These Julien MOEYS
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These Julien MOEYS
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J. Moeys Sommaire
◊ Sommaire abrégé
◊ Sommaire général
◊ SOMMAIRE ABRÉGÉ ................................................. 3
◊ SOMMAIRE GÉNÉRAL ............................................... 3
1 AVANT PROPOS & REMERCIEMENTS ......................... 13
2 INTRODUCTION, CONTEXTE ...................................... 16
■ 2.1 Problématique ................................................................. 16
■ 2.2 Processus en jeu ............................................................. 17
■ 2.3 Solutions envisageables .................................................. 18
■ 2.4 Programme de recherche ESHEL.................................... 19
■ 2.5 Limites méthodologiques ................................................. 19
3 OBJECTIFS .............................................................. 21
■ 3.1 Choix méthodologiques initiaux ....................................... 21
■ 3.2 Objectifs du travail de thèse............................................. 22
■ 3.3 Organisation du mémoire de thèse .................................. 23
3
J. Moeys Sommaire
4
J. Moeys Sommaire
3 L'ISOPROTURON ...................................................... 62
■ 3.1 Structure chimique de l’isoproturon et de ses métabolites 63
■ 3.2 Propriétés physico-chimiques .......................................... 64
■ 3.3 Homologations des usages.............................................. 64
■ 3.4 Évaluation de son comportement dans les sols ............... 65
■ Informations fournies par les bases de données et les ouvrages de référence ....... 65
□ Adsorption (KOC) ................................................................................................................65
□ Dégradation : DT50 au laboratoire.....................................................................................66
■ Adsorption et vitesse de dégradation : variabilité et déterminismes rapportés par
la littérature scientifique ........................................................................................ 66
□ Adsorption (KOC) ................................................................................................................66
□ Dégradation (DT50) ............................................................................................................68
■ 3.5 Occurrences de l’isoproturon dans les eaux de surface et
souterraines..................................................................... 69
5
J. Moeys Sommaire
6
J. Moeys Sommaire
permanent...........................................................................................................................115
□ Comparaison avec les mesures à la parcelle (Millot, 2004) ..............................................119
■ 4.3 Fraction d'eau immobile................................................... 120
■ Principe .................................................................................................................. 120
■ Protocole ................................................................................................................ 121
5 PRÉPARATION DES ÉCHANTILLONS DE SOL AVANT
LES MESURES AVEC L’ISOPROTURON ........................ 122
■ 5.1 Tamisage et détermination de la teneur en eau au
prélèvement..................................................................... 122
■ 5.2 Détermination de la teneur en eau à pF 2 après
tamisage .......................................................................... 122
6 ADSORPTION DE L’ISOPROTURON ............................. 123
■ 6.1 Adsorption linéaire de l'isoproturon sur les sols ............... 123
■ Principe .................................................................................................................. 123
■ Protocole ................................................................................................................ 124
■ 6.2 KD des horizons de surface et profonds de la parcelle
d’étude............................................................................. 125
7 DÉGRADATION DE L'ISOPROTURON........................... 126
■ 7.1 Suivi de la dégradation et de la minéralisation sur des
incubations au laboratoire................................................ 126
■ Principe .................................................................................................................. 126
■ Protocole général ................................................................................................... 126
■ Cinétique de dégradation et de minéralisation....................................................... 131
■ 7.2 Estimation des demi-vies de dégradation et de
minéralisation .................................................................. 131
■ Ajustement linéaire ................................................................................................ 132
□ Fixer ou ajuster la concentration initiale ...........................................................................132
■ Ajustement direct, non linéaire.............................................................................. 133
8 MÉTHODES STATISTIQUES UTILISÉES POUR LA
CARACTÉRISATION DE LA VARIABILITÉ SPATIALE DES
PROPRIÉTÉS AGRO-PÉDOLOGIQUES ......................... 133
■ 8.1 Hiérarchie des propriétés................................................. 134
■ 8.2 Statistiques descriptives................................................... 135
■ Graphiques ‘box & whisker’.................................................................................. 135
■ Statistiques de distribution..................................................................................... 136
□ Skewness & Kurtosis ..........................................................................................................136
□ Test de normalité de Shapiro..............................................................................................137
■ 8.3 Statistiques sur des propriétés non-normales .................. 137
■ Cas des populations bi- ou plurimodales ............................................................... 138
■ Cas des propriétés intrinsèquement non-normales ................................................ 138
■ Tests statistiques non paramétriques...................................................................... 138
■ 8.4 Corrélations entre propriétés quantitatives....................... 139
■ 8.5 Étude des liens entre propriétés qualitatives et propriétés
7
J. Moeys Sommaire
Partie IV Résultats.........................................148
1 CONSTITUANTS ET ORGANISATION DES SOLS ............ 149
■ 1.1 Propriétés physiques et physico-chimiques des sols ....... 149
■ Analyses physiques et physico-chimiques............................................................. 149
□ Granulométries fine et grossière ........................................................................................149
□ Carbone, azote organique et rapport C sur N ....................................................................151
□ Teneur en carbonate de calcium (CaCO3) .........................................................................153
□ pH 153
■ Masse volumique apparente au cylindre................................................................ 154
■ 1.2 Description des sondages tarière..................................... 154
■ Matériaux parentaux et substrats ........................................................................... 154
□ Matériaux et successions identifiés ....................................................................................154
□ Profondeur d’apparition du substrat..................................................................................156
■ Charges en éléments grossiers ............................................................................... 157
■ Types de sol identifiés ........................................................................................... 158
■ Modalité de travail du sol (conventionnel – simplifié) .......................................... 159
■ Répartition spatiale des sols et de ses propriétés physico-chimiques .................... 159
■ 1.3 Synthèse, discussion et conclusion intermédiaire ............ 161
2 PROPRIÉTÉS HYDRIQUES DU SOL ............................. 162
■ 2.1 Rétention en eau ............................................................. 162
■ Relation potentiel matriciel – teneur en eau .......................................................... 163
■ Paramètres de la fonction de rétention de Campbell.............................................. 164
■ 2.2 Conductivité hydraulique.................................................. 165
■ Estimation de la conductivité au voisinage de la saturation : infiltrométrie
monopotentiel ........................................................................................................ 165
□ Calculs par la méthode de White et Sully (1987) ...............................................................165
□ Calculs par la méthode de Haverkamp et al. (1994) ..........................................................169
■ Paramètres de la fonction de conductivité hydraulique de Campbell .................... 182
■ 2.3 Fraction d’eau immobile................................................... 183
■ Précision des mesures et respect des hypothèses................................................... 183
■ Valeurs de fraction d’eau immobile....................................................................... 184
■ 2.4 Synthèse, discussion et conclusion intermédiaire ............ 185
3 COMPORTEMENT DE L'ISOPROTURON DANS LES
SOLS ....................................................................... 188
■ 3.1 Adsorption de l'isoproturon dans les sols ......................... 188
■ Coefficient d'adsorption linéaire............................................................................ 188
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J. Moeys Sommaire
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J. Moeys Sommaire
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J. Moeys Sommaire
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J. Moeys Sommaire
12
J. Moeys Avant propos et remerciements
—— ooOOoo ——
merci
—— ooOOoo ——
Maigre espace de liberté dans le cadre de l’exercice très codifié que constitue la rédaction d’un
manuscrit de thèse, l’écriture des remerciements est un exercice de style destiné à lui donner un parfum
plus inhumain. La thèse est une longue pièce de théâtre qui, partant d’une banale tranche de vie, oscille
parfois entre tragédie, comédie et farce absurde. Seuls les interprètes peuvent démêler vérité et légende
dans le « synopsis » officieux et humoristique que constitue l’avant propos...
Des trois actes de la thèse (mise en place de l’intrigue – perte de contrôle et basculement – épilogue),
je commencerai comme le veut la tradition par la chute fin, puisque celle-ci n’est normalement que le
début d’une autre pièce, que l’on souhaite plus longue, mais tout aussi riche en rebondissements.
C’est donc avec un grand plaisir que j’adresse mes sincères remerciements à Yves COQUET (Pr.
AgroParisTech, Grignon), mon directeur de thèse, qui fût tout à la fois co-scénariste et, jusqu’au bout, un
discret mais efficace metteur en scène. J’ose ici évoquer ce surnom qui n’est pas volé, « la flèche », tant
Yves a toujours cerné mes questions les plus ardues avec une rapidité et une pertinence déconcertantes,
tel un « deus ex machina » qui aurait anticipé les questions et les doutes que ne manque pas d’avoir son
doctorant ! J’ai aussi beaucoup apprécié la patience avec laquelle Yves a tenté d’éclaircir éclairci les
subtilités de l’hydrologie du sol que j’avais parfois du mal à comprendre.
A la fois critiques et spectateurs résignés privilégiés, le jury de soutenance de thèse mérite lui aussi
une mention spéciale.
Je remercie chaleureusement le président du jury, Dominique KING (D.R. INRA, Orléans), qui a eu
la délicate mission d’accorder les différentes voix présentes dans le jury, chacune représentant une
discipline distincte de l’univers hétéroclite qu’est la science du sol. L’expérience d’un spécialiste reconnu
de l’« approche spatiale de la couverture pédologique », domaine ô combien pluridisciplinaire, ne
pouvait mieux convenir à ce rôle, et a permis de mettre en perspective efficacement l’ensemble du travail.
Je remercie également, et avec beaucoup d’admiration, les deux rapporteurs de cette thèse, Rafael
ANGULO-JARAMILLO (C.R., ENTPE, Lyon) et Guy SOULAS (D.R. INRA, Bordeaux). Ils ont eu la
13
J. Moeys Avant propos et remerciements
délicate mission de lire avec attention ce pavé manuscrit, chacun avec un regard différent : hydrologie
des sols pour le premier, et comportement des pesticides dans le sol pour le second. Je reconnais
volontiers que le scénario, quoique passionnant, traîne parfois en longueur. Mais loin de s’y enliser, les
rapporteurs ont su repérer les aspects les plus critiquables critiques de ce travail, et apporter ainsi à la
soutenance le recul si difficile à prendre en fin de thèse.
Je ne saurais trop remercier Liliane BEL (M.C., AgroParisTech, Paris), qui a accepté de s’écarter
un peu de son domaine de recherche habituel et d’apporter une voix plus « statistique » à ce jury. Tel un
pasteur-missionnaire à la recherche de ses brebis égarées, le statisticien qui s’attaque à aborde la
science du sol sait qu’il lui faudra souvent faire preuve de patience et de pédagogie, tant les a priori
ésotériques sont nombreux. Si elles n’étaient pas toujours indispensables aux pionniers qui ont fondé la
pédologie, les statistiques sont désormais un ingrédient essentiel au progrès de la science des sols.
Enfin, j’ai également beaucoup apprécié que Ludovic LOISEAU (Dr., AFSSA) participe à ce jury.
Après la mise en orbite du candidat au doctorat par les questions pointilleuses pointues du jury, il est
délicat de le ramener vers des questions plus pragmatiques sans risquer un atterrissage d’urgence. Ça
n’en est pas moins indispensable, tant les questions soulevées par la problématique « sol-eau-pesticide »
sont importantes pour notre société.
Mais n’oublions pas qu’avant le jury de soutenance de thèse, et en parallèle du directeur de thèse,
intervient un groupe plus discret, mais dont le rôle est non moins essentiel à toutes les étapes de la thèse
et d’une pièce, le comité de sages pilotage.
Je remercie donc tout spécialement Hocine BOURENNANE (INRA, Orléans), Isabelle COUSIN
(INRA, Orléans), Igor DUBUS (BRGM, Orléans), Jean-Marc GILLIOT (AgroParisTech, Grignon),
Christian GUYOT (Bayer CropScience) et Emmanuelle VAUDOUR-DUPUIS (AgroParisTech,
Grignon) pour s’être penché à deux reprises sur ce travail. Les membres du comité de pilotage jouent
successivement le rôle de pyromanes et de pompiers : ils doivent dans un premier temps éclairer le
doctorant sur les nombreuses pistes qui s’offrent à lui, et les chausse-trapes dans lesquelles il ne doit pas
tomber ; puis, dans un second temps, l’aider à rassembler et à valoriser ses trouvailles, et à sortir des
chausse-trapes dans lesquelles il n’a pas manqué de tomber.
Mais revenons à notre pièce de théâtre. Celle-ci doit comme chacun sait répondre à 3 contraintes :
unité de temps (3 ans, voir plus si affinités), unité de lieu (si possible un endroit isolé, propice au huis
clos) et unité d’action (la thèse, encore la thèse, et rien que la thèse).
Passons rapidement sur l’unité de temps, qui a été à peu près respectée. L’unité de lieu a pleinement
bénéficié de la situation exceptionnelle de Thiverval-Grignon, écrin de verdure isolé au milieu du « Far
West » parisien. Ce décor a servi à merveille la pièce, tout en autorisant de sains et reposants
« entractes ». L’unité de recherche « Environnement et Grandes Cultures » (INRA, AgroParisTech) a vu
se dérouler l’essentiel de l’action. Je remercie au passage ses directeurs d’unité successifs, Pierre
CELLIER et Enrique BARRIUSO, ainsi que Sabine HOUOT, responsable de l’équipe Sol, pour leur
accueil et pour leur capacité d’écoute très appréciable. La page de Grignon sera assurément difficile à
tourner. Il faut aussi souligner la diligence et le pragmatisme très appréciable des ‘promoteurs’, l’École
Doctorale ABIES, qui contribue indéniablement au bon déroulement des thèses (et plus encore de
l’après-thèse).
Le secteur de Ouarville, en Beauce, est l’ « objet » principal des travaux présentés ici. L’étude aurait
certainement bénéficié d’une présence plus assidue sur le « terrain », mais il est vrai que chaque heure
passée in situ implique de longues heures d’un ennuyeux patient travail de laboratoire, puis de traitement
des données... Ainsi va la recherche. Je n’oublie pas de remercier très sincèrement les exploitants
agricoles de Ouarville et de ses environs, qui ont accepté sans sourcilier que nous fassions des
prélèvements et des mesures sur leur parcelle, malgré le caractère « médiatiquement sensible » du sujet
étudié. Merci aussi a Sébastien SALÉ (Chambre d’Agriculture d’Eure-et-Loir) qui a toujours répondu
avec beaucoup d’enthousiasme à mes questions « agronomiques », malgré certains atermoiements du
programme sur ce point.
En coulisse de la pièce se tiennent de proches collaborateurs, dont le rôle parfois plus discret cache
en fait une contribution importante au numéro d’équilibriste du doctorant :
14
J. Moeys Avant propos et remerciements
Un grand merci à Christophe LABAT (terrain & labo de physique), Valérie BERGHEAUD et Pierre
BENOÎT (labo pesticides), et Nathalie BERNET-LEMPEREUR (labo de chimie).
J'attribue un prix spécial à l’ensemble de l’équipe Sol pour l’état d’esprit professionnel, agréable et
détendu durant les pauses café le travail.
L’unité d’action est plus délicate. Elle doit être de préférence servie par des interprètes au caractère
ouvert, affirmé et original (appelés « chercheurs »). Comme dans les meilleures épopées, l’interprète
principal doit tenir son rôle tandis que se déroulent autour de lui des drames parallèles, mais pas
toujours synchrones. Il côtoie ainsi d’autres acteurs secondaires dits « doctorants », qui sont autant de
miroirs narcissiques sur son état présent (doctorant en régime de croisière), son passé récent
(insouciance heureuse du doctorant qui joue le prologue de sa thèse), ou son futur immédiat (état de
décomposition avancée du doctorant en phase terminale de rédaction).
Les doctorants « synchrones » sont bien entendu les principaux complices, pour le meilleur comme
pour le pire... J’envoie donc une mention toute personnelle à deux piliers sans qui rien n’aurait été
possible (enfin, presque rien) : Lionel ALLETTO et Xavier TROLLE. Cher Lionel, il est bien difficile de
travailler à ta suite sur un sujet, tant en matière de boulot tu n’as rien à envier à Stakhanov ou Hercule
(enfin, on sait qu’Hercule était une légende, et Stakhanov un outil de propagande !). Mais tant qu’à
choisir entre plier sous le travail et se plier de rire, j’accepte sans rancune bien volontiers ton invitation
à prolonger nos discussions autour d’une bonne bière (ou d’un bon vin d’chez toi) ! Quant à Xavier, tu
sais que ces « remerciements » ne sont qu’une vile façade pour cacher mes prudes talents d’actrice
acteur, mais tu ne me feras pas chanter sur ce point (salut au passage à toute l’équipe des
Agricompnteurs !). Là aussi, je prolongerai bien volontiers nos interminables discussions métaphysiques,
élément indispensable à la bonne santé psychologique du doctorant...
Les voisins de bureau et autres intermittents de la recherche sont eux aussi exposés aux aléas du huis
clos (parfois trop clos). Merci à ceux qui ont subit égayé mon passage à Grignon : (dans l’ordre
alphabétique) Marie ALEXIS, Maha CHALHOUB, Bruno CHEVIRON, Diego COSENTINO, Elsa
COUCHENEY, Lionel BERTHIER, Magalie DELMAS, Jeremy DOUBLET, Nadia ELYEZNASNI,
Muriel JOLY, Théodore KABORE, HongJian GAO, Gwenaëlle LASHERMES, Thomas LERCH,
Mercedes MENDEZ, Christophe MONI, Jean-Christophe PITRES, Clément PELTRES, GuyFang QI
(et bien d’autres que j’ai volontairement certainement oublié !)...
Mais comment oublier l’élément sans lequel une pièce thèse ne serait rien : le public les amis, et la
famille !
Je ne saurais faire ici la liste de tous les voisins de la résidence Jacques Ratineau (aka la fine équipe
de « move’n’Grignon »), avec qui j’ai eu le plaisir de partager chaque soir (ou presque) mes repas, et
bien d’autres bon moments. Merci à tous infiniment, et au plaisir de vous retrouver pour un « mercredi
sans spaghetti » ou autour d’un bon feu et une bonne grillade au « bassin des anglais » (c’est interdit ?
vous en êtes sur ?). Merci aussi à mon ami Benoît MERLOT (aka « DJ Ben ») qui, tout comme Xavier, a
en plus eu la charge de se farcir relire avec un regard « neuf » la première partie de ce document !
A ma famille, mes parents Benoît et Christine, ma sœur Marie et mon frère Charles, merci
infiniment pour votre soutien (pour cette thèse, et pour tout ce qui a précédé !), quand bien vous fûtes fort
négligés du fait de mes activités scientifiques de plus en plus passionnantes...
(Rideau)
15
J. Moeys Introduction, contexte
2 Introduction, contexte
■ 2.1 Problématique
Les produits phytosanitaires de protection des cultures – plus communément
appelés pesticides – sont un des piliers de la production végétale d’une
agriculture intensive (certains diront ‘productiviste’).
Les plantes cultivées ont généralement été sélectionnées pour leur capacité à
produire des rendements élevés quand elles sont semées dans un sol qui leur fournit
en suffisance l’eau, l’azote et les autres éléments nutritifs qui sont nécessaires à leur
croissance. La fertilisation adéquate du sol par l’agriculteur (fertilisation ‘raisonnée’)
permet de subvenir aux exigences des plantes cultivées. Seulement, la sélection
variétale est souvent accompagnée d’un corollaire indésirable : la plante est
généralement moins résistante aux maladies1, elle se défend moins bien contre les
ravageurs2 et elle est moins apte à concurrencer les plantes adventices qui
s’accaparent les ressources en eau, éléments minéraux et lumière.
Les variétés à haute performance ne nécessitent donc pas seulement une
fertilisation optimale, elles ont aussi besoin d’être protégées par des traitements
pesticides adéquats : herbicides, fongicides, insecticides et autres produits
phytosanitaires sont indispensables à leur croissance.
Une partie du produit phytosanitaire apporté lors du traitement n’atteint jamais sa
cible. Une part importante du produit résiduel est dégradée par les micro-organismes
du sol, par la lumière ou par d’autres phénomènes physiques et/ou chimiques. Une
faible proportion peut aussi échapper à cette dégradation, et être emportée dans l’air,
ou avec l’eau qui circule dans le sol. Cette dernière fraction se retrouve par la suite
dans les milieux aquatiques de surface ou les nappes phréatiques.
Les produits phytosanitaires étant souvent coûteux, ces pertes ont un coût
économique pour l’agriculteur (l’efficacité du traitement est réduite). Plus grave, la
faible fraction du produit qui s’échappe parfois vers l’air ou les ressources en eau peut
ensuite être inhalée/ingérée par des organismes vivants (plantes et animaux) et aussi
par l’homme.
Les produits phytosanitaires étant des molécules chimiquement réactives, il arrive
qu’elles aient un effet toxique (immédiat ou chronique) sur certains organismes vivants
non-ciblés quand elles sont ingérées en quantité trop importante. D’un problème
agro-économique, les pertes de produits phytosanitaires deviennent un
problème environnemental, voire un problème de santé publique.
Face à ce problème, plusieurs solutions sont envisageables, mais avant de les
exposer, il est important de rappeler les processus biologiques, physiques et chimiques
qui aboutissent à ces pertes inopinées de produits phytosanitaires.
L’étude présentée ici est focalisée sur la pollution diffuse des ressources en
eau souterraines par les produits phytosanitaires, et plus particulièrement sur
l’initiation de ces transferts dans la couche la plus superficielle de la croûte
terrestre, le sol.
1
Attaques fongiques ou virales.
2
Insectes, gastéropodes et rongeurs.
16
J. Moeys Introduction, contexte
3
Ou de toute autre surface ayant reçu un traitement par un produit phytosanitaire : bords de routes,
voies ferrées, allées engravées, pelouses de particuliers ou de terrains de sport...
17
J. Moeys Introduction, contexte
4
Programmes informatiques reproduisant les processus en jeu.
18
J. Moeys Introduction, contexte
19
J. Moeys Introduction, contexte
20
J. Moeys Objectifs
3 Objectifs
■ 3.1 Choix méthodologiques initiaux
Les objectifs du travail de thèse ont été définis à partir de choix méthodologiques
initiaux permettant de cadrer les recherches.
Le travail porte sur les sols d’un secteur agricole de 2600 ha centré autour de la
commune de Ouarville, en Beauce chartraine. La nappe de Beauce était (et est
toujours) contaminée à des niveaux variables par des produits phytosanitaires,
notamment dans le secteur étudié.
– Une seule molécule est étudiée, l’isoproturon. La molécule est largement utilisée
et, au même titre que le chlortoluron (de la même famille des urées substituées),
elle est fréquemment retrouvée dans les eaux souterraines.
– Le travail porte essentiellement sur la couche de sol cultivée, et non sur les
couches de sol sous-jacentes. L’horizon de surface est en effet crucial pour
l’adsorption et la dégradation des pesticides.
– En parallèle des objectifs exposés ci-dessous, le travail doit permettre l’acquisition
d’un jeu de mesures permettant de paramétrer un modèle de transfert de
pesticides dans les sols. La modélisation permet, une fois les propriétés
importantes mesurées, d’évaluer leurs effets combinés sur les transferts de
pesticides.
Ce modèle doit être basé sur des équations à base physique (modèle dit
mécaniste) permettant de rendre compte :
– Des transferts d’eau verticaux ;
– Du transport de soluté par convection ;
– De l’adsorption du soluté sur la phase solide du sol ;
– De la dégradation du soluté dans le sol.
En raison du contexte pédologique et topographique local, le travail de thèse ne
porte pas sur :
– Les transferts5 par ruissellement et érosion. Le relief local étant très peu
marqué, on estime que les pertes d'eau, de sol et de solutés par ruissellement et
érosion sont négligeables ;
– Les transferts via les fissures ou les macropores. Un précédent travail a permis
de montrer que les flux de macropores sont probablement négligeables dans le
secteur étudié. La molécule étudiée est appliquée à l'automne, et la période
critique des transferts va de l'automne au printemps. Aucune fissuration du sol
n'a été observée à cette période, le sol étant relativement humide et peu
'gonflant' (des fissures sont par contre observées en été à la surface du sol) ;
– Le transport colloïdal. Cet aspect est négligé autant pour des raisons de
moyens que pour l'absence d'évidence de transport profond de colloïdes.
5
Transferts d’eau et de soluté.
21
J. Moeys Objectifs
– La réalisation d’un ‘modèle spatial des sols’ cohérent avec la variabilité spatiale
des sols et des processus étudiés. Il s'agit d'un autre volet du programme
ESHEL.
– Quand différentes équations sont possibles pour rendre compte des processus
étudiés ci-dessus, les solutions les plus simples à paramétrer ont été choisies ;
– Le corollaire du point précédent est que ce travail doit privilégier l’évaluation de
la variabilité spatiale des propriétés du sol et de l’interaction sol-isoproturon
plutôt que la complexité locale des processus, en restant dans le cadre d’une
modélisation mécaniste. Une des conséquences de ce choix est un nombre plus
important d’échantillons évalués, mais une moindre complexité des méthodes de
mesure choisies.
En effet, la recherche sur les transferts de pesticides dans les sols peut privilégier
deux options : (a) Mieux comprendre et mieux décrire les processus en jeu ou (b)
mieux comprendre et mieux décrire la variabilité spatiale des processus. Ces
deux options sont complémentaires : dans une optique de recherche appliquée, il est
inutile de mieux rendre compte des processus si on ne sait pas les évaluer à une
échelle large, mais il est aussi inutile de réaliser des évaluations à une échelle plus
large si certains processus essentiels sont mal pris en compte... La limitation des
moyens oblige à privilégier alternativement l’une ou l’autre des options, et c’est la
deuxième qui a été choisie pour ce travail. Le programme ESHEL, situé quant à lui à
l’interface de ces deux options complémentaires, a pour but d’établir des connections
(transferts d’échelle) entre plusieurs échelles de mesures : Le profil de sol, la parcelle
agricole et une portion de bassin versant (‘secteur agricole’).
Les flux d’eau préférentiels6 sont soupçonnés d’expliquer une partie des pollutions
diffuses par les produits phytosanitaires. Des travaux antérieurs dans le secteur de
Ouarville ont permis de mettre en lumière certaines limitations des modèles de
transport de pesticides qui ne tiennent pas compte de ces flux préférentiels, ou qui les
décrivent par une compartimentation entre une microporosité et une macroporosité. Il a
été choisi d’explorer une troisième voie : les modèles hydriques à eaux mobile et
immobile.
6
Flux préférentiels : Flux d’eau se produisant à une vitesse plus rapide que ce qui est envisageable
avec la théorie classique de Richards. Voir le paragraphe « Flux préférentiels », p. 53.
22
J. Moeys Objectifs
23
J. Moeys Partie I
Partie I Étude
bibliographique
Flux d'eau et transferts de
pesticides dans les sols : les
processus et leur variabilité
spatiale
24
J. Moeys Partie I
25
J. Moeys Partie I
sa masse, et par le volume qu’elle occupe dans le sol. La figure 2 illustre la répartition
des masses et des volumes du sol, comme deux points de vue sur un même objet.
Les particules minérales et les constituants organiques qui constituent la phase
solide ne sont pas regroupés en bloc comme le suggère la figure 2, mais sont
disposées selon un arrangement complexe qui dégage des espaces libres, la
porosité, parfois appelée abusivement ‘vides’ du sol. Le volume total du sol est donc
constitué du volume occupé par la phase solide, et du volume des espaces laissés
libres.
Les volumes libres sont occupés par la phase liquide (l’eau) et par la phase
gazeuse du sol (l’air). La phase liquide remplit une partie des espaces libres, et la
phase gazeuse remplit les espaces laissés libres par le solide et par la phase liquide.
Si l’eau vient à percoler ou à s’évaporer, de l’air la remplace. Si de l’eau
supplémentaire s’infiltre dans le sol, elle chasse l’air des espaces libres. En résumé, la
phase solide (minérale) occupe un volume constant (ou considéré comme tel à court
terme) dans le sol. La phase liquide (eau), en quantité très variable, occupe tout ou
partie du volume laissé libre par la phase solide. La phase gazeuse (air) occupe
l’espace restant.
Le ‘sol sec’ est une appellation commune pour désigner le sol sans sa phase
liquide (remplacée par de l’air). On obtient ce sol sec par un séchage prolongé à 105°C,
mais le terme désigne aussi communément la phase solide d’un sol (sol qui n’a pas
forcément été séché). Ainsi, on exprimera l’abondance des différentes fractions qui
constituent la phase solide du sol en unité de masse par unité de masse de sol sec
(e.g. : g de CaCO3 . kg de sol sec-1).
La solution du sol désigne la phase liquide du sol et les éléments solubles ou en
suspension qui s’y trouvent. Ces éléments peuvent être des substances chimiques,
des molécules organiques ou des particules en suspension (colloïdes).
26
J. Moeys Partie I
27
J. Moeys Partie I
terrain.
La figure 4 présente le triangle des textures établi par la Chambre d’Agriculture de
l’Aisne, qui est le triangle des textures utilisé pour cette étude (Jamagne, 1967).
On peut représenter les caractéristiques granulométriques d’un échantillon sur le
triangle par un point positionné en fonction de ses proportions d’argile, de limon et de
sable. Cela permet d’attribuer une classe de texture à un échantillon, et de comparer
visuellement la granulométrie de plusieurs échantillons. Sur le terrain, c’est le procédé
inverse qui est utilisé. Les sensations tactiles et le comportement de l’échantillon
déterminent sa classe de texture. On peut alors estimer sa granulométrie à partir des
teneurs moyennes en argile, limon et sable de sa classe.
Mulla et McBratney (2002) indiquent que le coefficient de variation (CV) de la teneur
en argile est classiquement compris entre 16 et 53%, relativement en accord avec les
variabilités indiquées par Vauclin (1982) ou Warrick et Nielsen (1980).
■ Constituants organiques
La phase solide du sol est constituée de deux parties de nature chimique distinctes.
Une partie minérale, de loin la plus abondante8, qui dérive des matériaux géologiques
aux dépens desquels le sol s'est développé, et une partie organique, qui dérive des
débris végétaux tombés au sol et progressivement altérés et intégrés à celui-ci. Une
partie de ces débris est intégrée par la faune ou la microflore du sol. Un autre pool de
produits de l'altération des résidus végétaux forme de nouvelles molécules organiques,
par altération et/ou par condensation éventuelle d'une partie des produits de
l'altération, ou produite par les microorganismes du sol. Cette formation de
molécules organiques est appelée humification (Gobat et al., 2003). La phase ultime
de l'altération des matières organiques du sol est sa minéralisation (transformation en
molécules inorganiques), soit directement lors de son altération (minéralisation
primaire), soit à partir des matières organiques humifiées (minéralisation secondaire).
La macrofaune du sol (vers de terre, arthropodes, etc.), et la microflore (bactéries,
champignons, etc.), morte ou vivante, et leurs sécrétions / excrétions, ont un rôle de
premier plan sur le fonctionnement et les propriétés de cette matière organique. La
quantité de débris végétaux qui arrive au sol chaque année, et les vitesses des
différents processus (intégration biologique, humification, minéralisation) déterminent
l'équilibre qui s'établit entre eux et la quantité globale de matières organiques stockée
dans le sol. Les natures biochimiques des matières organiques sont très variées,
de même que leur temps moyen de résidence dans le sol (lié à leur stabilité). La
nature biochimique des matières organiques et les processus qui aboutissent à leur
formation et leur minéralisation ne sont pas développés ici, du fait notamment de leur
complexité. La nature biochimique des matières organiques n'en est pas moins
essentielle, notamment pour la réactivité du sol vis-à-vis des substances organiques
anthropiques / exogènes qui peuvent y être apportées (e.g. Ahmad et al., 2006).
La partie organique du sol est caractérisée en premier lieu par son
abondance, exprimée en grammes de matières organiques par kilogramme de terre
fine [g.kg-1], comme pour les fractions granulométriques. Le carbone est un élément
majeur dans la constitution des molécules organiques. Le dosage du carbone
organique du sol est plus aisé que celui de la matière organique totale. Pour cette
raison, on utilise souvent la teneur en carbone organique comme expression de
l’importance de la partie organique du sol (exprimée aussi en [g.kg-1]). Le rapport entre
la teneur en matière organique et la teneur en carbone organique est relativement
constant. Ce rapport se situe en général autour de 1,72 g de matières organiques par
8
À l’exception notoire des sols de tourbes et des horizons de surface sous forêt.
28
J. Moeys Partie I
■ Complexe argilo-humique
La matière organique est intimement mêlée à la matière minérale du sol, notamment
les fractions les plus fines (argiles), et forme avec elles ce que l’on appelle le
complexe argilo-humique (e.g. Gobat et al., 2003 ; Bronick et Lal, 2005). Outre le fait
qu'il est l'un des principaux liguant / ciment qui soude les particules de plus grande
29
J. Moeys Partie I
taille (limon, sable) entre elles, le complexe a une importance capitale pour les
interactions entre la phase solide du sol et les molécules solubilisées dans sa
phase liquide (soluté de la solution du sol).
L’approche retenue dans ce travail néglige les aspects relatifs à la nature
minéralogique ou biochimique du complexe argilo humique, au profit d’autres
propriétés agronomiques et pédologiques du sol. Pour cette raison, les
caractéristiques du complexe argilo-humique ne sont pas détaillées.
30
J. Moeys Partie I
31
J. Moeys Partie I
l’on combine cette revue bibliographique à celle de Warrick et Nielsen (1980) (sources
citées : Gumaa, 1978 ; Nielsen et al., 1973 ; Cassel et Bauer, 1975 ; Gajem et al.,
1981 ; Luxmoore et Sharma, 1980 ; Bascomb et Jarvis, 1976 ; Vauclin et al., 1982) les
valeurs moyennes des masses volumiques apparentes s’étalent de 1,25 à 1,63 kg.dm-3,
avec des coefficients de variation (CV) entre 4 % et 14,5 %. Sur 0,02 ha Luxmoore et
Sharma (1980) mesurent une masse volumique apparente moyenne de 1,63 g.kg-1 avec
un CV de 10,4 %. Sur 0,4 ha, Vauclin et al. (1982) obtiennent une masse volumique
moyenne de 1,29 g.kg-1, et un CV de 4 %. Sur 1,8 ha et n = 99 échantillons, Lennartz
(1999) mesure une masse volumique apparente moyenne de 1,42 g.kg-1 avec un CV de
6,2 %. Gumaa (1978), Gajem et al. (1981), et Nielsen et al. (1973) obtiennent des
masses volumiques apparentes moyennes de 1,3, 1,38, et 1,4 g.kg-1 et des CV de 6,9 %
14,5 %, et 6,8 % pour 15, 85 et 150 ha, respectivement. Sur 250 ha et 9 sols-types,
Morvan et al. (2004) mesurent une masse volumique apparente moyenne de 1,42 g.kg-1
avec un CV de 6,7 % (inter types), ou entre 1,16 à 1,68 kg.dm-3 et 0,6 et 13,7 % (intra
type). Aux échelles nationales, Nemes et al. (2005) obtiennent des valeurs moyennes
de 1,38, 1,25 et 1,63 g.kg-1 et des CV de 7,9 %, 4 % et 14,5 % pour des bases de
données européenne, hongroise et nord-américaine (voir le paragraphe Constituants
organiques, p. 27). Enfin, signalons que Gajem et al. (1981) et Webster (1977) (cités
par Vauclin, 1982) trouvent des longueurs d’autocorrélations de 2 et 33,3 mètres pour la
masse volumique apparente.
De cette analyse il ressort que (i) la masse volumique apparente a une variabilité
plutôt faible. Cette faible variabilité est à mettre en relation avec la gamme de valeurs
restreinte que peut prendre la masse volumique apparente d’un sol cultivable. En effet,
si l’on se réfère à l’équation 3, un sol ayant une masse volumique de 0,9 kg.dm-3 à une
porosité de 66 %, ce qui est beaucoup, et un sol ayant une masse volumique de
1,9 kg.dm-3 à une porosité de 28 %, ce qui est très faible (basées sur les valeurs
extrêmes citées par Nemes et al., 2005). Un calcul empirique simple (effectué à l'aide
d'un logiciel statistique) montre qu’une population de masses volumiques apparentes
ayant une distribution de probabilité uniforme entre 0,9 et 1,9 a un CV proche de 20 %.
(ii) la variabilité spatiale de la masse volumique apparente ne semble pas liée à
l’échelle considérée. Une variabilité importante est possible à l’échelle d’une petite
parcelle agricole comme à l’échelle nationale.
Se basant sur une revue de fonctions de pédotransfert, Tranter et al. (2007)
proposent un modèle conceptuel de la masse volumique apparente du sol :
32
J. Moeys Partie I
quantitativement plus importante que dans les sols cultivés (de Vos et al., 2005).
Tranter et al. (2007) considèrent la part de variabilité de la masse volumique apparente
‘non-expliquée’ par les modèles comme essentiellement liée à la structure du sol, qui
est rarement intégrée dans ces modèles, rejoignant en cela le constat fait par
Pachepsky et al. (2006) sur les fonctions de pédotransfert hydrologiques.
33
J. Moeys Partie I
■ Caractéristiques
Un sol se développe aux dépens / à partir d’un ou de plusieurs matériaux parentaux
(matériaux géologiques). Sous l’action de la pédogenèse, ces matériaux vont évoluer.
Ils s’altèrent et se structurent. Des mouvements d’éléments dissous et de particules en
suspension s’opèrent parfois, avec des phénomènes d’appauvrissement et
d’enrichissement relatif (depuis la partie du sol qui perd des constituants, vers la partie
du sol ou du sous-sol qui en gagne).
34
J. Moeys Partie I
■ Caractéristiques
Le type de sol est déterminé à partir d’une succession verticale d’horizons. Cette
succession, et donc la notion de types de sols est liée à une vision parfois
monodimensionnelles du sol (sondage à la tarière), parfois bidimensionnelle (profil de
sol) ou tridimensionnelle (le pédon), mais toujours localisée, limitée à une surface de
quelques mètres carrés.
L’agencement réel des horizons est défini dans les 3 dimensions de l’espace, pour
former un milieu continu qui recouvre les matériaux géologiques sous-jacents. Cet
agencement est appelé couverture pédologique9. La discipline qui porte sur l’étude
de sa formation et de son organisation est appelée 'analyse structurale'. Du fait des
moyens importants nécessaires à sa mise en œuvre, l’analyse structurale est rarement
appliquée sur de grandes étendues. Elle est plutôt utilisée à des fins de
compréhension des règles de répartition des sols dans le paysage, règles qui
peuvent ensuite être utilisées à une échelle plus petite (sur une surface plus grande).
35
J. Moeys Partie I
pas été observé, c’est le rôle des méthodes d’interpolation, qu’elles soient numériques
ou réalisées par expertise empirique. Il faut enfin simplifier la géométrie des objets
ainsi définis, c’est le rôle des plages cartographiques ou des pixels des représentations
en grille systématique (raster). Les trois étapes sont étroitement liées, les choix
méthodologiques de l’une déterminant les choix possibles pour les autres.
Ainsi, même quand les études portant sur le sol n’ont pas la précision nécessaire à
une analyse structurale, elles doivent néanmoins tenir compte de la manière dont sont
agencés les horizons, de la manière dont ils se répartissent dans le paysage et des
niveaux de variabilité spatiale du sol11, afin de choisir au mieux les simplifications
appliquées à la représentation du sol.
11
Dans les limites de ce qu’on en connaît ou de ce qu’on peut en connaître.
36
J. Moeys Partie I
37
J. Moeys Partie I
dans des proportions différentes selon leur volatilité, leur solubilité ou leur affinité pour
la phase solide du sol. Le rôle de la phase solide du sol est particulier, car les
molécules se répartissent généralement en surface de cette dernière, à l’interface
entre la phase liquide et la phase gazeuse : il s’agit du phénomène d’adsorption. Enfin,
une incorporation dans la phase solide du sol se produit parfois pour certaines
molécules. Ce phénomène appelé immobilisation, qui aboutit à la formation de résidus
liés (résidus non extractibles), a lieu sur des échelles de temps supérieures à ce qui
est présenté ici (Barriuso et Benoît, 2007, figure 26).
On peut considérer schématiquement 4 niveaux d’observation des pesticides
dans le sol :
– (i) Les compartiments dans lesquels les pesticides se répartissent, phase
gazeuse, liquide et solide ;
– (ii) Les processus qui gouvernent la répartition (équilibre) des pesticides dans les
différents compartiments en l’absence de mouvements de solution : la diffusion
et l'adsorption.
– (iii) Les processus qui gouvernent les transferts des pesticides dans une solution
en mouvement (mouvement dans la porosité du sol), cette dernière ‘emportant’ une
partie des solutés, par convection (accompagnée de dispersion) ;
– (iv) Les processus physiques, chimiques et/ou biologiques qui aboutissent à la
transformation des pesticides (dégradation, aboutissant à la formation de
métabolites), et au final à leur minéralisation.
figure 5 – Les processus de transport, d’adsorption et de dégradation des pesticides dans les
différentes phases du sol.
Adapté et modifié d’après Meiwirth (2003). NB : ce schéma ne présente pas les processus de
transport en surface du sol, par ruissellement et érosion.
L’eau est un des éléments clés pour expliquer le comportement des pesticides dans
les sols. Même en l’absence de mouvements d’eau dans le sol (hydrostatique), la
quantité d’eau présente dans le sol est cruciale car elle détermine le rapport
volumique ou massique entre l’eau et la phase solide, et de là :
38
J. Moeys Partie I
12
La figure 96, p. 302, en annexe de ce document, illustre les différents types de variables et leur rôle
dans les modèles informatiques de transferts de pesticides. Ces variables sont le pendant ‘numérique’
des propriétés du sol, des molécules et des processus exposés ici.
39
J. Moeys Partie I
40
J. Moeys Partie I
équation 6 – Relation entre teneur en eau massique, teneur en eau volumique et masse
volumique apparente.
Un sol ayant une masse volumique apparente de 1,2 g.cm-3 aura donc une teneur en
eau volumique égale à 1,2 fois sa teneur en eau massique.
L’équation 5 permet aussi, connaissant la teneur en eau massique d’un sol ou d’un
échantillon, de passer de la masse ‘équivalent sol sec’ à sa masse humide et vice
versa :
équation 7 – Conversions de la masse ‘équivalent sol sec’ (MS) à la masse de sol humide
(Mtot) ou de Mtot vers MS.
13
Elle varie selon le/les rayon(s) de courbure (ou l’angle de contact) à l’interface entre deux phases.
41
J. Moeys Partie I
■ Rétention en eau
La relation entre la teneur en eau volumique du sol θ et son potentiel matriciel h est
fortement non-linéaire : une multiplication ou une division par 2 de θ provoque une
variation d’un ordre de grandeur (multiplié ou divisé par 10) de h. Ainsi pour un sol
limono-argileux, le passage d’une teneur en eau de 0,43 à 0,22 puis 0,12 m3.m-3 fait
passer le potentiel de –1, à –10 puis –100 m (pF2, 3 et 4 respectivement ; exemples de
valeurs possibles).
Les mesures expérimentales de la relation entre la teneur en eau et le potentiel
matriciel présentent une forme à double asymptote : la teneur en eau tend vers un
maximum quand le potentiel tend vers 0 et un minimum quand le potentiel est élevé
(pF > 6). Les fonctions ajustées aux mesures expérimentales doivent présenter une ou
plusieurs des caractéristiques suivantes : (i) reproduire correctement la courbe et ses
deux asymptotes (ii) se baser sur un nombre de paramètres raisonnables, auxquels on
14
Notamment les phénomènes d'hystérésis, qui font que la relation θ(h) varie aussi selon le sens des
variations de θ, si le sol est en cours d'humectation ou de dessiccation.
42
J. Moeys Partie I
peut trouver une signification ‘physique’ (iii) établir un lien entre les propriétés de
rétention en eau du sol et sa conductivité hydraulique, par l’intermédiaire de certains
paramètres communs.
et quand hA ≤ h < 0
équation 12 – Modèle de Brooks et Corey θ(h).
Avec θE [-] l'indice de saturation en eau ; hA [L] ou (m) le potentiel matriciel au point d'entrée
d'air ; λ [-] un paramètre de forme, l'index de distribution de la taille des pores ; θR [L3.L-3] la
teneur en eau résiduelle et θS [L3.L-3] la teneur en eau à saturation du sol, quand h ≥ hA.
On notera que cette fonction est continue, en deux domaines, et présente une
rupture de pente. La valeur de θ est fixe quand hA ≤ h < 0, ce qui simplifie
artificiellement le comportement du sol observé au voisinage de la saturation.
quand h < hA
et quand hA ≤ h < 0
équation 13 – Modèle de Campbell 1974 reformulé en θ(h).
On constate que le paramètre λ de Brooks et Corey correspond à (1/b).
On constate aussi que la transformation des variables en ln(θ) = f( ln(h) ) permet de
dériver les paramètres b et hA par simple régression linéaire (voir l’équation 30 p. 99).
On constate que θS module la hauteur du palier sur l’axe des teneurs en eau, hA
43
J. Moeys Partie I
44
J. Moeys Partie I
45
J. Moeys Partie I
46
J. Moeys Partie I
volumique) d’eau potentiellement15 disponible pour les plantes. Dans le cas d’une
plante cultivée, si on multiplie cette différence de teneurs en eau volumiques par la
profondeur d’enracinement, on obtient une estimation de la hauteur (quantité) d’eau
potentiellement utilisable par la plante dans le sol : cette hauteur d’eau est appelée
réserve utile du sol (RU). Si l’on ne considère qu’un seul horizon de sol, colonisable
sur toute son épaisseur par les racines, on peut parler de teneur en eau utile de
l’horizon, avec θU = (θpF2 – θpF4,2) (teneurs en eau volumiques).
15
Il s’agit d’une quantité ‘potentielle’ et non d’une ‘réserve réelle’. La quantité d’eau dans le sol fluctue au
cours de la saison culturale, selon la météo et les prélèvements racinaires par les plantes.
47
J. Moeys Partie I
quand h < hA
et quand hA ≤ h < 0
équation 15 Modèle de Brooks et Corey de K en fonction de h.
Avec KS [L.T-1] ou (m.s-1) la conductivité hydraulique du sol à saturation ; hA [L] ou (m) le
potentiel matriciel au point d’entrée d’air ; m [-] un paramètre de forme dépendant de la
distribution de taille de pores.
48
J. Moeys Partie I
quand h < hA
et quand hA ≤ h < 0
équation 17 – Modèle de Campbell (1974) de K en fonction de h (reformulé).
On voit que le paramètre m de Brooks et Corey est égal à 2+3/b, et que les deux
modèles sont équivalents.
On constate que KS module la hauteur du palier sur l’axe des conductivités, hA
module l’amplitude de ce palier sur l’axe des potentiels et -(2+3/b) module la pente de
décroissance des conductivités pour les potentiels inférieurs à hA.
49
J. Moeys Partie I
50
J. Moeys Partie I
fosses pédologiques. Sur les horizons de surface de 4 autres fosses, situées dans une
même parcelle16 du secteur de Ouarville, Coquet et al. (2006) (mesures INRA
d’Orléans / I. Cousin) ont déterminé des conductivités hydrauliques avec la méthode
de Wind (1968) : les valeurs s’étalent de 6,28.10-3 mm.s-1 à 1,17.10-1 mm.s-1 (n=14). Sur
un transect réalisé dans la même parcelle, Coquet et al. (2006) (mesures
LTHE / R. Angulo-Jaramillo) ont déterminé des conductivités hydrauliques par la
méthode ‘Beerkan’ : dans l’inter-rang du blé, le KSAT va de 7,74.10-4 à 5,22.10-2 mm.s-1,
avec une moyenne de 1,36.10-2 mm.s-1 et un CV de 95 % (n = 24).
Mulla et McBratney (2002) classent la portée du variogramme de la conductivité
hydraulique à saturation entre 1 et 34 mètres. Vauclin (1982), analysant 5 publications
indique que la conductivité hydraulique à saturation a une portée ou une distance
d'autocorrélation comprise entre 2,5 et 50 mètres, avec une référence pour laquelle la
portée est inférieure à deux mètres (effet pépite). Russo et Bouton (1992) mesurent
des distances d'autocorrélations de 0,8 m, et citent les travaux de Byers et Stephens
(1983) et de Sudicky (1986) qui trouvent une distance d'autocorrélation entre 0,6 et
2,8 m. Logsdon et Janes (1996) trouvent une autocorrélation de KSAT sur 0,6-0,8 m.
■ La sorptivité
La sorptivité S [L.T-1/2] est un paramètre du sol qui reflète sa capacité à absorber
l’eau par capillarité, en fonction des teneurs en eau (et donc du potentiel) initiales
et finales lors d’un apport d’eau (comme c’est le cas lors d’une infiltration). Le
paramètre est exprimé en unité de longueur par unité de temps exprimée en √T. En
l’absence d’effets de la gravité sur l’infiltration d’eau dans le sol (ce qui est
approximativement le cas au début de cette dernière) la quantité d’eau infiltrée dans
le sol est fonction de la sorptivité et de la racine carrée du temps (cf. équation 37,
p. 107), ce qui traduit un ralentissement progressif des effets de la capillarité en
fonction du temps.
La sorptivité S est un paramètre essentiel pour la description de l’infiltration
de l’eau dans le sol, comme la conductivité hydraulique K(h). La sorptivité reflète
les effets de la capillarité sur l’infiltration, tandis que la conductivité reflète les effets de
la gravité, pour une différence de potentiel donné (cf. « Détermination des paramètres
de la conductivité hydraulique in situ », p. 100).
■ Équation de convection-dispersion
En l'absence de tout phénomène de dispersion ou de diffusion, tout déplacement
d'eau dans le sol induit un déplacement de soluté par convection. A un endroit donné
du sol, la variation de masse du soluté est égale à la quantité de soluté exportée par le
16
Parcelle étudiée par Alletto (2004), Moeys (2004), Moeys et al. (2006) et Millot (2004).
51
J. Moeys Partie I
flux d'eau. Mais le sol est un milieu complexe et sa porosité un réseau tortueux qui
induit une dispersion des molécules en solution : (1) dispersion du fait du gradient de
vélocité de l'eau dans chaque pore (vélocité maximale au centre), (2) dispersion du fait
de flux différents dans les pores de tailles différentes, (3) dispersion du fait de
directions de flux inégales et enfin (4) dispersion du fait de trajets de longueur variable
pour parcourir une 'distance' de point à point similaire. Lorsque des différences de
concentration en soluté existent dans le sol, des phénomènes de diffusion se mettent
en œuvre pour rééquilibrer les concentrations dans la solution du sol.
Diffusion et dispersion ayant des effets similaires et difficiles à séparer, les deux
phénomènes sont résumés par un seul est même paramètre, le coefficient de
dispersion hydrodynamique.
Les phénomènes de convection et de dispersion-diffusion sont rassemblés dans
une même équation de conservation de la masse, équation aux dérivées partielles qui
exprime la variation de masse de soluté par rapport au temps en fonction de la
variation dans l’espace du flux convectif de soluté auquel on ajoute les effets de la
dispersion. Une fonction additionnelle 'puits' ou 'source' de soluté permet de prendre
en compte les phénomènes connexes de prélèvement de soluté (par les plantes), ou
de dégradation.
52
J. Moeys Partie I
■ Flux préférentiels
Les études de dissipation des pesticides à l’échelle parcellaire ont montré que, dans
certains cas, le facteur ‘atténuation’ présenté ci-dessus ne semblait pas pertinent, dans
la mesure où des pesticides présentant des coefficients d’adsorption contrastés
atteignaient en même temps la base du sol (pour une revue, voir Flury, 1996). Si la
proportion totale de pesticide lixiviée est bien corrélée à ses propriétés d’adsorption et
de dégradation, la temporalité de certains flux d’eau et de pesticides est en désaccord
avec les équations du transport de l’eau.
Ces flux rapides et ‘non-expliqués’ par les théories classiques du transport d’eau et
des solutés sont appelés flux préférentiels. L’explication généralement donnée est
l’absence d’équilibre / d’homogénéité dans la porosité du sol. Le sol a une teneur en
eau et un potentiel global, mais il subsiste localement des différences, notamment liées
aux variations locales de porosité, ou de propriétés du sol (hydrophobicité). Cette
absence d’équilibre affecte la circulation de l’eau dans le sol, qui peut très localement
s’avérer plus rapide que le mouvement global prévu par les fonctions θ(h) et K(h).
Si l’on se réfère à Šimůnek et al. (2003), l’une des caractéristiques des flux
préférentiels est que « durant une phase d’humectation, une partie du front
d’humectation peut se propager rapidement à une profondeur significative, en court-
circuitant une large partie de l’espace poral de la matrice [du sol] ».
Les flux préférentiels sont en fait de nature variée. Radcliffe et Rasmussen (2002)
classent les modèles de flux préférentiels en 3 catégories :
– (i) Les flux préférentiels liés à la présence de macropores qui conduisent les flux
d’eau plus rapidement que la matrice lorsqu’ils sont saturés ;
– (ii) Les flux préférentiels liés aux contrastes de texture entre deux couches de sol
(horizon à granulométrie fine sur horizon à granulométrie plus grossière), ce qui
engendre un contraste de potentiel lors de l’infiltration, engendrant à son tour des
instabilités locales qui aboutissent à une infiltration par digitation dans l’horizon
à granulométrie grossière (en anglais : fingering) ;
– (iii) Les flux préférentiels liés à des contrastes de texture internes aux horizons
de sol ou aux matériaux de la zone non-saturée qui induisent des flux plus réduits
dans les zones de granulométrie plus grossière (en anglais : funneling).
La première catégorie peut être généralisée par les concepts de multi-porosité /
multi-perméabilité qui sous tendent de nombreux modèles physiques de flux
préférentiels. Le concept de double porosité peut par exemple refléter la présence de
macropores, dans le sens pédologique (pores les plus larges, fissures et conduits de
vers de terre...), au côté d’une porosité matricielle plus fine, mais n’est pas limité à ce
seul concept.
Une autre conséquence des flux préférentiels en ‘non-équilibre’, soulignée par
53
J. Moeys Partie I
Šimůnek et al. (2003), est le comportement encore moins ‘linéaire’ des flux d’eau et de
solutés au voisinage de la saturation (les fonctions K(h) ‘classiques’ induisant déjà une
non-linéarité des flux...).
C’est un des modèles les plus simples qui a été utilisé dans l’étude présentée ici, le
modèle à double porosité – double perméabilité eau mobile / eau immobile.
équation 22 – Bilan de masse de soluté dans les parties mobile et immobile de la phase
liquide du sol.
Avec S le soluté considéré ; MS,totale [M] ou (kg) la masse totale de soluté dans la phase liquide;
MS,mob. la masse de soluté dans la phase mobile ; MS,imm. la masse de soluté dans la phase immobile
du sol ; Comme la masse est égale à la concentration fois le volume, on obtient la 2e équation, avec
CS,globale [M.L-3] ou (kg.m-3) la concentration en soluté globale, dans la phase liquide ; CS,mob. la
concentration en soluté dans la phase mobile du sol ; CS,imm. la concentration en soluté dans la
phase immobile.
Cette équation permet notamment de déduire la teneur en eau immobile à partir
d'expériences d'infiltration avec un traceur inerte (voir les matériels et méthodes,
p. 120).
54
J. Moeys Partie I
Lorsque l'on considère une phase liquide en mouvement, sur un axe vertical
(monodimensionnel) et en régime hydrodynamique permanent, la concentration en
soluté à la profondeur z et au temps t est décrite par les équations aux dérivées
partielles suivantes :
avec
équation 23 – Équations aux dérivées partielles des teneurs en eau mobile et immobile et de
leurs concentrations en soluté.
Avec z [L] ou (m) la profondeur ; t [T] ou (s) le temps ; D le coefficient de dispersion [L2.T-1] ou
(m2.s-1) du soluté dans la phase mobile et α le coefficient de diffusion (d'échange) [T-1] ou (s-1) du
soluté entre la partie mobile et la partie immobile.
Le modèle MIM présenté ci-dessus ne comprend pas explicitement de termes
décrivant une éventuelle variation de la teneur en eau ‘apparemment’ immobile en
fonction du potentiel h. Or il paraît évident que la fraction d’eau dite immobile peut
parfois évoluer avec les variations de teneur en eau, notamment si la fraction d’eau
immobile est importante : lorsque le sol sèche, la teneur en eau du sol peut parfois être
inférieure à la teneur en eau immobile mesurée à saturation. Pour ces raisons, il est
important de comparer des fractions d’eau immobile en tenant compte du
potentiel auquel elles ont été mesurées.
55
J. Moeys Partie I
ici, Alletto et al. (2006b) mesurent des fractions d’eau immobile variant entre 21,3 % et
88,2 % (n = 8 ; h = -1 cm), avec une des 3 fosses pédologiques étudiées présentant une
fraction d’eau immobile plus basse. La fraction d’eau immobile moyenne entre les 3
fosses est de 53,3 %. Sur la même parcelle, Millot (2004) a mesuré des fractions d’eau
immobile variant entre 0 et 93 % et entre 0 et 96 %, et de 53,3 % en moyenne sur deux
transects emboîtés (n = 19 et 24 ; h = -1 cm), dans un alignement parallèle à celui des 3
fosses caractérisées par Alletto et al. (2006b). Köhne et al. (2004) ont estimé par
inversion les paramètres de deux modèles de teneur en eau immobile complexes, à 8
et 10 paramètres, sur des colonnes de sol. Ils mesurent une fraction d’eau immobile à
saturation (h = 0 cm) entre 59 et 89 %.
Alletto et al. (2006b) ont évalué que, sur la parcelle étudiée (Ouarville), les effets de
la diffusion (α) entre la fraction mobile et la fraction immobile pouvaient être négligés
lors d’une mesure de la fraction d’eau immobile au voisinage de la saturation. Ils
mesurent une valeur de α entre 0,0006 to 0.0115 h-1. Ces valeurs apparaissent
relativement faibles au regard d’autres études que les auteurs citent (α entre 0,008 et
0,3 h-1).
Sur un transect de 58 m, avec 47 mesures, Casey et al. (1997) n’ont pas réussi à
mettre en évidence de structure spatiale de la fraction d’eau immobile ou du coefficient
d’échange α, malgré un espacement entre les mesures un peu supérieur à 1 m. Millot
(2004) a identifié une longueur caractéristique de corrélation de 88 m, pour des
mesures de fraction d’eau immobile espacées de 40 m.
56
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par exemple représenter deux localisations différentes dans la porosité du sol, évoluent
indépendamment l’un de l’autre (pas de terme d’échange). Quand B = 0, la cinétique
globale devient une cinétique de premier ordre comme l’équation 28. Pour que l’allure
d’une cinétique de 2nd ordre diffère sensiblement de l’allure d’une cinétique de 1er
ordre, il faut : (i) que les constantes de dégradation k1 et k2 soient suffisamment
différentes (e.g. différant d’un facteur 5 à 10) (ii) que la différence entre A et B ne
soient pas trop importante (e.g. A ou B > 15% de C0).
Si ce modèle ajuste mieux des dégradations très biphasiques, il présente
néanmoins quelques désavantages par rapport à l’exponentielle simple : il comporte
deux constantes de dégradation, difficiles à comparer avec une valeur de demi-vie
unique (Beulke et Brown, 2001) ; il comprend 4 paramètres, ce qui peut nuire à la
robustesse des ajustements quand peu de données mesurées sont disponibles.
La fonction de 1er ordre de cet exemple a en fait été ‘ajustée’ sur la cinétique de 2nd
ordre (avec C0 = 100%), de manière à estimer la DT50 équivalente. On constate que
dans ce cas, la cinétique de 1er ordre sous-estime la dégradation dans un premier
temps, puis la surestime par la suite.
3 L'isoproturon
L’isoproturon est une molécule utilisée pour le désherbage sélectif des céréales
d’hiver ou de printemps (blé tendre d’hiver, blé de printemps, orge d’hiver, escourgeon,
seigle d’hiver ou triticale17, mais pas le blé dur).
Elle cible principalement les graminées annuelles comme le vulpin des champs,
l’agrostide ou jouet du vent, le pâturin annuel, le ray-grass et, dans une moindre
mesure, la folle avoine 18 et de plusieurs dicotylédones annuelles (Roberts, 1998 ou
Tomlin, 1994), dont la matricaire, le mouron blanc et l’alchémille (Rigaud et Lebreton,
2004). La molécule est absorbée par les feuilles et les racines, et a une action
systémique, aboutissant à l’inhibition de la photosynthèse des adventices (Tomlin
1994).
L’isoproturon est rattaché à la famille des urées substituées, comme le chlortoluron.
17
Triticum aestivum L. subsp. aestivum ; Hordeum vulgare ; Secale cereale L. ; Triticosecale.
18
Alopecurus myosuroides ; Agrostis spica-venti ; Poa annua ; Lilium sp. ; Avena fatua.
62
J. Moeys Partie I
La molécule est appliquée en pré- ou post-levée. Dans le secteur étudié, elle est
surtout utilisée sur les céréales d’hiver et appliquée peu après le semis. Elle est aussi
utilisée en ‘rattrapage’ de printemps, sur les mêmes céréales, si le désherbage hivernal
n’a pas été satisfaisant.
La dose d’application maximale légale de l’isoproturon utilisé seul est de 1200 g.ha-1.
Une note d’information19 éditée à l’occasion du réajustement à la baisse de cette dose
maximale rappelle que la dose doit être modulée en fonction des conditions
pédologiques et du stade de croissance des adventices (entre 800 et 1200 g.ha-1), avec
des doses plus faibles pour (i) les sols avec un drainage interne important, dits
« vulnérables » (sableux, ‘crayeux’, ‘filtrants’) (ii) les sols avec un faible teneur en
argile (< 20 %) (iii) les adventices a un stade peu avancé (1 à 3 feuilles). Des doses
intermédiaires sont préconisées sur les situations intermédiaires (teneur en argile entre
20 et 30 %, adventices en cours de tallage).
Une liste des produits commerciaux (formulations) comportant de l’isoproturon peut
être retrouvée sur le site e-phy du Ministère de l’Agriculture et de la pêche, et de la
SRPV (http://e-phy.agriculture.gouv.fr/mata/4818.htm, dernier accès : octobre 2007).
Isopropyl-aniline
Didéméthyl isoproturon
figure 11 – Formule plane de l’isoproturon et de ses métabolites.
Le tableau 1 ci-dessous donne les noms IUPAC de l’isoproturon et de ses métabolites (IUPAC :
International Union of Pure and Applied Chemistry).
L’isoproturon est une molécule organique de la famille des phénylurées. Ces
dernières sont constituées d’un cycle phényle (C6H4) avec une molécule de méthylurée
((NH2)–CO–NH–CH3) sur l’un des carbones (carbone 1). Les différentes molécules de
la famille des phénylurées se distinguent par la nature des groupements qui sont
greffés sur l’azote de la méthylurée (en remplacement du H) et/ou sur le carbone 3,
et/ou sur le carbone 4 du cycle phényle (en remplacement d’un H) (d’après Sorensen
et al. 2003).
L’isoproturon est le 3-(-4-isopropylphényl)-N’,N’-dimethylurée (figure 11,
tableau 1), l’hydrogène carbone 4 étant remplacé par un groupement diméthyle.
L’une des principales voies de dégradation de l’isoproturon dans les sols est la
déméthylation au niveau de l’atome d’azote, sous l’effet d’enzymes ou de micro-
organismes (Tomlin, 1994), aboutissant au mono-déméthyle isoproturon (MD-IPU) et
au di-déméthyle isoproturon (DM-IPU). La phénylurée est ensuite hydrolysée (Tomlin,
19
« Note d’information commune : ARVALIS, APCA, FFCAT, FNA, FNSEA, IN VIVO, Jeunes
Agriculteurs, Ministère de l’Agriculture, de l’Alimentation, de la Pêche et des Affaires Rurales, UIPP,
COLUMA–AFPP. », 2003.
63
J. Moeys Partie I
64
J. Moeys Partie I
□ Adsorption (KOC)
Le coefficient d’adsorption KOC de l’isoproturon – qui reflète son degré de mobilité
(ou plutôt son degré d’immobilisation par la phase solide du sol) – est en moyenne
entre 120 et 140 L.kg-1, ce qui en fait une molécule de mobilité intermédiaire (par
rapport à d’autres molécules, si l’on se réfère par exemple à la figure 1 dans
Wauchope, 2002). La du KOC est néanmoins importante, ce qui suggère que la
réactivité de cette dernière n’est pas uniquement contrôlée par la quantité de matières
organiques, mais aussi par d’autres paramètres comme les propriétés physico-
chimiques de la matière organique ou la réactivité vis à vis des argiles (explications
65
J. Moeys Partie I
possibles).
KOC [L.kg-1] KF [L.kg-1] nF [-]
AgriTox 36 à 241, m = 122 0,26 à 27,1 0,84
SANCO 2001 36 à 241, m = 122 0,26 à 27,1
Tomlin éd. 1994 0,8 à 4,2
Roberts éd. 1998 125
FOOTPRINT PPDB 2007. 139
tableau 3 – Valeurs d’adsorption (KF ou KOC) de l’isoproturon fournies par les bases de
données internationales et certains ouvrages de référence.
Les remarques du tableau 2 ci-dessus s’appliquent aussi aux données d’adsorption.
66
J. Moeys Partie I
ce qui indiquerait différents niveaux de variabilité spatiale. Les valeurs de KOC sont
elles aussi variables, dans des proportions similaires (valeurs de 43 à 342 L.kg-1, CV de
11 à 46 %). Les références citées ci-dessus n’utilisent pas forcément les mêmes
méthodes, ce qui peut induire un biais méthodologique. Les valeurs moyennes de KD
ne semblent pas liées au ratio sol-eau utilisé pour les mesures (données non
présentées ici).
Référence KD KF NF KOC CV n surf.
-1 -1 -1
unités [L.kg ] [L.kg ] [-] [L.kg ] % [-] [-] [ha]
Beck, 1996a 3,70 - - (74) 28% ; ? 25 ?
Walker, 1998 - 1,12 0,83 70 - 2 n.c.
Lennatrz, 1999 0.92 - - (77) 43% ; ? 99 1,8
Coquet, 2002 0,85 1,01 0,88 66 30% ; 12% 51;14 187
Walker, 2001 1,19 - - 47 11% ; 11% 30 5
Konda, 2002 - 1,19 0,53 174 - 1 n.c.
Spark, 2002 2,16 - - 43 41% ; 28% 5 n.c.
Alletto, 2004 4,4 - - 342 12% ; 13% 3 22
Cooke, 2004 4,23 - - 231 40% ; 32% 5 n.c.
Elkhattabi, 2004 - 1,43 0,87 98 - 2 n.c.
Boivin, 2006 - 3,35 0,92 195 25% ; 46% 13 n.c.
Bending, 2007 0,91 - - 61 - 2 n.c.
Vincent, 2007 2.8 - - 143 - 4 n.c.
tableau 5 – Comparaison des valeurs de KD, KF, NF ou KOC de l’isoproturon trouvées dans la
littérature scientifiques (liste non-exhaustive).
Les KOC entre parenthèses ont été estimés à partir du KD ou KF moyen, et normalisés par la valeur
moyenne de la fraction de carbone organique. Les références citées sont Beck et Jones (1996),
Walker et Jurado-Exposito (1998), Lennartz (1999), Coquet et Barriuso (2002), Walker et al.
(2001), Nemeth-Konda et al. (2002), Spark et Swift (2002), Alletto (2004), Cooke et al. (2004),
Elkhattabi et al., (2004), Boivin et al. (2006), Bending et Rodriguez-Cruz (2007), Vincent et al.
(2007), citant Madrigal et al. (2002) et Madrigal (2004).
67
J. Moeys Partie I
trouvé par Worral et al. (1996), qui trouvent un Kd de 2,15 L.kg-1 sur la kolinite. Coquet
(2003) montre aussi que l’adsorption de l’isoproturon est bien corrélée à la teneur en
argile (en tant que fraction grannulométrique < 2 µm) dans la zone non-saturée.
Pantani et al. (1997) montrent que l’isoproturon est adsorbé sur la montmorillonnite et
la kaolinite, notamment quand la surface de ces dernières est saturée par un cation
hydrophobe.
□ Dégradation (DT50)
Référence m(DT50) min–max CV T θ/h n surf.
unités [j] [j] [-] % [°C] [ha]
Beck 1996b 89 31–483 89% < 10°C ∆ 25 ?
Perrin-Ganier 1996 19 ? ? 20°C 80 % cc 1 n.c.
Jurado-Exposito 1998 15 ? ? 20°C 20 % m. 2 n.c.
Berger 1999 8,67 ? ? 20°C 40 % m. 3 n.c.
Walker 2001 / 2002 ? 6,5–30 ? 15°C –33 kPa 30 5
Elkhattabi 2004 41 - - 20°C 80 % cc 2 n.c.
Walker 2004 7–8 ou 15°C 40 % cc 5
15,8–24
Beulke 2005 18,6 - - 15°C 40 % m. 1 n.c.
Charnay 2005 13 6–32 46% 28°C 90 % cc 14 135
Issa 2005 16,6 - - 25°C 27 % m. 1 n.c.
Rodriguez-Cruz 2006 3,27 1,4–12,9 42%* 15°C? –33 kPa 20 1,44
Alletto 2006a 11 - - 22°C 90 % cc 3 22
Bending 2007 15,60 15°C 40 % cc 2 n.c.
Vincent 2007 15,2 7,8–25 - 18°C 80 % cc 5 n.c.
68
J. Moeys Partie I
69
J. Moeys Partie I
1997-1998 jusqu’en 2004 (en France métropolitaine ; 14e molécule la plus retrouvée
en 2003), la quantification de l’isoproturon dans les eaux de surface reste
importante, autour de 20 % des analyses (6e molécule la plus retrouvée en 2003 et
2004).
Sorensen et al. (2003), citant l’Environment Agency (2001) (Royaume-Uni) donne
des chiffres similaires – voir plus graves – pour l’Angleterre et le Pays de Galles, avec
14% d’analyses dépassant les seuils des 0,1 µg.L-1 dans les eaux de surface en 2000.
Au Danemark, des études comme celle de Spliid et Koppen (1998) ont conduit au
retrait de la molécule du marché danois. Pour cette étude, qui porte sur 4 bassins
versants contrastés, avec 300 analyses réparties entre 1,5 et 5 mètres, l’isoproturon
était détectable dans 3,3% des analyses, parfois au-dessus de la norme de 0,1 µg.L-1.
Dans sa fiche isoproturon, l’INERIS (2007) estime que les ventes d’isoproturon
actuelles (2007) en France à 1000 tonnes par an, et suppose que les ventes de la
molécule ont fortement baissé ces dernières années en France (division par deux
depuis le début des années 2000). Cette estimation ne peut être étayée par des
chiffres de ventes officiels au niveau français ou européen, qui sont inexistants
(INERIS, 2007). En Grande-Bretagne, les statistiques d’usage des pesticides
(‘Pesticides Usage Statistics’) réalisées par le CSL (‘Central Science Laboratory’)
indique que l’usage de l’isoproturon est passé de presque 3182 tonnes.an-1 en 1990-
1991, à presque 3477 tonnes.an-1 en 1998-1999, puis est redescendu à 2290 tonnes.an-1
en 2005. Dans le même temps, les surfaces traitées sont passées de 2,2 millions
d’hectares à 3,5 millions d’hectares avant de redescendre à 2,1 millions d’hectares.
70
J. Moeys Partie II
Partie II Le secteur
agricole de
Ouarville
Bibliographie locale &
description du secteur
géographique étudié
71
J. Moeys Partie II
1 Localisation géographique
■ 1.1 Localisation
Le secteur agricole étudié est situé autour de la commune de Ouarville, à l'est du
département de l'Eure-et-Loir, en France. Il est situé en Beauce chartraine, une des
petites régions agricoles qui composent l'ensemble plus vaste de la Beauce (figure 12).
Les coordonnées géographiques de la commune de Ouarville sont :
1°77'47,12 713 Est et 48°35'43,87 809 Nord (World Geodesic System 1984), ou
X:558 000 m Est et Y:1 073 000 m Nord (NTF, Lambert 1).
■ 1.2 Extension
Le secteur s'étend sur 2600 ha (figure 13), dans un périmètre de 5,3 km par
5,3 km. La délimitation précise du périmètre d'étude correspond à la carte des sols du
secteur (figure 18, p.80) utilisée pour notre étude (Cabinet Veillaux, 2000).
L'emprise de la carte des sols a été définie comme un périmètre opérationnel
pour le plan d'Action de Ouarville, un programme visant à réduire les pollutions par
les produits phytosanitaires du captage d'Alimentation en Eau potable (AEP) de
Ouarville (Ailliot et Sallé, 2003). Ce programme a été initié par le GREPPPES (Groupe
72
J. Moeys Partie II
Régional pour l'Étude de la Pollution par les Produits Phytosanitaires des Eaux et des
Sols).
Le périmètre opérationnel du plan d'action a été dérivé des limites du bassin
versant de 128 km2 qui alimente le captage d'Alimentation en Eau Potable de
Ouarville, tel que délimité en 1999 (bureau d'étude ANTEA, 1999, cité par Panel,
2000).
■ 1.3 Géographie
73
J. Moeys Partie II
74
J. Moeys Partie II
2 Données météorologiques
De par son hétérogénéité spatiale et temporelle, le climat est un facteur important
pour comprendre et expliquer l’hétérogénéité de la dissipation des produits
phytosanitaires dans les sols (voir par exemple Giambelluca 1996 ; Koren et al., 1999 ;
Aylmore et Di, 2000, van Alphen et Stoorvogel 2002). Le travail présenté ici ne
comprend pas de modélisation informatique du comportement des produits
phytosanitaires dans les sols. Il n’utilise donc pas explicitement de données
météorologiques. Il est néanmoins important de rappeler les caractéristiques
climatiques de la Beauce chartraine, afin de mettre en perspective les enjeux de ce
travail.
■ Type de climat
Le climat de la région est un climat tempéré, océanique altéré, se caractérisant par
des précipitations un peu moins importantes que sur les façades océaniques, et des
contrastes de température un peu plus accentués (Choisnel, 1992, cité par Rigaud
1998). La répartition des précipitations est aussi plus homogène sur l’année.
■ Températures moyennes
La température moyenne annuelle, relevée à la station Champhol près de
Chartres est de 10,8°C (moyenne entre l’année 1971 et l’année 2005 ; sa valeur
médiane est quasiment identique). Les variations de températures saisonnières ont
une amplitude modérée, avec à peine 14°C d’écart entre la température médiane des
mois les plus froids (env. 4°C, en décembre et janvier) et celle des mois les plus
chauds (env. 18°C, en juillet et août ; voir la figure 15–A). La transition entre les mois
chauds et les mois froids est progressive. L’écart médian entre les températures
journalières minimales et maximales est faible en hiver (5°C), et un peu plus important
en été (11°C). Les variations interannuelles de température pour un mois donné sont
plus importantes en hiver qu’en été, mais restent modérées (env. 5°C d’écart entre les
valeurs non-extrêmes minimales et maximales) et homogènes d’un mois à l’autre.
Une dizaine de jours de gel sont observés en décembre, janvier et février (valeur
médiane, voir la figure 15–B), et cinq jours environ pour novembre et mars. Les
variations interannuelles du nombre de jour de gel sont conséquentes pour ces
mois de l’année. Certaines années connaissent des gelées tardives en avril.
75
J. Moeys Partie II
A – Précipitations B – Évapotranspiration
figure 16 – Graphique ‘box & whisker’ des précipitations et de l’évapotranspiration
potentielle de chaque mois entre 1971 et 2005.
Les statistiques sont tirées de données météorologiques journalières ; les graphiques ‘box &
whisker’ donnent les statistiques (A) des précipitations et (B) de l’évapotranspiration potentielle
(ETP) de Penman-Monteith pour chaque mois de l’année ; la courbe en trait plein reprend les
valeurs médianes, et la droite horizontale en tirets donne la précipitation médiane interannuelle.
76
J. Moeys Partie II
figure 17 – Graphique ‘box & whisker’ des précipitations journalières maximales de chaque
mois entre 1971 et 2005.
Les statistiques sont tirées de données météorologiques journalières ; les graphiques ‘box &
whisker’ donnent les statistiques des précipitations journalières maximales pour chaque mois de
l’année ; la courbe en trait plein reprend les valeurs médianes, et la droite horizontale en tirets
donne la valeur médiane des précipitations journalières maximales interannuelles.
Sur la base des données journalières des précipitations entre 1971 et 2005, on
constate que les précipitations journalières maximales du mois sont plus importantes
en juillet que pendant le reste de l’année (en valeur médiane comme en valeurs
extrêmes). Ces précipitations journalières maximales sont aussi un peu plus
importantes que la valeur médiane en mai, juin, août, septembre et octobre.
Il serait nécessaire d’analyser des données météorologiques recueillies à une
résolution temporelle inférieure à la journée pour se faire une idée plus précise des
évènements pluvieux exceptionnels, mais ces chiffres reflètent – entre autres – des
pluies d’orages importantes en été, et notamment en juillet.
77
J. Moeys Partie II
3 Activités agricoles
La Beauce est souvent surnommée « le grenier à blé de la France ». Le tandem
géologique dominant ‘limon éolien sur calcaire’, dans un relief généralement peu
marqué, a donné naissance à des sols fertiles, exploités de longue date pour
l’agriculture. Si le contexte pédologique est en réalité plus contrasté (Aillot et
Verbeque, 1995), la Beauce n’est est pas moins une région agricole largement
dominée par les cultures végétales, et notamment par les céréales.
Une étude réalisée en 1999 dans le cadre du plan d’action de Ouarville a permis de
brosser un tableau des assolements pratiqués dans le secteur (Deschamps, 1999).
Une enquête est aussi réalisée tous les ans par la Chambre d’Agriculture d’Eure-et-
Loir pour suivre les emblavements et les pratiques de désherbage, mais ces données
ne sont pas utilisées ici.
Deux tiers des surfaces sont occupées par des céréales, dont deux-tiers sont
consacrés au blé tendre d’hiver, un peu plus de 10 % au maïs, un peu moins de 10 %
à l’orge d’hiver (escourgeon), et environ 5 % à l’orge de printemps. Entre 18 et 20 %
sont occupés par des oléo-protéagineux (pois protéagineux, colza). La culture de la
pomme de terre est aussi importante sur les secteurs qui peuvent être irrigués, dans
les sols avec une faible charge en éléments grossiers (Deschamps, 1999).
4 Contexte géologique
■ 4.1 Géologie et hydrogéologie de la Beauce
■ Le calcaire de Beauce
La Beauce – au sens géologique du terme – correspond à l’étendue d’une formation
géologique calcaire20 (aire tertiaire), installée dans une vaste dépression de la craie
(aire secondaire). Après le dépôt marin de la craie (terminé au Sénonien), le retrait de
la mer annonce un épisode continental qui provoque une altération superficielle de la
craie, aboutissant à la formation d’un niveau d’argile résiduelle à silex. Au tertiaire, la
zone connaît une succession de transgressions (avancées de la mer) et de
régressions (retrait de la mer), et se trouve donc alternativement en situation de mer
peu profonde, de lagune, de lacs ou d’embouchure de fleuves et de rivières. Cet
épisode provoque le remplissage de la dépression par les dépôts calcaires cités ci-
dessus, ainsi que par quelques formations intercalaires (marnes, molasses du
Gâtinais, marnes et sables de l’Orléanais...). Après les dernières transgressions, à la
fin des épisodes de glaciation du quaternaire, un dépôt limoneux éolien peu épais a
recouvert une bonne partie du calcaire (Lorain et al., 1973).
■ La nappe de Beauce
Le calcaire comme la craie sont des formations poreuses, ayant une perméabilité
importante. Sous l’effet de la dissolution et des contraintes tectoniques, le calcaire est
souvent parcouru par un vaste réseau de fissures (karst). À l’exception de la partie sud
20
Les calcaires de Beauce, au sens large.
78
J. Moeys Partie II
79
J. Moeys Partie II
(Gigot et Desprez, 1976, notice). Un faciès calcaire rosé et ocre a effectivement été
identifié, parfois fortement meuliérisé (silicifié), lors de l’ouverture des fosses
pédologiques sur la parcelle étudié (INRA d’Orléans, 2004), au bas du flanc ‘est’ du
talweg qui traverse cette dernière. La notice de la carte géologique précise que cette
formation « peut se charger en grains de sables détritiques allant jusqu’à constituer
des lentilles de sables quartzeux ».
80
J. Moeys Partie II
De nombreux avens, de petite taille et présentant une faible dépression (20 à 100 cm,
parfois plus), sont en effet observables dans le secteur étudié.
Les Sables de l’Orléanais, Sables de Lozère (m1b) du Burdigalien n’existent
qu’en « lentilles témoins » sur le secteur. Des matériaux sableux ont effectivement été
rencontrés lors de deux sondages distants, en remplissage d’un aven, sous une
épaisse couche de limon. Les ‘graviers de Lozère’, graviers blancs ou rosés, de nature
siliceuse (ou de feldspath potassique ?) ont été rencontrés plus fréquemment, soit
sous forme de lentilles très localisée au-dessus du calcaire (rare), soit en quantité
moyenne mêlés à une argile lourde (plus fréquent), soit en faible quantité dans le limon
(fréquent). Il n’est pas rare que ces derniers soient enrobés d’une pellicule brun
sombre à noire, évoquant d’une hydromorphie passée.
Le limon des plateaux (LP) est « très homogène, d’une teinte brune à brun-jaune
ou brun roux » très peu calcaire [...] et très fin. ». La notice de la carte géologique
précise aussi que « les analyses de la fraction argileuse reflètent la nature du
substratum ».
Formation Superficie Surface
LP 2371 ha 78,8%
m1a2 306 ha 10,2%
m1a1 178 ha 5,9%
hors carte 138 ha 4,6%
LP m1b 17 ha 0,6%
FC 1 ha 0,0%
TOTAL 3010 ha 100,0%
tableau 10 – Surface occupée par les différentes formations géologiques.
Hors carte : Autre carte géologique, non utilisée pour limiter les problèmes possibles de jointures
entre les deux cartes. Les formations colluviales (FC) ne sont pas abordées dans ce document vu
leur faible étendue.
La carte géologique ne fait pas mention des formations de faible épaisseur qui ont
été rencontrées localement dans le secteur étudié : l’argile à meulières et l’argile de
décarbonatation. Elles dérivent probablement toutes deux de la décarbonatation du
calcaire, la première à partir d’une formation contenant des meulières ou silicifiée, la
seconde à partir d’une formation exempte de meulières.
Une étude réalisée par le bureau d’étude ANTEA en mai 1999 (citée par
Deschamps, 1999) évalue le niveau de la nappe phréatique entre 127 mètres, au
niveau de Santeuil, et 122 mètres, au niveau de Ouarville, avec un gradient de
piézométrique du nord-ouest au sud-est (altitude absolue du toit de la nappe, ce qui
donne une nappe située entre 18 et 30 mètres sous le niveau du sol).
5 Contexte pédologique
■ 5.1 Carte des sols du secteur réalisée par un
bureau d’étude indépendant
En 2000, une carte des sols a été réalisée par un bureau d’étude indépendant pour
servir de base au plan d’action en cours sur le secteur de Ouarville (réduction des
pollutions par les produits phytosanitaires).
81
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82
J. Moeys Partie II
Les surfaces et proportions de la surface totale occupées par chacun des types de
sol sont données par le tableau suivant.
Type CPCS Type RP Superficie Surface
RENDZINE RENDOSOL ou RENDISOL 32 ha 1,2%
BRUN CALCAIRE CALCOSOL 231 ha 8,6%
BRUN CALCIQUE CALCISOL 166 ha 6,2%
BRUN BRUNISOL 139 ha 5,2%
BRUN LESSIVÉ NÉOLUVISOL 1289 ha 48,2%
LESSIVÉ LUVISOL 816 ha 30,5%
TOTAL 2675 ha 100,0%
tableau 12 – Surface occupée par les différents types de sol sur la carte.
D’après Delmas (2007).
Les sols à ‘ambiance calcaire ou carbonatée’ (saturation de la CEC par le calcium,
réserve de CaCO3 plus ou moins abondante, sous forme d’éléments grossiers), c’est à
dire les RENDOSOLS/RENDISOLS, CALCOSOLS et CALCISOLS occupent à peine 16 % des
surfaces du secteur. Les RENDOSOLS/RENDISOLS, peu épais et développés
principalement dans un matériau calcaire occupent moins de 2 % des surfaces.
Les BRUNISOLS, qui sont normalement les sols précurseurs des NÉOLUVISOLS et
LUVISOLS occupent à peine 6 % de la surface.
Les NÉOLUVISOLS, correspondent à une phase de pédogenèse intermédiaire entre
les BRUNISOLS et les LUVISOLS. Ils occupent à l’inverse presque la moitié de la surface,
les LUVISOLS occupant les 30 % restants.
On remarque une relation ténue mais claire entre la topographie, la géologie et les
types de sols. Les extrémités du secteur sont entaillées de talwegs naissants,
notamment au ‘nord-est’, et au ‘nord-ouest’ du secteur étudié. La carte géologique
indique, dans ces talwegs, la présence à faible profondeur21 des formations
géologiques m1a1 et m1a2. C'est dans ces mêmes secteurs que l’on retrouve
généralement les RENDOSOLS/RENDISOLS, CALCOSOLS et CALCISOLS. Mais ces derniers
se retrouvent aussi à d’autres endroits, sous la commune d’Edeville ou au-dessus
d’Ensonville. Les NÉOLUVISOLS et LUVISOLS occupent préférentiellement le plateau de
Ouarville, là où les pentes sont les plus faibles. La carte géologique indique la
présence d’une formation de limon des plateaux plus épaisse sur ces points hauts.
La carte pédologique renseigne aussi sur les profondeurs de sol, l’hydromorphie et
les matériaux géologiques parentaux. Pour ces derniers, seuls le limon et le calcaire
sont indiqués. L’hydromorphie des sols est généralement faible ou nulle22.
Les études réalisées en 2004 sur le secteur dans le cadre du programme ESHEL
(Moeys, 2004 ; Moeys et al., 2006), puis une campagne de sondages tarière réalisée
en 2005 (prospection Moeys & Michelin, non publié), ont permis de mettre en évidence
la présence d’autres matériaux géologiques parentaux non indiqués par la carte des
sols. Il s’agit de l’argile à meulière et de l’argile de décarbonatation. Ces deux
formations ne sont pas représentées sur la carte géologique, mais sont présentées
dans la notice. Si ces formations sont morphologiquement semblables à un horizon
21
Les cartes géologiques ne représentent pas systématiquement les formations géologiques de surface.
Si celles-ci ont une trop faible épaisseur, c’est la formation sous jacente qui est représentée. Ainsi, le
limon des plateaux n’est représenté que s’il dépasse une certaine épaisseur (le seuil étant décidé par
le géologue cartographe).
22
Les campagnes de sondages réalisées ont confirmé la rareté des phénomènes d’hydromorphie. Ceux-
ci sont vraisemblablement rares et liés à des épisodes particulièrement pluvieux (n’ayant pas lieu tous
les ans). Certains indices d’hydromorphie sont aussi des reliques d’un climat passé.
83
J. Moeys Partie II
d’accumulation d’argile (BT)23, il n’est pas certain qu’elles soient identiques du point de
vue de leur fonctionnement hydrique, ni de leur réactivité vis-à-vis des polluants
organiques.
Les sols développés dans l’argile à meulière, ou sur une argile de décarbonatation
peuvent être classés comme PSEUDO-LUVISOLS ou comme LUVISOLS (voir
NÉOLUVISOLS). Il est difficile d’arrêter un choix avec les seules données de terrain, et il
est possible que ces sols soient souvent des inter-grades de ces types de sols
(situations intermédiaires ou combinaison de facteurs).
Après l’échantillonnage de l’étude présentée ici, Delmas (2007) a effectué une
synthèse des données disponibles sur les sols du secteur, et évalué la précision de la
carte présentée ci-dessus. Cette étude confirme les manques de cette carte.
23
La présence de graviers et cailloux de meulière est en revanche une différence morphologique notoire
entre les horizons BT développés dans le limon et les horizons développés dans une argile à meulière.
84
J. Moeys Partie II
Ce dernier point doit cependant être nuancé. Une teneur en argile très élevée peut
être due à la présence d’argile de décarbonatation. Une teneur en éléments grossiers
de meulières notable, associée à une teneur en argile plus élevée et une absence
d’éléments grossiers calcaires peut être due à la présence d’argile à meulière.
85
J. Moeys Partie III
86
J. Moeys Partie III
1 Démarche générale
L'évaluation des risques de lixiviation d'isoproturon à la base des sols du secteur
agricole de Ouarville doit reposer - dans cette étude - sur l'utilisation de modèles
informatiques (programmes) qui simulent le comportement des molécules
phytopharmaceutiques dans le sol. Le modèle choisi est un modèle à base physique,
HYDRUS 1D. Ces modèles demandent d'être paramétrés en fonction des propriétés
du sol, de la molécule et de leurs interactions.
Il est ainsi nécessaire de connaître les propriétés hydriques du sol, que ce soit la
rétention en eau (relation entre teneur en eau θ et potentiel matriciel h) ou la
conductivité hydraulique du sol en régime non saturé (elle aussi exprimée en
fonction du potentiel h, et notée K(h)). Des propriétés physiques et physico-
chimiques du sol, comme sa masse volumique apparente et sa granulométrie sont
aussi généralement mesurées. La teneur en carbone organique est un paramètre
essentiel pour comprendre les propriétés d’adsorption des pesticides dans les sols.
Les propriétés physico-chimiques de la molécule seule, comme sa solubilité dans
l'eau, ne sont généralement pas mesurées (et ne le sont pas ici), mais peuvent être
renseignées d'après la littérature et les bases de données de propriétés des molécules
phytopharmaceutiques comme AFSSA (2007) ou FOOTPRINT (2006).
Les propriétés résultant de l'interaction entre la molécule et le sol doivent être
mesurées. Elles sont en effet très dépendantes des propriétés du sol dans lequel se
trouve la molécule. Ces propriétés sont principalement le coefficient d'adsorption de
la molécule sur le sol (noté Kd ou Kf selon l'équation considérée) et la cinétique de
dégradation de la molécule (synthétisée par son temps de demi-vie, DT50).
La connaissance exhaustive des propriétés du sol est déjà impossible sur un
échantillon simple et restreint (ex : un agrégat), elle l'est plus encore au niveau spatial,
que ce soit à l'échelle du profil de sol ou celle du bassin versant. La connaissance des
sols à l'échelle d'un secteur agricole passe donc obligatoirement par une étape
d'échantillonnage et de mesures des propriétés du sol sur des sites localisés. Ce
n'est qu'une fois ces mesures acquises que l'on peut envisager de les 'spatialiser'.
Après la phase de mesure, et avant l'étape de spatialisation, il est aussi important
d'identifier les propriétés du sol qui sont déterminantes pour l'interaction entre le
sol et la molécule, ou pour les propriétés hydriques du sol. Des tests statistiques
permettent de mettre en évidence ces liens. La connaissance de ces interactions est
déterminante pour expliquer la variabilité spatiale des propriétés importantes, et
éventuellement pour choisir la meilleure stratégie de spatialisation de ces dernières.
L'objet de cette partie est de décrire précisément cette étape d'échantillonnage et de
mesures, puis les tests statistiques destinés à mettre en évidence d'éventuels liens
entre les différentes propriétés mesurées.
2 Plan d'échantillonnage
■ 2.1 Nombre d’échantillons
La taille de l'échantillonnage a été arrêtée à 50 échantillons pour une campagne
(année culturale) de prélèvement et de mesure. Le facteur le plus limitant est le
87
J. Moeys Partie III
nombre d'incubations sol-pesticide qu'il est possible de gérer simultanément pour les
mesures de cinétique de dégradation de l'isoproturon. Seuls 50 incubations
peuvent être gérées simultanément. A raison de 2 répétitions par échantillons de sol à
étudier, une série de mesure de dégradation de l'herbicide ne peut concerner que 25
échantillons. Il est possible de réaliser 2 séries de mesures successives (lancées à
quelques semaines d'intervalle) au cours d'une campagne de prélèvement. Cela
ramène le nombre d'échantillons maximum à 50 par campagne.
D'autres campagnes de prélèvements et de mesures n'ont pas été possibles du fait
du temps nécessaire aux mesures en laboratoire et sur site.
88
J. Moeys Partie III
■ Principe
Le plan d'échantillonnage a été stratifié en suivant plusieurs éléments d'information
déjà disponibles pour le secteur étudié : le type de sol et sa classe de profondeur,
d'après la carte pédologique ; le substrat géologique d'après la carte géologique ; la
classe de clarté du sol issue d'une image satellitale. La distance moyenne entre les
sites d'échantillonnage a aussi été prise en compte afin d'obtenir un échantillonnage
relativement homogène géographiquement.
Les objectifs de l’échantillonnage pour chaque classe des différentes propriétés est
donnée en annexe (« Stratification de l’échantillonnage : objectifs », p. 280), ainsi que
la pondération entre ces différents critères.
Le type de travail du sol de l'exploitant (informations sur le parcellaire et enquête de
la Chambre d'Agriculture d'Eure-et-Loir ; Sallé S., 2004-2007, communications
personnelles) a été pris en compte dans un second temps (empiriquement), lors de la
sélection des 34 sites parmi les 44 échantillonnés. Le suréchantillonnage permet
d'ajuster après coup les caractéristiques de l'échantillonnage.
L'information portée par ces strates est sous forme de propriétés qualitatives, issues
de typologie. L'opération de stratification consiste à choisir les sites d'échantillonnage
de manière à ce que, pour chaque strate, les sites se répartissent correctement entre
les différentes valeurs possibles des propriétés qualitatives existantes.
Une première étape de la stratification consiste à définir propriété par propriété (type
de sol, formation géologique, etc.), et valeur par valeur (LUVISOLS, NÉOLUVISOLS, etc.)
le nombre d'échantillons qui doit s'y rattacher (ou la proportion d'échantillons).
Comme plusieurs strates d'information sont considérées simultanément, et que ces
strates peuvent avoir des liens entre elles (sol et géologie par exemple) il n'existe pas
forcément de solution parfaite en regard des objectifs fixés (en terme de répartition).
Les jeux d'échantillons 'possibles' ont donc été notés, pour chaque strate, en
fonction de l'adéquation entre l'échantillonnage proposé et l'objectif visé.
Cette stratification a été effectuée en 3 étapes :
– Établissement d'une grille systématique de localisation géographique, réparties de
manière régulière, espacées de 50 m (en X et Y). Cette grille de coordonnées
géographiques en Lambert 1 a été générée avec le logiciel Statistique R (R
Development Core Team, 2007), puis a été importée dans le Système d'Information
Géographique ArcMap (ESRI, Redlands, CA, USA) via une table MS Access
(Microsoft, WA, Redmont).
– Élimination des localisations géographiques se trouvant sur ou à proximité
d'éléments anthropiques ou non-agricoles. Une base de données géographiques au
format vectoriel (ArcMap) a été constituée à cette fin en digitalisant la carte IGN du
secteur et en la complétant par une analyse fine d'images satellitales récentes du
secteur. Les éléments de cette base considérés comme anthropiques sont :
– Les zones urbaines (villes et jardins alentours) ;
– Les voies de communication actuelles (routes et chemins agricoles) ;
– Les chemins agricoles anciens, effacés par les remembrements successifs,
repérés sur les images satellites et les photos aériennes, certaines prises il y a
plusieurs décennies ;
89
J. Moeys Partie III
■ Réalisation
La sélection préalable des sites à échantillonner a été effectuée par un script en
langage R, incluant une procédure itérative simple visant à choisir les sites par des
tirages aléatoires successifs.
Un premier sous-ensemble de 44 sites est constitué par un tirage aléatoire dans le
jeu de localisations initiales (grille).
Les écarts aux objectifs (types de sol, classe de profondeur...) sont calculés critère
par critère, moyennés sur l’ensemble des classes de chaque critère. Une moyenne
pondérée entre les critères permet d’obtenir un score global pour la sélection de 44
sites évalués.
Le sous-ensemble est modifié pas à pas, en éliminant à chaque étape un site, et en
le remplaçant par un autre. Si le remplacement améliore le score global, le
changement est validé ; dans le cas contraire, il est rejeté.
La procédure est arrêtée au bout de 3000 itérations et les sites retenus sont
présentés sous forme d’un fichier comportant leur localisation géographique.
La procédure permet de préciser si des sites ont déjà été échantillonnés. Ces
derniers font alors obligatoirement partie de l’ensemble de sites testés et le script
retourne un nombre de sites supplémentaires permettant d’améliorer l’échantillonnage
par rapport aux objectifs fixés.
La procédure est cependant difficile à mettre en œuvre au jour le jour, car les sites
échantillonnés ne sont jamais exactement à la position des sites visés (il peut aussi
s’agir de sites échantillonnés qui n’étaient pas visés initialement). Il est alors
nécessaire d’extraire du SIG les caractéristiques des sites échantillonnés (type de sol
supposé, classe de profondeur...). Cette procédure est relativement longue, car elle n’a
pas été automatisée.
90
J. Moeys Partie III
Les sites trop éloignés des voies d’accès ont été éliminés ou déplacés (si la
distance est supérieure à 300 m) et certains sites ont été échantillonnés sans avoir été
préalablement choisis.
91
J. Moeys Partie III
tranchant le sol avec la bêche. Sur une des faces du carré, du côté extérieur, le sol est
excavé sur 10 à 15 cm et mis de côté. Cette opération, éventuellement complétée par
un examen au couteau, permet de juger de la profondeur du lit de semence. La bêche
est enfoncée parallèlement à la surface du sol, juste au-dessus de la limite inférieure
du lit de semence, à l’intérieur du carré préalablement délimité. Le sol situé sur la
bêche est prélevé à l’aide de la petite pelle, et mis dans un sac plastique hermétique
de type ‘Ziplock’.
Pour les prélèvements dans le reste de l’horizon travaillé, l’opération est identique,
mais le lit de semence a été préalablement décapé sur une zone plus large que le
carré de 20 cm de côté préalablement délimité, de manière à limiter les
contaminations. Le sol du reste de l’horizon travaillé est prélevé sur 10 à 15 cm
d’épaisseur, suivant la profondeur du travail du sol.
Le sac est dûment annoté avec : le numéro du site échantillonné, la limite
supérieure et inférieure de la couche prélevée, la date, les coordonnées
géographiques sur site telles qu’affichée par le GPS, et le nom de l’étude.
De retour du terrain, les échantillons ont été stockés dans une chambre froide à 4°C
jusqu’à leur utilisation.
Une fiche de prélèvement est remplie, similaire à l’en-tête de la fiche de description
des sondages tarière présentée en annexe (figure 97, p. 303), avec un descriptif des
couches prélevées.
92
J. Moeys Partie III
93
J. Moeys Partie III
figure 22 – Distances du site le plus proche, distance moyenne aux autres sites et
histogramme des distances entre les 34 sites échantillonnés.
Les deux graphiques (droite et gauche) partagent la même échelle des ordonnées.
La figure 22 montre que la distance des sites à leur plus proche voisin est
conséquente. Cette dernière est en effet au minimum de 246 mètres (sites 20 001 et
20 002), et au maximum de 1 196 mètres, avec une moyenne de 526 mètres environ.
Ces chiffres peuvent paraître surprenants, car le secteur agricole étudié ne mesure
‘que’ 5 kilomètres sur 5 kilomètres. Par comparaison, la distance au site le plus proche
d’un échantillonnage selon une grille régulière et systématique, avec 36 sites (6 x 6),
serait de 757 mètres. La distance moyenne au site le plus proche est donc
inférieure de 30 % à celle d’un échantillonnage systématique, ce qui représente un
bon compromis compte tenu de la double contrainte d’un échantillonnage relativement
aléatoire et stratifié selon plusieurs facteurs (facteurs répartis de manière hétérogène
dans le secteur étudié).
94
J. Moeys Partie III
95
J. Moeys Partie III
gestion des résidus de culture, travail du sol...) est pris en compte (dans les limites du
contexte agricole local).
3 Le sol : constituants et
organisation
■ 3.1 Propriétés physico-chimiques des sols
96
J. Moeys Partie III
□ Protocole de mesure
Les masses volumiques apparentes ont été mesurées par la méthode au cylindre.
Trois répétitions de mesures ont été effectuées par site (quelquefois moins), avec un
prélèvement de 510 cm3 et deux prélèvements de 100 cm3. La méthode est décrite en
détail en annexe ('Masse volumique apparente au cylindre', p. 282)
97
J. Moeys Partie III
L'opérateur note sur une fiche les éventuels contrastes de couleur ou de compacité
qu'il perçoit lors de la réalisation du sondage, mais la description n'est entamée que
lorsque le sondage est fini.
L'opérateur délimite les horizons à l'aide des différences de couleur, de teneurs en
éléments grossiers ou autres indices pédologiques qu'il perçoit sur la profondeur du
sondage. Les indications de compacité qu'il a pu retenir lors du sondage sont aussi
utilisées (sous réserve qu'il ne s'agisse pas d'un front d'humectation ou de séchage),
ainsi que les appréciations tactiles ressenties lors de l'émottage.
Chaque horizon est ensuite décrit. La description est portée sur une fiche spécifique
(voir la figure 97, p. 303 en annexe du document). Les paramètres décrits sont :
– Les profondeurs des limites supérieure et inférieure de l'horizon ;
– L’état d’humidité de l’horizon (noyé, humide, frais, sec) ;
– La texture évaluée par des tests tactiles tels que décrits dans Baize et Jabiol
(1995). Ces tests ont parfois été réalisés a posteriori, à partir d'échantillons de sol
stockés dans des pédocomparateurs (‘boites’), ce qui permet de réaliser les tests
dans de meilleures conditions.
– La couleur de l'horizon. La couleur est évaluée visuellement par deux paramètres,
la teinte ('couleur de base') et sa clarté ('du clair au sombre'). Ce dernier paramètre
est difficile à distinguer de la pureté de la teinte ;
– L'effervescence à l'acide chlorhydrique (5 classes d'intensité) ;
– La présence éventuelle et l'abondance d'éléments grossiers, évaluée
individuellement pour chaque nature lithologique présente (calcaire, meulières,
graviers quartzeux) ;
– La présence éventuelle et l'abondance de taches d'oxydation et/ou de réduction ;
– La présence éventuelle et l'abondance de concrétions, ainsi que leur nature.
Sous la description des horizons, la profondeur maximale du sondage est reportée,
avec les raisons de l'arrêt (blocage, volontaire, longueur maximale de la tarière
atteinte). Le matériau dur sur lequel la tarière a bloqué est, dans la mesure du
possible, décrit comme un horizon.
L'examen des caractéristiques de tous les horizons permet ensuite de déterminer :
– Le matériau parental de l'horizon: limon, argile à meulière, argile de
décarbonatation ou calcaire altéré.
– Le type pédologique d'horizon de chacun d'eux. Celui-ci est reporté sur la fiche ;
– La profondeur du sol, c'est à dire la profondeur d'apparition d'un horizon du type C,
M ou R ;
– Le type pédologique du sol, ou les types possibles si le sol est un inter-grade. Il
faut noter que seul le type de sol 'le plus probable' a été utilisé dans les
analyses statistiques.
Le type pédologique d'horizon et de sol est déterminé d'après le Référentiel
pédologique de 1995.
De retour du terrain, la description des sondages a été saisie dans la base de
données MS Access créée pour stocker et organiser les informations (cf. annexes
'Précisions sur l’organisation et la gestion des données', p. 286).
98
J. Moeys Partie III
■ Principe
La formule de Campbell (équation 13, p. 43) peut être reformulée :
99
J. Moeys Partie III
perdre une partie de son eau jusqu’à ce que son potentiel matriciel atteigne la valeur
de –1 m (h = -1 m). Une fois l’équilibre atteint, la teneur en eau de l’échantillon est la
teneur en eau au potentiel –1 m. L’opération est recommencée au potentiel h = -160 m.
Les appareils utilisés pour cette mesure sont deux « presses de Richards » (en:
‘pressure plate extractors’) #1600 (5 bars) et #1500 (15 bars) (Soilmoisture equipment
corp., Santa Barbara, CA, USA), connectées à un compresseur et contrôlées par un
dispositif de régulation de pression de même marque (0700CG23), doté de manomètres
(0 à 4 bars, gradué 0,02 bar ou 0 à 20 bars, gradué 0,1 bar).
□ Protocole de mesure
Le protocole de mesure de la teneur en eau à un potentiel donné avec une presse
de Richards est exposé en annexe (« Mesure de la relation θ(h) – Presses de
Richards », p. 284). Pour chacune des 50 couches de sol à caractériser, un seul
prélèvement de sol non perturbé (49,1 cm3) a été réalisé pour la mesure de rétention en
eau (pas de répétitions). Le résultat de ces mesures est utilisé pour déduire les
paramètres hA et b de l’équation 30 (θSAT étant mesuré directement).
■ Principe
Une fois les paramètres hA et b déduits des mesures potentiel / teneur en eau
exposées ci-dessus, il est possible d’estimer la conductivité hydraulique à saturation à
partir d’une mesure de conductivité à un potentiel donné (potentiel nul ou légèrement
non-saturé). L’équation 17, reformulée, permet en effet de calculer directement KS :
quand h < hA
et quand hA ≤ h < 0
équation 31 – Estimation de KS avec une mesure de Kh (h ≤ 0), en connaissant les
paramètres hA et b.
L’estimation de la conductivité hydraulique à un potentiel donné – destinée à
calculer le paramètre KS – est l’objet des paragraphes suivants. Cette estimation de
K(h) a été réalisée par l’intermédiaire d’une mesure in situ d’infiltrométrie
monopotentiel non-saturée (h = –1 cm).
100
J. Moeys Partie III
101
J. Moeys Partie III
du disque d’infiltration, pour ne pas biaiser la surface d’infiltration réelle, (iii) doit être
réalisée avec un sable dont les particules sont relativement calibrées (gamme de taille
peu variable), et toujours identique d’une infiltration à l’autre. En pratique, le sable
utilisé est un sable de Fontainebleau prélevé en milieu naturel.
Une mesure d’infiltrométrie se déroule comme suit :
– Les tubes de l’infiltromètre sont remplis d’eau jusqu’à ce qu’un faible volume
d’air reste dans les tubes. Le tube plongeant depuis l’extérieur dans le vase de
Mariotte est baissé au maximum ;
– L’infiltromètre est maintenu en l’air, et le tube plongeant dans le vase de Mariotte est
remonté très progressivement. En dessus d’une certaine hauteur d’immersion du
tube, de l’eau s’écoule de l’infiltromètre. La hauteur du tube marquant l’arrêt de
l’écoulement est ‘ajustée’ progressivement. La pression à la base de
l’infiltromètre est alors la pression atmosphérique ;
– Le tube plongeant dans le réservoir de Mariotte est descendu de 1 cm précisément.
La pression de l’eau à la base de l’infiltromètre est alors de -1cm ;
– Une lecture de la hauteur d’eau dans l’infiltromètre est réalisée. Elle correspond
à la hauteur au temps initial (t0).
– L’infiltromètre est posé précisément sur la mince couche de sable de même
diamètre que le disque préalablement placée sur la surface du sol ; très rapidement
l’infiltromètre est stabilisé à l’aide de ses 3 pieds coulissants, sans perte de
contact24.
– Le chronomètre est déclenché au moment où l’infiltromètre est posé sur le sol.
– Une mesure de hauteur d’eau dans l’infiltromètre est prise à des intervalles
réguliers, puis de plus en plus espacés (10 s, 20 s, 30 s, 40 s, 50 s, 1’00, 1’15,
1’30, 1’45, 2’00, 2’30, 3’00, 3’30 [...], 5’, 6’, 7’...). Il est important d’avoir de
nombreuses mesures au début de l’infiltration pour une bonne estimation de la
sorptivité.
– À la fin de l’infiltration, un prélèvement de sol est réalisé avec une gouge selon les
modalités décrites dans le paragraphe suivant.
Les hauteurs d’eau infiltrées en fonction du temps sont reportées sur une fiche
dédiée comportant toutes les informations nécessaires (identification du site, de la
couche, de la répétition, de l’infiltromètre : diamètres du disque et du réservoir, des
échantillons de sol...).
Avant de réaliser les calculs de sorptivité et de conductivité, il est nécessaire de
convertir les mesures de manière à passer d’une ‘hauteur d’eau infiltrée dans le réservoir
[cm] = f( temps [min:sec])’ à ‘hauteur d’eau infiltrée sous le disque [mm] = f( temps [sec])’.
Une à deux répétitions des mesures d'infiltration sont réalisées pour chaque
couche de sol à caractériser (selon le temps disponible), à une distance de 50 à
100 cm l'une de l'autre. Un peu moins d'un cinquième des couches (16) n'ont pas pu
faire l'objet de deux répétitions successives (une seule), les 34 autres couches ont pu
faire l'objet de deux répétitions, soit 84 infiltrations au total.
24
En pratique, pour les infiltrations monopotentiel, l’infiltromètre est réglé à une succion de -15 à –20 cm,
posé sur le sable, stabilisé rapidement, et réglé à nouveau à – 1 cm. Au moment où l’infiltromètre est
réglé à – 1 cm le chronomètre est déclenché et la mesure commence. Il s’agit là d’un mauvais
compromis entre l’obligation de stabiliser l’infiltromètre (ce qui prend au moins 30 secondes) et la
nécessité de disposer de nombreuses mesures au tout début de l’infiltration (0 à 60 secondes).
102
J. Moeys Partie III
Les disques utilisés ont un diamètre de 8 ou 8,5 cm. Leur taille précise, ainsi que
les diamètres internes des réservoirs ont été mesurés à l’aide d’un pied à coulisse.
103
J. Moeys Partie III
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J. Moeys Partie III
équation 32 – Solution approchée de Wooding 1968 du flux en régime permanent pour une
infiltration axisymétrique.
Avec hfin [L] ou (m) le potentiel matriciel du sol une fois le régime permanent atteint, qui est aussi
le potentiel imposé par l’infiltromètre à la surface du sol ; hini [L] le potentiel du sol initial, avant
l’infiltration ; q∞ [L.T-1] ou (m.s-1) la densité de flux de l’infiltration en régime permanent à
l’interface entre le sol et l’infiltromètre ; K [L.T-1] la conductivité hydraulique du sol (au potentiel
hfin) ; Φ [L2.T-1] ou (m2.s-1) le potentiel d’écoulement entre le potentiel hini et le potentiel hfin, défini
par Gardner en 1958 (équation 33) ; r [L] ou (m) est le rayon du disque utilisé lors de l’infiltration.
Cette équation de transfert est une des solutions à la loi de Darcy généralisée,
appliquée au cas de l’infiltration axisymétrique. Elle sert de base à différentes
méthodes de mesure de la conductivité hydraulique non saturée par infiltrométrie. Le
potentiel d’écoulement avait été auparavant défini par Gardner (1958) comme
l’intégrale la conductivité hydraulique par rapport au potentiel matriciel, entre le
potentiel initial et le potentiel final. Il reflète le rôle de la capillarité dans le processus
d’infiltration.
105
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équation 36 – Estimation de la sorptivité de Philip (1969) sur les temps courts de la mesure
d’infiltration.
Avec I [L] ou (m) l’infiltration cumulée (lame d’eau infiltrée dans le sol) en fonction du temps t ;
S(θini, θfin) [L.T-1/2] ou (m.s-1/2) est la sorptivité capillaire du sol entre θini et θfin ; A un paramètre liée
à la conductivité hydraulique finale, entre 1/3 et 2/3 de K(hfin) (Talsma et Parlange, 1972, cité par
Roulier, 1999).
Dans cette équation, le premier terme (S.t1/2) reflète les effets de la capillarité
verticale (qui devient négligeable quand l’infiltration atteint un régime permanent, d’où
le domaine de validité restreint de l’équation), tandis que le deuxième terme A.t reflète
les effets gravitaires. Cette équation est monodimensionnelle, car elle néglige les
effets de la capillarité latérale.
106
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hauteur d’eau infiltrée ont été calculées à partir du formalisme de Haverkamp et al.
(1994), modifié par Roulier (1999) pour tenir compte de l’effet du sable (temps d’action
et lame d’eau infiltrée dans le sable). Il n’est pas détaillé ici, car il n’a pas été utilisé en
dehors de ces exemples.
– Sur le graphique Infiltration cumulée=f(temps), une régression est calculée sur la
phase 2. La valeur du flux en régime permanent est égale à la pente de la
régression (figure 27).
108
J. Moeys Partie III
avec et
109
J. Moeys Partie III
et
et
110
J. Moeys Partie III
d’eau infiltrée ou décalage dans la lecture du temps de mesure ; effet du vent sur les
tubes de mise à l’air de l’infiltromètre), qui n’apparaissent pas comme importantes sur
un graphique I=f(t), sont en revanche considérablement amplifiées sur un graphique
d.I/d.√t=f(√tgeom). Cela peut nuire à la qualité des estimations de S et K par la régression
linéaire, et cela renforce du même coup les effets ‘opérateurs’ lors du calcul (estimation
de la limite entre les phases d’infiltration).
111
J. Moeys Partie III
112
J. Moeys Partie III
113
J. Moeys Partie III
114
J. Moeys Partie III
(i.e. plusieurs intervalles de temps sont inférieurs ou égaux à TGRAV ou TSTAB), c’est
l’intervalle de temps le plus grand qui a été choisi systématiquement. Le nombre
d’intervalles de temps différents qu’il est possible d’utiliser étant généralement
important, il a été décidé d’automatiser ce choix à l’aide d’un script R décrit plus loin.
avec et
25
Les résultats ne sont reproductibles que sur un intervalle de mesure donné, choisi pour le régime
transitoire. L’opérateur (ou l’algorithme) choisi cet intervalle de temps parmi plusieurs possibles, ce qui
influence le résultat final.
115
J. Moeys Partie III
pour un couple de valeurs S et K donné. Cet ajustement est réalisé sur des valeurs
Infiltration = f(Temps), et non sur leurs valeurs transformées. L’‘ajustement par
inversion’ consiste en fait en une minimisation de la fonction d’erreur, en testant
différentes combinaisons possibles de S et K.
Il existe différents algorithmes d’optimisation dont le point commun est d’essayer
d’atteindre une solution minimisant le résultat de la fonction d’erreur en un temps
réduit. Comme il est impossible de connaître a priori la valeur minimale de la fonction
d’erreur, ces algorithmes procèdent par essais successifs de valeurs de paramètres (ici
S et K), le taux de variation des paramètres étant fonction du taux de variation de la
fonction d’erreur. L’erreur minimale est considérée comme atteinte quand le taux de
variation de l’erreur passe en dessous d’un seuil donné. Ces algorithmes requièrent au
minimum que l’utilisateur choisisse les valeurs de départ des paramètres, choix qui
peut influencer le résultat final.
Plusieurs stratégies ont été testées afin de contourner les effets indésirables de
l’ajustement non-linéaire direct soulignés par Haverkamp (1995) et Vandervaere et al.
(2000a) et de réaliser un ajustement direct acceptable :
– Ajustement direct (de S et de K) ‘combiné’ sur le régime transitoire et le régime
permanent de l’infiltration mesurée. Une telle hypothèse suppose la définition
d’une fonction d’erreur qui synthétise l’ajustement sur le régime permanent et celui
sur le régime transitoire.
– Ajustement direct (de S et de K) ‘combiné’ sur le régime transitoire, le régime
permanent de l’infiltration mesurée et la différence entre la durée du régime
transitoire et le temps de stabilisation. Ce cas de figure suppose la définition
d’une fonction d’erreur incluant l’écart entre la durée du régime transitoire et
le temps de stabilisation calculé à partir des valeurs de S et K estimées.
– Ajustement direct ‘combiné’ (de S et de K) sur le régime transitoire et la différence
entre la durée du régime transitoire et le temps de stabilisation. L’alternative d’un
ajustement sur le régime permanent et l’écart de temps n’est pas réaliste du fait de
la durée limitée des mesures d’infiltrations.
L’idée sous-jacente de ces approches est d’introduire dans l’ajustement direct
un paramètre – ici l’écart entre la durée du régime transitoire et le temps de
stabilisation – qui pénalise la fonction d’erreur si les valeurs de S et de K estimées
sont incohérentes par rapport à cet autre critère.
116
J. Moeys Partie III
117
J. Moeys Partie III
de manière à obtenir :
équation 50 – Correction apportée à la pondération des 3 composantes de la fonction
d’erreur globale de l’ajustement direct.
Avec p’RT, p’RP et p’∆T, les pondérations corrigées du régime transitoire, du régime permanent et
de l’écart au temps de stabilisation respectivement.
La fonction d’erreur globale pondérée se définit ensuite comme suit :
118
J. Moeys Partie III
26 “ ’BFGS' is a quasi-Newton method (also known as a variable metric algorithm), that [was]
published simultaneously in 1970 by Broyden, Fletcher, Goldfarb and Shanno ". Notice de la
fonction ‘optim’, R Development Core Team (2006).
27 " Method 'L-BFGS-B' is that of Byrd et. al. (1995), which allows box constraints, [...]. This
uses a limited-memory modification of the BFGS quasi-Newton method. ". Notice de la
fonction ‘optim’ , R Development Core Team (2006).
119
J. Moeys Partie III
■ Principe
En 1992, Clothier et al. ont mis au point une méthode de détermination de la teneur
en eau immobile in situ, basée sur l'infiltration successive d'eau, puis d'une solution
contenant un traceur inerte avec un infiltromètre à disque.
La première infiltration (qui n'infiltre que de l'eau sans soluté) permet d'atteindre la
teneur en eau au potentiel imposé (eau mobile et immobile), ainsi qu'un flux
d'infiltration constant (régime permanent). A la fin de la première infiltration, la
concentration en traceur (soluté) dans la phase mobile et dans la phase immobile est
nulle, celui-ci n'étant normalement pas présent dans le sol, ni dans l’eau infiltrée
initialement.
Un échange rapide d'infiltromètre – ou un changement rapide de la solution du
réservoir – permet d'infiltrer ensuite une solution contenant le traceur. L'infiltration
reprend, au même flux et au même potentiel que précédemment, mais avec cette fois
un traceur. Les teneurs en eau mobile et immobile sont normalement inchangées. On
peut considérer que pendant un temps limité, la diffusion du soluté entre la phase
mobile et immobile est négligeable. Comme il n'y a théoriquement pas d'échange
d'eau entre la phase mobile et la phase immobile, la solution contenant le traceur
remplace progressivement la solution sans traceur dans la phase mobile du sol,
mais pas dans la phase immobile. La concentration en traceur dans la phase mobile
devient égale à la concentration injectée par l'infiltromètre. On peut alors réécrire
l'équation 22 (p. 54) de manière à exprimer θimm. en fonction de θ, C, Cmob. et Cimm., en
replaçant θmob. par (θ - θimm.) (équation 21) :
équation 54 – Calcul de la teneur en eau immobile pour une infiltration avec un seul traceur
(Clothier et al., 1992) quand les échanges par diffusion sont négligeables.
Avec θimm. [L3.L3] ou (m3.m-3) la teneur en eau immobile ; θ la teneur en eau globale du sol au
potentiel imposé, mesurée après l'infiltration ; CS,globale [M.L-3] ou (kg.m-3) la concentration globale
en traceur dans la phase liquide du sol ; CS,mob. la concentration en soluté dans la phase mobile du
sol ; CS,globale,mesurée la concentration globale en traceur dans la phase liquide du sol mesurée sur
l'échantillon prélevé ; CS,infiltromètre la concentration en traceur de la solution injectée par
l'infiltromètre.
Lors de la double infiltration décrite ci-dessus, CS,mob. devient égal à la concentration
de la solution injectée par l'infiltromètre. CS,globale peut quant à elle être mesurée sur un
prélèvement de sol (de volume connu) sous l'infiltromètre, par analyse au laboratoire.
Cette approche pose néanmoins quelques problèmes méthodologiques :
– Le temps d'infiltration doit être suffisamment court pour que l'hypothèse de base
d'un d'échange de traceur entre la phase mobile et la phase immobile soit
négligeable (à une profondeur donnée).
120
J. Moeys Partie III
– Le temps d'infiltration doit être suffisamment long pour que la solution injectée
par le 2e infiltromètre ait eu le temps de remplacer la solution d'eau sans traceur
initiale, et cela en tenant compte des effets de dispersion du traceur lors de
l'infiltration (à une profondeur donnée).
– L'échantillonnage, destiné à mesurer la concentration en traceur dans le sol à la fin
de l'infiltration, doit avoir lieu au milieu du disque d'infiltration, là où l’hypothèse
d'écoulement monodimensionnel vertical est respectée.
– La profondeur/hauteur de l’échantillon et le moment de l'échantillonnage
doivent être compatible avec les 2 premières contraintes.
Snow (1999) a étudié en détail ces questions et fournit des indications de hauteurs
d'eau optimales à infiltrer en fonction du flux en régime permanent, de la valeur du
paramètre d'échange par diffusion α [T-1] ou (s-1) et de la dispersivité λ [L] ou (m).
■ Protocole
Après avoir réalisé une infiltration au potentiel de –1 cm (infiltration servant à
estimer S et K comme décrit dans le paragraphe « Détermination de la conductivité
hydraulique au voisinage de la saturation avec un infiltromètre à disque » p. 100) on
remplace l'infiltromètre par un autre, réglé au même potentiel, mais dont le réservoir
est rempli d'une solution de Bromure (Br–, traceur n'interagissant pas avec la phase
solide du sol) à 507 mg.L-1 (+/- 6 mg.L-1).
Le changement doit être rapide, de manière à ne pas affecter excessivement le flux
en régime permanent préalablement atteint. Cette deuxième infiltration est prolongée
jusqu'à ce qu'une hauteur de 10 mm au minimum ait été infiltrée sous le disque. Bien
que cette 2e infiltration ne serve pas à déterminer K(h), un suivi minimal de la hauteur
d'eau infiltrée en fonction du temps est réalisé de manière à pouvoir déterminer après
coup le flux en régime permanent et vérifier qu’il est cohérent avec le flux mesuré
avant l’application du traceur. Ce flux, et la hauteur d'eau infiltrée doivent permettre de
vérifier que les conditions définies par Snow (1999) sont respectées.
A la fin de l'infiltration, le prélèvement à la gouge d'un cylindre de sol de 2,5 cm de
diamètre pour 1 à 2 cm de haut est réalisé comme pour une infiltration sans traceur. La
teneur en eau massique de cet échantillon est déterminée, comme pour les
échantillons de sol sans traceur.
Une fois la masse de sol sec déterminée sur l'échantillon, un volume d'eau de 3 fois
la masse de sol sec est ajouté dans le flacon qui contient le sol. Le flacon est agité 24 h
dans un agitateur rotatif (REAX 20, Heidolph Instruments, Schwabach, DE) à
15 tours.minute-1. Après agitation, les échantillons sont mis à décanter. Une fois que les
particules et colloïdes en solution sont redescendus d'un à deux centimètres, un
aliquote de 1,5 mL est prélevé et filtré à l'aide d'un filtre nylon 0,45 µm (PK/100
Ø 133 mm, Teknokroma, Barcelone, ES) et placé dans un vial en verre.
Un sous aliquote de 50 µL est ensuite analysé par chromatographie haute pression
en phase liquide (HPLC Waters 2695, Milford, MA, USA) sur une colonne échangeuse
d’anion (AllSep A-2 Anion, AllTech, Deerfield, IL, USA), poussé par un éluant de
carbonate et bicarbonate de sodium (Na2CO3 à 2,2 mmol.L-1 et NaHCO3 à 2,8 mmol.L-1)
suivie d’un spectromètre (photodiodes Waters 996) sensible entre 193 et 246 nm (avec
un suivi sur 200 nm). Le temps de sortie du bromure est de 5,8 min.
Les aires des pics de bromure détectés sur le spectromètre sont intégrées de
manière semi-automatique, avec une vérification / sélection visuelle du début et de la
fin du pic, afin de déterminer l’aire du pic.
121
J. Moeys Partie III
122
J. Moeys Partie III
temps et caractéristiques (e.g. capacité au champ). Il est possible d’estimer, par une
mesure ou par l’utilisation de fonctions de pédotransfert une teneur en eau massique
moyenne à appliquer à tous les échantillons. Dans cette étude, il a été choisi de
fixer le potentiel matriciel des échantillons incubés à pF 2, en adaptant pour
chaque échantillon la teneur en eau du sol. Cela nécessite une mesure préalable
de la teneur en eau au pF 2 de chaque échantillon. Cette détermination doit se
faire sur le sol tamisé, pour tenir compte du changement de porosité structurale
dû au tamisage.
La teneur en eau massique à pF 2 des échantillons de sol tamisés a été
déterminée suivant un protocole similaire à celui exposé dans le paragraphe
« Détermination des paramètres de la rétention en eau sur des échantillons de sol »,
p. 99. Au lieu d’utiliser des cylindres métalliques de prélèvement, des agrégats sont
déposés dans des cylindres de PVC de même taille, fermés à leur base par une
membrane de nylon du même type que celle utilisée sous les infiltromètres ou sur le
bac d’humectation (maille un peu plus large), afin d’éviter que du sol ne s’en échappe.
La suite de la procédure est identique. Pour chaque échantillon de sol, 2 répétitions
de la mesure sont réalisées avec, pour chacune d’elle, 25 à 45 g de sol frais utilisé.
6 Adsorption de l’isoproturon
L’adsorption d’une molécule organique sur la phase solide du sol dépend à la fois
des propriétés physico-chimiques d’interaction entre la molécule et la phase solide du
sol, de la quantité d’eau présente dans le sol (ratio sol-eau), ainsi que la quantité de
molécules présentes dans le sol. Les modèles d’adsorption sont décrits par l’équation
24 et l’équation 25 et illustrée par la figure 9 (p. 58).
■ Principe
La mesure de l’adsorption sur des échantillons de sol non perturbés est complexe,
car, suivant l’état de remplissage de la porosité du sol par la phase liquide, tous les
sites d’adsorption de la phase solide ne seront pas accessibles aux molécules.
On utilise donc des agrégats de sol (après fragmentation et tamisage) que l’on
place dans un tube (qui n’adsorbe pas ou peu la molécule) avant de le remplir avec
une solution contenant la molécule (isoproturon). Le rapport sol / solution est
supérieur à ce qui existe dans un sol réel, de manière à ce que les molécules puissent
être en contact avec tous les sites d’adsorption. Le tube est agité 24 h à température
constante, afin de maximiser le contact sol-molécule et de disperser les agrégats.
Pendant ces 24 h un équilibre s’installe entre les molécules adsorbées sur la
phase solide et celles qui restent en solution, et la dégradation de la molécule reste
négligeable.
Après l’agitation, les tubes sont centrifugés de manière à plaquer les particules de
sol au fond du tube, tandis que la solution, moins dense, reste au-dessus. Un aliquote
de solution est récupéré afin d’y doser la concentration en pesticide. Ce dosage est
facilité par le fait que la molécule est radio-marquée au carbone 14 (noté 14C), ce qui
permet de la quantifier par comptage des désintégrations, plus aisé que le dosage par
123
J. Moeys Partie III
chromatographie.
La demi-vie de désintégration du carbone 14 étant bien supérieure à la durée de
l'expérience, il n'est pas nécessaire de tenir compte de ce paramètre dans les calculs :
la quantité d'isoproturon dégradée par désintégration du 14C au cours de l'expérience
est très faible au regard du nombre total de molécules.
La masse de sol (phase solide), le volume de solution et la quantité de molécules
introduites dans le tube sont connus au départ. La quantité de molécules en solution à
l’équilibre (après centrifugation) est mesurée à la fin. On obtient par différence la
quantité de molécule adsorbée. Ces paramètres permettent de calculer le KD avec
l’équation 24.
figure 30 – Mesures de l’adsorption d’une molécule par agitation d’un tube contenant un
mélange eau-sol liquide (mesure en batch).
Avec MS [M] ou (kg) la masse ‘équivalent sol sec’(solide) ajoutée dans le tube ; VE [L3] ou (m3) le
volume de solution ajoutée au tube, solution qui contient une masse MP [M] de pesticide (ainsi que
du CaCl2) ; MP,E [M] la masse de pesticide dans la solution ; MP,S [M] la masse de pesticide
adsorbée sur la phase solide. Le dosage est la quantification de MP,E sur un aliquote de solution.
■ Protocole
Pour chaque échantillon, 3 g équivalent sol sec sont placés dans un tube à
centrifugation en verre Corex (no8446®, USA) de 25 mL de capacité. La teneur en eau
du sol est ensuite ajustée, échantillon par échantillon, afin d’atteindre une teneur en
eau massique de 1 g pour 3 g de sol sec (par ajout d’eau déminéralisée, en fonction de
la teneur en eau initiale des échantillons). Les pesées sont réalisées sur une balance
de précision 1 mg (Mettler AE240).
Un volume de 9 mL de solution d’isoproturon à 5,55 mg.L-1 est ensuite ajouté au
tube, ce qui donne avec le gramme d’eau déjà présent dans le sol une concentration
dans le tube de 5 mg.L-1. Le rapport sol / eau est de 3 pour 10 (≈ 1/3). La solution
contient aussi du CaCl2 à 10-2 M (soit 1,47 g.L-1 de CaCl2 2H2O), afin de rééquilibrer la
balance minérale du sol (Wauchope et al., 2002) et d’améliorer la sédimentation des
argiles lors de la centrifugation (floculation). La solution apportée est pesée sur une
balance de précision 0,1 g (PB 3002-5, Mettler-Toledo). Tous les calculs sont basés
sur les masses de sol et de solution effectivement apportés (pesées) et non sur
les volumes visés.
Cette dose est proche de la concentration en isoproturon dans la phase liquide du
sol lors d’une utilisation agronomique. Au champ, l’isoproturon est apporté à 1 200 g.ha-1
(maximum légal), ce qui donne pour une épaisseur de 0,05 m de sol, avec une masse
124
J. Moeys Partie III
125
J. Moeys Partie III
adsorptions en batch comme décrites ci-dessus. Il est donc difficile de comparer les
mesures de KD des horizons de surface du secteur agricole avec les KD mesurés sur
les horizons profonds.
Des mesures d’adsorption en batch ont donc été conduites sur les horizons
prélevés par Alletto (2004), et sur les horizons de 2 nouvelles fosses ouvertes et
prélevées en 2005, afin de pouvoir comparer l’adsorption des horizons de surface et
celle des horizons profonds de la parcelle. Quatre horizons de surface et 12 horizons
profonds de la parcelle ont fait l’objet de mesures de KD en batch :
– Un NÉOLUVISOL sur limon de Beauce (fosse 1-2, Alletto 2004), avec ses horizons
LA, BT2 et BT/C (3 échantillons)
– Un BRUNISOL sur argile à meulière (fosse 2-2, Alletto 2004), avec ses horizons LA et
IIIC1.
– Un NÉOLUVISOL sur argile à meulière (fosse 3-2, Alletto 2004), avec ses horizons
LA, BT1, IIC et IIIC.
– Un CALCOSOL caillouteux (fosse 4), avec ses horizons LA, S et C.
– Un NÉOLUVISOL sur limon colluvionné, avec ses horizons LA, BT2.1, IIC et IIIC.
Ces échantillons permettent d’ajouter aux mesures de surface des horizons
limono-argileux à argileux profonds (dont des horizons dérivés de l’argile à
meulière), ainsi que des horizons à fortes teneurs en éléments grossiers et en
carbonates.
7 Dégradation de l'isoproturon
Les résultats concernant cette partie sont exposés p. 189.
■ Principe
Le calcul d’un temps de demi-vie de l’isoproturon nécessite un suivi de l’évolution de
la concentration en isoproturon dans le sol, en fonction du temps, dans des conditions
de température et de teneur en eau constantes. Après un apport initial en isoproturon
de masse connue, la molécule est progressivement dégradée et minéralisée. Le suivi
de cette dégradation est appelé « cinétique de dégradation ».
Comme pour les mesures d’adsorption, l’utilisation de molécules d’isoproturon
radiomarquées au carbone 14 (noté 14C) sur leur cycle permet de suivre la
concentration en isoproturon dans les solutions extraites du sol avec des solvants et
permet de connaître la quantité totale de radioactivité présente. Une analyse HPLC sert
ensuite à déterminer les proportions d’isoproturon et de ses métabolites dans la
radioactivité totale dosée.
■ Protocole général
La mesure a été conduite en deux séries de mesures, portant sur 25 échantillons
chacune. Les incubations des échantillons d’une même série démarrent et se
126
J. Moeys Partie III
figure 31 – Incubation de sol avec une solution de 14C isoproturon pour mesurer la cinétique
de dégradation et de minéralisation.
Avec MS [M] la masse ‘équivalent sol sec’ (phase solide) ; H2O la quantité d’eau (VE) ajoutée pour
ajuster le pF du sol à 2 ; Solution : la solution de 14C isoproturon apportée au sol ; 14C le carbone
14 (CO2) issu de la minéralisation de l’isoproturon ; NaOH une solution de soude destinée à piéger
le CO2 émis par le sol (dont le 14CO2 de l’isoproturon) ; Jd1, Jd2, ... les jours/temps 1, 2 ...
auxquels certains bocaux sont sacrifiés pour un dosage de l’isoproturon dans le sol ; Jm1, Jm2, les
jours/temps 1, 2, ... auxquels le pilulier de soude est changé et dosé (sans sacrifice).
Pour chaque échantillon, 8 réplicats sont préparés avec, pour chacun, 20 g
équivalents sol sec placés dans un pilulier (en verre, contenance 60 mL). Trois temps
d’extraction (dits ‘de sacrifice’) sont prévus (dosage de la quantité d’isoproturon restant
dans le sol), portant pour chacun d’eux sur 2 réplicats (2 piluliers). Les deux réplicats
restant devaient permettre de rajouter un temps d’extraction additionnel ou de palier à
la perte éventuelle de certains piluliers. Chaque série comporte donc 200 piluliers.
Les temps d’extraction sont en nombre limité : 3, 14 et 98 jours (nommées t3, t14 et
t98). Les répétitions sont nommées A et B.
La quantité d’eau présente dans l’échantillon est ajustée à l’aide d’une propipette.
Elle est vérifiée par pesée sur une balance de 0,1 g de précision (PB 300S-S, Mettler-
Toledo), pour atteindre 90 % de la teneur en eau de l’échantillon à pF 2 (mesurée
préalablement), à laquelle on a retranché 0,5 g, soit la quantité de solution
d’isoproturon qui est apportée immédiatement après. Le pilulier entier est ensuite pesé,
afin de pouvoir contrôler régulièrement (et ajuster) la teneur en eau de sol mis à
incuber.
L’isoproturon radiomarqué est apporté dans 0,5 mL d’une solution à 10 mg.L-1 et
marquée à 600 000 DPM.mL-1. Les 0,5 mL apportés sont pesés sur une balance de
précision 1 mg (AE240, Mettler). C’est la masse de solution effectivement apportée qui
est ensuite utilisée dans les calculs.
La solution a été préparée à partir des mêmes sources marquées et non marquées
que pour les mesures d’adsorption.
La concentration en isoproturon atteinte dans le bocal au moment de l’apport est de
0,25 µg d’isoproturon . g de sol sec-1 (0,25 mg.kg-1), et de 939 µg d’isoproturon . L de solution
du sol-1. La concentration en radioactivité est de 15 000 DPM . g de sol sec-1 (soit
300 000 DPM par pilulier).
Rapporté à une dose agronomique appliquée par hectare, cette dose est
équivalente à un apport de 157,5 g.ha-1 (répartie sur les 5 premiers cm de sol à une
masse volumique apparente de 1260 kg.m-3 de sol), soit environ 1/8e de la dose
maximale autorisée (1200 g.ha-1).
127
J. Moeys Partie III
128
J. Moeys Partie III
l’étape suivante.
Le sol resté dans le tube à centrifuger est ensuite remis en suspension dans 60 mL
de méthanol. Comme pour l’extrait à l’eau, il est agité 24 h et le surnageant est
récupéré par centrifugation dans un flacon de verre de 180 mL. L’opération est
recommencée 2 fois, et les 3 extraits méthanols obtenus sont groupés dans le même
flacon. Ce dernier, dont la masse à vide est connue, est pesé avec les 3 extraits
méthanol et mélangé. Comme pour les extraits eau, 1 aliquote de 0,5 mL sont ensuite
prélevés et mis au compteur à scintillation. Le flacon de méthanol est stocké à 4°C.
A la fin de ces étapes, la quantité de molécules radioactives extractible à l’eau
ou au méthanol est connue. Cette radioactivité peut provenir de l’isoproturon,
mais aussi de ses métabolites, et plus généralement toute molécule incluant des
atomes de carbone du cycle marqué, issue de sa dégradation qui n’ait pas été
minéralisée. Il est donc nécessaire de déterminer la quantité d’isoproturon (en
proportion de la radioactivité totale) présente dans les deux extraits. Une partie
de la radioactivité n’a pas été extraite et reste dans le sol. Il est possible de la doser,
mais cette mesure n’a pas été effectuée. Comme dans les extraits à l’eau ou au
méthanol, la radioactivité qui reste dans le sol peut être de l’isoproturon, ou ses
métabolites. Cette fraction est appelée ‘résidus liés’, ou ‘fraction non extractible’, et elle
est considérée arbitrairement comme un produit de dégradation de l’isoproturon dans
les calculs de cinétique de dégradation. Il est en réalité difficile de savoir si les
résidus liés sont de l’isoproturon immobilisé, ou s’ils sont des produits de
dégradation de l’isoproturon. La fraction non-extractible peut être importante sur le
long terme si la séquestration des molécules s’avère être réversible. Le dosage de
cette radioactivité est aussi utilisé pour réaliser des bilans de radioactivité (vérifier qu’il
n’y a pas de pertes).
129
J. Moeys Partie III
récupérées dans les 2 mL de méthanol, dans un flacon de verre. Deux mL d’eau sont
mélangés à la solution, et un aliquote de 1 mL placé dans un vial en verre pour être
analysé en HPLC. Le mélange eau/méthanol 50 %-50 % améliore la séparation
chromatographique.
130
J. Moeys Partie III
131
J. Moeys Partie III
■ Ajustement linéaire
Une transformation logarithmique des deux termes de l’équation permet d’aboutir à
la relation linéaire :
132
J. Moeys Partie III
133
J. Moeys Partie III
Les liens éventuels entre les différentes propriétés sont ensuite examinés en
prenant les propriétés deux à deux. S’il s’agit de deux propriétés quantitatives, le
coefficient de corrélation est calculé, s’il s’agit d’une propriété quantitative et d’une
propriété qualitative, une analyse de la variance est effectuée. Le cas échéant,
quelques analyses de la variance à deux facteurs contrôlés sont réalisées.
Les liens entre propriétés pouvant être multiples, des analyses en composantes
principales sont réalisées sur différents sous-ensembles de propriétés. Elles doivent
permettre de dégager les grandes ‘composantes’ de la variabilité au sein des sols
mesurés, et les propriétés qui y sont associées. Ces analyses se basent uniquement
sur les propriétés quantitatives, mais il est possible d’examiner visuellement le rôle des
propriétés qualitatives par rapport à cette variabilité.
L’objectif étant de pouvoir prédire certaines propriétés ‘importantes mais difficiles à
mesurer’ à partir de propriétés ‘plus simples à mesurer’ (fonctions de pédotransfert),
plusieurs méthodes de ‘modélisation statistique’ sont mises en œuvre, et leurs
résultats testés, afin de définir si ces prédictions sont possibles.
Dans les chapitres suivants, le terme de « propriété » (dans le sens d’une propriété
physique, chimique ou biologique du sol) est préféré au terme « variable » (au sens
statistique du terme), afin de garder une cohérence terminologique entre les chapitres
de cette thèse. Les valeurs mesurées/observées d’une propriété sont assimilées à des
‘réalisations’ d’une variable. Par « propriété qualitative ou quantitative », il faut donc
aussi comprendre « variable qualitative ou quantitative ».
134
J. Moeys Partie III
135
J. Moeys Partie III
figure 35 – Position des différentes statistiques sur un graphique ‘box & whisker’.
La partie cintrée de la boite autour de la médiane correspond à une estimation d’intervalle de
confiance autour de celle-ci. Exemple sur une distribution log-normale (300 valeurs ;
log(moyenne) = 1, log(écart type) = 0,7).
Ces définitions sont données d’après l’aide de la fonction ‘boxplot’, package
‘graphics’, version 2.4.1, (R Development Core Team, 2006). Cette fonction a servi à
produire les graphiques ‘box & whisker’ de ce document.
■ Statistiques de distribution
136
J. Moeys Partie III
137
J. Moeys Partie III
ces tests soient relativement robustes, la fiabilité de leurs conclusions est contestable
en cas de non-normalité avérée d’une des propriétés étudiées.
Les valeurs prises par une propriété peuvent s’écarter de la normalité pour plusieurs
raisons. Les propriétés, qui reflètent des propriétés physiques, chimiques ou
biologiques du sol, peuvent suivre ‘intrinsèquement’ une distribution non normale
(asymétrique, et/ou aplatie/pointue). Par exemple, la gamme de valeurs ‘habituelles’
des conductivités hydrauliques à saturation s’étale sur plusieurs ordres de grandeur.
Dans d’autres cas, la propriété peut suivre une distribution relativement proche de la
normalité, mais les mesures concernent deux (ou plusieurs) ‘populations’ (types de sol,
pratiques agronomiques) contrastées dont la distribution groupée est bimodale ou
plurimodale.
138
J. Moeys Partie III
A – Pearson B – Spearman
équation 60 – Coefficients de corrélation de Pearson et de Spearman.
Avec rx,y le coefficient de corrélation de Pearson (en : Pearson product moment correlation
coefficient) entre les propriétés x et y ; xi et yi les ièmes valeurs prises par les propriétés x et y ; n le
nombre de couples de valeurs {x,y} ; et les moyennes des propriétés x et y ; σ2x et σ2y les
variances de x et y ; ρx,y le coefficient de corrélation de rang de Spearman ; rang(xi) et rang(yi) les
rangs respectifs du ie couple de valeur {x,y} quand les propriétés sont ordonnées indépendamment
sur x et sur y. D'après Dodge, 2003.
L’un et l’autre ont été calculés avec la fonction ‘cor’ et ‘cor.test’ du logiciel R et
évalués selon leur probabilité P29, qui est comparée à la probabilité α30 choisie (ici
α = 5%).
Ces coefficients de corrélation ne peuvent être appliqués qu’aux propriétés
quantitatives (e.g. teneur en argile) ou qualitatives ordonnées (e.g. classe de
profondeur de sol). Pour tester les liens entre des propriétés quantitatives et les
propriétés qualitatives non-ordonnées (e.g. type de sol), il faut faire appel à d’autres
tests statistiques, comme les analyses de la variance (ci-dessous).
29
Probabilité d’obtenir une telle corrélation si l’hypothèse H0 (absence de corrélation entre les variables)
est ‘en réalité’ vraie.
30
Probabilité de conclure que les propriétés sont significativement corrélées alors que l’hypothèse H0
(absence de corrélation entre les variables) est ‘en réalité’ vraie.
139
J. Moeys Partie III
140
J. Moeys Partie III
un ‘test de Student’ avec une approximation des degrés de liberté selon Welch 1946
et/ou Satterthwaite 1946 comme une solution au problème d’hétérogénéité des
variances, mais cette alternative ne résout pas le problème de non-normalité de la
propriété quantitative.
L’analyse de la variance de Kruskal Wallis et le calcul de la valeur P ont été réalisés
avec la fonction ‘kruskal.test’ du logiciel R.
141
J. Moeys Partie III
alors O1 se distingue des autres observations par sa faible valeur sur P2.
L’analyse en composantes principales, ne repose pas sur des hypothèses quant
à la nature de la distribution des propriétés, elle est donc non-paramétrique
(Webster, 2001 ; Schlens, 2005). L’analyse en composantes principales n’est pas
interprétée sous l’angle de test de significativité comme d’autres statistiques. L’analyse
en composantes principales décompose la variabilité par des relations linéaires
(composante = f( propriétés quantitatives )), ce qui n’est pas toujours la solution la plus
adaptée (d’autres méthodes existent pour ces cas de figure ; voir Schlens, 2005).
Par ailleurs, l’analyse en composantes principales ne permet pas de mettre en
évidence des liens de cause à effet des propriétés explicatives sur les propriétés
d'intérêt, expliquées. Elle met en évidence des liens structurels qu'elle modélise de
manière statistique (et non par des modèles physiques) et montre des variations
concomitantes des propriétés, et ce pour différentes ‘strates’ de variabilité. Cela ne
constitue pas la preuve d'un lien de causalité, même si c'est un élément pouvant servir
à sa démonstration.
31
Ou par tout autre méthode de prédiction spatialisée, comme l’utilisation d’images satellites.
142
J. Moeys Partie III
143
J. Moeys Partie III
multivariées, sont souvent utilisées pour calculer les fonctions de pédotransfert (du
type y = a.x1 + b.x2 + c.x3... + o).
144
J. Moeys Partie III
145
J. Moeys Partie III
146
J. Moeys Partie III
147
J. Moeys Partie IV
Partie IV Résultats
Variabilité spatiale &
déterminisme des processus
dans les sols
33
« Incertitudes – N’utilisez pas de fonctions de pédotransfert sans en évaluer l’incertitude et, pour un
problème donné, si plusieurs fonctions de pédotransfert existent, utilisez celle qui a la plus petite
variance » [variance de l’erreur de prédiction] PTFs: PedoTransfer Functions
148
J. Moeys Partie IV
1 Constituants et organisation
des sols
■ 1.1 Propriétés physiques et physico-chimiques
des sols
149
J. Moeys Partie IV
figure 37 – Textures non décarbonatées des sols du secteur agricole de Ouarville, placées
sur le triangle des textures de la Chambre d’Agriculture de l’Aisne. Vue générale et
agrandissement.
Ces résultats proviennent des analyses réalisées sur les échantillons prélevés, et non des
estimations de terrain.
Les coefficients de variation de ces propriétés sont faibles (13 % pour l'argile, 8 %
pour le limon), sauf pour la fraction sableuse (47 %), mais celle-ci est minoritaire.
Les 3 fractions sont très peu affectées par la décarbonatation, ce qui montre que les
carbonates ne constituent qu'une part très minoritaire de leurs constituants
minéralogiques. Les carbonates sont surtout localisés dans les sables, et plus
faiblement dans la fraction limoneuse.
Placées sur le triangle des textures, ces 3 fractions se répartissent dans deux
classes de texture, le limon argileux ou l'argile limoneuse. Sur ce triangle, les
échantillons se dispersent surtout le long de l'axe des teneurs en argile.
Les graviers et cailloux occupent une part modeste de la masse totale, 2,5 % en
moyenne cumulée, mais éminemment variable. Les coefficients de variation de ces
deux propriétés dépassent en effet les 100 %.
Propriété [g.kg-1] Skewness Kurtosis Valeur PW-S
Argile (ND) 0,0 1,1 2,34.10+2
Limon (ND) -0,6 -0,2 6,60.10-2
Sable (ND) 1,4 3,1 4,40.10-4
Graviers 1,7 3,1 8,80.10-7
Cailloux 1,2 0,3 5,59.10-6
tableau 19 – Statistiques de distribution des fractions granulométriques non décarbonatées.
ND : analyses sans décarbonatation ; Une valeur du test de Shapiro inférieure à 5.10-2 (alpha = 5%)
signifie que la normalité n’est pas respectée.
Les statistiques de distribution (tableau 19) des fractions les plus fines, argile et
limon, ne s'écartent pas, ou modérément de la normalité (test de Shapiro). Le
resserrement apparent (kurtosis) de la propriété 'teneur en argile' autour de son/ses
modes cache en fait une distribution d'allure bimodale, comme le montre le graphique
ci-dessous :
150
J. Moeys Partie IV
figure 39 – Graphique ‘box & whisker’ des charges massiques des différentes fractions
granulométriques grossières (graviers, cailloux et totale).
Ces résultats proviennent des analyses réalisées sur les échantillons prélevés, et non des
estimations de terrain.
34
Somme des graviers et cailloux.
151
J. Moeys Partie IV
152
J. Moeys Partie IV
figure 42 – Graphique ‘box & whisker’ du rapport carbone organique sur azote.
□ pH
Si la variabilité de la teneur en carbonate de calcium est très élevée, celle du pH est
au contraire modérée. La valeur du pH est en partie liée à la teneur en CaCO3, mais
elle dépend aussi des pratiques d'amendement calcaire des agriculteurs, dont l'impact
n'est pas forcément visible sur les teneurs en CaCO3 (qui se dissolvent), mais bien sur
le pH.
Moyenne Écart type CV
7,3 0,7 9%
Minimum Q10 % Q50 % Q90 % Maximum
6,0 6,3 7,4 8,2 8,3
Distribution : Skewness –0,2 ; Kurtosis –1,3; test de Shapiro 1,39.10-2.
tableau 23 – Statistiques descriptives du pH des échantillons analysés [-].
Comme le montre son kurtosis de –1,3, le pH a une distribution très aplatie, avec
153
J. Moeys Partie IV
figure 45 – Graphique ‘box & whisker’ des masses volumiques apparentes mesurées
(g.cm-3).
154
J. Moeys Partie IV
figure 46 – Symboles utilisés dans les schémas pour les principaux matériaux parentaux du
secteur étudié.
Trois matériaux secondaires ont aussi été identifiés :
– Les graviers de Lozère du Burdigalien, qui ne représentent souvent qu'une part très
minoritaire de la phase solide, mais qui peuvent être occasionnellement trouvés en
grandes quantités (> 20 % du volume du sol ; cas rares ou très localisés dans le
secteur).
– Un lœss carbonaté (une seule observation) ;
– Une formation sableuse (deux observations), probablement rattachée au
Burdigalien (les sables du Burdigalien ne sont pas rares dans d'autres secteurs de
la Beauce). Ces sables sont jaunes orangés mais présentent des incursions plus
sombres ou rouge 'lépidocrocite'.
Les deux derniers matériaux n’ont été rencontrés que très localement. Il s'agit donc
certainement de formations reliques ayant échappé à l'érosion (ou à l'altération). Les
sables ont toujours été trouvés à bonne profondeur (> 1,5 m), dans une situation
laissant penser qu'il s'agit d'une poche de dissolution du calcaire remplie de matériaux
exogènes.
La succession verticale des principaux matériaux est parfaitement régulière (à
l'exception notable des graviers de Lozère), mais il est très fréquent qu’un ou plusieurs
matériaux situés au-dessus du calcaire ne soit pas présent.
Sur le terrain, les matériaux présentant des caractéristiques intermédiaires sont
nombreux, ce qui suggère des mélanges ou des ‘contaminations’ respectives. En effet,
les processus pédologiques seuls ne peuvent expliquer ces ‘variantes’. On rencontre
par exemple fréquemment :
– Du limon enrichi en argile et/ou en éléments grossiers de meulières ;
l’enrichissement provient soit d'une illuviation d'argile depuis un horizon supérieur,
soit d'un mélange avec une formation argileuse (à meulières, de décarbonatation)
sur laquelle s'est déposé le limon, auquel cas des cailloux sont aussi incorporés ;
– De l’argile à meulière contaminée par du limon ;
– Du calcaire altéré avec une importante fraction limoneuse ;
155
J. Moeys Partie IV
figure 47 – Schéma des successions de matériaux parentaux observées (ou non) sur le secteur
étudié.
NB : La hauteur des schémas ne reflète pas la profondeur du sol. Les situations (c) et (e) n'existent
en fait qu'avec un horizon de surface partiellement contaminé par du limon (voir ci-dessous). La
situation (a) a été observée très ponctuellement mais très nettement au sud-est du secteur étudié.
Les sols du secteur agricole de Ouarville dérivent donc d'un nombre très restreint
de matériaux géologiques qui se succèdent dans un ordre bien précis. Mais de
très nombreuses situations intermédiaires dérivant des mélanges de matériaux
rendent souvent difficile le rattachement d'un horizon à l'un ou l'autre des matériaux
parentaux. Cela est particulièrement vrai pour les situations intermédiaires entre le
limon et le calcaire altéré, ou entre le limon et l'argile à meulières, avec des teneurs en
argile et des charges en éléments grossiers variables (en quantité comme en nature
lithologique).
156
J. Moeys Partie IV
157
J. Moeys Partie IV
figure 51 – Graphique ‘box & whisker’ des teneurs en éléments grossiers maximales des
sondages tarière.
158
J. Moeys Partie IV
159
J. Moeys Partie IV
éléments grossiers à une position ‘de plateau’ ou ‘de talweg’. Pour la profondeur du
sol, ce constat visuel a été confirmé par des statistiques (non-présentées ici) tirées de
la base de sondages ayant servi à élaborer la carte des sols du secteur (figure 19,
p. 82) : il ne semble pas y avoir d’effet ‘pente’, ou d’effet ‘orientation de pente’
sur ce paramètre.
Un examen visuel de la carte topographique (p. 73), de la carte géologique (p. 80)
et des cartes des propriétés, montre que le secteur nord-est présente à la fois une
topographie de petits talwegs plus marquée qu’ailleurs et une épaisseur de limon des
plateaux moindre. Or, on constate que c’est aussi dans ce secteur qu’on trouve le
plus de sols peu profonds, avec une teneur en argile, en carbonates et en
éléments grossiers plus élevés (observation en accord avec la carte des sols et les
conclusions de Delmas, 2007). Cependant, de tels sols sont observés ailleurs sur la
carte.
La seule conclusion qui peut être raisonnablement tirée sur la répartition spatiale
des types de sols est liée aux matériaux géologiques : les RENDISOLS, CALCOSOLS et
CALCISOLS sont par définition les plus carbonatés, logiquement peu épais (puisque le
carbonate provient du calcaire sous-jacent) et sont plus spécifiquement présents dans
le secteur nord-est, là où le relief est plus marqué.
Après avoir ‘réinterprété’35 les fiches de sondage de la carte des sols du secteur,
Delmas (2007) a montré qu’un large quart nord-ouest (et une petite zone autour du
bois du secteur nord-est) comporte de fréquents plaquages d’argile à meulière, et
une teneur en argile de surface plus élevée. L’auteur montre aussi que les sols les
plus épais, et les plus limoneux, sont situés sur le plateau ‘Ossonville-Ouarville’.
Cependant, le travail de Delmas (2007) montre que la cartographie des matériaux
parentaux – et plus encore celle des sols – est très difficile à l’échelle considérée
(1/25 000). Moeys et al. (2006) ont montrés que la cartographie des sols était possible à
l’échelle parcellaire (20 ha), mais les moyens sont autrement plus importants que dans
le cas de la carte des sols du secteur (prospection pédologique dense + mesure
géophysique).
Les observations de terrain montrent qu’il est difficile de différencier un PSEUDO-
LUVISOL d’un NÉOLUVISOL ou d’un LUVISOL (sans analyses physico-chimiques). La
confusion est encore renforcée par le fait qu’il existe très certainement des
intergrades (NÉOLUVISOLS développés dans une argile à meulière).
Les observations de terrain (prospection Moeys et Michelin ; Delmas, 2007) laissent
aussi penser que certains NÉOLUVISOLS situés en bordure de talwegs sont tronqués
(couleur de surface plus rouge), d’où une teneur en argile de surface plus élevée et un
contraste de teneurs en argile absent dans le profil (puisqu’il est tronqué). Combiné à
la difficulté d’évaluer correctement la texture sur le terrain, ce constat laisse supposer
que des erreurs de diagnostic sont possibles pour les NÉOLUVISOLS TRONQUÉS, qui
peuvent être diagnostiqués en BRUNISOLS.
Il n’est pas certains que ces types de sols (PSEUDO-LUVISOLS, NÉOLUVISOLS
(tronqués), LUVISOLS, BRUNISOLS) se différencient beaucoup du point de vue de leur
fonctionnement (sauf un effet possible des éléments grossiers et/ou de la structure
sur le régime hydrique), mais leur répartition obéit à des logiques différentes
(géologiques et/ou pédologiques). Ces erreurs possibles de diagnostic diminuent la
fiabilité de leur cartographie.
35
Le matériau ‘argile à meulière’ n’était pas explicitement renseigné sur les fiches. La combinaison des
critères ‘teneur en argile élevée’ et ‘présence en quantité non négligeable de meulières’ est cependant
un bon critère pour identifier la formation.
160
J. Moeys Partie IV
161
J. Moeys Partie IV
La distribution des teneurs en CaCO3 est aussi bimodale (dans le sens absence
/ présence). Cette bimodalité montre probablement un effet seuil de la profondeur
du sol : si les sols ont plus de 30 ou 40 cm d’épaisseur, les éléments grossiers ne
sont pas remontés par le labour, et ceux qui sont présent finissent par être dissous
et lessivés. Cette hypothèse doit cependant être modulée par les différents apports
anthropiques possibles : amendements calcaires et effets des anciens chemins ou
des bords de parcelle empierrés.
Les amendements calcaires sont aussi très certainement à l’origine de la relative
homogénéité du pH.
La profondeur médiane des sols, 65 cm, contrastent avec ceux de Delmas,
2007 qui trouvait que « la plupart des sols ont une profondeur supérieure à 60 cm »
dans le même secteur. Cela reflète le biais induit pas l’échantillonnage stratifié, qui
surreprésente les sols peu épais. La présence d’avens karstiques (peu visible en
surface et remplis de matériaux exogènes) et autres accidents géologiques,
explique sans doute la non-normalité de la distribution de la profondeur des sols.
Comme pour la teneur en argile, la teneur en carbone organique est
relativement peu contrastée au regard des données de la littérature, et ce
malgré la présence de modalités de travail du sol contrastées. Seuls Walker et
al. 2001 obtiennent un CV plus bas, de 9 % (sur 1,5 ha). Les autres articles étudiés
indiquent des CV bien supérieurs à 20 %. Le coefficient de variation du C/N semble
indiquer que leur nature est peu variable. Les raisons de la faible variabilité de la
teneur en carbone organique et du C/N reflètent certainement la vocation
essentiellement céréalière du secteur, où les exploitations de polyculture-élevage et
les prairies ont disparu depuis longtemps.
Exception faite de la teneur en éléments grossiers et en carbonates, le seul
paramètre qui apparaisse vraiment variable est la masse volumique apparente.
Son CV est en accord avec les données de la littérature. Il n’en est pas moins
élevé. Si l’on se réfère à l’équation 4, p. 32, les principales sources de variabilité
sont la granulométrie, la teneur en carbone organique et le travail du sol. Les deux
premières propriétés sont classées comme ‘peu variables’ dans le secteur. Les
effets du travail du sol semblent donc la principale cause de variabilité de la masse
volumique apparente (voir plus loin le tableau 67, p. 212). On peut se demander si
la variabilité de la masse volumique apparente reflète une variabilité de la
structure de l’horizon de surface, mais aucune mesure n’est disponible sur ce
point.
162
J. Moeys Partie IV
pF 2 et 4,2. Ces deux propriétés sont importantes pour évaluer les potentialités
agronomiques des sols (ici de l’horizon de surface), au travers de la réserve utile de
l'horizon notamment.
figure 52 – Graphiques box & whisker des teneurs en eau [cm3.cm-3] mesurées à différents
potentiels matriciels caractéristiques (saturation, pF 2 et pF 4,2) & de la réserve utile
estimée.
Avec R.U. la réserve utile de l'horizon ; 'theta pF4,2', 'theta pF2' et 'theta sat.' les teneurs en eau
volumiques à pF 4,2, à pF 2 et à saturation (h=0).
163
J. Moeys Partie IV
164
J. Moeys Partie IV
165
J. Moeys Partie IV
Résultats :
Le tableau 33 synthétise le résultat des calculs effectués à l’échelle du secteur
agricole :
Secteur agricole [i ; i+1] [i-1 ; i+1]
min méd. max min méd. max
-1/2 -2 +0 -2
S [mm.s ] 6,2.10 4,0.10 -1
1,1.10 8,1.10 3,6.10 -1
1,1.10+0
K [mm.s-1] 1,4.10-3 9,1.10-3 7,8.10-2 6,0.10-6 8,4.10-3 7,0.10-2
%Succès (sans TSTAB) – 58 % – – 58 % –
%Succès (avec TSTAB) – 42 % – – 49 % –
RRSEP%RT – 28 % – – 25 % –
tableau 33 – Paramètres statistiques de S et K calculés avec la méthode de White et Sully
(1987), pour le secteur agricole.
Les calculs ont été réalisés sur [i ; i+1] ou [i-1 ; i+1] ; S est la sorptivité capillaire ; K est la
conductivité hydraulique non-saturée ; %Succès (sans TSTAB) est le pourcentage d’infiltrations
pour lesquelles S et K sont positifs (>0) ; %Succès (avec TSTAB) est le pourcentage d’infiltrations
pour lesquelles S et K sont positifs (>0) et l’intervalle de temps du régime transitoire est inférieur
au temps de stabilisation estimé avec S et K ; RRSEP%RT est la racine de l’erreur relative
quadratique (RRSEP, exprimée en %) du régime transitoire. La RRSEP% du régime permanent
n’est pas calculée car il n’existe pas d’équations de White et Sully pour le régime permanent.
Le tableau 34 synthétise le résultat des calculs effectués à l’échelle de la parcelle
d’étude :
Parcelle d’étude [i ; i+1] [i-1 ; i+1]
min méd. max min méd. max
S [mm.s-1/2] 5,2.10-2 3,5.10-1 1,0.10+0 4,2.10-2 3,5.10-1 1,1.10+0
K [mm.s-1] 2,0.10-4 1,1.10-2 8,5.10-2 7,8.10-4 9,2.10-3 6,0.10-2
%Succès (sans TSTAB) – 70 % – – 74 % –
%Succès (avec TSTAB) – 66 % – – 74 % –
RRSEP%RT – 23 % – – 25 % –
tableau 34 – Paramètres statistiques de S et K calculés avec la méthode de White et Sully
(1987), pour la parcelle (Millot, 2004).
Il faut signaler que, quel que soit l’intervalle de temps choisi pour le régime
transitoire, la méthode de White et Sully (modifiée) permet toujours d’obtenir des
valeurs de S supérieures à 0, du fait de la méthode de détermination de S. Ce n’est pas
le cas des autres approches testées.
Le calcul du temps d’effet du sable sur l’intervalle [i-1 ; i+1] semble donner des
résultats un peu meilleurs que sur l’intervalle [i ; i+1] (cohérence du temps de calcul
avec TSTAB notamment), mais la différence est peu marquée.
La gamme de variation de S et de K est très proche entre la parcelle et le secteur
agricole, avec des valeurs médianes très proches. Les valeurs de sorptivité minimales
sont basses, mais pas excessives.
A l’échelle du secteur agricole, moins de 50 % des calculs d’infiltrations aboutissent
à des temps de stabilisation ou gravitaires cohérents avec l’intervalle de temps des
calculs du régime transitoire. A l’échelle du secteur agricole, cette valeur passe à 75 %,
166
J. Moeys Partie IV
ce qui est beaucoup mieux mais encore insatisfaisant. Cela signifie qu’au moins 25 %
des infiltrations ont des valeurs de S et ou de K ‘incohérentes’, ou en tout cas moins
sûres.
Il faut rappeler que ces résultats prennent en compte, pour chaque infiltration, le
meilleur résultat parmi tous les intervalles de temps de calcul du régime
transitoire possible. Il n’y a donc pas d’imprécision liée au mauvais choix d’un
opérateur ici.
Exemples graphiques :
167
J. Moeys Partie IV
168
J. Moeys Partie IV
169
J. Moeys Partie IV
différence nette.
On constate que par rapport à la méthode de White et Sully (1987), la gamme de
conductivités hydrauliques estimées est plus restreinte. Par contre les valeurs
minimales de sorptivité sont beaucoup plus basses, ce qui semble confirmer le fait que
la méthode de White et Sully surestime cette dernière.
Le pourcentage de calculs permettant d’obtenir un calcul de S et de K basé sur un
intervalle de temps cohérent (inférieur) avec le temps de stabilisation estimé est plus
faible qu’avec la méthode de White et Sully (1987) (44 % contre 49 % sur le secteur
agricole ; 58 % contre 74 % sur la parcelle d’étude). Si l’on ne prend pas en compte la
cohérence du temps de stabilisation, le rapport s’inverse (93 % contre 58 % sur le
secteur agricole ; 98 % contre 74 % sur la parcelle d’étude).
Tandis que la RRSEP% du régime permanent est plus élevée que celle du régime
transitoire pour les infiltrations à l’échelle du secteur agricole, elles sont comparables
pour les mesures sur la parcelle d’étude (alors même que le calcul ne tient compte que
du régime transitoire).
Il apparaît aussi que, en moyenne, pour une infiltration donnée, seuls 35 % des
intervalles de temps testés pour le régime transitoire permettent d’obtenir une valeur
de S positive pour les infiltrations mesurées sur le secteur agricole. Ce chiffre passe à
65 % pour la parcelle d’étude. Cela montre que les conditions d’applications de la
méthode d'Haverkamp et al. (1994) sont limites pour le secteur agricole, et un peu
meilleures pour la parcelle d’étude, et/ou que les mesures sont probablement de
meilleure qualité sur la parcelle (effet possible des erreurs de mesure).
Exemples graphiques
170
J. Moeys Partie IV
figure 61 – Exemple de résultat (1) de l’ajustement des équations de Haverkamp et al. (1994)
du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t), après détermination graphique de
S et K sur le régime transitoire.
Avec un temps de régime transitoire de 435 s et un temps de stabilisation estimé à 1156 s, la
contrainte de temps est respectée sur cet exemple. La courbe d'ajustement sur le régime permanent
est tracée sur ce graphique, mais l'équation spécifique décrivant l'infiltration sur cet intervalle n'est
pas utilisée pour déterminer S et K dans le cas de la méthode par ajustement linéaire.
La figure 61 présente un ajustement des fonctions de Haverkamp et al. (1994)
relativement correct, ce qui n’est pas toujours le cas. Le léger écart entre les mesures
réelles et l’infiltration estimée sur le régime permanent est parfaitement acceptable, car
la détermination de S et K est réalisée sur le régime transitoire.
171
J. Moeys Partie IV
172
J. Moeys Partie IV
173
J. Moeys Partie IV
s’expliquer par le fait que l’ajustement direct n’utilise pas (dans ce cas) de contraintes
de valeurs pour S et K : l’algorithme d’optimisation peut tester, et éventuellement
choisir, des valeurs de S ou de K négatives ou nulles.
Exemples graphiques
figure 63 – Exemple de résultat (1) de l’ajustement des équations de Haverkamp et al. (1994)
du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t), après détermination directe de S
et K sur les régimes transitoire et permanent.
La valeur de S estimée est de 0,11 mm.s-1/2, celle de K de 0,004 mm.s-1. Avec un temps de régime
transitoire de 1095 s et un temps de stabilisation estimé à 1102 s, la contrainte de temps est
respectée sur cet exemple.
figure 64 – Exemple de résultat (2) de l’ajustement des équations de Haverkamp et al. (1994)
du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t), après détermination directe de S
et K sur les régimes transitoire et permanent.
La valeur de S estimée est de 0,28 mm.s-1/2, celle de K de 0,0086 mm.s-1. Avec un temps de régime
transitoire de 900 s et un temps de stabilisation estimé à 902 s, la contrainte de temps est respectée
sur cet exemple.
Sur l'exemple de la figure 63, l’ajustement sur les régimes transitoire et permanent
est correct. De même, la jointure entre le régime transitoire et le régime permanent est
assez bonne. Pour d’autres infiltrations, il arrive fréquemment qu’un biais plus net
apparaisse sur le régime transitoire et/ou le régime permanent, et/ou que la jointure
174
J. Moeys Partie IV
entre les deux régimes soit beaucoup moins bonne. Ces biais et décalages respectent
malgré tout généralement la ‘tendance’ de la courbe. Ils sont dus au fait que
l’optimisation tient compte de l’‘écart au temps de stabilisation’. Cela peut amener
l’algorithme à choisir des solutions pour K et S moins fidèles aux mesures d’infiltration,
mais plus cohérentes l’une par rapport à l’autre, et relativement au temps de
stabilisation.
Sur l’exemple de la figure 64, comme sur le précédent, on constate que l’ajustement
est correct dans sa tendance, mais qu'il existe toujours un décalage constant sur le
régime transitoire, lié à la sorptivité du sable de contact.
175
J. Moeys Partie IV
une moyenne globale. Si, dans le premier cas, le nombre de points utilisés pour le
calcul du régime transitoire et du régime permanent n’affecte pas la pondération, dans
le second (sans pondération explicite) l’un ou l’autre des régimes est privilégié en
fonction de l’effectif de points qu’il comprend. Cette approche paraît a priori équilibrée.
Le tableau 40 synthétise le résultat des calculs effectués à l’échelle du secteur
agricole et de la parcelle d’étude, sur l’intervalle [i-1,i+1] :
[i-1,i+1] secteur agricole parcelle d’étude
min méd. max min méd. max
S [mm.s-1/2] 9,2.10-3 2,1.10-1 7,5.10-1 5,3.10-2 2,9.10-1 6,0.10-1
K [mm.s-1] 3,2.10-5 3,1.10-3 3,8.10-2 1,0.10-3 5,2.10-3 2,6.10-2
%Succès (sans TSTAB) – 94 % – – 70 % –
%Succès (avec TSTAB) – 49 % – – 26 % –
RRSEP%RT – 30 % – – 22 % –
RRSEP%RP – 16 % – – 7% –
tableau 40 – Paramètres statistiques de S et K calculés avec la méthode de Haverkamp et
al. (1994), avec un ajustement direct et une fonction d’erreur basée sur les régimes
transitoire et permanent (secteur agricole ; fonction d’erreur %RRSEPglobale,alt).
On voit que l’utilisation de la fonction d’erreur ‘alternative’ (qui équilibre l’importance
de l’ajustement sur le régime transitoire et le régime permanent en fonction du nombre
de mesures concernées) ne permet pas d’obtenir une proportion satisfaisante de
mesures avec une durée du régime transitoire cohérente avec le temps de
stabilisation.
Il est difficile de comparer la qualité des ajustements de cette méthode avec les
autres approches car la fonction d’erreur utilisée pour optimiser l’ajustement est
différente. Néanmoins, on constate que les RRSEP% obtenues sur les régimes
transitoires et permanents restent acceptables.
Il est difficile de comprendre pourquoi cette méthode d’ajustement (calcul d’erreur)
donne des résultats moins pertinents que la précédente, mais le fait est que les
intervalles de temps de calculs du régime transitoire ne sont pas en accord avec les
temps caractéristiques dérivés des valeurs de S et de K.
176
J. Moeys Partie IV
donc non réalistes de S et de K (cas de figure qui concerne quand même au minimum
1 à 15% des calculs précédents avec les méthodes par ajustements directs).
Les contraintes choisies sont : S ≥ 1.10-2 mm.s-1/2 et K ≥ 1.10-10 mm.s-1. Les valeurs
initiales de S et K restent par contre inchangées par rapport aux ajustements directs
précédents.
Le tableau 41 synthétise le résultat des calculs effectués à l’échelle du secteur
agricole et de la parcelle d’étude, sur l’intervalle [i-1,i+1] :
[i-1,i+1] secteur agricole parcelle d’étude
min méd. max min méd. max
S [mm.s-1/2] 1,0.10-02 1,0.10-02 5,4.10-01 1,0.10-02 1,0.10-02 4,3.10-01
K [mm.s-1] 1,0.10-10 1,0.10-10 5,2.10-02 1,0.10-10 1,0.10-10 3,5.10-02
%Succès (sans TSTAB) – 100 % – – 100% –
%Succès (avec TSTAB) – 99 % – – 98% –
RRSEP%RT – 95 % – – 97% –
+6 +6
RRSEP%RP – 1.10 % – – 2.10 % –
tableau 41 – Paramètres statistiques de S et K calculés avec la méthode de Haverkamp et
al. (1994), avec un ajustement direct et une fonction d’erreur basée sur les régimes
transitoire et permanent (fonction d’erreur %RRSEPglobale).
Ce cas de figure reflète à lui seul les difficultés de l’ajustement direct :
– Le temps de calcul du régime transitoire est quasiment tout le temps respecté,
mais...
– On constate que la conductivité hydraulique estimée est extrêmement faible. Sa
valeur médiane de 1.10-10 correspond en fait à la valeur minimale imposée pour K.
– On constate que la sorptivité estimée est, elle aussi, faible. Sa valeur médiane de
1.10-2 correspond en fait à la valeur minimale imposée pour S.
– Malgré ces valeurs de S et de K aberrantes, l’intervalle de temps sur lequel est
réalisé le calcul du régime transitoire est presque toujours compatible avec le temps
de stabilisation ou de gravité estimé. Cela montre les limites de ces critères
d’évaluation.
Il est très probable qu’un meilleur paramétrage de la fonction d’optimisation (seuils
de convergences...), ainsi qu’un ajustement uniquement sur le régime transitoire,
permettrait d’obtenir des valeurs plus réalistes pour S. D’autres essais, non détaillés ici,
ont montré qu’une optimisation contrainte aboutit quasiment systématiquement à des
valeurs de K très faibles. Il semblerait que l’algorithme tende à fixer K au minimum et
n’ajuste effectivement que la valeur de S.
Cela montre qu’un ajustement direct avec une optimisation contrainte tend à faire
échouer la procédure d’optimisation (avec les réglages utilisés de la fonction
d'optimisation – peut-être d'autres réglages donneraient un meilleur résultat ?), ou que
l'ajustement direct sans contrainte sur l'écart au temps de stabilisation n'est pas
sensible aux valeurs de K.
177
J. Moeys Partie IV
178
J. Moeys Partie IV
d’erreur RRSEP%RT ne semble pas présenter36 un optimum unique, mais plutôt une
plage de valeurs de S et de K permettant un ajustement minimisant la RRSEP%RT. Ce
constat confirme visuellement les problèmes constatés pour les ajustements directs
des fonctions de Haverkamp et al. (1994) basées uniquement sur le régime transitoire.
36
La topographie locale des isovaleurs de la RRSEP% dépend aussi de la résolution de la grille [S,K] sur
laquelle sont effectués les calculs
179
J. Moeys Partie IV
La figure 67, présente les isovaleurs de la RRSEP% globale, c’est à dire d’une
agglomération des erreurs sur le régime transitoire, le régime permanent et l’écart au
temps de stabilisation. À l’inverse de ce qui est constaté sur la figure 65, on constate
l’existence d’un optimum local pour S et K permettant de minimiser la RRSEP% globale.
Il s’agit d’une confirmation visuelle de la plus grande robustesse de la méthode.
Les deux exemples présentés ci-dessus ne représentent pas de valeurs négatives
de S et de K. Or les méthodes d’ajustement direct utilisées sont, sauf exception, non
contraintes à des valeurs positives de S et de K. Il faudrait en toute rigueur examiner la
surface de réponse de la RRSEP% avec des valeurs négatives de S et K, mais la
visualisation / représentation graphique logarithmique doit alors être découpée en
plusieurs domaines.
figure 68 – Graphique ‘box & whisker’ des sorptivités, en fonction des différentes méthodes
de calcul (intervalle [i-1,i+1]).
L’axe des abscisses est en échelle logarithmique, ce qui atténue un peu la distorsion des valeurs de
S vers les valeurs faibles.
Les différences entre méthodes de calcul semblent plus importantes qu’entre les
valeurs obtenues sur tout le secteur agricole et la parcelle. Plus que les différences
entre les valeurs médianes observées d’une méthode à l’autre, c’est l’étalement des
valeurs (quantiles) qui change le plus.
180
J. Moeys Partie IV
figure 69 – Graphique ‘box & whisker’ des conductivités hydrauliques, en fonction des
différentes méthodes de calcul (intervalle [i-1,i+1]).
L’axe des abscisses est en échelle logarithmique, ce qui atténue un peu la distorsion des valeurs de
K vers les valeurs faibles.
La figure 70 présente les gammes de valeurs des écarts au temps de stabilisation,
quand le calcul a permis d’aboutir à des valeurs de S et K positives. Avec la méthode
de White et Sully (1987) cet écart est quasiment tout le temps positif et inférieur à 3
minutes (voir inférieur à 30 s pour la parcelle), ce qui montre que la méthode permet
des valeurs de S, K et TSTAB cohérentes avec l’intervalle de temps utilisé pour le calcul
du régime transitoire. Avec la méthode d’ajustement linéaire de la fonction de
Haverkamp et al. (1994), une proportion importante des temps de calcul du régime
transitoire (> 50 % sur le secteur agricole) est supérieure au temps de stabilisation
estimé (écart négatif). Avec la méthode d’ajustement direct non-linéaire des équations
de Haverkamp et al. (1994), seuls 25 % des valeurs sont inférieures au temps de
stabilisation, et quasiment toutes les mesures ont un écart au temps de stabilisation
inférieur à –30 s.
La méthode qui a été retenue pour les traitements statistiques est l’ajustement
direct avec une optimisation simultanée sur le régime transitoire, le régime
permanent et l’écart au temps de stabilisation.
Ce choix ne correspond pas réellement à un ‘optimum’, mais c’est le seul qui
permette à la fois de tenir compte des 3 composantes de l’infiltration (contrairement à
la méthode White et Sully, qui néglige la capillarité latérale) et d’obtenir des valeurs de
S et de K qui paraissent réalistes (> 0) et cohérentes (respect des temps
caractéristiques).
181
J. Moeys Partie IV
figure 70 – Graphique ‘box & whisker’ des écarts au temps de stabilisation, en fonction des
différentes méthodes de calcul (intervalle [i-1,i+1]).
L’axe des abscisses est en échelle logarithmique double (intervalle 30 s), centrée sur le zéro ;
TSTAB est le temps de stabilisation ; ∆tRT est la durée écoulée entre le début de l’infiltration et la
dernière considérée comme appartenant au régime transitoire. Ce graphique ne représente les
écarts au temps de stabilisation que pour les calculs ayant permis d’aboutir à une valeur de S et de
K positives, et ne tient pas compte du temps gravitaire, ce qui explique la différence entre les
statistiques présentées ci-dessus et les ‘%succès (avec TSTAB)’ des tableaux présentés plus haut.
NB : les écarts peuvent être positifs ou négatifs, suivant que le temps de stabilisation déterminé
avec S et K est supérieur ou inférieur au temps de transition 'régime transitoire - régime permanent'
choisi pour les calculs.
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Ces écarts permettent de relativiser les écarts de valeurs observés entre les
différentes méthodes de traitement des mesures d'infiltration. L'écart entre la
méthode White et Sully (1987) et la méthode Haverkamp et al. (1994 ; par
ajustement linéaire ou direct) ne sont 'que' d'un facteur 2 environ (K-1cm plus faible
avec la méthode White et Sully, 1987).
Les valeurs de conductivité hydraulique obtenues sur la parcelle d'étude, avec
les données collectées par Millot 2004, sont étonnamment proches de celles
obtenues à l'échelle du secteur agricole, et ce, quelle que soit la méthode
employée. Les implications de ce constat seront discutées plus loin.
Le principal problème soulevé par les différences de valeurs obtenues entre les
méthodes n'est donc pas tant les écarts de conductivité moyenne, mais plutôt leur
validité par rapport aux temps caractéristiques. Dans notre cas, la méthode
Haverkamp et al. par ajustement linéaire ne permet pas toujours d'obtenir des
valeurs de S et de K compatibles avec les temps caractéristiques (incompatibilité
dans 42 à 56% des cas). La méthode par ajustement direct 'à triple contrainte'
fonctionne mieux, mais elle n'est pas plus précise et elle est biaisée par l'effet
du sable. Concernant la difficulté à estimer correctement S et K, Il est difficile de
mettre en cause la méthode elle-même car de toute évidence les conditions de
mesure ne sont pas idéales. Les teneurs en eau initiales au moment de la
mesure sont trop élevées37 et l'hypothèse d'une conductivité hydraulique initiale
négligeable devant la conductivité finale n'est probablement pas respectée. On doit
ensuite signaler plusieurs facteurs aggravants : (i) la mesure n'est pas assez
précise (bulles, positions de lecture), (ii) il est difficile d'obtenir un nombre correct de
points de mesure durant les 60 premières secondes de l'infiltration, pourtant
cruciales pour la détermination de la sorptivité et (iii) le plateau de Ouarville est
exposé au vent, ce qui n'est pas favorable à de bonnes mesures (et ce malgré
l'installation de larges paravents, doublés si nécessaires de parasols couchés !).
Une des solutions envisageables est l'utilisation d'infiltromètres à mesures
automatisées.
Il faut aussi revenir sur les effets possibles de la couche de sable intercalaire
sur la mesure d'infiltration. Avec la méthode de Haverkamp et al. par régression
linéaire en dI/d√t = f(√t), le calcul de la sorptivité S, n'est théoriquement pas
influencé par la couche de sable. Cependant, lorsque l'on teste la qualité de
l'ajustement des paramètres S et K sur la courbe d'infiltration I = f(t), un décalage
se produit sur I puisque la couche de sable joue effectivement sur l'infiltration.
Lorsqu'on réalise un ajustement direct, non-linéaire, de S et de K sur la courbe
I = f(t), la partie initiale de la courbe très influencée par le sable a certes été écartée,
mais le reste de la courbe est toujours influencé par le sable de contact.
L'ajustement direct intègre donc l'effet de cette couche de sable, ce qui biaise sans
37
Les infiltrations réalisées à l'échelle du secteur agricole ont été réalisées en mars-avril-mai 2006, celles
réalisées par Millot 2004 ont été réalisées en avril-mai 2004. Au début de cette saison la réserve utile
du sol a été reconstituée (pendant l’hiver), mais les prélèvements d'eau par les céréales (ET)
augmentent régulièrement avec la remontée des températures (au printemps).
186
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187
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une réduction de la continuité des pores (iii) lors du changement, la mince couche
de sable est très perturbée (constat visuel). Un lissage délicat au couteau permet de
la remettre horizontale, mais la perturbation ne peut-elle pas engendrer une
hétérogénéité des flux sous l'infiltromètre, aboutissant à une baisse de flux ?
L'hypothèse (ii) remet clairement en cause la fiabilité des mesures de
fraction d'eau immobile, car une réduction de la continuité des pores, et le
fermeture de certains crée de facto une porosité captive, immobile, qui n'était
pourtant pas immobile avant le changement d'infiltromètre. Si ce cas de figure
est confirmé, les fractions d'eau immobile peuvent être surestimées.
Enfin, la variabilité spatiale élevée à extrêmement élevée des mesures de
fraction d'eau immobile et de conductivité pose la question de leurs
déterminismes, car les propriétés pédologiques (physico-chimiques) sont peu
variables dans le secteur. Les tests statistiques doivent donner un point de vue
supplémentaire sur ce constat.
3 Comportement de
l'isoproturon dans les sols
■ 3.1 Adsorption de l'isoproturon dans les sols
Les paramètres de l’adsorption des molécules phytosanitaires sur la fraction
organo-minérale du sol est une des propriétés déterminantes de son comportement, et
donc de son éventuel transfert, dans les sols.
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– Horizons C ou S carbonatés
F1-2, BT/C F2-2, IIIC1 F3-2, IIIC1 – F4 – – F5 –
S C IIIC IVC
KD [L.kg-1] 0,22 0,20 0,20 0,23 0,16 0,19 0,16
KOC [L.kg-1] 42 66 57 23 23 28 39
CORG [g.kg-1] 5 3 4 10 7 7 4
Argile [g.kg-1] 359 427 498 356 362 294 321
CaCO3 [g.kg-1] 512 670 564 585 566 293 337
tableau 51 – KD des horizons C ou S carbonatés.
Pour les mêmes horizons, les KD mesurés par Alletto (2004) sur le t0 des mesures de dégradation
des fosses 1-1, 1-2 et 1-3 sont respectivement, de 0,5, 0,3 et 0,3 L.kg-1.
Le KD des horizons carbonatés est très bas, avec une moyenne de 0,19 L.kg-1. Il faut
rapprocher cette valeur de l’erreur de mesure du KD (erreurs et adsorption sur le verre
et le bouchon des flacons), estimée expérimentalement en moyenne à 0,1 L.kg-1.
Malgré leur teneur relativement élevée en argile, et parfois en matière organique, les
valeurs de KD sont très basses comparées aux horizons de surface. La partie
carbonatée du sol (argile, sables, graviers) semble donc relativement inerte pour
l’Isoproturon.
– Résultats
Le tableau 52 montre que le calcul de la concentration initiale en isoproturon par la
régression impose une translation des valeurs de DT50 par rapport à la régression avec
une concentration initiale imposée. Les valeurs de cette dernière sont en moyenne
inférieures de 4 jours aux DT50 estimées avec un C0 ‘ajusté’. Quand elle est calculée, la
concentration initiale dans le bocal a une valeur moyenne de 65 % de la molécule
apportée théoriquement, avec 80 % de ces valeurs entre 48 et 79 %. Ces valeurs sont
faibles et paraissent peu réalistes. Inversement, l’ajustement linéaire des droites
ln(C) = f(t) est meilleur dans le cas où la concentration initiale est calculée, ce qui est
191
J. Moeys Partie IV
– Exemples graphiques
L’examen des graphiques C = f(t) et ln(C) = f(t) permet de mieux comprendre les
raisons pour lesquelles la qualité des ajustements est médiocre.
Les illustrations portent sur deux cas de figure assez contrastés (dans leurs
résultats d'ajustement), le lit de semence du site 20 003 et celui du site 20 006. Le
second présente une vitesse de dégradation initiale apparemment plus élevée, et
une concentration finale plus faible.
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– Exemples graphiques
La figure 79 illustre bien les différences entre la méthode d’ajustement linéaire
graphique et la méthode d’ajustement direct. Sur le graphique A, on constate que,
contrairement à la méthode d’ajustement linéaire, l’ajustement direct avec une
minimisation sur la RRSEP% privilégie la première partie de la courbe, au détriment du
dernier temps d’extraction qui est mal modélisé.
Inversement, l’ajustement direct avec une optimisation sur la MAEP% (graphique B)
privilégie un ajustement sur la fin de la courbe. les deux calculs d’erreurs semblent
avoir un optimum différent. La méthode MAEP% est plus sensible aux erreurs de
prédiction sur les mesures présentant une faible concentration en isoproturon que la
RRSEP% (pour être exact, la MAEP% calcule une erreur relative à chaque mesure, elle
est donc moins dépendante des différences de concentration d’une extraction à
l’autre).
La figure 80 présente cas un peu différent de celui de la figure 79. Comme dans le
cas précédent, une minimisation de l’erreur sur la RRSEP% aboutit à privilégier les
195
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figure 82 – Graphique ‘box & whisker’ des demi-vies (DT50) de dégradation de l’isoproturon
estimées selon les 7 méthodes de détermination testées.
Avec ‘Lin.’ pour les ajustements par régression linéaire sur ln(CIPU) = f(t), avec une valeur de C0
(Concentration en isoproturon au temps 0) fixée à 100 % de CIPU initiale ou ajustée ; ‘Dir.’ pour les
ajustements directs sur CIPU = f(t), optimisés alternativement sur la RRSEP% ou la MAEP% ;
‘cont.’ pour les ajustements avec une contrainte minimale et maximale pour les valeurs de DT50 ;
‘non cont.’ pour les ajustements non contraints. La méthode MAEP% est de fait contrainte. La
vibrisse manquante du cas ‘MAEP direct’ (optimum général) indique qu’il n’y a pas de valeurs
entre le quantile 75 % (Q75%) et les valeurs extrêmes au-delà de Q75% + 1,5 . (Q75%-Q25%).
199
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deux, même si l’idéal serait d’ajuster une cinétique double et de pouvoir en intégrer
les paramètres dans un modèle qui la prend en compte.
La DT50 moyenne obtenue est, à 1 ou 2 jours près, en concordance avec les
données moyennes de la littérature (13,7 jours avec les données présentées
dans la partie bibliographie). Le CV de la DT50 est par contre plus important que ce
qui est généralement observé, ce qui confirme le risque de sous-estimer la
variabilité en utilisant les données de la littérature. La DT50 moyenne donnée par la
base de données Footprint PPDB (2007) est aussi de 12 jours. Charnay et al.
(2005) ont mesuré, dans un contexte un peu différent, une DT50 de 13 jours. Les
données d’Alletto et al. (2006a), obtenues sur les sols de surface de 3 fosses de la
parcelle d’étude, sont étonnamment proches, avec une DT50 de 11 jours.
La DT50 de minéralisation du pesticide est moins variable, et suit correctement
une cinétique de 1er ordre. Il faut près d’une demi-année, ou une saison culturale,
pour que l’essentiel de l’isoproturon (> 50%) et de ses métabolites soit minéralisé, et
donc dissipé (à 22°C et 90 % de la capacité au champ).
4 Étude statistique de la
variabilité spatiale et des
déterminismes agro-
pédologiques
La seule estimation de ses propriétés n'apporte que peu d'informations sur un milieu
complexe comme le sol. La mise en évidence des liens qui existent entre les
différentes propriétés présente un grand intérêt. Même si un lien statistique n'est pas
un lien causal, mais plutôt une variation concomitante suffisamment nette pour ne pas
être attribuée au hasard, il n'en est pas moins un jalon dans la compréhension du
fonctionnement du système. Ces variations concomitantes peuvent ensuite être
'modélisées' par des régressions ou d'autres outils, dans le but de quantifier la relation
entre deux propriétés, et parfois dans le but d'utiliser une propriété (plus) simple à
mesurer pour en estimer une autre, plus difficile à mesurer, là où des mesures sont
disponibles pour la première mais pas pour la seconde (voir ci-dessous).
La logique d'organisation de ce chapitre est d'examiner dans un premier temps
les liens des propriétés deux à deux. Soit par le calcul de coefficients de corrélation
si les deux propriétés sont quantitatives, soit par des analyses de la variance quand
une des propriétés est quantitative et l'autre qualitative. Dans un second temps, les
liens des propriétés quantitatives 'de plusieurs à plusieurs' (approche multivariée)
et avec les échantillons analysés sont examinés au moyen d'une décomposition de la
variabilité par une analyse en composantes principales. Le positionnement des
propriétés quantitatives est examiné visuellement en parallèle des propriétés
qualitatives (mais elles n'interviennent pas dans la décomposition de la variabilité par
ACP). Enfin, stade ultime de l'analyse, une modélisation des variations des
principales propriétés 'à expliquer' (KS, KD, KOC, DT50, etc.) par classes (de
propriétés quantitatives explicatives), puis par régressions multivariées, est calibrée et
évaluée de manière semi-indépendante.
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J. Moeys Partie IV
toutefois limitée par le fait que de nombreuses propriétés n’ont été mesurées que dans
l’horizon de surface. Les corrélations informent sur les variations concomitantes des
propriétés deux à deux, mais pas sur les relations de cause à effet ou sur les
associations multiples de propriétés.
Ce constat est tout à fait cohérent avec ce qui avait déjà été constaté à l’échelle
parcellaire dans le secteur (Moeys et al., 2006) : le substrat est invariablement un
matériau calcaire, sur lequel s’est déposée une épaisseur variable de limon éolien.
Moins le sol est épais, plus il contient d’inclusions du matériau calcaire sous-jacent :
éléments grossiers calcaires ou de meulières, carbonates, et fractions argileuses
issues de la décarbonatation du calcaire. La présence possible d’argile à meulière
entre le calcaire et le limon semble confirmer le lien entre profondeur du sol et
teneur en argile de surface. Le limon, sans doute peu carbonaté à l’origine, ne
contient plus de fractions carbonatées, ce qui renforce la corrélation entre les
fractions carbonatées fines ou grossières et la profondeur du substrat calcaire.
38
Cette hypothèse est une explication plausible à la présence fréquente, mais en petite quantité, de ces
graviers dans l'horizon de surface (de limon), alors qu'on ne le retrouve pas forcément en profondeur.
La présence de ces graviers dans le calcaire (et dans les argiles à meulières) est plus fréquente, et en
quantités beaucoup plus importantes, d'où l'hypothèse d'un apport par le calcaire utilisé pour le
chaulage.
204
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205
J. Moeys Partie IV
et 4,2 (rS = 0,48), quand l’une est basse, l’autre tend à l’être aussi. De même, la réserve
utile est négativement corrélée aux paramètres hA et b, ce qui est aussi assez logique
(hA et b dérivent des mêmes paramètres que la réserve utile).
■ Propriétés hydrodynamiques
Les propriétés hydrodynamiques mesurées sont la conductivité hydraulique à
saturation (KS.) et au potentiel de –1 cm (K–1 cm). Ces deux propriétés sont (logiquement)
très corrélées (rS = 0,93), puisque KS. = K–1 cm quand hA < - 1 cm.
Limon (ND) E.G. tot. CaCO3 CORG. Profond.
K–1cm (–0,31) (0,31) 0,40 0,32 (-0,37)
KS. –0,38 0,35 0,47 0,34 –0,32
tableau 63 – Corrélations des propriétés de conductivité hydraulique avec les propriétés
agro-pédologiques.
Le tableau 63 des corrélations fait apparaître que les conductivités élevées sont
associées à des teneurs en limon plus faibles, à des teneurs en éléments grossiers, en
CaCO3 ou en matière organique plus importantes. Mais ces corrélations restent faibles,
206
J. Moeys Partie IV
La première hypothèse soulevée par ce résultat est que les sols à forte
conductivité hydraulique au voisinage de la saturation ont une teneur en eau
immobile faible (probablement du fait d'une 'connectivité' plus importante de la
porosité). La deuxième est que la fraction d'eau immobile mesure en fait un effet
cinétique du flux d'eau sur la répartition du traceur dans la phase liquide du sol
(préalablement remplie sous l'effet de la sorptivité et de la gravité), reflétant une
partie de la phase liquide 'beaucoup moins mobile' plutôt qu'une partie réellement
immobile. Le lien négatif entre la sorptivité et la fraction d'eau immobile est un peu
en contradiction avec le fait que, sous le disque, les effets gravitaires dominent
théoriquement. En effet, la sorptivité n’est plus sensée agir au moment où le traceur
est appliqué. On peut émettre l’hypothèse que la sorptivité est plus fortement
influencée par (et donc positivement corrélée à) une fraction de la porosité du sol
qui se sature par capillarité mais contribue peu (et donc négativement corrélée) au
mouvement d’eau au voisinage de la saturation.
207
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Un KOC plus élevé peut être dû à une matière organique plus réactive vis-à-vis de
l’isoproturon (à quantité égale) et/ou une phase solide du sol plus réactive vis-à-vis
de la molécule. On peut émettre l’hypothèse que la réactivité de la phase solide ou
de la phase organique influence aussi la cinétique de dégradation (peut être par des
effets d’immobilisation du pesticide ou de ses métabolites, qui deviennent alors non-
extractibles).
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travail du sol ont un effet très significatif. L'effet de la classe de texture sur la masse
volumique n'est pas significatif.
Couche Travail Type R.P. Classe text.
NB
Carbone org. 0,10239 0,02005 * 0,11006 0,00040 ***
Mass. vol. app. 0,00410 ** 0,00562 ** 0,10008 0,06251 °
tableau 67 – Analyse de la variance à un facteur contrôlé : effet des propriétés qualitatives
sur le carbone organique et la masse volumique apparente.
Méthode non-paramétrique de Kruskal-Wallis. Le tableau indique la probabilité P de l'absence
d'effet de la propriété qualitative (en colonne) sur la propriété quantitative (en ligne), et sa
significativité. Symboles suivant le P : '***' si 0 < P ≤ 0,001 ; '**' si 0,001 < P ≤ 0,01 ; '*' si 0,01 <
P ≤ 0,05 ; '°' si 0,05 < P ≤ 0,1 ; ' ' si P > 0,1). Les valeurs de P au-dessus de 0,05 ne sont pas
considérées comme révélant un effet significatif. Couche : effet couche de sol (lit de semence vs
reste de l'horizon travaillé); Travail : modalité de travail du sol (avec labour vs sans labour) ;
Type R.P. : type pédologique selon le Référentiel Pédologique, 6 classes identifiées ; Classe
text. : Classe de texture, d'après le triangle de l'Aisne, 2 classes identifiées ; Carbone org. : teneur
en carbone organique ; Mass. vol app. : masse volumique apparente.
NB : L'effet 'couche de sol' est tout juste significative avec une analyse de la variance de Fisher
avec P = 0,04409 *.
Les deux tableaux ci-dessous illustrent le sens des effets mis en évidence :
Couche Travail
Lit de sem. Reste horiz. Convent. Simplifié
n = 34 n = 16 n = 32 n = 18
-1
Carbone org. [g.kg ] 13,0 12,1 12,1 14,5
Mass. vol. app. [g.cm-3] 1,2 1,4 1,2 1,3
tableau 68 – Valeurs médianes de la teneur en carbone organique ou de la masse
volumique apparente selon la couche de sol considérée ou selon le type de travail du sol.
‘Lit de sem.’ : Lit de semence ; ‘Reste horiz.’ : reste de l’horizon travaillé, hors lit de semence ;
‘Convent.’ : travail conventionnel, avec labour ; ‘Simplifié’ : travail simplifié du sol, sans labour ;
les effectifs indiqués (n) sont le nombre d’échantillons, et non le nombre de sites.
La teneur en carbone organique est plus élevée dans le lit de semence, et en
situation de travail du sol simplifié. La masse volumique apparente est plus élevée
dans la partie de l’horizon travaillé qui n’a pas été semée, et dans les parcelles en
travail simplifié.
Classe de texture.
‘AL’ ‘LA’
n= n = 13 n = 37
-1
Carbone org. [g.kg ] 15,3 11,8
Mass. vol. app. [g.cm-3] 12,23 12,26
tableau 69 – Valeurs médianes de la teneur en carbone organique ou de la masse
volumique apparente selon la classe de texture.
‘AL’ : texture argilo-limoneuse ; ‘LA’ : texture limono-argileuse ; les effectifs indiqués (n) sont le
nombre d’échantillons, et non le nombre de sites.
La classe de texture AL présente des échantillons plus organiques, mais n’a pas
d’effet sur la masse volumique apparente.
Les propriétés / variables qui ont été simplifiées en propriétés binaires (type
pédologique simplifié, classe de pH, classe de teneur en CaCO3 ou de teneur en
éléments grossiers) peuvent aussi avoir un effet sur la teneur en carbone organique ou
la masse volumique apparente.
212
J. Moeys Partie IV
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214
J. Moeys Partie IV
Le tableau 74 montre que les lits de semence ont en moyenne une fraction d’eau
immobile plus basse que le reste de l’horizon travaillé, une teneur en eau à saturation
légèrement plus élevée, mais des teneurs en eau aux pF2 et 4,2 plus basses. Ils ont
aussi une conductivité hydraulique à saturation plus élevée, et le KD de l’isoproturon y
est un peu plus élevé.
Les sols en travail du simplifié ont une demi-vie de l’isoproturon plus basse que les
sols en travail conventionnel.
Type R.P. (non simplifié) Classe text.
R. C. B. P. N. L. ‘AL’ ‘LA’
n= 1 11 17 4 16 1 n = 13 n = 37
θSAT. [%] n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. 48 % 45 %
θ(pF 4,2) [%] n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. 20 % 17 %
R.U. [%] 11% 14% 15% 13% 17% 19% 13 % 17 %
hA [-] n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. -0,02 -0,10
'b' [-] 11,6 8,8 7,5 9,0 7,6 6,2 11,0 7,6
-1
KSAT. [m.s ] n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. 0,04 0,01
-1
KOC [L.kg ] 55 67 83 88 83 65 74 83
DT50 dégr. [j] n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. n.s. 5,0 7,3
tableau 75 – Valeur médiane des propriétés bio-physico-chimiques testées selon le type
pédologique de sol ou selon la classe de texture.
‘AL’ : texture argilo-limoneuse ; ‘LA’ : texture limono-argileuse ; ‘R.’ : Rendosol ; ‘C.’ :
Calcisol ; ‘B.’ : BRUNISOL ; ‘P.’ : PSEUDO-LUVISOLS ; ‘N.’ : Néoluvisols ; ‘L.’ : Luvisols ; ‘n.s.’
analyse de la variance non significative et non ‘limites’ (P > 0,1), les valeurs de la propriété ne
sont pas présentées. Les effectifs indiqués (n) sont le nombre d’échantillons, et non le nombre de
sites.
Sur le tableau 75, on peut voir que l’effet du type de sol sur le KOC semble se
segmenter en fonction des types de sols calcaires et des autres (les premiers ayant un
KOC plus bas), mais les LUVISOLS font exception à cette règle.
Les effets de la classe de texture sont plus clairs, avec une réserve utile plus basse
et une conductivité hydraulique à saturation plus élevée pour les sols argilo-limoneux.
Type RP (2) Cl. pH Cl. CaCO3 Cl. E.G.
Frac. Im. 0,13981 0,02330 * 0,06627 ° 0,01707 *
θS. 0,35167 0,00254 * 0,06162 ° 0,00961 **
θ(pF 2) 0,71626 0,18051 0,65000 0,21151
θ(pF 4,2) 0,20330 0,39005 0,00075 ** 0,14596
R.U. 0,06912 ° 0,01394 * 0,00054 ** 0,09720 °
hA 0,19539 0,00164 * 0,00267 * 0,00234 **
'b' 0,03093 * 0,01146 * 0,00011 ** 0,06918 *
KS. 0,04561 * 0,00021 ** 0,01078 * 0,00023 **
KD 0,75047 0,21900 0,66564 0,89159
KOC 0,00392 * 0,22658 0,00008 *** 0,00271 **
DT50 dégr. 0,09910 ° 0,20019 0,07080 ° 0,02734 *
tableau 76 – Analyse de la variance avec les propriétés qualitatives 'dérivées' : effet sur les
propriétés hydriques du sol et les interactions sol-isoproturon
Pour une explication des différents seuils de la probabilité P et des symboles associés se référer au
tableau 67 p. 212. Type RP (2) : classification du référentiel pédologique simplifiée en 2 classes
(sols à ambiance carbonatée ou non) ; Cl. pH : 2 classes de pH (acide vs neutre à basique) ; Cl.
CaCO3 : 2 classes de teneurs en CaCO3 (teneurs faibles vs teneurs élevées) ; Cl. E.G. : 2 classes
de teneurs en éléments grossiers (teneurs faibles vs teneurs élevées).
Le tableau 76 montre les effets des propriétés qualitatives ‘dérivées’. L’utilisation du
215
J. Moeys Partie IV
216
J. Moeys Partie IV
la classe de teneur en éléments grossiers vont dans le même sens, avec des effets
similaires entre les échantillons dont la teneur en CaCO3 est supérieure à 4 g.kg-1 et/ou
ceux dont la teneur en éléments grossiers est supérieure à 40 g.kg-1. Cette catégorie
d’échantillons a une fraction d’eau immobile inférieure, une teneur en eau à saturation
supérieure mais une réserve utile inférieure. Ces sols carbonatés / caillouteux ont
aussi une conductivité hydraulique à saturation plus élevée, une DT50 de l’isoproturon
inférieure et un KOC inférieur.
217
J. Moeys Partie IV
Par contre les différences sont moins marquées entre le lit de semence et le reste
de l'horizon de surface en travail conventionnel. De même, la différence de teneur en
carbone organique du reste de l'horizon travaillé est faible entre les modalités travail
simplifié et conventionnel.
L'effet conjoint du mode de travail du sol et de la stratification verticale de l'horizon
travaillé sur la masse volumique apparente est moins important mais significatif
(P = 0,0118289 *) :
ρb [kg.dm-3] Couche
Lit de sem. Reste horiz.
Travail Convent. 1,23 1,24
Simplifié 1,26 1,48
tableau 80 – Valeurs médianes de la masse volumique apparente ρb pour les différents
groupes d’échantillons {travail du sol ; couche}.
Le tableau 80 fait apparaître des différences moins tranchées pour la masse
volumique que ne le laisse penser le résultat de l'analyse de la variance. La principale
différence de masse volumique est la masse volumique apparente nettement plus
élevée de l'horizon travaillé, hors lit de semence, en travail du sol simplifié
(1,48 kg.dm-3). Quelle que soit la modalité de travail du sol, les lits de semence sont
moins denses que le reste de l'horizon travaillé. La différence réelle est probablement
plus accentuée, du fait de la difficulté à réaliser un prélèvement de masse volumique
correct dans les zones les plus meubles du lit de semence, ce qui a pu biaiser la
représentativité de l'échantillonnage.
Le KD semble aussi influencé conjointement par le travail du sol et la couche
de sol de l’horizon labouré (P = 0,001755 **). On note aussi une influence croisée du
travail du sol et de la classe de teneur en CaCO3 sur ce dernier (P = 0,01284 *).
KD [L.kg-1] Couche Cl. CaCO3
Lit de sem. Reste horiz. < 4 g.kg-1 ≥ 4 g.kg-1
Travail Convent. 1,06 1,03 1,01 1,18
Simplifié 1,39 0,94 1,29 0,97
tableau 81 – Valeurs médianes de l’adsorption (KD) pour les différents groupes
d’échantillons {travail du sol ;couche} ou {travail du sol ; classe de CaCO3}.
218
J. Moeys Partie IV
Il apparaît que les sols dont le pH est inférieur à 7 voient leur teneur en eau
immobile peu affectée par la couche de sol, tandis que pour les sols dont le pH est
supérieur ou égal à 7, la fraction d’eau immobile est bien inférieure dans le lit de
semence que dans le reste de l’horizon travaillé. Une hypothèse pouvant expliquer ce
constat est une moindre stabilité structurale des sols un peu acides, entraînant du
même coup une baisse de la connectivité du réseau poral.
L’effet combiné de la couche de sol et du type pédologique simplifié apparaît être
moins net sur le tableau 82, si ce n’est fortuit. En effet on observe bien une fraction
d’eau immobile plus faible dans le lit de semence que dans le reste de l’horizon
travaillé, mais le groupe des RENDOSOLS et CALCISOLS a une teneur en eau immobile
plus basse dans le lit de semence que les autres types de sol, mais dans le reste de
l’horizon une fraction d’eau immobile plus élevée.
Des analyses de la variance à deux ou plusieurs facteurs contrôlés ont été réalisées
de la même manière sur les autres propriétés quantitatives importantes (DT50, KS, KOC),
en testant les différents croisements possibles des propriétés qualitatives présentées
plus haut (analyse de la variance à un facteur contrôlé), mais les résultats ne sont pas
ou peu significatifs (non présentés ici).
219
J. Moeys Partie IV
tableau 83 – Abréviations des noms de propriétés utilisées pour les ACP et les PLSR.
La profondeur du sol, peu corrélée aux autres propriétés, n'a pas été inclue dans les
analyses présentées ici (mais a été testée). Les paramètres b, hA et la réserve utile de
l'horizon ont aussi été écartées au profit des teneurs en eau caractéristiques (à pF 2,
pF 4,2 et saturation), à partir desquelles les 3 paramètres cités plus haut sont calculés.
Cela permet aussi de limiter la redondance des informations, qui nuit à la lisibilité des
résultats de l'ACP.
Pour des raisons de lisibilité, les analyses en composantes principales sont
réalisées en prenant un panel de propriétés agro-pédologiques de base (granulométrie
...), systématiquement utilisé, avec une ou deux propriétés d'intérêt (KS, KD, DT50, etc.),
dont on cherche à comprendre la variabilité spatiale. Les liens entre les propriétés
d'intérêt ne sont pas examinés, car il n'y a pas probablement pas d'intérêt à prédire
l'une avec l'autre (ex. KSavec DT50).
220
J. Moeys Partie IV
Avant de procéder à un examen des propriétés les plus importantes pour le devenir
de l’isoproturon dans les sols (DT50, KD, KOC, KS), il est nécessaire d’examiner les liens
entre les propriétés pédologiques (physico-chimiques ou de rétention en eau) plus
simples à mesurer. L’analyse en composantes principales permet d’examiner ces liens,
par une décomposition de la variabilité des échantillons en strates (composantes)
indépendantes.
figure 86 – résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques et de rétention en eau des
échantillons.
Pour chacun des 4 graphiques, deux composantes sont représentées dans le plan : la droite
horizontale représente une première composante (composante 1 pour (A) et (B), composante 3 pour
(C) et (D)), la droite verticale représente la deuxième composante (composante 2 pour (A) et (B),
composante 4 pour (C) et (D)). L’axe du haut représente le poids des propriétés sur la composante
horizontale, l’axe de droite représente le poids des propriétés sur la composante verticale. L’axe du
bas représente le poids des observations dans la composante horizontale, l’axe de gauche
représente le poids des observations dans la composante verticale. Les graphiques (A) et (B)
représentent les mêmes résultats, mais en mettant en évidence des informations différentes (comme
pour les graphiques (C) et (D)). Les graphiques de gauche mettent en évidence les observations,
notées selon la convention {n° du site:strate}, avec en grisé les vecteurs des propriétés projetées.
Les graphiques de droite mettent en évidence les propriétés (flèches) avec en grisé la position des
observations et une information synthétique selon la convention {type de sol,modalité de travail
du sol}. Ces propriétés sont affichées, mais n’ont pas été utilisées dans l’ACP) ; la signification des
abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220.
221
J. Moeys Partie IV
222
J. Moeys Partie IV
Sur le graphique (D), on voit que l’axe 4 (12 % de la variabilité) est surtout influencé
(négativement) par la masse volumique apparente, la teneur en eau à saturation et la
teneur en éléments grossiers. L’axe 3 est influencé par le carbone organique et la
teneur en eau au pF 2.
La répartition des observations n’est plus dirigée par la stratification verticale de
l’horizon travaillé, mais par plutôt par la modalité de travail du sol. On voit que les sols
en travail simplifié (x2) sont plutôt dans sous la diagonale y = x tandis que les sols en
travail conventionnel sont plutôt au-dessus de la diagonale y = x. Cette partition est
relativement logique, puisqu’elle indique que les sols en travail simplifié tendent à être
plus denses et plus organiques, avec une teneur en eau à saturation élevée.
Cependant, une partie non négligeable des observations est proche du croisement de
l’axe 3 et 4, ce qui montre que cette distinction n’est pas valable pour toutes les
observations.
figure 87 – Résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques, de rétention eau des
échantillons et la fraction d'eau immobile.
La légende de la figure 86 (p. 221) donne une description détaillée des graphiques tirés d’une
ACP ; la signification des abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220. Les composantes 3
et 4 ne sont pas présentées car le poids de la fraction immobile y est faible.
Les graphiques (A) et (B) de la figure 87, qui montrent les résultats de l'ACP sur les
composantes 1 et 2, fait apparaître des liens modérés, entre la fraction d'eau immobile
et les autres propriétés physico-chimiques du sol. Assez logiquement la fraction d'eau
immobile est (positivement) corrélée aux propriétés liées à la structure du sol, la
masse volumique apparente et les teneurs en eau aux pF 2 et 4,2. Elle est aussi
négativement corrélée, mais dans une moindre mesure, à la teneur en eau à
223
J. Moeys Partie IV
L'analyse par ACP n'est donc pas vraiment concluante pour faire apparaître
les déterminismes pédologiques ou agronomiques de la conductivité
hydraulique à saturation.
224
J. Moeys Partie IV
figure 88 – résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques, de rétention eau des
échantillons et de conductivité hydraulique à saturation et à h = -1 cm.
La légende de la figure 86 (p. 221) donne une description détaillée des graphiques tirés d’une
ACP ; la signification des abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220.
Sur cette ACP, on constate que les échantillons du lit de semence sont liés
à des conductivités hydrauliques plus élevées que dans le reste de l'horizon
225
J. Moeys Partie IV
travaillé.
figure 89 – résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques, de rétention eau des
échantillons et d'adsorption linéaire de l'isoproturon.
La légende de la figure 86 (p. 221) donne une description détaillée des graphiques tirés d’une
ACP ; la signification des abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220.
226
J. Moeys Partie IV
Dans le cas du KD, seule la relation avec le carbone organique trouve une
explication claire et évidente dans les processus physico-chimiques de l'adsorption des
molécules sur les matières organiques du sol. Les liens avec les propriétés de
rétention en eau du sol sont d'autant plus surprenants que le KD est mesuré sur des
échantillons tamisés, puis complètement dispersés sous l'action de l'agitation dans la
solution contenant l'isoproturon. La porosité est donc en grande partie détruite lors de
la mesure. Il est possible que ce lien résulte de l'association circonstancielle entre la
teneur en carbone organique et les propriétés de rétention en eau du sol et de masse
volumique apparente, sous l'effet combiné de la préparation du lit de semence par les
outils agricoles et de l'accumulation de matières organiques en surface quand le sol
n'est pas labouré (ce 2e point n'est pas confirmé par l'ACP).
Une ACP réalisée avec les fractions granulométriques décarbonatées (à la place
des fractions non-décarbonatées) donne des résultats similaires (non présentés ici).
227
J. Moeys Partie IV
figure 90 – résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques, de rétention eau des
échantillons et d'adsorption normalisée de l'isoproturon.
La légende de la figure 86 (p. 221) donne une description détaillée des graphiques tirés d’une
ACP ; la signification des abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220.
Les résultats de l'ACP réalisée avec le KOC sont assez indépendants de ceux
obtenus avec le KD (figure 89).
Sur les axes 1 et 2, qui représentent 57 % de la variabilité totale, le KOC est
positivement (mais faiblement) lié à la première composante, comme la teneur en
limon non-décarbonatée (le KD est surtout lié à la 2e composante). La teneur en argile,
en éléments grossiers, en sables, en CaCO3 et le pH sont sur le même axe, mais avec
un coefficient négatif. Cela signifie par exemple que les sols à teneur en argile plus
élevée ont un KOC plus faible.
Sur les axes 3 et 4, le KOC apparaît bien corrélé à la teneur en sable, et
négativement corrélée à la masse volumique apparente et la teneur en éléments
grossiers. Sur ces deux axes, qui comptent pour 19 % de la variabilité, les échantillons
en travail conventionnel semblent plus nombreux pour les valeurs de KOC fortes, et les
échantillons en travail simplifié se placent de l'autre côté de l'axe 4, avec des KOC plus
228
J. Moeys Partie IV
figure 91 – résultats de l’ACP sur les propriétés physico-chimiques, de rétention eau des
échantillons, de dégradation et de minéralisation de l'isoproturon.
La légende de la figure 86 (p. 221) donne une description détaillée des graphiques tirés d’une
ACP ; la signification des abréviations est donnée dans le tableau 83, p. 220.
Les 4 axes expliquent 75 % de la variance expliquée. La DT50 de dégradation de
l’isoproturon a un poids très faible sur les axes 1 et 2 de l’ACP. Les distinctions
précédentes (figure 86), basées sur (i) les fractions granulométriques fines et
grossières ou sur (ii) les propriétés de masse volumique apparente et de rétention en
eau n’ont que peu d’importance vis à vis de la DT50 sur les axes 1 et 2 (54 % de la
variabilité globale).
Par contre sur les axes 3 et 4 la DT50 de dégradation de l’isoproturon se détache
nettement, avec un poids positif sur l’axe 3 et un poids positif sur l’axe 4 (d’intensité
équivalente). Deux propriétés s’opposent nettement à la DT50, la teneur en limon non
décarbonatée et la teneur en eau à saturation.
229
J. Moeys Partie IV
Il parait cependant difficile de discriminer les valeurs de DT50 sur ces critères
(% limon et θS). Il ne s’agit que de 20% de la variabilité globale des échantillons, et
la distinction qui semblait se dessiner précédemment (tableau 73, p. 214) entre les
modalités de travail du sol simplifié et conventionnelle n’apparaît plus sur les axes 3
et 4 de cette ACP.
39
Propriétés hydriques, teneur en eau immobile, adsorption et demi-vie de l’isoproturon.
230
J. Moeys Partie IV
40
Il s'agit d'une 'fausse prédiction' destinées à servir de point de référence en terme d'erreur de
prédiction : la valeur prédite de la variable X pour la ie mesure est égale à la moyenne de X (de i=1 à n)
231
J. Moeys Partie IV
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L’utilisation d’une prédiction par PLSR de la fraction d’eau immobile réduit d’à
peine 1/5e l’erreur par rapport à une absence de prédiction. L’utilisation de la PLSR
pour prédire la fraction d’eau immobile est donc peu pertinente.
234
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235
J. Moeys Partie IV
propriétés que dans le cas du KD. Les propriétés les plus importantes (VIP) sont les
éléments grossiers totaux et la teneur en limon. Le carbone organique a une
importance plus faible, et les teneurs en eau aux pF2 et 4,2 ont une importance
intermédiaire.
236
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J. Moeys Partie V
239
J. Moeys Partie V
1 Discussion
■ 1.1 Identification des problèmes rencontrés
... ou l'analyse a posteriori d’un échec relatif...
Pour quelles raisons n’a-t-il pas été possible d’identifier
clairement et de modéliser statistiquement les déterminismes de
la variabilité des propriétés du sol et de l'isoproturon ?
Si des tendances sont observées, qui montrent des liens logiques entre les
différentes propriétés mesurées, il n’a pas été possible de modéliser statistiquement la
variabilité des propriétés d’intérêt de manière satisfaisante. Il est donc nécessaire de
chercher à expliquer cet échec. Plusieurs hypothèses, non exclusives, sont possibles :
Hypothèse 1 : Les propriétés agro-pédologiques mesurées ne sont pas les
propriétés explicatives réelles des propriétés d’intérêt (KSAT, KD, KOC, DT50). On
peut par exemple supposer que la prédiction des propriétés hydriques du sol
bénéficierait d’une meilleure description (quantitative) de la structure du sol à
l’échelle de la mesure (voir Lin et al., 1999 a et b). Concernant le KD, les pistes à
envisager sont l’effet de la nature biochimique des matières organiques et l’effet
des éléments grossiers et de la fraction sableuse. Les deux derniers paramètres
ont été mesurés, mais pas sur une gamme de valeurs suffisamment étendue. Ils
auraient aussi dû/pu être mesurés sur les quelques grammes de sol ayant servi à
mesurer le KD, et leur volume soustrait à celui de la terre fine, afin d'évaluer le KD de la
terre fine. En accord avec la bibliographie, une étude plus précise de la microflore
dégradante du sol aurait peut-être permis de dégager quelques pistes d’explications
de la DT50. La spécificité de la flore dégradante et la complexité des processus en jeu
en font une hypothèse réaliste, mais difficile à traiter à l’échelle d’un secteur agricole.
240
J. Moeys Partie V
241
J. Moeys Partie V
des erreurs sur les propriétés estimées. Les sources d’erreur lors des différentes
mesures sont par contre généralement connues. Les principales sources d’erreur qui
ont pu être identifiées/soupçonnés lors de cette étude sont : (i) l’imprécision de la
lecture de la hauteur d’eau écoulée dans le réservoir de l’infiltromètre, et les problèmes
possibles de potentiel imposé non-constant du fait des effets du vent sur le vase de
Mariotte et sur la stabilité de l'infiltromètre. (ii) La difficulté d’effectuer un prélèvement
non-destructif à la gouge sous l’infiltromètre à la fin de l’infiltration ou la différence de
masse volumique apparente entre les mesures au cylindre (qui servent à ‘corriger’ les
prélèvements sous l’infiltromètre) et la masse volumique apparente réelle sous
l’infiltromètre (inconnue). (iii) Le manque de précision des mesures de quantité
d’isoproturon résiduelle au temps final des incubations, lié notamment à une mauvaise
estimation des quantités de molécules radiomarquées nécessaires (en partie liée à
l’aspect biphasique des cinétiques). (iv) Il est difficile de réaliser des prélèvements de
bonne qualité (non perturbés) pour les mesures de la relation θ(h) sur de petits
cylindres de sol (plus large que haut). Sur ce point, la qualité des prélèvements
semblait néanmoins correcte (comme pour les prélèvements de masse volumique
apparente).
Hypothèse 3.e : Une part de l’imprécision des mesures résulte d’une
inadéquation entre les ‘modèles de processus’ simples qui ont été choisi et la
‘réalité des processus’ plus complexe. Ce type d’erreur, appelé ‘erreur
structurelle’, pose à la fois problème lors de l’estimation des paramètres du modèle
avec des données mesurées et lors de l’utilisation des propriétés estimées dans des
modèles informatiques de prédiction du comportement des pesticides dans les sols
(sur ce dernier point, voir Dubus et al., 2003), avec les mêmes équations. La réalité
mesurée n’est pas correctement prise en compte lors de l’estimation des paramètres,
puis le modèle informatique échoue à reproduire de manière satisfaisante des mesures
réalisées par ailleurs. Quand elle est identifiée, l’erreur structurelle s’apparente au non-
respect des hypothèses de base liées aux modèles de processus. Ce problème est
évident pour l’estimation de la DT50 avec une cinétique de 1er ordre, et il a
probablement été aggravé par le faible nombre de temps d’extraction (3) au cours de la
cinétique de dégradation.
Il est fort possible que les problèmes d’interprétation des mesures d’infiltration
soient en partie dus au non-respect des hypothèses des modèles utilisés. Si l’utilisation
des équations de Campbell pour décrire la rétention en eau et la conductivité du sol
n’est pas problématique (avec 3 mesures de teneur en eau et une conductivité
hydraulique, un seul ajustement est possible), il est évident que la forme des courbes
θ(h) et K(h) ne reproduit pas la forme plus complexe des relations réelles. Cresswell et
Paydar (1996) ont cependant montré que les erreurs dérivant de cette méthode sont
acceptables. La mesure du coefficient d’adsorption avec un modèle linéaire est aussi
une simplification par rapport au processus réel mieux reproduit par l’équation de
Freundlich. Plusieurs études ont montré que l’adsorption de l’isoproturon s’écarte un
peu de la linéarité (NF < 1 ; e.g. Coquet et Barriuso, 2002).
242
J. Moeys Partie V
243
J. Moeys Partie V
généralement la variabilité (le nombre de mesures est aussi plus faible). Cela signifie-
t-il que des mesures à l’échelle d’une parcelle sont suffisantes pour caractériser
le secteur agricole de Ouarville ? La question est importante car, si la parcelle n’est
pas a proprement parler un secteur de référence, elle a été sélectionnée sur les
mêmes critères qu’un secteur de référence (hypothèse de représentativité vis-à-vis
de la diversité et de la répartition spatiale de la couverture pédologique).
D’un point de vue pédologique il est assez clair que le choix de cette parcelle
était pertinent. La plupart des matériaux géo-pédologiques du secteur y sont
représentés, et leur répartition à une échelle allant jusqu’à la 100aine de mètres est
caractéristique de ce qui s’observe à l’échelle du secteur agricole complet. Elle n’est
pas pertinente pour étudier les règles de répartition des sols dans le paysage, mais ces
règles ne sont pas plus apparentes à l’échelle du secteur agricole complet.
Comme les seules propriétés comparées sont celles de l’horizon de surface, et
que les analyses statistiques ont montré que cet horizon de surface avait des
propriétés pédologiques peu contrastées à l’échelle du secteur agricole, on peut par
contre se demander si l’adéquation entre les propriétés mesurées à la parcelle et
celles mesurées à l’échelle du secteur agricole n’est pas fortuite.
Cette question est légitime dans la mesure où la parcelle ne représente pas la
diversité des pratiques agronomiques dans le secteur étudié. Ces pratiques
influencent les propriétés de l’horizon de surface (carbone organique et structure
notamment), et les tests statistiques ont montré que certaines de ces propriétés
influencent les propriétés hydriques du sol et le comportement de l’isoproturon dans
ces sols.
2 Conclusion générale
Le travail présenté dans ce document a concerné la mise en œuvre d’une stratégie
d’évaluation de la variabilité spatiale des propriétés du sol, à l’échelle d’un
secteur agricole de 2600 ha, en relation avec leur impact potentiel sur le
comportement de l’isoproturon dans ces sols. La mise en évidence des facteurs
agronomiques et pédologiques qui influencent le comportement de l’isoproturon – ou
plus exactement le risque de voir cette molécule transportée par l’eau au travers du sol
vers la nappe – est une étape clé pour définir ensuite les zones ‘à risque’ pour ces
transferts.
L’évaluation des risques de transferts par l’utilisation de modèles informatiques
mécanistes, qui doit suivre ce travail, est un moyen essentiel de compréhension des
phénomènes. Par le couplage des processus, elle apporte une vision synthétique et
globale qui ne peut être mise en œuvre par l’examen individuel des propriétés du sol.
Mais cette approche est lourde à mettre en œuvre et coûteuse. Le pari de ce travail
était donc de réaliser une évaluation ‘a minima’ des propriétés du sol, tout en restant
dans le cadre ‘mécaniste’ de processus biologiques, physiques et chimiques intégrés
dans les modèles, en utilisant des jeux d’équations relativement simples à paramétrer.
La contrepartie attendue du choix de modèles de processus simples est la possibilité
de multiplier les mesures et, par-là, de mieux évaluer la variabilité spatiale des
propriétés, et de décortiquer les facteurs agronomiques et pédologiques qui influencent
les propriétés les plus critiques. La stratégie d’échantillonnage mise en œuvre et les
méthodes de mesures employées avaient pour but de capturer au mieux la variabilité
spatiale des propriétés du sol essentielles pour ces transferts.
La première question posée dans les objectifs de cette thèse est « quel est le
niveau de variabilité spatiale des processus étudiés ? ». Les mesures ont révélé
244
J. Moeys Partie V
245
J. Moeys Partie V
246
J. Moeys Partie V
les effets qui sont prépondérants sur les risques de transferts de l’isoproturon.
En conclusion (1) les sols de surface du secteur agricoles de Ouarville sont
peu contrastés du point de vue de leurs propriétés agronomiques et
pédologiques ; (2) certaines propriétés cruciales pour le comportement de
l’isoproturon sont néanmoins très variables ; (3) si l’on parvient à identifier
certains de leur déterminismes (facteurs agro-pédologiques), ces déterminismes
sont, à l’exception notoire du KD, trop peu marqués pour permettre de prédire les
propriétés du sol importantes pour les transferts de pesticides à partir de ses
propriétés de base. (4) Enfin, les propriétés du sol importantes pour les
transferts de pesticides ont parfois des effets antagonistes sur les risques de
transferts.
La prédiction spatiale des risques de transferts de pesticides à partir d’une
carte des propriétés pédologiques du sol ne semble donc pas possible. Une
prédiction du KD à partir d’une carte des teneurs en matières organiques est par
contre envisageable.
La dernière question à laquelle doit répondre cette thèse a pour but d’apporter un
éclairage sur les raisons de l’échec relatif exposé ci-dessus : « quelles sont les
conséquences du choix méthodologique privilégiant l’estimation de la variabilité
spatiale au détriment de la complexité des processus suivis ». Ces conséquences
ont été largement discutées dans le chapitre précédent (discussion), elles sont
synthétisées par la figure 94 ci-dessus.
Le fait est que les moyens dont disposent les études portant sur des problèmes
agro-environnementaux liés au sol sont généralement le facteur limitant, notamment du
fait des limites méthodologiques à la connaissance des sols, qui ont été exposées en
introduction de ce document. La complexité du milieu naturel en général et des sols en
particulier est aussi un invariant avec lequel il faut composer.
Il n'est pas toujours possible de mesurer toutes les propriétés du sol sur un seul et
même prélèvement, ou sur un seul et même point de mesure (appelé ici 'site'). Or, si
certaines propriétés du sol varient à courte distance (sa structure dans l'horizon
labouré par exemple), la différence de support de mesure engendre une variabilité
supplémentaire, parasite, qui masque une partie des liens existant entre les propriétés
mesurées.
La solution la plus évidente consiste à réduire le nombre de sites caractérisés, afin
d'augmenter le nombre de répétitions de chaque mesure pour un même site, afin de
compenser la variabilité locale – les moyens, et donc le nombre de mesures étant un
invariant. La baisse du nombre de sites caractérisés engendre à son tour une réduction
de la puissance des méthodes statistiques employées, notamment si le nombre de
sites caractérisés est faible.
Mais si on ne peut réduire le nombre de sites caractérisés, et qu'il faut augmenter le
nombre de répétitions, il est encore possible d'utiliser des modèles de processus
plus simples, qui demandent moins de mesures pour être calibrés. C'est la
stratégie qui a été retenue pour cette thèse, et nous avons vu qu'elle peut
engendrer à son tour une variabilité supplémentaire - du fait de l'inadéquation
entre les modèles et la réalité - qui masque elle aussi une partie des relations entre
propriétés.
247
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260
J. Moeys Références bibliographiques
261
J. Moeys Liste des figures
Partie IV Résultats.........................................148
figure 37 – Textures non décarbonatées des sols du secteur agricole de Ouarville,
placées sur le triangle des textures de la Chambre d’Agriculture de
l’Aisne. Vue générale et agrandissement........................................ 150
figure 38 – Histogramme de la teneur en argile (non-décarbonatée)................. 151
figure 39 – Graphique ‘box & whisker’ des charges massiques des différentes
fractions granulométriques grossières (graviers, cailloux et totale). 151
figure 40 – Graphique ‘box & whisker’ de la teneur en carbone organique........ 152
figure 41 – Graphique ‘box & whisker’ de la teneur en azote organique............ 152
figure 42 – Graphique ‘box & whisker’ du rapport carbone organique sur azote.153
figure 43 – Graphique ‘box & whisker’ de la teneur en CaCO3. ......................... 153
figure 44 – Graphique box & whisker du pH des échantillons analysés............. 154
figure 45 – Graphique ‘box & whisker’ des masses volumiques apparentes
mesurées (g.cm-3)....................................................................... 154
262
J. Moeys Liste des figures
figure 46 – Symboles utilisés dans les schémas pour les principaux matériaux
parentaux du secteur étudié. .......................................................... 155
figure 47 – Schéma des successions de matériaux parentaux observées (ou non)
sur le secteur étudié. ...................................................................... 156
figure 48 – Matériaux ‘intermédiaires’ résultants de mélanges sous l’effet de la
cryoturbation................................................................................... 156
figure 49 – Statistiques descriptives des teneurs en éléments grossiers maximales
dans les sondages décrits à la tarière............................................. 157
figure 50 – Statistiques de distribution des teneurs en éléments grossiers
maximales dans les sondages décrits à la tarière........................... 158
figure 51 – Graphique ‘box & whisker’ des teneurs en éléments grossiers
maximales des sondages tarière. ................................................... 158
figure 52 – Graphiques box & whisker des teneurs en eau [cm3.cm-3] mesurées à
différents potentiels matriciels caractéristiques (saturation, pF 2 et
pF 4,2) & de la réserve utile estimée. ............................................. 163
figure 53 – Graphique ‘box & whisker’ du paramètre hA de Campbell. .............. 164
figure 54 – Graphique ‘box & whisker’ du paramètre b de Campbell. ................ 165
figure 55 – Exemple graphique (1) de détermination de la sorptivité pour la
méthode White et Sully (modifiée), en d.I/d.√t = f(√tgéom). ............... 167
figure 56 – Exemple de résultat (1) de la détermination de qRP par la méthode de
White et Sully (1987) et de l’ajustement de la courbe d’infiltration
I = S.√t avec la valeur de S déterminée précédemment.................. 167
figure 57 – Exemple graphique (2) de détermination de la sorptivité pour la
méthode White et Sully (modifiée), en d.I/d.√t = f(√tgéom). ............... 168
figure 58 – Exemple de résultat (2) de la détermination de qRP par la méthode de
White et Sully et de l’ajustement de la courbe d’infiltration I = S.√t
avec la valeur de S déterminée précédemment.............................. 168
figure 59 – Exemple de résultat (1) de la détermination de S et K par la méthode
de Haverkamp et al. (1994), avec une détermination graphique en
d.I/d.√t = f(√tgéom). ........................................................................... 170
figure 60 – Exemple de résultat (2) de la détermination de S et K par la méthode
de Haverkamp et al. (1994), avec une détermination graphique en
d.I/d.√t = f(√tgéom). ........................................................................... 171
figure 61 – Exemple de résultat (1) de l’ajustement des équations de Haverkamp
et al. (1994) du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t),
après détermination graphique de S et K sur le régime transitoire.. 171
figure 62 – Exemple de résultat (2) de l’ajustement des équations de Haverkamp
du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t), après
détermination graphique de S et K sur le régime transitoire............ 172
figure 63 – Exemple de résultat (1) de l’ajustement des équations de Haverkamp
et al. (1994) du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t),
après détermination directe de S et K sur les régimes transitoire et
permanent. ..................................................................................... 174
figure 64 – Exemple de résultat (2) de l’ajustement des équations de Haverkamp
et al. (1994) du régime transitoire et du régime permanent, sur I=f(t),
après détermination directe de S et K sur les régimes transitoire et
permanent. ..................................................................................... 174
263
J. Moeys Liste des figures
264
J. Moeys Liste des figures
Partie VI Annexes..........................................274
figure 95 – Modalité de prélèvement des cylindres de sol non perturbés pour les
masses volumiques apparentes. .................................................... 282
figure 96 – Les différents types de variables utilisées par les modèles
informatiques de transferts de pesticides........................................ 302
figure 97 – Fiche de sondage tarière utilisée pour décrire les sondages. .......... 303
figure 98 – Carte de la profondeur du sol et de la teneur en argile de l’horizon de
surface sur 34 sites (50 couches) étudiés....................................... 304
figure 99 – Carte des valeurs de teneur en éléments grossiers et en CaCO3 de
l’horizon de surface sur 34 sites (50 couches) étudiés.................... 304
figure 100 – Carte des valeurs de réserve utile et des conductivités hydrauliques à
saturation de l’horizon de surface sur 34 sites (50 couches) étudiés.305
figure 101 – Carte des valeurs de fraction d’eau immobile de l’horizon de surface
sur 34 sites (50 couches) étudiés. .................................................. 305
figure 102 – Carte des valeurs teneurs en carbone organique et de coefficient
d’adsorption de l’horizon de surface sur 34 sites (50 couches) étudiés.306
figure 103 – Carte des valeurs de coefficient d’adsorption normalisé par la fraction
de carbone organique et de temps de demi-vie de l’isoproturon de
l’horizon de surface sur 34 sites (50 couches) étudiés.................... 306
265
J. Moeys Liste des tableaux
Partie IV Résultats.........................................148
tableau 17 – Statistiques descriptives des fractions granulométriques non
décarbonatées................................................................................ 149
tableau 18 – Statistiques descriptives des fractions granulométriques
décarbonatées................................................................................ 149
tableau 19 – Statistiques de distribution des fractions granulométriques non
décarbonatées................................................................................ 150
tableau 20 – Statistiques descriptives du carbone, de l’azote organique, et du C/N.152
tableau 21 – Statistiques de distribution du carbone, de l’azote organique, et du
C/N................................................................................................. 152
tableau 22 – Statistiques descriptives de la teneur en CaCO3 (en g de CaCO3 . g de
sol sec total-1). ................................................................................ 153
tableau 23 – Statistiques descriptives du pH des échantillons analysés [-]. ......... 153
266
J. Moeys Liste des tableaux
267
J. Moeys Liste des tableaux
268
J. Moeys Liste des tableaux
269
J. Moeys Liste des tableaux
270
J. Moeys Liste des équations
271
J. Moeys Liste des équations
Partie IV Résultats.........................................148
Partie V Discussion & conclusions ................239
Partie VI Annexes..........................................274
équation 61 – Erreur moyenne et moyenne de l'erreur en valeur absolue......... 288
équation 62 – Somme des carrés des écarts (SCE).......................................... 288
équation 63 – Racine carrée de l'erreur quadratique moyenne. ........................ 288
équation 64 – Racine carrée de l'erreur relative au carré (1)............................. 289
équation 65 – Racine carrée de l'erreur relative au carré (2)............................. 289
équation 66 – Pourcentage d'erreur moyen en valeur absolue, MAPE.............. 290
équation 67 – Centrage et réduction d’une variable. ......................................... 292
équation 68 – Transformation inverse négative d’une variable.......................... 292
équation 69 – Transformation logarithmique décimale d’une variable. .............. 292
272
THÈSE
pour obtenir le grade de
Docteur
n° /__/__/__/__/__/__/__/__/__/__/
de
l’Institut des Sciences et Industries du Vivant et de l’Environnement
– AgroParisTech –
Spécialité : sciences du sol
ANNEXES
application au cas de l'isoproturon
dans un secteur agricole
de Beauce chartraine
présentée et soutenue publiquement par
Julien MOEYS
le 20 décembre 2007
devant un jury composé de
Partie VI Annexes
274
J. Moeys Annexes
1 terminologie
Il est nécessaire de préciser succinctement la définition de certains termes utilisés
fréquemment dans ce document. Ils se réfèrent aux définitions communément admises
dans la littérature, mais apportent des précisions spécifiques au travail présenté.
275
J. Moeys Annexes
mouvements de l’eau dans ce dernier. Les propriétés attendues d’un traceur sont
(i) d’être, en l’absence d’apport externe, à une concentration nulle ou négligeable
dans le sol, (i) l’absence d’interaction avec la phase solide du sol (adsorption) (ii)
l’absence de dégradation biologique ou physico-chimique.
Déterminisme(s) agro-pédologique(s) : Dans cette étude, les 'déterminismes'
agronomiques et pédologiques d'une propriété du sol sont l'ensemble des autres
propriétés plus élémentaires (propriétés du sol, éventuellement influencées par
les pratiques agronomiques locales) qui influencent (déterminent) directement ou
indirectement cette propriété et sa valeur lorsqu'on mesure cette propriété. Voir
les « Termes relatifs aux tests statistiques » ci-dessous, quand cette propriété
est vue comme une propriété d'intérêt ou une propriété à prédire.
41 Sampling site: "A well delimited area, where sampling operations take place"
42 Stratification (ISO 3534-1, 1993) : "The division of a population into mutually exclusive and
exhaustive sub-populations (called strata), which are thought to be more homogeneous with
respect to the characteristics investigated than the total population"
276
J. Moeys Annexes
43 Sampling point: "The place where sampling occurs within the sampling site"
44 Sample (IUPAC, 1990; ISO 11074-2, 1998) : "A portion of material selected from a larger
quantity of material".
45 "constant : a quantity whose value is accurately known".
46 "variable : quantity whose value may change".
47 " independent variable : variable versus which changes in a dynamic system are described; e.g. time,
three spatial dimension ".
277
J. Moeys Annexes
279
J. Moeys Annexes
2 Stratification de
l’échantillonnage : objectifs
■ 2.1 Type de sol
Type de sol Objectif [-] Proportion de la grille [-]
R 0.100 0.0117
Ca 0.125 0.0771
Ci 0.125 0.0611
B 0.100 0.0542
NL 0.300 0.4779
L 0.250 0.0318
tableau 87 – Proportions visées et proportions réelles des différents types de sols
renseignés par la carte pour l’échantillonnage.
Avec R : RENDOSOL ou Rendisol ; Ca : CALCOSOL ; Ci : CALCISOL ; B : BRUNISOL ; NL :
NÉOLUVISOL ; L : LUVISOL.
280
J. Moeys Annexes
281
J. Moeys Annexes
3 Protocoles de mesure
■ 3.1 Masse volumique apparente au cylindre
282
J. Moeys Annexes
Le cylindre est ensuite posé sur la surface ainsi préparée. Deux dimensions de
cylindres ont été utilisées : des cylindres de 8,4 cm de diamètre intérieur et 9,2 cm de
haut (‘grands cylindres’), et des cylindres de 5 cm de diamètre intérieur pour 5 cm de
haut (‘petits cylindres’). Les premiers ont un volume de 510 cm3, les seconds un
volume de 100 cm3. La partie basse des deux types de cylindres, celle qui est posée
sur le sol, est biseautée de manière à ce que la terre soit tranchée lors de
l’enfoncement du cylindre (et non poussée, ce qui perturberait le prélèvement).
Le diamètre intérieur des grands cylindres est réduit de 1 mm à la base de ce
dernier, sur un centimètre de haut, de manière à limiter la surface de contact entre le
cylindre et le sol lors du prélèvement. La force de cisaillement exercée par le cylindre
sur le sol lors du prélèvement peut en effet provoquer un tassement du sol sous le
cylindre et à l’intérieur de celui-ci. Les cas où de tels phénomènes se produisent sont
repérables visuellement : lorsque le haut du cylindre atteint la surface du sol (autour du
cylindre), le niveau du sol dans le cylindre est plus bas, ce qui montre que le sol s’est
tassé à l’intérieur (ce qui est sans conséquence sur la masse volumique apparente)
et/ou qu’il s’est tassé sous le cylindre (tout le volume initial du sol n’a pas été prélevé,
une partie reste en dessous et la masse volumique est alors sous-estimée, de même
que la teneur en eau volumique).
Une fois posé sur la surface arasée, le cylindre est ensuite enfoncé dans le sol.
Cela peut être effectué à la main, si le sol est suffisamment humide, en exerçant une
pression verticale sur le cylindre. Si le sol n’est pas proche de la saturation, une
embase métallique est posée sur le rebord supérieur du cylindre. Cette dernière a le
même diamètre intérieur, mais elle est plus large que le cylindre. Elle permet de fermer
le dessus du cylindre, et de l’enfoncer un peu au-delà de la surface du sol, du fait de
son volume intérieur. Une embase a été utilisée pour les petits cylindres, mais pas
pour les grands (faute d’en avoir une). Une pièce de bois est posée sur l’embase ou
directement sur le cylindre, et le cylindre est enfoncé en appliquant des coups de
maillets d’intensité modérée, au centre de la pièce de bois.
Une fois complètement enfoncé, le cylindre et le sol qu’il contient sont dégagés en
excavant le sol qui se trouve autour, en dégageant une partie du sol située à un niveau
inférieur à la base du cylindre (mais pas sous le cylindre). Le cylindre est alors extrait
en tranchant horizontalement la terre à 1 cm en dessous, à l’aide d’un long couteau.
La terre dépassant de part et d’autre du cylindre doit être arasée au couteau,
comme lors de la préparation de la surface. Une fois le cylindre arasé, son contenu est
soigneusement vidé dans un sac plastique de type ‘Ziplock’, qui est ensuite fermé
hermétiquement et dûment annoté.
En cas de blocage de l’enfoncement du cylindre par un élément grossier, ou en
cas d’effondrement du sol au prélèvement du fait d’une structure trop peu
cohérente, le prélèvement a été recommencé jusqu’à être satisfaisant.
L’échantillon de sol prélevé est ensuite ramené au laboratoire. Il est placé dans une
barquette en aluminium ou un récipient en porcelaine de poids connu, et pesé (ce qui
donne le poids de sol humide). Les barquettes de sol sont placées dans une étuve à
105°C ventilée, pendant 48 h. Après ce délai, les barquettes de sol sont sorties de
l’étude, refroidies à l’air libre jusqu’à une température compatible avec une
manipulation à la main et pesées (ce qui donne le poids de la phase solide du sol).
Une pesée des échantillons à trop haute température perturbe la mesure.
La masse volumique apparente de chaque couche de sol a été caractérisée,
par le prélèvement d’un grand cylindre et deux petits, soit 3 répétitions. Les
résultats obtenus avec les grands cylindres et avec les petits sont généralement tout à
fait comparables. Les premiers sites mesurés ont parfois eu moins de prélèvements,
du fait de la mise au point méthodologique.
283
J. Moeys Annexes
284
J. Moeys Annexes
49
80 et 220 psi.
50
L’eau du sol qui est retenue à une succion trop faible pour compenser la pression imposée.
285
J. Moeys Annexes
286
J. Moeys Annexes
51
Calculs destinés à passer d’une information brute, directement dérivée d’une mesure, aux paramètres
d’intérêt des processus. Par exemple le passage d’une infiltration cumulée à une valeur de conductivité
hydraulique et de sorptivité.
287
J. Moeys Annexes
288
J. Moeys Annexes
290
J. Moeys Annexes
n/k. La répartition des observations dans les k groupes est effectuée par tirage
aléatoire. On calcule ensuite k régressions successives, avec pour jeu de calibration
les n observations initiales, moins les observations du groupe k. Les observations du
groupe k servent à calculer l'erreur de la ke régression, ce qui constitue une estimation
indépendante. On obtient ainsi k estimations de l'erreur de régression, dont on prend la
valeur moyenne comme estimation de l'erreur de la régression globale. Cette dernière
est calculée en utilisant cette fois le jeu complet des n observations. On voit que
l'erreur est estimée sur des régressions différentes de la régression finale, mais
élaborées avec une sous-partie du jeu de données. Elle est donc supposée proche de
l'erreur de prédiction réelle de la régression finale. Cette méthode est appelée
validation croisée (cross-validation) 'leave-some-out'.
La variante de la validation croisée (cross validation) utilisée est appelée
'leave-one-out' (abrégée 'CV-LOO') car le nombre de sous-groupes k est égal à n.
C'est donc une seule observation qui est mise de côté à chacune des n étapes du
calcul de l'erreur. Cette variante présente quelques limitations sur le plan statistique
(Wold et al., 2001, p. 116), mais elle a l'avantage considérable de donner un résultat
exactement identique pour un même jeu de données, ce qui est très important pour les
étapes décrites dans les paragraphes suivants (choix du nombre de composantes et
sélection des variables). Il est en effet important d'obtenir un résultat 'stable', qui ne
change pas d'un essai l'autre.
Une alternative à la méthode CV-LOO décrite ci-dessus pourrait être l'augmentation
du nombre de répétitions des opérations de cross-validation (répéter les calculs z fois,
avec, chaque fois, un découpage aléatoire en k groupes de taille homogène). Les
techniques de bootstrap sont une alternative et une généralisation de la méthode de
cross-validation. Il s'agit dans ce cas de répéter z fois une opération de tirage aléatoire
séparant les n données initiales en 2 groupes calibration/validation dont la taille est
déterminée à l'avance (si n est faible, il est préférable d'avoir un échantillon de
validation de petite taille par rapport à l'échantillon de calibration), avec à chaque étape
un calcul de l'erreur de prédiction sur l'échantillon de validation. Ces approches
présentent cependant plusieurs inconvénients : il est nécessaire de tester au préalable
le nombre de répétitions z nécessaires pour avoir une estimation de l'erreur ne variant
pas trop d'un essai à un autre (stabilité de l'estimation) ; comme z est souvent élevé
(>> 100 dans notre cas), les temps de calculs peuvent être élevés. C'est pour cette
raison que ces méthodes n'ont pas été utilisées avec la PLSR ou avec les autres
méthodes de prédiction.
6 Transformations de variables :
quelques exemples
■ 6.1 Centrage et réduction d’une variable
Le centrage d’une variable consiste à lui retrancher sa valeur moyenne. La valeur
moyenne de la variable est alors égale à zéro. La réduction d’une variable, aussi
appelée mise à l’échelle, consiste à la diviser par son écart type. L’écart type de la
variable devient est alors égal à un. Si l’on applique les deux transformations, on
obtient une variable centrée réduite (équation 67).
Il ne s’agit pas d’une normalisation puisque cela ne corrige nullement l’asymétrie de
la distribution. Il s’agit plutôt d’une ‘standardisation’ des valeurs et de leur variabilité.
291
J. Moeys Annexes
7 Choix du nombre de
composantes et de variables
pour la PLSR
■ Méthode de sélection du nombre de composantes
A moins de limiter arbitrairement le nombre de composantes calculées par la
fonction PLSR utilisée, cette dernière calcule automatiquement n-2 composantes (n
étant le nombre d'observations utilisées pour le calcul). A chaque composante la
fonction associe une erreur croisée. L'erreur croisée de la composante u correspond
en fait à l'erreur croisée d'une prédiction utilisant les valeurs cumulées des coefficients
des composantes 1 à u. Le nombre de 'composantes cumulées' présentant la plus
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sont parfois corrélées. Elles sont même parfois très liées de part la manière dont elles
ont été obtenues. Les fractions granulométriques non-décarbonatées et décarbonatées
sont ainsi très similaires du fait de la faible quantité (ou de l’absence) de carbonates
dans les échantillons. Les paramètres des fonctions de rétention en eau et de
conductivité hydraulique de Campbell sont très liés aux variables dont elles sont
dérivées : teneur en eau à saturation, à pF 2, à pF 4,2, conductivité hydraulique à -
1 cm...
Pour ces raisons, les variables corrélées & physiquement similaires ont une
importance proche dans la PLSR. Or, lors de la procédure de sélection, le cortège de
variables avec lesquelles sont mises en concurrence les variables ‘liées’ diffère d’une
méthode à l’autre. Il en résulte des choix différents d’une procédure à l’autre. Dans le
cas de la méthode forward, à une étape donnée, une variable est mise en concurrence
avec des variables qui ne sont pas encore intégrées à la PLSR, et elle est utilisée avec
des variables sélectionnées aux étapes précédentes. Dans le cas de la procédure
backward une variable est mise en concurrence et utilisée avec des variables qui n’ont
pas encore été éliminées de la PLSR. Il est donc probable que les étapes initiales de la
sélection backward aboutissent à de mauvais ajustements et/ou une capacité de
prédiction faible (erreur croisée élevée), du fait des nombreuses variables inutiles,
pouvant engendrer l’élimination de variables ‘pertinentes’ (au regard de la sélection
forward).
Un nombre important de variables explicatives au départ semble être un facteur
aggravant ces problèmes. Cela aboutit en tout cas plus fréquemment à des résultats
divergents entre les méthodes forward et backward. Pour cette raison, plusieurs jeux
de variables explicatives de départ, de taille plus limitée que la 50aine de variables
disponibles, ont été constitués. Le paragraphe suivant expose la manière dont ils
ont été constitués.
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8 Histoire géologique et
pédologique du site de
Ouarville : synthèse et
hypothèses
■ 8.1 Histoire géologique pré-glaciaire
Période géologique Climat / Paysage Phénomène
Aquitanien.............. Lacustre ..................... Dépôt du calcaire NG, sur le site :
- faciès gris sur les points hauts. HY, NG.
- faciès blanc crème. HY, NG.
- faciès rosé à meulières (talwegs). HY, NG.
Burdigalien............. Aride .......................... Assèchement NG
Burdigalien............. Climat plus humide .... Dépôts de graviers de Lozère NG = graviers
translucides quartzeux et rosés (de feldspaths
potassiques ?)
Pliocène.................. Climat tiède et ........... Pénéplanation par l’érosion, donne le relief
humide actuel NG
- localement : mélange des graviers de
Lozère au calcaire. HY
- érosion plus accentuée sur les versants
orientés au sud et à l’ouest. HY
- formation par fissuration et dissolution du
réseau karstique dans le calcaire. HY
- en surface, apparition d’avens, voire de
petites dolines. HY
- dans les pentes, les dolines sont plus
caillouteuses, au moins en surface, du fait
des apports locaux par érosion. HY
- sur terrain plat et sous limon épais, les
dolines sont non caillouteuses en surface
et avec plus d’argile de décarbonatation. HY
Pliocène ? .............. ? .............................. Formation de l’argile à meulières HY, piégeage
dans les avens karstiques HY
- souvent : mélange avec les graviers de
Lozère HY.
- Y a-t-il (eu) des orientations de pentes plus
favorables à la formation de ces argiles à
meulières ??
tableau 91 – Histoire géologique pré-glaciaire du site de Ouarville.
HY : hypothèse ; NG : information donnée par la notice de la carte géologique.
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■ Pédogenèse
Depuis approximativement 10 000 ans (IVaire, néogène, holocène), les matériaux
géologiques présents en surface n’ont pas subi de remaniements profonds comme
pendant les périodes glaciaires et périglaciaires. Les processus pédogénétiques ont
progressivement altéré et structuré les matériaux géologiques meubles de surface.
– Décalcification de la couverture limoneuse, sauf en cas de présence d’éléments
grossiers calcaires. HY
– Brunification et structuration de la couverture limoneuse. HY
– Structuration des horizons argileux de décarbonatation ou à meulières. HY
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figure 96 – Les différents types de variables utilisées par les modèles informatiques de
transferts de pesticides.
Inspiré du schéma conceptuel et du glossaire des Good Modelling Practice (STOWA-RIZA,
1999).
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◊ Abstract
Keywords: Soil; herbicide; isoproturon; spatial variability; determinisms; adsorption;
degradation; hydraulic properties; immobile water fraction.
Diffuse pollution of groundwater bodies by pesticides is a critical environmental
issue. Approaches designed to spatially modulate the applied pesticide dose, as a
function of pesticide leaching risks down the soil, seem to be appealing solutions. In a
research context, such approaches require a mapping of soil hydropedologic properties
and of pesticides adsorption and degradation properties, in order to be able to model
molecules fate in soils. The PhD work presented here deals with the first step of such
approach: the characterisation of soils properties and an herbicide molecule -
isoproturon - fate properties in soil at the scale of a 2600 ha agricultural area in the
Beauce chartraine region.
The PhD objectives hold in 3 parts: [i] characterising the spatial variability of soils
pedological, physico-chemical and hydraulic properties (water retention, hydraulic
conductivity KSAT, immobile water fraction fIMM), as well as isoproturon adsorption (KD)
and degradation (DT50) properties in the topsoil of the studied area; [ii] Identify the
agronomical and/or pedological determinisms of properties that are important for
pesticides fate in soils; [iii] Calibrate and test pedotransfer classes or functions in
order to predict important properties using simpler agronomical and/or pedological
properties.
Soils in the studied area have intermediate thickness and are derived from an
aeolian loess that stands on a frost cracked and cryoturbed limestone. The topsoil of
34 sites has been characterised, with a systematic measurement of the seedbed
properties, and a partial measurement of the rest of the cultivated layer. Among the 50
layers / samples that were characterised, one-third holds in no-tillage fields. With the
exception of bulk density, soil physico-chemical properties are moderately variable
(notably clay and CaCO3 contents). If the water holding properties and isoproturon KD
are moderately contrasted too, soil fIMM, and KSAT, as well as isoproturon DT50 are
highly variable. An important ‘method effect’ has been identified when treating the
measurements results of these two last variables. A ‘robust’ direct fitting procedure has
been established for KSAT computation, and a direct fitting procedure has been applied
for DT50 estimation. This last method does not solve the critical lack of correspondence
between a degradation kinetics that was indeed biphasic and the first order equation
used by pesticide fate models.
A close look at the statistical relations that exist between variables with both
parametric and non-parametric methods revealed coherent but weak links (and thus
potentially determinisms) between the variables: an important part of the spatial
variability is not explained by the measured agro-pedological variables. The
impossibility of calibrating local classes or pedotransfer functions with a satisfying
prediction error arises as a logic, but problematic, consequence of this ‘undetermined’
variability of soils and isoproturon fate variability. It is only possible to consider a KD or
KOC prediction. It does not seems to be possible to predict – and so to spatialize – the
other important properties influencing isoproturon fate in the topsoil of the studied area,
using the measured properties together with the statistical analysis tested.
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◊ Résumé
Mots clé : Sol ; herbicide ; isoproturon ; variabilité spatiale ; déterminismes ; adsorption ;
dégradation ; propriétés hydriques ; fraction d’eau immobile.
La pollution diffuse des nappes phréatiques par les pesticides pose un problème
environnemental critique. Les approches visant à moduler spatialement la dose de
pesticide apportée en fonction des risques de transfert des molécules phytosanitaires à
travers le sol sont a priori une solution séduisante. Dans un cadre de recherche, ces
approches requièrent une connaissance spatialisée des caractéristiques
hydropédologiques du sol, de l'adsorption et de la dégradation des molécules
phytosanitaires, afin de pouvoir modéliser le comportement des molécules. Le travail
de thèse présenté ici porte sur la première étape d'une telle démarche, la
caractérisation des propriétés du sol et d’une molécule herbicide – l’isoproturon – à
l’échelle d’un secteur agricole de 2600 ha de Beauce chartraine.
Les objectifs de la thèse se décomposent en 3 parties : [i] Caractériser la variabilité
spatiale des propriétés pédologiques, physico-chimiques et hydriques du sol (rétention
en eau, conductivité hydraulique KSAT, fraction d'eau immobile fIMM), ainsi que les
propriétés d’adsorption (KD) et de dégradation (DT50) de l’isoproturon dans l’horizon de
surface du secteur agricole étudié ; [iii] Identifier les déterminismes agronomiques
et/ou pédologiques des propriétés importantes pour le comportement des pesticides
dans les sols ; [iv] Établir et tester des classes et des fonctions de pédotransfert
permettant de prédire ces propriétés déterminantes à partir de propriétés
agronomiques ou pédologiques plus simples.
Les sols de ce secteur sont des sols moyennement épais développés dans un limon
éolien reposant sur un calcaire gélifracté et cryoturbé. L’horizon de surface de 34 sites
a été caractérisé, avec une détermination systématique des propriétés du lit de
semence, et une détermination partielle du reste de l’horizon travaillé. Sur les 50
couches / échantillons de sol caractérisés, un tiers se trouvent dans des parcelles en
travail simplifié (sans labour). À l’exception de la masse volumique apparente, les
propriétés physico-chimiques du sol sont peu variables (teneur en argile et en
CaCO3 notamment). Si les propriétés de rétention en eau et le KD de l’isoproturon sont,
elles aussi, modérément contrastées, la fIMM, la KSAT, et la DT50 de l’isoproturon sont
très variables. Un ‘effet méthode’ conséquent a été identifié pour l’interprétation des
résultats des mesures de ces deux dernières propriétés. Une procédure d’ajustement
direct ‘robuste’ des données d’infiltration a été mise au point pour calculer le KSAT, ainsi
qu'une procédure d’ajustement direct des données de dégradation pour le calcul de la
DT50 de l'isoproturon, mais elle ne résout pas l’inadéquation critique entre la cinétique
de dégradation ‘effectivement’ biphasique observée pour la molécule et le modèle
d’ordre 1 utilisé par les modèles pesticides. Une étude attentive des liens statistiques
entre les propriétés par des méthodes paramétriques et non-paramétriques révèle des
liens (et donc des déterminismes potentiels) cohérents mais peu marqués entre les
propriétés : une part importante de la variabilité spatiale n’est pas expliquée par les
propriétés agro-pédologiques mesurées. La conséquence logique, mais problématique,
de cette variabilité ‘indéterminée’ des propriétés du sol et de l’isoproturon est
l’impossibilité d’établir des classes ou des fonctions de pédotransfert locales avec une
erreur de prédiction satisfaisante. Seule la prédiction du KD, ou du KOC, peut être
envisagée. Avec les propriétés mesurées et les méthodes d’analyse testées, il ne
semble pas possible de prédire – et donc de spatialiser – les autres propriétés
importantes pour le devenir de l’isoproturon dans l’horizon de surface de ce secteur.
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