Chapitre 5 Cultures Cellulaires
Chapitre 5 Cultures Cellulaires
Chapitre 5 Cultures Cellulaires
1BBM – 1BCH
Année Académique
2023-24
S02E02 : Les transferts de gènes: Take home message
Les 3 principaux types de transfert naturel de gènes chez Chez les eucaryotes, le transfert horizontal des gènes
les procaryotes sont : est extrêmement rare naturellement (il a été courant
- La transformation : une cellule compétente absorbe de au début de l’histoire de la vie).
l’ADN exogène
- La conjugaison : Transfert d’un brin d’un plasmide d’une
bactérie donneuse vers une receveuse via le pilus sexuel
- La transduction : Transfert de matériel génétique par
l’intermédiaire d’un bactériophage Au laboratoire, la transfection (analogue à la
transformation bactérienne) est souvent utilisée pour
introduire des acides nucléiques dans des cellules
Au laboratoire, la transformation est souvent utilisée pour eucaryotes.
introduire un plasmide dans une bactérie. La transduction, à l’aide d’un virus, est également
La transduction est également utilisée. utilisée.
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Biologie 2
Thème : le vivant, les cellules
Genre: Docu-séries, Intrigues, sciences et nature
Programme: émotions, sensations fortes
Réalisation : Asmar - Duprez
•S02E01: Reproduction, cellules souches, hérédité humaine et hérédité des populations (7h)
•S02E02: Transfert génétique chez les procaryotes et chez les eucaryotes (2h)
•S02E03: Culture cellulaire eucaryote et culture bactérienne (2h)
•S02E04: Identification bactérienne (2h)
•S02E05: Antibiotiques et résistance (2h)
•S02E06: Biotechnologie et applications (5h)
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S02E03:
La culture cellulaire eucaryote et la culture
bactérienne
Saison 02
Episode 02
A l’issue de cet épisode, vous devrez être capable de…
❑ Définir la culture cellulaire
❑ Expliquer les étapes de la culture cellulaire
❑ Expliquez les précautions de stérilité à prendre lors de la culture cellulaire
❑ Dessinez la courbe de croissance des cellules + expliquez les différentes phases
❑ Décrire les constituants d’un milieu de culture de cellules eucaryotes
❑ Décrire une hotte à flux laminaire et un incubateur
❑ Expliquez les différents milieux de culture pour les bactéries
❑ Expliquez l’influence des facteurs environnementaux sur la culture des procaryotes
concrètement au laboratoire
❑ Décrire les méthodes de mesure de la croissance cellulaire
AAS2
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : plan de l’épisode
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La culture cellulaire : origine et définition
La culture cellulaire est un procédé qui permet aux cellules de se reproduire en dehors de
leur milieu de vie naturel ou de l'organisme dont elles proviennent.
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La culture cellulaire : origine et définition
Mais pourquoi cultiver des cellules?
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : plan de l’épisode
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
Une fois prélevée, les cellules doivent être placées dans un milieu de culture qui répond à
leurs besoins.
Un milieu de culture se définit donc comme un milieu dans lequel on trouve tous les
éléments nécessaires à la croissance de cellules mises en culture.
https://www.alloprof.qc.ca/fr/eleves/bv/sciences/la-culture-cellulaire-s1464 14
La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
Pour la survie et la croissance des cellules, les conditions physico-chimiques du milieu de vie
d’origine des cellules doivent être reproduites.
- La T°
- La pression atmosphérique
- L’humidité
- Le pH
- La composition en nutriments et en minéraux
- La [O2]
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
Dans un incubateur :
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
Pour ce faire, de nombreux traitements existent pour stériliser le matériel utile au travail.
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La culture cellulaire : Les différentes étapes
1 : Obtenir les cellules
2 : Les placer dans un milieu de culture approprié
3 : Reproduire les conditions du milieu de vie d'origine des cellules
Toutes les procédures nécessaires à la culture cellulaire nécessitent un travail en milieu stérile, c'est-à-dire un milieu exempt de tout micro-organisme vivant.
Pour ce faire, de nombreux traitements existent pour stériliser le matériel utile au travail.
Les agents physiques :
➢La chaleur humide : l’autoclave (20 min. à 121°C). Ex : milieu de culture
➢La chaleur sèche : le four (2 à 3h à 170-180°C) ou la flamme → moins efficace que la chaleur
humide
➢Le rayonnement :
➢les rayons UV : cassent l’ADN. Ex : pièce de labo
➢Les radiations ionisantes : pénètrent en profondeur dans les objets
➢La filtration : avec un filtre qui contient des pores très étroits (0,02 µm (virus); 0,2 à 0,45 µm
(bactéries)) : Ex : liquide ne pouvant être chauffés
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : plan de l’épisode
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La courbe de croissance des cellules
Phase de latence/d’adaptation : Il n'y a pratiquement pas
de croissance cellulaire puisque les cellules s'adaptent à
leur nouvel environnement et s'y installent.
- Les congeler
- Les repiquer, càd les transférer dans
un milieu de culture frais
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La culture des cellules eucaryotes
Les cellules eucaryotes en culture peuvent être :
- adhérentes : La plupart des cellules dérivées des tissus de l’organisme ont besoin d’une surface
ou d’une matrice extracellulaire pour assurer leur croissance et leur prolifération normale :
!!! Plastique traité avec capacité d’adhérence!!!
- en suspension : certaines cellules n’ont pas besoin d’adhérer à une surface pour se multiplier.
- des lignées cellulaires : cellules ayant la capacité de division non limitée : cellules cancéreuses
ou cellules saines rendues immortelles artificiellement
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La culture des cellules eucaryotes
Les milieux de culture des cellules eucaryotes : 2 types d’éléments
1 : Une base dont la composition chimique est connue : nutriments + électrolytes ajustés à
un pH défini
→ Les nutriments (macro et micro) assurent la survie cellulaire en fournissant les molécules
requises comme éléments structuraux pour la biosynthèse de certaines molécules et pour le
métabolisme énergétique
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La culture des cellules eucaryotes
Les éléments de base d’un milieu de culture pour les cellules eucaryotes :
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La culture des cellules eucaryotes
Le sérum (plasma sans les éléments coagulants du sang) :
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La culture des cellules eucaryotes
→ Une fois les cellules eucaryotes obtenues, les différentes étapes de la culture des cellules
eucaryotes se réalisent sous une hotte.
!!! Les hottes pour la culture des cellules sont différentes des hottes utilisées en chimie!!!
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La culture des cellules eucaryotes
En Biologie : les hottes
à flux laminaire puisent
l’air environnant et le
filtrent avant de le
pousser vers l’intérieur
de la hotte. L’air stérile
est ainsi projeté sur le
matériel, réduisant les
risques de
contamination.
https://www.alloprof.qc.ca/fr/eleves/bv/sciences/la-culture-cellulaire-s1464 30
La culture des cellules eucaryotes
Une fois mise en contact avec le milieu de culture, les cellules sont placées dans un incubateur.
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Vidéo : les cultures cellulaires
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : plan de l’épisode
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Un milieu de culture de base
➢Digestion pancréatique de caséine (riche en peptides à chaines courtes et aa) Acides aminés et composés
➢Digestion enzymatique de farine de soja (aussi peptones) azotés complexes
➢Glucose → Source d’énergie et de C
➢Chlorure de sodium (0,5%) → équilibre osmotique
➢Phosphate dipotassique → Tampon
➢Eau distillée stérile
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Extrait de la fiche
technique du TSB
de la firme Becton
Dickinson
https://www.bd.com/europe/
regulatory/Assets/IFU/HB/CE/
BA/FR-BA-257107.pdf
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Milieu liquide vs. Milieu solide
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Bactérie vs. colonie
➢Une bactérie est invisible (µm) à l’œil nu!
➢Après culture dans des conditions favorables, les bactéries se développent, il y en a beaucoup
et des colonies deviennent visibles
Technique de l’isolement!
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Milieu naturel vs. Milieu synthétique
➢Milieu naturel = milieu préparé à partir d’un extrait naturel (caséine, soja,…) ayant subi une
digestion enzymatique.
→On ne connait pas exactement les concentrations précises des différents composés
→Très utilisé quand on ne sait pas exactement quelle bactérie on cultive (ex : échantillons biologiques)
➢Utilisé quand on connaît la bactérie à cultiver (ex : recherche d’une bactérie pathogène spécifique)
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Milieux riches
➢Pq? Certaines bactéries sont plus exigeantes et ont besoin de certains facteurs pour pousser.
➢Un exemple : Columbia sang = milieu de base + sang (de mouton, de cheval,…)
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Milieux sélectifs
➢C’est quoi? Milieux qui permettent la croissance de certaines espèces bactériennes à l’exclusion
d’autres espèces.
➢Agents sélectifs : Antibiotiques, cristal violet, sels biliaires,…
➢Exemple :
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Milieux différentiels
➢C’est quoi? Milieux qui permettent de distinguer différentes bactéries en mettant en évidence un
caractère biochimiques. La distinction se fait de manière visuelle par la couleur de la colonie ou du milieu
autour de la colonie.
➢Exemple : Le Mac Conkey :
Il met en évidence le caractère : fermentation du lactose par la présence de lactose dans le milieu et d’un
indicateur de pH (rouge neutre).
Fermentation du lactose → Acidification du milieu → virage de de l’indicateur au Rose
https://microbeonline.com/macconkey-agar-mac-composition-preparation-uses-and-colony-characteristics/ 41
Extrait de la fiche technique du Mac Conkey de la firme BioRad
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Extrait de la fiche technique du Mac Conkey de la firme BioRad
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Milieux chromogènes
➢C’est quoi? Milieux contenant un substrat chromogène
Suite à la dégradation par des enzymes bactériennes, le substrat libère un composé coloré
http://bio-rad.com44
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https://www.chromagar.com/notre-societe/technologie-chromogene/
Extrait de la fiche
technique du MRSA
Select II de la firme
BioRad
Extrait de la fiche
technique du
Selenite Cystine
Broth de la firme
BD
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Les milieux de culture
➢Les milieux liquides de base
➢Les milieux solides de base
➢Les milieux riches
➢Les milieux sélectifs
➢Les milieux différentiels
➢Les milieux chromogènes
➢Les milieux d’enrichissement
Sont tous utilisés quotidiennement dans un laboratoire de microbiologie médicale.
Selon le type de prélèvement (et donc le type de pathogène recherché), on choisit les milieux
à ensemencer
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La croissance en fermenteur
Un fermenteur est un appareil dans
lequel on multiplie des micro-
organismes (bactéries, levures,
champignons microscopiques,…) pour
la production de biomasse (masse
totale d’organismes vivants dans un
lieu déterminé) ou pour la production
d’un métabolite ou encore la
bioconversion d'une molécule
d'intérêt.
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La croissance en fermenteur
En industrie : afin d’augmenter le rendement en industrie, on utilise des fermenteurs : un système de culture en masse.
➢Permet la production d’une biomasse. En + : Ajustement du pH, de la t°, stérilisation du milieu,… s’effectuent dans des
conditions rigoureusement contrôlées. Les ordinateurs permettent de suivre les informations fournies par les sondes : mesure de
la biomasse, concentrations de produits métaboliques,…
➢Fréquemment on ajoute un composant essentiel du milieu (ex : glucose), de façon continue : alimentation continue : permet de
maintenir les microorganismes en phase logarithmique.
Ex : - Industries de fermentation (éthanol) ;
- Production de vaccins.
- Production d’antibiotiques
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Les facteurs environnementaux
La croissance des micro-organismes est considérablement influencée par la nature chimique et physique de
l’environnement. Une compréhension de l’influence du milieu aide à contrôler la croissance microbienne et à étudier la
distribution écologique des micro-organismes.
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Les facteurs environnementaux
➢La pression osmotique
Selon les micro-organismes, les capacités
Rappel : d’adaptation diffèrent
Membrane cytoplasmique perméable sélective
Vibrio sp.=
halophile
Solution hypotonique
H2O
BACTERIES PLUS RESISTANTES QUE physiologique
CELLULES EUCARYOTES!!
http://s3.e-monsite.com/2011/01/26/10/pression-osmotique.jpg 52
Les facteurs environnementaux
➢Le pH
0 5,5 8 14
acidophiles NEUTROPHILES Alcalophiles (extrêmes)
(6,5-7,5)
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Les facteurs environnementaux
➢La température
Elle influence particulièrement les réactions catalysées par les enzymes et aussi les membranes.
Optimale
Vitesse de croissance
Maximale
Minimale
Température
« Microbiologie », Prescott,
54 de Boeck
Les facteurs environnementaux
➢La température
Elle influence particulièrement les réactions catalysées par les enzymes et aussi les membranes.
« Microbiologie », Prescott,
55 de Boeck
Les facteurs environnementaux
➢L’oxygène
→ L’importance de l’oxygène pour la croissance d’un organisme est corrélée à son métabolisme.
Les aérobies strictes : exigent de l’oxygène (21%) pour leur développement. Ex : Pseudomonas sp.
Les microaérophiles : ne se développent qu’en présence d’une faible concentration en oxygène (2 à
10%). Ex : Campylobacter sp.
Les ana/aérobies facultatifs : n’ont pas besoin d’oxygène pour croître mais se développent mieux en
sa présence et utiliseront alors la respiration aérobie. Ex : Streptococcus sp.
Les anaérobies aérotolérants : peuvent se développer en présence d’oxygène mais ne l’utilisent
pas, ils pratiquent la fermentation. Ex : Enterococcus sp.
Les anaérobies strictes : sont inhibés ou tués en présence d’oxygène. Ex : Clostridium sp.
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Les facteurs environnementaux
➢L’oxygène
Concentration en O2
Les microaérophiles 4
Les ana/aérobies facultatifs 3
Les anaérobies aérotolérants 5
Les anaérobies stricts 2
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Les facteurs environnementaux
Bio 2 - 2
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Les facteurs environnementaux
➢L’oxygène : Au labo
Les microaérophiles
Les aérobies stricts
Les anaérobies stricts
Les ana/aérobies facultatifs
Les anaérobies aérotolérants
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Les facteurs environnementaux
La croissance des micro-organismes est considérablement influencée par la nature chimique et physique de l’environnement.
Une compréhension de l’influence du milieu aide à contrôler la croissance microbienne et à étudier la distribution écologique
des micro-organismes.
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : plan de l’épisode
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules totales
➢Mesure directe du nombre de cellules viables
➢Mesure de la masse cellulaire
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules totales :
1. Au moyen d’une chambre de comptage
Matériel : un microscope + une cellule de comptage (type Burker, Thoma, de Petroff-Hausser,..)
→ On utilise des colorants fluorescents (DAPI, SYBR Green) qui colore l’ADN et le comptage se fait alors
sous un microscope à fluorescence
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La mesure de la croissance des cellules
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La mesure de la croissance des cellules
http://www.cours-examens.org/images/An_2013_2/Etude_superieure/Medecine/Cytologie/Mosta/COURS%20-%2013%20-%20Cytom%C3%A9trie%20en%20flux.pdf65
La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules totales
Problèmes de ces 2 techniques?
On compte toutes les cellules (les vivantes ET les mortes)!!!
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules totales
➢Mesure directe du nombre de cellules viables
➢Mesure de la masse cellulaire
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules viables
Culture en milieu solide : seules les cellules viables vont se reproduire
Par étalement
On exprime les résultats en UFC (Unités formatrices de colonies)/ml : car on ne peut affirmer que chaque
colonie a pour origine une seule cellule!!
« Mini Manuel de Microbiologie68», Prieur, Dunod
La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules viables
Culture en milieu solide : seules les cellules viables vont se reproduire : Par inclusion
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure directe du nombre de cellules totales (cellules de comptage, cytométrie en flux)
➢Mesure directe du nombre de cellules viables (croissance sur boite de Petri)
➢Mesure de la masse cellulaire
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure de la masse cellulaire
+++ cellules → +++ suspension trouble → +++ lumière dispersée → +++ Absorbance (ou Densité Optique)
spectrophotomètre
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La mesure de la croissance des cellules
En 1907, Mc Farland a mis au point une série
de solutions de sulfate de baryum permettant
d’estimer le nombre de bactéries présentes
➢Mesure de la masse cellulaire : l’échelle de Mc Farland dans des solutions de turbidité équivalente.
= standards de turbidité : très utilisé pour tester l’effet des antibiotiques sur les bactéries!
0,5 1 2 Mc Farland
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La mesure de la croissance des cellules
➢Mesure de la masse cellulaire
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S02E03 : La culture cellulaire, la culture bactérienne et la physiologie
bactérienne : Take home message
➢ La culture cellulaire est un procédé qui permet aux cellules de se
reproduire en dehors de leur milieu de vie naturel ou de l'organisme
dont elles proviennent.
➢ Elle nécessite l’obtention des cellules, le choix d’un milieu de culture
approprié, l’incubation dans un environnement approprié et le respect
de la stérilité
➢ Un milieu de culture contient les éléments essentiels à la survie et la
croissance des cellules, il existe de nombreux milieux de culture
différents en fonction de l’utilisation voulue
➢ La phase exponentielle de croissance des cellules est la phase où l’on
étudie les cellules
➢ Diverses méthodes permettent de compter les cellules
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S02 E04:
L’identification bactérienne
Rendez-vous au
4ème épisode…