Fallo de segmentación con openmp en el programa Fortran 90 [duplicado]

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HotDogCannon 2019-11-23 19:38.

Estoy escribiendo un pequeño programa para practicar Fortran 90 y openmp . El siguiente código de ejemplo devuelve un error de segmentación cuando lo compilo, gfortran -fopenmp heat.f90 -o heatpero funciona bien cuando se compila sin la -fopenmpopción. ¿Alguien puede ayudarme a entender por qué sucede esto?

Estoy configurando export OMP_NUM_THREADS=4en mi shell (Bash en Ubuntu en Windows 10)

program heat

    use omp_lib
    implicit none

    integer, parameter :: nx = 1000
    integer, parameter :: ny = 800
    real, parameter :: H = 1.
    real, parameter :: alpha = 1.e-4
    real, parameter :: dt = 0.001
    real, parameter :: physical_time = 50.

    real aspect, L, dx, dy
    real, dimension(nx,ny) :: T

    aspect = real(nx)/real(ny)
    L = H*aspect
    dx = L/real(nx)
    dy = H/real(ny)

    T = initialize_T()
    call evolve_field()

    contains

        function initialize_T() result(T)
            implicit none
            real, parameter :: sigma = 0.2
            integer i, j
            real x, y
            real, dimension(nx,ny) :: T
            do i=1, nx
                do j=1, ny
                    x = real(i)/real(nx)*L
                    y = real(j)/real(ny)*H
                    T(i,j) = 10. + &
                             2.* ( &
                                   1./(2.*3.14*sigma**2.) * &
                                   exp(-1. * ( (x-L/2.)**2. + (y-H/2.)**2. ) / (2.*sigma**2.)) &
                                 )
                enddo
            enddo
        end function initialize_T

        subroutine heat_eqn()
            implicit none
            real, dimension(nx,ny) :: Tn
            real d2Tdx2, d2Tdy2
            integer i, j

            Tn(:,:) = T(:,:)

            !$omp parallel shared(T) private(i,j,d2Tdx2,d2Tdy2) !$omp do
            do i=2, nx-1
                do j=2, ny-1            
                    d2Tdx2 = ( Tn(i+1,j) - 2.*Tn(i,j) + Tn(i-1,j) ) / dx**2.
                    d2Tdy2 = ( Tn(i,j+1) - 2.*Tn(i,j) + Tn(i,j-1) ) / dy**2.
                    T(i,j) =  Tn(i,j) + dt*(alpha*(d2Tdx2 + d2Tdy2))
                end do
            end do
            !$omp end do !$omp end parallel

            T(:, 1)  = T(:, 2)
            T(:, ny) = T(:, ny-1)
            T(1, :)  = T(2, :)
            T(nx, :) = T(nx-1, :)

        end subroutine heat_eqn

        subroutine evolve_field()
            implicit none
            integer ts, total_ts, frames_total, output_period_ts, pic_counter
            real progress_pct
            character(len=16) :: pic_counter_str

            total_ts = ceiling(physical_time/dt)
            frames_total = 30*20
            output_period_ts = int(total_ts/frames_total)

            pic_counter = 0

            do ts = 0, total_ts

                if (mod(ts,output_period_ts) .eq. 0) then

                    progress_pct = 100.*real(ts)/real(total_ts)
                    print '(I8, F7.2, A)', ts, progress_pct, "%"

                    !! -- for plotting

                    !open(3, file="T.dat", access="stream")
                    !write(3) T(:,:)
                    !close(3)

                    !write (pic_counter_str,'(I5.5)') pic_counter
                    !call system('gnuplot -c plot3d.gnu '//trim(pic_counter_str))
                    !pic_counter = pic_counter + 1

                end if

                ! -----

                call heat_eqn()

                ! -----

            end do

        end subroutine evolve_field

end program heat

1 answers

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jacob 2019-11-24 06:37.

Como sugiere evets en los comentarios, el programa se bloquea debido a la escasez de memoria de la pila. Es decir, creó demasiadas matrices automáticas (asignadas en pila) demasiado grandes. Como indicación, puede ejecutar el programa en Valgrind

> gfortran -fopenmp heat.f90
> valgrind ./a.out

Antes de imprimir muchos errores de "escritura no válida", se generará algo como

==31723== Warning: client switching stacks?  SP change: 0x1ffefffbc0 --> 0x1ffecf2740
==31723==          to suppress, use: --max-stackframe=3200128 or greater

La advertencia sobre "pilas de conmutación de clientes" suele estar presente cuando se agota la memoria de la pila.

En un programa del mundo real, usaría allocatablematrices, que no están limitadas artificialmente. Sin embargo, en este caso simple tuve éxito con la bandera -fno-automatic, que evita el uso de matrices automáticas (asignadas en pila), colocándolas en un tipo diferente de memoria en su lugar:

> gfortran -fno-automatic -fopenmp heat.f90
> ./a.out
       0   0.00%
     500   0.17%
    1000   0.33%
    1500   0.50%
...

Puede leer detalles sobre esa opción en la página de manual.

Nota: probé el programa en una distribución de Linux diferente (no en Windows).

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