Les virus

MCB-20022
 Plan du cours
 Nature et classification des virus
 Propriétés générales des virus
 Structure virale
 Symétrie des capsides
 Diversité génomique
 Réplication virale
 Culture et détection des virus
 Physiopathologie de l’infection
virale

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 Propriétés générales des
virus
 Taille des virions entre 10 et 400 nm
de diamètre
 Organisation très simple
 Parasite intracellulaire obligatoire
 Incapacité de réplication autonome
 Contenu en acides nucléiques (ADN ou
ARN)
 Incapacité de synthétiser des protéines
 Incapacité de générer de l’énergie
 Insensibles aux agents antibactériens
(antibiotiques)

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 Différences entre les virus
et cellules vivantes
 Organisation simple et acellulaire.
 Absence d’ADN ou d’ARN ensemble dans le
même virion.
 Incapacité à se multiplier indépendamment
des cellules et à se diviser comme font les
cellules procaryotes et eucaryotes.
Note: Bien que des bactéries comme les
chlamydies et les rickettsies soient des parasites
intracellulaires obligés comme les virus, ils ne
répondent pas aux deux premiers critères.

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 Taille relative des virus
10 000 nm

cellule eucaryote

noyau cellulaire 2 800 nm

E. coli 2 000 nm

Virus

Rage 150 nm

Influenza et VIH 100 nm

Rhinovirus 70 nm

Polio 27 nm

Note: 1 nm = 10 -9 m
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 VIH

Rhinovirus
(rhume)
Virus du Nil
Occidental
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 Taxonomie des virus animaux à
ADN

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 Taxonomie des virus animaux à
ARN

MCB-20022
 Taxonomie des virus animaux à
ARN

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 Structure virale
 Tous les virions, qu’ils soient entourés
d’une enveloppe ou non, sont construits
autour d’une nucléocapside centrale.
 La nucléocapside est composée d’un
acide nucléique, soit de l’ADN soit de
l’ARN, maintenu dans une coque
protéique appelée capside.
 La capside protège le matériel génétique
viral et favorise ainsi son transfert
éventuel d’une cellule hôte à une autre.

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 Symétrie des capsides
 Certaines capsides sont de forme icosahédrique. Un
icosahèdre est un polyèdre régulier avec 20 faces
triangulaires équilatérales et 12 sommets.
 Certaines capsides sont hélicoïdales en forme de
cylindre protéique creux; elles peuvent être rigides ou
flexibles.
 Les virus complexes sont ceux dont la symétrie de
capside n’est pas totalement icosahédrique ou
hélicoïdale.
 Certains virus possèdent une enveloppe lipidique (une
couche extérieure membranaire entourant la
nucléocapside). Les virus enveloppés sont plutôt
sphériques ou de forme variable même si leur
nucléocapside est icosahédrale ou hélicoïdale.

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 Morphologie des
capsides

Virus de la mosaïque du tabac

Structure du coliphage T4

Icosahèdre

Complex
Hélicoïd e
ale

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 Diversité
génomique
 ADN monocaténaire (Parvoviridae)
 ADN bicaténaire (Adenoviridae,
Baculoviridae, Herpesviridae, Polyomaviridae
et Poxviridae)
 ARN monocaténaire à polarité négative
(Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae et
Rhabdoviridae)
 ARN monocaténaire à polarité positive
(Coronaviridae, Flaviviridae et Picornaviridae)
 ARN monocaténaire donnant un ADN
bicaténaire plus long que le génome
(Retroviridae)
 ARN bicaténaire (Reoviridae)

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 Réplication virale

MCB-20022
 Multiplication des
phages

MCB-20022
 Bactériophage à symétrie
cubique

MCB-20022
 Fixation du
virus à des
récepteurs
complémentair
es
Injection de
l’acide
nucléique dans
la bactérie
Phase d’éclipse (prise
en charge du
métabolisme
cellulaire par l’acide
nucléi-que viral)
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 Synthèse et
assemblage des
capsomères en
capside et insertion
de l’acide nucléique
dans la capside

Libération des
bactériophages
lors de la lyse
cellulaire
MCB-20022
 Multiplication des
virus animaux

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 Étapes du cycle
réplicatif
•Le cycle réplicatif viral peut se
subdiviser conceptuellement en trois
étapes distinctes:
(1)Les évènements précoces
(l'attachement aux cellules cibles, la
pénétration et la décapsidation)
(2)Les évènements de biosynthèse (la
réplication du génome viral, la
transcription et la traduction)
(3)L'assemblage de la particule virale
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  Fixation du virus à des récepteurs
spécifiques à la surface des cellules
sensibles (ex. VIH-1)

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 de la
cellule hôte servant de récepteurs
viraux

Virus Protéine cellulaire de surface

Virus Epstein-Barr Récepteur de la protéine C3d du

complément
Virus de l’hépatite A Alpha 2-macroglobuline
Virus HSV-1 Récepteur du facteur de croissance
fibroblastique
VIH CD4
Poliovirus Molécule d’adhésion cellulaire neuronale
(NCAM)
Virus de la rage Récepteur de l’acétylcholine des
neurones
Rhinovirus ICAM-1
Réovirus, type 3 Récepteur -adrénergique
Virus de la vaccine Récepteur du facteur de croissance
épidermique
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  Modes de pénétration des virus

•Les virus utilisent au moins trois modes d’entrée

différents:
-Chez certains virus nus comme le poliovirus, la
structure de la capside subit des modifications
majeures au moment de l’adsorption à la membrane,
avec pour conséquence la libération du seul acide
nucléique dans le cytoplasme. Suite à l'attachement
du poliovirus à une cellule cible, une des protéines de
la capside (i.e. VP4) est relarguée ce qui a pour effet
d'exposer des résidus hydrophobiques qui sont
normalement cachés à l'intérieur de la particule
virale. L'interaction de tels résidus avec la
membrane de l'endosome peut induire la formation
d'un pore à travers lequel l'ARN viral se fraie un
chemin jusqu'au cytoplasme.
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 Pénétration du virus complet
dans la cellule

Pénétration directe du virus nu

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  Modes de pénétration des virus

-L’enveloppe de certains virus enveloppés comme

celle des paramyxovirus fusionne directement
avec la membrane plasmique cellulaire, la
nucléocapside est ainsi introduite dans la matrice
cytoplasmique. Une polymérase virale, asociée à
la nucléocapside, commence alors la transcription
de l’ARN viral encore encapsidé. Une fusion au
niveau de la membrane plasmique s’observe chez
les virus herpétiques et le VIH.

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 Pénétration du virus complet
dans la cellule (fusion de
l’enveloppe glyco-lipidique)

Spikes = spicules

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  Modes de pénétration des virus
-La majorité des virus enveloppés pénètrent dans les
cellules par une troisième route: un processus
d’endocytoses par récepteur interposé (“receptor-
mediated endocytosis”), les virus sont alors inclus dans
des vésicules tapissées (“coated vesicles”). Les virus
s’attachent aux puits tapissées, régions spécialisées de
la membrane recouverte du côté cytoplasmique par une
protéine appelée clathrine. Les puits se referment alors
pour former des vésicules tapissées remplies de virus,
celles-ci fusionnent avec les lysosomes après
enlèvement de la clathrine. Les enzymes des lysosomes
peuvent aider à la décapsidation du virus. Dans certains
cas, l’enveloppe virale fusionnne avec la membrane
lysosomiale et la capside (qui peut avoir été
partiellement dégradée par les enzymes lysosomiales)
est libérée à l’intérieur du cytoplasme. L’acide
nucléique
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viral peut alors sortir de la capside ou
  Modes de pénétration des virus
-L'endocytose par récepteur interposé est le même
mécanisme qui est utilisé par la cellule pour
s'accaparer des facteurs de croissance, des
hormones peptidiques et autres molécules de haut
poids moléculaire qui ne peuvent traverser la
membrane plasmatique. Les virions qui sont liés à
leurs récepteurs cellulaires de surface sont
transportés latéralement à l'intérieur de la
membrane plasmatique jusqu'aux vésicules
recouvertes de clathrine ('clathrin-coated pits') qui
sont ultimement endocytosées. Par la suite, les
vésicules fusionnent avec un endosome et, à
l'intérieur d'un tel compartiment acidifié, la
décapsidation prend place. Le pH acide de
l'endosome est critique puisque les agents qui
accroissent
MCB-20022 le pH à l'intérieur de l'endosome (ex.
 Pénétration du virus complet
dans la cellule (endocytose)

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 Décapsidation et libération de
l’acide nucléique viral
Détournement des activités
biochimiques cellulaires au
profit de la synthèse des
constituants viraux

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 Assemblage des virus complets et
libération (acquisition de l’enveloppe
lors du passage à travers la
membrane cytoplasmique cellulaire)

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MCB-20022
 Morphologie du VIH

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 Cycle de vie du VIH

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 Culture
virale
 Oeufs embryonés
 Membrane chorio-allantoïdienne
 Cavités amniotique et/ou allantoïdienne
 Vitellus (jaune d’œuf)
 Cellules dérivées de tissus humains
en couche monocellulaire
(observation d’effets cytopathogènes
caractéristiques)
 Bactéries sensibles
(bactériophages) (plages de lyse sur
des tapis bactériens)

MCB-20022
 Détection des
virus
 Culture virale sur des cellules sensibles
 Cellules en culture en milieu synthétique
 Culture sur œufs embryonés
 Détection d’anticorps spécifiques chez
l’hôte infecté
 Test sérologiques [sérum précoce, sérum
tardif (phase aiguë ou latente)]
 Observation en microscopie électronique
 Détection du matériel génétique viral
(PCR)

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 Maladies causées par les
virus
 Virus pneumotropes
 Influenza, adénovirus, rhinovirus, virus
respiratoire syncytial,
 Virus dermotropes
 Variole, rougeole, rubéole, varicelle et
zona
 Virus viscérotropes
 Hépatite, fièvre jaune, gastro-entérite,
HIV, mononucléose
 Virus neurotropes
 Rage, encéphalite et polyomyélite

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 Immunité
antivirale
 Immunité humorale (complément)
 (Immunoglobulines) IgG, IgM et IgA sécrétoire,
actives contre les formes extracellulaires des
virus (lyse de l’enveloppe virale)
 Immunité cellulaire
 Destruction de cellules infectées par les virus
par des cellules T (lymphocytes) cytotoxiques
 Autre réponse immunitaire
spécifique
 L’infection virale induit la production d’interféron
qui inhibe la réplication virale chez les cellules
non infectées (ARN bicaténaire = bon inducteur)

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 Réponse immunitaire en images

La réponse immunitaire débute lorsque qu’un

macrophage rencontre un virus et le processus de
phagocyte est ainsi enclenché.

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 Réponse immunitaire en images (suite)

Le macrophage digère le virus et présente ce dernier

sous la forme de peptides viraux sur la surface
cellulaire dans le contexte des molécules du CMH-II.

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 Réponse immunitaire en images (suite)

Un lymphocyte T auxiliare (CD4+) portant à sa

surface un récepteur des cellules T spécifique pour
l’antigène viral présenté par le macrophage va se
lier à cette cellule présentatrice d’antigène.

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 Réponse immunitaire en images (suite)

Cette interaction cellule-cellule va mener à

l’activation cellulaire et à la production de diverses
substances solubles: l’interleukine (IL)-1 et le
facteur de la nécroses des tissus par le
macrophage et l’IL-2 et l’IFN- par la cellule T
auxiliaire. Le tout aura pour effet d’accroître
encore plus la communication intercellulaire.
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 Réponse immunitaire en images (suite)

L’IL-2 va favoriser la multiplication de d’autres

cellules T auxiliaires. Les cellules T auxiliaires en
prolifération vont produire des substances qui vont
causer la prolifération des cellules B et la
production d’anticorps.
MCB-20022
 Réponse immunitaire en images (suite)

Les anticorps lient les antigènes localisés à la

surface des virions. Une telle opsonisation va
faciliter la destruction des particules virales par
les macrophages et va aussi permettre la
destruction des virus par les composantes du
complément.
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 Réponse immunitaire en images (suite)

Finalement, à mesure que l’infection est sous

contrôle, les cellules T et B activées sont
désactivées par les cellule T suppressives.
Cependant, quelques cellules T de type mémoire
seront conservées dans le but de produire une
réponse plus rapide advenant le cas ou l’hôte
serait en contact ultérieurement avec le même
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 Contrôle des infections virales

 Vaccins antiviraux
(prévention)
 Virus inactivés (traitement thermique
ou au formol) = altération du matériel
génétique sans affecter la capside
 Virus atténués (vivants) : meilleure
stimulation du système immunitaire =
meilleure protection
 Vaccins sous-unitaires (génie
génétique)
MCB-20022

 Contrôle des infections virales

 Drogues antivirales (traitement)

 Amantadine: prévient l’attachement du
virus de l’influenza
 Vidarabine: traitement du zona et de
l’encéphalite causée par le virus de l’Herpès
 Acyclovir : traitement de la varicelle et de
l’herpès génital
 Analogues nucléosidiques et non
nucléosidiques, inhibiteurs de protéase et
inhibiteurs de fusion : agissent à diverses
étapes dy cycle de vie du VIH
 Inhibiteurs enzymatiques : polymérase

MCB-20022
 Vaccin antigrippal (2002-
2003)
 Vaccin viral trivalent, à virion fragmenté,
préparé à partir de virus cultivés dans la
cavité allantoïdienne d’œufs embryonnés de
poule. Le virus est inactivé à la formaldéhyde,
purifié par centrifugation, et fragmenté par le
désoxycholate de sodium et/ou le Triton X-
100. Chaque dose de 0.5 mL contient:
 15µg d ’hémagglutinine de la souche A/ New Caledonia/20/99
(H1N1)
 15µg d ’hémagglutinine de la souche A/ Panama/2007/99 (H3N2)
 15µg d ’hémagglutinine de la souche B/ Hong Kong/330/2001

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 Fonctions cibles des traitements
antiviraux
 Attachement du virus à la
cellule cible
 Transcription du génome viral
 Transcription inverse
 Régulation de la transcription
 Assemblage des ARN transcrits
 Traduction
 Réplication de l’ADN ou de l’ARN
 Assemblage du virion
 Maturation de la particule virale
MCB-20022
 Exemple de
traitement de
l’herpès simplex
Les 3 analogues de nucléosides
actuellement disponibles pour
traiter les infections à HSV
sont le famciclovir, le
valacyclovir et l’acyclovir.
Après absorption, le famciclovir
est tranformé en penciclovir et
le valacyclovir en acyclovir. La
phosphorylation du pencyclovir
et de l’acyclovir en nucléoside
est initiée par la thymidine
kinase du HSV. Sous leur forme
triphosphatée, les molécules
sont incorporées à l’ADN viral
en lieu et place de la
désoxyguanosine (G)
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