Rapport 2020

République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de la Santé
Réseau Algérien de Surveillance de la Résistance des

Bactéries aux Antibiotiques (AARN)
Surveillance de la résistance des

bactéries aux antibiotiques
21ème Rapport d’évaluation

(Années 2020)
Edition 2022
https://aarn.pasteur.dz/
Surveillance de la résistance des bactéries aux antibiotiques 21ème Rapport d’évaluation 2020
Membres fondateurs
Pr. K.RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. R.BELOUNI (CHU Frantz Fanon - Blida)
Pr. H.TALI MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Feu Dr. M.BOUDOUANE
Dr. M.F.K.MISSOUM (INSP - Alger)
Pr. A. BENSLIMANI (EHS Dr Maouche – Alger)
Dr. A. ABOUN (Institut Pasteur – Kouba – Alger)
Comité organisateur
Pr. K.RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Dr. M.F.K.MISSOUM (INSP - Alger)
Dr. H. AMMARI (CHU Béni Messous – Alger)
Pr. M. N. OUAR KORICHI (EHS CPMC – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa - Hamoud Alger)
Comité de rédaction
Pr. K. RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Dr. M.F.K. MISSOUM (INSP – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa Hamoud- Alger)
Corrigé par
Pr. K. RAHAL (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. H. TALI MAAMAR (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Pr. S. MAHRANE (CHU Nafissa – Hamoud- Alger)
Dr. S. BOUHERAOUA (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Participation technique
Mr C. MAHIEDDINE / Informatique (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Secrétariat
Mlle H. SAKHI (Institut Pasteur – Dely Ibrahim – Alger)
Remerciements
Mlle Y. Ammari pour avoir vérifié les calculs.
2
Liste des abréviations

QUINOLONES
β-LACTAMINES
Pénicilline PEN Acide nalidixique NAL
Oxacilline OXA Ofloxacine OFX
Ampicilline AMP Ciprofloxacine CIP
Amoxicilline AMX Lévofloxacine LVX
Amoxicilline +Ac.clavulanique AMC Gemifloxacine GEM
Ticarcilline TIC
Ticarcilline +Ac.clavulanique TCC
NITROFURANTOINES
Pipéracilline PIP
Céfalexine LEX Furanes NIT
Céfazoline CZO
Céfalotine CEF
Céfoxitine FOX AUTRES
Céfotaxime CTX FUS
Acide fusidique
Ceftriaxone CRO RIF
Rifampicine
Ceftazidime CAZ FOS
Fosfomycine
Aztréonam ATM
Imipénème IPM
Ertapénème ERT Autres abréviations
AMINOSIDES American Type Culture Collection ATCC

Gentamicine GEN β-lactamase Negative Ampicillin Resistant BLNAR
Gentamicine Haut niveau GEH S.aureus Résistant à la Méticilline SARM
Streptomycine Haut niveau STH Bactéries Multi-Résistantes BMR
Kanamycine KAN β-lactamase à Spectre Etendu BLSE
Amikacine AMK Céphalosporines de 3èmeGénération C3G
Tobramycine TOB Pénicillinase PASE
Nétilmicine NET Ceftazidime Résistant CAZ R
Imipénème Résistant IPM R
CYCLINES Ciprofloxacine Résistant CIP R
Tétracycline Enterococcus spp. Résistant à la Vancomycine ERV
TCY
Doxycycline Mc Farland MF
DOX
Clinical and Laboratory Standards Institute CLSI
MACROLIDES Entérobactéries productrices de BLSE EBLSE
Erythromycine ERY Entérobactéries productrices de carbapénèmase EPC
Azithromycine AZM Pneumocoque de sensibilité diminuée à la PSDP
pénicilline
Clindamycine CLI
Colistine Résistant CS R
Pristinamycine PRI S. aureus de sensibilité intermédiaire à la VISA
Quinupristine-Dalfopristine QDF vancomycine
PHENICOLES S. aureus de sensibilité intermédiaire aux GISA
glycopeptides
Chloramphénicol CHL Oto Rhino Laryngologie ORL
POLYPEPTIDES Algerian Antimicrobial Resistance Network AARN
Colistine COL
GLYCOPEPTIDES
Vancomycine VAN
Teicoplanine TEC
SULFAMIDES ET ASSOCIES
Triméthoprime+ sulfaméthoxazole SXT
3
Liste et abréviations des laboratoires médicaux
Centre Hospitalo-Universitaire d’Annaba CHU Annaba

Centre Hospitalo-Universitaire de Bab El Oued CHU Bab El Oued
Centre Hospitalo-Universitaire de Batna CHU Batna
Centre Hospitalo-Universitaire de Béni-Messous-laboratoire mère CHU Béni-Messous- laboratoire central
enfant
Centre Hospitalo-Universitaire de Blida CHU Blida
Centre Hospitalo-Universitaire de Constantine CHU Constantine
Centre Hospitalo-Universitaire d’Hussein Dey CHU Hussein Dey
Centre Hospitalo-Universitaire Mustapha Bacha CHU Mustapha Bacha
Centre Hospitalo-Universitaire d’Oran CHU Oran
Centre Hospitalo-Universitaire de Sétif CHU Sétif
Centre Hospitalo-Universitaire de Tizi Ouzou CHU Tizi Ouzou
Etablissement Hospitalier Universitaire d’Oran EHU Oran
Etablissement Public et Hospitalier de Birtraria EPH Birtraria
Etablissement Public et Hospitalier de Bologhine EPH Bologhine
Etablissement Public et Hospitalier de Boufarik EPH Boufarik
Etablissement Hospitalier Spécialisé Centre Pierre et Marie Curie EHS CPMC
Etablissement Hospitalier Spécialisé Salim Zemirli EHS Zemirli
Etablissement Hospitalier Spécialisé El Hadi Flici EHS El Hadi Flici
Etablissement Hospitalier Spécialisé Dr Maouche EHS Maouche
Hôpital Central de l’Armée HCA
Hôpital Militaire Universitaire Spécialisé de Staouéli HMUS Staouéli
Hôpital Militaire Régional Universitaire d’Oran HMRU Oran
Institut National de Santé publique INSP
Laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la IPA- Dely Ibrahim

Résistance aux Antibiotiques Institut Pasteur d’Algérie- Dely Ibrahim
Etablissement Public et hospitalier Rouiba – Alger EPH Rouiba
4
Liste des tableaux (année 2020)

Tab. 1 Liste des antibiotiques à tester par souche de référence 23
Tab. 2 Test du CQ de E.coli ATCC 25922 par laboratoire (année 2020) 24
Tab. 3 Test du CQ de S.aureus ATCC 25923 par laboratoire (année 2020) 25
Tab. 4 Test du CQ de P.aeruginosa ATCC 27853 par laboratoire (année 2020) 26
Tab. 5 Test du CQ de S.pneumoniae ATCC 49619 par laboratoire (année 2020) 27
Tab. 6 Test du CQ de Haemophilus influenzae ATCC 49247 par laboratoire (année 2020) 27
Tab.7 Nombre et pourcentage des différentes espèces bactériennes isolées des hémocultures (N=2043, année 2020) 29
Tab. 8 Nombre et pourcentage des Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2020) 31
Tab. 9 Nombre et pourcentage des Escherichia coli résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 32
Tab. 10 Nombre de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 33
Tab. 11 Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 34
Tab. 12 Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 35
Tab. 13 Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 36
Tab. 14 Répartition des BMR dans les hémocultures (N=2017, année 2020) 37
Tab. 15 Nombre et pourcentage des BMR par espèce bactérienne dans les hémocultures (N=2017, année 2020) 38
Tab. 16 Nombre des isolats bactériens á partir du LCR (année 2020) 40
Tab. 17 Répartition des isolats de N. meningitidis par sérogroupe (année 2020) 41
Tab. 18 Répartition des souches de N.meningitidis par sérogroupe et par tranche d’âge (Résultats du réseau, année 2020) 41
Tab. 19 Répartition des souches de N.meningitidis par sérogroupe et par tranche d’âge (Résultats de l’IPA, année 2020) 42
Tab. 20 Nombre de Neisseria meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques (Résultats du réseau, année 2020) 43
Tab. 21 Nombre de N. meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques (Résultats de l’IPA, année 2020) 43
Tab. 22 Répartition des souches de S. pneumoniae par tranche d’âge dans le LCR (année 2020) 44
Tab. 23 Nombre et pourcentage de résistance et de sensibilité de S. pneumoniae aux antibiotiques dans le LCR (année 2020) 45
Tab. 24 Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la pénicilline G pour S. pneumoniae dans le LCR (année 2020) 45
Tab. 25 Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae isolé à partir du LCR (année 2020) 46
Tab. 26 Sérotypes de S.pneumoniae dans le LCR (données de l’IPA, année 2020) 46
Tab. 27 Nombre des isolats de S.pneumoniae (LCR exclu) par laboratoire (année 2020) 48
Tab. 28 Répartition des souches de S.pneumoniae par type de prélèvement (LCR exclu) (année 2020) 49
5
Tab. 29 Répartition par tranches d’âges des souches de S.pneumoniae isolés à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2020) 50
Nombre et pourcentage de résistance et de sensibilité de S.pneumoniae aux antibiotiques dans les prélèvements autres que le
Tab. 30 51
LCR (année 2020)
Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la pénicilline G pour S. pneumoniae dans les prélèvements autres que le LCR (année
Tab. 31 52
2020)
Tab. 32 Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae isolé à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2020) 53
Tab. 33 Nombre et pourcentage de souches bactériennes isolées des coprocultures (année 2020) 55
Tab. 34 Nombre de salmonelles isolées à partir des différents prélèvements en milieu hospitalier et externe (N=228, année 2020) 56
Tab. 35 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 57
Tab. 36 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. digestives résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 57
Tab. 37 Nombre et pourcentage de Salmonella spp. extra-digestives résistantes (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 58
Tab. 38 Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, N=176, année 2020) 59
Nombre et pourcentage de résistance aux antibiotiques des différents sérovars de salmonelles isolées des patients externes et
Tab. 39 60
hospitalisés (données du réseau, année 2020)
Tab. 40 Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les patients hospitalisés (N=3152, année 2020) 62
Tab. 41 Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne chez les patients externes (N=2987, année 2020) 63
Tab. 42 Nombre et pourcentage des E.coli résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 64
Tab. 43 Répartition des BMR isolées des urines chez les patients hospitalisés (N=1657, année 2020) 65
Tab. 44 Nombre et pourcentage des BMR isolées des urines chez les patients hospitalisés (N=1657, année 2020) 66
Tab. 45 Répartition des BMR isolées des urines chez les patients externes (N=907, année 2020) 67
Tab. 46 Nombre et pourcentage des BMR isolées des urines chez les patients externes (année 2020) 68
Tab. 47 Nombre et pourcentage d’Escherichia coli résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 70
Tab. 48 Nombre et pourcentage de Klebsiella pneumoniae résistantes (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 71
Tab. 49 Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 72
Tab. 50 Nombre et pourcentage de Serratia marcescens résistantes (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 73
Tab. 51 Nombre et pourcentage de Proteus mirabilis résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 74
Tab. 52 Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 75
Tab. 53 Nombre et pourcentage d’Acinetobacter spp. résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 76
Tab. 54 Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2020) 77
Tab. 55 Nombre et pourcentage des SASM résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2020) 78
Tab. 56 Nombre et pourcentage des SARM résistants (R+ I) aux antibiotiques (année 2020) 79
6
Tab. 57 Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecalis résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 80
Tab. 58 Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecium résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2020) 81
Tab. 59 Nombre et pourcentage des entérobactéries multi-résistantes par laboratoires chez les patients hospitalisés (année 2020) 82
Tab. 60 Nombre et pourcentage des EBLSE chez les patients hospitalisés par service (année 2020) 83
Tab. 61 Nombre et pourcentage des EBLSE par espèce bactérienne (année 2020) 84
Tab. 62 Nombre et pourcentage des entérobactéries confirmées résistantes à l’imipenème isolées chez les patients hospitalisés (année
84
2020)
Tab. 63 Nombre et pourcentage des Pseudomonas et Acinetobacter multi résistants (BMR) par laboratoire chez les patients hospitalisés
85
(année 2020)
Tab. 64 Nombre et pourcentage de BMR à Gram positif par laboratoire chez les patients hospitalisés (année 2020) 86
Tab. 65 Nombre et pourcentage d’entérobactéries multi -résistantes par secteurs de soins (année 2020) 87
Tab. 66 Nombre et pourcentage des Pseudomonas et Acinetobacter multi résistants (BMR) par secteurs de soins (année 2020) 88
Tab. 67 Nombre et pourcentage des BMR à Gram positif par secteurs de soins (année 2020) 89
Tab. 68 Nombre et pourcentage des principaux marqueurs de résistance par espèce bactérienne isolée chez les patients hospitalisés
90
(année 2020)
Tab. 69 Répartition des BMR chez les patients hospitalisés (année 2020) 90
7
Liste des figures (année 2020)

Fig. 1 Pourcentage des différentes espèces bactériennes isolées à partir des hémocultures (N=2043, année 2020) 30
Pourcentage des Klebsiella pneumoniae résistantes (R+I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année
Fig. 2 31
2020)
Fig. 3 Pourcentage des Escherichia coli résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 32
Fig. 4 Pourcentage des Proteus mirabilis résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 33
Fig. 5 Pourcentage des Enterobacter cloacae résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020) 34
Pourcentage des Staphylococcus aureus résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année
Fig. 6 35
2020)
Pourcentage des Pseudomonas aeruginosa résistants (R+I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année
Fig. 7 36
2020)
Fig. 8 Répartition des BMR dans les hémocultures (N=2017, année 2020) 37
Fig. 9 Nombre et pourcentage des BMR par espèce bactérienne dans les hémocultures (N=2017, année 2020) 38
Répartition des souches de S.pneumoniae par type de prélèvement (LCR exclu) (Résultats
Fig. 10 49
du réseau, année 2020)
Répartition des souches de S.pneumoniae par catégories d’âges dans les prélèvements autres que le LCR
Fig. 11 50
(Résultats du réseau, année 2020)
Pourcentage de résistance et de sensibilité de S.pneumoniae aux antibiotiques dans les prélèvements
Fig. 12 52
autres que le LCR (Résultats du réseau, année 2020)
Fig. 13 Nombre des souches bactériennes isolées des coprocultures (N=238, année 2020) 55
Nombre de salmonelles isolées à partir de différents types d’infections en milieu hospitalier et externe
Fig. 14 56
(N=228, année 2020)
Fig. 15 Nombre des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, N=176, année 2020) 59
Fig. 16 Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients hospitalisés (N=3152, année 2020) 62
Fig. 17 Pourcentage des souches isolées dans les urines chez les patients externes (N=2987, année 2020) 63
Fig. 18 Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés des urines (année 2020) 64
Fig. 19 Répartition des BMR isolées des urines chez les patients hospitalisés (N=1657, année 2020) 65
Fig. 20 Nombre et pourcentage des BMR isolées des urines chez les patients hospitalisés (N=1657, année 2020) 66
Fig. 21 Répartition des BMR isolées des urines chez les patients externes (N=907, année 2020) 67
Nombre et pourcentage des BMR isolées dans les prélèvements urinaires chez les patients externes (année
Fig. 22 68
2020)
Fig. 23 Pourcentage de résistance (R+I) d’Escherichia coli aux antibiotiques (année 2020) 70
Fig. 24 Pourcentage de résistance (R+I) de Klebsiella pneumoniae aux antibiotiques (année 2020) 71
Fig. 25 Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterobacter cloacae aux antibiotiques (année 2020) 72
Fig. 26 Pourcentage de résistance (R+I) de Serratia marcescens aux antibiotiques (année 2020) 73
Fig. 27 Pourcentage de résistance (R+I) de Proteus mirabilis aux antibiotiques (année 2020) 74
Fig. 28 Pourcentage de résistance (R+I) de Pseudomonas aeruginosa aux antibiotiques (année 2020) 75
Fig. 29 Pourcentage de résistance (R+I) d’Acinetobacter spp. aux antibiotiques (année 2020) 76
Fig. 30 Pourcentage de résistance (R+I) de Staphylococcus aureus aux antibiotiques (année 2020) 77
Fig. 31 Pourcentage des SASM résistants (R+I) aux antibiotiques (année 2020) 78
Fig. 32 Pourcentage de résistance (R+I) des SARM aux antibiotiques (année 2020) 79
Fig. 33 Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterococcus faecalis aux antibiotiques (année 2020) 80
Fig. 34 Pourcentage de résistance (R+I) d’ Enterococcus faecium aux antibiotiques (année 2020) 81
8
LISTE DES MEMBRES DU RESEAU AARN

Coordinateur du réseau : Pr K. RAHAL
Médicaux :
Chef de service ou Coordinateur entre le

responsable de Tél. Fax
Noms et adresses de la structure service et le réseau
laboratoire
Institut Pasteur d’Algérie - Laboratoire de
Pr TALI-MAAMAR
01 bactériologie médicale et de surveillance de la BOUHERAOUA Selma 023 36 75 36 023 36 75 36
Hassiba
résistance aux antibiotiques - Alger
CHU Mustapha Bacha – Alger - Service de

02 Pr AMHIS Wahiba BACHTARZI Mohamed 021 23 57 87 021 23 57 87
microbiologie
03 CHU Beni Messous - Alger - Laboratoire central Pr YALA Djamel AMMARI Houria 021 93 12 88 021 93 12 88
04 CHU Beni Messous - Alger – Laboratoire mère Pr DJENNANE Fazia TOUATI Djamila 023 11 32 37 023 11 32 37
enfant
05 CHU Bab El Oued – Alger - Laboratoire central Pr MAKRELOUF HANNI Amina 021 96 02 42 021 96 02 42
Mohamed
06 EHS Pierre et Marie Curie – Alger - Laboratoire Pr OUAR KORICHI BALLOUT Imene 021 23 76 92 021 23 76 92
central Mounira
EHS Dr M.A. Maouche El Biar – Alger - Service
07 Pr BENSLIMANI Akila REZGUI Sonia 023 18 20 16 023 18 20 16
de Biologie clinique
08 EHS El Hadi Flici – Alger -Laboratoire central Pr ZIANE Hanifa MECHOUET Faiza 021 97 94 07(LD) 021 97 94 07
9
Institut National de Santé Publique - Alger - MISSOUM Mohamed

09 Département Soutien Technique - Laboratoire de Dr HAMMADI Djamila 023 18 74 56 021 91 27 37
Fawzi Karim
microbiologie
Pr AIT BELKACEM 021 49 56 16 021 49 56 16

10 CHU Hussein Dey - Alger – Laboratoire central MAHRANE Sadjia
Habiba 021 49 56 56 / 59 021 23 28 04
EPH Djilali Belkhanchir (Ex Birtraria) - Alger - 021 90 00 10 ST

11 Pr KECHOUT Nadia OUSSADOU Latifa 021 90 00 23
Laboratoire central
021 90 00 23 LD
Hôpital Central de l‘armée. - Alger. Laboratoire 021 54 54 54 (st)
12 Pr ZEROUKI Ali HENNICHE Fatma Zohra 021 54 52 38
de microbiologie
021 54 53 62
CHU Benbadis - Constantine- Service de 031 94 64 99 (L.D)
13 Pr BENLABED Kadour BENTCHOUALA Chafia 031 88 64 99
microbiologie
031 88 78 30
14 CHU Benflis Touhami Batna - Laboratoire de Pr BOUKHALFA Sanaa BEN MEHIDI Messaoud 033 30 83 26 (LD) 033 30 83 26
microbiologie
15 EPH Boufarik – Blida - Laboratoire central Dr LASSAS Karima SABABOU Karima 025 47 14 10 (P156) 025 47 14 11
16 CHU Saadna Mohamed Abdenour - Sétif - Pr SAHLI Farida SAHLI Farida 036 54 40 15 036 54 40 17
Laboratoire de bactériologie
17 CHU d’Oran Laboratoire central Dr ZOUAGUI Souad ZOUAGUI Souad 041 41 22 59 041 41 34 14
18 CHU Dorban – Annaba - Laboratoire central Pr NEDJAI Sabrina DJAHMI Nassima 038 42 58 04 038 42 58 04
19 CHU de Tizi-Ouzou - Laboratoire de Dr BOUBRIT Fella CHERIFI Lynda 026 21 13 16 026 21 71 04

microbiologie et de parasitologie
10
20 Pr CHERIFI Mohamed BENREDOUANE Mounia 021 95 95 51 021 95 95 51 (Labo)

EPH Bologhine - Alger - Laboratoire central 021 95 81 75 (DG)
21 EHU 1er Novembre1954 – Oran - Service de Dr DALI YAHIA Radia BOUOKKAZ Fatima 041 70 51 27 041 70 51 27
microbiologie
22 Hôpital militaire universitaire d'Oran - Laboratoire Dr BENMAHDI Lahcene BENMAHDI Lahcene 041 58 71 97 041 24 78 82
de microbiologie 041 24 69 61
Hôpital militaire universitaire spécialisé de

23 Pr BENSGHEIR Soufiane BOUKORCHI khelifa 021 39 36 63 021 39 10 10
Staoueli - Alger - Laboratoire central
24 EHS Salim Zemirli - Alger - Laboratoire central Dr DENIA Mohamed HAMIDI Moufida 023 97 14 05 023 97 14 05
Fatih
25 CHU Blida Hôpital Frantz Fanon - Laboratoire Pr ABDI Samia AZROU Sihem 025 40 49 69 025 40 49 69
central
26 EPH de Rouiba – Alger – Laboratoire central Pr DJENOUHAT Kamal BAGHDADI Imène 023 86 04 40 023 86 04 40
27 EHS BENAKNOUN Pr IMESSAOUDENE BENALI Khedaoudj

Belaid
28 CHU TLEMCEN Dr BOUSSELHAM Dr BOUSSELHAM

Ammara Ammara
11
CHU Tizi Ouzou

CHU Annaba
CHU Blida- EPH Boufarik –
CHU Oran- HMUR Oran CHU Constantine

EHU ORAN CHU Sétif
CHU Batna
Situation géographique des laboratoires médicaux membres du réseau AARN (année 2020)
IPA Institut Pasteur d’Algérie INSP Institut National de Santé Publique

CHU Centre Hospitalo-Universitaire CPMC Centre Pierre et Marie Curie
HCA Hôpital Central de l’Armée HMUS Hôpital Militaire Universitaire Spécialisé
EHS Etablissement Hospitalier Spécialisé HMUR Hôpital Militaire Universitaire Régional
EPH Etablissement Public Hospitalier EHU Etablissement Hospitalo-Universitaire
12
Sommaire
Pages
Préambule 14
Méthodologie 15
Contrôle de qualité de l’antibiogramme 19
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées
28
d’hémocultures
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées du liquide
39
céphalo-rachidien
Profil de sensibilité et de résistance de S. pneumoniae isolé à partir
47
d’autres prélèvements (LCR exclu)
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées des
54
coprocultures
Profils de sensibilité et de résistance des bactéries isolées des urines 61
Etat de la résistance aux antibiotiques et surveillance des bactéries
69
multi-résistantes (BMR)
13
PREAMBULE
Les années 2020-2021, sont appelées les années « Covid » . Lors de ces deux années, il
y a eu une pandémie due au virus SARS-CoV2. Durant cette période, en Algérie, les
hôpitaux ont été mobilisés pour prendre en charge les patients atteints de Covid-19, par
conséquent, les laboratoires de microbiologie et autres spécialités ont consacré beaucoup
de temps au diagnostic de cette maladie aux dépends des diagnostics des autres cas non
urgents. Les prélèvements concernant les autres infections étant rares, il est normal que le
nombre des données récoltées en microbiologie soit inférieur au nombre des données des
années précédentes. Il nous a donc paru plus judicieux de regrouper les résultats de ces
deux années en un seul document.
Ce bouleversement ne nous a pas empêchés d’assurer nos activités habituelles.

- En 2020 : notre réseau a été inscrit au niveau du système OMS « GLASS ». Système
de surveillance mondiale de la résistance bactérienne aux antibiotiques. Il permet de
partager les données des pays au niveau mondial.
La charte du réseau a été élaborée et distribuée durant cette année ainsi que le
fascicule « Standardisation des tests de sensibilité aux antibiotiques » rédigé par le
comité de rédaction du réseau et imprimé par l’OMS.
Le 16/12/2020, comme chaque année il y a eu par vidéo conférence, la journée
annuelle du réseau « Place du laboratoire de microbiologie dans l’antimicrobial
stewardship »
En 2021 : 29/11/2021, Journée annuelle du réseau par visio conférence

simultanément avec Oran et Constantine « Mésusage des antibiotiques en période
de pandémie ».
En 2022 avec la baisse des cas de Covid-19 les laboratoires du réseau ont repris
leurs activités normales.
PENSEE POUR NOS MALADES ET NOS CONFRERES QUI NOUS ONT QUITTES
DURANT CES ANNEES DE PANDEMIE.
Pr Kheira RAHAL
14
Méthodologie
Dr H. Ammari, Dr M.F.K. Missoum

et Pr A. Benslimani
15
1. Contrôle de qualité de l’antibiogramme
L’analyse des résultats du contrôle de qualité (CQ) de l’antibiogramme a été faite à

partir des données sur fichier excel envoyés par les différents laboratoires membres
du réseau, qui ont exploité leurs résultats de contrôle de qualité par logiciel WHONET
5.6.
La validation des données de l’antibiogramme a été faite à travers l’analyse des

résultats obtenus avec les souches de référence E. coli ATCC 25922, S. aureus ATCC
25923 et P. aeruginosa ATCC 27853
La période d’étude s’est étalée du 01 janvier 2020 au 31 décembre 2021. Les résultats
sont présentés séparément pour chaque année.
a. Critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs données dans les
délais impartis ont été inclus dans l’analyse.
b. Critères d’exclusion :
- contrôle de qualité interne (CQ) insuffisant (nombre total de tests < 30 par souche
ATCC et par molécule antibiotique correspondante).
- pourcentage de conformité insuffisant (<80%). Nous rappelons que les tests de CQ

sont considérés comme conformes lorsque les diamètres obtenus sont compris dans
l’intervalle des diamètres critiques plus ou moins 2 mm.
- antibiotiques ou des charges d’antibiotiques autres que ceux listés dans les
recommandations du fascicule de standardisation.
2. Etiologies bactériennes
Afin d’éviter les erreurs de transcription, l’étude des étiologies bactériennes a été faite
par les différents membres du comité de rédaction directement à partir des fichiers
WHONET et ou à partir de fichiers excel, pour les laboratoires ayant remis leurs
fichiers dans les délais.
16
3. Etude de la sensibilité et de la résistance aux antibiotiques
De même que pour les étiologies bactériennes, et pour les mêmes raisons,
l’exploitation des données de sensibilité aux antibiotiques des différentes espèces
bactériennes a été faite par les membres du comité de rédaction directement à partir
des fichiers WHONET et ou à partir de fichiers excel, pour les laboratoires ayant remis
leurs fichiers dans les délais.
a. critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs données dans les
délais impartis et ayant obtenu des CQ satisfaisants (voir paragraphe contrôle de
qualité de l’antibiogramme) ont été inclus dans l’analyse.
b. critères d’exclusion : ont été exclues des analyses les données des laboratoires
n’ayant pas fourni des CQ satisfaisants (voir paragraphe contrôle de qualité de
l’antibiogramme) ou n’ayant pas testé les molécules antibiotiques recommandées pour
chaque groupe de bactéries dans le fascicule de standardisation.
4. Etude des bactéries multi-résistantes (BMR)
a. critères d’inclusion : tous les laboratoires ayant envoyé leurs données dans les
délais impartis ont été inclus dans l’analyse.
b. critères d’exclusion :
- entérobactéries BLSE+ : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le

laboratoire participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests
mais pourcentage de conformité < 80%) avec E. coli ATCC 25922 vis-à-vis de CTX
et/ou AMC.
- entérobactéries résistantes ou intermédiaires aux carbapénèmes : les données ont

été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire participant avait obtenu un CQ non
satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais pourcentage de conformité < 80%) avec E.
coli ATCC 25922 vis-à-vis de l’ertapénème.
- SARM : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire participant
avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais pourcentage de
conformité < 80%) avec S. aureus ATCC 25923 vis-à-vis de FOX.
17
- Acinetobacter spp. IPM R : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le
laboratoire participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests
mais pourcentage de conformité < 80%) avec P. aeruginosa ATCC 27853 vis-à-vis de
IPM.
- P .aeruginosa IPM R, P. aeruginosa CAZ R et P. aeruginosa CIP R : les données ont

été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire participant avait obtenu un CQ non
satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais pourcentage de conformité < 80%) avec P.
aeruginosa ATCC 27853 vis-à-vis de IPM, CAZ et CIP.
- Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium résistants ou intermédiaires à la

vancomycine: les données ont été exclues de l’analyse lorsque le laboratoire
participant avait obtenu un CQ non satisfaisant (<30 tests ou > 30 tests mais
pourcentage de conformité < 80%) avec S. aureus ATCC 25923 vis-à-vis de VAN.
18
Contrôle de qualité de l’antibiogramme
Dr M.F.K. Missoum et Dr H. Ammari
19
Le contrôle de qualité interne permet d’assurer l'évaluation continue de la

reproductibilité des résultats, de garantir la performance des réactifs et du personnel
technique, ainsi seul garant de la fiabilité des résultats des tests de sensibilité aux
antibiotiques.
La période d’étude s’est étalée du 01 janvier au 31 décembre 2020.
Contrairement aux années précédentes, et à titre exceptionnel, les laboratoires ayant
effectué moins de 30 tests de CQ par souche ATCC ont été retenus pour l’analyse et
leurs résultats des tests de sensibilité vis-à-vis des souches de référence ou des
molécules correspondantes ont donc été validés lorsque les critères étaient assurés
(voir chapitre méthodologie).
1 - Liste des antibiotiques à tester par souche de référence

Le contrôle de qualité interne pour les laboratoires médicaux a porté sur les molécules
répertoriées dans le tableau 1.
2 - Laboratoires non retenus pour l’analyse

Pour l’année 2020, sur l’ensemble des laboratoires médicaux membres du réseau
AARN répartis sur le territoire national, 05 laboratoires membres n’ont pas remis leurs
résultats de CQ, donc non inclus dans l’analyse des résultats pour cette année.
3 - Laboratoires retenus pour l’analyse

CHU Mustapha Bacha INSP IPA Dely Ibrahim
CHU Béni Messous EHS EL Hadi Flici CHU Batna
CHU Bab El Oued HCA CHU Blida
EHS CPMC EPH Bologhine CHU Constantine
CHU Annaba CHU Tlemcen CHU Oran
EHS Zemirli EHS Ben Aknoun EHU Oran
HMUS Staoueli EPH Birtraria EPH Boufarik
20
4 - Résultats et remarques
Pour l’ensemble des laboratoires retenus pour l’analyse, de même que pour les
résultats de l’année précédente (2019), que ce soit pour E. coli ATCC 25922, S.
aureus ATCC 25923 ou pour P. aeruginosa ATCC 27853, les nombres de tests par
molécule antibiotique sont toujours sensiblement les mêmes vis-à-vis de chaque
souche ATCC testée et ceci pour chaque laboratoire.
Nous avons également constaté la persistance des faits signalés l’année précédente,
à savoir :
 Le nombre de molécules exclues du fait de leur non-conformité est restreint.
 Pour un nombre non négligeable de laboratoires, l’envoi des fichiers CQ au de-
là des délais fixés.
D’où la nécessité incontournable de la validation des fichiers et des CQ par le collègue

référent pour chaque laboratoire avant l’envoi des données (nécessité de lancer au
moins une analyse par souche ATCC).
- Pour S. pneumoniae ATCC 49619, 05 laboratoires médicaux ont pratiqué des
tests de CQ.
- Pour H. influenzae ATCC 49247, seul le laboratoire de l’IPA Dely Ibrahim a
effectué des tests de CQ vis à vis de cette souche de référence.
Le nombre de laboratoires qui effectuent ces tests reste toujours insuffisant (difficultés
à entretenir les souches et la non disponibilité du milieu HTM).
Les résultats des tests de CQ par laboratoire et par souche ATCC sont rapportés dans
les tableaux 2, 3, 4, 5 et 6.
21
5 – Recommandations
Nous rappelons que les anomalies doivent être signalées lors des évaluations
annuelles et nous recommandons de créer des fichiers Whonet pour les résultats de
CQ.
Nous recommandons également de:
 responsabiliser un membre de l’équipe technique du laboratoire qui sera
chargé de veiller à la conservation et l’entretien des souches de
référence selon les recommandations du fascicule de standardisation.
 retirer de toutes les paillasses les souches de référence dont les résultats
de CQ ne sont pas satisfaisants.
 veiller à respecter la durée de validité de l’étalon Mc Farland et contrôler
régulièrement sa turbidité, vérifier également l’étalonnage des
densitomètres.
 changer les souches de référence au début de chaque mois et travailler
avec des cultures de 18 h.
 conserver correctement les cartouches de disques d’antibiotiques.
 mesurer correctement les zones d’inhibition.
 tenir compte de la mise à jour des diamètres d’inhibition spécifiques aux
souches de contrôle de qualité.
 superviser les opérations de saisie des résultats de contrôle par le
partenaire membre du réseau.
 veiller à détecter en temps réel l’anomalie constatée au niveau d’un test
de CQ effectué, afin d’apporter une action corrective en tenant compte
de l’algorithme recommandé dans le fascicule de standardisation.
22
Tab. 1 : Liste des antibiotiques à tester par souche de référence
E. coli S. aureus P. aeruginosa S. pneumoniae H. influenzae
ATCC 25922 ATCC 25923 ATCC 27853 ATCC 49619 ATCC49247
Ampicilline (10µg) Pénicilline G(10UI) Ticarcilline (75µg) Oxacilline(1µg) Ampicilline (10µg)

Amoxicilline+ Céfoxitine(30µg) Amoxicilline
Acide clavulanique (20 µg +10µg) Ticarcilline Erythromycine (15µg)
Kanamycine (30µg) +Acide clavulanique
Céfazoline(30µg) +Acide clavulanique(75µg/10µg) Clindamycine(2µg)
Gentamicine(10µg) (20 µg +10µg)
Céfalotine(30µg) Pipéracilline(100µg)
Céfoxitine(30µg)
Amikacine (30µg) Chloramphénicol (30µg) Céfotaxime (30µg)
Céfotaxime(30µg) Erythromycine (15µg) Ceftazidime (30µg) Rifampicine (5µg) Tétracycline(30µg)
Ceftazidime(30µg) Clindamycine (2µg) Aztréonam (30µg) Azithromycine (15µg)
Triméthoprime
Aztréonam(30µg) Pristinamycine (15µg) / Acide nalidixique(30µg)
Imipénème (10µg) +Sulfaméthoxazole
Imipénème(10µg) Quinupristine-Dalfopristine(15µg) Ciprofloxacine (5µg)
Ertapénème(10µg) Ofloxacine (15µg) Amikacine (30µg) (1.25/23.75µg) Chloramphénicol(30µg)
Gentamicine (10µg) Ciprofloxacine (5µg) Gentamicine (10µg) Vancomycine (30µg) Triméthoprime
Amikacine(30µg) Lévofloxacine (5µg) + Sulfaméthoxazole
Acide nalidixique(30µg) Tobramycine (10µg) Lévofloxacine (5µg)
Chloramphénicol(30µg) (1.25/23.75µg)
Ciprofloxacine(5µg) Nétilmicine (30µg) Doxycycline (30µg)
Chloramphénicol(30µg)
Vancomycine*(30µg) Rifampicine (5µg)
Teicoplanine (30µg) Ciprofloxacine (5µg) Pristinamycine (15µg) /
Nitrofurantoïne(300µg)
Triméthoprime Rifampicine (5µg) Lévofloxacine (5µg) Quinupristine- Dalfopristine
+Sulfaméthoxazole(1.25/23.75µg) Triméthoprime (15µg)
Colistine (10µg)
Fosfomycine (200µg) +Sulfaméthoxazole(1.25/23.75µg) Fosfomycine (50µg)
Tétracycline(30µg) Gémifloxacine(5µg)
Acide fusidique(10 µg)
* Vancomycine : pour tester la validité du disque ou de la cartouche d’antibiotique
23
Tab. 2 : Tests du CQ de E coli ATCC 25922 par laboratoire (année 2020).
Laboratoires Antibiotiques
AMP AMC ATM CZO FOX CTX IPM ERT MERO AMK GEN NAL CIP COL CHL NIT SXT FOS 200
CHU MUSTAPHA BACHA X X X X X X X
CHU BENI MESSOUS X X X

CHU BAB EL OUED X X X X
EHS CPMC X X
EHS EL HADI FLICI
X X X
INSP X X X X X X X X X X
CHU HUSSEIN DEY X X X
HCA X X X X X X X X X X X X X X X X
CHU BLIDA X X X X
CHU ORAN X X X X X
CHU ANNABA X
EPH BOLOGHINE
EPH BIRTRARIA X X X X
EHU ORAN X X X X
EHS ZEMIRLI X X
IPA – DELY BRAHIM
CHU BEN BADIS X X X X
CHU BATNA X X X X
EHS BEN AKNOUN X X X
CHU TLEMCEN X X X X
EPH BOUFARIK X X X X X X X
HMUS STAOUELI X X X X X X X X X
Critères d’exclusion : 1- Pourcentage de conformité < 80% (in) . 2- Molécule antibiotique non testée X : Molécule exclue Molécule incluse
24
Tab. 3 : Tests du CQ de S .aureus ATCC 25923 par laboratoire (année 2020).
Laboratoires Antibiotiques
PEN OXA (CMI) FOX AMK GEN KAN ERY CLI QDA OFX CIP LVX CHL VAN (CMI) TEC RIF SXT TCY FUS
CHU MUSTAPHA BACHA X X X
CHU BENI MESSOUS X X
CHU BAB EL OUED X X X X X X X
EHS CPMC
EHS EL HADI FLICI X X X
INSP X X X X X X X X X X X X X
CHU HUSSEIN DEY X X X X
HCA X X X X X X X X X X
CHU BLIDA X
CHU ORAN X X X X X
CHU ANNABA X
EPH BOLOGHINE
EPH BIRTRARIA X X X X X
EHU ORAN X X X
EHS ZEMIRLI X X
IPA – DELY BRAHIM
CHU BEN BADIS X X X X X X X
CHU BATNA X X X X X X
EPH AMIZOUR
EHS BEN AKNOUN X X X
CHU TLEMCEN X X X X
EPH BOUFARIK X X X X X
HMUS STAOUELI X X X X X X X X X X X X X X X
Critères d’exclusion : 1- Pourcentage de conformité < 80% (in) . 2- Molécule antibiotique non testée X : molécule exclue
25
Tab. 4 : Tests du CQ de P. aeruginosa ATCC 27853 par laboratoire (année 2020).
Antibiotiques
Laboratoire
TIC TCC PIP PIP/TAZ CAZ ATM IPM MERO AMK GEN TOB NET CIP LVX COL (CMI) FOS (CMI)
CHU MUSTAPHA BACHA X X X X X X
CHU BENI MESSOUS X X X X
CHU BAB EL OUED X X X X
EHS CPMC X X X
EHS EL HADI FLICI X X X X
INSP X X X X X X X X X X X
CHU HUSSEIN DEY X X X X X X X
HCA X X X X X X X X X
CHU BLIDA X X X X
CHU ORAN X X X X
CHU ANNABA X X
EPH BOLOGHINE X X X
EPH BIRTRARIA X X X
EHU ORAN X X X X X
HMRU ORAN 37X 37X
EHS ZEMIRLI X X
IPA – DELY BRAHIM X
CHU BEN BADIS X X X X X
CHU BATNA X X X X
EHS BEN AKNOUN X X X X X X X
CHU TLEMCEN X X X X
EPH BOUFARIK X X X X X
HMUS STAOUELI X X X X X X X X X X X X X X
Critères d'exclusion : 1- Pourcentage de conformité < 80% (in) . 2- Molécule antibiotique non testée X : molécule exclue
26
Tab. 5 : Tests du CQ de Streptococcus pneumoniae ATCC 49619 par laboratoire (année 2020).
Antibiotiques
Laboratoire Ox 1µg ERY CLI QDA RIF SXT VAN LVX CHL DOX GEM
CHU Blida X
EHU Oran X
HCA X X X X X X X X X X X
EHS El Kettar X X
IPA Dely Brahim X X X X
Tab. 6*: Tests du CQ de Haemophilus influenzae ATCC 49247 par laboratoire (années 2020).
Laboratoire Antibiotiques
AMP AMC CTX TET AZM NAL CIP/LVX CHL SXT RIF
IPA Dely Brahim
* toutes les molécules sont incluses
27
Profils de sensibilité et de résistance des

bactéries isolées d’hémocultures
Pr. S. Mahrane
Année 2020
28
Tab. 7: Nombre et pourcentage des différentes espèces* bactériennes isolées

des hémocultures (N= 2043, année 2020)
Espèces Nombre Pourcentage

K. pneumoniae 490 23,98
S. aureus 346 16,94
A. baumannii 241 11,8
E. coli 198 9,7
P. aeruginosa 184 9
S. marcescens 154 7,54
E. faecalis 139 6,8
E. cloacae 131 6,41
E. faecium 64 3,13
S. maltophilia 19 0,93
Salmonella spp. 19 0,93
P. mirabilis 18 0,88
K. oxytoca 15 0,73
S. pneumoniae 11 0,54
S. agalactiae 6 0,3
S. pyogenes 4 0,2
H. influenzae non b 2 0,1
N. meningitidis 1 0,05
Shigella spp. 1 0,04
Total 2043 100
*les staphylocoques à coagulase négative n’ont été pris en considération
29
Fig. 1: Pourcentage des différentes espèces bactériennes isolés à partir des

hémocultures (N= 2043, année2020)
30
Tab. 8 : Nombre et pourcentage des Klebsiella pneumoniae

résistantes (R + I) aux antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2020)
Antibiotique
Nombre Total Pourcentage
AMC 307 457 67,18
CZO* 353 440 80,23
FOX 92 395 23,29
CTX / CRO 339 450 75,33
CAZ 97 130 74,62
ATM 57 77 74,03
IPM 67 440 15,23
ERT 74 365 20,27
GEN 205 411 49,88
AMK 65 447 14,54
CHL 43 269 15,99
NIT 96 159 60,38
NAL 90 176 51,14
CIP 223 428 52,10
COL (CMI)** 3 159 1,89
SXT 301 420 71,67
FOS 23 192 11,98
** : La CMI de la colistine doit se faire en milieu liquide
* : La résistance à la céfazoline est habituellement associée à celle de l’amoxicilline+acide
clavulanique. La différence observée pourrait être due à un problème de lecture (valeurs
critiques pour la céfazoline sensible pour tout diamètre ≥15mm pour les souches isolées du
tractus urinaire au lieu de ≥23mm pour les autres sites ). Les taux rapportés sont à prendre
avec précaution.
Fig. 2: Pourcentage des Klebsiella pneumoniae résistantes (R + I) aux

antibiotiques isolées d’hémocultures (année 2020)
31
www.sante.dz/aarn
Tab. 9: Nombre et pourcentage des Escherichia coli

résistants (R + I) aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020)
Antibiotique Nombre Total Pourcentage
AMP / AMX 143 185 77,30
AMC 102 187 54,55
CZO 95 174 54,60
FOX 16 149 10,74
CTX / CRO 70 195 35,90
CAZ 20 47 42,55
ATM 10 37 27,03
IPM 4 188 2,13
ERT 7 153 4,58
GEN 39 181 21,55
AMK 6 187 3,21
CHL 19 106 17,92
NIT 9 64 14,06
NAL 45 97 46,39
CIP 75 181 41,44
COL (CMI) 0 70 0,00
SXT 96 177 54,24
FOS 4 97 4,12
Fig. 3 : Pourcentage des Escherichia coli résistants (R + I) aux antibiotiques

isolés d’hémocultures (année 2020)
32
www.sante.dz/aarn
Tab. 10: Nombre de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques


AMP / AMX 29 38 76,32
AMC 20 38 52,63
CZO 20 37 54,05
FOX 4 35 11,43
CTX / CRO 13 39 33,33
CAZ 4 10 FE
ATM 2 9 FE
IPM* 4 39 10,26
ERT 1 28 FE
GEN 13 38 34,21
AMK 12 36 33,33
CHL 12 24 FE
NAL 5 12 FE
CIP 9 36 25,00
SXT 24 36 66,67
FOS 9 23 FE
FE : Faible effectif
* : Proteus mirabilis a une résistance naturelle de bas niveau à l’imipénème.
Fig. 4 : Pourcentage des Proteus mirabilis résistants (R + I) aux antibiotiques

33
www.sante.dz/aarn
Tab. 11: Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae
Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

CTX / CRO 66 121 54,55
CAZ 25 36 69,44
ATM 13 24 FE
IPM 6 111 5,41
ERT 11 84 13,10
GEN 50 107 46,73
AMK 11 121 9,09
CHL 35 82 42,68
NIT 25 47 53,19
NAL 14 45 31,11
CIP 44 117 37,61
COL (CMI) 0 44 0,00
SXT 58 119 48,74
FOS 10 56 17,86
Fig. 5: Pourcentage des Enterobacter cloacae résistants (R + I) aux

antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020)
34
www.sante.dz/aarn
Tab. 12 : Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus


PEN 224 226 99,12
OXA 191 322 59,32
KAN 68 152 44,74
GEN 78 285 27,37
AMK 37 157 23,57
ERY 129 303 42,57
CLI 68 284 23,94
PRI / QDF 8 264 3
VAN (CMI) 0 169 0,00
TEC 0 210 0,00
RIF 34 222 15,32
SXT 57 271 21,03
TCY 73 222 32,88
CHL 15 208 7,21
FUS 57 200 28,50
OFX 44 165 26,67
CIP 81 176 46,02
LVX 34 96 35,42
FOS 8 +
119 6,72
Fig. 6 : Pourcentage des Staphylococcus aureus résistants (R + I)

aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020)
35
www.sante.dz/aarn
Tab. 13: Nombre et pourcentage de Pseudomonas aeruginosa
Antibiotiques Nombre Total Pourcentage

TIC 87 169 51,48
TCC 85 151 56,29
PIP 56 161 34,78
CAZ 43 163 26,38
ATM 22 115 19,13
IPM 44 169 26,04
GEN 35 164 21,34
TOB 18 130 13,85
NET 7 66 10,61
AMK 36 172 20,93
CIP 21 161 13,04
LVX 10 90 11,11
FOS (CMI) 20 47 42,55
COL 2 129 1,55
Fig. 7 : Pourcentage des Pseudomonas aeruginosa résistants (R + I)
aux antibiotiques isolés d’hémocultures (année 2020)
36
www.sante.dz/aarn
Tab. 14 : Répartition des BMR dans les hémocultures (N=2017) (année 2020)
Marqueurs de résistance Nombre Pourcentage
EBLSE 494 24,5
Entérobactéries CTX 586 29,05
Entérobactéries de sensibilité diminuée au carbapénèmes
104 5,15
(ertapenem R+I)
ABRI 201 9,96
A. baumannii BLSE 117 5,8
ABRCiprofloxacine 187 9,27
PARCeftazidime 45 2,23
P. aeruginosa résistant à l'imipénème (R+I) 42 2,08
P. aeruginosa BLSE 25 1,23
PARCiprofloxacine 18 0,9
SARM 180 8,93
ERV 18 0,9
Total 2017 100
Abréviations : EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC : entérobactérie
résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine résistant, ABRI : A. baumannii
résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime résistant, HinPASE : pénicillinase,
SARM : S. aureus résistant à la méticilline, VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides
intermediate S. aureus, ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité
diminuée aux pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu, IPMR : imipénème résistant.
Tab. 8 : Répartition des BMR dans les hémocultures (N=2017) (année 2020)
37
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Tab. 15 : Nombre et pourcentage des BMR par espèce bactérienne dans les
hémocultures (N=2017) (année 2020)

ABRI 201 81,05
SARM 180 52,17
EBLSE 494 45,61
Entérobactéries de sensibilité diminuée au carbapénèmes
104 10,86
(ertapenem R+I)
ERV 18 9,14
Abréviations : EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC : entérobactérie
résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine résistant, ABRI : A. baumannii
résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime résistant, HinPASE : pénicillinase,
SARM : S. aureus résistant à la méticilline, VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides
intermediate S. aureus, ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité
diminuée aux pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu, IPMR : imipénème résistant.
Fig.9 : Nombre et pourcentage des BMR par espèce bactérienne dans les
hémocultures (N=2017) (année 2020)
38
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bactéries isolées du liquide céphalo-rachidien
Dr. H. Ammari
Année 2020
39
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Introduction
- Dans ce chapitre nous nous sommes intéressées à l’analyse des données

concernant les espèces bactériennes isolées du LCR et leurs profils de sensibilité
aux antibiotiques. Ces données ont été collectées sur la base des fichiers Whonet et
des questionnaires transmis par les membres du réseau, et concernent la période
allant de janvier à décembre 2020.
- Nous présenterons dans un premier temps les trois principales espèces bactériennes
responsables de méningites communautaires : Neisseria meningitidis, Streptococcus
pneumoniae et H. influenzae, dans un deuxième temps les autres étiologies
bactériennes.
Tab. 16 : Nombre des isolats bactériens à partir du LCR (année 2020)
S. pneumoniae
H. influenzae b
N. meningitidis
Espèces
S. agalactiae
Laboratoires
CHU Béni-Messous 0 2 0 0
EHS El Hadi Flici 2 10 0 0
CHU Hussein Dey 1 0 0 1
CHU Constantine 0 3 0 0
CHU Batna 1 2 0 0
CHU Oran 0 4 0 3
CHU Tizi Ouzou 0 3 0 1
CHU Annaba 0 1 0 0
EHS Zemirli 0 1 0 0
EPH Boufarik 0 1 0 0
CHU Tlemcen 0 0 0 1
Total 4 27 0 6
IPA* 3 13 0 0
Total général 7 40 0 6
* L‘IPA étant un laboratoire de référence, ses résultats sont présentés séparément.
40
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Tab.17 : Répartition des isolats de N. meningitidis par sérogroupe (année 2020)
Non
Sérogroupe A B W/Y Y Total
précisé
Réseau 1 1 2 0 0 4
IPA 0 2 ---- 1 0 3
Total 1 3 2 1 0 7
Tab. 18 : Répartition des souches de N. meningitidis par sérogroupe et par tranches

d’âges (Résultats du réseau, année 2020)
Sérogroupe Non
A B C W/Y précisé Total
Age
0-23 mois 0 1 0 0 0 1
24- 59 mois 0 0 0 0 0 0
5 ans-15 ans 0 0 0 1 0 1
16 ans – 20 ans 0 0 0 0 0 0
21 ans- 25 ans 1 0 0 0 0 1
26 ans- 30 ans 0 0 0 0 0 0
31 ans - 35 ans 0 0 0 0 0 0
36 ans - 40 ans 0 0 0 1 0 1
41 ans – 45 ans 0 0 0 0 0 0
46 ans - 55 ans 0 0 0 0 0 0
56 ans - 65 ans 0 0 0 0 0 0
>65 ans 0 0 0 0 0 0
Non précisé 0 0 0 0 0 0
TOTAL 1 1 0 2 0 4
41
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Tab. 19 : Répartition des souches de N. meningitidis par sérogroupe et par tranches

d’âges (Résultats de l’IPA, année 2020)
Sérogroupe
Non
Age A B C W Y Total
précisé
0-23 mois 0 1 0 0 0 0 1
24- 59 mois 0 0 0 0 0 0 0
5 ans-15 ans 0 0 0 0 1 0 1
16 ans – 20 ans 0 0 0 0 0 0 0
21 ans- 25 ans 0 1 0 0 0 0 1
26 ans- 30 ans 0 0 0 0 0 0 0
31 ans - 35 ans 0 0 0 0 0 0 0
36 ans - 40 ans 0 0 0 0 0 0 0
41 ans – 45 ans 0 0 0 0 0 0 0
46 ans - 55 ans 0 0 0 0 0 0 0
56 ans - 65 ans 0 0 0 0 0 0 0
>65 ans 0 0 0 0 0 0 0
Non précisé 0 0 0 0 0 0 0
TOTAL 0 2 0 0 1 0 3
42
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Tab. 20 : Nombre de Neisseria meningitidis sensibles et résistants aux

antibiotique (Résultats du réseau, année 2020)
Antibiotique Résistant Intermédiaire Sensible
PEN (CMI) 1/3 0/3 2/3

AMP (CMI) 0/3 1/3 2/3
CTX 0/4 0/4 4/4
CRO 0/3 0/3 3/3
CHL 0/2 0/2 2/2
RIF 0/4 0/4 4/4
CIP 0/2 0/2 2/2
AZM 0/3 0/3 3/3
Abréviations : PEN (pénicilline), AMP (ampicilline), CTX (céfotaxime), CRO (céftriaxone), CHL
(chloramphénicol), RIF (rifampicine), CIP (ciprofloxacine), AZM (azithromycine).
Tab. 21 : Nombre de N. meningitidis sensibles et résistants aux antibiotiques

(Résultats de l’IPA, année 2020)
Antibiotique Résistant Intermédiaire Sensible
PEN (CMI) 0/3 2/3 1/3

AMP (CMI) 0/3 2/3 1/3
CTX / CRO 0/3 0/3 3/3
CHL(CMI) 0/3 0/3 3/3
RIF (CMI) 0/3 0/3 3/3
CIP (CMI) 0/3 0/3 3/3
AZM (CMI) 0/3 0/3 3/3
Abréviations : PEN (pénicilline), AMP (ampicilline), CTX (céfotaxime), CRO (céftriaxone), CHL
(chloramphénicol), RIF (rifampicine), CIP (ciprofloxacine), AZM (azithromycine).
43
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Tab. 22 : Répartition des souches de S. pneumoniae par tranches d’âges dans le LCR
(année 2020)
Nombre de souches
Age
Réseau IPA
0-23 mois 3 3
24- 59 mois 2 2
5 ans-15 ans 4 4
16 ans – 20 ans 0 0
21 ans- 25 ans 0 0
26 ans- 30 ans 0 1
31 ans - 35 ans 1 0
36 ans - 40 ans 2 0
41 ans – 45 ans 3 1
46 ans - 55 ans 2 1
56 ans - 65 ans 1 1
>65 ans 1 0
Non précisé 8 0
TOTAL 27 13
44
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Tab. 23 : Nombre et pourcentage* de résistance et de sensibilité
de S. pneumoniae aux antibiotiques dans le LCR (année 2020)
Réseau IPA
Antibiotiques R I S R I S
PEN (CMI) 9/15 0/15 6/15 9/13 0/13 4/13
CTX (CMI) 3/18 2/18 13/18 1/13 3/13 9/13
IPM (CMI) 1/17 5/17 11/17 2/13 3/13 8/13
ERY 8/18 2/18 8/18 8/13 0/13 5/13
CLI 6/17 1/17 10/17 6/13 0/13 7/13
QDA NT NT NT NT NT NT
CHL 1/14 0/14 13/14 0/13 0/13 13/13
RIF 0/16 0/16 16/16 0/13 0/13 13/13
SXT 6/13 0/13 7/13 3/13 1/13 9/13
VAN 0/20 0/20 20/20 0/13 0/13 13/13
LVX 0/13 1/13 12/13 0/13 0/13 13/13
DOX 3/11 0/11 8/11 0/13 0/13 13/13
FOS (50µg) 0/4 0/4 4/4 6/13 0/13 7/13
GEM NT NT NT NT NT NT
Abréviations : PEN (pénicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY (érythromycine), CLI
(clindamycine), QDA (quinupristine- dalfopristine), CHL (chloramphénicol), RIF (rifampicine), SXT
(cotrimoxazole), VAN (vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX (doxycycline), FOS (fosfomycine),
GEM (gémifloxacine), CMI (concentration minimale inhibitrice), R (Résistant), I (intermédiaire), S
(sensible), NT (non testé).
* Les pourcentages ne sont pas calculés pour des effectifs inférieurs à 30.
NT : non testé
Tab. 24: Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la Pénicilline G

pour S. pneumoniae dans le LCR (année 2020)
Nombre de souches
CMI (mg/L)
Réseau IPA
≤ 0,016 0 1
[0,032 - 0,125 [ 8 3
[0,125 - 0,25 [ 0 1
[0,25 - 0,5 [ 0 2
[0,5 – 1 [ 0 1
[1 – 2 [ 1 2
[2 – 4 [ 2 3
[4 – 8 [ 2 0
[8 – 16 [ 0 0
≥ 16 2 0
Total 15 13
45
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Tab. 25: Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae
isolé à partir du LCR (année 2020)
Laboratoires Nombre de souches Nombre de CMI

isolées Pénicilline G Céfotaxime Imipénème
CHU Béni-Messous 2 1 1 1
EHS El Hadi Flici 10 8 10 10
CHU Constantine 3 0 0 0
CHU Batna 2 1 2 2
CHU Oran 4 4 4 4
CHU Tizi Ouzou 3 0 0 0
CHU Annaba 1 0 0 0
EHS Zemirli 1 1 1 0
EPH Boufarik 1 0 0 0
Total 27 15 18 17
IPA 13 13 13 13
TOTAL GENERAL 40 28 31 30
Tab. 26: Sérotypes de S. pneumoniae dans le LCR (Données de l’IPA, année 2020)
Sérotype Nombre de souches

Type 7F 1
Type 10A 1
Type 11A 1
Type 12B 1
Type 14 1
Type 19F 3
Type 23F 2
Type 24A 1
Type 24F 1
Type 31 1
Total 13
46
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Profils de sensibilité et de résistance de

S. pneumoniae isolé à partir d’autres
prélèvements (LCR exclu)
Dr. H. Ammari
(2020)
47
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Introduction
Les tableaux et figures représentés ci-après, rapportent les résultats de sensibilité et de

résistance aux antibiotiques des souches de Streptococcus pneumoniae, isolées à partir des
prélèvements autres que le liquide céphalo-rachidien, durant la période allant de janvier à
décembre 2020.
L’analyse des données a été faite par le logiciel WHONET 2019.
Tab. 27 : Nombre des isolats de S. pneumoniae (LCR exclu) par laboratoire

(année 2020)
Laboratoires Nombre de souches de S. pneumoniae
CHU Béni-Messous 15
EHS CPMC 3
EHS El Hadi Flici 2
CHU Hussein Dey 6
HCA 10
EPH Birtaria 8
CHU Constantine 2
CHU Blida 7
CHU Oran 2
CHU Tizi Ouzou 1
EHS Zemirli 3
Total 59
IPA* 7
Total général 66
* L’IPA étant laboratoire de référence, ses résultats sont présentés séparément.
48
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Tab. 28: Répartition des souches de S. pneumoniae par type de prélèvement (LCR
exclu) (année 2020)
Nombre de souches
Type de prélèvement
Réseau IPA
Oreille 5 0
Naso-pharyngé 4 0
Expectoration 10 3
Bronchique 4 1
Prélèvement distal protégé 2 0
Liquide pleural 7 0
Hémoculture 12 0
Suppurations 13 3
Non précisé 2 0
Total 59 7
Fig. 10: Répartition des souches de S. pneumoniae par type de prélèvement

(LCR exclu) (Résultats du réseau, année 2020)
49
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Tab. 29: Répartition par tranches d’âges des souches de S. pneumoniae

isolées à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2020)
Nombre de souches
Age
Réseau IPA
0-23 mois 9 1
24- 59 mois 2 1
5 ans-15 ans 6 1
16 ans – 20 ans 2 0
21 ans- 25 ans 0 1
26 ans- 30 ans 1 0
31 ans - 35 ans 2 0
36 ans - 40 ans 3 1
41 ans – 45 ans 1 0
46 ans - 55 ans 4 1
56 ans - 65 ans 2 0
>65 ans 7 1
Non précisé 20 0
TOTAL 59 7
Fig. 11: Répartition des souches de S. pneumoniae par catégories d’âges dans
les prélèvements autres que le LCR (Résultats du réseau, année 2020)
50
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Tab. 30 : Nombre et pourcentage* de résistance et de sensibilité de

S.pneumoniae aux antibiotiques dans les prélèvements autres que le LCR
(année 2020)
Réseau IPA
Antibiotiques R I S R I S
PEN (CMI):
- Orale 9/37 18/37 10/37 3/7 3/7 1/7

(24,3%) (48,7%) (27%)
- Parentérale 2/37 3/37 32/37 0/7 0/7 6/7
(5,4%) (8,1%) (86,5%)
AMX (CMI) 4/23 1/23 18/23 0/7 0/7 7/7
6/30 1/30 23/30
CTX (CMI)
(20%) (3,3%) (76,7%) 0/7 0/7 7/7
IPM (CMI) 1/19 8/19 10/19 0/6 2/6 4/6
23/48 4/48 21/48
ERY 4/7 0/7 3/7
(48%) (8,3%) (43.7%)
18/45 2/45 25/45
CLI 4/7 0/7 3/7
(40%) (4,4%) (55,6%)
QDA 4/10 1/10 5/10 NT NT NT
6/44 0/44 38/44
CHL 0/7 0/7 7/7
(13,6%) (0%) (86,4%)
2/40 0/40 38/40
RIF 1/7 0/7 6/7
(5%) (0%) (95%)
12/42 1/42 29/42
SXT NT NT NT
(28,6%) (2,4%) (69%)
0/50 0/50 50/50
VAN 0/7 0/7 7/7
(0%) (0%) (100%)
0/49 0/49 49/49
LVX 0/7 0/7 7/7
(0%) (0%) (100%)
2/31 2/31 27/31
DOX 0/7 0/7 7/7
(6,45%) (6,45%) (87,1%)
FOS (50µg) 3/11 0/11 8/11 NT NT NT
GEM NT NT NT NT NT NT
Abréviations :PEN (pénicilline), AMX (amoxicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY (érythromycine), CLI
(clindamycine), QDA (quinupristine- dalfopristine), CHL (chloramphénicol), RIF (rifampicine), SXT (cotrimoxazole), VAN
(vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX (doxycycline), FOS (fosfomycine), GEM (gémifloxacine), CMI (concentration minimale
inhibitrice), R (Résistant), I (intermédiaire), S (sensible), NT (non testé).
* Les pourcentages ne sont pas calculés pour des effectifs inférieurs à 30.
51
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Fig. 12 : Pourcentages de résistance et de sensibilité de S. pneumoniae aux

antibiotiques dans les prélèvements autres que le LCR (résultats du réseau,
année 2020)
Abréviations : PEN (pénicilline), AMX (amoxicilline), CTX (céfotaxime), IPM (imipénème), ERY (érythromycine), CLI
(clindamycine), CHL (chloramphénicol), RIF (rifampicine), SXT (cotrimoxazole), VAN (vancomycine), LVX (lévofloxacine), DOX
(doxycycline), CMI (concentration minimale inhibitrice), R (Résistant), I (intermédiaire), S (sensible).
Tab. 31: Distribution des valeurs de CMI vis-à-vis de la Pénicilline G pour

S. pneumoniae dans les prélèvements autres que le LCR (année 2020)
Nombre de souches
CMI (mg/L)
Réseau IPA
≤ 0,016 3 0
[0,032 - 0,125 [ 8 1
[0,125 - 0,25 [ 5 3
[0,25 - 0,5 [ 5 0
[0,5 – 1 [ 5 0
[1 – 2 [ 3 0
[2 – 4 [ 3 3
[4 – 8 [ 5 0
[8 – 16 [ 0 0
≥ 16 0 0
Total 37 7
52
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Tab. 32: Nombre de CMI déterminées par laboratoire pour S. pneumoniae

isolé à partir des prélèvements autres que le LCR (année 2020)
Nombre Nombre de CMI déterminées
Laboratoires de
souches Pénicilline G Amoxicilline Céfotaxime Imipénème
isolées
CHU Béni-Messous 15 6 5 6 1
CHU Constantine 2 0 0 0 0
CHU Blida 7 7 0 0 0
CHU Oran 2 2 2 2 2
CHU Tizi Ouzou 1 .0 0 0 0
CHU Hussein Dey 6 0 5 4 4
HCA 10 10 10 10 8
EPH Birtaria 8 7 1 1 2
EHS El Hadi Flici 2 2 0 1 2
EHS CPMC 3 1 0 3 0
EHS Zemirli 3 2 0 3 0
Total 59 37 23 30 19
IPA 7 7 7 7 6
TOTAL GENERAL 66 44 30 37 25
53
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Profils de sensibilité et de résistance des bactéries

isolées des coprocultures
Pr. M. N. KORICHI- OUAR
Année 2020
54
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I- Introduction :
Ce chapitre regroupe l’ensemble des données adressées par les laboratoires membres du
réseau AARN durant l’année 2020 ,concernant les étiologies responsables des gastro-
entérites bactériennes ,la résistance des salmonelles aux antibiotiques et les sérotypes les
plus fréquemment isolés.
II- Résultats et discussion :
Tab. 33 : Nombre et pourcentage de souches bactériennes isolées des coprocultures

(année 2020)
Hospitalisés Externes Totaux
Nombre % Nombre % Nombre %
Salmonella spp.
155 72,09 13 37,14 168 70,59
E.coli
51 23,72 7 20,00 58 24,37
6 02,79 2 05,72 8 03,36

Shigella spp.
Pseudomonas 3 01,40 1 02,86 4 01,68
aeruginosa
Totaux
215 100 23 100 238 100
Fig. 13 : Nombre des souches bactériennes isolées des coprocultures (année 2020)
(n=238)
Sur un total de 238 souches isolées des coprocultures : 168 souches de Salmonella spp.
ont été isolées.
Nous notons :
 le questionnaire de collecte des données est mal renseigné par certains membres du
réseau.
 Aucune souche de Campylobacter n’a été isolée.
55
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 Certains microbiologistes agglutinent encore les E.coli EPEC avec les douze sérums
commercialisés sans étude des facteurs de virulence des EPEC (gène « eae »)
Chute du nombre de souches bactériennes isolés des coprocultures durant l’année

2020 par rapport aux années précédentes, cela peut s’expliquer par la pandémie
Covid-19.
Données sur les salmonelles
L’ensemble des laboratoires du réseau AARN ont isolé un total de 228 souches de
salmonelles, 168 souches à partir des selles et 60 souches de prélèvements extra-digestifs.
Les 168 souches d’origine digestives sont essentiellement d’origine hospitalière avec 155
souches, contre 13 souches d’origine extra hospitalière.
Les 60 souches de salmonelles isolées des prélèvements extra digestifs sont aussi
majoritairement d’origine hospitalière avec 48 souches et 12 souches uniquement pour les
prélèvements extra hospitaliers. Les souches extradigestives ont été isolées à partir des
prélèvements suivants : hémoculture (n = 24), urine (n = 20), LCR (n = 8), autres
prélèvements (n = 8).
Tab. 34 : Nombre de salmonelles isolées à partir des différents prélèvements en

milieu hospitalier et externe (année 2020) (n = 228)
Hémoculture urine LCR autres Coproculture Total
Hospitalisés 22 17 8 1 155 203

Externes 2 3 7 13 25
Total 24 20 8 8 168 228
Fig. 14 : Nombre de salmonelles isolées à partir de différents types d’infections en

milieu hospitalier et externe (année 2020) (n=228)
56
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Tab. 35 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. résistantes (R + I) aux

antibiotiques (année 2020)
Hospitalisés Externes TOTAL
Antibiotiques
Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
AMP / AMX 163 203 80,29 16 24 FE 179 227 78,85
AMC 123 194 63,40 8 23 FE 131 217 60,36
CZO* 152 194 78,35 13 25 FE 165 219 75,34
FOX* 41 185 22,16 3 17 FE 44 202 21,78
CTX / CRO 121 202 59,90 3 22 FE 124 224 55,35
IPM 10 196 4,59 0 21 0,00 10 217 4,60
GEN* 105 193 54,40 9 23 FE 114 216 52,77
AMK* 85 186 45,69 4 21 FE 89 207 42,99
CHL 14 141 9,92 0 19 0,00 14 160 8,75
NIT 39 66 59,09 3 11 FE 42 77 54,54
NAL 51 64 79,68 13 16 FE 64 80 80,00
CIP 107 190 56,31 6 20 FE 113 210 53,80
SXT 89 153 58 ,16 2 20 FE 91 173 52,60
FOS 0 97 0,00 0 8 0,00 0 105 0,00

FE : faible effectif
*Bien qu’une sensibilité in vitro soit observée, il n’y a pas d’activité in vivo pour ces
molécules vis-à-vis de Salmonella.
Tab. 36 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. digestives résistantes (R + I) aux

Antibiotiques Hospitalisés Externes TOTAL
AMP / AMX 134 155 86,45 9 13 FE 143 168 85,12

AMC 110 148 74,32 5 12 FE 115 160 71,88
CZO * 139 152 91,45 6 13 FE 145 165 87,88
FOX * 36 146 24,66 2 11 FE 38 157 24,20
CTX / CRO 116 153 75,82 2 13 FE 118 166 71,08
IPM 10 147 6,12 0 13 FE 10 160 6,25
GEN * 94 151 62,25 4 13 FE 98 164 59,76
AMK * 76 144 52,78 2 12 FE 78 156 50,00
CHL 7 114 6,14 0 10 0,00 7 124 5,64
NIT 20 36 55,56 1 6 FE 21 42 50,00
NAL 24 34 70,59 2 5 FE 26 39 66,67
CIP 86 148 58,10 3 11 FE 89 159 55,97
SXT 82 110 74,54 1 11 FE 83 121 68,59
FOS 0 77 0,00 0 3 0,00 0 80 0,00
*Bien qu’une sensibilité in vitro soit observée, il n’y a pas d’activité in vivo pour ces
molécules vis-à-vis de Salmonella.
57
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Tab. 37 : Nombre et pourcentage de Salmonella spp. extra digestives résistantes (R +

I) aux antibiotiques (année 2020)

AMP / AMX 29 48 60,42 7 11 FE 36 59 61,02
AMC 13 46 28,26 3 11 FE 16 57 28,07
CZO 13 42 30,95 7 12 FE 20 54 37,04
FOX 5 39 12,82 1 6 FE 6 45 13,33
CTX / CRO 5 49 10,20 1 9 FE 6 58 10,34
IPM 0 49 0,00 0 8 0,00 0 57 0,00
GEN 11 42 26,19 5 10 FE 16 52 30,77
AMK 9 42 21,43 2 9 FE 11 51 21,57
CHL 7 27 FE 0 9 0,00 7 36 19,44
NIT 19 28 FE 2 7 FE 21 35 60,00
NAL 27 30 90,00 11 11 FE 38 41 92,68
CIP 21 42 50,00 3 9 FE 24 51 47,06
SXT 7 43 16,28 1 9 FE 8 52 15,38
FOS 0 20 0,00 0 5 0,00 0 25 0,00
Durant l’année 2020, les participants ont signalé des pénuries en disques d’antibiotiques, ce
qui pourrait expliquer le fait que toutes les souches isolées n’ont bénéficié de tests de
sensibilité aux antibiotiques.
Remarques
Le taux de résistance aux céphalosporines de 3 ème génération des salmonelles non

typhoïdiques est de 55,35 %, avec 71,8 % de résistance chez les souches digestives et 10
% chez les souches extra digestives. Ce taux élevé est dû en parti à une épidémie à
Salmonella Heidelberg productrice d’une BLSE au CHU de Constantine (n=123) .Durant
cette épidémie 10 souches résistantes de l’imipénème par production d’une
carbapénèmases ont été décrites (n= 10/217). L’émergence de cette résistance avait fait
l’objet d’une alerte en 2018 (https://www.aarn.pasteur.dz/index.php/alerte/34-alerte-du-17-
juin-2018)
Quatorze sérotypes différents ont été retrouvés dans les données des laboratoires du réseau
AARN. Les sérotypes les plus fréquents sont : S.Heidelberg (n=123, suite à une épidémie
en milieu hospitalier au CHU Constantine), S. Enteritidis (n= 36), S. Typhimurium (n=12),
S. Kentucky (n=2), S. ParaTyphi C (n=1), S. Hadar (n=1), S. Virchow ( n=1)
58
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Tab. 38 : Nombre et pourcentage des différents sérovars de salmonelles (données

du réseau, année 2020) (n=176)
Données réseau Données IPA

Sérotype Nombre Pourcentage Nombre Pourcentage
S.Heidelberg 123 69,88 --- ---
S.Enteritidis 36 20,45 12 30,77
S.Typhimurium 12 6,81 10 25,64
S .Kentucky 2 1,13 2 5,13
S.ParaTyphi C 1 0,56 --- ---
S.Hadar 1 0,56 3 7,69
S.Virchow 1 0,56 4 10,26
S.Indiana --- --- 1 2,56
S.Infantis --- --- 2 5,13
S.Derby --- --- 1 2,56
S.Bredeney --- --- 4 10,26
Total 176 100 39 100
Remarque : nombre de souches non typées : 52
Fig. 15 : Nombre des différents sérovars de salmonelles (données du réseau, année

2020) (n=176)
59
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Tab. 39 : Nombre et pourcentage de résistance aux antibiotiques des différents sérovars de salmonelles isolées des patients externes et
hospitalisés (données du réseau, année 2020)
salmonelle non Total

Antibiotiques Enteritidis Kentucky Typhimurium Heidelberg sérotypés
Nombre %
AMP ou AMX 16/36 2/2 8/12 122/123 31/51 179/227 79,20
AMC 9/36 2/2 5/12 97/113 18/51 131/217 60,36
CZO 7/30 1/2 8/11 119/122 29/51 165/219 75,34
FOX 3/30 1/2 2/10 27/120 10/38 44/200 22,00
CTX ou CRO 3/33 0/2 0/12 117/123 4/51 124/224 55,35
IPM 0/37 0/2 0/12 10/114 0/49 10/217 04,60
GEN 3/33 0/2 8/11 82/120 20/47 114/216 71,25
AMK 4/33 0/2 3/11 70/111 11/47 89/207 43,00
CHL 0/28 0/2 2/11 8/82 4/35 14/160 08,75
NIT 20/25 0/1 2/9 1/4 18/35 42/77 54,54
NAL 21/21 0/1 1/9 3/4 38/43 64/80 80,00
CIP 14/32 1/1 1/10 73/118 23/47 113/210 53,80
SXT 1/32 0/2 2/10 77/79 11/47 91/173 52,60
FOS 0/7 0/0 0/2 0/71 0/24 0/105 00,00
FE : faible effectif HN : CQ hors norme
60
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bactéries isolées des urines
Pr. S. Mahrane
Année 2020
61
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Tab. 40 : Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne
chez les patients hospitalisés (n= 3152 , année 2020)
Groupe de bactéries Espèces bactériennes Nombre Pourcentage

Entérobactéries E. coli 1550 49,18
(N=2475) K. pneumoniae 611 19,38
K. oxytoca 38 1,21
E. cloacae 85 2,70
P. aeruginosa 220 6,98
Bacilles à Gram A. baumannii 87 2,76
négatif S. maltophilia 1 0,03
oxydatifs
(N=308)
Staphylocoques S. aureus 68 2,16

(n=68)
Streptocoques S. agalactiae 33 1,05
(N=37) S. pyogenes 2 0,06
Entérocoques E. faecalis 202 6,41

(N=266) E. faecium 64 2,03
Total 3152 100,00
Fig. 16 : Pourcentage de souches isolées dans les urines chez les patients
hospitalisés (N=3152, année 2020)
62
Tab. 41 : Répartition des bactéries isolées des urines par espèce bactérienne
chez les patients externes (n=2987, année 2020)
Groupes bactériens Espèces

bactériennes Nombre Pourcentage
Entérobactéries E. coli 1812 60,66
(N=2581) K. pneumoniae 546 18,28
K. oxytoca 31 1,04
E. cloacae 71 2,38
Bacilles à Gram négatif P. aeruginosa 121 4,05
oxydatifs
(N=143) A. baumannii 22 0,74
Staphylocoques
(N=62) S. aureus 62 2,08
Streptocoques S. agalactiae 92 3,08
(N=94) S. pyogenes 2 0,07
Enterocoques E. faecalis 90 3,01
(N=107) E. faecium 17 0,57
Total 2987 100,00
Fig. 17 : Pourcentage des souches isolées dans les urines chez les patients
externes 2020 (N= 2987)
63
Tab. 42 : Nombre et pourcentage des E.coli résistants (R+I) isolés des urines
(année 2020)
Hospitalisés Externes TOTAL

Antibiotique
Nombre Total Pourcentage Nombre Total Pourcentage Nombre Total Pourcentage
AMP / AMX 1082 1319 82,03 1291 1647 78,38 2373 2966 80,01
AMC 715 1424 50,21 844 1748 48,28 1559 3172 49,15
CZO 406 989 41,05 730 1630 44,79 1136 2619 43,38
FOX 57 1108 5,14 50 1358 3,68 107 2466 4,34
CTX / CRO 249 1400 17,79 181 1670 10,84 430 3070 14,01
CAZ 71 380 18,68 58 450 12,89 129 830 15,54
ATM 58 383 15,14 30 383 7,83 88 766 11,49
IPM 6 1190 0,50 7 1473 0,48 13 2663 0,49
ERT 7 1098 0,64 6 1058 0,57 13 2156 0,60
GEN 349 1043 33,46 165 1592 10,36 514 2635 19,51
AMK 39 1330 2,93 19 1471 1,29 58 2801 2,07
CHL 80 466 17,17 86 542 15,87 166 1008 16,47
NIT 103 988 10,43 137 1167 11,74 240 2155 11,14
NAL 388 939 41,32 489 1367 35,77 877 2306 38,03
CIP 416 1343 30,98 443 1678 26,40 859 3021 28,43
COL (CMI) 0 337 0,00 1 311 0,32 1 648 0,15
SXT 700 1305 53,64 701 1580 44,37 1401 2885 48,56
FOS 16 867 1,85 19 994 1,91 35 1861 1,88
Fig. 18 : Pourcentage de résistance aux antibiotiques (R+I) des E. coli isolés

des urines (année 2020)
64
Tab. 43 : Répartition des BMR isolées des urines chez les patients hospitalisés
(N=1657, année 2020)

EBLSE 539 32,52
Entérobactéries sensibilité diminuée au 74 4,46
carbapénèmes (ertapenem R+I)
ABRI 66 3,98
SARM 25 1,5
ERV 18 1,1
Total 1657 100
Fig. 19 : Répartition des BMR isolées des urines chez les patients
hospitalisés (n=1657)
Abréviations :
EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC : entérobactérie
résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine résistant, ABRI :
A. baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ R : ceftazidime
résistant, PASE : pénicillinase, SARM : S. aureus résistant à la méticilline, VISA : vancomycin
intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus, ERV : entérocoque
résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée aux pénicillines,
BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu.
65
Tab. 44 : Nombre et pourcentage des BMR isolées des urines chez les patients
hospitalisés (n=1657,année 2020)

Entérobactéries sensibilité diminuée au carbapénèmes
74/2003 3,69
(ertapenem R+I)
ERV 18/313 5,75
P. aeruginosa BLSE 22/149 14,76
PARCiprofloxacine 33/203 16,25
A. baumannii BLSE 8/45 17,77
P. aeruginosa résistant à l'imipénème (R+I) 44/216 20,37
EBLSE 539 /2409 22,37
PARCeftazidime 59/234 25,21
Entérobactéries CTX 703/2468 28,48
SARM 25/82 30,48
ABRI 66/99 66,66
ABRCiprofloxacine 66/93 70,96
Fig. 20 : Nombre et pourcentage des BMR isolées des urines chez

les patients hospitalisés (n=1657, année 2020)
Abréviations :
EBLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre étendu, EPC :
entérobactérie résistante aux carbapénèmes, CTX R : céfotaxime résistant, CS R : colistine
résistant, ABRI : A. baumannii résistant à l’imipénème, CIP R : ciprofloxacine résistant, CAZ
R : ceftazidime résistant, PASE : pénicillinase, SARM : S. aureus résistant à la méticilline,
VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus, ERV :
entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée aux
pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu.
66
Tab. 45 : Répartition des BMR isolées des urines chez les patients
externes(n=907, année2020)
Marqueur de résistance Nombre Pourcentage
ERV 7 0,75
ABRI 11 1,21
SARM 15 1,63
Entérobactéries sensibilité diminuée au carbapénèmes (ertapenem 33 3,63
R+I)
EBLSE 345 37,98
Total 908 100
Fig. 21 : Répartition des BMR isolées des urines chez les patients
externes (n=907, année 2020)
Abréviations :
VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus, ERV :
entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée aux
pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu.
67
Tab. 46 : Nombre et pourcentage des BMR isolées dans les

prélèvements urinaires chez les patients externes (année 2020)
Marqueur de résistance Nombre Total Pourcentage
EBLSE 345 2573 13,4
Entérobactéries CTX 425 2544 16,7
Entérobactéries sensibilité diminuée au
33 2210 1,49
carbapénèmes (ertapenem R+I)
ABRI 11 21 FE
A. baumannii BLSE 4 9 FE
ABRCiprofloxacine 8 14 FE
PARCeftazidime 16 107 14,95
P. aeruginosa résistant à l'imipénème (R+I) 18 112 16,07
P. aeruginosa BLSE 1 49 2,04
PARCiprofloxacine 25 97 25,77
SARM 15 63 23,8
ERV
7 140 5
Fig. 22 : Nombre et pourcentage des BMR isolées dans les prélèvements

urinaires chez les patients externes
68
Etat de la résistance aux antibiotiques et

surveillance des bactéries multi-résistantes
(BMR)
Pr. A. BENSLIMANI, Pr.S.MAHRANE, Mr. C. MAHIEDDINE
69
Tab. 47 : Nombre et pourcentage d’Escherichia coli résistants (R + I) aux


NBR TOT % NBR TOT % NBR TOT %
AMP / AMX 2295 2798 82,02 1404 1814 77,40 3699 4612 80,20
AMC 1627 3129 52,00 997 2000 49,85 2624 5129 51,16
CZO 1415 2762 51,23 895 1805 49,58 2310 4567 50,58
FOX 172 2542 6,77 67 1492 4,49 239 4034 5,92
CTX / CRO 743 3084 24,09 233 1864 12,50 976 4948 19,73
CAZ 190 747 25,44 64 504 12,70 254 1251 20,30
ATM 128 699 18,31 35 432 8,10 163 1131 14,41
IPM 35 2793 1,25 5 1638 0,31 40 4431 0,90
ERT 51 2353 2,17 7 1337 0,52 58 3690 1,57
GEN 406 2751 14,76 173 1779 9,72 579 4530 12,78
AMK 84 2865 2,93 28 1658 1,69 112 4523 2,48
CHL 263 1378 19,09 96 585 16,41 359 1963 18,29
NIT 164 1608 10,20 82 1150 7,13 246 2758 8,92
NAL 828 1849 44,78 526 1567 33,57 1354 3416 39,64
CIP 1027 2896 35,46 532 1857 28,65 1559 4753 32,80
COL (CMI) 10 844 1,18 1 394 0,25 11 1238 0,89
SXT 1522 2853 53,35 793 1730 45,84 2315 4583 50,51
FOS (200) 34 1523 2,23 47 1027 4,58 81 2550 3,18
Pourcentages
Antibiotiques
Fig.23 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Escherichia coli aux antibiotiques

(année 2020)
70
Tab. 48 : Nombre et pourcentage de Klebsiella pneumoniae résistantes (R +

I) aux antibiotiques (année 2020)

AMC 1442 2388 60,39 379 758 50,00 1821 3146 57,88
CZO 1628 2194 74,20 368 680 54,12 1996 2874 69,45
FOX 404 1851 21,83 54 541 9,98 458 2392 19,15
CTX / CRO 1493 2370 63,00 294 777 37,84 1787 3147 56,78
CAZ 480 691 69,46 75 226 33,19 555 917 60,52
ATM 228 472 48,31 99 205 48,29 327 677 48,30
IPM 222 2195 10,11 20 671 2,98 242 2866 8,44
ERT 223 1629 13,69 16 520 3,08 239 2149 11,12
GEN 774 2053 37,70 153 716 21,37 927 2769 33,48
AMK 281 2204 12,75 28 671 4,17 309 2875 10,75
CHL 202 1184 17,06 42 262 16,03 244 1446 16,87
NIT 581 994 58,45 179 397 45,09 760 1391 54,64
NAL 569 1226 46,41 170 452 37,61 739 1678 44,04
CIP 994 2160 46,02 224 702 31,91 1218 2862 42,56
COL (CMI) 27 782 3,45 5 233 2,15 32 1015 3,15
SXT 1300 2035 63,88 287 647 44,36 1587 2682 59,17
FOS 82 1137 7,21 34 307 11,07 116 1444 8,03
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 24: Pourcentage de résistance (R+I) de Klebsiella pneumoniae aux
71
Tab. 49 : Nombre et pourcentage d’Enterobacter cloacae résistants (R+ I)

aux antibiotiques (année 2020).

CTX / CRO 403 783 51,47 67 201 33,33 470 984 47,76
CAZ 115 188 61,17 12 41 29,27 127 229 55,46
ATM 42 94 44,68 6 24 25,00 48 118 40,68
IPM 36 735 4,90 13 190 6,84 49 925 5,30
ERT 81 530 15,28 10 112 8,93 91 642 14,17
GEN 211 715 29,51 38 172 22,09 249 887 28,07
AMK 46 715 6,43 10 189 5,29 56 904 6,19
CHL 117 349 33,52 11 52 21,15 128 401 31,92
NIT 166 263 63,12 36 76 47,37 202 339 59,59
NAL 102 260 39,23 23 69 33,33 125 329 37,99
CIP 244 736 33,15 53 192 27,60 297 928 32,00
COL (CMI) 27 313 8,63 9 77 11,69 36 390 9,23
SXT 265 610 43,44 55 145 37,93 320 755 42,38
FOS 39 280 13,93 7 53 13,21 46 333 13,81
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 25 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterobacter cloacae aux

aux antibiotiques
72
Tab. 50 : Nombre et pourcentage de Serratia marcescens résistantes (R + I)

aux antibiotiques (année 2020)

CZO 408 413 98,79 43 45 95,56 451 458 98,47
FOX 211 378 55,82 19 35 54,29 230 413 55,69
CTX / CRO 140 410 34,15 11 41 26,83 151 451 33,48
CAZ 72 185 38,92 1 18 FE 73 203 35,96
FE
ATM 40 69 57,97 1 15 41 84 48,81
IPM 6 381 1,57 1 40 2,50 7 421 1,66
ERT 5 347 1,44 0 37 0,00 5 384 1,30
GEN 102 381 26,77 7 41 17,07 109 422 25,83
AMK 24 420 5,71 0 35 0,00 24 455 5,27
CHL 21 293 7,17 4 24 FE 25 317 7,89
NIT 251 265 94,72 20 21 FE 271 286 94,76
NAL 71 242 29,34 7 29 FE 78 271 28,78
CIP 86 407 21,13 4 41 9,76 90 448 20,09
SXT 109 382 28,53 11 33 33,33 120 415 28,92
FOS 11 199 5,53 4 21 FE 15 220 6,82
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 26 : Pourcentage de résistance (R+I) de Serratia marcescens aux

73
Tab. 51 : Nombre et pourcentage de Proteus mirabilis résistants (R + I) aux


AMP / AMX 503 710 70,85 143 211 67,77 646 921 70,14
AMC 318 748 42,51 69 204 33,82 387 952 40,65
CZO 364 657 55,40 105 195 53,85 469 852 55,05
FOX 62 591 10,49 16 146 10,96 78 737 10,58
CTX / CRO 143 735 19,46 22 210 10,48 165 945 17,46
CAZ 38 156 24,36 3 53 5,66 41 209 19,62
ATM 13 170 7,65 0 45 0,00 13 215 6,05
IPM 50 657 7,61 3 164 1,83 53 821 6,46
ERT 12 542 2,21 0 144 0,00 12 686 1,75
GEN 171 646 26,47 38 187 20,32 209 833 25,09
AMK 79 680 11,62 13 183 7,10 92 863 10,66
CHL 125 359 34,82 25 65 38,46 150 424 35,38
NAL 228 406 56,16 54 125 43,20 282 531 53,11
CIP 252 684 36,84 66 193 34,20 318 877 36,26
SXT 387 666 58,11 90 197 45,69 477 863 55,27
FOS (200) 40 290 13,79 10 83 12,05 50 373 13,40
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 27 : Pourcentage de résistance (R+I) de Proteus mirabilis aux

74
Tab. 52 : Nombre et Pourcentage de Pseudomonas aeruginosa résistants

(R + I) aux antibiotiques (année 2020)

TIC 925 1727 53,56 195 388 50,26 1120 2115 52,96
TCC 887 1613 54,99 180 380 47,37 1067 1993 53,54
PIP 490 1621 30,23 99 371 26,68 589 1992 29,57
CAZ 326 1733 18,81 61 380 16,05 387 2113 18,32
ATM 166 1051 15,79 26 268 9,70 192 1319 14,56
IPM 360 1785 20,17 49 388 12,63 409 2173 18,82
GEN 247 1451 17,02 52 348 14,94 299 1799 16,62
TOB 189 1504 12,57 41 363 11,29 230 1867 12,32
NET 78 798 9,77 10 206 4,85 88 1004 8,76
AMK 197 1644 11,98 21 359 5,85 218 2003 10,88
CIP 229 1516 15,11 52 357 14,57 281 1873 15,00
LVX 189 1038 18,21 63 239 26,36 252 1277 19,73
FOS (CMI) 103 299 34,45 14 50 28,00 117 349 33,52
COL 4 1158 0,35 5 332 1,51 9 1490 0,60
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 28 : Pourcentage de résistance (R+I) de Pseudomonas aeruginosa aux

aux antibiotiques
75
Tab. 53 : Nombre et pourcentage d’Acinetobacter spp. résistants (R + I) aux


TIC 837 910 91,98 81 92 88,04 918 1002 91,62
TCC 741 820 90,37 77 86 89,53 818 906 90,29
PIP 817 847 96,46 77 85 90,59 894 932 95,92
CAZ 866 929 93,22 72 83 86,75 938 1012 92,69
IPM 761 905 84,09 78 95 82,11 839 1000 83,90
GEN 688 802 85,79 63 87 72,41 751 889 84,48
TOB 471 714 65,97 49 78 62,82 520 792 65,66
NET (CMI) 38 95 40,00 1 3 FE 39 98 39,80
AMK 631 805 78,39 63 93 67,74 694 898 77,28
CIP 696 777 89,58 67 81 82,72 763 858 88,93
LVX 468 532 87,97 28 44 63,64 496 576 86,11
DOX 189 338 55,92 25 33 75,76 214 371 57,68
SXT 603 737 81,82 52 68 76,47 655 805 81,37
COL (CMI) 17 352 4,83 0 32 0,00 17 384 4,43
Remarque : la résistance à la colistine doit être confirmée par CMI en milieu liquide
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 29 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Acinetobacter spp. aux antibiotiques

(année 2020)
76
Tab. 54 : Nombre et pourcentage de Staphylococcus aureus résistants (R+ I)


PEN 1367 1424 96,00 335 343 97,67 1702 1767 96,32
OXA 968 2066 46,85 156 458 34,06 1124 2524 44,53
KAN 617 1428 43,21 99 315 31,43 716 1743 41,08
GEN 271 1531 17,70 27 384 7,03 298 1915 15,56
AMK 346 1397 24,77 31 254 12,20 377 1651 22,83
ERY 609 1931 31,54 98 439 22,32 707 2370 29,83
CLI 333 1834 18,16 41 406 10,10 374 2240 16,70
PRI / QDF 116 1208 6,4 15 294 5,1 131 2102 6,23
VAN (CMI) 0 706 0,00 0 162 0,00 0 868 0,00
TEC 211 1604 13,15 0 399 0,00 211 2003 10,53
RIF 184 1733 10,62 17 399 4,26 201 2132 9,43
SXT 208 1540 13,51 17 309 5,50 225 1849 12,17
TCY 456 1441 31,64 116 370 31,35 572 1811 31,58
CHL 40 1247 3,21 11 280 3,93 51 1527 3,34
FUS 545 1472 37,02 93 340 27,35 638 1812 35,21
OFX 335 1331 25,17 41 317 12,93 376 1648 22,82
CIP 370 1172 31,57 52 288 18,06 422 1460 28,90
LVX 266 1045 25,45 30 208 14,42 296 1253 23,62
FOS 23 437 5,26 3 104 2,88 26 541 4,81
Hospitalisés
120
96,32 Externes
100 Total
Pourcentages
80
60 44,53
41,08
29,83 35,21
40 28,9
31,58
22,83 22,82 23,62
15,56 12,17
16,7 3,34
20 10,53
9,43 4,81
6,23
0
0
PEN OXA KAN GEN AMK ERY CLI PRI / VAN TEC RIF SXT TCY CHL FUS OFX CIP LVX FOS
QDF (CMI)
Antibiotiques
Fig. 30 : Pourcentage de résistance (R+I) de Staphylococcus aureus aux
aux antibiotiques
77
Tab. 55 : Nombre et pourcentage des SASM résistants (R + I) aux antibiotiques

(année 2020)

PEN 639 732 87,30 201 241 83,40 840 973 86,33
OXA 0 1065 0,00 0 263 0,00 0 1328 0,00
KAN 119 674 17,66 30 149 20,13 149 823 18,10
GEN 16 818 1,96 3 213 1,41 19 1031 1,84
AMK 51 665 7,67 7 151 4,64 58 816 7,11
ERY 211 980 21,53 53 229 23,14 264 1209 21,84
CLI 104 896 11,61 19 224 8,48 123 1120 10,98
PRI / QDF 34 867 3,92 6 185 3,24 40 1052 3,80
VAN (CMI) 0 371 0,00 0 101 0,00 0 472 0,00
TEC 1 765 0,13 0 203 0,00 1 968 0,10
RIF 24 887 2,71 3 212 1,42 27 1099 2,46
SXT 24 773 3,10 8 201 3,98 32 974 3,29
TCY 117 728 16,07 30 172 17,44 147 900 16,33
CHL 9 578 1,56 2 145 1,38 11 723 1,52
FUS 144 783 18,39 42 197 21,32 186 980 18,98
OFX 36 722 4,99 11 169 6,51 47 891 5,27
CIP 52 590 8,81 12 153 7,84 64 743 8,61
LVX 27 549 4,92 4 111 3,60 31 660 4,70
FOS 3 198 1,52 1 59 1,69 4 257 1,56
Hospitalisés
100 86,33
Externes
90
80 Total
70
Pourcentages
60
50
40
21,84
30 18,1 18,98
20 16,33 1,52 8,61
10,98 3,29
10 0 1,84 7,11 5,27 4,7 1,56
3,8
0 0,1 2,46
0
QDF (CMI)
Antibiotiques
Fig. 31: pourcentage des SASM résistants (R + I) aux antibiotiques (année 2020)
78
Tab. 56 : Nombre et pourcentage des SARM résistants (R + I) aux antibiotiques

(année 2020)

PEN 693 767 90,35 108 168 64,29 801 935 85,67
OXA 922 922 100,00 152 152 100,00 1074 1074 100,00
KAN 433 576 75,17 61 101 60,40 494 677 72,97
GEN 250 634 39,43 22 106 20,75 272 740 36,76
AMK 283 582 48,63 23 87 26,44 306 669 45,74
ERY 399 825 48,36 45 124 36,29 444 949 46,79
CLI 226 766 29,50 21 116 18,10 247 882 28,00
PRI / QDF 75 742 10,10 12 100 12 87 842 10,33
VAN (CMI) 0 278 0,00 0 57 0,00 0 335 0,00
TEC 0 594 0,00 1 93 1,08 1 687 0,15
RIF 149 705 21,13 20 105 19,05 169 810 20,86
SXT 151 681 22,17 8 106 7,55 159 787 20,20
TCY 350 605 57,85 57 113 50,44 407 718 56,69
CHL 31 576 5,38 9 88 10,23 40 664 6,02
FUS 372 627 59,33 49 100 49,00 421 727 57,91
OFX 296 548 54,01 26 86 30,23 322 634 50,79
CIP 313 525 59,62 33 87 37,93 346 612 56,54
LVX 238 482 49,38 21 63 33,33 259 545 47,52
FOS 18 256 7,03 2 30 6,67 20 286 6,99
120 Hospitalisés
100
85,67 Externes
100
Pourcentages
Total
72,97
80
57,91 56,54
46,79 56,69
60 50,79
45,74 47,52
36,76
40 20,2
28
6,02
20,86
20 10,33 6,99
0 0,15
0
QDF (CMI)
Antibiotiques
Fig. 32 : Pourcentage de résistance (R+I) des SARM aux antibiotiques (année 2020)
79
Tab. 57 :Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecalis résistants (R + I) aux

antibiotiques (année 2020).

AMP 76 692 10,98 5 144 3,47 81 836 9,69
GEH 114 536 21,27 11 111 9,91 125 647 19,32
STH 121 348 34,77 18 96 18,75 139 444 31,31
ERY 538 687 78,31 117 149 78,52 655 836 78,35
NIT 52 390 13,33 4 79 5,06 56 469 11,94
TCY 402 512 78,52 106 125 84,80 508 637 79,75
VAN 16 677 2,36 4 146 2,74 20 823 2,43
TEC 8 575 1,39 1 124 0,81 9 699 1,29
CIP 212 317 66,88 31 61 50,82 243 378 64,29
LVX 206 512 40,23 27 109 24,77 233 621 37,52
RIF 297 527 56,36 53 129 41,09 350 656 53,35
FOS (200) 25 440 5,68 5 90 5,56 30 530 5,66
QDF 190 266 71,43 27 37 72,97 217 303 71,62
CHL 63 500 12,60 22 96 22,92 85 596 14,26
TIG (CMI) 0 14 FE 0 9 FE 0 23 FE
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 33 : Pourcentage de résistance (R+I) d’Enterococcus faecalis aux
80
Tab. 58 : Nombre et pourcentage d’Enterococcus faecium résistants (R + I)


AMP 228 250 91,20 34 39 87,18 262 289 90,66
GEH 72 153 47,06 8 24 FE 80 177 45,20
STH 56 118 47,46 11 23 FE 67 141 47,52
ERY 249 267 93,26 39 43 FE 288 310 92,90
NIT 32 73 43,84 3 18 FE 35 91 38,46
TCY 108 189 57,14 6 14 FE 114 203 56,16
VAN 53 258 20,54 9 35 FE 62 293 21,16
TEC 24 159 15,09 3 23 FE 27 182 14,84
CIP 123 138 89,13 14 16 FE 137 154 88,96
LVX 115 157 73,25 10 22 FE 125 179 69,83
RIF 92 153 60,13 21 35 FE 113 188 60,11
FOS (200) 21 138 15,22 2 21 FE 23 159 14,47
QDF 16 45 35,56 1 6 FE 17 51 33,33
CHL 25 171 14,62 2 26 FE 27 197 13,71
TIG (CMI) 0 12 0,00 0 1 0,00 0 13 0,00
Pourcentages
Antibiotiques
Fig. 34 : Pourcentage de résistance (R+I) d’ Enterococcus faecium aux
81
Tab. 59 : Nombre et pourcentage des entérobactéries multi-résistantes par laboratoire

chez les patients hospitalisés (année 2020)
Entérobactéries
Entérobactéries
EBLSE de sensibilité
LABORATOIRES CTX R
diminuée à l’IPM
CHU Mustapha 23 5.8
56 7.00 316 39.54
Bacha
CHU Béni-Messous. 12 3.26
87 21.48 106 26.17
Labo central
CHU Bab El Oued 36 9.62 121 32.35 28 7.48
EHS CPMC 72 15.09 98 20.54 28 6.03
EHS EL KETTAR 43 16.16 3 1,12 1 .37
CHU Hussein Dey 52 25.8 67 45.89 0 0
30 17.54
CHU Annaba 143 61.63 132 57,67
IPA Dely Ibrahim 18 21.95 29 35.36 10 12.19
CHU Blida 53 17.20 137 79.14 33 9.06
1 2
CHU ORAN 116 29.44 174 44.38
BOLOGHINE 30 15 53 26.5 6 3
EHU ORAN 316 49.07 412 55.45 24 3.43
STAOUALI 82 30.82 110 50 0 0
HCA 291 20.55 423 30 68 5.41
CHU Constantine 713 48.11 713 48.11 137 9.76
EPH Boufarik 4 25 5 31.25 0 0
EHS Zemirli 111 20.14 183 33.21 23 4.17
BENAKNOUN 22 19.46 / / 11 12.5
CHU TELEMCEN 39 44 / / 2 13.33

TOTAUX GLOBAUX 2284 28 3082 34,69 437 5,49
HN :CQ < 30 FE : faible effectif
82
Tab. 60 : Nombre et pourcentage des EBLSE chez les patients hospitalisés par service (année 2020)
Espèces Médecine Réanimation Chirurgie Urgences Pédiatrie

bactériennes NBR TOT % NBR TOT % NBR TOT % NBR TOT % NBR TOT %
150 893 13,71 60 218 27,52 158 1007 15,69 78 597 13,07 96 390 24,62
E.coli
Klebsiella 270 658 22,16 285 509 55,99 291 725 40,14 64 227 28,19 179 267 67,04
pneumoniae
34 248 11,52 60 141 42,55 108 445 24,27 11 60 18,33 22 50 44,00
Enterobacter spp.
Serratia 41 185 9,09 30 77 38,96 34 134 25,37 1 FE 5,26 3 FE 25,00
marcescens
41 356 0,00 46 141 32,62 26 341 7,62 3 73 4,11 4 44 9,09
Proteus spp.
Salmonella spp. 1 11 FE 0 4 0,00 1 FE 100,0 1 FE 50,00 112 133 84,21
Digestives
Salmonella spp. 0 27 FE 0 0 0,00 1 FE 33,33 0 FE 0,00 5 FE 41,67
Extra digestives
537 2378 22,58 481 1090 44,13 619 2656 23,3 158 984 16 421 908 46,36
Total
83
Tab. 61 : Nombre et pourcentage des EBLSE par espèce bactérienne (année

2020)
Espèces bactériennes Nombre %
E.coli BLSE+ 542 17.45
K.pneumoniae BLSE+ 1089 45.64
Enterobacter spp. BLSE+ 235 24.89
S.marcescens BLSE+ 109 25.52
Proteus spp. BLSE+ 120 12.44
Salmonella spp digestive BLSE+ 115 76.15
Salmonella spp extra-digestive BLSE+ 6 12.5
Abréviations :
VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus,
ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité
diminuée aux pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu.
Tab. 62 : Nombre et pourcentage des entérobactéries confirmées résistantes à

l’imipénème isolées chez les patients hospitalisés (année 2020)
Espèces bactériennes Nombre Total %

E.coli 35 2793 1.25
Klebsiella pneumoniae 222 2195 10.11
Enterobacter cloacae 36 735 4.9
Serratia marcescens 6 381 1.75
Proteus mirabilis 50 657 7.61
Salmonella spp. digestive 9 147 6.12
Salmonella spp. extra
0 49 0
digestive
Total 358 6957 5.14
84
Tab. 63 : Nombre et pourcentage des Pseudomonas et Acinetobacter multirésistants (BMR) par laboratoire chez les patients
hospitalisés (année 2020)
Acinetobacter Acinetobacter Acinetobacter P. aeruginosa P. aeruginosa IPM P. aeruginosa P. aeruginosa

LABORATOIRES baumannii baumannii baumannii. BLSE+ BLSE+ R CAZ R CIP R
IPM R CIP R
Nbre % Nbre % Nbre % Nbre % Nbre % Nbre % Nbre %
CHU Mustapha Bacha 39 84.78 35 87.5 0 0 0 0 25 14.97 44 26.19 8 7.92

CHU Béni-Messous. Labo central 38 73.07 40 80 0 0 0 0 7 8.13 6 6.89 12 13.79
CHU Bab El Oued 34 85 34 89.47 0 0 0 0 15 25 17 30.35 11 18.33
EHS CPMC 11 64.70 13 72.22 1 14.28 1 1.06 20 21.73 12 12.76 13 13.97
El kettar 3 60 4 580 3 50 0 0 3 9.37 1 4.16 2 8
CHU Hussein dey 15 83.33 3 735 0 0 0 0 6 9.75 0 0 0 0

HCA 98 96.07 111 97.36 0 0 0 0 39 25.65 23 174.74 31 21.08
IPA Dely Brahim 5 83.33 4 57.14 0 0 0 0 4 23.52 2 13.33 1 3.84
CHU Constantine 175 93.58 165 94.28 165 97.63 57 26.63 63 26.03 60 26.9 26 11.03
CHU BLIDA 46 88.46 39 82.97 0 0 0 0 21 13.2 10 6.28 5 4.9
CHU BATNA 74 94.87 85 96.59 0 0 0 0 18 18.18 12 13.97 12 10.34
EPH Boufarik 1 100 0 0 0 0 00 0 0 0 1 25 0 0
CHU ORAN 31 88.57 34 97.14 0 0 0 0 4 26.66 5 33.33 1 6.66
CHU Annaba 17 85 25 86.2 43 97.72 27 24.77 32 25.19 33 26.4 15 28.84

BOLOGHINE 3 100 3 100 0 0 0 0 2 8.33 2 8.33 0 0
EHU ORAN 90 80.35 75 90.36 0 0 0 0 64 30.91 53 25.72 55 31.07
HMU STAOUALI 2 20 2 16.66 0 0 0 0 0 0 6 20 4 20
EHS Zemirli 56 62.22 / / 0 0 0 0 29 16.95 5 3.26 18 10.46
EHS BEN AKNOUN 5 83.33 4 80 0 0 1 33.33 0 0 1 33.33 1 33.33

CHU TLEMCEN 18 72 20 83.33 0 0 0 0 8 13.11 33 55 14 23.72
TOTAUX GLOBAUX 761 84,09 696 89,58 212 22,82 86 4,96 360 20 ,17 326 18,81 229 15,11
FE : Faible Effectif (<30) HN : CQ hors normes

85
Tab. 64 : Nombre et pourcentage de BMR à Gram positif par laboratoire chez les patients hospitalisés (année 2020)
SARM VISA GISA ERV
LABORATOIRES
Nombre % Nombre % Nombre % Nombre %
CHU Mustapha Bacha 52 43,69 0 0 0 0 5 2.74
CHU Béni-Messous 24 36.36 0 0 0 0 0 0
CHU Bab El Oued 31 37.34 0 0 0 0 0 0
EHS CPMC 17 24.28 0 0 0 0 6 28,57
EL KETTAR 36 33.96 0 0 0 0 0 0
CHU Hussein dey 28 48.27 0 0 0 0 0 0
HCA 84 47,19 0 0 0 0 4 3,96
IPA Dely Brahim 11 40,74 0 0 0 0 6 35.29
CHU Constantine 135 61,36 0 0 0 0 31 18.56
CHU Blida 62 40,78 0 0 0 0 0 0

CHU BATNA 54 41.22 0 0 0 0 4 23,52
EPH Boufarik 0 0 0 0 0 0 0 0
CHU ORAN 87 64.92 0 0 0 0 0 0
CHU Annaba 53 49,53 0 0 0 0 5 11,11
EPH BOLOGHINE 7 25 0 0 0 0 0 0
EHU ORAN 136 64,15 0 0 0 0 5 3.06
HMRU STAOUALI 56 46,66 0 0 0 0 0 0
EHS Zemirli 39 28,46 0 0 0 0 2 6,66
BENAKNOUN 7 25,95 0 0 0 0 0 0
CHU TLEMCEN 20 41,66 0 0 0 0 4 33,33
TOTAUX GLOBAUX 939 39 ,62 0 0 0 0 72 6,69
FE : Faible effectif (<30), HN : CQ hors norm

86
Tab. 65 : Nombre et pourcentage d’entérobactéries multi-résistantes par

secteurs de soins (année 2020)
Entérobactéries de
Entérobactéries
EBLSE sensibilité diminuée aux
Spécialités CTX R
carbapénèmes
cliniques
Réanimation
543 44,62 746 56,73 135 12,99
Médecine*
535 20,30 800 29,71 87 4,06
Chirurgie 697 23,58 1099 36,82 150 6,22
Urgences
166 15,73 180 15,75 10 1,12
Pédiatrie
465 45,72 530 48,71 89 10,31
* Spécialités de médecine : cardiologie, diabétologie, pneumologie, endocrinologie et médecine interne

FE : faible effectif.
87
Tab. 66 : Nombre et pourcentage des Pseudomonas et Acinetobacter multirésistants (B.M.R) par secteurs de soins
(année 2020)
Médecine Réanimation Chirurgie Urgences Pédiatrie

Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total % Nombre Total %
76 119 63,87 385 413 93,22 143 184 77,72 25 49 51,02 42 70 60,00
ABRI
21 53 39,62 111 180 61,67 45 87 51,72 10 15 FE 33 45 73,33
A. baumannii BLSE
77 114 67,54 361 390 92,56 141 183 77,05 22 47 46,81 39 66 59,09
ABRCiprofloxacine
95 527 18,03 126 377 33,42 165 651 25,35 14 163 8,59 18 123 14,63
PARCeftazidime
P. aeruginosa
79 503 15,71 137 335 40,90 108 670 16,12 11 143 7,69 9 115 7,83
résistant à
l'imipénème (R+I)
23 316 7,28 49 175 28,00 26 286 9,09 1 51 1,96 3 51 5,88
P. aeruginosa BLSE
72 407 17,69 58 307 18,89 37 458 8,08 11 142 7,75 5 109 4,59
PARCiprofloxacine
* Spécialités de médecine : cardiologie, diabétologie, pneumologie, endocrinologie et médecine interne
88
Tab. 67 : Nombre et pourcentage des BMR à Gram positif par secteurs de soins chez les patients hospitalisés (année 2020)
SARM VISA GISA ERV

Spécialités cliniques
Nombre % Nombre % Nombre % Nombre %
Réanimation 215/341 63.05 0 0 0 0 17/200 8.5
Médecine* 294/749 39.25 00 0 0 0 21/330 6.36
Chirurgie 284/632 44.94 0 0 0 0 10/357 2.8
Urgences 73/223 32.74 0 0 0 0 3/78 3.85
Pédiatrie 49/130 37.69 0 0 0 0 15/77 19.48
* Spécialité de médecine : cardiologie, diabétologie, pneumologie, endocrinologie et médecine interne
89
Tab. 68 : Nombre et pourcentage des principaux marqueurs de résistance par espèce

bactérienne isolée chez les patients hospitalisés (Année 2020)

EBLSE 2406/8880 27,09
EPC 471/7351 6,4
Acinetobacter spp. imipénème R 761/905 84,09
P. aeruginosa imipénème R 360/1785 20,17
SARM 968/2066 46,85
E. faecalis Van R 16/677 2,36
E. faecium Van R 53 /258 20,54
TOTAL 8276/21922 37,75
Tab. 69 : Répartition des BMR chez les patients hospitalisés (Année 2020)

E.BLSE 2406 47,78
Entérobactéries de sensibilité réduite
aux carbapénèmes 471 9,35
Acinetobacter IPM R 761 15,11
P.aeruginosa IPM R 360 7,15
SARM 968 19,22
E.faecalis VAN R 16 0,31
E.faecium VAN R 53 1,06
Total 5035 100
Abréviations :
VISA : vancomycin intermediate S. aureus, GISA : glycopeptides intermediate S. aureus,
ERV : entérocoque résistant à la vancomycine, PSDP : pneumocoque de sensibilité
diminuée aux pénicillines, BSLE : bêta-lactamase à spectre étendu.
90

Rapport 2020

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Réseau Algérien de Surveillance de la Résistance des

Surveillance de la résistance des

21ème Rapport d’évaluation

Liste des abréviations

AMINOSIDES American Type Culture Collection ATCC

Liste et abréviations des laboratoires médicaux

Centre Hospitalo-Universitaire d’Annaba CHU Annaba

Hôpital Central de l’Armée HCA

Hôpital Militaire Universitaire Spécialisé de Staouéli HMUS Staouéli

Hôpital Militaire Régional Universitaire d’Oran HMRU Oran

Institut National de Santé publique INSP

Laboratoire de Bactériologie Médicale et de Surveillance de la IPA- Dely Ibrahim

Etablissement Public et hospitalier Rouiba – Alger EPH Rouiba

Liste des tableaux (année 2020)

Tab. 2 Test du CQ de E.coli ATCC 25922 par laboratoire (année 2020) 24

Tab. 3 Test du CQ de S.aureus ATCC 25923 par laboratoire (année 2020) 25

Tab. 4 Test du CQ de P.aeruginosa ATCC 27853 par laboratoire (année 2020) 26

Tab. 5 Test du CQ de S.pneumoniae ATCC 49619 par laboratoire (année 2020) 27

Tab. 16 Nombre des isolats bactériens á partir du LCR (année 2020) 40

Tab. 17 Répartition des isolats de N. meningitidis par sérogroupe (année 2020) 41

Tab. 26 Sérotypes de S.pneumoniae dans le LCR (données de l’IPA, année 2020) 46

Liste des figures (année 2020)

LISTE DES MEMBRES DU RESEAU AARN

Chef de service ou Coordinateur entre le

CHU Mustapha Bacha – Alger - Service de

Institut National de Santé Publique - Alger - MISSOUM Mohamed

Pr AIT BELKACEM 021 49 56 16 021 49 56 16

EPH Djilali Belkhanchir (Ex Birtraria) - Alger - 021 90 00 10 ST

19 CHU de Tizi-Ouzou - Laboratoire de Dr BOUBRIT Fella CHERIFI Lynda 026 21 13 16 026 21 71 04

20 Pr CHERIFI Mohamed BENREDOUANE Mounia 021 95 95 51 021 95 95 51 (Labo)

Hôpital militaire universitaire spécialisé de

27 EHS BENAKNOUN Pr IMESSAOUDENE BENALI Khedaoudj

28 CHU TLEMCEN Dr BOUSSELHAM Dr BOUSSELHAM

CHU Tizi Ouzou

CHU Oran- HMUR Oran CHU Constantine

IPA Institut Pasteur d’Algérie INSP Institut National de Santé Publique

Ce bouleversement ne nous a pas empêchés d’assurer nos activités habituelles.

En 2021 : 29/11/2021, Journée annuelle du réseau par visio conférence

Dr H. Ammari, Dr M.F.K. Missoum

1. Contrôle de qualité de l’antibiogramme

L’analyse des résultats du contrôle de qualité (CQ) de l’antibiogramme a été faite à

La validation des données de l’antibiogramme a été faite à travers l’analyse des

- pourcentage de conformité insuffisant (<80%). Nous rappelons que les tests de CQ

3. Etude de la sensibilité et de la résistance aux antibiotiques

4. Etude des bactéries multi-résistantes (BMR)

- entérobactéries BLSE+ : les données ont été exclues de l’analyse lorsque le

- entérobactéries résistantes ou intermédiaires aux carbapénèmes : les données ont

- P .aeruginosa IPM R, P. aeruginosa CAZ R et P. aeruginosa CIP R : les données ont

- Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium résistants ou intermédiaires à la

Contrôle de qualité de l’antibiogramme

Dr M.F.K. Missoum et Dr H. Ammari

Le contrôle de qualité interne permet d’assurer l'évaluation continue de la

1 - Liste des antibiotiques à tester par souche de référence

2 - Laboratoires non retenus pour l’analyse

3 - Laboratoires retenus pour l’analyse

D’où la nécessité incontournable de la validation des fichiers et des CQ par le collègue

Tab. 1 : Liste des antibiotiques à tester par souche de référence