RA19 Lycee G 2 SVT Metabolisme 1160684

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VOIE GÉNÉRALE 2de Sciences de la vie et de la Terre

Informer et accompagner
les professionnels de l’éducation

VOIE GÉNÉRALE

2DE 1RE TLE

Sciences de la vie et de la Terre


ENSEIGNEMENT
COMMUN

L’ORGANISATION FONCTIONNELLE DU VIVANT


Thème
Thème 1 - La Terre, la vie et l’organisation du vivant.
Note d’intention
Cette fiche a pour objectif de donner une vision globale de ce thème dans l’enseignement des
SVT au lycée : enjeux éducatifs - notions clés à renforcer ou à construire - points de vigilance
- cohérence et complémentarité des programmes en articulation avec le cycle 4 pour aider à la
prise en compte de la progressivité des apprentissages et à l’approche spiralaire – pistes pour
problématiser - sitographie.
Mots-clés
Cellule, matrice extracellulaire/paroi, tissu, organe ; organites, spécialisation cellulaire, ADN,
double hélice, nucléotides (adénine, thymine, cytosine, guanine), complémentarité, gène,
séquence. Métabolisme, autotrophe, hétérotrophe, enzymes.

Enjeux éducatifs
L’étude de l’organisation fonctionnelle des êtres vivants, de la cellule à l’organisme, avec
une incursion au niveau moléculaire (structure de l’ADN, certains aspects du métabolisme)
est l’occasion de travailler les 6 domaines de compétences évoqués dans les programmes.
Pour les élèves, l’utilisation d’un matériel souvent nouveau (Expérimentation assistée par
ordinateur, modélisations numériques moléculaires, …) leur permettra de dépasser l’aspect
qualitatif et l’observation pour effectuer des mesures quantitatives.

La découverte de nouveaux outils d’investigation du vivant permet à la fois :


• d’étayer les possibles en vue d’élaborer des stratégies de résolution de problème ;
• d’aborder des champs professionnels plus précis en lien avec les métiers de la science.

Il est important de rappeler à cette occasion que le recours à un outil, quel qu’il soit (logiciel,
base de données, EXAO, …) doit être justifié. Ainsi, on n’utilise pas un outil pour lui-même,
mais parce que ses fonctionnalités permettent de répondre à un besoin dans le cadre d’une
démarche scientifique. Cette approche est importante pour la formation scientifique des
élèves. Ils doivent d’abord identifier le besoin avant de choisir et d’utiliser l’outil adéquat. On
évitera ainsi d’intituler des séquences par le nom de l’outil (à titre exemple : on n’intitulera pas
une séquence « utilisation d’Anagène », mais on l’intitulera en fonction de l’objectif poursuivi).

En outre, dans un souci de formation scientifique des élèves, il sera important de leur
permettre parfois de travailler réellement à la problématisation, et de ne pas se contenter de
les placer en situation de répondre à des problématiques.
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Les activités proposées aux élèves dans le cadre de cette thématique étant souvent
expérimentales, il est intéressant de profiter de l’occasion pour former les élèves aux
responsabilités individuelles et collectives (on peut ainsi par exemple les associer à
l’élaboration des règles de sécurité qui devront être strictement respectées).

Vision synoptique du sous-thème

Place du sous-thème dans les programmes de SVT du secondaire

Notions à consolider, notions à construire, limites


Cohérence avec les cycles 3 et 4
Les élèves découvrent la cellule en tant qu’unité structurelle du vivant (membrane,
cytoplasme, noyau). Dans le cadre de l’étude de la matière en sciences et technologie, l’élève
distingue matière minérale et matière organique. Dans le cadre de la production de matière
par les êtres vivants les élèves ont abordé :
• le fonctionnement d’une plante ou d’un animal en lien avec sa nutrition ;
• les besoins des plantes vertes et leur place particulière dans les réseaux trophiques ;
• les échanges de matière entre un être vivant et son milieu de vie ;
• les lieux de production ou de prélèvement de matière et de stockage et les systèmes de
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transport au sein de la plante ;

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• les besoins des cellules animales et le rôle des systèmes de transport dans l’organisme
(nutrition et organisation fonctionnelle à l’échelle de l’organisme, des organes, des tissus
et des cellules).

Les élèves savent donc que tous les êtres vivants produisent de la matière à partir de ce
qu’ils prélèvent dans leur milieu de vie. Ils connaissent les différences dans ce domaine
entre les végétaux chlorophylliens (qui ne prélèvent pas de matière organique dans leur
milieu de vie et qui sont donc des producteurs primaires de cette matière organique dans les
réseaux trophiques) et les animaux et champignons (qui prélèvent de la matière organique
produite par d’autres êtres vivants, et qui sont donc des producteurs secondaires de matière
organique). Ils ont donc établi qu’il existait une circulation de matière organique au sein des
écosystèmes, et savent pourquoi les végétaux chlorophylliens sont à la base de toute chaîne
alimentaire1 (tout du moins dans les écosystèmes connus des élèves à ce stade).

Les termes d’autotrophie et d’hétérotrophie n’ont pas été posés.

Sans aller jusqu’à sa structure, les élèves ont découvert l’ADN, molécule support de
l’information génétique au sein des cellules. Ils ont vu que le phénotype est lié au génotype et
comment la division cellulaire permet la conservation, mais aussi la variabilité d’un caryotype
(mitose et méiose – termes non exigés).

Mots-clés : chromosomes, gènes, allèles, ADN, mutations, division cellulaire, fécondation.

Rappels
Attendus de fin de cycle 4 (programmes de SVT)
Expliquer l’organisation du monde vivant, sa structure et son dynamisme à différentes échelles
d’espace et de temps.
Expliquer quelques processus biologiques impliqués dans le fonctionnement de l’organisme
humain : activités musculaire, nerveuse et cardio-vasculaire, cérébrale, alimentation et digestion,
relations avec le monde microbien reproduction et sexualité.
Connaissances et compétences associées
Expliquer comment les phénotypes sont déterminés par les génotypes et par l’action de
l’environnement.
Relier comme processus dynamiques la diversité génétique et la biodiversité.
Expliquer le devenir des aliments dans le tube digestif.
Ressources d’accompagnement de la mise en œuvre des programmes de cycle 4 en SVT
Idées clés pour enseigner

Notions abordées en seconde


En classe de seconde c’est le métabolisme est abordé au niveau cellulaire qui est abordé.
Avant d’aborder la construction de notions nouvelles, il est important de mobiliser les acquis
des élèves au niveau de l’organisme et des organes ou tissus (échanges avec le milieu –
production et utilisation de matière). Dans la même optique, il est important en fin d’étude
de resituer les phénomènes observés au niveau cellulaire dans un contexte plus global
(organisme, écosystème).

La notion de métabolisme sera précisée.

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1. Au collège les élèves n’étudient pas d’autres écosystèmes que ceux qui ont des végétaux chlorophylliens à leur
bas

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Parties du Des notions…


sous-thème

L’organisme Des notions à consolider2


pluricellulaire, • Chez les organismes unicellulaires, toutes les fonctions sont assurées par
un ensemble
une seule cellule. Chez les organismes pluricellulaires, les organes sont
de cellules
spécialisées constitués de cellules spécialisées formant des tissus, et assurant des
fonctions particulières.
• Toutes les cellules d’un organisme sont issues d’une cellule unique à l’origine
de cet organisme.
• L’information génétique est organisée en gènes constitués d’ADN.

Des notions nouvelles à bâtir


• Matrice extracellulaire/paroi-organites.
• Les cellules spécialisées n’expriment qu’une partie de leurs gènes
L’étude des modalités de l’expression des gènes relève de l’enseignement de
spécialité SVT de la classe de première.
• Structure de l’ADN (double hélice, nucléotides, adénine, thymine, cytosine,
guanine, complémentarité, gène, séquence).
L’étude de la structure de l’ADN est à mener en relation directe avec sa fonction (la
question qui se pose est de déterminer en quoi les caractéristiques de la molécule
d’ADN lui permettent d’être le support d’une information).

Le métabolisme Des notions à consolider


des cellules • Les élèves ont découvert une partie du métabolisme hétérotrophe appliqué au
tissu ou à l’organe.

Des notions nouvelles à bâtir


• Le métabolisme cellulaire, autotrophe, hétérotrophe.
La photosynthèse sera abordée en enseignement scientifique de première.
• Le métabolisme dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule
(organites, macromolécules dont les enzymes).
La nature et les mécanismes d’intervention des enzymes relèvent de
l’enseignement de spécialité SVT de la classe de première.

Limites et précisions
Les points suivants ne sont pas des objectifs de formation en seconde :
• la structure fine des tissus cellulaires : ceux-ci sont considérés comme des ensembles
cohérents de différentes cellules spécialisées (double cohérence de structure – rôle des
matrices – et de fonction - spécialisation) ;
• le détail des molécules impliquées dans l’adhérence cellulaire ;
• la structure moléculaire des enzymes ;
• le détail des différentes phases de la mitose : celle-ci est vue comme une séparation des
chromatides, nécessaire à la conservation des caryotypes.

2. À considérer comme des prérequis, indispensables pour aborder le programme de seconde : ils peuvent être
réexpliqués, remobilisés, mais ne doivent pas faire l’objet de démarches spécifiques pour être redémontrés.
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On ne vise pas l’exhaustivité : les élèves travaillent chaque année sur des exemples en
nombre limité pour construire et enrichir des concepts tout au long de leur scolarité. Une
pratique pédagogique pertinente pour permettre une généralisation des notions travaillées
est d’envisager ponctuellement des travaux en atelier : plusieurs groupes d’élèves travaillent
à partir d’exemples différents ; une mutualisation est effectuée ensuite.

Un point de vigilance : il est important de ne pas laisser penser aux élèves que « les végétaux
produisent seuls leur matière organique », alors que les animaux ont besoin d’en prélever. Ce
raccourci de formulation, encore fréquent, peut être source de confusion pour les élèves. Tous
les organismes produisent « seuls » leur matière organique, ce qui va changer c’est à partir de
quels matériaux ils vont le faire.

Notions abordées en cycle terminal spécialité SVT


Précisions - Limites

Notions Thème 1
nouvelles en • Le cycle cellulaire, la réplication de l’ADN, la mitose, la méiose.
enseignement • L’expression du patrimoine génétique (transcription, traduction, …).
de spécialité
SVT première • La nature, les mécanismes d’intervention des enzymes (catalyse, substrat,
produit, spécificité, …).
• Certaines variations génétiques résultent d’une sélection naturelle (tolérance
au lactose ; résistance à la haute altitude).

Notions Thème 1
nouvelles en • L’origine du génotype des individus – stabilité et évolution clonale / brassage
enseignement des génomes à chaque génération par la reproduction sexuée.
de spécialité
SVT terminale • Complexification des génomes (transferts horizontaux et endosymbioses) :
origine des mitochondries et des chloroplastes.
Thème 3
• Produire le mouvement : contraction musculaire et apport d’énergie –
la cellule musculaire : une cellule spécialisée permettant son propre
raccourcissement – origine de l’ATP nécessaire à la contraction de la cellule
musculaire – contrôle des flux de glucose, source essentielle d’énergie des
cellules musculaires.
• Comportement et stress : vers une vision intégrée de l’organisme – voies
physiologiques et coordination de ces voies à l’échelle de l’organisme.

Articulation avec l’enseignement scientifique du tronc commun


Enseignement scientifique en classe de première – thème 2 « le soleil, notre source
d’énergie » - sous-thème « une conversion biologique de l’énergie solaire : la photosynthèse».

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En seconde : le sous-thème en deux tableaux synthétiques


L’organisation pluricellulaire, un ensemble de cellules spécialisées

Objectifs Un organisme pluricellulaire peut s’observer à différentes échelles


Des observations à différentes échelles (depuis l’œil aux images de microscopie
électronique) d’un animal et/ou d’une plante et des résultats d’expériences
(électrophorèse en 2 dimensions), permettent de construire les notions suivantes :
• un organisme pluricellulaire est composé d’un ensemble d’organes formés de tissus.
Ces tissus regroupent des cellules spécialisées renfermant des organites et réunies
entre elles par une matrice extracellulaire ;
• les caractéristiques structurelles et métaboliques des cellules spécialisées reposent
sur la palette de molécules spécifiques qu’elles fabriquent.

Toutes les cellules d’un organisme possèdent la même information génétique, mais
chacune n’en exprime qu’une partie.
Des modélisations analogiques, numériques et l’étude de résultats d’expériences
historiques permettent de construire les notions suivantes :
• l’information génétique est organisée en gènes constitués d’ADN (Acide
Désoxyribonucléique) ;
• l’ADN est une longue molécule formée de 2 brins complémentaires enroulés en
double hélice (chromosome). Chaque brin est constitué d’une succession de
nucléotides (4 types possibles, A, T, G ou C) ;
• un gène représente une partie de la séquence de la molécule d’ADN ;
• un chromosome contient de nombreux gènes ;
• la structure de la molécule d’ADN est la même chez tous les êtres vivants. Seules les
séquences de nucléotides varient ;
• toutes les cellules d’un même organisme possèdent les mêmes gènes, mais elles
ne possèdent pas les mêmes protéines. Elles n’expriment pas les mêmes gènes au
même moment.

Le métabolisme des cellules

Objectifs Les échanges de matière et d’énergie entre cellules assurés par le métabolisme
permettent le bon fonctionnement de l’organisme pluricellulaire.
Des expériences pour identifier les substrats et produits du métabolisme et pour suivre le
devenir des produits du métabolisme permettent de construire les notions suivantes :
• les cellules possèdent une ou des voies métaboliques leur permettant de produire de
l’énergie (respiration cellulaire/fermentation ?) ;
• cette énergie leur permet de produire leur propre matière organique ;
• les cellules photosynthétiques produisent leur propre matière organique à partir
d’eau, de matière minérale et d’énergie lumineuse. On les qualifie d’autotrophes ;
• les cellules ayant besoin d’un apport en matière organique pour produire leur propre
matière sont qualifiées d’hétérotrophes ;
• des échanges entre cellules autotrophes et hétérotrophes au sein du même
organisme et entre organismes assurent leur bon fonctionnement ;
• les voies métaboliques au sein d’une cellule sont interconnectées par des molécules
intermédiaires des métabolismes.

De nombreuses transformations biochimiques assurent le bon fonctionnement des


cellules.
Des expériences de suivi de réactions du métabolisme permettent de les caractériser et
de construire les notions suivantes :
• l’ensemble des transformations biochimiques se déroulant dans une cellule
constitue son métabolisme ;
• une voie métabolique est une succession de réactions biochimiques transformant
Retrouvez éduscol sur : une molécule en une autre ;
• le métabolisme dépend de l’équipement spécialisé de chaque cellule (organites,
macromolécules dont les enzymes).

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Remarques
La spécialisation des cellules ne s’observe pas uniquement au niveau de leurs structures (matrice
extracellulaire, organites particuliers). Elle s’observe aussi dans les fonctions assurées par les
cellules. Leur rôle dans l’organe et dans l’organisme s’explique en partie par leur équipement
enzymatique (protéines) qui va influencer leur fonctionnement. Ainsi, en fonction des gènes
qui s’exprimeront, chaque catégorie de cellules aura un protéome (ensemble des protéines
d’une cellule) qui lui sera propre. A l’échelle d’un organe, d’un organisme, on pourra définir des
protéomes cellulaires différents. On pourra envisager de comparer des protéomes de cellules
différentes d’un même organisme via des résultats d’électrophorèse 2D par exemple pour les
mettre en évidence.
Cette partie de programme repose donc en partie sur l’existence du protéome : pour autant l’étude
des mécanismes de fabrication des protéines n’interviendra qu’en enseignement de spécialité.

Quelques pistes pour problématiser


Des approches variées sont envisageables, du moment qu’elles impliquent les élèves tout au
long de la séance.

Une carte heuristique peut constituer un bon outil pour envisager différentes façons d’aborder
un thème, les points à traiter pour répondre à une problématique, les activités à mettre en
œuvre de façon complémentaire, etc. Elle peut être conçue par l’enseignant seul dans le cadre
de la préparation de ses séances, mais aussi avec les élèves dans le cadre d’une activité
dédiée à la problématisation ou au traitement d’une problématique.

À titre d’exemple3, la carte heuristique ci-dessous a été conçue en lien avec une approche
possible pour ce thème : « comment des cellules censées avoir les mêmes gènes (car issues
de la même cellule œuf) peuvent avoir des structures et des fonctions différentes ? ».

Éléments de contexte : les élèves comprennent que les organismes pluricellulaires sont
constitués d’un ensemble de cellules spécialisées. Ces cellules, bien que possédant la
même information génétique, se différencient par des caractéristiques structurelles et des
activités métaboliques différentes. Alors que chez les organismes unicellulaires, toutes
les fonctions sont assurées par une seule cellule, chez les organismes pluricellulaires, des
échanges de matière et d’énergie entre cellules spécialisées assurent le bon fonctionnement
de l’organisme en relation avec les autres êtres vivants et son milieu. La spécialisation
des structures et la diversité des métabolismes auront été observées et des données
quantitatives auront pu être obtenues au préalable.

Deux types d’hypothèses sont à envisager :


• les cellules possèdent la même information génétique, mais les cellules n’expriment pas
la totalité de cette information – conséquence vérifiable : il doit y avoir le même ADN dans
chaque cellule ;
• les programmes génétiques ne sont en fait pas identiques – conséquence vérifiable : les
ADN sont différents selon les cellules.

3. L’exemple présenté ici n’a pas vocation à être modélisant – il a vocation à montrer qu’un outil tel qu’une carte
heuristique peut contribuer à l’organisation des idées, à leur structuration, pour servir notamment de trame aux
démarches qui vont être mises en œuvre, aux scénarios pédagogiques qui vont être construits
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Pour tester ces hypothèses, il faut nécessairement caractériser la séquence de l’ADN afin de
rechercher d’éventuelles différences entre deux cellules spécialisées d’un même organisme.

Cliquer ici pour obtenir la carte heuristique en taille réelle

Sitographie
• Éduscol - Portail national de ressources SVT
• Planet Vie - ENS Paris
• Éduscol - Risques et sécurité en SVT
• UPMC - RNBio - Ressources numériques en biologie - Compléments d’informations sur la
photosynthèse avec des techniques de mesures
• IFÉ – ENS Lyon - Plateforme Acces
• Une très belle animation sur la vie cellulaire « The inner cell of life » - également sur
biovisions
• Sorbonne université Faculté des sciences et ingénierie campus Jussieu, Université de
Jussieu - Compréhension et observation de différents tissus chez les angiospermes
• Université de Namur (Belgique) - Compréhension et observation de différents tissus
animaux
• Planet Vie – ENS Paris - Coloration de cellulose et de lignine
• Université d’Angers - le principe de l’électrophorèse

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