Disserta Ao Carol8
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Dissertação de Mestrado
BELO HORIZONTE
Fevereiro – 2011
Caroline Pereira Domingueti
BELO HORIZONTE
Fevereiro – 2011
DEDICATÓRIA
Dedico esta dissertação ao meu pai Helder, à minha mãe Rozilene e aos meus irmãos
Helder e Carine que sempre estiveram ao meu lado me apoiando e me incentivando.
Ao meu orientador prof. Dr. Vasco Azevedo pela oportunidade e pela confiança
depositada em mim;
Ao meu co-orientador prof. Dr. Anderson Miyoshi pelos ensinamentos e pela grande
ajuda fornecida;
Aos colegas do LGCM por contribuírem para o meu crescimento científico e por me
auxiliarem na realização dos experimentos;
À minha família e aos meus amigos pela torcida por meu sucesso e felicidade;
E principalmente, aos meus pais por sempre terem acreditado e confiado em mim.
SUMÁRIO
LISTA DE FIGURAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . I
LISTA DE TABELAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . V
LISTA DE ABREVIATURAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . VI
RESUMO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1
ABSTRACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2
1. INTRODUÇÃO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3
1.1 Linfadenite caseosa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.1.1 Impactos econômicos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
1.1.2 Patogenia e imunologia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
1.1.3 Epidemiologia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
1.1.4 Transmissão . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
1.1.5 Tratamento . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
1.1.6 Profilaxia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
1.1.6.1 Diagnóstico . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
1.1.6.2 Vacinas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1.1.6.2.1 Vacinas comerciais . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
1.1.6.2.2 Vacinas experimentais . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
1.2 O gênero Corynebacterium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .13
1.3 Corynebacterium pseudotuberculosis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
1.3.1 Aspectos microbiológicos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
1.3.2 Propriedades bioquímicas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
1.3.3 Taxonomia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
1.3.4 Suscetibilidade antimicrobiana . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
1.3.5 Fatores de virulência . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .16
1.3.5.1 Fosfolipase D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
1.3.5.2 Lipídeos tóxicos da parede celular . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .17
1.3.5.3 Novos candidatos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .17
1.4 Fatores sigma bacterianos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
1.4.1 Fatores sigma alternativos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
1.4.2 Fatores sigma de função extracitoplasmática (ECF) . . . . . . . . . . . . 22
1.4.3 Fatores sigma e virulência . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
1.4.4 Fatores sigma alternativos de C. pseudotuberculosis . . . . . . . . . . . 28
1.4.5 Fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28
1.4.5.1 Fator sigma C e ilhas de patogenicidade de C.
pseudotuberculosis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
2. OBJETIVOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33
2.1 Objetivo geral . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
2.2 Objetivos específicos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
3. MATERIAL E MÉTODOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35
3.1 Linhagens bacterianas e condições de cultivo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
3.2 Construção de uma linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o
fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
3.3 Caracterização morfológica, bioquímica e molecular da linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
3.4 Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
3.5 Condições de estresse in vitro . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
3.6 Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem e mutante para o fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
3.7 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem e
mutante para o fator sigma C às condições de estresse in vitro . . . . . . . . . . . . . 42
4. RESULTADOS E DISCUSSÃO . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
4.1 Construção de uma linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o
fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
4.2 Geração de uma linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator
sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
4.3 Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
4.4 Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem e mutante para o fator sigma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
4.5 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem e
mutante para o fator sigma C às condições de estresse in vitro . . . . . . . . . . . . . 52
4.5.1 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C ao estresse oxidativo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
4.5.2 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C ao estresse ácido . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
4.5.3 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C ao estresse osmótico . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
4.5.4 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C ao estresse térmico . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
5. CONCLUSÕES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
6. PERSPECTIVAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
7. REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
8. ANEXOS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
LISTA DE FIGURAS
Figura 1.1. Representação esquemática das regiões conservadas dos fatores sigma
dos grupos 1, 2, 3 e 4 e das regiões promotoras que elas reconhecem. . . . . . . . . . . 19
Figura 1.2. Domínios dos fatores sigma primários (A) e dos fatores sigma ECF (B) e
seqüências consenso das regiões promotoras -35 e -10 reconhecidas por eles. . . . . 21
Figura 1.3. Localização do gene sigC (Cp1002_172) no genoma da linhagem 1002 de
C. pseudotuberculosis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
Figura 1.4. Possíveis regiões promotoras do gene sigC de C. pseudotuberculosis
numa região de 1500 pb à montante do início da ORF deste gene. . . . . . . . . . . . . . . 31
Figura 3.1. Representação esquemática do evento de recombinação homóloga
simples entre o plasmídeo pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) contendo o fragmento do
gene que codifica o fator sigma C e o gene que codifica este fator sigma presente no
cromossomo bacteriano para gerar uma linhagem de C. pseudotuberculosis mutante
para o fator sigma C. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
Figura 3.2. Combinações dos diferentes iniciadores utilizados para confirmar o evento
de recombinação na linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator sigma
C.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
Figura 3.3. Representação esquemática da etapa inicial da curva de crescimento para
avaliação da suscetibilidade de C. pseudotuberculosis a agentes geradores de
estresse. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Figura 3.4. Representação esquemática dos procedimentos adotados para o
monitoramento das curvas de crescimento em intervalos de tempo específicos. . . . 44
Figura 4.1. Confirmação da presença do fragmento do gene que codifica o fator sigma
C no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de digestão com a endonuclease de
restrição EcoRI (Invitrogen®). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Figura 4.2. Confirmação da presença do fragmento do gene que codifica o fator sigma
C no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de PCR. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
Figura 4.3. Ensaio de PCR multiplex para caracterização molecular da linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Figura 4.4. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C através de ensaios de PCR. . . . . 49
Figura 4.5. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fatores sigma C através de um ensaio de PCR
utilizando a combinação dos iniciadores sigCe_F – sigCe_R. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Figura 4.6. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52
I
Figura 4.7. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse oxidativo (H2O2 70mM) em duplicata e quando crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Figura 4.8. Crescimento relativo das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse oxidativo (H2O2 70mM) em relação às bactérias crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
Figura 4.9. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse oxidativo (H2O2 70mM) em duplicata e quando crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Figura 4.10. Viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse oxidativo (H2O2 70mM) em relação às bactérias crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Figura 4.11. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse ácido (pH 5,0) em duplicata e quando crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
Figura 4.12. Crescimento relativo das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse ácido (pH 5,0) em relação às bactérias crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Figura 4.13. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse ácido (pH 5,0) em duplicata e quando crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Figura 4.14. Viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse ácido (pH 5,0) em relação às bactérias crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
Figura 4.15. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse osmótico (NaCl 2,0M) em duplicata e quando crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
II
Figura 4.16. Crescimento relativo das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse osmótico (NaCl 2,0M) em relação às bactérias crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
Figura 4.17. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse osmótico (NaCl 2,0M) em duplicata e quando crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Figura 4.18. Viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse osmótico (NaCl 2,0M) em relação às bactérias crescidas sob
condições normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Figura 4.19. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse térmico (50ºC) em duplicata e quando crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Figura 4.20. Crescimento relativo das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse térmico (50ºC) em relação às bactérias crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Figura 4.21. Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse térmico (50ºC) em duplicata e quando crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
Figura 4.22. Viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002
selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC) quando expostas ao agente
gerador do estresse térmico (50ºC) em relação às bactérias crescidas sob condições
normais (sem estresse). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Figura 8.1. Confirmação da presença dos fragmentos dos genes que codificam os
fatores sigma B, D, H, K e M no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de PCR. . . . 99
Figura 8.2. Confirmação da presença dos fragmentos dos genes que codificam os
fatores sigma B, D, H, K e M no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de digestão
com a endonuclease de restrição EcoRI (Invitrogen®). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 100
Figura 8.3. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma B através de ensaios de PCR. . . . .101
Figura 8.4. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma D através de ensaios de PCR. . . . .102
III
Figura 8.5. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma H através de ensaios de PCR. . . . .103
Figura 8.6 – Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma K através de ensaios de PCR. . . . .104
Figura 8.7. Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma M através de ensaios de PCR. . . . .105
Figura 8.8. Confirmação do evento de recombinação nas linhagens de C.
pseudotuberculosis mutantes para os fatores sigma B, D, H, K e M através de um
ensaio de PCR. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
IV
LISTA DE TABELAS
V
LISTA DE ABREVIATURAS
VI
PCR – Reação em cadeia da polimerase
pH – Potencial hidrogeniônico
pld – Fosfolipase D
qsp – Quantidade suficiente para
rDNA – DNA codificador do RNA ribossômico
rpoB – Subunidade beta da RNA polimerase
RNA – Ácido ribonucléico
rRNA – RNA ribossômico
ROS - Espécies reativas do oxigênio
SDS – Dodecil sulfato de sódio
TNF-α – Fator de necrose tumoral alfa
tRNA – RNA transportador
UFC – Unidade formadora de colônia
µg – Micrograma
µM – Micromolar
µm – Micrômetro
wt – Selvagem
VII
RESUMO
1
ABSTRACT
2
1. INTRODUÇÃO
3
1.1 Linfadenite caseosa
4
perda de peso, redução da lactação e da eficiência reprodutiva dos animais infectados,
e perda do valor comercial das peles. Assim, os prejuízos gerados por esta
enfermidade são de considerável extensão, pois além de afetar uma cultura de
subsistência básica para o pequeno produtor nordestino, traz grandes prejuízos para
as indústrias de derivados da ovinocaprinocultura, devido à redução na produção de
lã, carne e leite, e também à condenação das carcaças e peles dos animais infectados
nos abatedouros (Aiello et al., 1998; Williamson, 2001; Songer, 2005; Dorella et al.,
2009a).
5
em abscessos anos após a infecção inicial. Também podem ocorrer reativações da
doença, com o desenvolvimento de lesões em novos locais após um considerável
período de aparente quiescência (Baird e Fontaine, 2007).
A formação de granulomas é um processo dependente da imunidade adaptiva
que, nesse caso, é complexa e envolve tanto uma resposta imune humoral como
mediada por linfócitos T (Paule, 2003; El-Enbaawy et al., 2005). Pépin e cols. (1994)
observaram que há mais linfócitos T CD8 em granulomas no sítio de inoculação em
comparação com aqueles presentes em linfonodos drenantes. Esta subpopulação de
linfócitos está relacionada com a atividade efetora e citotóxica, podendo atuar como
um mecanismo de proteção antibacteriana para conter a disseminação de macrófagos
infectados.
Diversas citocinas são expressas durante a infecção experimental, entre as
quais se destacam a produção de IL-2 e IL-4 em linfonodos drenantes e de TNF-α e
IFN-γ no sítio de inoculação. Estas citocinas desempenham um papel importante no
desenvolvimento da resposta imune celular, sendo que o IFN-γ possui grande
importância na ativação de macrófagos, os quais são os responsáveis pela eliminação
de patógenos intracelulares (Pépin et al., 1997). De acordo com Jolly (1965), a
resolução da infecção por C. pseudotuberculosis está relacionada com a presença de
macrófagos ativados dentro da lesão.
O papel da resposta imune humoral na proteção contra C. pseudotuberculosis
foi demonstrado em ensaios de imunização passiva, nos quais a administração de
soros antitoxina e antibactéria protegeram camundongos desafiados com a bactéria
(Paule, 2003). Contudo, Irwin e Knight (1975) relataram que a proteção contra C.
pseudotuberculosis é dependente de linfócitos T e está associada com a diminuição
da resposta humoral, ressaltando-se a importância da imunidade mediada por células.
1.1.3 Epidemiologia
6
rebanhos da região norte do estado, onde 84,3% dos produtores relataram ter
problemas decorrentes da patologia (Faria et al., 2004). Estudos epidemiológicos
realizados por nosso grupo de pesquisa indicaram que a prevalência da LC em Minas
Gerais é de aproximadamente 75,8% entre ovinos (Guimarães, 2009) e 78,9% entre
caprinos (Seyffert et al., 2010).
A prevalência da doença apresenta variações quando se analisa o fator
hospedeiro, sendo maior em ovinos do que em caprinos. Contudo, nas duas espécies,
a patologia é mais observada em animais adultos, o que reflete uma maior exposição
aos fatores de risco (Al-Rawashdeh et al., 2000; Radostits et al., 2002). Em ovinos, a
raça Merinos e seus mestiços são as mais propensas a desenvolverem a doença, o
que se deve à presença de uma pele mais fina apresentando dobras, o que propicia
maiores lesões por ocasião da tosquia (Radostits et al., 2002).
C. pseudotuberculosis é um patógeno que pode infectar diferentes espécies,
incluindo eqüinos e bovinos (causando linfangite ulcerativa), camelos, lhamasju,
búfalos e humanos (Peel et al., 1997; Selim, 2001; Williamson, 2001; Yeruham et al.,
2004). A infecção humana causada por C. pseudotuberculosis é um evento raro, mas
demonstra o potencial zoonótico desta bactéria. A maioria dos casos relatados em
seres humanos envolveu o contato direto com animais doentes ou a exposição a
produtos animais contaminados, sendo a doença geralmente assoc iada a atividades
profissionais. Já foram relatados aproximadamente 25 casos de infecção em humanos
com este microrganismo (Mills et al., 1997; Peel et al., 1997; Liu et al., 2005), sendo
que a sintomatologia envolve a presença de linfadenite e de abscessos nos nódulos
linfáticos (Peel et al., 1997). O tratamento apenas com antibióticos sistêmicos
geralmente é ineficaz, de modo que a maioria dos casos também requer a excisão
cirúrgica do linfonodo afetado (Baird e Fontaine, 2007).
1.1.4 Transmissão
7
causados tanto por procedimentos de manejo, como tosquia, castração, tratamento do
cordão umbilical e agulhas contaminadas, quanto por fatores naturais, como arbustos
pontiagudos e espinhos (Alves e Pinheiro, 1997).
A transmissão e a disseminação de C. pseudotuberculosis estão relacionadas
com as condições ambientais encontradas nas criações dos animais (Augustine e
Renshaw, 1986; Yeruham et al., 2004). Esta bactéria é resistente em temperaturas
baixas e locais úmidos, podendo sobreviver por oito meses no solo, por quatro meses
em galpões de tosquia e por dois meses em feno e materiais contaminados (Radostits
et al., 2002).
Os principais fatores de risco incluem a falta de higiene das instalações, o
contato direto entre animais infectados, a poeira, os banhos e a tosquia (Radostits et
al., 2002). Na caprino e ovinocultura brasileiras, um importante fator de risco é a
vegetação do Nordeste brasileiro, caracterizada pela presença de espinhos que
podem provocar lesões na pele dos animais (Alves e Pinheiro, 1997). Em bovinos e
bufalinos, há evidências de transmissão da bactéria por mosca doméstica e por outros
dípteros (Yeruham et al., 1996; Selim, 2001; Yeruham et al., 2004)
1.1.5 Tratamento
1.1.6 Profilaxia
8
cada animal. Galpões, troncos de tosquia e baias de contenção devem ser bem
higienizados e desinfetados (Alves e Pinheiro, 1997). A tosquia deve ser iniciada pelos
animais mais jovens, evitando contato entre eles e os demais. Os animais que
possuem lesões palpáveis devem ser manipulados por último, as feridas na pele
devem ser desinfetadas e agentes bactericidas devem ser adicionados à água
utilizada no banho. Na aquisição dos animais, deve-se levar em consideração o
histórico livre da patologia, e deve-se realizar a quarentena dos mesmos (Radostits et
al., 2002; Scott, 2007).
Outras medidas profiláticas mais drásticas também são sugeridas, como o
sacrifício dos animais que apresentem lesões aparentes ou que sejam soropositivos
em testes diagnósticos. Contudo, estes testes podem gerar resultados falso-positivos,
levando a eliminação de animais não infectados (Radostits et al., 2002; Menzies et al.,
2004).
Assim, o controle da LC deve ser baseado em medidas que impeçam a entrada
e a disseminação do microrganismo nos rebanhos, sendo que a melhor estratégia
consiste na vacinação dos animais saudáveis, juntamente com a identificação e
eliminação dos animais infectados. Para isso, é necessário o desenvolvimento de
vacinas e de testes diagnósticos eficazes, já que ainda não existe uma imunoprofilaxia
ideal para o combate a esta doença. (Piontkowski e Shivvers, 1998; Paton et al., 2003;
Dorella et al., 2006a).
1.1.6.1 Diagnóstico
9
identificação altamente específica do microrganismo de interesse com grande
economia de tempo e de reagentes. Assim, nosso grupo de pesquisa na UFMG
desenvolveu uma nova metodologia, baseada em uma reação de PCR multiplex
(mPCR), para amplificar simultaneamente, seqüências de três genes específicos de C.
pseudotuberculosis: 16S rDNA (RNA ribossômico 16S), que é o gene de escolha na
maioria dos estudos de taxonomia bacteriana; rpoB (subunidade beta da RNA
polimerase), um gene que vem sendo amplamente utilizado em análises filogenéticas
de microrganismos dos gêneros Mycobacterium e Corynebacterium; e pld (fosfolipase
D), que codifica uma exotoxina associada com a virulência de C. pseudotuberculosis,
C. ulcerans e Arcanobacterium haemolyticum. Através da utilização deste teste de
mPCR associado a um método de extração de DNA bacteriano diretamente do
material purulento, foi possível detectar C. pseudotuberculosis mais rapidamente e de
modo tão específico quanto a cultura bacteriológica seguida por identificação
bioquímica dos isolados, que é considerado pelo Centro Nacional de Referência em
Corynebacterioses, localizado no Instituto Pasteur, o padrão-ouro para o diagnóstico
da LC (Pacheco et al., 2007). Contudo, este método não é capaz de identificar o
microrganismo em amostras sorológicas.
Nos últimos anos, diversos testes sorológicos foram desenvolvidos na tentativa
de superar o problema do diagnóstico subclínico da LC, incluindo o teste de soro-
aglutinação (Awad, 1960), a imunodifusão em gel (Burrel, 1980b; Nain et al., 1984), a
hemaglutinação indireta (Shigidi, 1978), a fixação do complemento (Shigidi, 1979), a
inibição da hemólise (Burrel, 1980a) e diferentes ensaios de ELISA, como ELISAs
indiretos utilizando várias preparações da célula bacteriana, proteínas secretadas e a
toxina de C. pseudotuberculosis (Binns et al., 2007; Dercksen et al., 2000; Carminatti
et al., 2003), ELISA sanduíche com PLD (Ter Laak et al., 1992; Dercksen et al., 2000)
e ELISA para detectar interferon gama (IFN-γ) como um marcador de imunidade
mediada por células contra C. pseudotuberculosis (Menzies et al., 2004; Prescott et
al., 2002). Contudo, a maioria destes testes não possui sensibilidade e especificidade
suficientemente satisfatórias, e não permite a diferenciação entre os animais
infectados e os vacinados.
1.1.6.2 Vacinas
10
reações adversas, e que permita a diferenciação entre animais vacinados e infectados,
tem sido uma prioridade (Dorella et al., 2009). Para isso, diferentes estratégias
vacinais têm sido testadas, como o uso de bactérias atenuadas e mortas (Brogden et
al., 1990; LeaMaster et al., 1987; Simmons et al., 1997; Simmons et al., 1998), frações
contendo antígenos da parede bacteriana (Braga, 2007), sobrenadantes da cultura
bacteriana (Eggleton et al., 1991; Ellis et al., 1991), proteínas recombinantes (Fontaine
et al., 2006; Hodgson et al., 1999; Tachedjian et al., 1995; Moore et al., 2000), vacinas
de DNA (Chaplin et al., 1999) e uma mistura de componentes celulares e
sobrenadantes (El-Enbaawy et al., 2005; Braga, 2007). Essas preparações ofereceram
certo grau de proteção contra infecções experimentais, e até mesmo naturais;
contudo, os níveis de proteção e a severidade das lesões são variáveis.
11
1.1.6.2.2 Vacinas experimentais
12
identificação de genes que codificam proteínas exportadas, como subunidades
fimbriais e adesinas, as quais estão provavelmente envolvidas diretamente com os
processos de entrada e sobrevivência da bactéria nas células hospedeiras,
contribuindo para a sua virulência (Dorella et al., 2006b). Ensaios de imunização
permitiram selecionar um desses mutantes (Cp13) como um candidato promissor para
o desenvolvimento de uma nova vacina viva atenuada contra a LC (Dorella, 2009). O
mutante Cp13 foi capaz de conferir 81% de proteção contra a infecção pela bactéria
selvagem em camundongos, superando o nível de proteção oferecido pela vacina
Glanvac-3 (Pfizer®), comercializada e amplamente utilizada na Austrália (Dorella,
2009). A linhagem Cp13 foi patenteada e nosso grupo de pesquisa na UFMG está
realizando testes-piloto com esta linhagem em caprinos e ovinos para verificar se ela
garante os mesmos níveis de proteção obtidos nos murinos quando desafiados com a
linhagem selvagem.
13
1.3.1 Aspectos microbiológicos
1.3.3 Taxonomia
14
biovar equi (isolado de eqüinos e bovinos; redução de nitrato positiva) do biovar ovis
(isolado de ovinos e caprinos; redução de nitrato negativa). Foi sugerida uma relação
próxima entre C. pseudotuberculosis e C. ulcerans devido ao fato desses organismos
serem os únicos entre as corinebactérias a produzirem fosfolipase D (Groman et al.,
1984; Buck et al., 1985). Além disso, algumas linhagens de C. pseudotuberculosis e C.
ulcerans podem produzir a toxina diftérica, e outras linhagens não-toxigênicas podem
ser convertidas em toxigênicas quando lisogenizadas por fagos β de C. diphteriae
produtora de toxina (Buck et al., 1985; Cianciotto e Groman, 1985; Cianciotto et al.,
1986; Groman et al., 1984).
Métodos moleculares, incluindo hibridização de ácidos nucléicos e análises de
seqüências do gene 16S rDNA foram utilizados para determinar o grau de relação
entre diferentes espécies e linhagens de corinebactérias (Riegel et al., 1995;
Takahashi et al., 1997; Hou et al., 1997; Khamis et al., 2005). Dois estudos
independentes concluíram que C. pseudotuberculosis e C. ulcerans estão
proximamente relacionadas (Hou et al., 1997; Takahashi et al., 1997). Riegels e cols.
(1995) concluíram ainda que os biovares equi e ovis de C. pseudotuberculosis não
devem ser classificados como subespécies, devido à sua grande similaridade
genômica. Recentemente, foi verificado que análises de seqüências do gene rpoB são
mais precisas do que aquelas baseadas no gene 16S rDNA para a identificação de
espécies de corinebactérias (Khamis et al., 2004; Khamis et al., 2005). Contudo, vários
autores sugerem que os dois métodos devem ser complementares em estudos
filogenéticos de espécies de Corynebacterium e Mycobacterium (Mollet et al., 1997;
Kim et al., 1999; Khamis et al., 2004; Khamis et al., 2005).
15
1.3.5 Fatores de virulência
1.3.5.1 Fosfolipase D
16
presente no genoma de C. pseudotuberculosis em cópia única (Egen et al., 1989;
Hodgson et al., 1990; McNamara et al., 1995; Songer et al., 1990)
17
hospedeiro, passando pelo sistema linfático e a replicação no interior de macrófagos,
até o estabelecimento de lesões dentro dos órgãos (McKean et al., 2007a; 2007b).
Diferentemente de patógenos como Mycobacterium tuberculosis e Brucella abortus, C.
pseudotuberculosis não impede a fusão entre o fagossomo e o lisossomo nos
macrófagos (Tashjian e Campbell, 1983). Ao invés disso, esta bactéria é capaz de
resistir ao ambiente extremamente hostil do fagolisossomo, caracterizado pela
presença de baixo pH, alta atividade proteolítica e grande potencial oxidativo, e ainda
mata as células fagocíticas infectadas dentro de poucas horas (Tashjian e Campbell,
1983; Rohde et al., 2007; McKean et al., 2007b). Certamente, mudanças na expressão
gênica desempenham um papel importante nas adaptações e modificações
necessárias para o desenvolvimento de uma infecção bem-sucedida por este
patógeno.
18
o genoma rico em G + C, como Mycobacterium e Corynebacterium (Sachdeva et al.,
2009). Na maioria das espécies que possuem o fator σ54, este é denominado σN e
freqüentemente está envolvido na assimilação do nitrogênio, além de controlar vários
outros processos celulares, como a motilidade, o transporte de nutrientes, a formação
de pili, a sinalização célula-célula e a tolerância ao zinco (Kazmierczak et al., 2005;
Potvin et al., 2007). Já os membros da família σ70 são encontrados em todas as
bactérias (Sachdeva et al., 2009). Os fatores sigma relacionados ao σ70 podem
apresentar até quatro regiões conservadas (regiões 1, 2, 3 e 4), as quais podem ser
divididas em subregiões (figura 1.1). A região 1 está localizada na porção amino-
terminal e contém as subregiões 1.1 e 1.2. A subregião 1.1 apresenta carga negativa e
tem sido relacionada com a inibição da ligação dos fatores sigma livres ao DNA. A
região 2 é composta por quatro subregiões, sendo que a subregião 2.4 é necessária
para o reconhecimento da região promotora -10. A região 3 é compreendida pelas
subregiões 3.0, 3.1 e 3.2. A subregião 3.0 está envolvida com o reconhecimento de
elementos promotores -10 extendidos. Finalmente, a região 4 possui as subregiões 4.1
e 4.2, sendo que a subregião 4.2 é responsável pelo reconhecimento da região
promotora -35 e pela interação com vários ativadores transcricionais. Todas as regiões
contribuem, embora em diferentes extensões, para a ligação do fator sigma a RNA
polimerase (Rodrigue et al., 2006).
19
pela ativação da transcrição da maioria dos genes essenciais ao crescimento
exponencial em meio mínimo, sob condições ótimas de cultivo (genes housekeeping)
(Halgasova et al., 2002). Os fatores sigma do grupo 2 são encontrados em um número
limitado de espécies de bactérias (Proteobacteria, Cyanobacteria e bactérias Gram-
positivas que possuem o genoma rico em G + C) e são proximamente relacionados
aos fatores sigma do grupo 1, embora não sejam essenciais para a sobrevivência das
bactérias e não apresentem a subregião 1.1. Os fatores sigma do grupo 2 mais bem
caracterizados estão envolvidos na transcrição de genes de resposta geral ao estresse
e de sobrevivência na fase estacionária. Os fatores sigma do grupo 3 também
possuem as regiões conservadas 2, 3 e 4, mas estão distantemente relacionados aos
fatores sigma do grupo 1. Os fatores sigma do grupo 3 compreendem proteínas
evolucionariamente relacionadas que possuem funções similares, como resposta ao
estresse térmico, esporulação ou biossíntese de flagelo. O grupo 4 corresponde ao
maior e mais heterogêneo grupo de fatores sigma. Os membros deste grupo, também
descritos como fatores sigma de função extracitoplasmática (ECF), contém apenas as
regiões conservadas 2 e 4. Embora a função de muitos dos fatores sigma deste grupo
ainda seja desconhecida, eles estão freqüentemente envolvidos em condições de
resposta ao estresse, como limitação de ferro, estresse oxidativo e estresse de
superfície celular. Além disso, muitos destes fatores sigma são importantes para a
virulência das bactérias (Rodrigue et al., 2006; Sachdeva et al., 2009).
As eubactérias possuem pelo menos um fator sigma principal ou primário,
pertencente à família σ70, ativador da transcrição da maioria dos genes housekeeping
(Halgasova et al., 2002). Por exemplo, o fator σA de B. subtilis e o fator σ70 codificado
pelo gene rpoD de E. coli são fatores sigma reguladores da transcrição de genes
essenciais às respectivas espécies. Por outro lado, a exposição a determinados
estímulos ambientais pode alterar a transcrição gênica através de um mecanismo no
qual a subunidade σ primária ligada ao cerne da RNA polimerase é substituída por um
fator sigma alternativo (Helmann, 2002; Kazmierczak et al., 2005).
20
de mecanismos de adaptação às mudanças que ocorrem no periplasma e na
membrana da bactéria e no ambiente extracelular (Kazmierczak et al., 2005; Potvin et
al., 2008).
Os fatores sigma primários possuem todos os quatro domínios distintos típicos
das proteínas σ70, designados σ1, σ2, σ3 e σ4. Já os fatores sigma ECF apresentam
apenas os domínios σ2 e σ4, os quais são necessários para a interação com o cerne
da RNA polimerase e para o reconhecimento dos promotores bacterianos. Ao contrário
das seqüências consenso clássicas dos promotores bacterianos reconhecidos pelos
fatores sigma primários, as regiões -35 (‘TTGACA’) e -10 (‘TATAAT’), muitos dos
promotores reconhecidos pelos fatores sigma ECF são caracterizados pela presença
do motivo altamente conservado ‘AAC’ na região -35 e de um agrupamento de
trinucleotídeos ‘CGT’ na região -10 (figura 1.2) (Helman, 2002; Starón et al., 2009).
A região -35 dos promotores reconhecidos por diferentes fatores sigma ECF é
bastante conservada, o que sugere que estes fatores sigma apresentam uma
especificidade promotora muito semelhante. Por outro lado, a região -10 destes
promotores apresenta uma maior variabilidade, o que pode ser explicado pelo baixo
grau de similaridade entre as subregiões 2.4 dos diferentes fatores sigma ECF. Assim,
acredita-se que a especificidade promotora individual dos diferentes fatores sigma
ECF seja determinada pela região 2, que é responsável pelo reconhecimento da
região promotora -10, já que esta região é menos conservada entre estes fatores do
21
que a região 4, que reconhece a região promotora -35. Isto pode contribuir para a
coexistência de múltiplos membros da classe de fatores sigma ECF em uma mesma
espécie, os quais podem regular diferentes grupos de genes (Missiakas e Raina, 1998,
Raivio e Silhavy, 2001).
Um dos primeiros fatores sigma alternativos identificados foi o fator σB de B.
subtilis, o qual pertence à família σ70 e possui domínios protéicos similares aos dos
fatores sigma primários. A expressão gênica global de linhagens de Corynebacterium
glutamicum deficientes e proficientes para o fator σB foi avaliada pelo emprego da
técnica de microarranjo de DNA. Após uma análise detalhada dos genes mais
fortemente ativados por este regulador transcricional, foi observada a presença de
seqüências consenso a -10 nos promotores destes genes idênticas as dos genes
househeeping (Nesvera e Pátek, 2008). Isto sugere que o fator σB deve funcionar
como uma proteína reguladora reserva, já que ele é capaz de ativar a transcrição de
genes cujos promotores são similares aos reconhecidos pelo fator σA.
Vários estudos têm demonstrado que o fator σB está relacionado a mecanismos
gerais de resposta ao estresse. O fator σB de B. subtillis é responsável pela regulação
da transcrição de pelo menos 127 genes envolvidos em diversas funções, dentre as
quais se destacam a resistência ao etanol, às temperaturas elevadas e à acidez
(Kazmierczak et al., 2005). O gene sigB de C. glutamicum é expresso principalmente
durante a transição da fase de crescimento exponencial para a fase estacionária,
enquanto ocorre simultaneamente uma redução da expressão do gene sigA (Larisch et
al., 2007; Nesvera e Pátek, 2008). Várias evidências ainda sugerem que fator σB de C.
glutamicum está envolvido na resposta aos estresses ácido, osmótico, alcoólico e
térmico, sendo o gene sigB provavelmente regulado por um fator sigma ECF (Nesvera
e Pátek, 2008).
Enquanto o fator σB participa da ativação de mecanismos gerais de resposta ao
estresse nas bactérias Gram-positivas, como B. subtillis, L. monocytogenes e M.
tuberculosis, o fator σS desempenha função semelhante nas bactérias Gram-
negativas, como E. coli, Salmonella enterica e Pseudomonas aeruginosa. Além disso,
o fator σS participa da ativação de vários genes necessários para a sobrevivência
destas bactérias durante a fase estacionária (Kazmierczak et al., 2005).
22
membrana/periplasma, as proteínas apresentam uma mobilidade reduzida, há
escassez de ATP e o ambiente é predominantemente oxidante, é necessário um
sistema de resposta ao estresse específico para esta região da célula bacteriana,
sendo que os fatores sigma ECF possuem um importante papel na regulação deste
sistema (Bashyam e Hasnai, 2004; Raivio e Silhavy, 2001).
Os fatores sigma ECF se destacam dentre os fatores sigma alternativos por
compreenderem proteínas que freqüentemente controlam processos relacionados ao
envelope celular bacteriano, incluindo secreção, síntese de exopolissacarídeos,
influxo/efluxo de ferro, e síntese de proteases extracelulares. Tais processos
compõem parte do repertório de invasão do hospedeiro e de fuga do sistema
imunológico utilizado por bactérias patogênicas durante a infecção (Helmann, 2002;
Bashyam e Hasnai, 2004; Jordan et al., 2008).
A transcrição dos genes codificadores de cada fator sigma ECF pode ser
regulada pelo próprio fator σ que está sendo produzido ou por um ou mais fatores σ
distintos. Geralmente os fatores sigma são co-transcritos com um fator anti-sigma
transmembrânico que possui um domínio sensorial extracitoplasmático e um domínio
inibitório intracelular. Os fatores anti-sigma se ligam aos fatores sigma cognatos e os
inibem, atuando como reguladores negativos. Na presença de sinais específicos
gerados devido a modificações no ambiente extracelular, o fator anti-sigma é inativado
por degradação proteolítica ou por modificações conformacionais, acarretando a
liberação do fator sigma cognato, o qual pode então se ligar à RNA polimerase para
estimular a transcrição de genes específicos. A autoregulação positiva que ocorre em
muitos fatores σ serve para amplificar o sinal produzido pela liberação deste fator σ
ativo do complexo inativo σ-anti-σ (Helmann, 2002; Nesvera e Pátek, 2008).
Análises comparativas entre seqüências genômicas bacterianas disponíveis em
bancos de dados revelaram uma ampla variação no número de genes de fatores
sigma ECF entre diversos microrganismos: 0 em Mycoplasma, 2 em E. coli, 7 em B.
subtilis, 10 em M. tuberculosis, 19 em P. aeruginosa, 50 em Streptomyces coelicolor e
83 em Sorangium cellulosum (Helmann, 2002). Dentre as espécies do gênero
Corynebacterium que possuem o genoma completamente seqüenciado, as
patogênicas C. diphtheriae e C. jeikeium apresentam 7 genes de prováveis fatores
sigma ECF, enquanto que as ambientais C. glutamicum e C. efficiens apresentam
somente 5 (Jordan et al., 2008; Stáron et al., 2009).
O número de fatores sigma ECF geralmente se correlaciona com a
variabilidade de ambientes encontrados por uma dada espécie bacteriana. Assim,
apesar do número de fatores sigma ECF geralmente aumentar proporcionalmente com
o aumento do tamanho do genoma, microrganismos que desenvolveram programas de
23
diferenciação, como esporulação, tendem a apresentar maiores taxas de fatores sigma
ECF / tamanho do genoma do que a maioria dos patógenos obrigatórios ou bactérias
comensais (Sachdeva et al., 2009).
Na tentativa de avaliar se há um conjunto mínimo de genes de fatores sigma
ECF necessários para o crescimento vegetativo de B. subtilis, Asai e cols (2008)
mutaram todos os 7 genes de fatores σECF do genoma de uma linhagem desta
bactéria, e verificaram que esta era viável na ausência de estresses, sendo ainda
capaz de esporular como a bactéria selvagem.
O primeiro fator sigma ECF identificado foi o fator σE de E. coli, o qual foi
reconhecido como um segundo fator sigma de resposta ao estresse térmico nesta
bactéria (Kazmierczak et al., 2005). Este fator sigma foi descoberto através de um
estudo realizado com o gene degP de E. coli, o qual consiste em um gene essencial
para o crescimento em temperaturas elevadas, que codifica uma protease
periplasmática. Foi observado que a transcrição deste gene é ativada em
temperaturas elevadas (em torno de 50˚C), e que esta ativação não depende do fator
sigma 32 de resposta ao estresse térmico, o qual ativa a expressão de proteínas
chaperones e de proteases quando há proteínas desnaturadas no citoplasma. Assim,
este estudo revelou que a presença de proteínas desnaturadas no periplasma poderia
induzir a expressão do gene degP através de um mecanismo dependente de um outro
fator sigma de resposta ao estresse térmico, o fator sigma ECF σE (Bashyam e
Hasnain, 2004; Erickson e Gross, 1989; Raivio e Silhavy, 2001).
Um dos fatores sigma ECF de C. glutamicum envolvido na adaptação a
situações geradoras de estresse é o fator σM. Análises de microarranjo de DNA
envolvendo uma linhagem desta bactéria desprovida do fator σM revelaram que este
fator regula a atividade dos genes codificadores das proteínas tiorredoxina (trxC e
trxB1) e tiorredoxina redutase (trxB) e do operon suf, os quais estão envolvidos na
resposta ao estresse oxidativo resultante da modificação de grupos tiol (-SH). Além
disso, o fator σM ativa a expressão de genes que codificam proteínas chaperones
(groES, groEL, clpB ) e proteínas envolvidas na resposta ao estresse térmico (hspR,
dnaJ, grpE). A linhagem de C. glutamicum deficiente para o fator σM ainda apresentou
uma redução na viabilidade celular após a exposição aos estresses térmico e oxidativo
(Nakunst et al., 2007).
A análise de diversas seqüências gênicas revelou que os promotores
reconhecidos pelos fatores σM e σH apresentam seqüências consenso -10 e -35
similares entre si (Nesvera e Pátek, 2008), o que sugere algum envolvimento do fator
σH na resposta ao estresse oxidativo. Através da deleção do gene sigH de C.
glutamicum, Nakunst e cols (2007) demonstraram que a indução dos estresses
24
térmico e oxidativo provocou um aumento da expressão do gene sigM somente na
linhagem selvagem, indicando que este gene é provavelmente regulado pelo fator σH.
Contudo, como os fatores σM e σH reconhecem promotores estruturalmente similares, é
provável que a expressão do gene sigM também seja auto-regulada (Nesvera e Pátek,
2008). Kim e cols (2005) verificaram que uma linhagem de C. glutamicum deficiente
para o fator σH se mostrou mais susceptível aos estresses térmico e oxidativo.
Recentemente, uma linhagem de C. glutamicum deficiente pata o fator σE
tornou-se mais vulnerável a condições de estresse de superfície, como tratamento
com SDS ou lisozima, e ao estresse térmico, além de muito mais sensível a diferentes
antibióticos (Park et al., 2008). Estudos realizados por nosso grupo de pesquisa ainda
demonstraram que uma linhagem de C. pseudotuberculosis deficiente para o fator σE
se tornou mais susceptível aos estresses nitrosativo, ácido e de superfície som SDS
(Pacheco, 2010).
25
uma linhagem mutante atenuada em relação à linhagem selvagem, indicando uma
associação do fator σB com a virulência deste microrganismo (Fouet et al., 2000). Na
tabela 1 podemos encontrar outros exemplos de fatores sigma alternativos envolvidos
na ativação de mecanismos relacionados à virulência.
σ28
FliA C. jejuni, H. pylori, S. enterica var. Typhimurium, V.
cholerae, Y. Enterocolitica
Família σ54
σN C. jejuni, H. pylori, L. monocytogenes, P. aeruginosa, P.
syringae, V. cholerae, V. Parahaemolyticus
Adaptado: Kazmierczak et al., 2005.
26
estresses oxidativo e térmico, também regula a expressão das enzimas da via de
biossíntese do alginato (Potvin et al., 2008; Wood e Ohman, 2009). Similarmente, os
fatores σE de S. enterica var. Typhimurium e de M. tuberculosis também regulam a
expressão de genes que proporcionam resistência ao estresse oxidativo, auxiliando na
sobrevivência da bactéria dentro de macrófagos (Testerman et al., 2002; Manganelli et
al., 2001; Kazmierczak et al., 2005).
Em um estudo envolvendo os fatores sigma ECF, Manganelli e cols (1999)
desenvolveram um sistema de PCR em tempo real que utiliza várias sondas
fluorescentes para avaliar simultaneamente a expressão diferencial dos 10 fatores
sigma ECF presentes no genoma da bactéria M. tuberculosis, sob diversas condições
ambientais. Os fatores σE e σH tiveram níveis de transcrição aumentados após o
choque térmico e o fator σE ainda respondeu ao estresse de superfície celular induzido
por tratamento com SDS.
Estudos posteriores demonstraram que uma linhagem de M. tuberculosis
deficiente para o fator σE era mais susceptível aos estresses térmico, oxidativo e de
superfície induzido por SDS (Manganelli et al., 2001). Além disso, esta linhagem se
mostrou mais sensível à atividade microbicida de macrófagos em cultura e altamente
atenuada em camundongos infectados experimentalmente, indicando a importância
deste fator sigma para a virulência da bactéria (Manganelli et al., 2004). Análises de
microarranjo desta linhagem, quando exposta ao estresse de superfície, revelaram
que o fator σE regula a expressão de enzimas envolvidas na degradação de ácidos
graxos, de algumas proteínas do choque térmico, de genes envolvidos na biossíntese
do ácido micólico e de genes que participam da resposta ao estresse oxidativo, além
de regular a expressão do fator σB (Manganelli et al., 2001).
Através da produção de uma linhagem de M. tuberculosis mutante para o fator
H
σ , foi observado que esta se tornou mais sensível aos estresses térmico e oxidativo
(Mandanelli et al., 2002). Esta linhagem também se mostrou significativamente
atenuada em relação à linhagem selvagem em modelo murino, apesar de ser capaz
de sobreviver e de proliferar no interior de macrófagos, o que indica que este fator
sigma é importante para a virulência da bactéria (Kaushal et al., 2002). Através de
estudos de microarranjo, foi verificado que o fator σH regula a transcrição de proteínas
do choque térmico, do operon trxB2C, que codifica as enzimas tiorredoxina redutase e
tiorredoxina, as quais são importantes para a resposta ao estresse oxidativo, e de
proteínas envolvidas na biossíntese da cisteína e no metabolismo da glicose. Além
disso, o fator σH regula sua própria expressão e a expressão dos fatores σB e σE
(Mandanelli et al., 2002).
27
O fator σK de função extracitoplasmática é conhecido por seus regulons
relativamente pequenos e pelo seu importante papel na regulação da transcrição de
genes codificadores de proteínas imunogênicas, como MPB83 e MPB70, de linhagens
do Bacilo Calmette-Guérin (BCG) de M. bovis, as quais consistem em linhagens
atenuadas da bactéria que são utilizadas na vacinação contra a tuberculose. A
expressão das proteínas MPB83 e MPB70 varia consideravelmente entre as linhagens
do BCG, o que contribui para a grande diversidade observada na resposta a esta
vacina. Foi verificado que uma mutação no códon iniciador do gene sigK está
relacionada à fraca expressão deste gene e, conseqüentemente, a uma menor
produção das proteínas MPB83 e MPB70 em algumas linhagens do BCG (Charlet et
al., 2005). A corinebactéria de interesse biotecnológico C. glutamicum não possui o
fator σK, sugerindo que este pode estar envolvido em algum mecanismo de virulência
em C. pseudotuberculosis.
28
todos os fatores sigma de M. tuberculosis durante a fase exponencial, apesar da maior
parte do cerne da RNA polimerase se encontrar associada com os fatores σA e σB
durante esta fase do crescimento bacteriano. Assim, acredita-se que o fator σC deve
ser traduzido com uma baixa eficiência ou que ele deve apresentar uma baixa
afinidade pelo cerne da RNA polimerase nesta bactéria (Manganelli et al., 1999).
Sun e cols (2004) construíram uma linhagem de M. tuberculosis mutante para o
fator σC e verificaram que este não é essencial para a sobrevivência da bactéria no
interior de macrófagos alveolares ativados ou de macrófagos derivados da medula
óssea de camundongos. Entretanto, esta linhagem deficiente para o fator σC se
mostrou significativamente atenuada em relação à linhagem selvagem em modelo
murino, indicando que este fator sigma desempenha um papel importante para a
virulência da bactéria. Através de um estudo de microarranjo genômico, estes autores
também demonstraram que o fator σC modula a expressão de vários genes associados
à virulência, incluindo os genes hspX, senX3, mtrA e fbpC, os quais codificam um
homólogo de α-cristalina, um sensor histidina kinase de dois componentes, um
regulador transcricional de dois componentes e o antígeno 85C, respectivamente.
Além disso, eles observaram que o fator σC regula a expressão de seu próprio gene e
do gene que codifica o fator σB. Assim, acredita-se que a atenuação da linhagem
mutante para o fator σC pode ser decorrente de uma alteração na regulação da
expressão destes e de outros genes associados à virulência, ou de uma deficiência do
sistema de regulação da transcrição necessário para a virulência da bactéria. Estes
autores também demonstraram que a linhagem de M. tuberculosis deficiente para o
fator σC se prolifera e persiste no tecido pulmonar dos camundongos em níveis
semelhantes à linhagem selvagem; contudo, gerando uma resposta inflamatória
menos acentuada e não causando a morte dos animais. Deste modo, esta linhagem é
capaz de persistir no hospedeiro e estimular a resposta imunológica sem causar
alterações patológicas nos tecidos deste, consistindo assim em um bom candidato
vacinal contra a tuberculose.
Abdul-Majid e cols (2008) observaram que camundongos infectados com a
linhagem de M. tuberculosis mutante para o fator σC apresentaram níveis menores de
citocinas inflamatórias e de infiltrado neutrofílico quando comparado com
camundongos infectados com a linhagem selvagem, sugerindo que a capacidade da
linhagem deficiente para o fator σC de se proliferar e persistir nos pulmões dos
camundongos sem causar danos severos pode ser decorrente da inabilidade do
hospedeiro de desencadear uma resposta imunológica precoce eficaz contra a
bactéria. Assim, alterações nas propriedades antigênicas desta linhagem podem ser
responsáveis pela atenuação da doença no hospedeiro. Através de estudos com
29
cobaias, Karls e cols (2006) verificaram que a linhagem de M. tuberculosis mutante
para o fator σC não acarretou a formação de granulomas necróticos nos pulmões e no
baço destes animais, sugerindo que os genes regulados pelo fator σC desempenham
um papel importante na patogênese e na sobrevivência da bactéria.
Através de mutagênese com o emprego de transposons, Yukawa w cols (2007)
obtiveram linhagens de C. glutamicum mutantes para os fatores sigma B, E, H e M,
mas eles não conseguiram obter linhagens mutantes para os fatores sigma A e C, o
que indica que o fator sigma C deve ser essencial para a viabilidade desta bactéria.
O gene que codifica o fator sigma C (sigC) está presente em todas as
linhagens de C. pseudotuberculosis seqüenciadas até o momento (linhagens 1002,
C231, FRC41 e I19), sendo que a seqüência de nucleotídeos da matriz aberta de
leitura (do inglês, ORF) deste gene é idêntica entre estas linhagens e ele não está
organizado em operon. Na linhagem 1002 de C. pseudotuberculosis, este gene está
localizado na fita complementar da região genômica compreendida entre 183.855 pb e
184.418 pb (figura 1.3).
30
Figura 1.4 – Possíveis regiões promotoras do gene sigC de C.
pseudotuberculosis numa região de 1500 pb à montante do início da ORF deste
gene. As possíveis regiões promotoras foram identificadas utilizando a ferramente de
bioinformática SoftBerry – BPROM e estão destadas em azul. Os códons de início e
de término da tradução da ORF deste gene estão destacados em vermelho.
31
para a incorporação de DNA por transformação, conjugação ou transdução (Dobrindt
et al., 2004). O estudo das ilhas de patogenicidade pode auxiliar na identificação de
fatores de virulência bacterianos, já que elas apresentam altas concentrações de
genes de virulência, os quais medeiam mecanismos de adesão, invasão, colonização,
proliferação no hospedeiro e evasão do sistema imunológico (Karaolis et al., 1998.
Schumann, 2007).
Através de análises in silico realizadas por nosso grupo de pesquisa, foram
encontradas sete regiões no genoma da linhagem 1002 de C. pseudotuberculosis que
apresentam a maioria ou todas as características de regiões adquiridas
horizontalmente. Além disso, estas regiões estão ausentes no genoma de espécies
não patogênicas pertencentes ao mesmo gênero, como C. glutamicum, e assim, elas
foram classificadas potencialmente como ilhas de patogenicidade de C.
pseudotuberculosis (PICp). Através de análises dos genes presentes nestas ilhas de
patogenicidade, foi verificado que o gene que codifica o fator σC se encontra na PICp5,
o que sugere que o fator σC possa desempenhar um papel importante na virulência
desta bactéria.
Assim, é provável que o fator σC regule a expressão de genes que são
importantes para a resposta de C. pseudotuberculosis a diferentes condições de
estresse ambiental, contribuindo para a sobrevivência e para a virulência desta
bactéria.
32
2. OBJETIVOS
33
2.1 Objetivo geral
34
3. MATERIAL E MÉTODOS
35
3.1 Linhagens bacterianas e condições de cultivo
Iniciador Seqüência
sigC_F 5’-ACCGAGTTCATCCGAGAGAC-3’
sigC_R 5’-GACGTTGGCGATTTTTGCT-3’
36
O fragmento do gene que codifica o fator sigma C amplificado por PCR foi
ligado no plasmídeo pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®), de acordo com as recomendações
do fabricante, e transformado na linhagem Top 10 de E. coli, como previamente
descrito (Sambroock et al., 2001). A seleção dos clones transformantes foi realizada
em meio LB contendo o antibiótico canamicina a 50 µg/mL. Posteriormente, este
plasmídeo foi extraído de alguns clones selecionados de E. coli através de miniprep,
como previamente descrito (Sambroock et al., 2001), e a presença do inserto nestes
foi verificada através de PCR, utilizando os iniciadores e as condições apresentadas
nas tabelas 3.1 e 3.2; e de digestão com a endonuclease de restrição EcoRI
(Invitrogen®). Um clone de E. coli apresentando o fragmento do gene que codifica o
fator sigma C clonado no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) foi selecionado, e grandes
quantidades do plasmídeo foi extraída deste clone utilizando o kit Wizard® Plus
Maxipreps DNA Purification System (Promega®), de acordo com as recomendações do
fabricante. A seqüência do fragmento do gene que codifica o fator sigma C presente
no vetor pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) foi confirmada por seqüenciamento.
O plasmídeo pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) contendo o fragmento do gene que
codifica o fator sigma C foi diretamente transformado na linhagem 1002 de C.
pseudotuberculosis para gerar uma linhagem mutante através de um evento de
recombinação homóloga simples, como previamente descrito (figura 3.1) (Miyoshi et
al., 2002). A seleção dos clones mutantes para o fator sigma C foi realizada em meio
BHI contendo o antibiótico canamicina a 25 µg/mL.
37
Figura 3.1 – Representação esquemática do evento de recombinação homóloga
simples entre o plasmídeo pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) contendo o fragmento
do gene que codifica o fator sigma C e o gene que codifica este fator sigma
presente no cromossomo bacteriano para gerar uma linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C.
38
3.4 Confirmação do evento de recombinação na linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C
Iniciador Seqüência
sigC_F 5’-ATGAAGAACTCGGAACGCG-3’
sigC_R 5’-TTAGGCGCTAGCTGCATTG-3’
sigCe_F 5’-ATGAAGAACTCGGAACGCG-3’
sigCe_R 5’-TTAGGCGCTAGCTGCATTG-3’
Kan_F 5’-ATGATTGAACAAGATGGATTG-3’
Kan_R 5’-TTAATAATTCAGAAGAACTC-3’
pTOPO®2.1 M13_F 5’-GTAAAACGACGGCCAG-3’
pTOPO®2.1 M13_R 5’-CAGGAAACAGCTATGAC-3’
39
Figura 3.2 – Combinações dos diferentes iniciadores utilizados para confirmar o
evento de recombinação na linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o
fator sigma C.
40
Tabela 3.5 – Condições de estresse in vitro e resistência da linhagem 1002 de C.
pseudotuberculosis às diferentes condições de estresse
Condição Método Agente Concentrações Resistência
de gerador de testadas (1002 wt) no
estresse estresse início da
fase log
Estresse Ressuspensão da NaCl 0,5 M > 90%
osmótico cultura em meio 1,0 M 50 – 90%
contendo NaCl. 2,0 M < 50%
2,5 M 0%
Estresse Adição de solução H2O2 500 µM 100%
oxidativo comercial de H2O2 1 mM > 90%
(30 % em H2O – 2,5 mM > 90%
Sigma-Aldrich®) ao 5 mM > 90%
meio de cultura. 10 mM 50 – 90%
25 mM < 50%
40 mM < 50%
50 mM < 50%
70 mM < 50%
100 mM < 50%
150 mM < 50%
200 mM 0%
Estresse Ressuspensão da HCl pH 4,0 0%
ácido cultura em meio pH 4,5 < 50%
acidificado com pH 5,0 < 50%
solução pH 5,5 50 – 90%
concentrada de pH 6,5 50 – 90%
HCl.
Estresse Incubação das Temperatura 55˚C 0%
térmico culturas a 50˚C 50 – 90%
diferentes 4˚C 50 – 90%
temperaturas.
Adaptado: Pacheco, 2010
41
3.7 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem e
mutante para o fator sigma C às condições de estresse in vitro
42
Adaptado: Castro, 2009
Figura 3.3 – Representação esquemática da etapa inicial da curva de
crescimento para avaliação da suscetibilidade de C. pseudotuberculosis a
agentes geradores de estresse. Após a diluição do pré-inóculo (1:100), a DO600nm da
cultura foi regularmente monitorada em espectrofotômetro até atingir ~0,2. Este
momento foi considerado o tempo inicial (T0) da curva, quando houve a divisão da
cultura em três alíquotas e o agente gerador de estresse foi aplicado a duas alíquotas,
consistindo a terceira alíquota em um controle.
43
Adaptado: Castro, 2009
Figura 3.4 – Representação esquemática dos procedimentos adotados para o
monitoramento das curvas de crescimento em intervalos de tempo específicos.
Para todos os tempos definidos (15, 60, 180 e 270 minutos) foram realizadas leituras
de DO600nm em triplicata e diluições seriadas em múltiplos de 10, sendo as três maiores
diluições destas (10-4, 10-5 e 10-6) plaqueadas em duplicata.
44
4. RESULTADOS E DISCUSSÃO
45
4.1 Construção de uma linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator
sigma C
Um fragmento interno do gene que codifica o fator sigma C foi amplificado por
PCR a partir do DNA genômico da linhagem 1002 de C. pseudotuberculosis.
O fragmento do gene que codifica o fator sigma C amplificado por PCR foi
ligado no plasmídeo pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®), e clonado na linhagem Top 10 de
E. coli. Este plasmídeo foi extraído de alguns clones selecionados de E. coli
transformada através de miniprep, e a presença do inserto neste foi verificada através
de PCR e de digestão com a endonuclease de restrição EcoRI (Invitrogen®).
Um clone de E. coli apresentando o fragmento do gene que codifica o fator
sigma C clonado no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) foi selecionado, e grandes
quantidades do plasmídeo foi extraída deste clone através de maxiprep. Na figura 4.1
podemos visualizar o plasmídeo extraído através de maxiprep e a confirmação da
presença do inserto neste através de digestão com a endonuclease de restrição EcoRI
(Invitrogen®), e na figura 4.2 podemos visualizar a confirmação da presença do inserto
neste através de PCR.
1 2 3
46
1 2 3
47
1 2 3 4
48
(tabela 3.5), de modo que foi confirmada a obtenção de uma linhagem de C.
pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
49
1 2 3 4
50
deficiente para o fator sigma E por Pacheco (2010) abrem grandes perspectivas para o
estudo da regulação da expressão gênica em C. pseudotuberculosis. Através do
estudo do transcriptoma destas linhagens mutantes será possível descobrir quais
genes são regulados por cada fator sigma alternativo, e deste modo, construir uma
rede regulatória da expressão gênica nesta bactéria, a qual deve envolver inclusive a
regulação de um fator sigma por outro, e a regulação de outros fatores transcricionais
por fatores sigma alternativos. Além disso, muitos dos genes regulados pelos fatores
sigma alternativos devem consistir em genes de virulência ou em genes associados à
virulência, de modo que o estudo do transcriptoma destas linhagens permitirá a
identificação de novos fatores de virulência de C. pseudotuberculosis, os quais
consistirão em possíveis alvos para o desenvolvimento de vacinas, testes de
diagnóstico e tratamentos mais eficazes para a linfadenite caseosa.
Estudos posteriores que visem à análise da virulência destas linhagens
mutantes em macrófagos e em camundongos poderão nos informar se estas são ou
não atenuadas em relação à linhagem selvagem. Se a interrupção dos fatores sigma
alternativos tiverem tornado estas linhagens atenuadas, elas poderão ser testadas
como possíveis vacinas contra a linfadenite caseosa. Além disso, poderão ser
construídas linhagens de C. pseudotuberculosis mutantes para mais de um fator sigma
alternativo na tentativa de se obter linhagens ainda mais atenuadas, e
conseqüentemente, melhores candidatos vacinais (Sun et al., 2004; Sachdeva et al.,
2009).
51
Figura 4.6 – Curvas de crescimento das linhagens de C. pseudotuberculosis
1002 selvagem (wt) e mutante para o fator sigma C (∆sigC).
52
cristalina, um sensor histidina kinase de dois componentes, um regulador
transcricional de dois componentes e o antígeno 85C, respectivamente, o que também
demonstra a importância deste fator sigma para a virulência da bactéria.
Assim, nós avaliamos a resistência da linhagem mutante para o fator sigma C
aos estresses oxidativo, ácido, osmótico e térmico, os quais consistem em condições
de estresse que C. pseudotuberculosis normalmente encontra no meio ambiente e no
interior do organismo hospedeiro, e às quais esta bactéria precisa responder de modo
rápido e eficaz para conseguir sobreviver, proliferar e causar uma infecção bem-
sucedida.
53
Nas figuras 4.8 e 4.10 podemos visualizar, respectivamente, o crescimento
relativo e a viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C quando expostas ao agente gerador do estresse
oxidativo (H2O2 70mM) em relação às bactérias crescidas sob condições normais.
54
A
55
A
56
A
57
observada uma redução significativa do crescimento destas linhagens 15 minutos
após a adição do agente gerador do estresse oxidativo. Contudo, foi observado que a
linhagem selvagem retorna o crescimento após 60 minutos de exposição ao estresse
oxidativo, enquanto que o crescimento da linhagem mutante continua diminuindo de
modo significativo após 60 e 180 minutos de exposição ao estresse oxidativo e se
mantém reduzido após 270 minutos de exposição a esta condição de estresse.
Após analisar as diferenças na viabilidade relativa entre os tempos sucessivos
de exposição das linhagens 1002 selvagem e mutante para o fator sigma C ao
estresse oxidativo, utilizando-se o Teste T de Student, foi observado que esta
condição de estresse afeta a viabilidade apenas da linhagem mutante, tendo sido
observada uma redução significativa da viabilidade desta linhagem 15 e 60 minutos
após a adição do agente gerador do estresse oxidativo e a viabilidade ainda se
mantém reduzida 180 e 270 minutos após a exposição a esta condição de estresse.
Assim, podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para uma resposta tardia ao estresse oxidativo, já que o crescimento de
ambas as linhagens é afetado imediatamente após a exposição a esta condição de
estresse, mas a linhagem selvagem consegue superar os efeitos gerados pelo
estresse oxidativo e retorna o crescimento após 60 minutos de exposição ao estresse,
enquanto que a linhagem mutante, supostamente devido à deficiência do fator sigma
C, não consegue superar os efeitos gerados pelo estresse oxidativo e não retorna o
seu crescimento normal.
Além disso, após suspender a exposição ao estresse oxidativo, a linhagem
selvagem retorna o seu crescimento normal, de modo que a viabilidade desta
linhagem não é afetada, enquanto que a linhagem mutante não consegue superar os
efeitos gerados pelo estresse oxidativo e não retorna o seu crescimento normal, de
modo que é observada uma redução significativa na viabilidade desta linhagem.
Como a linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C se
mostrou significativamente mais susceptível ao estresse oxidativo do que a linhagem
selvagem, nós podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para a resposta da bactéria a esta condição de estresse, e possivelmente,
para a sua sobrevivência no interior do ambiente extremamente oxidativo dos
macrófagos e para a sua virulência. Provavelmente, este fator sigma deve regular a
expressão de genes associados à virulência que são importantes para a resposta ao
estresse oxidativo e para a sobrevivência da bactéria no interior do fagolisossomo dos
macrófagos. Estudos posteriores que visem analisar a persistência e a virulência desta
linhagem em macrófagos e em camundongos poderão confirmar a importância do fator
sigma C para a sobrevivência e a virulência da bactéria. Através destes estudos,
58
também será possível verificar se a linhagem mutante para o fator sigma C é atenuada
em relação à linhagem selvagem, e se ela consiste em um possível candidato vacinal
contra a linfadenite caseosa.
Através da determinação dos níveis transcricionais dos genes que codificam os
fatores sigma alternativos de C. pseudotuberculosis após a exposição desta ao
estresse oxidativo, Castro (2009) verificou que ocorre um aumento significativo da
expressão do gene que codifica o fator sigma C 15 minutos após a exposição da
bactéria a esta condição de estresse, o que corrobora a importância deste fator sigma
para a resposta ao estresse oxidativo nesta bactéria.
Outros estudos relataram que linhagens de C. glutamicum deficientes para os
fatores sigma H e M se mostraram mais susceptíveis do que a linhagem selvagem ao
estresse oxidativo (Kim et al., 2005; Nakunst et al., 2007) e que linhagens de M.
tuberculosis mutantes para os fatores sigma E e H também se tornaram mais
sensíveis a esta condição de estresse (Manganelli et al., 2001; Manganelli et al.,
2002), o que demonstra a importância dos fatores sigma alternativos para a resposta
bacteriana ao estresse oxidativo.
59
duplicata, para os tempos 15, 60, 180 e 270 minutos após a adição do agente gerador
do estresse ácido (pH 5,0).
Nas figuras 4.12 e 4.14 podemos visualizar, respectivamente, o crescimento
relativo e a viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C quando expostas ao agente gerador do estresse ácido
(pH 5,0) em relação às bactérias crescidas sob condições normais.
60
A
61
A
62
A
63
observado que esta condição de estresse afeta igualmente o crescimento das duas
linhagens e não afeta a viabilidade destas linhagens.
Assim, podemos sugerir que o fator sigma C não deve desempenhar um papel
essencial para a resposta da bactéria ao estresse ácido, ou que outros fatores sigma
alternativos devem atuar, juntamente com o fator sigma C, na resposta a esta
condição de estresse, compensando deste modo, a deficiência deste. Isto é possível
porque diferentes genes que atuam na resposta a uma mesma condição de estresse
podem ser regulados por diferentes fatores sigma, como ocorre com os fatores sigma
X e W de B. subtilis (Helmann, 2002). Além disso, alguns fatores sigma possuem
especificidade promotora muito semelhante, de modo que o mesmo promotor pode ser
reconhecido por mais de um fator sigma, como os fatores sigma E e H de M.
tuberculosis que se ligam a um mesmo promotor para ativar a transcrição do gene
sigB; e um único gene ainda pode apresentar múltiplos promotores, sendo
reconhecido por diferentes fatores sigma , como ocorre com os fatores sigma E e F de
M. tuberculosis na ativação da transcrição do gene sigB (Sachdeva et al., 2009).
64
duplicata, para os tempos 15, 60, 180 e 270 minutos após a adição do agente gerador
do estresse osmótico (NaCl 2,0M).
Nas figuras 4.16 e 4.18 podemos visualizar, respectivamente, o crescimento
relativo e a viabilidade relativa das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C quando expostas ao agente gerador do estresse
osmótico (NaCl 2,0M) em relação às bactérias crescidas sob condições normais.
65
A
66
A
67
A
68
contudo, também ocorre uma redução significativa no crescimento da linhagem
mutante 15 minutos após a exposição ao estresse osmótico, o que não é observado
com a linhagem selvagem, o que indica que a linhagem mutante sofre os efeitos
gerados pelo estresse osmótico mais cedo do que a linhagem selvagem.
Após analisar as diferenças na viabilidade relativa entre os tempos sucessivos
de exposição das linhagens 1002 selvagem e mutante para o fator sigma C ao
estresse osmótico, utilizando-se o Teste T de Student, foi observado que a viabilidade
da linhagem mutante é afetada por esta condição de estresse mais precocemente do
que a viabilidade da linhagem selvagem, sendo que ocorreu uma redução significativa
na viabilidade da linhagem mutante 15 e 60 minutos após a exposição ao estresse
osmótico, enquanto que só ocorreu uma redução significativa na viabilidade da
linhagem selvagem 180 e 270 minutos após a exposição a esta condição de estresse.
Assim, podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para uma resposta precoce ao estresse osmótico, já que o crescimento da
linhagem mutante é afetado imediatamente após a exposição a esta condição de
estresse, o que não é observado com a linhagem selvagem.
Além disso, após suspender a exposição ao estresse osmótico, a linhagem
mutante não consegue superar os efeitos gerados por esta condição de estresse, de
modo que ocorre uma redução significativa na viabilidade desta linhagem 15 e 60
minutos após a exposição ao estresse osmótico, enquanto que a linhagem selvagem
consegue superar os efeitos gerados por esta condição de estresse inicialmente,
ocorrendo uma redução significativa na viabilidade desta linhagem somente 180 e 270
minutos após a exposição ao estresse osmótico.
Como a linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C se
mostrou significativamente mais susceptível ao estresse osmótico do que a linhagem
selvagem, nós podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para a resposta da bactéria a esta condição de estresse e para a sua
capacidade de adaptação ao aumento da osmolaridade do meio. Provavelmente, este
fator sigma deve regular a expressão de genes associados à virulência que são
importantes para a resposta ao estresse osmótico e para a sobrevivência da bactéria
diante das variações da osmolaridade que ocorrem no meio ambiente e no interior do
hospedeiro.
69
4.5.4 Resistência das linhagens de C. pseudotuberculosis 1002 selvagem
e mutante para o fator sigma C ao estresse térmico
70
A
71
A
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A
73
A
74
uma redução significativa no crescimento destas linhagens 60 e 180 minutos após a
exposição ao estresse térmico.
Após analisar as diferenças na viabilidade relativa entre os tempos sucessivos
de exposição das linhagens 1002 selvagem e mutante para o fator sigma C ao
estresse térmico, utilizando-se o Teste T de Student, foi observado que a viabilidade
da linhagem mutante é afetada por esta condição de estresse mais precocemente do
que a viabilidade da linhagem selvagem, sendo que ocorreu uma redução significativa
na viabilidade da linhagem mutante 60 minutos após a exposição ao estresse térmico,
enquanto que só ocorreu uma redução significativa na viabilidade da linhagem
selvagem 180 minutos após a exposição a esta condição de estresse.
Assim, podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para uma resposta tardia ao estresse térmico, já que apesar do
crescimento de ambas as linhagens ser afetado após a exposição a esta condição de
estresse, após suspender a exposição ao estresse térmico, a linhagem mutante não
consegue superar os efeitos gerados por esta condição de estresse, de modo que
ocorre uma redução significativa na viabilidade desta linhagem 60 minutos após a
exposição ao estresse térmico, enquanto que a linhagem selvagem consegue superar
os efeitos gerados por esta condição de estresse inicialmente, ocorrendo uma redução
significativa na viabilidade desta linhagem somente 180 minutos após a exposição ao
estresse térmico.
Como a linhagem de C. pseudotuberculosis mutante para o fator sigma C se
mostrou significativamente mais susceptível ao estresse térmico do que a linhagem
selvagem, nós podemos sugerir que o fator sigma C deve desempenhar um papel
importante para a resposta da bactéria a esta condição de estresse e para a sua
capacidade de adaptação ao aumento da temperatura do meio. Provavelmente, este
fator sigma deve regular a expressão de genes associados à virulência que são
importantes para a resposta ao estresse térmico e para a sobrevivência da bactéria
diante das variações da temperatura que ocorrem no meio ambiente e no interior do
hospedeiro.
Outros trabalhos revelaram que uma linhagem de L. monocytogeneses mutante
para o fator sigma C apresentou uma maior susceptibilidade ao estresse térmico do
que a linhagem selvagem (Chaturongakul et al., 2008), que linhagens de C.
glutamicum deficientes para os fatores sigma H e M se mostraram mais susceptíveis
do que a linhagem selvagem a esta condição de estresse (Kim et al., 2005; Nakunst et
al., 2007) e que linhagens de M. tuberculosis mutantes para os fatores sigma E e H
também se tornaram mais sensíveis a este tipo de estresse (Manganelli et al., 2001;
75
Manganelli et al., 2002), o que demonstra a importância dos fatores sigma alternativos
para a resposta bacteriana ao estresse térmico.
76
5. CONCLUSÕES
77
Através do emprego de um plasmídeo suicida, foi possível a obtenção de
linhagens de C. pseudotuberculosis mutantes para os fatores sigma alternativos B, C,
D, H, K e M, e a obtenção destas linhagens foi confirmada através de ensaios de PCR.
Após avaliar a resistência da linhagem mutante para o fator sigma C aos
estresses oxidativo, ácido, osmótico e térmico, não foi observada uma diferença
significativa na susceptibilidade desta linhagem ao estresse ácido em relação à
linhagem 1002 selvagem.
Contudo, foi verificado que esta linhagem é significativamente mais susceptível
aos estresses oxidativo, osmótico e térmico do que a linhagem 1002 selvagem,
indicando que o fator sigma C deve desempenhar um papel importante para a
resposta da bactéria a estas condições de estresse, e possivelmente, para a sua
sobrevivência no meio ambiente e no interior do hospedeiro e para a sua virulência.
78
6. PERSPECTIVAS
79
Este trabalho abre perspectivas para:
§ Avaliar a resistência das linhagens mutantes para os fatores sigma B, D, H, K e
M a diferentes condições de estresse in vitro;
§ Avaliar a persistência da infecção e da virulência das linhagens mutantes para
os fatores sigma B, C, D, H, K e M em macrófagos e em camundongos;
§ Testar as linhagens mutantes que se tornaram atenuadas em relação à
linhagem 1002 selvagem como possíveis vacinas contra a linfadenite caseosa;
§ Caracterizar o transcriptoma das linhagens mutantes para os fatores sigma B,
C, D, E, H, K e M quando cultivadas sob condições normais e quando expostas a
condições de estresse in vitro;
§ Analisar os genes diferencialmente expressos nas linhagens mutantes em
relação à linhagem 1002 selvagem quando cultivadas sob condições normais e
quando expostas a condições de estresse, com a finalidade de identificar os genes
que são regulados por cada um dos fatores sigma alternativos que são importantes
para a resposta às condições de estresse e para a virulência da bactéria;
§ Construir uma rede regulatória da expressão gênica pelos fatores sigma
alternativos em C. pseudotuberculosis.
80
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94
8. ANEXOS
95
Tabela 8.1 – Iniciadores utilizados para a amplificação dos fragmentos internos
dos genes que codificam os fatores sigma B, D, H, K e M de C.
pseudotuberculosis
Iniciador Seqüência
sigB_F 5’-GAAAAATTTGATTATTCCAAGG-3’
sigB_R 5’-GTCTAAGCCATAACGCATTC-3’
sigD_F 5’-GCCGAAACAGAGACTGAACTC-3’
sigD_R 5’-TCCTGCTCTAATGCCTTGC-3’
sigH_F 5’-TGCAAGAGACCTACATCAAGG-3’
sigH_R 5’-GTTTCAGAACTGTGAGAAGCC-3’
sigK_F 5’-CTTTCCGTTGTAGAGTTACCGGTC-3’
sigK_R 5’-TAATCCATCTCTGACCCAGG-3’
sigM_F 5’-CGACTCTGATCTCGTTCTACAG-3’
sigM_R 5-‘CGGTCGAACTTTTTCTATCTG-3’
96
Tabela 8.3 - Iniciadores utilizados para confirmar o evento de recombinação nas
linhagens de C. pseudotuberculosis mutantes para os fatores sigma B, D, H, K e
M
Iniciador Seqüência
sigB_F 5’-ATGATGACAGAATCATCCAG-3’
sigB_R 5’-TTAGATCGCGTAGGCGCG-3’
sigBe_F 5’-ATGATGACAGAATCATCCAG-3’
sigBe_R 5’-TTAGATCGCGTAGGCGCG-3’
sigD_F 5’-ATGCGAATGATGGAAGAGAAA-3’
sigD_R 5’-TTAGTTCTCCTGCTCTAATG-3’
sigDe_F 5’-ATGCGAATGATGGAAGAGAAA-3’
sigDe_R 5’-TTAGTTCTCCTGCTCTAATG-3’
sigH_F 5’-ATGGCAACGAAAACAACTGA-3’
sigH_R 5’-TTATGCCTTCGCCTTTCCAA-3’
sigHe_F 5’-ATGGCAACGAAAACAACTGA-3’
sigHe_R 5’-TTATGCCTTCGCCTTTCCAA-3’
sigK_F 5’-ATGATTTCCACCCTTTCCGT-3’
sigK_R 5’-TTACACATCTACTACGGCAA-3’
sigKe_F 5’-ATGATTTCCACCCTTTCCGT-3’
sigKe_R 5’-TTACACATCTACTACGGCAA-3’
sigM_F 5’-ATGTCGCTACAAAACGACAC-3’
sigM_R 5’-CTAAAGCTCTTCGAATACGG-3’
sigMe_F 5’-ATGTCGCTACAAAACGACAC-3’
sigMe_R 5’-CTAAAGCTCTTCGAATACGG-3’
Kan_F 5’-ATGATTGAACAAGATGGATTG-3’
Kan_R 5’-TTAATAATTCAGAAGAACTC-3’
pTOPO®2.1 M13_F 5’-GTAAAACGACGGCCAG-3’
pTOPO®2.1 M13_R 5’-CAGGAAACAGCTATGAC-3’
97
Tabela 8.4 - Combinações dos diferentes iniciadores utilizados para confirmar o
evento de recombinação nas linhagens de C. pseudotuberculosis mutantes para
os fatores sigma B, D, H, K e M e tamanho esperado dos fragmentos nas reações
de PCR
Combinação de iniciadores Tamanho esperado
do fragmento na
reação de PCR
Kan_F – Kan_R 794 pb
Kan_F – sigB_F 3326 pb
Kan_F – sigD_R 3426 pb
Kan_F – sigH_R 3377 pb
Kan_F – sigK_R 3403 pb
Kan_F – sigM_R 3344 pb
pTOPO®2.1 M13_F – sigB_R 562 pb
pTOPO®2.1 M13_F – sigD_F 662 pb
pTOPO®2.1 M13_F – sigH_F 613 pb
pTOPO®2.1 M13_F – sigK_F 639 pb
pTOPO®2.1 M13_F – sigM_F 580 pb
pTOPO®2.1 M13_R – sigB_R 540 pb
pTOPO®2.1 M13_R – sigD_R 640 pb
pTOPO®2.1 M13_R – sigH_R 591 pb
pTOPO®2.1 M13_R – sigK_R 617 pb
pTOPO®2.1 M13_R – sigM_R 558 pb
sigBe_F – sigBe_R 5345 pb
sigDe_F – sigDe_R 5042 pb
sigHe_F – sigHe_R 5074 pb
sigKe_F – sigKe_R 5658 pb
sigMe_F – sigMe_R 5038 pb
98
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
Figura 8.1 – Confirmação da presença dos fragmentos dos genes que codificam
os fatores sigma B, D, H, K e M no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de PCR.
Padrão de peso molecular 1Kb Plus DNA Ladder (Invitrogen®) (canaleta 1),
fragmentos dos genes dos fatores sigma B, D, H, K e M amplificados por PCR
(canaletas 2, 4, 6, 8, e 10, respectivamente), controle negativo dos fatores sigma B, D,
H, K e M (canaletas 3, 5, 7, 9 e 11, respectivamente). Os fragmentos dos genes dos
fatores sigma B, D, H, K e M possuem 451 pb, 551 pb, 502 pb, 528 pb e 469 pb,
respectivamente.
99
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
Figura 8.2 – Confirmação da presença dos fragmentos dos genes que codificam
os fatores sigma B, D, H, K e M no pCR®2.1-TOPO® (Invitrogen®) através de
digestão com a endonuclease de restrição EcoRI (Invitrogen®). Padrão de peso
molecular 1Kb Plus DNA Ladder (Invitrogen®) (canaleta 1), plasmídeos contendo os
fragmentos dos genes dos fatores sigma B, D, H, K e M não digeridos (canaletas 2, 4,
6, 8, e 10, respectivamente), plasmídeos contendo os fragmentos dos genes dos
fatores sigma B, D, H, K, e M digeridos (canaletas 3, 5, 7, 9 e 11, respectivamente). Os
fragmentos dos genes dos fatores sigma B, D, H, K e M possuem 451 pb, 551 pb, 502
pb, 528 pb e 469 pb, respectivamente.
100
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
101
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
102
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
103
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
104
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17
105
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
106
fragmento de 5038 pb a partir do DNA genômico da linhagem mutante para o fator
sigma M e um fragmento de 669 pb a partir do DNA genômico da linhagem 1002
selvagem (canaleta 14 – linhagem mutante para o fator sigma M, canaleta 15 –
linhagem 1002 selvagem, canaleta 16 – controle negativo);
107
Caroline Pereira Domingueti
Curriculum Vitae
____________________________________________________________________________
__________
Dados Pessoais
Nome Caroline Pereira Domingueti
Nome em citações bibliográficas DOMINGUETI, C P
Sexo feminino
Endereço eletrônico
e-mail para contato : [email protected]
e-mail alternativo : [email protected]
____________________________________________________________________________
__________
Formação Acadêmica/Titulação
2009 Mestrado em Genética.
Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Belo Horizonte, Brasil
Título: Análise do papel do fator sigma C na resposta de Corynebacterium
pseudotuberculosis a diferentes condições de estresse ambiental.
Orientador: Vasco Ariston de Carvalho Azevedo
Palavras-chave: Corynebacterium pseudotuberculosis, fator sigma C, linhagem mutante,
resposta a estresse, virulência
Áreas do conhecimento : Genética Molecular, de Microorganismos e Biotecnologia
108
____________________________________________________________________________
__________
Atuação profissional
__________________________________________________________________
__________
Atividades
____________________________________________________________________________
__________
Projetos
2009 - Atual Análise do papel do fator sigma C na resposta de Corynebacterium
pseudotuberculosis a diferentes condições de estresse ambiental.
Situação: Em Andamento Natureza: Pesquisa
Alunos envolvidos: Graduação (1); Mestrado acadêmico (2); Doutorado (1);
Integrantes: Caroline Pereira Domingueti; Luis Gustavo Carvalho Pacheco; Thiago Luis de
Paula Castro; Bianca Mendes Souza; Anderson Miyoshi; Vasco de Carvalho Ariston Azevedo
(Responsável); Fernanda de castro Militão
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico-CNPq,
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais-FAPEMIG
109
2006 - 2007 Eventos Trombóticos Arteriais: Avaliação de Polimorfismos no Gene da
Apolipoproteína E em Pacientes Atendidos em Serviço Médico
Especializado em Hemostasia
Situação: Concluído Natureza: Pesquisa
Alunos envolvidos: Graduação (1); Doutorado (1);
Integrantes: Caroline Pereira Domingueti; Lucy; Ana Paula Salles Moura Fernandes
(Responsável); Adriano de Paula Sabino; Maria das Graças Carvalho; Daniel Ribeiro
Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico-CNPq
____________________________________________________________________________
__________
Áreas de atuação
1. Genética Molecular e de Microorganismos
2. Biologia Molecular
3. Farmácia
4. Análises Clínicas e Toxicológicas
____________________________________________________________________________
__________
Idiomas
Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Escreve Bem, Lê Bem
____________________________________________________________________________
__________
Prêmios e títulos
2007 Medalha de Mérito Acadêmico devido ao excelente desempenho acadêmico
no Curso de Farmácia, com obtenção de rendimento semestral global de
4,86, Faculdade de Farmácia - Universidade Federal de Minas Gerais
110
Produção em C, T& A
Produção bibliográfica
111
7. SABINO, A P, CARVALHO, M G, RIBEIRO, D, DOMINGUETI, C P, DUSSE, L. M. S.,
FERNANDES, A P S M
[P-W-441] APOB/APOA-I RATIO IN PATIENTS WITH ISCHEMIC STROKE (IS) AND
PERIPHERAL ARTERIAL DISEASE In: XXI st Congress of the Internacional Society on
Thrombosis and Haemostasis, 2007, Geneva.
CD ROOM. , 2007.
Referências adicionais : Suiça/Inglês. Meio de divulgação: Vários
Apresentação de Trabalho
112
2. DOMINGUETI, C P, SABINO, A P, RIBEIRO, D, CARVALHO, M G, DUSSE, L. M. S.,
FERNANDES, A P S M
Avaliação de Polimorfismos no Gene da Apolipoproteína E em Pacientes Atendidos em
Serviço Médico Especializado em Hemostasia, 2006. (Seminário, Apresentação de
Trabalho)
Áreas do conhecimento : Biologia Molecular,Hematologia
Referências adicionais : Brasil/Português. Meio de divulgação: Vários; Local: Universidade Federal de Minas Gerais;
Cidade: Belo Horizonte; Evento: XV Semana de Iniciação Científica; Inst.promotora/financiadora: Universidade Federal
de Minas Gerais
Eventos
Participação em eventos
113
10. Apresentação de Poster / Painel no(a) XIV Semana de Iniciação Científica, realizada na
Universidade Federal de Minas Gerais, 2005. (Seminário)
“Avaliação de Fatores Genéticos Predisponentes a Trombose Venosa em Pacientes do Estado
de Minas Gerais”.
____________________________________________________________________________
__________
Totais de produção
Produção bibliográfica
Trabalhos publicados em anais de
eventos.................................................. 12
Apresentações de Trabalhos
(Seminário).................................................... 3
Eventos
Participações em eventos
(congresso)...................................................... 1
Participações em eventos
(seminário)...................................................... 3
Participações em eventos
(simpósio)....................................................... 6
Participações em eventos
(encontro)....................................................... 1
114