DM Cours

Laboratoire d’Informatique
Fondamentale de Lille
O
OPAC
Fouille de données (Data Mining)

- Un tour d’horizon -
E-G. Talbi
[email protected]
Introduction au Data Mining
Définition du Data Mining

Pourquoi le Data Mining ?
Description du processus KDD
(Knowledge Data Discovery)
Applications
Tâches et Techniques du Data Mining
Qu’est-ce que le DM ?
Processus inductif, itératif et interactif de

découverte dans les BD larges de modèles de
données valides, nouveaux, utiles et
compréhensibles.
Itératif : nécessite plusieurs passes
Interactif : l’utilisateur est dans la boucle du

processus
Valides : valables dans le futur
Nouveaux : non prévisibles
Utiles : permettent à l’utilisateur de prendre
des décisions
Compréhensibles : présentation simple
Notion d’induction [Peirce 1903]
Abduction : diagnostic médical, ...

Toutes les voitures ont 4 roues
La Peugeot 206 a 4 roues
==> La Peugeot 206 est une voiture
Déduction : Raisonnement qui conclut à partir de

prémisses et d’hypothèses à la vérité d’une proposition en
usant des règles d’inférence
Toutes les voitures ont 4 roues
La Peugeot 206 est une voiture
==> La Peugeot 206 a 4 roues
Notion d’induction [Peirce 1903]
Induction : Généralisation d’une observation ou d’un

raisonnement établis à partir de cas singuliers.
Utilisée en Data mining (tirer une conclusion à partir

d ’une série de faits, pas sûre à 100%)
La clio a 4 roues, La Peugeot 106 a 4 roues, La BMW M3 a 4

roues, La Mercedes 190 a 4 roues
==> Toutes les voitures ont 4 roues
Motivations (1)
Explosion des données

Masse importante de données (millions de milliards
d’instances) : elle double tous les 20 mois.
BD très larges - Very Large Databases (VLDB)
Données multi-dimensionnelles (milliers d’attributs)
BD denses
Inexploitables par les méthodes d’analyse classiques
Collecte de masses importantes de données (Gbytes/heure)
Données satellitaires, génomiques (micro-arrays, …),
simulations scientifiques, etc.
Besoin de traitement en temps réel de ces données
Motivations (2)
Améliorer la productivité
Forte pression due à la concurrence du marché
Brièveté du cycle de vie des produits
Besoin de prendre des décisions stratégiques efficaces
Exploiter le vécu (données historiques) pour prédire le
futur et anticiper le marché
individualisation des consommateurs (dé-massification).
Croissance en puissance/coût des machines capables

de supporter de gros volumes de données
d’exécuter le processus intensif d’exploration
hétérogénéité des supports de stockage
Motivations (3)
F ile E dit
500
400
300
200
L oc ate V iew
E
D
C
B
A
H elp
Storage
Storage
100 Mount
431 7437 1950
0
1 2 3 4 5 6
Network
7
79% /
Traffic 02 631963
Help 47358
93% /us
Storage
Storage
Storage
Storage Storage
Storage
Storage Storage Storage
Storage
Storage Storage
Internet
Storage
Storage
Masse importante de données – supports hétérogènes

Le processus de découverte de connaissances
Data mining : coeur de KDD

(Knowledge Data Discovery).
Collecte, Data
Data
Collecte, Préparation
Nettoyage,
Nettoyage, Data
Préparation Données Mining
Mining
Intégration desdonnées
des données
Intégration d’apprentissage
Warehouse
Vérification&&
Vérification Modèles,
Sources de Evaluation
Evaluation Patterns
données
Démarche méthodologique (1)
Comprendre l’application
Connaissances a priori, objectifs, etc.
Sélectionner un échantillon de données
Choisir une méthode d’échantillonnage
Nettoyage et transformation des données
Supprimer le «bruit» : données superflues, marginales,
données manquantes, etc.
Effectuer une sélection d’attributs, réduire la dimension
du problème, etc.
Appliquer les techniques de fouille de données
Choisir le bon algorithme
Démarche méthodologique (2)
Visualiser, évaluer et interpréter les modèles

découverts
Analyser la connaissance (intérêt)
Vérifier sa validité (sur le reste de la base de données)
Réitérer le processus si nécessaire
Gérer la connaissance découverte

La mettre à la disposition des décideurs
L’échanger avec d’autres applications (système expert, …)
etc.
Data Mining et aide à la décision
Potentiel de support
de décision Utilisateur(s)
Prise
de décisions
Présentation des Décideur(s)

connaissances
Techniques de visualisation
Data Mining Analyste(s) de données
Découverte de connaissances
Exploration de données
(Statistiques, Requêtes, ...)
Data Warehouses Administrateur de
(OLAP, ...) Bases de données
Sources de données
(Papier, Fichiers, Fournisseurs d’information, SGBD, …)
Objectifs
Développer des techniques et systèmes efficaces

et extensibles pour l’exploration de :
BD larges et multi-dimensionnelles
Données distribuées
Faciliter l’utilisation des systèmes de DM

Limiter l’intervention de l’utilisateur
Représentation simple de la connaissance
Visualisation sous forme exploitable
Communautés impliquées
Intelligence artificielle et apprentissage
Bases de données
Analyse de données (statistiques)
Visualisation
Recherche opérationnelle et optimisation
Informatique parallèle et distribuée
Etc.
Data Mining et Statistiques
Data mining : Exploratoire, Data-driven modeling

Statistiques : Confirmatoire, User-driven modeling
Distribution d ’une seule variable : moyenne, médiane,

variance, écart-type, …
Explorer les relation entre variables : coefficient de

corrélation, …
Découverte de la cause des relations entre de nombreuses
variables est assez complexe.
test du X2, ...

Réseaux bayésiens (probabilités conditionnelles)
Découverte de modèles fonctionnels
Méthodes de régression :
régression linéaire : Y = aX+ b (a, b : valeurs réelles)
Nombre de
petits commerçants
*
* *
*
*
* * Nombre de grandes
surfaces
Rapide et efficace (valeurs réelles)
Insuffisante pour l ’analyse d’espace multidimentionnel
Découverte de modèles fonctionnels
Kernel regression : découvrir graphiquement

la fonction à utiliser, peut être une courbe
Nombre de
petits commerçants
*
*
*
* *
* Nombre de grandes
*
surfaces
Techniques statistiques inadéquates : nombre de

facteurs important, modèles non linéaires.
Domaines d’application
Prise de décision basée

sur de nouvelles
connaissances
Marketing
Ex., impact sur le
marketing
Le rôle et l’importance du BDD

Marketing
KDD et DM est de plus en
plus important
Data KDD &
Warehousing Data Mining
Mais le DM n’est pas
seulement dans le
marketing...
Marketing direct : population à cibler (âge, sexe,

profession, habitation, région, …) pour un
publipostage.
Gestion et analyse des marchés : Ex. Grande
distribution : profils des consommateurs, modèle
d ’achat, effet des périodes de solde ou de
publicité, « panier de la ménagère »
Détection de fraudes : Télécommunications, ...
Gestion de stocks : quand commander un produit,
quelle quantité demander, …
Analyse financière : maximiser l ’investissement de
portefeuilles d ’actions.
Gestion et analyse de risque : Assurances, Banques

(crédit accordé ou non)
Compagnies aériennes
Bioinformatique et Génome : ADN mining, …
Médecine et pharmacie :
Diagnostic : découvrir d ’après les symptomes du
patient sa maladie
Choix du médicament le plus approprié pour
guérir une maladie donné
Web mining, text mining, etc.
Exemple 1 - Marketing
Vous êtes gestionnaire marketing d’un

opérateur de télécommunications
mobiles :
Les clients recoivent un téléphone gratuit
(valeur 150€) avec un contrat d’un an ;
vous payer une commission de vente de
250€ par contrat
Problème : Taux de renouvellement (à la
fin du contrat) est de 25%
Donner un nouveau téléphone à toute
personne ayant expirer son contrat coûte
cher.
Faire revenir un client après avoir quitter
est difficile et coûteux.
Exemple 1 - Marketing
Trois mois avant

Yippee!
Yippee! l’expiration du contrat,
Jereste
Je reste!! prédire les clients qui
vont quitter :
Si vous voulez les garder,

offrir un nouveau
téléphone.
Exemple 2 - Assurances
Vous êtes un agent
Oh,oui!
Oh, oui! d’assurance et vous
J’aimema
J’aime ma devez définir un
Ferrari!
Ferrari! paiement mensuel adapté
à un jeune de 18 ans qui a
acheté une Ferrari.
Qu’est ce qu’il faut faire

?
Exemple 2 - Assurances
Analyser les données de tous les

clients de la compagnie.
La probabilité d’avoir un accident
est basée sur … ?
Sexe du client (M/F) et l’âge
Modèle de la voiture, âge, adresse, ....
etc.
Si la probabilité d’avoir un
accident est supérieure à la
moyenne, initialiser la mensualité
suivant les risques.
Exemple 3 – Banque - Télécom
Vous êtes à l’étranger et

quelqu’un a volé votre carte de
crédir ou votre mobile …
compagnies bancaires …
Utiliser les données historiques pour
construire un modèle de comportement
frauduleux et utiliser le data mining
pour identifier des instances
similaires.
compagnies téléphoniques …
Analyser les “patterns” qui dérivent du
comportement attendu (destinataire,
durée, etc.)
Exemple 4 - Web
Les logs des accés Web sont

analysés pour …
bonne
bonne
expériencede
expérience desurfing!
surfing! Découvrir les préférences des
utilisateurs
Améliorer l’organisation du site

Web
De manière similaire …
L’analyse de tous les types
d’informations sur les logs
Adaptation de l’interface
utilisateur/service
Paramètres d’un processus KDD
Technique ?
Format, Type ?
Données
Data
Data
Tâche ?
d’apprentissage Mining
Mining
Modèles, Type de
Patterns représentation ?
Les données
Valeurs des champs des enregistrements des

tables de l’entropot (base de données)
Types :
Données discrètes : données binaires (sexe, …),
données énumératives (couleur, …), énumératives
ordonnées (réponses 1:très satisfait, 2:satisfait,
…).
Données continues : données entières ou réelles
(âge, salaire, …)
Dates
Données textuelles
Pages/liens web, Multimédia, …
Tâches du Data Mining
Classification
Clustering (Segmentation)
Recherche d’associations
Recherche de séquences
Détection de déviation
Classification
Elle permet de prédire si une instance de donnée est membre

d’un groupe ou d’une classe prédéfinie.
Classes
Groupes d’instances avec des profils particuliers
Apprentissage supervisé : classes connues à l’avance
Applications : marketing direct (profils des consommateurs),

grande distribution (classement des clients), médecine
(malades/non malades), etc.
Exemple : les acheteurs de voitures de sport sont de jeunes
citadins ayant un revenu important
Clustering (Segmentation)
Partitionnement logique de la base de données en

clusters
Clusters : groupes d’instances ayant les mêmes

caractéristiques
Apprentissage non supervisé (classes inconnues)
Pb : interprétation des clusters identifiés
Applications : Economie (segmentation de marchés),

médecine (localisation de tumeurs dans le cerveau), etc.
Règles d’association
Corrélations (ou relations) entre attributs (méthode non

supervisée)
Applications : grande distribution, gestion des stocks, web

(pages visitées), etc.
Exemple
BD commerciale : panier de la ménagère
Articles figurant dans le même ticket de caisse
Ex : achat de riz + vin blanc ==> achat de poisson
Achats bières et couches-culottes (USA, Week-end)
Liaisons entre événements sur une période de temps
Extension des règles d’association
Prise en compte du temps (série temporelle)
Achat Télévision ==> Achat Magnétoscope d’ici 5 ans
Applications : marketing direct (anticipation des
commandes), bioinformatique (séquences d’ADN), bourse
(prédiction des valeurs des actions)
Exemple
BD commerciale (ventes par correspondance)
Commandes de clients
Ex : 60% des consommateurs qui commandent la bière
«Mort subite» commandent de l’aspro juste après
Q Séquences d’AND : ACGTC est suivie par GTCA après un
gap de 9, avec une probabilité de 30%
Détection de déviation
Instances ayant des caractéristiques les plus

différentes des autres
Basée sur la notion de distance entre instances
Expression du problème
Temporelle : évolution des instances ?
Spatiale : caractéristique d’un cluster d’instances ?
Applications
Détection de fraudes (transactions avec une carte
bancaire inhabituelle en telemarketing)
Caractéristiques
Problème d’interprétation : bruit ou exception (donc
connaissance intéressante)
Illustration
Point isolé
Techniques utilisées
K-moyennes, A-priori, K-NN

Réseaux de neurones
Algorithmes génétiques
Chaînes de Markov cachées
Arbres de décision
Réseaux bayesiens
Soft computing : ensembles flous
…
Résumé - Introduction
Data mining : découverte automatique de modèles
intéressants à partir d’ensemble de données de
grande taille
KDD (knowledge data discovery) est un processus :
Pré-traitement (Pre-processing)
Data mining
Post-traitement (Post-processing)
Pour le data mining, utilisation de différents …
Base de données (relationelle, orientée objet, spatiale,
WWW, …)
Connaissances (classification, clustering, association, …)
Techniques (apprentissage, statistiques, optimisation, …)
Applications (génomique, télécom, banque, assurance,
distribution, …)
Travaux pratiques :
Cadre du travail
WEKA 3.2
Waikato Environment for Knowledge

Analysis
http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/
http://www.lifl.fr/~jourdan
WEKA
Logiciel gratuit disponible sur le web :

http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/
Plate forme logicielle en Java tournant
sous :
Windows
Linux
Facile à prendre en main
WEKA
Interface en ligne de commande
Explorer (interface graphique)
Filtre
Apprentissage (clustering,
classification, ...)
Sélection d’attributs
Visualisateur de données et de
résultats
Expérimenter (environnement
d’expérience)
Test d’une méthode spécifique sur
un ensemble de données avec des
critères variés pour la
comparaison de résultats
WEKA
En entrée : fichiers, base de données, Url
En sortie : affichage des résultats, sortie des
résultats dans des fichiers, visualisation
graphique …
Exemple de
visualisation après
une classification :
une couleur
représente une
classe
Weka - Explorer
Les fonctions disponibles :

Filtre et Preprocess sur les données
Classification
Clustering
Visualisateur
Plan du cours
Clustering
Plan
Classification
Outils pour le Data Mining

Clustering
(Segmentation)
Clustering - Plan
Problèmatique du clustering
Applications
Sommaire Similarité et types de données
Méthodes de clustering
Méthodes de partitionnement
Méthodes hiérarchiques
Méthodes par voisinage dense
Application réelle en génomique
Résumé
Problèmatique
Soient N instances de données à k attributs,

Trouver un partitionnement en c clusters
(groupes) ayant un sens (Similitude)
Affectation automatique de “labels” aux clusters

c peut être donné, ou “découvert”
Plus difficile que la classification car les classes
ne sont pas connues à l’avance (non supervisé)
Attributs
• Numériques (distance bien définie)
• Enumératifs ou mixtes (distance difficile à définir)
Qualité d’un clustering
Une bonne méthode de clustering produira

des clusters d’excellente qualité avec :
Similarité intra-classe importante
Similarité inter-classe faible
La qualité d’un clustering dépend de :
La mesure de similarité utilisée
L’implémentation de la mesure de
similarité
La qualité d’une méthode de clustering est
évaluée par son abilité à découvrir certains
ou tous les “patterns” cachés.
Objectifs du clustering
Minimiser
Minimiser les
les distances
distances Maximiser
Maximiser les
les distances
distances
intra-cluster
intra-cluster inter-clusters
inter-clusters
Exemples d’applications
Marketing : segmentation du marché en découvrant des

groupes de clients distincts à partir de bases de doneées
d’achats.
Environnement : identification des zones terrestres
similaires (en termes d’utilisation) dans une base de
données d’observation de la terre.
Assurance: identification de groupes d’assurés distincts
associés à un nombre important de déclarations.
Planification de villes : identification de groupes
d’habitations suivant le type d’habitation, valeur,
localisation géographique, …
Médecine : Localisation de tumeurs dans le cerveau
Nuage de points du cerveau fournis par le neurologue
Identification des points définissant une tumeur
Exemple: segmentation de marchés
Mesure de la similarité
Il n’y a pas de définition unique

de la similarité entre objets
Différentes mesures de
distances d(x,y)
La définition de la similarité
entre objets dépend de :
Le type des données
considérées
Le type de similarité
recherchée
Choix de la distance
Propriétés d’une distance :
1. d ( x , y ) ≥ 0
2. d ( x , y ) = 0 iff x = y
3. d ( x , y ) = d ( y , x )
4. d ( x , z ) ≤ d ( x , y ) + d ( y , z )
Définir une distance sur chacun des champs

Champs numériques : d(x,y) = |x-y|, d(x,y)= |x-y|/dmax
(distance normalisée).
Exemple : Age, taille, poids, …
Distance – Données numériques
Combiner les distances : Soient x=(x1,…,xn) et y=(y1, …,yn)

Exemples numériques :
n
Distance euclidienne : d(x, y)= ∑(xi − yi )2
i=1
n
Distance de Manhattan : d(x, y)= ∑x−y
i=1
i i
q n q
−y
Distance de Minkowski : d(x, y)= ∑
i =1
xi i
k=1 : distance de Manhattan.

k=2 : distance euclidienne
Choix de la distance
Champs discrets :
Données binaires : d(0,0)=d(1,1)=0, d(0,1)=d(1,0)=1
Donnée énumératives : distance nulle si les valeurs sont

égales et 1 sinon.
Donnée énumératives ordonnées : idem. On peut définir

une distance utilisant la relation d’ordre.
Données de types complexes : textes, images, données

génétiques, ...
Distance – Données binaires
Object j
Table de contingence 1 0 sum
(dissimilarité)
1 a b a +b
Object i 0 c d c+d
sum a + c b + d p
Coefficient de correspondance simple (similarité

invariante, si la variable binaire est symétrique)
symétrique :
d (i, j ) = b+c
a+b+c+d
Coefficient de Jaccard (similarité non invariante,
si la variable binaire est asymétrique):
asymétrique
d (i, j ) = b+c
a+b+c
Exemple : dissimilarité entre variables binaires

• Table de patients
Nom Sexe Fièvre Toux Test-1 Test-2 Test-3 Test-4
Jack M Y N P N N N
Mary F Y N P N P N
Jim M Y P N N N N
• 8 attributs, avec
Sexe un attribut symétrique, et
Les attributs restants sont asymétriques
(test VIH, …)
Les valeurs Y et P sont initialisées à 1, et la

valeur N à 0.
Calculer la distance entre patients, basée
sur le coefficient de Jaccard.
0 +1
d ( jack , mary ) = = 0.33
2 + 0 +1
1+1
d ( jack , jim ) = = 0.67
1+1+1
1+ 2
d ( jim , mary ) = = 0.75
1+1+ 2
Distance – Données énumératives
Généralisation des variables binaires, avec

états e.g., rouge, jaune, bleu, vert
plus de 2 états,
Méthode 1: correpondance simple

m: # de correspondances, p: # total de
variables
d (i, j ) = p − m
p
Distance – Données mixtes
Exemple : (Age, Propriétaire résidence principale, montant

des mensualités en cours)
x=(30,1,1000), y=(40,0,2200), z=(45,1,4000)

d(x,y)=sqrt( (10/15)2 + 12 + (1200/3000)2) = 1.27
d(x,z)= sqrt( (15/15)2 + 02 + (3000/3000)2) = 1.41
d(y,z)= sqrt( (5/15)2 + 12 + (1800/3000)2) = 1.21
plus proche voisin de x = y
Distances normalisées.
Sommation : d(x,y)=d1(x1,y1) + … + dn(xn,yn)
Données mixtes – Exemple 1
Base de données « Cancer du sein »

http://www1.ics.uci.edu/~mlearn/MLSummary.html
#instances = 286 (Institut Oncologie, Yugoslavie)
# attributs = 10
Classe : no-recurence-events, recurrence-events
Age : 10-19, 20-29, 30-39, 40-49, …, 90-99
Menopause : Lt40, Ge40, premeno
Taille de la tumeur : 0-4, 5-9, 10-14, …, 55-59
Inv-nodes : 0-2, 3-5, 6-8, …, 36-39 (ganglions lymphatiques)
Node-caps : Oui, Non
Deg-malig : 1, 2, 3 (Dégré de malignité)
Sein : Gauche, Droit
Breast-quad : left-up, left-low, right-up, right-low, central
Irradiation : Oui, Non
Données mixtes – Exemple 2
Base de données « Diabète » : Diagnostic (OMS)

http://www1.ics.uci.edu/~mlearn/MLSummary.html
#instances = 768 (Arizona, USA)
# attributs = 8
Nombre de grossesses
Concentration du taux de glucose dans le plasma
Pression sanguine diastolique (mm Hg)
Epaisseur de la graisse du triceps (mm)
Taux d’insuline après 2 heures (repas) (mu U/ml)
Indice de masse corporelle (poids en kg / (taille en m)^2)
Fonction « Diabete pedigree »
Age (ans)
Classe (Positif ou Négatif)
Méthodes de Clustering
Méthode de partitionnement (K-

moyennes)
Méthodes hiérarchiques (par
agglomération)
Méthode par voisinage dense
Caractéristiques
Apprentissage non supervisé
(classes inconnues)
Pb : interprétation des
clusters identifiés
Méthodes de clustering - Caractéristiques
Extensibilité
Abilité à traiter différents
types de données
Découverte de clusters de
différents formes
Connaissances requises
(paramètres de l’algorithme)
Abilité à traiter les données
bruitées et isolées.
Algorithme des k-moyennes (K-means)
Entrée : un échantillon de m enregistrements x1, …, xm

1. Choisir k centres initiaux c1, …, ck
2. Répartir chacun des m enregistrements dans le groupe
i dont le centre ci est le plus proche.
3. Si aucun élément ne change de groupe alors arrêt et
sortir les groupes
4. Calculer les nouveaux centres : pour tout i, ci est la
moyenne des éléments du groupe i.
Aller en 2.
Illustration (1)
Centres
initiaux
Illustration (2)
Nouveaux
centres
Illustration (3)
Centres
finaux
Algorithme des k-moyennes : Exemple
8 points A, …, H de l ’espace euclidéen 2D. k=2 (2 groupes)

Tire aléatoirement 2 centres : B et D choisis.
points Centre Centre Centre
D(2,4), D(2,4), J(5/3,10/3),
B(2,2) I(27/7,17/7) K(24/5,11/5)
A(1,3) B D J
B(2,2) B I J
C(2,3) B D J
D(2,4) D D J
E(4,2) B I K
F(5,2) B I K
G(6,2) B I K
H(7,3) B I K
K-moyennes : Avantages
Relativement extensible dans le

traitement d’ensembles de taille
importante
Relativement efficace : O(t.k.n),
où n représente # objets, k #
clusters, et t # iterations.
Normalement, k, t << n.
Produit généralement un optimum
local ; un optimum global peut être
obtenu en utilisant d’autres
techniques telles que :
algorithmes génétiques, …
K-moyennes : Inconvénients
Applicable seulement dans le cas où la

moyenne des objets est définie
Besoin de spécifier k, le nombre de
clusters, a priori
Incapable de traiter les données
bruitées (noisy).
Non adapté pour découvrir des
clusters avec structures non-convexes,
et des clusters de tailles différentes
Les points isolés sont mal gérés
(doivent-ils appartenir obligatoirement
à un cluster ?) - probabiliste
K-moyennes : Variantes
Sélection des centres initiaux

Calcul des similarités
Calcul des centres (K-medoids : [Kaufman
& Rousseeuw’87] )
GMM : Variantes de K-moyennes basées
sur les probabilités
K-modes : données catégorielles
[Huang’98]
K-prototype : données mixtes (numériques
et catégorielles)
Une méthode hiérarchique :

construit une hiérarchie de clusters,
non seulement une partition unique
des objets.
Le nombre de clusters k n’est pas
exigé comme donnée
Utilise une matrice de distances
comme critère de clustering
Une condition de terminaison peut
être utilisée (ex. Nombre de
clusters)
Entrée : un échantillon de m enregistrements x1, …, xm

1. On commence avec m clusters (cluster = 1
enregistrement)
2. Grouper les deux clusters les plus « proches ».
3. S’arrêter lorsque tous les enregistrements sont
membres d’un seul groupe
4. Aller en 2.
Arbre de clusters : Exemple
Step 0 Step 1 Step 2 Step 3 Step 4
a
ab
b abcde
c
cde
d
de
e
Arbre de clusters
Résultat : Graphe hiérarchique qui peut être coupé à un
niveau de dissimilarité pour former une partition.
La hiérarchie de clusters est

représentée comme un arbre de
clusters, appelé dendrogramme
Les feuilles de l’arbre représentent
les objets
Les noeuds intermédiaires de l’arbre
représentent les clusters
Distance entre clusters
Distance entre les centres des clusters (Centroid

Method)
Distance minimale entre toutes les paires de données des
2 clusters (Single Link Method) d (i, j ) = min x∈Ci , y∈Cj { d ( x, y) }
Distance maximale entre toutes les paires de données

des 2 clusters (Complete Link Method)
d (i, j ) = max x∈Ci , y∈Cj { d ( x, y ) }
Distance moyenne entre toutes la paires

d’enregistrements (Average Linkage) d (i, j ) = avg x∈Ci , y∈Cj { d ( x, y ) }
Méthodes hiérarchiques :
Avantages
Conceptuellement simple
Propriétés théoriques sont

bien connues
Quand les clusters sont

groupés, la décision est
définitive => le nombre
d’alternatives différentes à
à examiner est réduit
Méthodes hiérarchiques :
Inconvénients
Groupement de clusters est

définitif => décisions
erronnées sont impossibles à
modifier ultérieurement
Méthodes non extensibles

pour des ensembles de
données de grandes tailles
Méthodes basées sur la densité
Pour ce types de problèmes, l’utilisation de mesures
de similarité (distance) est moins efficace que
l’utilisation de densité de voisinage.
Minimiser la distance inter-clusters n’est pas
toujours un bon critère pour reconnaître des
«formes » (applications géographiques,
reconnaissance de formes – tumeurs, …).
Dist=18
Dist=15.3
Méthodes basées sur la densité (1)
Soit d* un nombre réel positif
Si d(P,Q)<=d*, Alors P et Q appartiennent au

même cluster
Si P et Q appartiennent au même cluster, et

d(Q,R)<=d*, Alors P et R appartiennent au
même cluster
Méthodes basées sur la densité (2)
Soit e* un nombre réel positif

Un point P est dense ssi |{Q/d(P,Q)<=d*}|>=e*
Si P et Q appartiennent au même cluster, et
d(Q,R)<=d* et Q est dense, Alors P et R
appartiennent au même cluster
Les points non-denses sont appelés points de
« bordure ».
Les points en dehors des clusters sont
appelés « bruits ».
d* e*=4
Q
S R
• Points noirs sont denses ; les autres ne sont pas denses

• Pour montrer que P et S appartiennent au même cluster, il suffit de
montrer que P et R appartiennent au même cluster. Pour le
montrer pour P et R, il suffit de le montrer pour P et Q …
Deux clusters sont trouvés

Deux points sont des « bruits »
Trois points sont des « bordures »
Etude de cas réel : Génomique
+ Clustering
LIFL : Equipe OPAC

I.B.L
Le contexte
Génopole de Lille : Aspect génétique des

maladies multifactorielles
Collaboration avec l’I.B.L. (Institut de
Biologie de Lille) laboratoire des
maladies multifactorielles (UPRES-A
8090) : diabète, obésité
Génération de gros volumes de données :
outil d’aide à l’interprétation des
résultats
Etudes de l’IBL
Etudes de type familial (parents, enfants) –
Prélévement d’ADN
Analyse de liaison : co-transmission d’un gène
Comparaison de gènes entre paires d’individus
d’une même famille
Objectif :
Localiser un ou plusieurs gènes de
prédisposition pour la maladie
Problème posé
Très grand nombre de données générées

(~ 1 000 points de comparaison, 200 familles)
Méthodes statistiques limitées pour

étudier la corrélation entre gènes
Besoin d’un outil d’extraction

de connaissances : Data Mining
Contexte
Hypothèses de travail :
un cas particulier de Data Mining
les données fournies par l’IBL contiennent de
nombreux attributs
existence de données manquantes ou incertaines
contexte d ’apprentissage non supervisé
Objectif :
connaître les classes d ’attributs provoquant la
maladie
connaître les corrélations entre les attributs
Méthodologie adoptée
Réalisation :
• d’une sélection d ’attributs : Réduire le nombre
d ’attributs pour améliorer la classification
• d’un clustering
Sélection Classes
d ’attributs Clustering
m attributs
N attributs N>>m
K-moyennes
Sans sélection d ’attributs :

400 attributs pour 200 objets,
temps de calcul > 7500 min. (>125 h.),
résultats inexploitables
Avec sélection d ’attributs :
une dizaine d ’attributs pour 200 objets,
temps de calcul entre 3 minutes et 15 minutes,
résultats exploitables.
Workshop GAW11 de 1998
Données simulées dont on connaît les

résultats
Résultats à trouver :
A B
C
D
E1
Résultats
Résultats obtenus sur le workshop GAW11 de 1998

Exemple d ’ensembles d ’attributs sélectionnés
(Support trouvé > 0.65) :
81 85, 402 407, 224 229 (Locus C) , 308 313, 190
195, 374 379 (Locus B)
Exemple de clustering
E1 C E2 B
Classe 1 Classe 2
Conclusion
Bilan
Compréhension et modélisation d ’un
problème complexe
Sélection d ’attributs : sélection de locus
impliqués dans la maladie
Clustering : les ensembles finaux sont
trouvés lorsqu ’il y a peu d ’erreurs dans le
choix des attributs sélectionnés
Clustering – Résumé (1)
Le clustering groupe des objets
en se basant sur leurs
similarités.
Le clustering possède plusieurs
applications.
La mesure de similarité peut
être calculée pour différents
types de données.
La sélection de la mesure de
similarité dépend des données
utilisées et le type de similarité
recherchée.
Clustering – Résumé (2)
Les méthodes de clustering

peuvent être classées en :
Méthodes de
partitionnement,
Méthodes hiérarchiques,
Méthodes à densité de
voisinage.
Plusieurs travaux de
recherche sur le clustering
en cours et en perspective.
Plusieurs applications en
perspective : Génomique,
Environnement, …
Références
M. R. Anderberg. Cluster Analysis for Applications.

Academic Press, 1973.
P. Arabie, L. J. Hubert, and G. De Soete. Clustering
and Classification. World Scientific, 1996
A. K. Jain and R. C. Dubes. Algorithms for Clustering
Data. Prentice Hall, 1988
L. Kaufman and P. J. Rousseeuw. Finding Groups in
Data: an Introduction to Cluster Analysis. John
Wiley & Sons, 1990.
Classification
Sommaire
Définition
Validation d’une classification
Sommaire (accuracy)
K-NN (plus proches voisins)
Arbres de décision
Autres méthodes de
classification
Etude de cas réel :
Protéomique
Résumé
Classification
Elle permet de prédire si un élément est membre

d’un groupe ou d ’une catégorie donné.
Classes
Identification de groupes avec des profils
particuliers
Possibilité de décider de l’appartenance d’une
entité à une classe
Caractéristiques
Apprentissage supervisé : classes connues à
l’avance
Pb : qualité de la classification (taux d’erreur)
Ex : établir un diagnostic (si erreur !!!)
Classification - Applications
Accord de crédit
Marketing ciblé
Applications
Diagnostic médical
Analyse de l’effet d’un
traitement
Détection de fraudes
fiscales
etc.
Processus à deux étapes
Etape 1 :
Construction du modèle à
processus partir de l’ensemble
à 2 étapes d’apprentissage (training
set)
Etape 2 :
Utilisation du modèle :
tester la précision du
modèle et l’utiliser dans la
classification de nouvelles
données
Construction du modèle
Chaque instance est supposée

appartenir à une classe
prédéfinie
Etape 1 La classe d’une instance est
déterminée par l’attribut ”classe”
L’ensemble des instances
d’apprentissage est utilisé dans la
construction du modèle
Le modèle est représenté par des
règles de classification, arbres
de décision, formules
mathématiques, ...
Utilisation du modèle
Classification de nouvelles
instances ou instances inconnues
Etape 2
Estimer le taux d’erreur du
modèle
la classe connue d’une instance
test est comparée avec le
résultat du modèle
Taux d’erreur = pourcentage de
tests incorrectement classés
par le modèle
Validation de la Classification
(accuracy)
Estimation des taux d’erreurs :

Partitionnement : apprentissage et test (ensemble
de données important)
Utiliser 2 ensembles indépendents, e.g.,
ensemble d’apprentissage (2/3), ensemble test
(1/3)
Apprentissage Dt Validation D\Dt

Validation de la Classification
(accuracy)
Validation croisée (ensemble de données modéré)

Diviser les données en k sous-ensembles
Utiliser k-1 sous-ensembles comme données
d’apprentissage et un sous-ensemble comme données test
D1 D2 D3 D4
D1 D2 D3 D4 D1 D2 D3 D4
D1 D2 D3 D4 D1 D2 D3 D4
Bootstrapping : n instances test aléatoires (ensemble de

données réduit)
Exemple : Construction du modèle
Algorithmes
Données
Classification
Apprentissage
Nom Rang Année Titulaire

Mary Assistant Prof 3 non
Modèle
James Assistant Prof 7 oui
Bill Professor 2 oui
John Associate Prof 7 oui Si Rang = ‘Professor’
Mark Assistant Prof 6 non Ou Année > 6
Annie Associate Prof 3 non Alors Titulaire = Oui
Exemple : Utilisation du modèle
Classifier
Données
Taux d’erreur
Test
du modèle ?

Tom Assistant Prof 2 non
Lisa Associate Prof 7 non
Jack Professor 5 oui
Ann Assistant Prof 7 oui
Exemple : Utilisation du modèle
Classifier
Donnée
inconnue Titulaire ?

Jeff Professor 4 ? Oui
Paul Associate Prof 7 ? Oui
Evaluation des
méthodes de classification
Taux d’erreur (Accuracy)

Temps d’exécution (construction,
utilisation)
Robustesse (bruit, données
manquantes,...)
Extensibilité
Interprétabilité
Simplicité
Méthodes de Classification
Méthode K-NN (plus proche

voisin)
Arbres de décision
Classification bayésienne
Caractéristiques
Apprentissage supervisé
(classes connues)
Méthode des plus proches voisins
Méthode dédiée à la classification (k-NN : nearest

neighbor).
Méthode de raisonnement à partir de cas : prendre
des décisions en recherchant un ou des cas similaires
déjà résolus.
Pas d’étape d ’apprentissage : construction d ’un
modèle à partir d’un échantillon d ’apprentissage
(réseaux de neurones, arbres de décision, …).
Modèle = échantillon d’apprentissage + fonction de
distance + fonction de choix de la classe en fonction
des classes des voisins les plus proches.
Algorithme kNN (K-nearest neighbors)
Objectif : affecter une classe à une nouvelle instance

donnée : un échantillon de m enregistrements classés
(x, c(x))
entrée : un enregistrement y
1. Déterminer les k plus proches enregistrements
de y
2. combiner les classes de ces k exemples en une
classe c
sortie : la classe de y est c(y)=c
Algorithme kNN : sélection de la classe
Solution simple : rechercher le cas le plus proche et

prendre la même décision (Méthode 1-NN).
Combinaison des k classes :
Heuristique : k = nombre d ’attributs + 1
Vote majoritaire : prendre la classe majoritaire.
Vote majoritaire pondéré : chaque classe est pondérée.
Le poids de c(xi) est inversement proportionnel à la
distance d(y,xi).
Confiance : Définir une confiance dans la classe attribuée

= rapport entre les votes gagnants et le total des votes.
Illustration
Voisinage
5 de la classe
3 de la classe
=
Algorithme kNN : critique
Pas d’apprentissage : introduction de nouvelles données ne

nécessite pas la reconstruction du modèle.
Clarté des résultats
Tout type de données
Nombre d’attributs
Temps de classification : -
Stocker le modèle : -
Distance et nombre de voisins : dépend de la distance, du
nombre de voisins et du mode de combinaison.
Arbres de décision
Génération d’arbres de décision à partir des données

Arbre = Représentation graphique d’une procédure de
classification
Accord d’un prêt bancaire

MS : moyenne solde compte courant Un arbre de décision est un
MS>5000 arbre où :
Non Oui
Noeud interne = un
Age>25 Oui attribut
Oui Non
Branche d’un noeud = un
Non
Autres comptes test sur un attribut
Oui Non
Feuilles = classe donnée
Oui Non
Arbre de décision - Exemple
Outlook Temperature Humidity Windy Class

sunny hot high false N
sunny hot high true N
Ensemble overcast hot high false P
d’apprentissage rain mild high false P
rain cool normal false P
rain cool normal true N
overcast cool normal true P
sunny mild high false N
sunny cool normal false P
rain mild normal false P
sunny mild normal true P
overcast mild high true P
overcast hot normal false P
rain mild high true N
Jouer au tennis ?
Arbre de décision - Exemple
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind
High Normal Strong Weak
No Yes No Yes
Exemple – Jouer au tennis ?
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Chaque noeud interne teste un attribut
High Normal Chaque branche correspond à une

valeur de l’attribut
No Yes Chaque feuille représente une classe
Arbres de décision – Exemple
Risque - Assurances
Age < 27.5
Tid Age Car Type Class
0 23 Family High
1 17 Sports High CarType ∈ {Sports}
2 43 Sports High
High
3 68 Family Low
4 32 Truck Low
5 20 Family High
High Low
Age=40, CarType=Family ⇒ Class=Low

Numérique Enumératif
Des arbres de décision aux règles
Age < 27.5
1) Age < 27.5 ⇒ High

CarType ∈ {Sports}
2) Age >= 27.5 and
CarType = Sports ⇒ High
High
3) Age >= 27.5 and
CarType ≠ Sports ⇒ High
High Low
Arbres de décision – Exemple
Détection de fraudes fiscales
atif atif ue Attributs significatifs
r r iq
m
é
m
é ér se
u u m as Ristourne
én én nu cl
Oui Non
Id Ristourne Situation Impôt
famille revenu Fraude Non Situation
1 Oui Célibat. 125K Non Célibat, Divorcé Marié
2 Non Marié 100K Non Impôt Non

3 Non Célibat. 70K Non < 80K >= 80K
4 Oui Marié 120K Non
Non Oui
5 Non Divorcé 95K Oui
6 Non Marié 60K Non L’attribut significatif à un noeud est
déterminé en se basant sur l’indice
7 Oui Divorcé 220K Non
Gini.
8 Non Célibat. 85K Oui Pour classer une instance : descendre
9 Non Marié 75K Non dans l’arbre selon les réponses aux
différents tests. Ex = (Ristourne=Non,
10 Non Célibat. 90K Oui
10
Situation=Divorcé, Impôt=100K) Î Oui
De l’arbre de décision aux règles
de classification
une règle est générée pour

outlook
chaque chemin de l’arbre (de
sunny
overcast
rain
la racine à une feuille)
humidity P windy Les paires attribut-valeur
high normal false
d’un chemin forment une
true
conjonction
Le noeud terminal
N P N P
représente la classe prédite

Si outlook=sunny
Les règles sont
Et humidity=normal
généralement plus faciles à
Alors play tennis comprendre que les arbres
Arbre de décision = Système de règles exhaustives et

mutuellement exclusives
1) Ristourne = Oui ⇒ Non
Ristourne
Oui Non
2) Ristourne = Non et
Situation in {Célibat., Divorcé}
Non Situation et Impôt < 80K ⇒ Non
Célibat., Divorcé Marié
Impôt Non 3) Ristourne = Non et

< 80K >= 80K Situation in {Célibat., Divorcé}
et Impôt >= 80K ⇒ Oui
Non Oui
4) Ristourne = Non et
Situation in {Marié} ⇒ Non
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind

No Yes No Yes
R1: If (Outlook=Sunny) ∧ (Humidity=High) Then PlayTennis=No
R2: If (Outlook=Sunny) ∧ (Humidity=Normal) Then PlayTennis=Yes
R3: If (Outlook=Overcast) Then PlayTennis=Yes
R4: If (Outlook=Rain) ∧ (Wind=Strong) Then PlayTennis=No
R5: If (Outlook=Rain) ∧ (Wind=Weak) Then PlayTennis=Yes
Génération de l’arbre de décision
Deux phases dans la génération de

l’arbre :
Construction de l’arbre
Arbre peut atteindre une taille
élevée
Elaguer l’arbre (Pruning)
Identifier et supprimer les
branches qui représentent du
“bruit” Æ Améliorer le taux
d’erreur
Algorithmes de classification
Construction de l’arbre
Au départ, toutes les instances d’apprentissage
sont à la racine de l’arbre
Sélectionner un attribut et choisir un test de
séparation (split) sur l’attribut, qui sépare le
“mieux” les instances.
La sélection des attributs est basée sur une
heuristique ou une mesure statistique.
Partitionner les instances entre les noeuds fils
suivant la satisfaction des tests logiques
Traiter chaque noeud fils de façon récursive

Répéter jusqu’à ce que tous les noeuds soient des
terminaux. Un noeud courant est terminal si :
Il n’y a plus d’attributs disponibles
Le noeud est “pur”, i.e. toutes les instances
appartiennent à une seule classe,
Le noeud est “presque pur”, i.e. la majorité des instances
appartiennent à une seule classe (Ex : 95%)
Nombre minimun d’instances par branche (Ex :
algorithme C5 évite la croissance de l’arbre, k=2 par
défaut)
Etiqueter le noeud terminal par la classe
majoritaire
Elaguer l’arbre obtenu (pruning)

Supprimer les sous-arbres qui n’améliorent pas
l’erreur de la classification (accuracy) Î arbre
ayant un meilleur pouvoir de généralisation,
même si on augmente l’erreur sur l’ensemble
d’apprentissage
Eviter le problème de sur-spécialisation (over-
fitting), i.e., on a appris “par coeur” l’ensemble
d’apprentissage, mais on n’est pas capable de
généraliser
Sur-spécialisation - arbre de
décision
L’arbre généré peut sur-

spécialiser l’ensemble
d’apprentissage
Plusieurs branches
Taux d’erreur important pour les
instances inconnues
Raisons de la sur-spécialisation
bruits et exceptions
Peu de donnée d’apprentissage
Maxima locaux dans la recherche
gloutonne
Overfitting dans les arbres de décision
Comment éviter l’overfitting ?
Deux approches :
Pré-élagage : Arrêter de
façon prématurée la
construction de l’arbre
Post-élagage : Supprimer des

branches de l’arbre complet
(“fully grown”)
Convertir l’arbre en règles ;
élaguer les règles de façon
indépendante (C4.5)
Construction de l’arbre -
Synthèse
Evaluation des différents branchements pour

tous les attributs
Sélection du “meilleur” branchement “et de
l’attribut “gagnant”
Partitionner les données entre les fils
Construction en largeur (C4.5) ou en profondeur
(SPLIT)
Questions critiques :
Formulation des tests de branchement
Mesure de sélection des attributes
Exemple : Jouer au tennis ?
Outlook Temperature Humidity Windy Class

sunny hot high false N
sunny hot high true N
Ensemble overcast hot high false P
d’apprentissage rain mild high false P
rain cool normal false P
rain cool normal true N
overcast cool normal true P
sunny mild high false N
sunny cool normal false P
rain mild normal false P
sunny mild normal true P
overcast mild high true P
overcast hot normal false P
rain mild high true N
Arbre de décision obtenu avec
ID3 (Quinlan 86)
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind
No Yes No Yes
Arbre de décision obtenu avec
ID3 (Quinlan 86)
Outlook Temperature Humidity Wind PlayTennis
Sunny Hot High Weak ?No
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind
No Yes No Yes
Arbre de décision et conjonction
Outlook=Sunny ∧ Wind=Weak
Outlook
Sunny Overcast Rain
Wind No No
Strong Weak
No Yes
Arbre de décision et disjonction
Outlook=Sunny ∨ Wind=Weak
Outlook
Sunny Overcast Rain
Yes Wind Wind
Strong Weak Strong Weak
No Yes No Yes
Arbre de décision et XOR
Outlook=Sunny XOR Wind=Weak
Outlook
Sunny Overcast Rain
Wind Wind Wind
Strong Weak Strong Weak Strong Weak
Yes No No Yes No Yes

Arbre de décision et conjonction
• arbre de décision représente des disjonctions de conjonctions
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind

No Yes No Yes
(Outlook=Sunny ∧ Humidity=Normal)
∨ (Outlook=Overcast)
∨ (Outlook=Rain ∧ Wind=Weak)
Algorithmes pour les arbres de
décision
Algorithme de base
Construction récursive d’un arbre de
manière “diviser-pour-régner” descendante
Attributs considérés énumératifs
Glouton (piégé par les optima locaux)
Plusieurs variantes : ID3, C4.5, CART, CHAID

Différence principale : mesure de sélection
d’un attribut – critère de branchement
(split)
Mesures de sélection d’attributs
Gain d’Information (ID3,

C4.5)
Indice Gini (CART)
Table de contingence
statistique χ2 (CHAID)
G-statistic
Bonne sélection et branchement ?
CarType
Low Risk
High Risk
Sports
< 25 Age
Gain d’information
Sélectionner l’attribut avec le plus grand gain

d’information
Soient P et N deux classes et S un ensemble
d’instances avec p éléments de P et n éléments
de N
L’information nécessaire pour déterminer si
une instance prise au hasard fait partie de P
ou N est (entropie) :
p p n n
I ( p, n) = − log 2 − log 2
p+n p+n p+n p+n
Entropie
S est l’ensemble d’apprentissage

p+ est la proportion d’exemples positifs (P)
p- est la proportion d’exemples négatifs (N)
Entropie mesure l’impureté de S
Entropie(S) = -p+ log2 p+ - p- log2 p-
Gain d’information
Soient les ensembles {S1, S2 , …, Sv} formant une

partition de l’ensemble S, en utilisant l’attribut A
Toute partition Si contient pi instances de P et ni
instances de N
L’entropie,
L’entropie ou l’information nécessaire pour classifier
les instances dans les sous-arbres Si est :
ν p +n
E ( A) = ∑ i i I ( pi , ni )
i =1 p + n
Le gain d’information par rapport au branchement sur

A est
Gain ( A ) = I ( p , n ) − E ( A )
Choisir l’attribut qui maximise le gain Æ besoin

d’information minimal
Gain d’information - Exemple
Hypothèses :
• Classe P : jouer_tennis =
“oui”
• Classe N : jouer_tennis =
“non”
• Information nécessaire
pour classer un exemple
donné est :
I ( p, n) = I (9,5) = 0.940
Calculer l’entropie pour

outlook pi ni I(pi, ni)
l’attribut outlook :
sunny 2 3 0,971
overcast 4 0 0
rain 3 2 0,971
On a 5 4 5
E (outlook ) = I ( 2,3) + I ( 4,0) + I (3,2) = 0.694
14 14 14
Alors Gain (outlook ) = I (9,5) − E (outlook ) = 0.246
De manière similaire Gain (temperatur e) = 0.029

Gain ( humidity ) = 0.151
Gain ( windy ) = 0.048
Quel Attribut est ”meilleur” ?
[29+,35-] A1=? A2=? [29+,35-]
True False True False
[21+, 5-] [8+, 30-] [18+, 33-] [11+, 2-]

Gain(S,A) : réduction attendue de l’entropie dûe
au branchement de S sur l’attribut A
Gain(S,A)=Entropie(S) - ∑v∈values(A) |Sv|/|S| Entropie(Sv)
Entropie([29+,35-]) = -29/64 log2 29/64 – 35/64 log2 35/64

= 0.99
[29+,35-] A1=? A2=? [29+,35-]
[21+, 5-] [8+, 30-] [18+, 33-] [11+, 2-]

Entropie([21+,5-]) = 0.71 Entropie([18+,33-]) = 0.94

Entropie([8+,30-]) = 0.74 Entropie([8+,30-]) = 0.62
Gain(S,A1)=Entropie(S) Gain(S,A2)=Entropie(S)
-26/64*Entropie([21+,5-]) -51/64*Entropie([18+,33-])
-38/64*Entropie([8+,30-]) -13/64*Entropie([11+,2-])
=0.27 =0.12
[29+,35-] A1=? A2=? [29+,35-]
[21+, 5-] [8+, 30-] [18+, 33-] [11+, 2-]

Exemple d’apprentissage
Day Outlook Temp. Humidit Wind Play Tennis
D1 Sunny Hot y
High Weak No
D2 Sunny Hot High Strong No
D3 Overcast Hot High Weak Yes
D4 Rain Mild High Weak Yes
D5 Rain Cool Normal Weak Yes
D6 Rain Cool Normal Strong No
D7 Overcast Cool Normal Weak Yes
D8 Sunny Mild High Weak No
D9 Sunny Cold Normal Weak Yes
D10 Rain Mild Normal Strong Yes
D11 Sunny Mild Normal Strong Yes
D12 Overcast Mild High Strong Yes
D13 Overcast Hot Normal Weak Yes
D14 Rain Mild High Strong No
Sélection de l’attribut suivant
S=[9+,5-] S=[9+,5-]
E=0.940 E=0.940
Humidity Wind
High Normal Weak Strong
[3+, 4-] [6+, 1-] [6+, 2-] [3+, 3-]

E=0.985 E=0.592 E=0.811 E=1.0
Gain(S,Humidity) Gain(S,Wind)
=0.940-(7/14)*0.985 =0.940-(8/14)*0.811
– (7/14)*0.592 – (6/14)*1.0
=0.151 =0.048
Sélection de l’attribut suivant
S=[9+,5-]
E=0.940
Outlook
Over
Sunny Rain
cast
[2+, 3-] [4+, 0] [3+, 2-]

E=0.971 E=0.0 E=0.971
Gain(S,Outlook)
=0.940-(5/14)*0.971
-(4/14)*0.0 – (5/14)*0.0971
=0.247
Algorithme ID3
[D1,D2,…,D14] Outlook
[9+,5-]
Sunny Overcast Rain
Ssunny=[D1,D2,D8,D9,D11] [D3,D7,D12,D13] [D4,D5,D6,D10,D14]

[2+,3-] [4+,0-] [3+,2-]
? Yes ?
Gain(Ssunny , Humidity)=0.970-(3/5)0.0 – 2/5(0.0) = 0.970
Gain(Ssunny , Temp.)=0.970-(2/5)0.0 –2/5(1.0)-(1/5)0.0 = 0.570
Gain(Ssunny , Wind)=0.970= -(2/5)1.0 – 3/5(0.918) = 0.019
Algorithme ID3
Outlook
Sunny Overcast Rain
Humidity Yes Wind

[D3,D7,D12,D13]
No Yes No Yes
[D1,D2] [D8,D9,D11] [D6,D14] [D4,D5,D10]

Indice Gini
Utiliser l’indice Gini pour un partitionnement pur

c
Gini ( S ) = 1 − ∑ pi2
i =1
n1 n
Gini ( S1 , S 2 ) = Gini ( S1 ) + 2 Gini ( S 2 )
n n
pi est la fréquence relative de la classe c dans S
Si S est pur (classe unique), Gini(S) = 0
Gini(S1,S2) = Gini pour une partition de S en deux sous-
ensembles S1 et S2 selon un test donné.
Trouver le branchement (split-point) qui minimise
l’indice Gini
Nécessite seulement les distributions de classes
Indice Gini - Exemple
Fraude
Situation famille Situation famille Pas fraude
Revenu Revenu
Calcul de Gini nécessite une Matrice de dénombrement

Non Oui Non Oui
<80K 14 9 M 5 23
>80K 1 18 F 10 4
Gini(split) = 0.31 Gini(split) = 0.34

Attributs énumératifs – indice GINI
Pour chaque valeur distincte, calculer le nombre

d’instances de chaque classe
Utiliser la matrice de dénombrement pour la prise
de décision
Partage en plusieurs Partage en deux “classes”

classes (trouver la meilleure partition de valeurs)
CarType CarType CarType

Family Sports Luxury {Sports, {Family,
{Family} {Sports}
Luxury} Luxury}
C1 1 2 1 C1 3 1 C1 2 2
C2 4 1 1 C2 2 4 C2 1 5
Gini 0.393 Gini 0.400 Gini 0.419
Attributs numériques – indice GINI
calcul efficace : pour chaque attribut,

Trier les instances selon la valeur de l’attribut
Entre chaque valeur de cette liste : un test possible (split)
Evaluation de Gini pour chacun des test
Choisir le split qui minimise l’indice gini
Fraude No No No Yes Yes Yes No No No No
Revenu imposable
Valeurs triées 60 70 75 85 90 95 100 120 125 220
Positions Split 55 65 72 80 87 92 97 110 122 172 230

<= > <= > <= > <= > <= > <= > <= > <= > <= > <= > <= >
Yes 0 3 0 3 0 3 0 3 1 2 2 1 3 0 3 0 3 0 3 0 3 0
No 0 7 1 6 2 5 3 4 3 4 3 4 3 4 4 3 5 2 6 1 7 0
Gini 0.420 0.400 0.375 0.343 0.417 0.400 0.300 0.343 0.375 0.400 0.420
Méthodes à base d’arbres de
décision
CART (BFO’80 - Classification and

regression trees, variables numériques,
Gini, Elagage ascendant)
C5 (Quinlan’93 - dernière version ID3 et
C4.5, attributs d’arité quelconque,
entropie et gain d’information)
SLIQ (EDBT’96 — Mehta et al. IBM)
SPRINT (VLDB’96—J. Shafer et al. IBM)
PUBLIC (VLDB’98 — Rastogi & Shim)
RainForest (VLDB’98 — Gehrke,
Ramakrishnan & Ganti)
CHAID (Chi-square Automation
Interaction Detection – variables
discrètes)
Arbres de décision - Avantages
Compréhensible pour tout utilisateur

(lisibilité du résultat – règles - arbre)
Justification de la classification d’une
instance (racine Æ feuille)
Tout type de données
Robuste au bruit et aux valeurs manquantes
Attributs apparaissent dans l’ordre de
pertinence Æ tâche de pré-traitement
(sélection d’attributs)
Classification rapide (parcours d’un chemin
dans un arbre)
Outils disponibles dans la plupart des
environnements de data mining
Arbres de décision - Inconvénients
Sensibles au nombre de
classes : performances se
dégradent
Evolutivité dans le temps :

si les données évoluent
dans le temps, il est
nécessaire de relance la
phase d’apprentissage
Réseau neuronal : simule le système nerveux biologique

Un réseau de neurones est composé de plusieurs
neurones interconnectés. Un poids est associé à chaque
arc. A chaque neurone on associe une valeur.
Temps de ”switch” d’un

neurone > 10-3 secs
Nombre de neurones
(humain) ~1010
Connexions (synapses)
par neurone : ~104–105
Neurone ou perceptron
Neurone = Unité de calcul élémentaire

Le vecteur d’entrée X est transformé en une variable de sortie y,
par un produit scalaire et une fonction de transformation non
linéaire
X0 w0
X1 w1
∑ f
Sortie y
Xn wn
Vecteur Vecteur Somme Fonction

entrée X poids w pondérée d’activation
(coefficients
Synaptiques)
Neurone ou perceptron
Linear treshold unit (LTU)

x0=1
x1 w1
w0
w2
x2 Σ o
. Σi=0n wi xi
.
. wn
xn 1 si Σi=0n wi xi >0
o(xi)= { -1 sinon
Neurone
Fonction d’activation la plus utilisée est la fonction sigmoide
σ(x)= 1
1+e x
Elle prend ses valeurs (entrée et sortie) dans l’intervalle [0,1]
0 1
Capacité d ’apprentissage : apprendre et changer son

comportement en fonction de toute nouvelle
expérience.
Permettent de découvrir automatiquement des

modèles complexes.
Plusieurs modèles de réseaux de neurones : PMC

(Perceptron Multi-Couches), RBF (Radial Basis
Function), Kohonen, ...
Perceptron Multi Couches (PMC)
Vecteur sortie
Couche sortie Calculs effectués des entrées

vers les sorties
Plusieurs
Couches
cachées
Couche Graphe complet

entrée
Vecteur entrée
Paradigme d’apprentissage
Vecteur sortie
Classification : Ajuster les poids

en utilisant l’erreur
Erreur = Valeur désirée – Valeur

actuelle
Vecteur entrée
Algorithmes d’apprentissage
Rétro-propagation du gradient (Back

propagation)
Kohonen
RBF (Radial basis function)
Réseaux de neurones probabilistes
ART (Adaptive resonance theory)
…
Rétro-propagation du gradient
Principales étapes
Construction du réseau
Représentation des entrées
Nombre de couches, nombre de noeuds dans chaque
couche
Apprentissage du réseau utilisant les données
disponibles
Elagage du réseau
Interprétation des résultats
Nombre de noeuds en entrée : correspond à la

dimension des données du problème (attributs ou
leurs codages).
Normaliser dans l’intervalle [0,1].
Exemple énumératif : Attribut A prenant ses valeurs

{1,2,3,4,5}
5 entrées à valeurs binaires ; 3 = 00100
3 bits ; 3 = 010
1 entrée réelle ; 0, 0.25, 0.5, 0.75, 1
Nombre de couches cachées : Ajuster pendant

l’apprentissage.
Nombre de nœuds par couche : Le nombre de nœuds
par couche est au moins égal à deux et au plus égal au
nombre de nœuds en entrée
Nombre de nœuds en sortie : fonction du nombre de
classes associées à l’application.
Réseau riche Æ pouvoir d’expression grand (Ex. 4-2-1

est moins puissant que 4-4-1)
Attention : Choisir une architecture riche mais pas
trop – Problème de sur-spécialisation
Apprentissage du réseau
Objectif principal : obtenir un ensemble de poids qui
font que la plupart des instances de l’ensemble
d’apprentissage sont correctement classées.
Etapes :
Poids initiaux sont générés aléatoirement
Les vecteurs en entrée sont traités en séquentiel par le
réseau
Calcul des valeurs d’activation des nœuds cachés
Calcul du vecteur de sortie
Calcul de l’erreur (sortie désirée – sortie actuelle).
e(PMC)= 1 ∑
2 x∈S (d(x)−a(x)) 2
d(x) : sortie désirée, a(x) : sortie actuelle

Les poids sont mis à jour en utilisant l’erreur. Le nombre

d’instances qui sont passés dans le réseau avant la mise
à jour des poids est un paramètre (entre 1 –
convergence rapide et minimum local - et m –
convergence lente -).
Rétro propagation à l’aide de la méthode de gradient. Le

paramètre taux d’apprentissage [0,1] influe sur la
modification des poids.
Valeur grande : modification forte ; Valeur petite :
modification minime
wi = wi + ∆wi
∆wi = η (t - o) xi
t=c(x) est la valeur désirée
o est la sortie obtenue
η est le taux d’apprentissage (e.g 0.1)
Critère d’arrêt : la tolérance définit l’erreur cible.

et/ou Nombre d’instances bien classées (seuil)
(w1,w2)
(w1+∆w1,w2 +∆w2)
Elagage du réseau
Réseau fortement connexe est difficile à articuler
N nœuds en entrée, h couches cachées, et m nœuds

en sortie Æ h(m+n) arcs (poids)
Elagage : Supprimer les arcs et les nœuds qui

n’affectent pas le taux d’erreur du réseau. Eviter le
problème de sur-spécialisation (over-fitting).
Ceci permet de générer des règles concises et
compréhensibles.
Réseaux de neurones - Avantages
Taux d’erreur généralement bon

Outil disponible dans les
environnements de data mining
Robustesse (bruit) –
reconnaissance de formes (son,
images sur une rétine, …)
Classification rapide (réseau
étant construit)
Combinaison avec d’autres
méthodes (ex : arbre de décision
pour sélection d’attributs)
Réseaux de neurones -
Inconvénients
Apprentissage très long

Plusieurs paramètres
(architecture, coefficients
synaptiques, …)
Pouvoir explicatif faible (boite
noire)
Pas facile d’incorporer les
connaissances du domaine.
Traitent facilement les attributs
numériques et binaires
Evolutivité dans le temps (phase
d’apprentissage)
Classification bayésienne :
Pourquoi ? (1)
Apprentissage probabiliste :
calcul explicite de probabilités sur des
hypothèses
Approche pratique pour certains types de
problèmes d’apprentissage
Incrémental :
Chaque instance d’apprentissage peut de façon
incrémentale augmenter/diminuer la
probabilité qu’une hypothèse est correcte
Des connaissances a priori peuvent être
combinées avec les données observées.
Classification bayésienne :
Pourquoi ? (2)
Prédiction Probabiliste :
Prédit des hypothèses multiples, pondérées par
leurs probabilités.
Référence en terme d’évaluation :

Même si les méthodes bayésiennes sont
coûteuses en temps d’exécution, elles peuvent
fournir des solutions optimales à partir
desquelles les autres méthodes peuvent être
évaluées.
Classification bayésienne
Le problème de classification peut être formulé

en utilisant les probabilités a-posteriori :
P(C|X) = probabilité que le tuple (instance)
X=<x1,…,xk> est dans la classe C
Par exemple
P(classe
P( =N | outlook=sunny,windy=true,…)
Idée : affecter à une instance X la classe C

telle que P(C|X) est maximale
Estimation des probabilités a-
posteriori
Théorème de Bayes :
P(C|X) = P(X|C)·P(C) / P(X)
P(X) est une constante pour toutes les
classes
P(C) = fréquence relative des
instances de la classe C
C tel que P(C|X) est maximal =
C tel que P(X|C)·P(C) est maximal
Problème : calculer P(X|C) est non
faisable !
Classification bayésienne naive
Hypothèse Naïve : indépendance des

attributs
P(x1,…,xk|C) = P(x1|C)·…·P(xk|C)
P(xi|C) est estimée comme la fréquence

relative des instances possédant la valeur
xi (i-ème attribut) dans la classe C
Non coûteux à calculer dans les deux cas

Classification bayésienne –
Exemple (1)
Estimation de P(xi|C)
P(p) = 9/14
P(n) = 5/14
Outlook
P(sunny | p) = 2/9 P(sunny | n) = 3/5 Humidity
P(overcast | p) = 4/9 P(overcast | n) = 0 P(high | p) = 3/9 P(high | n) = 4/5
P(rain | p) = 3/9 P(rain | n) = 2/5 P(normal | p) = 6/9 P(normal | n) = 1/5
Temperature
P(hot | p) = 2/9 P(hot | n) = 2/5 Windy
P(mild | p) = 4/9 P(mild | n) = 2/5 P(true | p) = 3/9 P(true | n) = 3/5
P(cool | p) = 3/9 P(cool | n) = 1/5 P(false | p) = 6/9 P(false | n) = 2/5
Exemple (1)
Classification de X :
Une instance inconnue X = <rain, hot, high, false>
P(X|p)·P(p) =
P(rain|p)·P(hot|p)·P(high|p)·P(false|p)·P(p) =
3/9·2/9·3/9·6/9·9/14 = 0.010582
P(X|n)·P(n) =
P(rain|n)·P(hot|n)·P(high|n)·P(false|n)·P(n) =
2/5·2/5·4/5·2/5·5/14 = 0.018286
Instance X est classifiée dans la classe n (ne pas
jouer)
l’hypothèse d’indépendance
… fait que le calcul est possible

… trouve un modèle de classification optimal si
hypothèse satisfaite
… mais est rarement satisfaite en pratique, étant
donné que les attributs (variables) sont souvent
corrélés.
Pour éliminer cette limitation :
Réseaux bayésiens,
bayésiens qui combinent le
raisonnement bayésien et la relation causale
entre attributs
Arbres de décision,
décision qui traitent un attribut à la
fois, considérant les attributs les plus importants
en premier
Etude de cas
Prédiction de structure de la
protéine
Les protéines
Une protéine = séquence d’acides aminés définie par un gêne

et ayant une fonction spécifique dans la cellule
« Building block of life »
• Les protéines sont partout :

• Protéines enzymatiques (catalyse)
• Protéines de transport : hémoglobine (oxygène),
albumine (corps gras) …
• Protéine messager : insuline …
• Protéines récepteur
• Protéines sériques : anticorps
• Protéines structurelles : collagène dans la peau,
kératine dans les cheveux, …
•…
Les protéines
20 acides aminés distincts, chaque acide aminé étant

constitué de (jusqu’à) 18 atomes
Une séquence protéique est constituée de 50 à 2000
acides aminés
3000 à 4000 protéines dans une cellule
Une protéine se replie « en pelote », adoptant une
configuration spatiale caractéristique de sa fonction
Les 20 Acides Aminés
A Ala Alanine M Met Methionine

C Cys Cysteine N Asn Asparagine
D Asp Aspartic P Pro Proline
E Glu Glutamic Q Gln Glutamine
F Phe Phenylalanine R Arg Arginine
G Gly Glycine S Ser Serine
H His Histidine T Thr Threonine
I Ile Isoleucine V Val Valine
K Lys Lysine W Trp Tryptophan
L Leu Leucine Y Tyr Tyrosine
20 Lettres de l’alphabet
Les structures
Structure primaire = ordre dans lequel sont

enchaînés les acides aminés dans la molécule
Structure secondaire = rotation des atomes de la

chaîne peptidique les uns par rapport aux autres au
cours de la synthèse de la chaîne
Structure tertiaire = résultat de liaisons diverses

(hydrogène, hydrophobes, électrostatiques,
covalentes,...) entre des acides aminés de la même
chaîne peptidique mais non voisins dans la
structure primaire
Structure primaire
O H O H O H O H O H OH OH
H3N+ CH C N CH C N CH C N CH C N CH C N CH C N CH C N CH COO-
CH2 CH2 CH CH2 H C CH3 CH2 CH2 CH2 CH2
COO- CH2 H3C CH3 CH2 HC CH CH2
CH2 CH3 HN N
NH CH
NH2 N +H 2
Asp Arg Val Tyr Ile His Pro Phe

D R V Y I H P F
Séquence de la protéine : DRVYIHPF
Protein Folding Problem
Etant donné une séquence primaire de la protéine, ex.,
MDPNCSCAAAGDSCTCANSCTCLACKCTSCK,
prédire la structure secondaire et 3D.
Base de données
Structures prédites (connues) :

Protein Data Bank (PDB) (centaine de structures
non redondantes) [www.rcsb.org/pdb/]
Base de données de séquences de protéines :

Genbank (milliers de séquences)
[www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/GenbankSearch.html]
SWISSPROT
[www.ebi.ac.uk/swissprot]
Structure secondaire
Hélice α
Feuillet ß parallèle :
tous les segments
ont la même
orientation
Feuillet ß anti-
parallèle
Feuillet ß mixte
Hélice α
Feuillet ß parallèle :
tous les segments
ont la même
orientation
Feuillet ß anti-
parallèle
Feuillet ß mixte
Beta Hélice
Structure 3D
Permet de comprendre le mode d'action d'une
protéine : activité enzymatique, interaction avec
d'autres protéines (ligands, substrats, récepteur,
épitope, etc.).
Structure primaire Structure

secondaire / tertiaire
- Le processus neuronal de base traite des signaux
d'entrée d'un ou plusieurs neurones et envoie un
signal de sortie à un ou plusieurs (un 0 ou un 1)
- Le signal de sortie à chaque neurone récepteur est
pondéré – ces poids sont ajustés par entraînement
du modèle avec des séquences de structures
connues
- Le programme donne une évaluation de fiabilité de
chaque prévision basée sur la force des signaux
d’une hélice alpha, d’un feuillet bêta et d’une
boucle
Référence : Rost B, Sander C (1994) Combining evolutionary
information and neural networks to predict protein
secondary structure. Proteins, 19, 55-72
Entrée : structure
primaire
Sortie : indication sur … Entrée
la structure
secondaire
Couche cachée
Sortie
Hélice α Feuillet β Boucle

Efficacité > 70% H B C
Plus proches voisins
Une liste de fragments courts de séquence

est faite en glissant une fenêtre de
longueur n le long d'un ensemble
d'approximativement 100-400 séquence
d’entraînement de structure connue mais
de similitude minimale
La structure secondaire de l'acide aminé
central dans chaque fenêtre
d’entraînement est enregistrée
Une fenêtre coulissante de même taille est
alors choisi parmi la séquence de requête
Plus proches voisins
La séquence dans la fenêtre à chaque position de la

séquence demandée est comparée à chacun des
fragments d’entraînement et les 50 meilleurs
fragments appariés sont identifiés → Nécessité
d’une notion de distance
Les fréquences de la structure secondaire connue
de l'acide aminé du milieu dans chacun de ces
fragments appariés (H, B et C) sont alors employés
pour prévoir la structure secondaire de l'acide
aminé du milieu de la fenêtre de requête
Des règles ou un NN sont utilisées pour faire la
prédiction finale pour chaque AA.
Liens Web - Logiciels
http://dot.imgen.bcm.tmc.edu:9331/seq-
search/struc-predict.html
http://jura.ebi.ac.uk:8888/jnet/
http://www.embl-
heidelberg.de/predictprotein/
http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprot
ein
(B Rost: PHD: predicting one-dimensional protein

structure by profile based neural networks. Methods
in Enzymology, 266, 525-539, 1996 )
Autres méthodes de classification
Réseaux bayésiens
Autres
méthodes
Case-based reasoning
Ensembles flous
Rough set
Analyse discriminante
(Discriminant linéaire de Fisher,
Algorithme Closest Class Mean -
CCM-)
Classification - Résumé
La classification est un
problème largement étudié
La classification, avec ses

nombreuses extensions,
est probablement la
technique la plus répandue
Modèles Facile à comprendre

Arbres de décision
Règles d’induction
Modèles de régression
Réseaux de neurones Difficile à comprendre
Classification - Résumé
L’extensibilité reste une

issue importante pour les
applications
Directions de recherche :
classification de données
non relationnels, e.x.,
texte, spatiales et
données multimédia
Classification - Références
J. R. Quinlan. C4.5: Programs for Machine Learning. Morgan

Kaufman, 1993.
J. R. Quinlan. Induction of decision trees. Machine Learning,
1:81-106, 1986.
L. Breiman, J. Friedman, R. Olshen, and C. Stone. Classification
and Regression Trees. Wadsworth International Group, 1984.
S. M. Weiss and C. A. Kulikowski. Computer Systems that Learn:
Classification and Prediction Methods from Statistics, Neural
Nets, Machine Learning, and Expert Systems. Morgan Kaufman,
1991.
D. E. Rumelhart, G. E. Hinton and R. J. Williams. Learning
internal representation by error propagation. In D. E. Rumelhart
and J. L. McClelland (eds.) Parallel Distributed Processing. The
MIT Press, 1986
Règles
d’association
Sommaire
Exemple : Panier de la
Sommaire ménagère
Définitions
A-Priori
Résumé
Exemple : Analyse du panier
de la ménagère
• Découverte d’associations et de corrélations entre les
articles achetés par les clients en analysant les achats
effectués (panier)
Lait, Oeufs, Sucre,

Lait, Oeufs, Céréale, Lait Oeufs, Sucre
Pain
Client 1
Client 3
Client 2
de la ménagère
• Etant donnée :
• Une base de données de transactions de clients, où chaque
transaction est représentée par un ensemble d’articles -set of items-
(ex., produits)
• Trouver :
• Groupes d’articles (itemset) achetés fréquemment (ensemble)
de la ménagère
Extraction d’informations sur le comportement
de clients
SI achat de riz + vin blanc ALORS achat de poisson (avec
une grande probabilité)
Intérêt de l’information : peut suggérer ...

Disposition des produits dans le magasin
Quels produits mettre en promotion, gestion de stock, …
Approche applicable dans d’autres domaines

Cartes de crédit, e-commerce, …
Services des compagnies de télécommunication
Services bancaires
Traitements médicaux, …
Règles d’associations
Recherche de règles d’association :

Découvrir des patterns, corrélations, associations
fréquentes, à partir d’ensembles d’items contenus dans
des base de données.
Compréhensibles : Facile à comprendre
Utiles : Aide à la décision
Efficaces : Algorithmes de recherche
Applications :
Analyse des achats de clients, Marketing, Accés Web,
Design de catalogue, Génomique, etc.
Formats de représentation des règles

d’association :
couches ⇒ bière [0.5%, 60%]
achète:couches ⇒ achète:bière [0.5%, 60%]
“SI achète couches ALORS achète bière dans 60% de

cas. Les couches et la bière sont tous deux achetés dans
0.5% des transactions de la base de données."
Autres représentations (utilisée dans l’ouvrage

de Han) :
achète(x, “couches") ⇒ achète(x, “bière") [0.5%, 60%]
couche ⇒ bière [0.5%, 60%]

“SI achète couche,
ALORS achète bière,
1 2 3 4 dans 60% de cas,
dans 0.5% de la base"
1 Condition partie gauche de la règle
Condition,
2 quence partie droite de la règle
Conséquence,
3 Support fréquence (“partie gauche et droite sont
Support,
présentes ensemble dans la base”)
4 Confiance (“si partie gauche de la règle est
vérifiée, probabilité que la partie droite de la
règle soit vérifiée“)
• Support : % d’instances de la base vérifiant la règle.
support(A ⇒ B [ s, c ]) = p(A∪B) = support ({A,B})
• Confiance : % d’instances de la base vérifiant l’implication
confiance(A ⇒ B [ s, c ]) = p(B|A) = p(A∪B) / p(A) =

support({A,B}) / support({A})
Exemple
TID Items
1 Pain, Lait
2 Bière, Couches, Pain, Oeufs {Couches , Lait} ⇒ s ,α Bière
3 Bière, Coca, Couches, Lait
4 Bière, Pain, Couches, Lait
σ (Couches , Lait, Bière ) 2
5 Coca, Pain, Couches, Lait s= = = 0. 4
Nombre total d' instances 5
Règle : X ⇒ s ,α y
σ (Couches, Lait, Bière)
α= = 0.66
σ ( X ∪ y) σ (Couches, Lait) |
Support : s= ( s = P (X, y))
|T |
Confiance : α = σ (X ∪ y) (α = P( y | X))
σ (X) |
Support minimum σ :
Elevé ⇒ peu d’itemsets fréquents
⇒ peu de règles valides qui ont été
souvent vérifiées
Réduit ⇒ plusieurs règles valides qui ont été
rarement vérifiées
Confiance minimum γ :
Elevée ⇒ peu de règles, mais toutes “pratiquement”
correctes
Réduite ⇒ plusieurs règles, plusieurs d’entre elles sont
“incertaines”
Valeurs utilisées : σ = 2 - 10 %, γ = 70 - 90 %
Etant donné : (1) un base de données de

transactions, (2) chaque transaction est un
ensemble d’articles (items) achetés
Transaction ID Items achetés Itemset fréquent Support
100 A,B,C {A} 3 ou 75%
200 A,C {B} et {C} 2 ou 50%
400 A,D {D}, {E} et {F} 1 ou 25%
500 B,E,F {A,C} 2 ou 50%
Autres paires d’items max 25%
Trouver : toutes les règles avec un support et une

confiance minimum donnés
• Si support min. 50% et confiance min. 50%, alors
A ⇒ C [50%, 66.6%], C ⇒ A [50%, 100%]
Recherche de règles d’association
Données d ’entrée : liste d ’achats

Achat = liste d ’articles (longueur variable)
Produit Produit Produit Produit Produit

A B C D E
Achat 1
* *
Achat 2
* * *
Achat 3
* *
Achat 4
* * *
Achat 5
* *
Recherche de règles d’association
Tableau de co-occurrence : combien de fois deux

produits ont été achetés ensemble ?
Produit Produit Produit Produit Produit

A B C D E
Produit A 4 1 1 2 1
Produit B 1 2 1 1 0
Produit C 1 1 1 0 0
Produit D 2 1 0 3 1
Produit E 1 0 0 1 2
Illustration / Exemple
Règle d ’association :
Si A alors B (règle 1)
Si A alors D (règle 2)
Si D alors A (règle 3)
Supports :
Support(1)=20% ; Support(2)=Support(3)=40%
Confiances :
Confiance(2) = 50% ; Confiance(3) = 67%
On préfère la règle 3 à la règle 2.

Description de la méthode
Support et confiance ne sont pas toujours suffisants

Ex : Soient les 3 articles A, B et C
article A B C A et B A et C B et C A, B et C
fréquence 45% 42,5% 40% 25% 20% 15% 5%
Règles à 3 articles : même support 5%

Confiance
Règle : Si A et B alors C = 0.20
Règle : Si A et C alors B = 0.25
Règle : Si B et C alors A = 0.33
Description de la méthode
Amélioration = confiance / fréq(résultat)

Comparer le résultat de la prédiction en utilisant la
règle avec la prédiction sans la règle
Règle intéressante si Amélioration > 1
Règle Confiance F(résultat) Amélioration
Si A et B alors C 0.20 40% 0.50
Si A et C alors B 0.25 42.5% 0.59
Si B et C alors A 0.33 45% 0.74
Règle : Si A alors B ; support=25% ; confiance=55% ;

Amélioration = 1.31 Meilleure règle
Recherche de règles
Soient une liste de n articles et de m achats.

1. Calculer le nombre d’occurrences de chaque article.
2. Calculer le tableau des co-occurrences pour les paires
d ’articles.
3. Déterminer les règles de niveau 2 en utilisant les
valeurs de support, confiance et amélioration.
4. Calculer le tableau des co-occurrences pour les
triplets d ’articles.
5. Déterminer les règles de niveau 3 en utilisant les
valeurs de support, confiance et amélioration
...
Complexité
Soient :
n : nombre de transactions dans la BD
m : Nombre d’attributs (items) différents
Complexité
Nombre de règles d’association : Ο(m.2m −1 )
Complexité de calcul : Ο(n.m.2m )
Réduction de la complexité
n de l’ordre du million (parcours de la liste nécessaire)
Taille des tableaux en fonction de m et du nombre d ’articles
présents dans la règle
2 3 4
n n(n-1)/2 n(n-1)(n-2)/6 n(n-1)(n-2)(n-3)/24
100 4950 161 700 3 921 225
10000 5.107 1.7 1011 4.2 1014
Conclusion de la règle restreinte à un sous-ensemble de l ’ensemble

des articles vendus.
Exemple : articles nouvellement vendues.
Création de groupes d ’articles (différents niveaux d’abstraction).
Elagage par support minimum.
Illustration sur une BD commerciale
Attribut Compteur Attributs (1-itemsets)

Pain 4
Coca 2
Lait 4 Itemset Compteur paires (2-itemsets)
Bière 3
{Pain,Lait} 3
Couches 4
Oeufs 1 {Pain,Bière} 2
{Pain,Couches} 3
{Lait,Bière} 2
{Lait,Couches} 3
{Bière,Couches} 3
Support Minimum = 3
Triplets (3-itemsets)
Si tout sous-ensemble est considéré, Itemset Compteur

C61 + C62 + C63 = 41 {Pain,Lait,Couches} 3
{Lait,Couches,Bière} 2
En considérant un seuil support min,
6 + 6 + 2 = 14
L’algorithme Apriori [Agrawal93]
Deux étapes
Recherche des k-itemsets fréquents
(support≥MINSUP)
(Pain, Fromage, Vin) = 3-itemset
Principe : Les sous-itemsets d’un k-itemset fréquent
sont obligatoirement fréquents
Construction des règles à partir des k-itemsets

trouvés
Une règle fréquente est retenue si et seulement si sa
confiance c≥ MINCONF
Exemple : ABCD fréquent
AB Æ CD est retenue si sa confiance ≥ MINCONF
Recherche des k-itemsets fréquents (1)
Exemple
I = {A, B, C, D, E, F}
T = {AB, ABCD, ABD, ABDF, ACDE, BCDF}
MINSUP = 1/2
Calcul de L1 (ensemble des 1-itemsets)
C1 = I = {A,B,C,D,E,F} // C1 : ensemble de 1-itemsets candidats
s(A) = s(B) = 5/6, s(C) = 3/6, s(D) = 5/6, s(E) = 1/6, s(F) = 2/6
L1 = {A, B, C, D}
C2 = L1xL1 = {AB,AC, AD, BC, BD, CD}
s(AB) = 4/6, s(AC) = 2/6, s(AD) = 4/6, s(BC) = 2/6, s(BD) = 4/6,
s(CD) = 3/6
L2 = {AB,AD, BD, CD}
Recherche des k-itemsets fréquents (2)

C3 = {ABD} (ABC ∉ C3 car AC ∉ L2)
s(ABD) = 3/6
L3 = {ABD}
C4 = φ
L4 = φ
Calcul de L (ensembles des itemsets fréquents)

L = ∪Li = {A, B, C, D, AB, AD, BD, CD, ABD}
L’algorithme Apriori
L1 = {1-itemsets fréquents};
for (k=2; Lk-1≠ φ; k++) do
Ck = apriori_gen(Lk-1);
forall instances t∈T do
Ct = subset(Ck,t);
forall candidats c ∈ Ct do
c.count++;
Lk = { c∈ Ck / c.count ≥ MINSUP }
L = ∪iLi;
La procédure Apriori_gen
{ Jointure Lk-1 * Lk-1 ; k-2 éléments communs}

insert into Ck;
select p.item1, p.item2, …, p.itemk-1, q.itemk-1
from Lk-1p, Lk-1q
where p.item1=q.item1, …, p.itemk-2=q.itemk-2
, p.itemk-1< q.itemk-1
forall itemsets c ∈ Ck do
forall (k-1)-itemsets s⊂c do
if s∉Lk-1 then
delete c from Ck;
Apriori - Exemple
Base de
C1 L1
données D
itemset sup.
TID Items itemset sup.
{1} 2
100 134 {1} 2
200 235
Scan D {2} 3
{2} 3
{3} 3
300 1235 {3} 3
{4} 1
400 25 {5} 3
{5} 3
Apriori - Exemple
C2 C2 L2
itemset itemset sup
{1 2} {1 2} 1 itemset sup
{1 3} {1 3} 2 {1 3} 2
{1 5}
Scan D {1 5} 1 {2 3} 2
{2 3} {2 3} 2 {2 5} 3
{2 5} {2 5} 3 {3 5} 2
{3 5} {3 5} 2
Apriori - Exemple
C3 L3
itemset Scan D itemset sup

{2 3 5} {2 3 5} 2
Apriori - Exemple
Espace de 12345
recherche
1234 1235 1245 1345 2345
123 124 125 134 135 145 234 235 245 345
12 13 14 15 23 24 25 34 35 45
1 2 3 4 5
Apriori - Exemple
Apriori 12345
au Niveau 1
1234 1235 1245 1345 2345
123 124 125 134 135 145 234 235 245 345
12 13 14 15 23 24 25 34 35 45
1 2 3 4 5
Apriori - Exemple
Apriori 12345
au niveau 2
1234 1235 1245 1345 2345
123 124 125 134 135 145 234 235 245 345
12 13 14 15 23 24 25 34 35 45
1 2 3 4 5
Génération des règles à partir des itemsets
Pseudo-code :
pour chaque itemset fréquent l
générer tous les sous-itemsets non vides s de l
pour chaque sous-itemset non vide s de l
produire la règle "s ⇒ (l-s)" si
support(l)/support(s) ≥ min_conf", où min_conf est la
confiance minimale
Exemple : itemset fréquent l = {abc},

Sous-itemsets s = {a, b, c, ab, ac, bc)
a ⇒ bc, b ⇒ ac, c ⇒ ab
ab ⇒ c, ac ⇒ b, bc ⇒ a
Génération des règles à partir des itemsets
Règle 1 à mémoriser :
La génération des itemsets fréquents est une opération
coûteuse
La génération des règles d’association à partir des itemsets
fréquents est rapide
Règle 2 à mémoriser :
Pour la génération des itemsets, le seuil support est utilisé.
Pour la génération des règles d’association, le seuil confiance
est utilisé.
Complexité en pratique ?
A partir d’un exemple réel (petite taille) …
Expériences réalisées sur un serveur Alpha Citum 4/275 avec
512 MB de RAM & Red Hat Linux release 5.0 (kernel 2.0.30)
Exemple de performances
Network
NetworkManagement
ManagementSystem
System Réseau switché
MSC
MSC MSC
MSC MSC
MSC
BSC
BSC BSC
BSC BSC
BSC
Réseau d’accés
BTS
BTS BTS
BTS BTS
BTS
MSC
MSC Mobile station controller
Alarms
Alarms
BSC
BSC Base station controller
BTS Base station transceiver

BTS
Réseau cellulaire
Données télécom contenant des alarmes :

1234 EL1 PCM 940926082623 A1 ALARMTEXT..
Alarm type Date, time Alarm severity class
Alarming network element
Alarm number
Exemple de données 1 :
43 478 alarmes (26.9.94 - 5.10.94; ~ 10 jours)
2 234 différent types d’alarmes, 23 attributs, 5503 différentes
valeurs
Exemple de données 2 :
73 679 alarmes (1.2.95 - 22.3.95; ~ 7 semaines)
287 différent types d’alarmes, 19 attributs, 3411 différentes
valeurs
Ensemble données 1 (~10 jours) Ensemble données 2 (~7 semaines)
Exemple de règles :
alarm_number=1234, alarm_type=PCM ⇒ alarm_severity=A1 [2%,45%]
Exemple de résultats pour les données 1 :

Seuil de fréquence : 0.1
Itemsets candidats : 109 719 Temps: 12.02 s
Itemsets fréquents : 79 311 Temps: 64 855.73 s
Règles : 3 750 000 Temps: 860.60 s
Exemple de résultats pour les données 2 :

Seuil de fréquence : 0.1
Itemsets candidats : 43 600 Temps: 1.70 s
Itemsets fréquents : 13 321 Temps: 10 478.93 s
Règles : 509 075 Temps: 143.35 s
Apriori - Complexité
• Phase coûteuse : Génération des candidats
– Ensemble des candidats de grande taille :

• 104 1-itemset fréquents génèrent 107 candidats pour les 2-
itemsets
• Pour trouver un itemset de taille 100, e.x., {a1, a2, …, a100},
on doit générer 2100 ≈ 1030 candidats.
– Multiple scans de la base de données :

• Besoin de (n +1 ) scans, n est la longueur de l’itemset le plus
long
Apriori - Complexité
En pratique :
Pour l’algorithme Apriori basique, le nombre d’attributs est
généralement plus critique que le nombre de transactions
Par exemple :
50 attributs chacun possédant 1-3 valeurs, 100.000 transactions
(not very bad)
50 attributs chacun possédant 10-100 valeurs, 100.000 transactions
(quite bad)
10.000 attributs chacun possédant 5-10 valeurs, 100 transactions
(very bad...)
Notons :
Un attribut peut avoir plusieurs valeurs différentes
Les algorithmes traitent chaque paire attribut-valeur comme un
attribut (2 attributs avec 5 valeurs Æ “10 attributs”
Quelques pistes pour résoudre le problème …
Apriori – Réduction de la complexité
Suppression de transactions :
Une transaction qui ne contient pas de k-itemsets
fréquents est inutile à traiter dans les parcours (scan)
suivants.
Partitionnement :
Tout itemset qui est potentiellement fréquent dans une
BD doit être potentiellement fréquent dans au moins une
des partitions de la BD.
Echantillonage :
Extraction à partir d’un sous-ensemble de données,
décroitre le seuil support
Apriori - Avantages
Résultats clairs : règles faciles à

interpréter.
Simplicité de la méthode
Aucune hypothèse préalable
(Apprentissage non supervisé)
Introduction du temps : méthode facile
à adapter aux séries temporelles. Ex :
Un client ayant acheté le produit A est
susceptible d ’acheter le produit B dans
deux ans.
Apriori - Inconvénients
Coût de la méthode : méthode

coûteuse en temps
Qualité des règles : production d’un
nombre important de règles triviales
ou inutiles.
Articles rares : méthode non
efficace pour les articles rares.
Adapté aux règles binaires
Apriori amélioré
Variantes de Apriori : DHP, DIC, etc.
Partition [Savasere et al. 1995]
Eclat et Clique [Zaki et al. 1997]
…
Typologie des règles
Règles d’association binaires

Forme : if C then P. C,P : ensembles d’objets
Règles d’association quantitatives
Forme : if C then P
C = terme1 & terme2 & … & termen
P = termen+1
termei = <attributj, op, valeur> ou <attributj, op,
valeur_de, valeur_a>
Classes : valeurs de P
Exemple : if ((Age>30) & (situation=marié)) then prêt=prioritaire
Règles de classification généralisée
Forme : if C then P, P=p1, p2, …, pm P: attribut but
etc.
Classification généralisée
par Algorithmes
Génétiques
Problématique
Q Découvrir dans une large BD quelques petites
règles intéressantes «Si C Alors P»

• C = terme1 & terme2 ... & termen (n≤MAXTERM)
• termei =1..n ≡ <attribut=valeur> / valeur est énumératif
• P = terme ≡ <attribut but=valeur>

• attribut but ∈ GoalsSet (défini par l’utilisateur)
Q Exemple : SI (Situation=Single) and (Age=Young) THEN

(Recommandation=Very_recommand)
Les algorithmes génétiques
J. Holland (1975)
Population
Sélection
Principes Génération Parents
suivante Elitisme
Codage des solutions
Opérateurs Mutation
Sélection
Croisement
Croisement (Crossover)
Mutation
Enfants
Situation Age Recommandation
Very_recommand
L’algorithme Génétique
Single Young
Sous-population 1 Sous-population K
C11 P1 Ck1 Pk
... ... ...
C1N P1 CkN Pk
Suppression petites règles Suppression

Crossover Crossover
Mutation Mutation
Remplacement quelques règles Remplacement
intéressantes
Evaluation Evaluation
(Fitness function) (Fitness function)
BD
Fitness (Intérêt d’une règle)
C
G ( Rule ) = b . log( ab ) [Wang et al. 98]
N
P C & P
a = ,b =
N C
ω 1 .G ( Rule ) + ω 2.
η pu
F ( Rule ) =
ηt [Freitas 99]
ω1+ω 2
Opérateurs génétiques : Crossover (1)
Deux parents P1 et P2 ont un ou plusieurs

attributs commun(s) dans leurs parties C
Sélection aléatoire d’un terme
Permutation de leurs valeurs
Exemple :
P1 : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male)
P2 : (Marital_status= single) ∧ (Salary=high)
Enfant1 : (Marital_status=single) ∧ (Gender=male).

Enfant2 : (Marital_status=married) ∧ (Salary=high).
Opérateurs génétiques : Crossover (2)
P1,P2 n’ont aucun attribut commun dans C

Sélection aléatoire d’un terme dans P1
Insertion dans P2
Proba = (MAXTERM - K)/MAXTERM
K: Nombre de termes dans la partie C de P2
Vice versa
Exemple :
P1 : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male)
P2 : (Age = young) ∧ (Salary=high)
E1 : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male) ∧ (Age=young)
E2 : (Marital_status=married) ∧ (Salary=high) ∧
(Gender=male)
Opérateurs génétiques : Mutation (1)
Deux types de mutation

Mutation d’attributs
Mutation de valeurs d’attributs
Le type de mutation est choisi aléatoirement
Mutation d’attribut
Remplacement d’un attribut par un autre (choix aléatoire)
La valeur du nouvel attribut est choisie aléatoirement
Exemple :
P : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male)
Enfant : (Age=young) ∧ (Gender=male)
Opérateurs génétiques : Mutation (2)
Mutation de valeur d’attribut

Sélection d’un attribut aléatoirement
Remplacement de sa valeur par une autre choisie
aléatoirement
Exemple :
Parent : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male)
Enfant : (Marital_status=single) ∧ (Gender=male)
Opérateurs génétiques : Suppression
Suppression de termes
But : règles plus faciles à comprendre (petites)
Suppression d’un terme choisi aléatoirement avec
une probabilité proportionnelle à sa longueur
Exemple :
P : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male) ∧
(Age=young)
E : (Marital_status=married) ∧ (Gender=male)
Application
• BD : Nursery school
Q From http://www.ics.uci.edu/AI/ML/Machine-Learning.html
Q 12960 data instances with 9 attributes
Attribute name Attribute values
1 Parents Usual, pretentious, great_pret
2 Has_nurs Proper, less_proper, improper, critical, very_crit
3 Form Complete, completed, incomplete, foster
4 Children 1, 2, 3, more
5 Housing Convenient, less_conv, critical
6 Finance Convenient, inconv
7 Social Nonprob, slightly_prob, problematic
8 Health Recommended, priority, not_recom
9 Recommendation Recommend, priority, not_recom, very_recom
• Hardware platform • Paramètres de l’AG

Q SGI/IRIX (100MHz R4600, Q 3 attributs buts
32MB RAM, 549MB disque) Q MAXTERM=5
Q 150 individus /3 sous-populations
Evaluation expérimentale (1)
Publication
N. Melab and E-G. Talbi. A Parallel Genetic Algorithm
for Rule Mining. IEEE Intl. Workshop on Bio-Inspired
Solutions to Parallel Processing Problems (BioSP3), San
Francisco, USA, Apr. 23, 2001.
Evaluation de l’AG
Qualité des règles extraites
Paramètres mesurés :
Validité : facteur de confiance des règles
C&P
FC =
C
Evaluation expérimentale (2)
Règle |C| |P| |C&P| FCTrain FCTest

R1 18 1296 9 0.500000 0.500000
R2 6 1296 3 0.500000 0.500000
R3 288 196 124 0.430556 0.000000
R4 18 864 18 1.000000 1.000000
R5 18 864 18 1.000000 1.000000
R6 54 864 18 0.333333 0.333333
R7 57 864 18 0.333333 0.333333
R8 162 864 54 0.333333 0.333333
Moyenne 0.552500 0.4987500
FC mesurés
Sur les données d’apprentissage (20%) : FCtrain
Sur les données de test (80%) : Fctest
Exemple : R4 : SI ((parents=usual) && (health=not_recomm))

ALORS (recommandation=not_recomm)
Technique “Puces à ADN”
Avantage principal des techniques “Puces à

ADN”
Permet l’analyse simultanée d’expressions de
milliers de gènes dans une seule expérience
Processus “Puces à AND”

Arrayer
Expérience : Hybridation
Capture des images résultats
Analyse
Analyse de l’expression de gènes :
Technologie Puces à ADN
Des robots alignent les

ESTs (Expressed
Sequence Tags) sur les
lames de microscopes
cellules mRNA marquées
par des tags fluorescents
Liaison mRNA - cDNA
exprimée (fluorescence)
indique que le gène est
actif
Ressources
Objectif de “Microarray Mining”
Analyse des expressions de gènes

sous différentes conditions
test … … ….
A B C
gene
1 0.6 0.4 0.2 …
2 0.2 0.9 0.8 …
3 0 0 0.3 …
4 0.7 0.5 0.2 …
.. .. .. .. …
.. .. .. .. …
1000 0.3 0.8 0.7 …
Objectif du “Microarray Mining”
Analyse des expressions de gènes

sous différentes conditions
test … … ….
A B C
gène
1 0.6 0.4 0.2 …
2 0.2 0.9 0.8 …
3 0 0 0.3 …
4 0.7 0.5 0.2 …
.. .. .. .. …
.. .. .. .. …
1000 0.3 0.8 0.7 …
Clustering de gènes
Genes participating in the same pathway are most likely expression at same time.
Gene1, Gene2, Gene3, Gene4, Gene5.
Gène représentant la conséquence ?
Chaque condition (microarray) est une instance.
Gènes représentent les itemsets.
Règles d’association avec confiance élevée (100%?)
Gènes cibles = conséquence des règles

Positive regulation
Gene 1 Gene 2 Gene 3 Gene 4

Gene x
Negative regulation
Expérimentations
Ensemble de données
Source：Lawrence Berkeley National Lab

(LBNL) Michael Eisen's Lab
http://rana.lbl.gov/EisenData.htm
Données d’expression Microarray de “yeast

saccharomyces cerevisiae”, contenant 6221
gènes sous 80 conditions
Règles d’association – Résumé
Probablement la contribution
la plus significative de la
communauté KDD
Méthodes de recherche de
règles :
A-priori
Plusieurs articles ont été
publiés dans ce domaine
Règles d’association – Résumé
Plusieurs issues ont été
explorées : intérêt d’une règle,
optimisation des algorithmes,
parallélisme et distribution, …
Directions de recherche :
Règles d’associations pour
d’autres types de données :
données spatiales,
multimedia, séries
temporelles, …
Règles d’association - Références
R. Agrawal, T. Imielinski, and A. Swami. Mining association rules

between sets of items in large databases. SIGMOD'93, 207-216,
Washington, D.C.
S. Brin, R. Motwani, and C. Silverstein. Beyond market basket:
Generalizing association rules to correlations. SIGMOD'97, 265-276,
Tucson, Arizona.
M. Klemettinen, H. Mannila, P. Ronkainen, H. Toivonen, and A.I.
Verkamo. Finding interesting rules from large sets of discovered
association rules. CIKM'94, 401-408, Gaithersburg, Maryland.
H. Mannila, H. Toivonen, and A. I. Verkamo. Efficient algorithms for
discovering association rules. KDD'94, 181-192, Seattle, WA, July
1994.
G. Piatetsky-Shapiro. Discovery, analysis, and presentation of strong
rules. In G. Piatetsky-Shapiro and W. J. Frawley, editors, Knowledge
Discovery in Databases, 229-238. AAAI/MIT Press, 1991.
Outils pour le Data
Mining
Comment Choisir un outil ?
Systèmes commerciaux de data

mining possèdent peu de
propriétés communes :
Différentes méthodologies et
fonctionalités de data mining
Différents types d’ensembles
de données
Pour la sélection d’un outil, on a

besoin d’une analyse multi-
critère des systèmes existants
Types de donnés : relationnel, transactionnel,

texte, séquences temporelles, spaciales ?
Issues systèmes
Support systèmes d’exploitation ?
Architecture client/serveur ?
Fournit une interface Web et permet des
données XML en entrée et/ou en sortie ?
Sources des données :
Fichiers texte ASCII, sources de données
relationnels multiples, …
Support ODBC (OLE DB, JDBC) ?
Fonctionalités et méthodologies
une vs. plusieurs fonctions de data mining
une vs. plusieurs méthodes par fonction
Couplage avec les systèmes de gestion de base
de données et les entropots de données
Outils de visualization : visualisation des

données, visualisation des résultats obtenus,
visualisation du processus, visualisation interactive
(split attribut, …), etc.
Extensibilité (Scalability)
instances (Taille de la base de données)
attributs (dimension de la base)
Extensibilité en terme d’attributs est plus
difficile à assurer que l’extensibilité en terme
d’instances
Langage de requête et interface graphique

(IHM)
easy-to-use et qualité de l’interface
data mining interactif
Exemple d’outils (1)
Intelligent Miner d’IBM

Intelligent Miner for Data (IMA)
Intelligent Miner for Text (IMT)
Tâches : groupage de données, classification,
recherche d’associations, etc.
Entreprise Miner de SAS
SAS : longue expérience en statistiques
Outil «complet» pour le DM
Darwin de Thinking Machines
Trois techniques : réseaux de neurones, arbres de
décision et régression.
Client-Serveur
Exemples d’outils (2)
MineSet de Silicon Graphics

Fonctionnalités interactives et graphiques
Techniques sous-jacentes : classification,
segmentation, recherche de règles d’association.
Outils/librairies libres
SIPINA
WEKA
Data-Miner Software Kit (DMSK)
Kit de programmes : méthodes statistiques,
segmentation, groupage, réseaux de neurones, etc.
Il existe une version en java
etc.
SAS Entreprise Miner (1)
Société : SAS Institute Inc.

Création : Mai 1998
Plate-formes : Windows NT & Unix
Utilisation
Réduction des coûts
Maîtrise des risques
Fidélisation
Prospection
Outils de data warehouse
Interface graphique (icônes)
Construction d’un diagramme
Deux types d’utilisateurs

Spécialistes en statistiques
Spécialistes métiers (chef de projet, études…)
Techniques implémentées
Arbres de décision
Régression
Alice (1)
Société : ISoft
Création : 1988
Plate-formes : Windows 95/98/NT/2000,
TSE, Metaframe
Utilisation
Marketing : études de marché, segmentation …
Banque, Assurance : scoring, analyse de risques, détection de
fraudes
Industrie : contrôle qualité, diagnostic, segmentation,
classification, construction de modèles, prédiction et
simulation
Alice (2)
Interface graphique (tools)
Type d’utilisateur : responsables opérationnels

Clementine (1)
Société : ISL (Integral Solutions Limited)
Création : 1994
Plate-formes : Windows NT, Unix
Utilisation
Prévision de parts de marché
Détection de fraudes
Segmentation de marché
Implantation de points de vente …
Environnement intégré : #Types d’utilisateurs
Gens du métier (pas forcement des informaticiens)
Développeurs / End users
Clementine (2)
Interface simple, puissante et complète
interface conviviale
Clementine (3)
Techniques :
Arbres de décision
Induction de règles
Méthodes statistiques
Forecast Pro (1)
Société : Business Forecast Systems

Création : 1997
Plate-formes : Windows 95, NT
Utilisation
Tous domaines activités et secteurs
Notamment la prévision (5 types différents)
Outil d’analyse incomparable
Le plus utilisé dans le monde
Forecast Pro (2)
Types d’utilisateurs : PME/PMI,
administrations, consultants, universitaires,
chefs de projets,…
Facilité d’utilisation (connaissances en
statistiques non requises)
Vaste palette de choix graphiques
Valeurs observées, prévisions, valeurs calculées
sur l'historique, intervalles de confiance,
diagnostics (erreurs)
Forecast Pro (3)
Intelligent Miner (1)
Société : IBM
Création : 1998
Plate-formes : AIX, OS/390, OS/400,
Solaris, Windows 2000 & NT
Utilisation
Domaines où l’aide à la décision est très
importante (exemple : domaine médical)
Analyse de textes
Fortement couplé avec DB2 (BD relationnel)
Deux versions
Intelligent Miner for Data (IMD)
Intelligent Miner for Text (IMT)
Types d’utilisateurs : spécialistes ou
professionnels expérimentés
Parallel Intelligent Miner

L’IMD
Sélection et codage des données à explorer
Détermination des valeurs manquantes
Agrégation de valeurs
Diverses techniques pour la fouille de données
Règles d’association (Apriori), classification (Arbres
de décision, réseaux de neurones), clustering,
détection de déviation (analyse statistique &
visualisation)
Visualisation des résultats
Algorithmes extensibles (scalability)
IMT = analyse de textes libres
Trois composants
Moteur de recherche textuel avancé (TextMiner)
Outil d'accès au Web (moteur de recherche
NetQuestion et un méta-moteur)
Outil d'analyse de textes (Text Analysis)
L'objectif général est de faciliter la
compréhension des textes
MineSet (1)
Société : SGI (Silicon Graphics Inc.)

Création : 1996
Plate-forme : Silicon Graphics
Utilisation
Services financiers
Prise de décisions
Algorithmes de visualisation avancés
MineSet (2)
Interface visuelle 3D
MineSet (3)
Interface graphique
client/serveur
Tool Manager (Client)
DataMover (Server)
Utilisateurs
Managers
Analystes
MineSet (4)
Tâches
Classification
Présentation de la connaissance
Arbre
Statistiques
Clusters (nuages de points)
Synthèse
Autres techniques de Data Mining
Web mining (contenu,

usage, …)
Visual data mining (images)
Audio data mining (son,

musique)
Data mining et requêtes

d’interrogation
“intelligentes”
Visualisation de données
Données dans un base de

données ou un entropot de
données peuvent être
visualisées :
À différents niveaux de
granularité ou d’abstraction
A l’aide de différentes
combinaisons d’attributs ou
dimensions
Résultats des outils de Data
Mining peuvent être présentées
sous diverses formes visuelles
Box-plots dans StatSoft
Scatter-plots dans SAS
Enterprise Miner
Règles d’association dans
MineSet 3.0
Arbres de décision dans
MineSet 3.0
Clusters dans IBM Intelligent
Miner
Résumé
Data mining : découverte
automatique de “patterns”
intéressants à partir d’ensembles de
données de grande taille
KDD (Knowledge discovery) est un
processus :
pré-traitement
data mining
post-traitement
Domaines d’application :
distribution, finances, biologie,
médecine, télécommunications,
assurances, banques, ...
Résumé
L’information peut être extraite à
partir de différentes types de
bases de données (relationnel,
orienté objet, spatial, WWW, ...)
Plusieurs fonctions de data mining
(différents modèles) : clustering,
classification, règles d’association,
...
Plusieurs techniques dans
différents domaines :
apprentissage, statistiques, IA,
optimisation, ....
Résumé
Plusieurs problèmes
ouverts :
Visualisation
Parallélisme et
distribution
Issues de sécurité et
confidentialité
Futur prometteur …
Références bibliographiques (1)
Georges Gardarin
Université de Versailles (laboratoire PRISM)
Internet/intranet et bases de données – Data Web,
Data Warehouse, Data Mining, Ed. Eyrolles
http://torquenada.prism.uvsq.fr/~gardarin/home.html
Rakesh Agrawal (IBM)
IBM Almaden Research Center
http://www.almaden.ibm.com/cs/people/ragrawal/
Mohammed Zaki
Rensselaer Polytechnic Institute, New York
http://www.cs.rpi.edu/~zaki/
Vipin Kumar
Army High Performance Computing Research Center
http://www-users.cs.umn.edu/~kumar
Rémi Gilleron
Découverte de connaissances à partir de données,
polycopié (Université de Lille 3)
http://www.univ-lille3.fr/grappa
The Data Mine
http://www.cs.bham.ac.uk/~anp/TheDataMine.html
Knowledge Discovery Nuggets (Kdnuggets)
www.kdnuggets.com
•"Data Mining: Concepts and Techniques“

by Jiawei Han and Micheline Kamber,
Morgan Kaufmann Publishers,
August 2000. 550 pages. ISBN 1-55860-489-8
Conférences - Historique
1989 Workshop IJCAI

1991-1994 Workshops KDD
1995-1998 Conférences KDD
1998 ACM SIGKDD
1999- Conférences SIGKDD
Et plusieurs nouvelles conférences DM …
PAKDD, PKDD
SIAM-Data Mining, (IEEE) ICDM
etc.
Conférences - Journaux
“Standards”
“Standards”
DM: Conférences : KDD, PKDD, PAKDD, ...
Journaux : Data Mining and Knowledge
Discovery, CACM
DM/DB: Conférences : ACM-SIGMOD/PODS, VLDB, ...
Journaux : ACM-TODS, J. ACM,
IEEE-TKDE, JIIS, ...
AI/ML: Conférences : Machine Learning, AAAI, IJCAI,
...
Journaux : Machine Learning, Artific. Intell.,
...

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Laboratoire d’Informatique

Fouille de données (Data Mining)

 Définition du Data Mining

 Processus inductif, itératif et interactif de

 Interactif : l’utilisateur est dans la boucle du

 Abduction : diagnostic médical, ...

 Déduction : Raisonnement qui conclut à partir de

 Induction : Généralisation d’une observation ou d’un

 Utilisée en Data mining (tirer une conclusion à partir

 La clio a 4 roues, La Peugeot 106 a 4 roues, La BMW M3 a 4

 Explosion des données

 Croissance en puissance/coût des machines capables

Masse importante de données – supports hétérogènes

 Data mining : coeur de KDD

 Visualiser, évaluer et interpréter les modèles

 Gérer la connaissance découverte

Présentation des Décideur(s)

 Développer des techniques et systèmes efficaces

 Faciliter l’utilisation des systèmes de DM

 Intelligence artificielle et apprentissage

 Analyse de données (statistiques)

 Recherche opérationnelle et optimisation

 Informatique parallèle et distribuée

 Data mining : Exploratoire, Data-driven modeling

 Distribution d ’une seule variable : moyenne, médiane,

 Explorer les relation entre variables : coefficient de

 test du X2, ...

 Kernel regression : découvrir graphiquement

 Techniques statistiques inadéquates : nombre de

 Prise de décision basée

 Le rôle et l’importance du BDD

 Marketing direct : population à cibler (âge, sexe,

 Gestion et analyse de risque : Assurances, Banques

 Vous êtes gestionnaire marketing d’un

 Trois mois avant

 Si vous voulez les garder,

 Qu’est ce qu’il faut faire

 Analyser les données de tous les

 Vous êtes à l’étranger et

 Les logs des accés Web sont

 Améliorer l’organisation du site

 Valeurs des champs des enregistrements des

 Elle permet de prédire si une instance de donnée est membre

 Applications : marketing direct (profils des consommateurs),

 Partitionnement logique de la base de données en

 Clusters : groupes d’instances ayant les mêmes

 Pb : interprétation des clusters identifiés

 Applications : Economie (segmentation de marchés),

 Corrélations (ou relations) entre attributs (méthode non

 Applications : grande distribution, gestion des stocks, web

 Instances ayant des caractéristiques les plus

 K-moyennes, A-priori, K-NN

Waikato Environment for Knowledge

 Logiciel gratuit disponible sur le web :

Les fonctions disponibles :

 Outils pour le Data Mining

 Soient N instances de données à k attributs,

 Affectation automatique de “labels” aux clusters

 Une bonne méthode de clustering produira

Définition du Data Mining

Processus inductif, itératif et interactif de

Interactif : l’utilisateur est dans la boucle du

Abduction : diagnostic médical, ...

Déduction : Raisonnement qui conclut à partir de

Induction : Généralisation d’une observation ou d’un

Utilisée en Data mining (tirer une conclusion à partir

La clio a 4 roues, La Peugeot 106 a 4 roues, La BMW M3 a 4

Explosion des données

Croissance en puissance/coût des machines capables

Data mining : coeur de KDD

Visualiser, évaluer et interpréter les modèles

Gérer la connaissance découverte

Développer des techniques et systèmes efficaces

Faciliter l’utilisation des systèmes de DM

Intelligence artificielle et apprentissage

Analyse de données (statistiques)

Recherche opérationnelle et optimisation

Informatique parallèle et distribuée

Data mining : Exploratoire, Data-driven modeling

Distribution d ’une seule variable : moyenne, médiane,

Explorer les relation entre variables : coefficient de

test du X2, ...

Kernel regression : découvrir graphiquement

Techniques statistiques inadéquates : nombre de

Prise de décision basée

Le rôle et l’importance du BDD

Marketing direct : population à cibler (âge, sexe,

Gestion et analyse de risque : Assurances, Banques

Vous êtes gestionnaire marketing d’un

Trois mois avant

Si vous voulez les garder,

Qu’est ce qu’il faut faire

Analyser les données de tous les

Vous êtes à l’étranger et

Les logs des accés Web sont

Améliorer l’organisation du site

Valeurs des champs des enregistrements des

Elle permet de prédire si une instance de donnée est membre

Applications : marketing direct (profils des consommateurs),

Partitionnement logique de la base de données en

Clusters : groupes d’instances ayant les mêmes

Pb : interprétation des clusters identifiés

Applications : Economie (segmentation de marchés),

Corrélations (ou relations) entre attributs (méthode non

Applications : grande distribution, gestion des stocks, web

Instances ayant des caractéristiques les plus

K-moyennes, A-priori, K-NN

Logiciel gratuit disponible sur le web :

Outils pour le Data Mining

Soient N instances de données à k attributs,

Affectation automatique de “labels” aux clusters

Une bonne méthode de clustering produira

Marketing : segmentation du marché en découvrant des

Il n’y a pas de définition unique

Propriétés d’une distance :

Définir une distance sur chacun des champs

Combiner les distances : Soient x=(x1,…,xn) et y=(y1, …,yn)

Données binaires : d(0,0)=d(1,1)=0, d(0,1)=d(1,0)=1

Donnée énumératives : distance nulle si les valeurs sont

Donnée énumératives ordonnées : idem. On peut définir

Données de types complexes : textes, images, données

Coefficient de correspondance simple (similarité

Les valeurs Y et P sont initialisées à 1, et la

Généralisation des variables binaires, avec

Méthode 1: correpondance simple

Exemple : (Age, Propriétaire résidence principale, montant

x=(30,1,1000), y=(40,0,2200), z=(45,1,4000)

Base de données « Cancer du sein »

Base de données « Diabète » : Diagnostic (OMS)

Méthode de partitionnement (K-

Entrée : un échantillon de m enregistrements x1, …, xm

8 points A, …, H de l ’espace euclidéen 2D. k=2 (2 groupes)

Relativement extensible dans le

Applicable seulement dans le cas où la

Sélection des centres initiaux

Une méthode hiérarchique :

Entrée : un échantillon de m enregistrements x1, …, xm

La hiérarchie de clusters est

Distance entre les centres des clusters (Centroid