Organisation Générale Des Êtres Vivants

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Organisation générale des

êtres vivants
I- Aperçu sur les niveaux d’organisation du monde vivant

1- Le monde vivant

1.1 Les fonctions globales

Un organisme, pour être qualifié de vivant doit être capable de se nourrir, de communiquer et
de se multiplier. Un être vivant possède donc :
➢ Une fonction de nutrition, c'est à dire la capacité d'échanger de la matière au sens large
avec l'environnement et entre ses propres cellules ;
➢ Une fonction de relation qui permet les interactions avec l'environnement ou la
coordination de l'organisme ;
➢ Une fonction de reproduction qui se retrouve au niveau de l'organisme en question mais
également pour une seule cellule. Vous verrez que ces fonctions se retrouvent également
lors de l'étude des systèmes qui composent l’être humain (par exemple le système
digestif exerce la fonction de nutrition).
1.2 La classification du monde vivant

Le monde vivant a été classé en deux catégories suivant la structure de leur unité structurelle
de base : la cellule.

Selon l’organisation cellulaire et moléculaire du vivant, on retrouve ainsi :

➢ Les procaryotes qui se caractérisent par une absence de compartimentation au sein


de la cellule et donc le matériel génétique est directement dans le cytoplasme. Il s'agit des
bactéries, qui peuvent être subdivisées en :
✓ Archéobactéries ou archées : qui sont des bactéries vivantes dans des conditions
extrêmes (en termes de température, pression etc).
✓ Eubactéries : il s'agit des bactéries « classiques » et qui ont colonisé l'ensemble
du globe terrestre.
➢ Les eucaryotes qui se caractérisent par une compartimentation de leurs fonctions
grâce à des membranes au sein même de leurs cellules. Ces organismes possèdent un
noyau qui contient l'information génétique. Chez les eucaryotes, on retrouve :
✓ Les protistes qui sont des eucaryotes unicellulaires regroupant les protophytes
et les protozoaires ;

✓ Les mycètes regroupent les champignons, qu'ils soient unicellulaires (les


levures), pluricellulaires, supérieurs etc ;

✓ Les Végétaux (on parle également de règne végétal) : organismes


pluricellulaires.
✓ Les Animaux (ou règne animal) : tous les organismes appartenant au règne
animal sont également pluricellulaires. Par la suite, nous allons étudier
l’organisation propre au règne animal et particulièrement au corps humain.
➢ Les grandes familles de molécules du vivant

Les cellules sont en grande partie composées d’eau, jusqu’à 90% de leur poids. Toutes les
réactions chimiques qui ont lieu dans les cellules sont en phase aqueuse. L’eau et les sels
minéraux sont les molécules minérales. En s’associant à l’hydrogène, l’oxygène et l’azote
(et d’autres atomes en plus faible quantité) les atomes de carbone forment les 4 grandes
familles de molécules qui composent les cellules : protéines, lipides, glucides et acides
nucléiques. Ce sont les molécules organiques.
MOLÉCULES MINÉRALES : MOLÉCULES ORGANIQUES :
Eau, sels minéraux Protéines, glucides, lipides et acides
nucléiques

• Molécules ne contenant pas de carbone • Molécules à base de carbone sous forme


• Unies par des liaisons ioniques de chaînes carbonées
• De petite taille, peuvent servir de support • Unies par liaisons covalentes
structural aux êtres vivants • Très petites ou très grandes tailles et
• Appelées aussi molécules inorganiques servent de molécules structurantes

➢ Les molécules minérales


✓ L’eau
• Structure de la molécule d’eau :
C’est une petite molécule. L’atome d’oxygène et l’atome d’hydrogène occupent les sommets
d’un triangle. Ils sont liés par des liaisons covalentes.

La molécule d’eau est une molécule polaire : les électrons du nuage électronique sont
inégalement répartis : défaut d’électrons au niveau de l’hydrogène et excès au niveau de
l’oxygène. Cette électronégativité crée un dipôle électrique.

Cette polarité conditionne les interactions avec les autres types de molécules : c’est le caractère
hydrophile (affinité de l’eau pour les molécules polaires et les ions) ou hydrophobe (repousse
les molécules apolaires).
• Loi d’osmose
Le transport de l’eau est passif et obéit à la loi d’osmose. C’est le passage d’un solvant à travers
une membrane hémiperméable (ex : membrane plasmique).
Ce flux s’effectue d’une solution hypotonique (moins concentrée : diluée) vers une solution
hypertonique (plus concentrée) jusqu’à l’équilibre osmotique ou isotonie.

• Les sels minéraux


Chimiquement, ce sont des éléments ionisés chargés soit positivement (cations) ou
négativement (anions). Ils divisés en 2 groupes :
- les éléments principaux ou macroéléments : Ca, P, K, Cl, Na, Mg
- les éléments traces ou oligoéléments : Fe, Zn, Cu, Mn, I, Mo, etc.
Outre le fait qu’ils font partie des os et des dents, ils interviennent dans divers mécanismes :
contrôle de l'équilibre hydrique (pression osmotique), de l'équilibre acide-base (pH), en tant
que catalyseurs de nombreuses réactions métaboliques, entrent dans la composition des
enzymes, des hormones, …
Une carence en sels minéraux chez les plantes peut entrainer des symptômes tels un
ralentissement dans la croissance, des chloroses voir même des nécroses.

• Les molécules organiques


Ce sont des molécules constituées d’un squelette carboné sur lequel se greffent d’autres atomes
comme l’hydrogène, l’oxygène, l’azote et le phosphore … Elles sont classées en 4 grands
groupes : protéines, glucides, lipides et acides nucléiques.
o Les protéines
Ce sont des polymères d’acides aminés (les monomères) liés par une liaison peptidique,
covalente CO-NH. La structure de base des acides aminés est toujours la même :
- Un carbone central sur lequel se greffe un atome d’H, deux groupements : amine et
carboxyle
- Une chaîne latérale qui varie selon les 20 acides aminés.

La succession des acides aminés varie d’une protéine à l’autre. On parle de séquence primaire.
Différentes interactions au sein des chaînes peptidiques donnent une structure secondaire,
tertiaire puis quaternaire aboutissant à une structure tridimensionnelle aboutissant à une
protéine fonctionnelle.
Les protéines se forment par condensation d’acides aminés.

Les polymères se coupent souvent par des réactions d’hydrolyse (hydratation) : Réaction
chimique par laquelle une molécule est coupée par l’addition d’une molécule d’eau. C’est un
processus qui libère de l’énergie.

Il existe deux grands groupes de protéines :

- Protéines de structure : dans les membranes, le cytosquelette …

- Protéines enzymatiques, nécessaires à divers processus métaboliques, ex : protéases,


hydrolases, …

Les protéines peuvent se dénaturer (perdre leur conformation native) sous l’effet de la
chaleur, d’un pH inadéquat ou d’une mauvaise concentration en sels (protéines non
fonctionnelles) et elles peuvent reprendre leur forme si le milieu redevient normal.

La séquence des acides aminés d’une protéine est dictée par un « gène » de l’ADN. Si une
mutation génétique survient, la protéine sera modifiée : mutée.
Il existe des regroupements d'atomes particuliers « accroché » aux squelettes carbonés des
molécules. Ce sont les groupements fonctionnels qui donnent aux molécules une plus grande
réactivité.

o Les glucides

Ce sont des molécules, appelées aussi sucres, composées de C, H, O selon la formule brute
(CH2O)n. Ce sont des molécules hydrophiles.

Selon l’arrangement des atomes, on distingue plusieurs isomères qui n’ont pas les mêmes
propriétés.

En fonction du nombre de monosaccharides, on distingue les disaccharides : association de


2 monosaccharides (maltose) et les polysaccharides : association de plusieurs
monosaccharides pour former des polymères (amidon, glycogène, cellulose).
o Rôle des glucides

Essentiellement, rôle de réserve (graines), énergie pour la cellule, composants de la paroi


pectocellulosique, des acides nucléiques et des membranes et également rôle dans la
jonction dans le mécanisme de reconnaissance cellulaire.

Le monde vivant est structuré selon des niveaux d’organisation de complexité


croissante (molécules, organites, cellules, tissus, organes, individus, populations,
communautés).

o Les lipides

- Ce sont des macromolécules formées d’une molécule de glycérol (alcool) et de 3 molécules


d’acides gras.

- Formule générale : CH3-(CH2)n-COOH

- Hydrophobes ou amphiphiles, ils sont solubles dans l’éther.

Les lipides de réserve sont constitués d’acides gras (qui peuvent être saturés ou insaturés)
et de leurs associations en triglycérides et en phospholipides. Les acides gras sont de longues
chaînes carbonées à nombre pair de carbones et portant une fonction acide au niveau du
carbone1.

Les AG saturés ne comportent que des liaisons simples alors que les AG insaturés présentent
des doubles et des triples liaisons.

Les lipides membranaires sont constitués par un assemblage de 2 acides gras, de glycérol
et de phosphate. Ils ont une manière particulière de s’organiser en présence d’eau : pôle
hydrophobe et pôle hydrophile.
o Rôles des lipides

Réserves d’énergie (graines oléagineuses chez les végétaux et tissus adipeux chez les
animaux), constituant des membranes, source d’énergie pour la cellule.

• Les acides nucléiques

Les acides nucléiques ont été isolés initialement des noyaux des cellules. On peut en
distinguer deux grands types :

- Les acides désoxyribonucléiques (ADN) : localisés dans le noyau des cellules et


constituent le support de l’information génétique,
- Les acides ribonucléiques (ARN) : participent à l’expression de l’information
génétique.

Les acides nucléiques (ADN et ARN) sont des macromolécules et comportent des sous unités
appelées nucléotides.

• ADN : Acide Désoxyribonucléique

C’est une chaîne de plusieurs nucléotides, eux-mêmes composés de :


Bases azotées dérivées de 2 noyaux hétérocyclés azotés :
- Noyau Purine : Adénine (A), Guanine (G) : Bases Puriques
- Noyau Pyrimidine : Cytosine (C), Uracile (U), Thymine (T) : Bases
Pyrimidiques

La Thymine (T) se trouve uniquement chez l’ADN et l’Uracile (U) uniquement chez l’ARN.

- Pentose : est soit le Ribose (dans l’ARN) ou le Désoxyribose (dans l’ADN)


- L’acide phosphorique (H3PO4)

Chaque nucléotide d’ADN est composé de :

- Thymidine = Thymine + Désoxyribose


- Uridine = Uracile + Ribose
- Guanosine = Guanine + Ribose/ Désoxyribose
- Adénosine = Adénine + Ribose/ Désoxyribose
- Cytidine = Cytosine + Ribose/ Désoxyribose
La liaison acide phosphorique-pentose est une liaison phosphoester. L’ADN est une
macromolécule de longue chaîne polynucléotidique orientée dans le sens de l’extrémité 5’
(comportant un groupement phosphate) vers l’extrémité 3’ qui possède un OH C’est la
structure primaire. Elle a une structure secondaire importante : elle est formée d’une double
chaîne nucléotidique : 2 brins anti-parallèles, disposés dans des directions opposées (5’à3’ et
3’à5’), hélicoïdaux (double hélice à rotation droite) et complémentaires (2 liaisons hydrogène
entre A et T et 3 liaisons hydrogène entre C et G). L’ADN est le support qui sert de base à la
biosynthèse des protéines.

• ARN : Acide ribonucléique

Chaque nucléotide d’ARN est composé de :


Les ARN sont des macromolécules composées d’une seule chaîne nucléotidique =
Monocaténaires. Mais dans une même chaîne d’ARN des portions peuvent être sous forme
bicaténaire avec une complémentarité suivant la règle :
- 2 liaisons hydrogène entre A et U et
- 3 liaisons hydrogène entre C et G
Il existe 3 types d’ARN qui jouent un rôle essentiel dans la transcription (ARNm) et la
traduction (ARNt et ARNr) de l'information génétique qui aboutit à la biosynthèse des
protéines.

En biologie, les niveaux d'organisation du vivant forment une hiérarchie des structures et des
systèmes biologiques complexe qui définissent la vie.

Les échelles du vivant


Quelles sont les différentes échelles du vivant ?
L’objectif de ce cours est de revoir les différentes échelles c’est-à-dire les niveaux
d’observation afin de comprendre l’ordre de grandeur de tout ce qui caractérise les êtres
vivants : atomes, molécules, cellules, tissus, organes, appareils, organisme.
Le schéma d'organisation biologique standard simple, du niveau le plus bas au niveau le plus
élevé, est le suivant :
• Les atomes
Comment sont organisés les êtres vivants à l’échelle atomique ?
Le zoom le plus important est le niveau des atomes (ou éléments chimiques). L’être humain est
un mélange de matière minérale (eau par exemple) et de matière organique. Il est donc constitué
d’éléments chimiques (carbone C, hydrogène H, oxygène O, azote N, calcium Ca, etc.)
La taille d’un atome est d’environ 10-10 m soit 0,1 nm (ou encore 1 ångström noté Å).
• Les molécules
Comment sont organisés les êtres vivants à l’échelle moléculaire ?
Les atomes sont assemblés pour former une molécule. Une molécule est donc formée d’1, 2, 3
et parfois plusieurs dizaines ou centaines d’atomes.
Exemple : le glucose C6H12O6.
La taille moyenne d’une molécule est de l’ordre de 10-9 m soit 1 nm.
À cette échelle, les molécules peuvent être observées au microscope électronique (très
puissant). Ce sont les plus petits éléments que l’on peut observer en microscopie, en effet, les
atomes sont trop petits pour être observés, on les représente donc de façon schématique.
• Les cellules
Comment sont organisés les êtres vivants à l’échelle cellulaire ?
Troisième niveau d’observation : les cellules, qui peuvent être observées au microscope
optique. Les cellules sont le premier niveau caractéristique des êtres vivants, en effet, la matière
inerte comporte aussi des atomes et des molécules.
Elles peuvent être séparées en deux groupes :
✓ Les procaryotes (bactérie) d’ordre de grandeur 10-6 m soit 1 μm.
✓ Les eucaryotes comportant un noyau et des organites à l’intérieur de la cellule.
Exemple : la cellule végétale. Elle fait en moyenne 5.10-5 m soit 50 μm. À l’intérieur, les
organites ont une taille comparable à celle d’une bactérie, de l’ordre de 1 à 10 μm.
Pour certains organismes, la cellule correspond à l’être vivant en entier, ce sont les êtres vivants
unicellulaires comme les bactéries. Mais concernant l’organisme humain, les cellules ne vivent
pas toutes seules, elles sont regroupées au sein des tissus.
• Les tissus
Un tissu, en biologie, est un ensemble de cellules semblables et de même origine, regroupées
en amas. Il constitue le niveau d'organisation intermédiaire entre la cellule et l’organe.
Les tissus sont des associations de cellules (exemple : paroi de l’intestin) d’ordre de grandeur
10-3 m soit 1 mm.
• Les organes
Les tissus sont regroupés pour former des organes, unités visibles à l’œil nu. Ces tissus
collaborent dans la réalisation d’une fonction (exemple : l’intestin est un organe composé de
différents tissus).
Les organes mesurent entre 10-2 à 10-1 m soit entre 1 cm jusqu’à quelques dizaines de
centimètres.
• Les appareils ou systèmes
Les organes peuvent être regroupées dans les appareils ou systèmes. C’est un ensemble
d’organes dont le fonctionnement est coordonné (exemple : le système digestif). Leur ordre de
grandeur entre 10-1 à 1 m. Un appareil peut mesurer quelques dizaines de centimètres à 1 m voir
un peu plus car la longueur totale du système digestif dépasse 1 m.
• L’organisme
Enfin, tous les appareils d’un individu forment l’organisme. Ils fonctionnent de
façon complémentaire (système digestif, système nerveux, système reproducteur) et permettent
à l’organisme de se nourrir, de se reproduire ou de communiquer avec son environnement.
➢ L'individu ou organisme : ce niveau englobe tous les organismes individuels depuis
les êtres unicellulaires jusqu'aux arbres et aux gros mammifères.

➢ La population : une population est l’ensemble des individus de même espèce, vivant
sur une surface déterminée. Le développement d’une population et son évolution sont
contrôlés par l’environnement.

➢ La communauté : Une communauté est l’ensemble des populations réunies dans un


même espace et dont l’ensemble présente une certaine homogénéité vis à vis des
critères retenus pour la distinguer. La notion de communauté peut désigner :

✓ Les populations végétales constituant un groupement végétal ou phytocénose.

✓ Les populations animales ou zoocénose.

✓ Les micro-organismes du sol ou micro-biocénose.

✓ Elle peut désigner aussi l’ensemble des organismes ou biocénose.

➢ Ecosystème : En écologie, un écosystème est un ensemble formé par une communoté


d’êtres vivants en interaction (biocénose) avec leur environnement (biotope). Les
composants de l'écosystème développent un dense réseau de dépendances, d'échanges
d'énergie, d'information et de matière permettant le maintien et le développement de la
vie.
➢ Biome : Un biome (du grec βίος / bíos, « vie ») appelé aussi macroécosystème ou aire
biotique, est un ensemble d’écosystème caractéristique d'une aire biogéographique et
nommé à partir de la végétation et des espèces animales qui y prédominent et y sont
adaptées.

Le milieu dans son sens écologique le plus large, est constitué au niveau planétaire par la
Biosphère qui est définie comme étant la région de la planète qui renferme l’ensemble des
êtres vivants et dans laquelle la vie est possible en permanence. En effet toute la surface
du globe terrestre n’est pas également favorable aux organismes. On y rencontre des
territoires, comme les calottes polaires et les hautes montagnes où la vie y est presque
impossible.

➢ La biosphère peut être subdivisée en trois compartiments de natures physiques


différentes :

➢ La lithosphère : limitée aux couches les plus superficielles de l’écorce terrestre. C’est
le milieu solide constitué par l’ensemble des continents émergés.

➢ L’hydrosphère : ou océan mondial, milieu liquide qui recouvre les 7/10 de la surface
planétaire.

➢ L’atmosphère : couche gazeuse homogène qui constitue la zone la plus périphérique


de notre planète et enveloppe les deux précédents milieux.

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