Cours de Nématologie - GENERALITES
Cours de Nématologie - GENERALITES
Cours de Nématologie - GENERALITES
Dr Bouma THIO
INERA/DRREA-Ouest/Station de Farako-Bâ
Tél. 70313722; Email : [email protected]
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PLAN DE LA PRESENTATION
1.Introduction
2.Historique
3.Classification des nématodes
4.Morphologie des nématodes
5.Reproduction chez les nématodes
6.Développement chez les nématodes
7.Stratégie de survie des nématodes
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INTRODUCTION
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INTRODUCTION
Le mot « nématode » vient du Grec « nema » (fil) et « oides »
(en forme). Les nématodes sont des animaux filiforme à
symétrie bilatérale;
Les nématodes (vers ronds et effilés) font partie
de l’embranchement des vers non segmentés et
classés parmi les ecdysozoaires;
La Nématologie est une branche importante de la science
biologique regroupant un groupe important de vers connus
sous le nom de nématodes;
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INTRODUCTION
✓ Les nématodes jouent un rôle important la diversité
biologique sur terre et constituent, en nombre
d'individus, les 4/5 du règne animal; on les trouve
dans les sols du monde entier, mais ils sont plus
nombreux en zone subarctique (38 %), tempérées
(24 %), devant les régions tropicales (21 %) ;
✓ Les nématodes décrits sont compris entre 15.000 et
25.000 espèces sur une estimation d’environ 500.000
subdivisées en 4 groupes:
• les nématodes marins : 50%
• les nématodes libres du sol : 35%
• les nématodes parasites des plantes : 10%
• les nématodes parasites de l’homme : 5%
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INTRODUCTION
✓ La nématofaune désigne les différentes espèces de
vers nématodes présents dans un espace donné;
✓ Les nématodes libres dans le sol sont souvent non
parasites et peuvent être fungivores, bactérivores,
détritivores ou prédateurs; ces nématodes sont les plus
nombreux et la plupart contribuent au bon
fonctionnement des agrosystèmes et en sont des
bioindicateurs jouant un rôle importants dans les
cycles du sol et des plantes dont ils stimulent la
croissance en améliorant le cycle des nutriments;
✓ Certains causent des dégâts sur les végétaux et sont
désignés nématodes parasites des plantes;
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INTRODUCTION
✓ Certains parasitent l’homme et les animaux (dans ce
dernier cas, ils sont le plus souvent des parasites gastro-
intestinaux et ne font pas l’objet de ce cours).
✓ Le mot Helminthologie est plus usité pour désigner les
nématodes parasites des hommes et des animaux;
✓ Les nématodes qui parasitent l’homme ont été décrits
bien avant l’ère chrétienne;
✓ Exemple: Ascaris lumbricoides parasite de l’homme
✓ Autres nématodes parasites (oxyures, filariose,
dracunculose, …)
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HISTORIQUE
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HISTORIQUE
✓ Les nématodes parasites de
l’homme et des animaux
ont été découverts bien
avant l’ère chrétienne;
✓ Les nématodes parasites
des plantes ont été
découverts beaucoup plus
tard grâce à l’invention du
microscope par l’Anglais
Robert Hooke (1635-1703)
✓ et le néerlandais Anthony
van Leeuwenhoek (1632-
1723)
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HISTORIQUE
✓ Le premier nématode décrit
est l’anguillule du vinaigre
ou ver du vinaigre, Turbatrix
aceti
✓ est un nématode de l'ordre
des Rhabditida qui se
nourrit des micro-
organismes constituant
la mère du vinaigre
✓ On peut les trouver dans du
vinaigre non-filtré ; ces vers
n'ont pas d'effet sur la
santé humaine.
HISTORIQUE
✓ Le laboratoire de Nématologie de l’INERA/Farako-Bâ
dispose d’infrastructures performantes pour l’extraction
des nématodes parasites des cultures;
✓ L’extraction des nématodes présents dans le sol est
faite selon la méthode dite de l’élutriateur de Seinhorst
(1962) et celle des nématodes présents dans les
racines par la méthode de l’asperseur de Seinhorst
(1950)
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HISTORIQUE
✓ Laboratoire est équipé pour l’identification et le comptage
des nématodes parasites des cultures
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CLASSIFICATION DES NEMATODES
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CLASSIFICATION DES NÉMATODES
Le règne animal est divisé en 2 groupes
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CLASSIFICATION DES NÉMATODES
✓ Les diblastiques : 2 couches cellulaires
(ectoderme et endoderme)
• Ectoderme qui va donner naissance à la cuticule
• Le tube digestif est vide à l’intérieur, l’alimentation du
nématode se faisant par simple absorption des
éléments dissouts;
• ce sont des animaux primitif
Ectoderme
Endoderme
Intestin Mésoglée
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CLASSIFICATION DES NÉMATODES
Nematoda
Adenophorea Secermentea
Desmoscolecida Camallanida
Mononchida
Stichosomida Monhysterida
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Les nématodes entomopathogènes
✓ Les Mermithidae sont une famille de vers nématodes qui sont des
endoparasites chez les arthropodes, les crustacées, les annélides,
etc..
✓ Au moins 25 espèces parasites les larves de moustiques et
peuvent être utilisées en lutte biologique; ils peuvent atteindre
20mm;
✓ Ils infestent également la simulie (Simulium damnosum)
✓ Plusieurs Mermithidae ont été observées sur les larves de la
chenille légionnaire d’automne (CLA) chez laquelle le nématode
peut atteindre 20cm;
✓ Souvent le 3ème stade larvaire est le stade infestant et le
nématode est ingéré lors de l’alimentation de l’insecte.
Les nematodes libres du sol
Les nématodes libres du sol
✓ Les nématodes libres du sol (non parasites des plantes)
sont présents dans tous les milieux et climats et
contribuent pour beaucoup à l’activité biologique des
organismes;
✓ Les nématodes libres du sol sont sont les animaux les
plus importants de la faune du sol et représentent 35%
de l’ensemble des nématodes;
✓ Ils jouent un rôle important dans la décomposition de la
matière organique avec des densités de populations
pouvant atteindre 1 à 10 millions/m2 dans les pays
tropicaux (Lavelle et Spain, 2001);
Les nématodes libres du sol
Abondance de la nématofaune du sol par m2 (sol européen)
Les nématodes libres du sol
✓ Leur présence en nombre et de façon équilibrée entre les différents
régimes alimentaires est donc synonyme d’un bon fonctionnement du
sol : ils peuvent être:
• La présence des bactérivores et fongivores renseignent sur la
santé du réseau trophique du sol : leur présence indique celle, en
masse, de leurs proies, offrant elles-mêmes d’autres services
écologiques (recyclage des nutriments et des résidus végétaux par
exemple).
• Enfin la faible présence des omnivores reflète les perturbations
physiques ou chimiques du milieu.
✓ Par contre la présence de nématodes phytoparasites indique un
manque de couverture végétale (lorsqu’une couverture végétale est
présente, ils sont remplacés par des nématodes ayant d’autres régimes,
inoffensifs pour les cultures).
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Les nématodes parasites des plantes
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Les nématodes parasites des plantes
■ Classe des Secernentea (phasmidia)
✓ L’ordre des Aphelinchina regroupe
les nématodes foliaires :
• Morphologie: petite à moyenne
taille (0,4-1,2 mm),
• Nématodes minces.
• Lobe de la glande œsophagienne
chevauchant l'intestin
dorsalement.
• Rassemble essentiellement les
nématodes foliaires
• Compte 2 genres : Aphelenchoides
et Bursaphelenchus
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Les nématodes parasites des plantes
✓ L’ordre des Aphelinchina / Aphelenchoides spp.
▪ Ces nématodes causent des dégâts sur plusieurs plantes cultivées comme le
riz, l’arachide, les fraises, etc.
o Sur le riz, les dégâts sont reconnaissables par une décoloration des
extrémités de la feuille (couleur blanchâtre) pouvant se torsader et
devenir sèches;
o Sur l’arachide le nématode provoque une décoloration des gousses
et les graines infectées par les nématodes sont rétrécies et
foncées;
o Sur la fraise le nématodes provoque des lésions étroites sur les nervures
parallèles et les feuilles brunissent et tombent;
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Les nématodes parasites des plantes
✓ L’ordre des Aphelinchina / Bursaphelenchus spp.
• Bursaphelenchus cocophilus cause
des dégâts importants sur le cocotier
et le palmier dans les zones de
production;
• Les dégâts se manifestent sous forme
d’anneau rougeâtre au niveau du tronc
de l’arbre et la chute des feuilles chez
le cocotier/palmier.
• Le vecteur du nématode est un
scarabée
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Les nématodes parasites des plantes
✓ L’ordre des Aphelinchina / Bursaphelenchus spp.
• Bursaphelenchus
xylophilus causent la
mortalité des
pins/sapins en Europe et
en Amérique du Nord;
• Le vecteur du nématode
est un scarabée.
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Les nématodes parasites des plantes
❑ Classe des Secernentea (phasmidia)
✓ Ordre des Tylenchina regroupent les
nématodes attaquant le système racinaire
– Ce sont des animaux vermiformes dont la
longueur varie généralement entre 0,2 à
1mm mais ils peuvent atteindre
occasionnellement 4mm
– Chez certains genres, les femelles peuvent
être obèses ou globuleuses
– Rassemble les nématodes les plus étudiés
car regroupant la presque totalité des
nématodes parasites des plantes (plus de
80%);
– Regroupe les nématodes les
dommageables aux cultures;
– Exemple: Meloidogyne, Heterodera,
Pratylenchus, Rotylenchulus,
Hirschmanniella 40
Les nématodes parasites des plantes
❑ Classe des Secernentea/ Ordre des Tylenchina/nématodes à galles du genre
Meloidogyne
✓ Les nématodes à galles du genre Meloidogyne sont considérés comme les plus
dommageables aux cultures principalement maraîchères;
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Les nématodes parasites des plantes
❑ Classe des Secernentea/ Ordre des Tylenchina/nématodes à galles du genre
Meloidogyne
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Les nématodes parasites des plantes
En fonction de la morpho-biométrie et
des outils modernes
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Les nématodes parasites des plantes
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En fonction du mode de parasitisme
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Les nématodes parasites des plantes
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Les nématodes parasites des plantes
✓ Les semi-endoparasites :
• La partie antérieure du
corps pénètre dans la
racine alors que la partie
postérieure reste à
l’extérieur du corps.
• A ce type de parasite
appartiennent surtout les
espèces du genre
Rotylenchulus,
Tylenchulus
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Les nématodes parasites des plantes
✓ Endoparasites migrateurs
• Envahissent le tissu
racinaire en entrant
entièrement
• Se nourrissent directement
Pratylenchus dans racines
après pénétration dans la de maïs
racine ou migrent à
l’intérieur et se fixent sur
un site préférentiel pour se
nourrir (cortex ou
parenchymes cellulaires) Radopholus similis dans
racines de bananier
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Les nématodes parasites des plantes
✓ Endoparasites sédentaires
Nématodes à galles
Nématodes à kystes
Meloidogyne
Heterodera
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Les nématodes parasites des plantes
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MORPHOLOGIE DES NEMATODES
Morphologie générale d’un nématode phytoparasite
(Coyne et al., 2010)
✓ Les nématodes ont généralement une
forme allongée entourés d’une cuticule
pour les transferts gazeux; la bouche
avec le stylet se trouve dans la
antérieure et l’anus dans la partie
postérieure.
✓ Deux faces :
• Dorsale;
• Sur la face ventrale : orifice excréteur
dans la partie antérieure; la vulve et
anus chez la femelle et cloaque et
spicules/bourse chez le mâle;
1. Nématode
femelle
2. Nématode
mâle
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REPRODUCTION CHEZ LES NEMATODES
La reproduction chez les nématodes
Deux (2) modes de reproduction sont principalement observés
chez les nématodes parasites:
1. L’amphimixie : les sexes sont séparés avec existence de
mâle et de femelle
2. La parthénogenèse : le mâle est absent ou il est non
fonctionnel ou enfin il est très rare
NB: Un autre type de reproduction est l'hermaphrodisme, où le
spermatocytes et l’ovocyte sont produits par le même
individu.
La reproduction chez les nématodes
Le déterminisme sexuel
➢ Les nématodes femelles sont homozygote
(génétiquement XX) et les mâles sont hétérozygotes
(parfois XO ou XY).
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La reproduction chez les nématodes
L’amphimixie
La reproduction chez les nématodes
Définition de l’amphimixie
➢ Les œufs passent à travers la vulve et se retrouvent dans le sol ou les tissus
végétaux (racines, feuilles, talles, etc.)
La reproduction chez les nématodes
➢aux faibles distances parcourues par les nématodes (15m par an) et difficultés
de rencontrer des nématodes femelles
La reproduction chez les nématodes
La parthénogenèse
La reproduction chez les nématodes
La parthénogenèse méiotique
La reproduction chez les nématodes
La parthénogénèse cyclique :
✓ les femelles produiront des femelles (en
conditions favorables),
✓ lorsque les conditions environnementales
se dégradent, elles produisent alors des
mâles capables de produire des œufs
résistants via la reproduction sexuée.
La reproduction chez les nématodes
✓ Avantages:
➢ la reproduction parthénogénétique
assurée par les nématodes femelles
permet une production d'individus plus
grande sur un faible nombre de
générations ;
➢ une plus grande compétitivité est
observée pour ce mode de reproduction
pour le substrat (plante).
La reproduction chez les nématodes
✓ Désavantages :
✓ faible diversité au sein des générations
de populations de nématodes car
absence de mâle nécessaire à
l’enrichissement du patrimoine
génétique ;
✓ faible adaptation aux modifications de
leur environnement car populations
homogènes.
La reproduction chez les nématodes
La parthénogenèse mitotique
La reproduction chez les nématodes
Mécanisme de la parthénogenèse mitotique
✓ La parthénogénèse mitotique est une forme de
reproduction asexuée avec production d’un zygote
diploïde sans fécondation entre gamètes mâles et
femelles.
✓ C’est la méthode la plus commune de la reproduction
asexuée;
✓ Dans la parthénogenèse mitotique : les chromosomes
diploïdes (2n) se dupliquent et le noyau se scinde en 2
noyaux-filles, chacun ayant l’effectif complet du noyau
de départ.
La reproduction chez les nématodes
L’Hermaphrodisme
La reproduction chez les nématodes
L’Hermaphrodisme (c’est la réunion des caractères
des deux sexes dans un seul individu)
✓ C’est une reproduction bisexuelle.
✓La larve de 2ème stade est libérée par l’œuf. Cette larve de 2ème
stade ou J2 est souvent appelée larve infestante.
Larve infestante
Œuf Larve L1 Larve L2
1èmemue
2èmemue
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La reproduction chez les nématodes
Exemples de reproduction :
1. Nématode ectoparasite
2. Nématode semi-endoparasite
Les œufs sont pondus dans le sol et les nématodes à tous les stades peuvent
parasiter la plante 100
La reproduction chez les nématodes
Nématode semi-endoparasite
✓ le cycle de vie complet de
R. reniformis est de 24 à
29 jours dans les
conditions optimales.
✓ Chez cette espèce, seule
la femelle immature est
infestante, les juvéniles et
les males restant dans le
sol sans se nourrir.
✓ Après la maturation des
gonades féminines, les
œufs sont fécondés avec
les spermatozoïdes
stockés dans la
spermathèque, et environ
60 à 200 œufs sont
déposés dans une
matrice gélatineuse.
La reproduction chez les nématodes
1a : larve J2 infestant une racine de plante. La 1ère mue a lieu dans l’œuf ;
2b et 2c : larve J3 après la 2ère mue de la J2. Les larves J3 commencent à s’enfler sur des
cellules nourricières où elles se sont fixées ;
3d et 3e : larve J4 ayant subi la 3ème mue, a une forme plus arrondie et est toujours
fixée sur les cellules nourricières ;
4f : nématode femelle adulte avec sa forme sphérique en forme de gourde après la 4ème
mue et présentant lesœufs regroupés dans une masse gélatineuse (4g)
4h : mâle adulte filiforme de Meloidogyne
La reproduction chez les nématodes
Modification chez les larves de Meloidogyne au différents de
développement
La reproduction chez les nématodes
Nématode endoparasite sédentaire (nématodes à kystes Globodera (ou Heterodera)
✓ Les nématodes à kyste survivent
dans le sol à l’intérieur de kystes
(des petites boules de la taille d’une
tête d’épingle) sous forme de larve
ou d’œuf.
✓ Dès l’éclosion des œufs,
principalement déclenchée par des
exsudats radiculaires, les juvéniles
(jeunes larves) migrent en direction
de la racine de la plante, et y
pénètrent pour s'y nourrir.
✓ Elles s’enflent de sorte que la partie
postérieure des femelles adultes
fait éclater la paroi de la racine, ce
qui les rend visibles à l'œil nu.
✓ Après fécondation par le mâle, la femelle produit entre 100 et 1000 œufs. Ces œufs
se développent à l'intérieur du corps de la femelle, qui meurt quand les œufs sont
arrivés à leur complet développement.
✓ La femelle, morte, tombe alors de la racine dans le sol. Sa cuticule se durcit,
devient résistante, et constitue le kyste, paroi continuant à protéger les œufs.
✓ Ils peuvent y subsister sans nourriture pendant des années; certaines sources
avançant même le chiffre de vingt ans. 105
LE DEVELOPPEMENT CHEZ LES NÉMATODES PHYTOPARASITES
Le développement chez les nématodes phytoparasites
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Stratégie de survie des nématodes
QUIESCENCE DIAPAUSE
✓La quiescence est une réponse ✓La diapause est un état de
spontanée réversible à des développement arrêté ;
conditions environnementales ✓le développement ne se poursuit
défavorables imprévisibles pas tant que les exigences
spécifiques n'ont pas été
✓la levée de la quiescence se produit satisfaites (retour de conditions
lorsque les conditions favorables favorables);
reviennent. ✓Il est soit programmé dans le
✓La quiescence peut être facultative cycle de vie (diapause
obligatoire) ou est déclenchée
ou obligatoire. par des stimuli
➢ La quiescence obligatoire survient environnementaux (diapause
facultative) tels que la durée du
lorsque l'information jour.
environnementale affecte un
récepteur spécifique à un stade ■ c’estpar
une stratégies développée
les nématodes pour
du cycle de vie du nématode. surmonter les conditions
➢ En revanche, la quiescence saisonnières cycliques difficiles
et / ou en l'absence de hôte qui
facultative n'est pas spécifique à ne favorisent pas l'éclosion et
un stade de développement. l'infection.
Stratégie de survie des nématodes
QUIESCENCE DIAPAUSE
✓Types de quiescence : ✓ Types de diapause :
➢ le refroidissement (cryobiose), ➢ L'incidence de diapause varie
➢ le manque d'oxygène (anoxybiose), considérablement entre les espèces
➢ la déshydratation ou dessiccation et entre les populations de la même
(anhydrobiose en relation avec l’eau) : espèce;
La dessiccation concentre les corps solutés ✓ Cas de la masse d’œufs chez
et augmente le stress osmotique interne et Meloidogyne : La masse gélatineuse
cette exposition à à des conditions d’hyper- des espèces de Meloidogyne rétrécit
osmotique provoquent la déshydratation et durcit lorsqu’elle est séchée,
partielle du nématode; cela permet : exerçant ainsi une pression sur les
œufs pour empêcher les éclosions
o de réduire le niveau de
pendant les périodes de sécheresse;
déshydratation du nématode
✓ Rotylenchulus reniformis conserve
o de prolonger le temps mis par le
ses mues cuticulaires pour protéger
nématode pour atteindre un stade
les stades infectieux :L'éclosion du J2
létal
dans le sol et les mues subséquentes
o de permettre des changements sont effectuées sans que le nématode
structurels et biochimiques s’alimente, entraînant une diminution
nécessaires à la survie à long terme. du volume corporel.
INTERACTION NEMATODES/AUTRES ORGANISMES TELLURIQUES
Interaction nematodes/autres organismes telluriques
Plusieurs organismes et microorganismes cohabitent sur le même substrat
avec les nématodes phytoparasites
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Interaction nematodes/autres organismes telluriques
Synergie:
✓ Réduction de la tolérance de la plante (plusieurs
stress à cause des différents pathogènes);
✓ Vecteurs de virus (Longidoridae et Trichodoridae);
✓ Modification du substrat (lié à la présence de
plusieurs pathogènes sur la même plante);
✓ Création de points d’entrée pour les champignons
et bactéries (essentiellement Meloidogyne);
✓ Perte d’énergie pour la plante (liée à l’introduction
de champignons et de bactéries).
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Interaction nematodes/autres organismes telluriques
Antagonisme
✓ Réduction du stress (mycorhize favorisant un
meilleur développement racinaire donc de la plante
et entrant en compétition contre les nématodes
endoparasites);
✓ Antagonisme biologique (compétition entre
plusieurs microorganismes et nématodes);
✓ Réduction de la disponibilité du substrat
(compétition)
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Merci pour votre attention