Progrès en urologie (2014) 24, 1058—1062

Disponible en ligne sur

ScienceDirect
www.sciencedirect.com

ARTICLE ORIGINAL

Profil actuel de résistance aux antibiotiques

des souches d’Escherichia coli
uropathogènes et conséquences
thérapeutiques
Current antibiotic resistance profile of uropathogenic Escherichia
coli strains and therapeutic consequences

M.C. El bouamri a,∗,b, L. Arsalane a,c, Y. Kamouni a,c,

H. Yahyaoui a,c, N. Bennouar a, M. Berraha a,b,
S. Zouhair a,b

a
Laboratoire de bactériologie et virologie, hôpital militaire et universitaire Avicenne de
Marrakech, Marrakech, Maroc
b
Faculté de médecine et de pharmacie, université Mohammed V. Souissi, Rabat, Maroc
c
Faculté de médecine et de pharmacie, université Cadi Ayyad, Marrakech, Maroc

Reçu le 20 décembre 2013 ; accepté le 12 septembre 2014

Disponible sur Internet le 11 octobre 2014

MOTS CLÉS Résumé

E. coli ; Introduction. — Les infections urinaires (IU) sont un motif très fréquent de consultation et
Entérobactéries ; de prescription médicale en pratique courante. L’usage excessif et/ou inapproprié des anti-
␤-lactamases à biotiques dans le traitement des infections urinaires est à l’origine de l’émergence et de la
spectre étendu ; dissémination des bactéries uropathogènes multirésistantes.
Résistance ; But. — Évaluer la fréquence d’isolement et la résistance aux antibiotiques des souches
Antibiotiques d’Escherichia coli uropathogènes isolées au niveau de la région de Marrakech.
Matériel et méthodes. — Nous avons mené une étude rétrospective sur une durée de trois
années (du 1er janvier 2010 au 31 décembre 2012). Elle a concerné l’ensemble des souches
non redondantes d’E. coli uropathogènes isolées au laboratoire de microbiologie de l’hôpital
Avicenne de Marrakech, Maroc. Les échantillons urinaires proviennent de patients hospitalisés
et de patients en ambulatoire.

∗ Auteur correspondant.
Adresse e-mail : [email protected] (M.C. El bouamri).

http://dx.doi.org/10.1016/j.purol.2014.09.035
1166-7087/© 2014 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Profil actuel de résistance aux antibiotiques des souches d’Escherichia coli 1059

Résultats. — Au cours de cette étude, 1472 entérobactéries uropathogènes ont été isolées
dont 924 souches non répétitives d’E. coli, soit une fréquence d’isolement globale de 63 %.
L’antibiorésistance des souches d’E. coli isolées a mis en évidence des taux de résistance à
l’amoxicilline (65 %), au sulfaméthoxazole-triméthropime (55 %), à l’association amoxicilline-
acide clavulanique (43 %), à la ciprofloxacine (22 %), à la gentamicine (14 %), aux nitrofuranes
(11 %), à l’amikacine (8 %) et à la fosfomycine (7 %). Le nombre de souches d’E. coli résis-
tantes aux céphalosporines de troisième génération « C3G » par production de ␤-lactamases
à spectre élargi « BLSE » a été de 67, soit une fréquence moyenne de 4,5 % de l’ensemble
des entérobactéries uropathogènes isolées. Les résistances associées aux antibiotiques dans
le cas des E. coli productrices de BLSE étaient de 82 % pour la ciprofloxacine, 76 % pour le
sulfaméthozole-triméthropime, 66 % pour la gentamicine et 56 % pour l’amikacine. Aucune résis-
tance à l’imipénème n’a été enregistrée pour les souches d’E. coli isolées, soit une sensibilité
à l’imipénème de 100 %.
Conclusion. — La résistance aux antibiotiques des souches d’E. coli uropathogènes limite consi-
dérablement les options thérapeutiques et constitue donc un réel problème de santé publique.
L’actualisation régulière des statistiques de sensibilité aux antibiotiques des souches d’E. coli
permet une meilleure adaptation de l’antibiothérapie probabiliste aux données épidémiolo-
giques locales.
Niveau de preuve. — 5.
© 2014 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.

KEYWORDS Summary Urinary tract infections (UTI) are a very common reason for consultation and pres-
E. coli; cription in current practice. Excessive or inappropriate use of antibiotics in treating urinary
Extended-spectrum tract infections is responsible for the emergence and spread of multiresistant uropathogenic
␤-lactamase; bacteria.
Resistance; Aim of the study. — To evaluate the isolation frequency and antibiotic resistance of uropatho-
Antibiotics genic Escherichia coli strains isolated at the Marrakech region.
Material and methods. — We conducted a retrospective study over a period of three years (from
1st January 2010 to 31 December 2012). It included all non-redundant uropathogenic E. coli
strains isolated in the microbiology laboratory of the Avicenne hospital of Marrakech, Morocco.
Results. — During this study, 1472 uropathogenic enterobacteriaceae were isolated including
924 non-repetitive E. coli strains, an overall isolation frequency of 63%. Antibiotic resistance
of isolated E. coli strains showed resistance rates to amoxicillin (65%), sulfamethoxazole-
triméthropime (55%), amoxicillin-clavulanic acid (43%), ciprofloxacin (22%), gentamicin (14%),
nitrofurans (11%), amikacin (8%) and fosfomycin (7%). The number of E. coli strains resistant
to C3G by ESBL production was 67, an average frequency of 4.5% of all isolated uropathoge-
nic enterobacteria. The associated antibiotic resistance in the case of ESBL-producing E. coli
were 82% for ciprofloxacin, 76% for sulfamethozole trimethoprim, 66% for gentamicin and 56%
for amikacin. No resistance to imipenem was recorded for the isolated E. coli strains, which
represents an imipenem sensitivity of 100%.
Conclusion. — Antibiotic resistance of uropathogenic E. coli strains limits treatment options and
therefore constitutes a real public health problem. The regular updating of antibiotic suscepti-
bility statistics of E. coli strains allows a better adaptation of the probabilistic antibiotic therapy
to local epidemiological data.
Level of evidence. — 5.
© 2014 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Introduction l’utilisation de ces molécules de choix dans le traitement

de ce genre d’infections.
Les infections urinaires (IU) sont un motif très fréquent Les infections urinaires à Escherichia coli (E. coli) consti-
de consultation et de prescription médicale en pra- tuent une priorité en matière de surveillance et d’étude de
tique courante [1]. L’usage intensif et souvent abusif des résistance aux antibiotiques étant donné leur fréquence éle-
antibiotiques tels que les fluoroquinolones et des céphalo- vée et leur gravité. L’objectif de ce travail est d’évaluer
sporines de troisième génération (C3G) dans le traitement la fréquence d’isolement et la sensibilité aux antibiotiques
des IU a été rapidement suivi par l’apparition de souches des souches d’E. coli uropathogènes isolées au laboratoire
multirésistantes et a compromis dans de nombreux cas de microbiologie de l’hôpital Avicenne de Marrakech. Ceci
1060 M.C. El bouamri et al.

permet de proposer de nouvelles mesures adaptatives pour

une meilleure optimisation du traitement empirique des
infections urinaires à E. coli dans notre région.

Matériel et méthodes
Nous avons mené une étude rétrospective sur une durée de
trois années (du 1er janvier 2010 au 31 décembre 2012).
Elle a porté sur 924 patients présentant une IU confirmée à
E. coli dans le laboratoire de microbiologie de l’hôpital Avi-
cenne de Marrakech qui comporte toutes les spécialités et
les consultations correspondantes en dehors de la pédiatrie.
Les échantillons urinaires proviennent de patients hospi-
talisés et de patients consultants en ambulatoire adressés
au laboratoire par les consultations au niveau de la même
institution hospitalière et des structures communautaires Figure 1. Test de synergie positif (aspect en bouchon de cham-
rattachées à l’hôpital. Toute souche bactérienne d’E. coli pagne). FEP : céfépime ; AMC : amoxicilline + acide clavulanique ;
ATM : aztréonam, CTX : céfotaxime.
isolée plus d’une fois chez un même patient et ayant le
même profil à l’antibiogramme n’a été prise en compte
qu’une fois. Tableau 1 Évolution des E. coli-BLSE selon les années.
Les examens cytobactériologiques des urines (ECBU) ont Année 2010 2011 2012
été fréquemment prescrits, par les cliniciens, chez les
patients présentant : Fréquence d’isolement (X %) 3 4 6
• un échec d’antibiothérapie probabiliste préalable ;
• une IU récidivante ;
• une pathologie sous-jacente ; Résultats
• une infection grave ;
• des brûlures et douleurs à la miction ; Au cours de cette étude, 1472 entérobactéries uropatho-
• une pollakiurie. gènes ont été isolées dont 924 souches non répétitives
d’E. coli, soit une fréquence d’isolement globale de 63 %. Les
Les résultats des ECBU validés par le biologiste sont souches d’E. coli uropathogènes ont été isolées essentielle-
ensuite communiqués au clinicien à qui revient la décision ment (86 %) chez des patients consultants en ambulatoire
de prescrire ou non une antibiothérapie selon les conditions (dispensaires, consultations externes et urgences).
de réalisation du prélèvement (par exemple : tenir compte L’antibiorésistance des souches d’E. coli non produc-
des risques de souillure de l’échantillon urinaire et de la trices de BLSE isolées a mis en évidence des taux moyens
colonisation), l’état clinique du patient (par exemple : IU de résistance à l’amoxicilline (65 %), au triméthropime-
symptomatique ou asymptomatique avec ou sans fièvre) et sulfaméthoxazole « TMP-SMX » (55 %), à l’AMC (43 %), à la
l’existence ou non d’une antibiothérapie préalable. ciprofloxacine (22 %), à la gentamicine (14 %), aux nitrofu-
Ont été retenus pour cette étude les prélèvements uri- ranes (11 %), à l’amikacine (8 %), à la fosfomycine (7 %) et à
naires répondant à une bactériurie significative supérieure l’imipénème (0 %) (Fig. 2).
ou égale à 105 UFC/mL (au-delà de 2 types de colonies dif- Les fréquences d’isolement des souches d’E. coli pro-
férentes, l’analyse n’est pas poursuivie sauf en situation ductrices de BLSE est passé de 3 % en 2010 à 6 % en 2012,
particulière et en concertation avec le clinicien) en présence soit une fréquence moyenne de 4,5 % (67/1472) par rapport
d’une leucocyturie supérieure ou égale à 104 éléments/mL. à l’ensemble des souches d’entérobactéries uropathogènes
Les seuils de bactériurie de 103 UFC/mL pour les cystites à (Tableau 1).
E. coli ont aussi été retenus. Les résistances aux antibiotiques usuels dans le cas des
L’identification des bactéries isolées a été basée sur E. coli productrices de BLSE étaient de 82 % pour la cipro-
l’étude de leurs caractères morphologiques, culturaux et floxacine, 76 % pour le TMP-SMX, 66 % pour la gentamicine,
biochimiques par méthode automatisée sur Microscan (Dade 56 % pour l’amikacine et 0 % pour l’imipénème (Tableau 2).
Behring®, Sacramento, États-Unis). Les critères de lec-
ture et d’interprétation sont ceux du comité de la société
française de microbiologie (CA-SFM) [2]. Discussion
La production de ␤-lactamases à spectre élargi (BLSE),
détectée par l’automate, a été confirmée par la méthode de Le profil épidémiologique des bactéries uropathogènes
diffusion impliquant le test de synergie entre l’association varie d’une région à l’autre. De ce fait, la connaissance
amoxicilline + acide clavulanique « AMC » et une cépha- de l’épidémiologie locale ainsi que son évolution reste
losporine de troisième ou quatrième génération et/ou indispensable pour le choix d’une antibiothérapie de pre-
l’aztréonam. Cette synergie est caractérisée par une image mière intention efficace et adaptée pour chaque région.
en « bouchon de champagne » et signe la présence d’une Les résultats de notre étude ont mis en évidence une
BLSE (Fig. 1). forte implication des souches d’E. coli (63 %) dans les IU à
Profil actuel de résistance aux antibiotiques des souches d’Escherichia coli 1061

Figure 2. Les taux moyens de résistance des souches d’E. coli non productrices de BLSE isolées aux différents antibiotiques testés.

l’association amoxicilline-acide clavulanique a été de 60 %

Tableau 2 La résistance aux antibiotiques usuels des
chez les patients hospitalisés et de 50 % chez les patients
souches d’E. coli productrices ou non de BLSE.
consultants [9].
Antibiotique testé E. coli non BLSE E. coli BLSE Les fluoroquinolones occupent une place privilégiée
(n = 857) (%) (n = 67) (%) parmi les molécules prescrites dans le traitement des infec-
tions du tractus urinaire et notamment dans le traitement
Ciprofloxacine 22 82
probabiliste de la cystite aiguë non compliquée de la femme
TMP-SMX 55 76
[10]. Comme tout autre antibiotique, la relation entre
Gentamicine 14 66
augmentation de la consommation des fluoroquinolones et
Amikacine 8 56
l’augmentation de la résistance bactérienne à ces molécules
Imipénème 0 0
n’est plus à démontrer [10]. Le taux de résistance d’E. coli
à la ciprofloxacine a été de 22 % dans notre hôpital, de 20 %
à El jadida [4] et 27 % à Rabat [9]. La situation épidémio-
entérobactéries. Ceci est clairement justifié par la domi- logique mondiale de la résistance des souches d’E. coli aux
nation d’E. coli du profil général des bactéries responsables fluoroquinolones reste variable avec des taux de résistance
d’IU [3]. de 10 % aux États-Unis [11] et 50 % en Chine [12].
L’étude de l’antibiorésistance des souches d’E. coli uro- Les taux élevés de résistance d’E. coli uropathogènes au
pathogènes hospitalières et communautaires a mis en TMP-SMX rapportés dans notre étude (55 %) et à El jadida
évidence des taux de résistance variables aux antibiotiques (33,7 %) [4] confirment l’élimination de cet antibiotique dans
testés, notamment aux principales molécules utilisées dans le traitement de première intention de l’IU non compliquée.
le traitement des IU. E. coli est naturellement sensible à l’ensemble des ␤-
Il a été enregistré au niveau de notre hôpital un taux lactamines. Le mécanisme essentiel de la résistance acquise
élevé de la résistance aux aminopénicillines (amoxicilline aux ␤-lactamines est de nature enzymatique par production
et ampicilline) de 65 %. À l’échelle nationale, un taux simi- des ␤-lactamases. L’implication des entérobactéries produc-
laires de résistance à l’amoxicilline 61,2 % a été rapporté à trices de ␤-lactamases à spectre élargi (E-BLSE) dans les
El jadida (Maroc) [4]. Des taux de résistance à l’amoxicilline IU tant communautaires que nosocomiales constitue un réel
encore plus élevés, allant jusqu’à 75 %, ont été rapportés problème de santé publique [13]. Au niveau de la région de
par d’autres études [5,6]. Ces taux élevés de résistance des Marrakech, la production de BLSE par les souches d’E. coli
E. coli uropathogènes à l’amoxicilline justifient que les ami- uropathogènes est passée de 2 % en 2008 à 6 % en 2012 [14].
nopénicillines ne soient plus actuellement recommandées Ces taux élevés de la production des BLSE par les souches
en traitement probabiliste des IU [7]. d’E. coli uropathogènes confirme aussi bien la forte sécré-
L’acquisition de la résistance à l’AMC, antibiotique à très tion des BLSE par les souches d’E. coli que la large diffusion
forte prescription au Maroc, est un phénomène mondial rap- de ce phénomène de résistance aussi bien en milieu commu-
porté à des taux très variables [8]. Dans notre étude, la nautaire qu’en milieu hospitalier [14—16].
résistance à l’amoxicilline—clavulanate a été de 43 % contre L’antibiorésistance des souches d’E. coli productrices de
un taux de résistance de 13,7 % au niveau de la ville d’El BLSE a mis en évidence des taux de résistance plus éle-
jadida [4]. Au niveau de la ville de Rabat, la résistance à vés à un grand nombre d’antibiotiques en comparaison aux
1062 M.C. El bouamri et al.

souches d’E. coli non productrices de BLSE (Tableau 2). Ceci [6] Matute AJ, Hak E, Schurink C, et al. Resistance of uropathogens
peut être expliqué par le fait que les gènes des BLSE, por- in symptomatic urinary tract infection in Leon, Nicaragua. Int
tés généralement par des plasmides, sont souvent associés J Antimicrob Agents 2004;23:506—9.
à des gènes de résistance aux antibiotiques, notamment aux [7] Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé.
aminosides et aux fluoroquinolones [17,18]. Recommandations pratiques : diagnostic et antibiothérapie
des infections urinaires bactériennes communautaires chez
Aucune résistance à l’imipénème n’a été mise en
l’adulte. Med Malad Infect 2008;38S:203—52.
évidence pour les souches d’E. coli identifiées, soit une sen- [8] ONERBA. Résistance bactérienne aux antibiotiques. Données
sibilité à l’imipénème de 100 %. Cependant, l’utilisation de l’observatoire national de l’épidémiologie de la résistance
rationnelle de cette molécule est obligatoire afin d’éviter bactérienne. Med Mal Infect 2005;35:155—69.
l’émergence de souches d’E. coli productrices de carbapé- [9] Tagajdid MR, Boumhil L, Iken M, Adnaoui M, Benouda A. Étude
nèmases. de la résistance des souches d’Escherichia coli isolées dans
les urines aux fluoroquinolones et aux céphalosporines de troi-
sième génération. Med Mal Infect 2010;40:70—3.
Conclusion [10] Cizman M, Orazem A, Krizan-Hergouth V, et al. Correlation bet-
ween increased consumption of fluoroquinolones in outpatients
L’émergence et la dissémination des bactéries uropatho- and resistance of Escherichia coli from urinary tract infections.
J Antimicrob Agents Chemother 2001;47:502—3.
gènes multirésistantes constituent un véritable problème
[11] Neuhausser MM, Weinstein RA, Rydman R. Antibiotic resis-
de santé publique et un véritable défi pour les biologistes, tance among Gram negative bacilli in US intensive care
les cliniciens, les hygiénistes et les autorités sanitaires. units: implications for fluoroquinolones use. JAMA 2003;289:
L’adoption d’une politique pour le bon usage des anti- 885—8.
biotiques, actualisée par des programmes réguliers de [12] Ling TK, Xiong J, Yu Y. Multicenter antimicrobial suscep-
surveillance de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques, tibility survey of Gram negative bacteria isolated from
reste parmi les outils clés pour la diminution de l’ampleur du patients with community-acquired infections in the People’s
phénomène de la résistance bactérienne aux antibiotiques. Republic of China. Antimicrob Agents Chemother 2006;50:
374—8.
[13] Pitout JD, Nordmann P, Laupland KB, Poirel L. Emergence
of Enterobacteriacae producing extended-spectrum beta-
Déclaration d’intérêts lactamases (ESBLs) in the community. J Antimicrob Chemother
2005;56:52—9.
Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en [14] El Bouamri MC, Arsalane L, Kamouni Y, Berraha M, Zouhair
relation avec cet article. S. Évolution récente du profil épidémiologique des entérobac-
téries uropathogènes productrices de B-lactamases à spectre
élargi à Marrakech, Maroc. Prog Urol 2014;24:451—5.
Références [15] Hernandez JR, Martinez-Martinez L, Canton R, Coque TM, Pas-
cual A. Nationwide Study of Escherichia coli and K. pneumonia
[1] Hooton TM. Pathogenesis of urinary tract infection: an update. producing extended-spectrum B-lactamases in Spain. Antimi-
J Antimicrob Chemother 2000;46:S1—7. crob Agents Chemother 2005;49:2122—5.
[2] http://www.sfm-microbiologie.org/UserFiles/file/CASFM/ [16] Fouquet M, Morange V, Bruyère F. Évolution sur cinq ans des
CASFM 2013.pdf (site consulté le 06 novembre 2013). infections à germes produisant une B-lactamase à spectre
[3] Bruyère F, Cariou G, Boiteux JP, Hoznek A, Mignard JP, Escara- étendu. Prog Urol 2012;22:17—21.
vage L, et al. Généralités. Prog Urol 2008;18(Suppl. 1):S4—8. [17] De Champs C, Sirot D, Chanal C, Poupart MC, Dumas MP, Sirot
[4] Nadmi H, Elotmani F, Talmi M, Zerouali K, Perrier-Gros-Claude J. Concomitant dissemination of three extended-spectrum
JD, Timinouni M. Profil de résistance aux antibiotiques des b-lactamases among different Enterobacteriaceae isolated
entérobactéries uropathogènes communautaires à El Jadida in a French hospital. J Antimicrobial Chemother 1991;27:
(Maroc). Med Mal Infect 2010;40:303—5. 441—7.
[5] Farrell DJ, Morissey I, De Rubeis D, et al. A UK multicentre study [18] Jacoby GA, Sutton L. Properties of plasmids responsible for
and the antimicrobial susceptibility of bacterial pathogens cau- production of extended-spectrum b-lactamases. Antimicrob
sing urinary tract infection. J Infect 2003;46(2):94—100. Agents Chemother 1991;35:164—9.