Pancryptista
A Pancryptista a Cryptistát és a Microheliellát tartalmazó taxon.[1]
Pancryptista | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rendszertani besorolás | ||||||||
|
Morfológia
szerkesztésLegtöbb tagjuknak legfeljebb 2 ostoruk van. Ejektoszómái térfogatuk jelentős részét kitöltik.[2] A Tetrahelia és a Microheliella mitokondriális cristái csőszerűek, míg a Cryptophytáéi és a Palpitomonaséi laposak.[3] A Cryptista átmeneti zónájában 1–3 lemez lehet, de csak az alsó átmeneti lemez.[3]
Élőhely
szerkesztésA Microheliella és a Tetrahelia alacsony sótartalmú vizekben él, előbbi torkolatokban, utóbbi mangrovemocsarakban.[3]
Történet
szerkesztésA Cryptistát 1989-ben írta le először Thomas Cavalier-Smith,[2] majd többször finomítottak meghatározásán. 2019-es csomópontalapú definíciója szerint a Cryptomonas, a Goniomonas, a Katablepharis és a Palpitomonas utolsó közös őséből elágazó klád, és nem használható a neve az olyan csoportokra, melyeknek tagja például a Telonema subtile, a Gephyrocapsa huxleyi, a Chlamydomonas reinhardtii vagy a Glaucocystis nostochinearum.[2]:82
Egy bazális faját, a Palpitomonas bilixet 2010-ben írták le Yabuki, Inagaki és Ishida,[4] a Microheliella marist Cavalier-Smith és Chao 2012-ben írták le.[5]
Cavalier-Smith et al. 2018-as tanulmányában a Microheliella, a Telonema és a Picomonas által alkotott Corbihelia monofíliáját mutatták ki 84% valószínűséggel, és hogy a Minchinia a Cryptista tagja.[6] Ez utóbbiról azonban kiderült, hogy a Rhizaria Endomyxa törzsének tagja.[7]
Adl et al.[2] és Burki et al. 2019-es tanulmányaiban[8] nem szerepelt a Pancryptista mint rendszertani csoport, a Microheliella maris ismeretlen helyzetűként (incertae sedis) szerepelt.
2022-ben megjelent tanulmányában Thomas Cavalier-Smith a Cryptistában létrehozta az Endohelia altörzset a 2012-ben létrehozott Endohelea számára, ide a Microheliella mellett a Tetrahelia pterbica fajt sorolta.[3]
2019-ben Yazaki et al. megállapították, hogy a M. maris annyira különbözik a Cryptistától, hogy annak nem tagja,[9]:29 míg 2022-ben Yazaki et al. a M. marist a Cryptista testvércsoportjaként határozták meg 319, összesen 88 592 aminosavhelyből álló gén alapján. Ezenkívül megállapították, hogy az Archaeplastida a Pancryptista testvércsoportja, ez alapján létrehozva a Cam kládot.[1]
Életmód
szerkesztésA Cryptista bakterivor fagotróf vagy mixotróf élőlényekből áll,[2] a Microheliella maris fagotróf.
Filogenetika
szerkesztésKülső
szerkesztésYazaki et al. 2022-ben a Pancryptista és az Archaeplastida egyesítésével létrehozták a Cam kládot. A Diaphoretickesen belül így helyezkedik el.
Diaphoretickes |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
Belső
szerkesztés319, összesen 88 592 aminosavhelyből álló gén maximális valószínűségen alapuló GlobE-elemzése alapján Yazaki et al. 2022-ben az alábbi elrendezést mutatták ki:[1]
Pancryptista |
| ||||||||||||
Genomika
szerkesztésMagi
szerkesztésCurtis et al. szekvenálták a Guillardia theta magi genomját.[10] Nem ismert, hogy a Palpitomonas bilix rendelkezik-e holocitokróm c-szintázzal, sem az, hogy a Katablepharidaceae vagy a Goniomonada rendelkeznek-e citokróm c-maturázzal.
Mitokondriális
szerkesztésA Palpitomonas bilix ősi citokróm c-maturázzal rendelkezik, genomszerkezete viszont levezetett tulajdonság. Kevés Pancryptista-mitogenomot szekvenáltak: két Cryptophyta-faj mellett a P. bilix genomját szekvenálták. Ez utóbbi közel 76 kbp hosszú lineáris genom, ebből mintegy 16 kbp „egyszer ismétlődő régióban” van, 60 kbp viszont két egymással ellentétes irányú azonos 30 kbp-os régióban. E genom tartalmaz ccmA–ccmC és ccmF citokróm c-maturáz-géneket.[10]
Jegyzetek
szerkesztés- ↑ a b c d Yazaki E, Yabuki A, Imaizumi A, Kume K, Hashimoto T, Inagaki Y (2022. április 13.). „The closest lineage of Archaeplastida is revealed by phylogenomics analyses that include Microheliella maris”. Open Biol 12 (4), 210376. o. DOI:10.1098/rsob.210376. ISSN 2046-2441. PMID 35414259.
- ↑ a b c d e Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJ, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EA, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019. január 1.). „Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes”. The Journal of Eukaryotic Microbiology 66 (1), 4–119. o. DOI:10.1111/jeu.12691. PMID 30257078.
- ↑ a b c d Cavalier-Smith, Thomas (2022. augusztus 14.). „Ciliary transition zone evolution and the root of the eukaryote tree: implications for opisthokont origin and classification of kingdoms Protozoa, Plantae, and Fungi”. Protoplasma 259, 487–593. o. DOI:10.1007/s00709-021-01665-7.
- ↑ Yabuki A, Inagaki Y, Ishida K (2010. október 1.). „Palpitomonas bilix gen. et sp. nov.: A novel deep-branching heterotroph possibly related to Archaeplastida or Hacrobia”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 161 (4), 523–538. o. DOI:10.1016/j.protis.2010.03.001. PMID 20418156.
- ↑ Yabuki, A. (2012). „Microheliella maris (Microhelida ord. n.), an ultrastructurally highly distinctive new axopodial protist species and genus, and the unity of phylum Heliozoa”. Protist 163 (3), 356–388. o. DOI:10.1016/j.protis.2011.10.001. PMID 22153838.
- ↑ Cavalier-Smith, T. (2018. április 17.). „Multigene phylogeny and cell evolution of chromist infrakingdom Rhizaria: contrasting cell organisation of sister phyla Cercozoa and Retaria”. Protoplasma 255 (5), 1517–1574. o. DOI:10.1007/s00709-018-1241-1. PMID 29666938.
- ↑ Minchinia Labbé, 1896. WoRMS. World Register of Marine Species. (Hozzáférés: 2024. július 23.)
- ↑ Burki F, Roger AJ, Brown MW, Simpson AGB (2019. október 9.). „The New Tree of Eukaryotes”. Trends Ecol Evol, 43–55. o. DOI:10.1016/j.tree.2019.08.008. (Hozzáférés: 2024. július 15.)
- ↑ Yazaki E, Imaizumi A, Kume K, Shiratori T, Hashimoto T, Yabuki A, Ishida K-I, Yuji I. „Phylogenomic Analysis Assessing the Positions of “Orphans” Including Microheliella maris”. VIII European Congress of Protistology – ISOP joint meeting. Hozzáférés: 2024. július 23.
- ↑ a b Nishimura Y, Tanifuji G, Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Inagaki Y (2016. október 13.). „Mitochondrial Genome of Palpitomonas bilix: Derived Genome Structure and Ancestral System for Cytochrome c Maturation”. Genome Biol Evol 8 (10), 3090–3098. o. DOI:10.1093/gbe/evw217. PMID 27604877.