複合遺跡（ふくごういせき）とは、同一範囲内の地中に、複数の時期・時代にまたがる複数種類の遺構が、層位を異にして重層的に存在している状態を表す考古学用語。またそのような遺跡のことである。これに対し、単一の時代・種類の遺構で構成される遺跡を「単純遺跡」という。
