortes mais tarde no decurso da infecção têm maior probabilidade de sucumbir à doença 55,
57, 58. Esta desregulação imunitária pode, na verdade, indicar imunopatologia que conduz à morte de hospedeiros susceptíveis e acrescenta um novo elemento à
nossa compreensão da quitridiomicose.

Além disso, assim como o Bd pode exibir plasticidade na expressão gênica de acordo com a identidade da espécie hospedeira, os hospedeiros podem exibir
plasticidade em suas respostas imunogenômicas à infecção de acordo com a linhagem Bd. Em um experimento comum em um jardim, McDonald et al. [56••]
examinaram a variação da resposta imunogenômica funcional nos estágios iniciais, intermediários e tardios da infecção no sapo-abóbora brasileiro,
Brachycephalus pitanga, quando exposto ao Bd-GPL ou ao Bd-Brasil localmente enzoótico. Eles descobriram que as respostas imunes do hospedeiro
variaram significativamente com a linhagem Bd, e que B. pitanga exibiu uma assinatura de tolerância ao Bd-Brasil. Especificamente, quando expostas ao Bd-
Brasil, as rãs montaram uma resposta imunológica por infecção em estágio intermediário, que foi amplamente resolvida pela infecção em estágio avançado. Em
contraste, a resposta ao Bd-GPL foi adiada até a infecção em estágio avançado e de magnitude mais grave, o que é consistente com a hipótese de que os resultados
graves da doença podem ser devidos à desregulação imunológica no hospedeiro.

Coexistência hospedeiro-patógeno, evidência de recuperação e um salto de esperança

O Bd atingiu níveis enzoóticos em muitas regiões do mundo onde anteriormente causava declínios. Nestas regiões, o agente patogénico já não causa eventos
epizoóticos e o declínio dos anfíbios, apesar de permanecer relativamente prevalente. Enquanto isso, relatos de observações de espécies de anfíbios que se acredita
terem sido extintas devido ao Bd, vários graus de recuperação após declínios associados a doenças e uma nova estabilidade em populações de anfíbios que
foram anteriormente dizimadas pelo Bd estão emergindo de todo o mundo e trazendo esperança para comunidades de conservação de anfíbios 59, 60,
61•, 62, 63, 64. Isto leva-nos à questão: que mecanismos estão a promover a coexistência hospedeiro-patógeno após declínios?

Alguns estudos apoiam a evolução do hospedeiro como um mecanismo que promove a coexistência anfíbio-Bd. Por exemplo, Hollanders et al. [61] monitoraram
populações de Mixophyes fleayi em recuperação e espécies de rãs simpátricas que atualmente coexistem com o Bd enzoótico na Austrália. Ao longo dos 4
anos de seu estudo, eles descobriram que M. fleayi tinha cargas de Bd mais baixas do que rãs de outras espécies simpátricas e eliminou infecções de Bd em
taxas mais altas do que contraíram infecções. Estes resultados sugerem que um aumento na resistência de M. fleayi pode ser responsável pela sua recuperação.
Esses resultados estão alinhados com os achados de Voyles et al. [59], que sugeriram que os hospedeiros desenvolveram resistência com base na evidência de que
os genótipos Bd isolados de uma comunidade pós-epizoótica em recuperação não exibiram atenuação na virulência. Também é sugerido um aumento
na resistência do hospedeiro para a comunidade de anfíbios em El Copé, Panamá. Além das mudanças na comunidade hospedeira, incluindo a ausência de
espécies que são consideradas hospedeiras de amplificação para Bd, a prevalência e a carga de infecção foram reduzidas após surtos de Bd 62, 65. Finalmente,
os avanços nas análises genómicas utilizando a captura de exoma estão revelando mudanças evolutivas nas populações de anfíbios após a Surto de Bd [66]. O
método descobriu diversas variantes de genes de resistência ao Bd relacionados ao sistema imunológico, mantendo a integridade da pele e combatendo a
patogênese do Bd em sobreviventes contemporâneos de Atelopus varius do Panamá (66).

Além da evolução do hospedeiro, os refúgios ambientais e o recrutamento compensatório (um aumento no recrutamento que contraria a diminuição da
sobrevivência) também foram sugeridos como mecanismos-chave para a coexistência anfíbio-Bd em todo o mundo 64, 67. Após eventos epizoóticos de Bd e declínios
de anfíbios na Austrália, elevado recrutamento e condições ambientais desfavoráveis para o crescimento do Bd podem ser responsáveis pela persistência de
quase 20 espécies [64]. No Chile, um estudo das populações da rã altamente suscetível de Darwin do Sul, Rhinoderma darwinii, revelou que uma população
com maior prevalência de Bd apresentava o maior esforço reprodutivo masculino e aumentava o recrutamento em relação a uma população com menor
prevalência de patógenos, levando a um aumento populacional apesar da elevada mortalidade em adultos [67]. Na Venezuela, o tamanho do corpo adulto em
ambos os sexos do sapo arlequim Atelopus cruciger diminuiu após epizootias de Bd [68]. Os autores sugeriram que a reprodução precoce, uma forma de
recrutamento compensatório, poderia ser a chave para a persistência das populações de A. cruciger (68). No entanto, estes mecanismos de persistência são
provavelmente dependentes do contexto e da espécie. Um estudo de recaptura de marcas de longo prazo - antes e depois da chegada de Bd - de cinco
populações de sapos boreais Anaxyrus boreas no Colorado (EUA) não encontrou evidências de recrutamento compensatório [69]. Discernir os mecanismos
subjacentes ao recrutamento compensatório - que pode incluir evolução rápida, plasticidade ou efeitos dependentes da densidade nas características da
história de vida do hospedeiro - continua a ser um desafio fundamental que necessita de mais investigação. Os esforços para caracterizar os mecanismos que
promovem a recuperação do hospedeiro e a coexistência com o Bd estão em curso e ajudarão a informar as estratégias de gestão num mundo pós-epizoótico.

Estudos retrospectivos revelam a coexistência histórica e têm o potencial de impulsionar saltos na compreensão

Estudos retrospectivos usando espécimes de museu para rastrear infecções históricas por Bd complicaram a história original do Bd como uma doença totalmente
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novo patógeno que se espalhou rapidamente e causou epizootias após introduções pontuais no final do século XX. O Bd foi detectado em espécimes de
museu da Costa Rica pelo menos 30 anos antes da infame epizootia ondulatória da década de 1990 [70], bem como da Baixa Califórnia na década de
1890 [71] e do sul da Califórnia na década de 1910 [72], em torno de um século antes das epizootias de Bd na Sierra Nevada da Califórnia. As análises de
genotipagem realizadas em esfregaços de espécimes de museus questionaram ainda mais a ideia de que o Bd-GPL foi recentemente introduzido nas Américas:
o Bd-GPL foi detectado no final de 1800 no Brasil [73] e datado como tendo divergido há mais de 1000 anos em a Sierra Nevada da Califórnia [74].

Espécimes de museu possuem um potencial inestimável para aprofundar nossa compreensão do sistema anfíbio-Bd (Figura 3). Com novas tecnologias,
incluindo técnicas antigas e históricas de extração de DNA [75], ensaios Fluidigm [38] e captura de exoma completo [74], agora podemos rastrear genótipos de
patógenos e hospedeiros retrocedendo no tempo. Esses estudos têm grande potencial para aumentar nossa compreensão dos impactos históricos dos
patógenos nos hospedeiros, com implicações importantes para os esforços de conservação [76]. Por exemplo, o acompanhamento das alterações genéticas do
hospedeiro ao longo do século passado pode fornecer informações sobre como a diversidade genética do hospedeiro influencia a susceptibilidade à
infecção, quais os genes do hospedeiro que são relevantes na determinação dos resultados da doença ao nível da população e quais os alelos do
hospedeiro que podem ser protectores contra novos genótipos de agentes patogénicos. Se os genótipos do patógeno também puderem ser recuperados de
espécimes de museu, a coevolução poderia ser testada rastreando mudanças no genótipo do patógeno associadas a dados epidemiológicos ou demográficos do hospedeiro.

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Figura 3. As colecções dos museus oferecem uma diversidade de potenciais vias de investigação, proporcionando uma janela sobre como os agentes patogénicos
e os hospedeiros mudaram ao longo do tempo. Exemplos de aplicações de pesquisa possíveis a partir de coleções de museus. Do lado do patógeno,
as determinações do status, carga e fenótipo da infecção por Bd são possíveis a partir de amostras de museu usando qPCR e/ou histologia; A linhagem
genotípica de Bd pode ser discernida usando ensaios moleculares; e coinfecções com micro ou macroparasitas podem ser avaliadas através de técnicas
moleculares e/ou exame físico das amostras. Do lado do hospedeiro, o genótipo e a imunogenética do hospedeiro, bem como a diversidade do microbioma
associado ao hospedeiro, podem ser avaliados utilizando técnicas históricas e antigas de DNA; os registos de espécimes de museus podem fornecer
informações sobre as mudanças nas comunidades hospedeiras ao longo do tempo através de mudanças nas distribuições de espécies, extirpações locais ou
extinções; e as amostras podem ser usadas para avaliar a condição do hospedeiro e características adaptativas, como tamanho corporal, condição corporal e produção reprodutiva.

Conclusões e direções futuras

Entre os melhores testes de coevolução estão experimentos de infecção com desenhos fatoriais que estimam a virulência relativa de combinações de hospedeiros
e patógenos que atualmente coexistem na natureza ao lado de combinações que não o fazem. Para o sistema anfíbio-Bd, isso envolveria a comparação dos
resultados das doenças para as múltiplas linhagens de Bd, que são geograficamente restritas em espécies de anfíbios que historicamente ocorreram ou não.
Embora esses testes amplos ainda não tenham sido realizados, podemos obter algumas informações de estudos individuais de virulência usando infecção
experimental [43]. Além disso, a potencial dinâmica coevolutiva pode ser inferida a partir da miríade de estudos de campo que fornecem uma estimativa robusta
de onde o Bd ocorre na natureza, bem como dos seus impactos nos seus hospedeiros.

Os resultados das infecções por Bd são dramaticamente diferentes entre espécies e comunidades hospedeiras, com muitos fatores determinando
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se a dinâmica é enzoótica ou epizoótica. Primeiro, a diversidade de hospedeiros pode, na verdade, favorecer as epizootias de Bd. Isso ocorre porque se

espera que os patógenos generalistas tenham virulência abaixo do ideal na maioria dos hospedeiros em relação aos especialistas, e a capacidade de infectar vários

hospedeiros libera um patógeno dos limites superiores de virulência. Assim, mais espécies hospedeiras em uma comunidade podem favorecer características que

poderiam promover a evolução da hipervirulência e uma maior probabilidade de que alguns hospedeiros sirvam como reservatórios, superespalhadores ou supertransmissores [77].

Em segundo lugar, a evolução do hospedeiro pode contribuir para a variação na virulência. Por exemplo, os anfíbios asiáticos aparentemente desenvolveram resistência

ao patógeno; embora a virulência do Bd na Ásia possa ter evoluído para um nível ideal dentro de seus hospedeiros endêmicos, o Bd da Ásia permanece

hipervirulento quando introduzido em populações hospedeiras ingênuas. Terceiro, os resultados das doenças estão ligados às diferenças entre as espécies de anfíbios,

mas ainda não temos uma compreensão clara dos mecanismos comuns que impulsionam a susceptibilidade diferencial. Há evidências crescentes de que uma

resposta imunológica forte e retardada pode causar mortalidade em alguns hospedeiros. Quarto, os dados sugerem que tanto os genótipos do patógeno quanto do

hospedeiro são adaptados diferencialmente, fornecendo evidências potenciais de coevolução. As linhagens enzoóticas parecem ser menos virulentas em geral [43], e

alguns genótipos de fungos estão mais associados a espécies hospedeiras específicas [40]. As diferenças genéticas entre as linhagens podem ser explicadas pelo

modelo de variação de nicho congelado, no qual múltiplas linhagens clonais com diferentes preferências de hospedeiro surgem de uma população sexual ancestral.

Esses insights desencadearam novas linhas de investigação. Mais pesquisas são necessárias para compreender a base genética das diferenças na virulência entre os

genótipos de Bd e os fatores de virulência em geral no Bd. Também não temos informações sobre se existe um compromisso entre virulência e transmissão,

bem como se existem compromissos de aptidão entre diferentes hospedeiros, conforme previsto pelo modelo pau para toda obra. Esses dois parâmetros seriam facilmente

testáveis estimando-se a virulência e a produção de zoósporos para múltiplos genótipos de Bd e múltiplas espécies de anfíbios em um experimento de inoculação

fatorial em laboratório. Além disso, ainda nos falta uma compreensão básica do verdadeiro nicho ecológico do Bd. Por exemplo, quanto do nicho está fora do

anfíbio? Se, por exemplo, o hospedeiro primário do Bd não fosse os anfíbios, então não haveria expectativa de que existisse um ótimo de virulência intermediária [20].

Há uma necessidade premente, no entanto, de compreender a base molecular para o processo de reconhecimento e os fatores que limitam o hospedeiro versus não

hospedeiro para Bd e outros fungos patogênicos. Apesar das incertezas remanescentes, é claro que o campo avançou muito na compreensão das origens e evolução

do patógeno e dos seus incontáveis e preciosos hospedeiros.

Que lições a riqueza de conhecimentos sobre a quitridiomicose dos anfíbios nos ensina que podem ser aplicadas a outros patógenos generalistas? Em

primeiro lugar, mesmo que uma pandemia esteja largamente associada a um único clone, pode acontecer que a emergência tenha menos a ver com o clone individual

e mais com a história do agente patogénico e da sua espécie hospedeira. Esta afirmação é verdadeira para as duas doenças mais notórias da vida selvagem, a

quitridiomicose nos anfíbios e a síndrome do nariz branco nos morcegos, em que os surtos se devem em grande parte à susceptibilidade do hospedeiro e à translocação

de agentes patogénicos 14, 78. Uma segunda lição é que, para os agentes patogénicos generalistas, o resgate evolutivo através da evolução do lado do hospedeiro

parece ser a rota mais provável para a sobrevivência da espécie hospedeira do que a evolução da virulência reduzida do patógeno 59, 79. Nesse sentido, as espécies

hospedeiras em maior risco são aquelas com menor potencial evolutivo, como como aqueles com tamanhos populacionais efetivos pequenos. Uma lição final das

investigações do Bd é a constatação de que é fundamental arquivar amostras de museus de uma maneira que possa ser acessada tanto a informação genética do

hospedeiro quanto do patógeno. Desta forma, podemos determinar mudanças nos genótipos do patógeno e do hospedeiro ao longo do tempo, fornecendo informações

sobre a coevolução e informando ações de gestão e conservação no futuro para mitigar os efeitos catastróficos das doenças da vida selvagem.

Declaração de interesse concorrente


Os autores declaram que não têm interesses financeiros concorrentes ou relações pessoais conhecidas que possam ter influenciado o trabalho relatado neste artigo.

Reconhecimentos
Os autores agradecem o generoso apoio do Prêmio Fundação Gordon e Betty Moore nº 9337 (10.37807/GBMF9337), do programa CIFAR Reino Fúngico: Ameaças e

Oportunidades e do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq nº 302834/2020-6).

Artigos de edições especiais Artigos recomendados

Disponibilidade de dados

Nenhum dado foi utilizado para a pesquisa descrita no artigo.

Referências e leituras recomendadas


Artigos de particular interesse, publicados dentro do período de revisão, foram destacados como:
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• de interesse especial

•• de juros pendentes

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hospedeiras e o genótipo Bd através da genotipagem de Bd a partir de esfregaços de diversas espécies hospedeiras. Especificamente, alguns genótipos de Bd estavam

restritos a determinadas espécies de rãs.

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primeiros transcriptomas in vivo de Batrachochytrium dendrobatidis revelam mecanismos de exploração do hospedeiro, expressão gênica
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Usando um conjunto de dados compilado a partir de 14 estudos de expressão do gene Bd e dados de expressão gênica recém-gerados para duas espécies (para

um total de 14 espécies hospedeiras), os autores mostram que a expressão do gene Bd depende da identidade e suscetibilidade do hospedeiro. Os genes

candidatos à virulência foram regulados positivamente em hospedeiros suscetíveis, enquanto os genes de defesa e transmissão foram regulados positivamente

em hospedeiros parcialmente ou não suscetíveis. Curiosamente, a expressão do gene Bd em hospedeiros suscetíveis se assemelhava mais à expressão do gene Bd in vitro.

43•• AM Belasen, ID Russell, KR Zamudio, MC Bletz Linhagens

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Este artigo produziu uma meta-análise de todos os experimentos publicados sobre infecção por múltiplas cepas Bd para testar os efeitos do genótipo da cepa no

resultado da infecção. As análises mostraram que geralmente as linhagens enzoóticas de Bd são menos virulentas que a linhagem panzoótica global

(GPL). Testes de adaptação recente usando cepas locais de GPL em comparação com cepas não locais não encontraram efeito entre os estudos, fornecendo

pouca evidência de atenuação da virulência do Bd devido à coexistência.

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Neste artigo, os autores utilizaram conjuntos de dados históricos e contemporâneos de ocorrência de Bd para construir uma linha temporal abrangente

abrangendo 165 anos, lançando luz sobre as interacções entre hospedeiros e o agente patogénico em África. Identificaram eventos epizoóticos de Bd que

poderiam estar potencialmente associados ao declínio dos hospedeiros africanos. Curiosamente, os dados de genotipagem gerados neste estudo sugerem

que estes declínios foram possivelmente causados pela expansão de uma linhagem anteriormente enzoótica (Bd-CAPE) na região.

47 CR Muletz-Wolz, SE Barnett, GV DiRenzo, KR Zamudio, LF Toledo, TY James, KR Lips


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De acordo com as conclusões do estudo, a transição da encistação de Bd, que envolve a mudança de uma célula móvel para uma célula reprodutiva, parece ser

influenciada pela presença de moléculas específicas secretadas pelos seus hospedeiros anfíbios. Quando a mucina anfíbia purificada, o principal

componente do muco, é utilizada, o processo de encistamento começa imediatamente. No entanto, este processo não ocorre quando são empregues

metilcelulose ou açúcares simples semelhantes.


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Lutando uma batalha perdida: resposta imunológica vigorosa combatida pela supressão das defesas do hospedeiro por patógenos no
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A ativação imunológica sustentada está associada à suscetibilidade ao fungo quitrídeo anfíbio


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As respostas imunes do hospedeiro a linhagens de patógenos enzoóticos e invasivos variam em magnitude, tempo e eficácia
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Os autores infectaram um sapo endêmico da Mata Atlântica brasileira (Brachycephalus pitanga) com Bd-GPL ou Bd-Brasil localmente endêmico e caracterizaram a

expressão gênica do hospedeiro nos estágios inicial, intermediário e tardio da infecção. Enquanto a infecção pelo Bd-Brasil induziu o pico

regulação positiva no estágio intermediário da infecção, as respostas à infecção por Bd-GPL foram atrasadas e ampliadas, com um nível muito alto de

expressão genética diferencial na fase tardia da infecção. Estes resultados apoiam a hipótese de longa data de que o sistema imunológico

a desregulação desempenha um papel na suscetibilidade do hospedeiro ao Bd.

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Estudo comparativo da resposta do hospedeiro à quitridiomicose em uma espécie de sapo suscetível e resistente
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As redescobertas da rã arlequim fornecem informações sobre a persistência das espécies face ao drástico declínio dos anfíbios
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Populações de rãs recuperadas coexistem com Batrachochytrium dendrobatidis endêmico, apesar da carga dependente
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Neste estudo, os riscos potenciais representados pelo Bd em um estágio enzoótico foram examinados em populações de rãs ameaçadas de extinção.
Mixophyes fleayi na Austrália. Mixophyes fleayi sofreu um declínio como resultado de surtos de Bd, mas agora se recuperou. O
os resultados deste estudo sugerem que populações recuperadas de Mixophyes fleayi exibem rápida eliminação de infecções por Bd e
mantêm cargas mais baixas de Bd em comparação com espécies simpátricas. Estes resultados sugerem fortemente que Mixophyes fleayi pode ter
desenvolveram resistência ao patógeno Bd, possibilitando sua coexistência com esta ameaça.

62 AV Longo, KR Lips, KR Zamudio


Ecologia evolutiva da competência do hospedeiro após um surto de quitrídeos em uma comunidade ingênua de anfíbios
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ÿ Dada a função de Editor Convidado, Tim James não teve envolvimento na revisão por pares do artigo e não tem acesso a informações relativas à sua revisão por pares. Completo
a responsabilidade pelo processo editorial deste artigo foi delegada a Sheng Sun.

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