Em 2023, a Série D manteve a fórmula de disputa dos últimos anos. Os 64 clubes foram divididos em 8 grupos, onde se enfrentam em turno e returno (14 jogos para cada time). Os quatro mais bem classificados, de cada chave, avançam para a segunda fase, quando começa o mata-mata.

A partir desta fase, a competição passa a ser decidida em jogos de ida e volta. Os futuros semifinalistas garantem o acesso.