Ecologia mediterranea

Stéphane Greff 2016 Métabolomique, effets biologiques et

caractère invasif de la macroalgue Asparagopsis taxiformis
Thèse de doctorat en sciences de l’université d’Aix-Marseille,
soutenue le 28 novembre 2016

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Stéphane Greff 2016 Métabolomique, effets biologiques et caractère invasif de la macroalgue Asparagopsis taxiformis
Thèse de doctorat en sciences de l’université d’Aix-Marseille, soutenue le 28 novembre 2016. In: Ecologia mediterranea,
tome 42 n°2, 2016. pp. 103-104;

https://www.persee.fr/doc/ecmed_0153-8756_2016_num_42_2_1992_t6_0103_0000_2;

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 Résumés de thèses

irradiances, des températures et des demandes évaporatives tempérés et tropicaux, et d’évaluer si le caractère invasif
extrêmes. L’éclaircie provoque cependant le développement d’A. taxiformis pouvait être expliqué par son identité géné-
d’une strate basse spontanée qui influence à son tour les plan- tique, son phénotype chimique ou la diversité de son micro-
tules. Les graminées limitent l’installation des plantules, biome associé.
tandis que les arbustes ont un effet faiblement compétitif à
Des travaux récents ont démontré l’existence de six lignées
facilitateur selon les espèces et les conditions. La réponse des
génétiques distinctes pour A. taxiformis. Le premier objectif
plantules dépend aussi de la stratégie de l’espèce cible : les
de cette thèse était de corréler le métabolisme spécialisé et
espèces décidues, tolérant l’ombre mais pas la photoinhibi-
la bioactivité de l’algue à son génotype, et éventuellement
tion, bénéficient plus d’un couvert végétal que les espèces
à son caractère proliférant. Aucune corrélation génétique/
sclérophylles sempervirentes. En pépinière, après 2 ans, la métabolomique n’a été démontrée, ce qui laisse entendre
décomposition de la litière des principales espèces ligneuses que le métabolisme de cette algue serait principalement
a modifié les propriétés physico-chimiques et microbiolo- influencé par l’environnement et/ou sa flore microbienne
giques du sol sous-jacent, mais pas le développement des associée. En milieu tempéré, A. taxiformis et A. armata
plantules de chêne, montrant un faible effet allélopathique. présentent des signatures métabolomiques globalement
L’éclaircie des peuplements de pin d’Alep denses est une similaires et associées à une bioactivité significativement
stratégie pour faciliter l’installation d’espèces feuillues et plus importante qu’en milieu tropical. Cependant, même
ainsi améliorer la diversité et la résilience des forêts. Cepen- lorsqu’elle a été introduite, une même lignée génétique et un
dant, l’intensité optimale de cette éclaircie dépend des condi- même phénotype chimique peuvent présenter des caractères
tions climatiques et édaphiques, de la nature du sous-bois et proliférants opposés.
de la stratégie des espèces cibles.
Nous avons également étudié l’interaction algue-coraux en
nous intéressant particulièrement au rôle du métabolisme
spécialisé. En milieu tropical, les extraits de macroalgues
testés in situ sur quatre espèces de coraux n’ont provoqué
que de faibles blanchissements. En milieu tempéré, aucun
Stéphane GREFF 2016 effet biologique de l’algue n’a été enregistré sur le corail
Astroides calycularis. En revanche, des expériences en
Métabolomique, effets biologiques aquarium ont permis de montrer qu’A. taxiformis pouvait
exprimer un métabolisme spécifique avec une bioactivité
et caractère invasif de la macroalgue augmentée après dix jours de contact avec ce corail.
Asparagopsis taxiformis En conclusion, qu’elle soit indigène ou introduite, A. taxi-
formis exerce très peu d’effets sur la santé des coraux et le
Thèse de doctorat en sciences de l’université d’Aix-Mar- caractère invasif de cette algue reste une source de débat.
seille, soutenue le 28 novembre 2016.

Jury – Philippe Potin (DR Cnrs), Gérald Culioli (Mcf, univer-

sité de Toulon), rapporteurs ; Catherine Fernandez (Pr, université

C
d’Aix-Marseille), Julijana Ivanisevic (Mcf, université de Lausanne), onsidered as a major threat for sub-tropical and tropi-
Claude Payri (DR Ird), examinateurs ; Thierry Perez (DR Cnrs), cal ecosystems, macroalgal proliferations are suscep-
Olivier Thomas (Pr, Galway University), codirecteurs. tible to modify the structure and the functioning of coral
reefs. The genus Asparagopsis (Rhodophyta) is known to
Mots clés : Asparagopsis, empreintes métabolomiques, bioac-
tivité, interactions macroalgue-corail. be widespread, introduced and sometimes invasive in cer-
tain regions such as the Western Mediterranean Sea. The
Keywords: Asparagopsis, metabolomic fingerprinting, bioac- lack of knowledge concerning this alga and its putative
tivity, cora-macroalgal interaction. impact on coral reefs requested an interdisciplinary study
to better understand and eventually manage proliferation
events. The main objectives of the ERA–NET BIOME pro-
C onsidérées comme des menaces pour les écosystèmes
marins tropicaux et subtropicaux, les proliférations de
macroalgues sont susceptibles de modifier le fonctionnement
ject « ­SEAPROLIF » (www.seaprolif.ird) were to study the
distribution and dynamics of A. taxiformis, both in temperate
et la structure des récifs coralliens. Le genre Asparagop- and tropical areas, and to evaluate if its proliferation trait
could be explained by genetic identity, its chemical pheno-
sis (Rhodophyta) est connu pour être largement distribué,
type, or the diversity of its associated microbiome.
introduit et parfois invasif dans certaines régions comme
en Méditerranée occidentale. Le manque de connaissances Recent studies have demonstrated the existence of six
concernant cette algue et ses effets réels sur les récifs néces- genetic lineages of A. taxiformis. The first objective of this
sitait une étude interdisciplinaire afin de mieux comprendre thesis was to correlate the algal specialized metabolism
et, le cas échéant, de gérer certains événements de proliféra- and its bioactivity with its genotype, and eventually with
tions. Le programme ERA–NET BIOME « ­SEAPROLIF » its proliferation trait. No correlation between genetics and
(www.seaprolif.ird) avait pour principaux objectifs d’étudier metabolomics has been demonstrated, which would sug-
la distribution et la dynamique d’A. taxiformis en milieux gest the main influence of environmental factors and/or the

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Résumés de thèses

associated microbial diversity on the algal metabolism. In sures because of its direct (exploitation) and indirect (attrac-
temperate regions, A. taxiformis and A. armata showed simi- tivity for recreational scuba-diving) economical values. This
lar metabolomic fingerprints with bioactivities significantly species has recently been impacted by mortality events linked
higher than in tropical regions. However, even when it is with thermal anomalies. Because of the extremely contrasted
introduced, a given genetic lineage and a given chemical thermal conditions it deals with along his range the red coral
phenotype can exhibit opposite proliferative traits. is an interesting model for the study of local adaptation.
The interaction between the alga and corals was also studied, During my thesis, I tried to understand the genetic basis of
focusing especially on the role of the specialized metabo- thermotolerance differences in the red coral. We first con-
lism. In tropical areas, algal extracts tested in situ on four firmed that gene expression differences were maintained
coral species did not lead to any coral bleaching. In temper- along time, in absence of thermal stress in individuals from
ate areas, no biological effect of the alga was recorded on different depths in Marseille. Some of these genes presented
Astroides calycularis. However, some aquarium experiments relevant functions which were already described in the stress
allowed to show that A. taxiformis can express a specific response in cnidaria and were good candidates for the study
metabolism, with an increased bioactivity after ten-days of of local adaptation and strong arguments supporting the con-
contact with coral. servation of this function in cnidaria. In order to identify
potential genetic basis of the local adaptation in the red coral,
To conclude, either indigenous or introduced, A. taxiformis we built a sampling design of pairs of “shallow vs deep”
poorly affects corals’ health, and thus the invasiveness of this populations in three geographical regions and sequenced
alga remains a matter of debate. via RAD-Sequencing the corresponding individuals. The
analysis of neutral genetic structure of the studied popula-
tions highlighted a limited connectivity of shallow popula-
tions with both shallow populations and deep populations
that could counteract recolonization abilities of population
Marine PRATLONG 2016 the most exposed to global change. Several methodological
obstacles have been met in the detection of loci under selec-
tion in such strongly structured species. By keeping in mind
The evolutionary challenge these potential biases, we highlighted a potential signal of
of climate change: adaptive local adaptation in Marseille and Corsica, without any con-
vergence in candidate genes and functions. The analysis of
processes in the Mediterranean, the genetic structure of the red coral led us to the identifica-
red coral (Corallium rubrum) tion of sex genetic markers which is the first description in a
non-bilaterian species. This observation confirms that the red
coral is an interesting model for evolutionary and integra-
Le défi évolutif du changement tive biology. In conclusion, this thesis completes ecological
climatique, processus adaptatifs and biological genetic knowledge we have for the red coral.
Here we provide a first study of local adaptation and genetic
chez le corail rouge sex determination in this species. New approaches will be
(Corallium rubrum) implemented to further explore the local adaptation of red
coral to depth, particularly in light of a genome, or a more
Thèse de doctorat en sciences de l’université d’Aix-Mar- focused view of the phenotype.
seille, soutenue le 5 décembre 2016.

Jury – Nicolas Bierne (DR Cnrs), Brigitte Crouau-Roy (Pr, univer-

sité de Toulouse 3), rapporteurs ; Nicolas Galtier (DR Cnrs), Jean-

L
Christophe Poggiale (Pr, université d’Aix-Marseille), Eve Toulza
e changement climatique actuel affecte déjà différents
(Mcf, université de Perpignan), examinateurs ; Didier Aurelle
(Mcf, université d’Aix-Marseille), Pierre Pontarotti (DR, Cnrs),
composants de la biodiversité, des gènes aux écosys-
codirecteurs. tèmes. En Méditerranée, le corail rouge (Corallium rubrum)
présente un important rôle écologique dans les écosystèmes
Mots clés : corail rouge, sélection, adaptation locale, change- benthiques de substrat dur. Il subit d’importantes pressions
ment climatique, déterminisme génétique du sexe, connectivité. anthropiques de par sa valeur économique directe (exploi-
tation) et indirecte (attrait pour la plongée récréative). Il
Keywords: red coral, selection, local adaptation, climate a récemment été touché par des événements de mortalité
change, genetic determinism of sex, connectivity. liés à des anomalies thermiques. Par ailleurs, les conditions
environnementales, et notamment thermiques, extrême-

T he on-going climate change should have major impacts

on the different components of biodiversity, from genes
to ecosystems. The Mediterranean red coral (Corallium
ment contrastées que cette espèce subit sur l’ensemble de
son aire de répartition en font un modèle intéressant pour
l’étude de l’adaptation locale. Nous avons donc cherché,
rubrum) has an important ecological role in Mediterranean au cours de notre thèse, à comprendre les bases génétiques
benthic ecosystems and is submitted to major anthropic pres- des différences de thermotolérance chez le corail rouge.

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