TD Biochimie Structurae

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REPUBLIQUE DU CAMEROUN REPUBLIC OF CAMEROON

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UNIVERSITE DE BERTOUA UNIVERSITY OF BERTOUA
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Tél : 222 24 18 01/Fax Phone: 222 24 18 01 /Fax
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FACULTE DE SCIENCES FACULTY OF SCIENCES
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DEPARTEMENT DE CHIMIE-BIOLOGIE

L1CHB
COURS DE BIOCHIMIE 1 (CH111)
(LMD)
FICHE DES TRAVAUX DIRIGES (TD)
Version 2023/2024

Mme MAIDE Colette

Biologiste-Biochimiste

694 308818/651 429 914

Colettemaide95@gmail.com

Biochimie
1 1(CHB121) L1CHB_6 crédits, CM 60h ; TD 20h ; TPE 10h.
T.D 1 : L’eau et les solutions tampons

Exercice 1 : Définitions : Composé polaire, solution tampon, liaison cavalente, liaison


hydrogène, équilibre acido-basique et molécule amphotère.

Exercice 2 : Choisir la ou les lettres correspondant à la bonne réponse

1. L’eau est un liquide inerte représentant :


a- 55% de la matière vivante ; c- 65% de la matière vivante
b- 75 de la matière vivante ; d- 85% de la matière vivante

2. L’eau joue un rôle de solvant polaire grâce à :


a- Sa capacité calorifique élevée ; c- son aptitude à former des liaisons hydrogènes
b- Son degrés de coordination qui est de 4 ; d- sa structure tétrahédrique

3- L’eau possède une chaleur de vaporisation :


a- Plus faible que celle du méthanol ; c-plus élevée que celle du méthanol
b- De 540 cal/g ; d- de 450 cal/g

4- On décide de préparer un tampon pH10 à partir de 100ml d’une solution décimolaire de


CH3CH2NH2 (pKa=10,75) et de 200 mL d’une solution d’HCL. De quel type de tampon
s’agit-il ?
a- Acide fort/Base faible ; b- Base forte/Acide faible ; c- Acide fort/Base conjuguée

5- Quelle sera dans ces conditions la concentration initiale de la solution d’HCL ?


a- 0,022 mol/L ; b- 0,032 mol/L ; c- 0,042 mol/L; d- aucune réponse

6- Quel est l’intervalle de la zone tampon ?


a- 10-10,75 ; b- 9-10 ; c- 9-11 ; 9,75-10,75 et e- 9,75-11,75
NB : les questions 4, 5, 6 sont liées.

T.D 2 : Acides aminés, peptides et protéines

Exercice 1 QCM : répondre par vrai ou faux et justifier les réponses fausses

a- Les acides aminés possèdent une fonction amines, une fonction acide carboxylique et
une chaine variable.
b- Il existe 15 chaines variables possibles.
c- Les acides aminés naturels sont tous sous forme D.
d- Les structures primaires des protéines sont les motifs de bases comme les hélices alpha
ou les coudes.
e- Tous las aa sont synthétisés au sein de l’organisme humain.
f- Toutes les protéines possèdent une structure tertiaire ou quaternaire.

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g- La structure tertiaire correspond à l’agencement dans l’espace de la protéine, tandis
que la structure secondaire est l’enchainement des acides aminés.
h- L’arginine et l’histidine sont des aminoacides indispensables synthétisés par les
plantes.
i- L’isoleucine, le tryptophane et la lysine sont les seuls aminoacides qui doivent être
apportés par la ration alimentaire.
j- Tous les aa trouvés dans les protéines ont un carbone asymétrique.
k- Le tryptophane est 4 fois moins absorbant que la tyrosine.
l- La trypsine est une protéine enzymatique.
m- Le glucose, l’hémoglobine et la myoglobine sont des protéines nutritives et de réserve.

Exercice 2 : Soit les composés suivants (de A à J) dont les structures sont données ci-dessous

1. Nommez-les

A B C

D E F

G H I

2) Parmi ces composés, le (s)quelle (s) appartient au :

a. Groupe 1 : acides aminés aliphatiques


b. Groupe 2 : acides aminés aromatiques
c. Groupe 3 : acides aminés dicarboxyliques et leurs amides
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d. Groupe 4 : acides aminés dibasiques
e. Groupe 5 : acides aminés alcools
f. Groupe 6 : acides aminés soufrés
g. Groupe 7 : iminoacide
Exercice 3 :

1. Citez et explique les méthodes de séparation des acides aminés


2. Nommez les peptides suivant : Val-His-Lys ; Ala- Ser- Lys et Ala- Lys- Asp.
3. Soient les acides aminés suivants: Ala, Asp, Lys.
a- Indiquer la charge nette globale de ces acides aminés à pH 1, à pH 7 et à pH 10.
b- Calculer leur pHi.

T.D 3 : Les glucides

Exercice 1
1. Soit les aldohexoses X, Y et Z dont les structures
sont données ci-après :

Indiquez parmi les propositions celle(s) qui est


exacte :
 a. les composés X et Y sont des épimères
 b. les composés X et Z appartiennent à la série D.
 c. les composés Y et Z sont des énantiomères
 d. le composé Y est présent sous la forme β dans la molécule de lactose
 e. le composé Z est un constituant de l'unité disaccharidique élémentaire de l'acide
hyaluronique

2. Est-t-il vrai qu'un ose


 a. est un polyalcool possédant une fonction pseudoaldéhyde ou pseudocétone
 b. ne possède jamais de groupement hydroxyle
 c. a comme formule générale (CH2O)n
 d. biologiquement important est en majorité de la forme L
 e. possède un pouvoir réducteur

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3. Soit le diholoside

 a. il présente le phénomène de mutarotation


 b. Il contient deux résidus de D-glucopyranose.
 c. La liaison unissant les molécules d'oses est une
liaison osidique.
 d. ce diholoside est abondant dans le lait
 e. Il est hydrolysable par une maltase.

Exercice 2
1. L'ose suivant

 a. est un aldohexose naturel


 b. est l'énantiomère du L glucose
 c. est un épimère du D glucose
 d. est un constituant du saccharose
 e. est un constituant du maltose

2. Le glucose et le galactose sont :


 a- Des épimères
 b- Des énantiomères
 c- Des anomères
 Des aldohexoses
 Des cétohexoses

3. Le D glycéraldéhyde
 a. est un aldotriose
 b. est un intermédiaire de la glycolyse
 c. est un constituant des glycérophospholipides
 d. est un composé réducteur
 e. existe principalement sous forme hémiacétalique

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Exercice 3
1- Soit le β-D-fructofuranosyl(2-1)-D-glucopyran-X.
a. Que doit-on écrire à la place de X
b. Ecrire sa formule semi-développée.

2. Quel type de liaison intervient dans la formation des disaccharides ?


• Les disaccharides les plus abondants sont : le saccharose, le lactose et le maltose.
Quelle est la composition en hexoses de ces diholosides ?
Quelles osidases spécifiques permettent leur hydrolyse ?

T.D 4 : Acides gras et triglycérides

Exercice1
Donner la structure des acides gras suivants :
acides butyrique, palmitique, stéarique, oléique, linoléique, linolénique ,arachidonique.

a. Pourquoi ont-ils un nombre pair de carbones ?


b. Nos cellules peuvent-elles les synthétiser ?
c. Quelle est la différence entre l’acide linolénique et l’acide linoléique ?
d. Comparer leur devenir dans l'organisme.

Exercice 2
Soient les acides gras suivants :
C16:0 , C16:19 , C18:0 , C18:19, C18:29,12
et les points de fusion :
- 5°C , O°C , 13°C , 63°C , 70°C
a. Donner le nom des différents acides gras.
b. Apparier acide gras et point de fusion.
c. Quel aspect structural de ces acides gras peut-être corrélé aux variations des points de
fusion ?
d. Comparer les rôles physiologiques du C18 :0 et du C189,12

Exercice 3
Un triglycéride synthétisable dans l'organisme comporte les acides gras suivants :
• acide stéarique
• acide gras à 18 carbones et 3 doubles liaisons dont la 3ème est entre C9 et C10
• acide palmitique
a. Ecrire la formule complète de ce triglycéride et le produit de son hydrolyse par la lipase
pancréatique.
b. Quelle est sa fonction biologique dans l’organisme.

Exercice 4
Donner le nom de ces deux lipides complexes.
Expliquer leurs fonctions et comparer leurs propriétés
Quels constituants obtient-on après actions enzymatiques spécifiques

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Quels éléments structuraux de ces lipides peut-on retrouver dans la structure des
gangliosides ?

T.D 5 : La structure des acides nucléiques

Exercice 1 : QCM : Répondre par vrai ou faux et justifier votre réponse

1-La molécule d’ADN


a- Est composée de bases azotées, de riboses et de phosphates.
b- Contient des bases azotées pyrimidiques et puriques.
c- Contient autant de bases azotées pyrimidiques que purique
2-Concernant la double hélice d’ADN :
a- C’est un enroulement de deux brins d’ADN parallèles.
b- Chacun de ses brins a une extrémité 5’hydroxyle et une extrémité 3’phosphate.
c- Chaque brin est constitué d’une séquence de bases azotées différente.
d- L’appariement de ses brins est stabilisé par des liaisons covalentes.
3-Les membres d’une paire chromosomique sont
a- Des chromosomes homologues.
b- Des chromosomes sexuels.
c- Hérite tous les deux de la mère.
d- Hérite tous les deux du père.
e- Porteurs d’une information génétique homologue.

Exercice 2
Ecrire les formules développées :
-Des base azotées suivantes : A, U, C et T.
-Des nucléosides suivants Guanosine, désoxythymidine.
-Des nucléotides acide desoxythymidilique et adénosine-5’-triphosphate.

Exercice 3
-Qu’est-ce qu’un pont phosphodiester ?
-Expliquer sur un exemple comment sont obtenus les composés nucléotidiques possédant un
pont phosphodiester intramoléculaire.

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Exercice 4
1) Identifier les bases présentes dans les structures suivantes

2) Parmi ces structures, lesquelles :


a) contiennent du ribose.
b) contiennent du désoxyribose.
c) contiennent une purine.
d) contiennent une pyrimidine
e) contiennent de la guanine.
f) sont des nucléosides.
g) sont des nucléotides.
h) se trouvent dans l’ARN.
i) se trouvent dans l’ADN.

Exercice 5
La séquence 5’ATCGTTCG3’ se rapport à l’un des brins de l’ADN bicaténaire A.
1- A quoi correspondent les valeurs et symboles 5’ et 3’ et quelle est leur signification ?
2- Parmi les poly-nucléotides (A), (B) et (C) ; déterminer celui qui correspond au brin de
l’ADN A, justifier votre reponse.’ATCGTTCG3

A = 5’TAGCAAGC3’ ; B = 5’CGAACGAT3’ et C = 3’CGAACGAT5’

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