II- PROTIDE

2.1- GENERALITE ET DEFINITION

2.1.1- Généralités
PROTIDE
(AA-AA-AA-AA-AA-.......) PROTÈINE
PEPTIDE
Liaison peptidique( ou amid e) (Protéide)
Oligopeptide Polypeptide Protéine simple Hétéroprotéine
Ex: -ADH(9AA) (holoprotéine) ex: -Lipoprotéine
Ex: -Dipeptide -Oxytocine(9AA) -Holoprotéine -Glycoprotéine
-Tripeptide -Glucagon(29AA) globulaire soluble -Phosphoprotéine
-Carnosine(Ala-His) -Insuline(51AA) ex:-protamine ......
-Glutathion(Glu-Cys-Gly) -Adrénocorticotrophine -histone
-.................... hormone(ACTH)(39AA) -albumine
-AlphaMSH -Prolamine
-Calcitonine -glutéline
-Parathormone -glubuline...
-Angiotensine -Holoprotéines
-Kinine f ibrillaires solubles
........ ex:-f ibrinogène
-myofibrille...
-Holoprotéines
f ibrillaires insolubles
ex:-collagène
-kératine
-élastine
-f ibroine de soi...
2.1.2- niymn½y(Définition) : CaBYkmUelKulFM² (macromolécules) pSMeLIgBI GasuItGamuIeN
(Acides aminés :AA) tP¢ab;Kñaedaysm<n§½buibTIdb¤GamId ( liaison peptidique ou amide ) :

- CaFatupSMrbs; ekasika

- CaFatupSMrbs; ³ sac;dMu GgsuIm (enzymes), GñkdwknaMmUelKul (transporteurs des molécules

: ]³ O2, Fe, Hb..), GñkTTYl (Récepteurs), GgÁbdib (Anticorps ou immunoglobuline ),

Précurseurs, Régulateurs du métabolisme etc…

2.2- ACIDES AMINES b¤GalhVaGamuINUGasuIt (ou ALPHA-AMINO-ACIDES)

2.2.1- Définition : CaBYk Acide carboxylique EdlmannaTI AmineenA Carbone alpha :

. CaFatupSMRKwHrbs; Protéines
. rUbmnþTUeTA (Formule générale ) :

. man –COOH, -NH2 et radical (R) tP¢ab;eTAkabUnTI2 ( carbone alpha )

1
. man Configuration L ( enAFmµCati ) Ex: L-Sérine

. enA pH physiologique acides aminés TRmg;Ca Ion

. raDIkal(Radical) GacCaExSlat (Chaîne aliphatique ou linéaire), ExSbiT
(cyclique ou aromatique ou hétérocyclique) .
. CaTUeTAman 20 Acides aminés cUlrYmkñúgkarsMeyaK Protéines tamry³ ARNm enA Ribosome .
eKcat;Tuk sélénocystéine (Sec) Ca acide aminé TI 21 vaCaFatupSMrbs; sélénoprotéine
( ex: désiodase, glutathion peroxydase, sélénoprotéine P…)

O
Alpha
H2N CH C OH
2 1
CH2SeH
Sélénocystéine

L-Pyrrolysine (Pyl)

nig pyrrolysine Ca acide aminé TI22 EteKCYbEtenAkñúgBYk archées méthanogènes(procaryote) xøH .

.tag (Symbole) : 3 tYGkSr (lettres) ou 1 tYGkSr
. textiles de synthèse(ររណាត់សំយោគ)ផលិតពី acides -aminés(les polyamides)

2.2.2- Classification ( cMNat;fñak;) : eKGac cMNat;fñak)aneRcInEbb

2.2.2.1- AA. Constitutifs des protéines (GasuItGamIeNEdlCaFatupSMrbs;RbUetGIun)

- karcMNat;fañ k; Ep¥kelIlkçN³rbs; radical (R)

* Chaînes latérales non polaires (Hydrophobes): Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp, Met
* ExSlatmanb:Ul (Chaînes latérales polaires) :
. KµanbnÞúk (Non chargées :neutre) : Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn et Gln

. bnÞúkviC©man (Chargées positivement :AA.Basiques) : Lys, Arg et His

. bnÞúkGviC©man (Chargées négativement :AA. Acides) : Asp et Glu

2
 STRUCTURE DES 22(20+2) ACIDES AMINES REPRESENTES
DANS LE CODE GENETIQUE

L-Sélénocystéine L-Pyrrolysine

taragsegçblkçNsMxan;²rbs; 22 acides amines

(les codes et abréviations indiqués sont ceux spécifiés par le comité de nomenclature
commun IUAPC - IUBMB) :
Occurrence Abondance
Code Code pointiso Codons
Masse (% ×106
à1 à3 Acide aminé électriq Nature d'ARN
molaire protéines molécules
lettre lettres ue(pI) messager
humaines) chez E. coli

A Ala Alanine 89,0940 6,01 Apolaire, GCU, GCC, 7,8 290

3
 aliphatiqu GCA, GCG
e

C Cys Cystéine 121,1540 5,05 Polaire UGU, UGC 1,9 52

Acide
D Asp 133,1038 2,85 Acide GAU, GAC 5,3 140
aspartique

Acide
E Glu 147,1307 3,15 Acide GAA, GAG 6,3 150
glutamique

Apolaire,
F Phe Phénylalanine 165,1918 5,49 aromatiqu UUU, UUC 3,9 110
e

Apolaire,
GGU, GGC,
G Gly Glycine 75,0671 6,06 aliphatiqu 7,2 350
GGA, GGG
e

H His Histidine 155,1563 7,60 Basique, CAU, CAC 2,3 54

Apolaire,
AUU, AUC,
I Ile Isoleucine 131,1746 6,05 aliphatiqu 5,3 170
AUA
e

K Lys Lysine 146,1893 9,60 Basique AAA, AAG 5,9 200

Apolaire, UUA, UUG,

L Leu Leucine 131,1746 6,01 aliphatiqu CUU, CUC, 9,1 260
e CUA, CUG

M Met Méthionine 149,2078 5,74 Apolaire AUG 2,3 88

N Asn Asparagine 132,1190 5,41 Polaire AAU, AAC 4,3 140

UAG associé à
O Pyl Pyrrolysine 255,3134 Polaire un élément 0,0 -
PYLIS

CCU, CCC,
P Pro Proline 115,1319 6,30 Apolaire 5,2 130
CCA, CCG

Q Gln Glutamine 146,1459 5,65 Polaire CAA, CAG 4,2 150

CGU, CGC,
R Arg Arginine 174,2027 10,76 Basique CGA, CGG, 5,1 170
AGA, AGG

UCU, UCC,
S Ser Sérine 105,0934 5,68 Polaire UCA, UCG, 6,8 120
AGU, AGC

ACU, ACC,
T Thr Thréonine 119,1203 5,60 Polaire 5,9 150
ACA, ACG

UGA associé à
U Sec Sélénocystéine 168,053 Polaire un élément - -
SECIS

Apolaire,
GUU, GUC,
V Val Valine 117,1478 6,00 aliphatiqu 6,6 240
GUA, GUG
e

Apolaire, UGG (et UGA

W Trp Tryptophane 204,2284 5,89 aromatiqu chez les 1,4 33
e mycoplasmes)

Polaire,
Y Tyr Tyrosine 181,1912 5,64 aromatiqu UAU, UAC 3,2 79
e

Les acides aminés aliphatiques hydrophobes

4
1- Glycine ( ou glycocolle) :G ou Gly

- Nom IUPAC : Acide 2-aminoéthanoïque

- Formule brute : C2H5O2N
- Solubilité dans l'éthanol : Oui
Kµan Carbone asymétrique sMbUrkñúg collagène, fibroine de la soi nig élastéine. CaFatupSMrbs;;
Hémoglobine et sels biliaires.
Acide aminé naturel: Bétaïne ou triméthylglycine (Ex :la muscarine, la choline et la neurine)
មានយៅរនុងៈ la betterave (250 mg pour 100 g), le son de blé (1500 mg pour 100 g) et les

germes de blé (1250 mg pour 100 g), choux vert, les fruits de mer, les épinards, les céréales
complètes,…..
យរ្រៈ veinotonique

BETAÏNE
2- GaLanIn (Alanine) :A ou Ala

- យ្មោះតាម IUPAC(international union of pure and applied chemistry'

Union internationale de chimie pure et appliquée ) : acide 2-aminopropionique
- rUbmnþdul (Formule brute): C H O N
3 7 2

- Structure chimique de la bêta-alanine ou 3-aminopropionique ou Acide β-aminopro-

panoïque .
O
║
H2N---CH2---CH2---C---OH
eKeRbICa»sf ( Spécialité pharmaceutique ABUFENE®) eRbIkñúgkrNIman Bouffées de
chaleur.
Alanine amino transférase (ALATou ALT) b¤ transaminase glutamique pyruvique
(TGP ou GPT) Ca Enzyme (transaminase) mantUnaTICakatalIkr kñúg
karepÞrnaTI Amine rbs; Alanine eTAeGay α-cétoglutarate sMbUrenAeføIm.
3- Valine : V ou Val
- Formule brute : NH11C5O2

5
4- Leucine : L ou Leu

- Nom IUPAC : Acide 2-amino-4-méthylpentanoïqie

- Formule brute : C6H13NO2
- Ca Acide aminé ramifié, homologue supérieur de val sMbUrenA kñúg germe de blé, le thon, les
arachides, le saumon, le filet de bœuf, les pois chiches, le fromage blanc et le riz.

5- Isoleucine

- Nom IUPAC : Acide (2S, 3S)-2-amino-3-méthylpentanoïque

- Formule brute : C6H13NO2
- Ca Acide aminé ramifié

6- Proline : P ou Pro

- Formule brute : NH9C5O2

-sMbUrenAkñúg Collagène Hydroxyproline dérive de la proline par hydroxylation en 4.

Les acides aminés aromatiques hydrophobes

7- Phénylalanine : F ou Phe

- Formule brute : NH11C9O2

- Phe Ca précurseur rbs; Tyr et aspatam
- Phe + O2+ NADPH2 katalIkr phénylalanine hydroxylase  Tyrosine

-eRbIBüa)al la fatigue, la dépression, le syndrome prémenstruel

6
8- Tryptophane
- Formule brute : N2H12C11O2
- Ca précurseur rbs; la sérotonine, la mélatonine, la bufoténine, vitamine PP etc
- rcnasm<½n§rbs;vaman Noyau indole.

- Les bactéries et les plantes sont capables de synthétiser le tryptophane à partir de

chorismate ou l'anthranilate.
- tryptophane manenAkñúgriz complet, produits laitiers, viande, arachides, protéines de
soja, œufs, poisson, légumineuses, chocolat, banane, amandes et les noix de cajou,
levure de bière .

Les acides aminés amidés

3- Asparagine: N ou Asn

- Nom IUPAC : acide (2S)-2-amino-3-carbamoyl-propanoïque

- Formule brute : C4H8O3N2
sMbUrenAkñúgrukçCati CaBiesskñúg asperge

7- Glutamine: Q ou Gln

- Nom IUPAC : acide 2-Amino- 5-carbamoylpentan-1-oïque

- Formule brute : C5H10O3N2
- Forme de transport et de réserve de NH+3
-eRbIBüa)al Crampes musculaires rbs;mnusSv½ycas; , la fatigue et la dépression.

Les acides aminés aromatiques hydroxylés

7
19- Tyrosine : Y ou Tyr
- Formule brute : NH11C9O3
- Ca précurseur rbs; catécholamines (l'adrénaline, la noradrénaline, la dopamine et la
DOPA.) et des hormones thyroidiennes (T4 ou thyroxine et T3).
-manenAkñúg : les amandes, avocats, bananes, produits laitiers, fèves lima, graines de
citrouille, et graines de sésame sont d'excellentes sources de tyrosine.

Les acides aminés hydrophiles hydroxylés(AA alcool)

16- Sérine : S ou Ser

- Nom IUPAC : Acide 2-amino-3hydroxypropanoïque.
- Formule brute : NH7C3O3.
- AA alcool EdlCaFatupSMrbs; lipide ( OH :polaire, non ionisé)

17- Thréonine : T ou Thr

Thréonine de synthèse, obtenue par fermentation est pure à 98,5 %

- Formule brute : NH9C4O3 ( OH :polaire, non ionisé)

Les acides aminés soufrés

5- Cystéine: C ou Cys

- Nom IUPAC : acide (2R)-2-amino- 3-sulfanyl-propanoïque

- Formule brute : C3H7O2NS
- Oxydation entre 2 Cys→ Cystine ( man pont disulfure)

(critaux)
cystéine GaceRbICaGaharbEnßmmanTRmg;Ca N-acétylcystéine (NAC) . stVecómRtUvkar Cystine
kñúgkarplit laines Cys eFVI oxydation énergique )an Acide cystéinique rYceFVI décarboxylation )an
8
Taurine

13- Méthionine ; M ou Met

- Formule brute : C5H11O2NS

- Codons : AUG
- CaGñkeGay CH3.

Les acides aminés dibasiques(AA basique) :diamine monoacide

12- Lysine: K ou Lys

- Nom IUPAC : Acide (S)-2,6-diaminohexanoïque

- Formule brute : C6H14N2O2
- Lys eFVI décarboxylation )an cadavérine (køins¥yú dUcexµac).

2- GaksuInIn (Arginine: R ou Arg)

- Nom IUPAC : Acide 2-amino-5-(diaminomethylidene amino) pentanoïque
- Formule brute : C6H14O2N4
- Ca précurseur de l’urée et de la créatinine
- Créatine phosphate CamUelKulEdlpþl;famBlenAkñúgsac;duM.

9- Histidine: H ou His

- Nom IUPAC : Acide (S)-2-amino-3-(1H-imidazol- 4-yl) propanoïque

- Formule brute : C6H9O2N3
-rcnasm<½n§rbs;vaman Noyau imidazole sMbUrenAkñúg Hémoglobine
9
 - His eFVI décarboxylation )an Histamine ( vasodilatateur )
-Ca Précurseur rbs; Carnosine.

Les acides aminés diacides : diacide monoamine

4- Acide aspartique: D ou Asp

- Nom IUPAC : acide (2S)-2-aminobutanedioïque

- Formule brute : C4H7O4N
-Aspartate aminotransférase (ASAT ou AST) ou transaminase glutamique
oxaloacétique(TGO ou GOT) sMbUrenAsac ;duM.

6- Acide glutamique : E ou Glu

eKtag Glu ou E . kñúg chaîne peptidique eKtag (Glx, Z) nig glutamine eKtag (Gln, Q)
- Nom IUPAC : Acide (S)-2-aminopentanedioïque
- Formule brute : C5H9O4N
-eFVI décarboxylation )an gamma aminobutyrique (GABA) Ca Neurotransmetteur
-GMbilebs ;va Glutamate monosodique (b‘Íecg)

* AA. Essentiels ou indispensables : Met, Ile, Leu, Val, Lys, Phe, Thr, Trp (Arg
et His : AA. essentiels au cours de la croissance < semi-essentiels>).
*La cystéine, la glycine et la tyrosine CYnkal Essentiels cMeBaHRbCaCnxøHEdlminGacsM

eyaK)anRKb;RKan; .
Ex : krNIGñkman Phénylcétonurie RtUvbnßykarnaMcUlticbMputnUv Phe EdlCa Précurseur rbs; Tyr

CaehtunaMeGay Tys Ca AA essentiel eRBaHcaM)ac;RtUvnaMcUltamcMNIGahar.

10
 Valeurs
pour un
Nom Doses journalières recommandées
adulte de 70
kg (mg)

F Phénylalanine 14 (en plus de la tyrosine) 980

L Leucine 14 980

13 (en plus de la cystéine) pour les adultes en mg par kilo

M Méthionine 910
selon l'OMS

K Lysine 12 840

I Isoleucine 10 700

V Valine 10 700

T Thréonine 7 490

W Tryptophane 3 245

H Histidine 28 pour les nourrissons

?, nécesaires pour les nourrissons, peut-être les personnes

R Arginine (?)
agées
/

*AA essentiels kñúgkrNIxHø pøas;bþÚreTAtam Espèce ; Ex : la taurine (qui n'est pas un acide aminé
au sens strict) Ca AA. Essentiel cMeBaH qµa EtmincMeBaHEqá eT.
* AA. Glucoformateurs: Ala, Asp, Asn, Cys, Met, Glu, Gln, His, Ile, Val, Phe, Tyr, Pro, Ser,
Trp et Thr
* AA. Cétogènes (cétoformateurs) : Ile, Leu, Lys, Phe, Tyr, Thr et Trp -
*AA. Aliphatiques ( ExSlat ) : Gly, Ala, Val, Leu, Ile

11
* AA. Aromatiques : Phe, Tyr et Trp (chaîne latéral non-polaire sauf Tyr )

*AA. Kµan Carbone asymétrique : Gly

*enA pH physiologique groupe alpha-aminé manbnÞÞúkviC¢man (pK=9) nig Alpha-carboxyl
manbnÞÞúkGviC¢man (pK=2)
*Arg, Lys et His manbnÞÞúkviC¢manenA pH = 7

*Asp et Glu manbnÞÞúkGviC¢manenA pH = 7

*Point isoélectrique (pI) ou Phi : charges positives = charges négatives
*AA. man pI xus²Kña.
2.2.2.2- Autres acides aminés présentent dans les protéines : Ca dérivés rbs; 20AA xagelI
Ex : - Hydroxyproline
- Hydroxylysine
- Cystine
-Sélénocystéine

2.2.2.3- Les AA non constitutifs de protéines

Ex : - Bêta alanine
- Ornithine
- Homosérine
- Dopa
- Thyronine

2.2.2.4- Dérivés des AA

12
 Ex : Acide pyroglutamique (par lactamisation de l'acide glutamique )

OH NH2

O COOH O C O C H2N (CH2)4 COOH

N OH NH2
H
Acide pyroglutamique Acide carbonique Urée GABA

- Urée (sMeyaKkñúg foie)

- Créatine (sMeyaKkñúg rein BI Gly, Arg et Met)
- Créatinine (produit de la dégradation des créatines musculaire)
- Acide gama-aminobutyrique ou GABA (produit de la décarboxylation duGlu)
- Histamine ( sMeyaK BI His) - Sérotonine(sMeyaK BI Trp)

- Mélatonine( sMeyaK BI Trp) - la citrulline (sMeyaK BI Arginine)

- Catécolamine ( Adrénaline, Noradrénaline, dopa, dopamine) ( sMeyaK BI Tyr)

2.2.3- Propriétés physiques

2.2.3.1- Propriété optique (Pouvoir rotatoire) : AA. man C asymétrique ou C alpha
chiral ticbMpt
u 1elIkElg Gly man dévier la lumière polarisée man pouvoir
rotatoire man série L et D man isomère ( eRbI Polarimètre )
2.2.3.2- Propriété ionique (pouvoir ionisation) : Degrés ionisation Tak;Tgnwg -COOH, -NH2

nig R rbs;; C2
R-CH-COOH R-CH-COO- R-CH-COO-
 -H+  -H+ 
13
 NH3+ NH3+ NH2
AA man caractère amphotère
2.2.3.3- Propriété spectrale
-RKb; AA absorbent dans l`UV RbEhl 210-220nm(1nanomètre = 10 -9
m)
-Cystine absorbe à 240 nm
- Phe absorbe à 250-260 nm
- Tyr et Trp absorbent vers 280 nm
- Protéines sMbUr AA Aromatiques dUcenHGaceFVI dosagervag 260 nm à 280nm
2.2.3.4- Solubilité karrlay

- kñúgTwk (dans l`eau): Tak;Tgnwg Radical (TMhM bnÞúk cMnYn CH2), pH de la solutionRbePT

nig kMhab; ions Edlman.

- kñúgFaturMlaysrIr³ (dans les solvants organiques) : rlayexSaymindUcKñaeT

EteKeRbIsMrab;Ejk AA ( tamrebob Chromatographie de partage).

- karrlayTabbMputrbs; acide amines enA pH = pHi rbs;va

Ex : rUbsrub acides aminés tam Diagramme de Venn

2.2.4- Propriétés chimiques

2.2.4.1- Tak;Tgnwg -COOH rbs; Carbone 2
- Estérification : AA + Alcool Ester + Eau
O O

R1 CH C OH + H O-R2 R1 CH C O-R2 + H2 O
H+
NH2 Alcool NH2 Ester

- Amidation : AA + Amine Amide + Eau

14
 O O
H
R1 CH C OH + H N-R2 R1 CH C HN-R2+ H2 O
Amine
NH2 NH2 Amide

- Décarboxylation : edayeRbIkatalIkCasarFatu KImI b¤ enzyme :

R1 CH C OH R1 CH2 NH2 + CO2

NH2 Amine

2.2.4.2- Tak;Tgnwg -NH2 rbs; Carbone 2

- Désamination par l`acide nitreux (HNO2) :

O O

R1 CH C OH + HNO2 R1 CH C OH + N2 + H2 O

NH2 OH Acide-alcool

- Formation d`imine :

H
R2-C H O + NH2 CH R1 R2-CH=N C R1

COOH Imine COOH

- Formation de dérivés N-acylés ( Acylation ) :

H
R2-CO-X + NH2 CH R1 R2-CO HN C R1 + XH

COOH Dérivé N-acylé COOH

- Formation de dérivés N-acylés cycliques :

R1
CO
-X-
R1 CH COO- + COX R1 CH COOH N 1O
OH- 2
acétate de
NH2 R2 HN sodium
O R2
R2 5-oxazolone substituée

15
 2.2.4.3- Propriétés liées à la fonction des acides aminés

- GMeBIrbs; CaRbtikmµRKwHkñúgkarrk AA eKeRbIRbtikmµenHkñúg Appareil de dosage

ninhydrine :

automatique. eKeRbICa révélateur des acides aminés kúñgkareFVI chromatographie EdlmanTRmg;Ca

ninhydrine hydratée : 2,2-dihydroxyindan-1,3-dione, soit:

La fonction cétone centrale est très électrophile et réagit avec la fonction amine des acides aminés

L' -aminoalcool perd une mole d'eau, puis une mole de CO2, en donnant une imine,

Cette imine est hydrolysée et libère un aldéhyde et une amine,

L'amine libérée réagit avec une autre mole de ninhydrine pour donner une nouvelle cétimine,

Violet de Ruhemann
(bleu-violet-rose)
Absorbant à 570nm
Ce composé fortement délocalisé est coloré(bleu-violet-rose), on le nomme Pourpre de Ruhemann. Il
est à noter qu'il ne reste qu'un atome d'azote provenant de l'acide aminé initial dans le colorant final.

16
 Les amines primaires donnent une réaction analogue excepté le départ de CO2 remplacé par
une expulsion de proton.
o o o

(Absorbant à 570nm)

- GMeBIrbs; 1-fluor-2,4-dinitrobenzène (FDNB) : réaction de SANGER

NO2 NO2
2 2
O2N 1 F-H2N-R O2N 1 NH-R + HF

dérivé 2,4-dinitrophényl

- GMeBIrbs; phénylisothiocyanate : réaction d`EDMAN

R
OH-
C6H5 N =C=S + H2N CH COOH R CH COOH
H
HN N C6H5
R O

HN N C6H5 H+
O

Phényl-thiohydantoine
O

- GMeBIrbs; chlorure de dansyl : Dansylation

H3C CH3 H3C CH3

N N
NH2

+ CH R -HCl
COOH
-O S O- -O S O-
N H
Dansyl amino-acide
Cl
Chlorure de dansyle
CH R
HOOC
- GMeBIrbs; fluorescamine :

17
 O R N

O O

O + R-NH2 OH

COOH
O
Fluorescamine composé fluorescent

Tak;Tgnwg Chaîne latérale –R

2.2.4.4-

-CamYynaTI OH rbs;; R GaceFVI estérification CamYy Acide acétique et phosphorique.

-CamYy Noyau aromatique rbs; R, AA.Gac Absorber BnøW UV nigman réaction de substitution

- blocquer edayelah³F¶n; (Pb, Ag, Hg, As)

- CamYynaTI SH(thiol) rbs; R Gac - CamYy acide )an thioester

-eFVI oxydation eTACa acide sulfonique

2.2.5- Propriétés biologiques des acides aminés

- manmuxgarBIrEdlsMxan;
- CaFatupSMrbs; protéine nigCaRbPB Azote EtmYyKt;rbs;srIragÁmnusSeyIg

- muxgarsMxan;Ca précurseurs rbs; métabolites importants (Ex : Choline,Créatine, etc…) nig

Hormones (Ex : adrénaline, hormones thyroidiennes etc….).

2.2. 6- Séparation, identification et dosage des acides aminés

2.2.6.1- Généralités :
- edIm,Irk Structure primaire des protéines eKsikSaenA biochimie générale
- edIm,Irk Amino-acideskñúg liquides bilogiques ( Qamsang, Twkenamurine..)eKsikSaenA
biochimie clinique
Méthodes nimYy²man degrés de précision et de rapidité xus²Kña EtCaTUeTAeKrktam
rebób3Ebb ³
. Séparation par contre-courant
. Méthode chromatographique
. Méthode électrophorétique

2.2.6.2- Séparation par distribution à contre-courant

eKGaceRbI ³
- Ampoule à décantation : eRbIFgÁFaturavBIrminrlaycUlKña(Ex : n-butanol-eau; phénol-eau)
18
 - rebobenHeKeRbIkñúAppareil automatique (méthode de Craig))anlT§pll¥
2.2.6.3- Méthodes chromatographiques

maneRcInEbbeKGacEbgEckeTAtam ³
RbePTrbs;pas (phase) mobile :
• Chromatographie en phase liquide : phase mobile ou éluant CaFaturMlayTwkb¤srIr³ (Solvant
aqueuse ou organique) :
- Chromatographie sur papier
- Chromatographie sur couche mince (CCM)
- Chromatographie sur colonne :
# Chromatographie basse pression (CLBP)
# Chromatographie haute pression (CLHP) ou (HPLC = high pressure liquide chromatography

• Chromatographie en phase gazeux (CPG) :

- Phase mobile Ca gaz (gaz inerte : helium, azote, argon,…)
- Phase stationnaire Ca solide (CGS)

- Phase stationnaire Ca liquide (CGL)

• Chromatographie avec des fluides à l`état supercritique (SFC) : phase mobile
Ca fluide à l`état supercritique.
Ex: CO2, NH3, b¤Cal,ay CO2/méthanol.

eKalkarN_ (principe) xus²Kñarbs; chromatographie :

- Chromatographie d’absorption
- Chromatographie de partage
- Chromatographie échangeuse d’ions
- Chromatographie d’exclusion-diffusion
- Chromatographie d’affinité

manrebobBIrEbbEdleKeRbIsMrab;Ejk Acides amines

- Chromatographie de partage

Ex : Chromatographie sur papier

19
 distance parcourue par le constituant
(rapport frontal) Rf =
distance parcourue par le solvant

- Chromatographie échangeuse d`ions

CarebóbvaytémønUvbrimaN (Evaluation quantitative) niglMdab;fñak;rbs; Acides aminés
GacmankMhsu (erreur) RbEhl + b¤ – 3%. bec©keTsEp¥kelIkarbegáItsm<nн ionique (liaison ionique)
rvagbnÞúk rbs;TRm (Résine synthétique de polystyrène) nigbnÞúkrbs; Acides aminés. eKeXIj man
Résine BIrEbb ³

- Les échangeurs de cations (Ex : Carboxyméthylcellulose) manTRmg; R-SO3- ou

R-COO- ( manbnÞúk Gvic¢man )
- Les échangeurs d’anion (Ex : Diéthylaminoéthylcellulose) manTRmg; ( manbnÞúk vic¢man )
CH3

CH3
N C2H5
HN
R CH3
R C2H5

niymny Résine échangeuse d’ ion : ]Ta> eQµaH DOWEX, AMBAFITE…Edlman degré de

réticulation (X2,X4,X12,X16,…) nig TMhMRKab ;l¥itKitCa mesh (50-100 mesh = 300 `a
150 microns de diameter; 300-400 mesh = 74-37 microns de diameter .
Ex: Dowes 50x2(50-100mesh)

20
Chromatographie sur résine échangeuse de cations
- dak;Hydrolysat protéique kµúg colonne kMBs;50cm
- eRbI 3 solutions tampons citrate de sodium enAsItNÐPaB 50ċ ryeBl 3h eK)an
acides aminés bnþbnþab; : AA.acides, AA.neutres nigcugeRkayeK AA.basiques

2.2.6.4- Méthode électrophorétique

eKeRbIsMrab;Ejk Acides aminés . eKalkarN_Ep¥kelIbnÞúkebs; Acides aminésAA rt;
(migrer) kñúgEdnGKÁÁIsnI (Champs électriques) eTAtam pH rbs;mCÄdæanEdlvaenA ³

- ebI pH < pHi AA manbnÞúk (+) Ca Cation rt;eTAkan; Cathode (pôle -)

- ebI pH > pHi AA manbnÞúk (-) Ca Anion rt;eTAkan; Anode (pôle +)

lTÞplEdl)an ³
- ebIeRbIGKÁIsnIexSayeK)an Acides aminés sßitenACaRkum² ³ Acides aminés acides, AA
basiques, AA neuters .
- ebIeRbIGKÁIsnIxøagM eK)an Acides aminés Ejkdac;ecjBIKñamYy²
ElectrophorèseRbRBwtþeTAelITRmrwg (Support solide) dUcCa ³ papier, acétate de cellulose,

gel d’agarose ou polyacrylamide.

21
2.3- LES PEPTIDES

2.3.1- Généralités
Molécules pSMeLIgBI Acides aminés tP¢ab;Kñaeday liaison peptidique (cMNgrvag COOH
enA C2rbs; Acide aminé mYyeTA NH2 enA C2rbs; Acide aminé mYyeTót)

eKEckCa ³
. Les oligopeptides
. Les polypeptides : man PM rhUtdl; 500 b¤ 10000 daltons eTAtamGñkniBn§ elIsBIenH eKehA
22
 protéine .
kartag nig karehAeQµaHbuibTIt (Représentation et dénomination d’un peptide) :
Alanyl - Cystéinyl - Glycocolle (Nom de chaque AA + YL elIkElg AAman COOH esrI)
CH3 H
 
2HN-CH-CO-NH-CH-CO-NH-CH-COOH

CH2

SH
Côté N-terminal côté C-terminal
eKsresrExS peptide BI AA N-terminal enAxageqVgeTA AA C-terminal enAxagsþaM .
2.3.2- Caractéristique de la liaison peptidique

2.3.2.1- Conformation
- C, C=O, N-H, C sßitenAelI Plan EtmYy
- C sßitenA kñúgTisedA Trans eRbóbeFóbeTAnwg C-N

- N-H minGac ioniser )an. C-N minGacvilCaesrI)an bu:Enþman Plan BIrGacvilCuMvij C.
Liaison peptidique : Possibilités de rotation autour de Cα
(Distance entre les atomes)

Rbtikmµ[BN’ (Réaction colorée) :Réaction Biuret

2.3.2.2-

Peptide + SO4Cu en milieu alcalin BN’sVaydUc Biuret

NH2 NH2
O=C O=C
NH2 NH Biurée(diurée)
Urée O=C
NH2

23
2.3.3-karrkrcnasm<½n (Détermination de la structure)
KWrkcMnYn RbePT nig TItaMglMdab;fñak;BitR)akdrbs; Acides aminés EdlenAkñúgExS Peptide.
rebóbrkmaneRcIndMNak;kal :
2.3.3.1- karkat;pþac;cMNgbuibTIt (Rupture des liaisons peptidiques)
- Hydrolyse chimique :
. Hydrolyse acide : eKdak; Peptide nig HCl 6 N kñúgGMBUlpSarCitry³eBl 24 eTA
72em:ag .eK)an AA dac;ecjBIKñaTaMgGs; elIkElg Tryptophane EdlxUcnigGasuIt.
eKGaceRbI ³
. Hydrolyse alcaline :CamYy NaOH 4 N ry³eBl 4 eTA 8em:ag
- Hydrolyse enzymatique :
eRbIry³eBlyUr nigCaTUeTA minsBV ehIyGacxusedaysarman Autolyse rbs; enzyme
Caehtu naMeGaydac;; AA EdlCaFatupSMrbs; enzymexønÜ mkEdr. CaTUeTAeKeRbIsMrab;;
hydrolyse partielle des chaînes peptidiques.

2.3.3.2- karepÞógpÞat; nig karrkkMhab; AA (Identification et dosage des acides aminés)

- rebóbrkGasuItGamIeN N-terminaux :

* Méthodes chimiques :
. Méthode de Sanger : Rbtikr (Réactif) EdleRbI ³ 1 fluoro-2,4 dinitrobenzène (FDNB)

Frederick Sanger Production du réactif de Sanger par la méthode de H. B. Gottlieb

2HN-O-O-O-O----- + FDNB DNP-HN-O-O-O-O----Hydrolyse acide totale

DNP-AA (alpha dinitrophényl AA) Extraction à l’éther par chromatographie

24
sur papier et dosage spectrophotométrique (longeur d’onde  : 360 nm) .
Méthode de Sanger de détermination de l'acide aminé N-terminal :
A : fixation d'un résidu dinitrophényle sur l'acide aminé N-terminal
B : hydrolyse acide totale du polypeptide, libérant tous les acides aminés, dont l'acide aminé
N-terminal lié au résidu dinitrophényle.

. Méthode par récurence d’Edman : Rbtikr (Réactif) EdleRbI ³

Phénylisothiocyanate (PTC)

2HN-O-O-O-O---- + PTC PTC-HN-O-O-O---- cyclisation

kat;pþac;eday hydrolyse PTH-AA (phénylthiohydantoine-AA) eFVI Identification et
dosage spectrophotométrique. ExSEdlenAsl;bnþeFVJIRbtikmµ Edman eLIgvijCabnþbnÞab;rhUt

Tal;EtGs; AA (principe séquenceur automatique).

. Méthode de Dansylation : Rbtikr (Réactif) EdleRbI ³ Chlorure de Dansyle sarFatu
Edl)anCa dérivée sulfonamide (fluorescence UV) EdlGac Identifier eday Chromatographie
sur couche mince de gel de silice. Méthode enH SensibleCag Méthode de Sanger 100 dg.

. Action de la fluorescamine en milieu alcalin : eGayCasarFatuu Fluorescence (Réaction très

sensible et très rapide).
25
 * Méthode enzymatique :
eRbI Enzyme eQµaH Exoaminopeptidase (aminopeptidase) edIm,Ikat;pþac;; Acide aminé
N-terminale.

- rebóbrkGasuItGamIeN C-terminal :
* Méthode chimique : Réaction d'Akabar

eRbI Hydrazine (2HN-NH2) kat;pþac;RKb;smÁn§½ Peptide )anCa Hydrazide enAsItuNðPaB 100 ċ

elIkElg AA C-terminal dEdlRtUv libéré, isolé et identifié.
* Méthode enzymatique :
eRbI Enzyme eQµaH Carboxypeptidase A, B et Prolidase Ca exopeptidase kat;pþac;; Acide
aminé C-terminal.

2.3.4- karkat;pþac;xagkñúgExS Peptide (fragmentation des peptides intra-chaîne)

2.3.4.1- Méthode chimique

- Bromure cyanogène (CNBr) kat;pþac;cMNg peptide Rtg; COOH rbs; Met EdlenAkñúgExS
.
Peptide

- karkat;pþac; Ponts disulfure tamkareFVI oxydation ou réduction

---O-O-Cys-O-O--- Oxydation (acide performique HO-COOH) ---Cys---- + ---Cys---

S SO3H SO3H
S OU
---O-O-Cys-O-O--- Réduction (ß mercaptoéthanol (HS-CH2-CH2OH) --Cys-- +--Cys--
SH SH

26
 2.3.4.2- Méthode enzymatique
- Enzyme EdleRbIeQµaH ³ Endopeptidase
Carboxypeptidases :
- A:kat;pþac;RKb; AA C-terminalelIkElg Arg, Lys, Pro
- B: kat;pþac; AA C-terminalEdlCa Lys et Arg

Exopeptidases: Prolidase: kat;pþac; AA C-terminal EdlCa Pro

Aminopeptidases : kat;pþac;RKb; AA N-terminal

elIkElg Pro RtUveRbI Prolinase

Enzyme protéolytique
Trypsine pancréatique :kat;pþac;Rtg; COOH rbs;
Lys ou Argminkat;eTkalNaAAxagsþaMCa Pro(milieu alcalin)

Endopeptidase: Chymotrepsine pancréatique : kat;pþac;Rtg; COOH

rbs; Phe, Tyr, Trp kat;exSayeTAelI Leu, Met, Asn,

Glu elIkElg AA xagsþaMCa Pro

Pepsine: kat;pþac;Rtg; NH2rbs; Tyr, Phe, Trp,Leu,Glu

Papaine :ykecjBIC½rlðúgkat;pþac;RKb; peptideCakg;xøI²

Exemple :

2.3.5- Peptides sMxan;²EdlmanplRbeyaCn_kñúgCIv³viTüa

27
 2.3.5.1- Oligopeptides
- La carnosine : Ca Dipeptide (ß-alanyl-histidine) CaFatupSMrbs;sac;duM. muxgar ³
Neuromédiateur dans les phosphorylations.

ßAla
O O
H
H2N CH2 CH2 C NH C C OH

CH2

(liaison pseudo-peptidique) NH His

- Glutathion : Ca tripeptide (glutamyl-cystéinyl-glycocolle)

muxgar (Rôles) :
- CYyeGaymanlMngw pH kñúg cytoplasme rbs;ekasika
- CYyeGaymanlMngw Fe++ kñúg Hémoglobine
- CYyeGayPñasrbs;QamRkhmrwgmaMeRBaHkgVH glutathion naMeGayEbkRKab;Qam Rkhm
(anémie hémolytique).

2.3.5.2- Polypeptides hormonaux

-Peptide post-hypophysaire
- La vasopressine ou antidiurétique hormone (ADH) :
S--------------------------S
.Ca Nonapeptide H2N-Gly-Arg-Pro-Cys-Asp-Glu-Phe-Tyr-Cys-COOH
28
 . Ca Hormones post-hypophysaire
man Action hypertensive et effet antidiurétique
- L’oxytocine :
S-------------------------S
.Ca Nonapeptide H2N-Gly-Leu-Pro-Cys-Asp-Glu-Ile-Tyr-Cys-COOH
.Ca Hormones post-hypophysaire

GMeBI ³ Contraction utérine et sécrétion du lait

- Peptides anté-hypophysaires :

. L’ACTH (hormone adrénocorticotrope ou corticotrophine) : 39 AA et Tm¶g;mUelKul

( PMpoids moléculaire) =4500daltons.
ACTH pSMeLIgBI 39 acides aminés, Et 24 AA mdMbUgminERbRbYleTBI espèces mYyeTA espèce mYy.
vamantYnaTIrMejac cortex surrénal [ GMeBIenHTak;TgeTAnwg AA TI1 dl; TI20 xag N-terminal
( TItaMgskmµ ) ]edIm,IeGayplit cortisol (glucocorticoide) et aldostérone (minéralocorticoide)
NH2-Ser-Tyr-Ser-Met-Glu-His-Phe-Arg-Try-Gly-Lys-Pro-Val-Gly-Lys-Lys-Arg-Arg-Pro-Val-
Lys-Val-Tyr-Pro-Asp-Ala-Gly-Glu-Asp-Glu-Ser-Ala-Glu-Ala-Phe-Pro-Leu-Glu-Phe-COOH
. L’ MSH melanocyte-stimulating hormones ou hormone de stimulation des
mélanocytes : man 13 AA dUc ACTH
Acétyl-Ser-Tyr-Ser-Met-Glu-His-Phe-Arg-Trp-Gly-Lys-Pro-Val
GMeBI ³ mobilisation des graisses et rMejat mélanocytes.

2.3.5.3- Peptides pancréatiques

- L’insuline : pliteday Cellule ß des ilôts de Langerhans du pancréas )an préproinsuline
bnÞab;mkkat;pþac ;séquence signale ecj)an Proinsuline.eRkamGMeBIrrbs; Peptidase kat;pþac;
Peptide C ecj)an Insuline active. Insuline Ca polypeptide pSMeLIgBI2ExS Peptides :

A (21 AA,1 pont disulfure) et B (30 AA) tP¢ab;ExS A eday 2 ponts disulfures. Insuline Kµan

Trp et Met enAkñúg molécule

muxgar ³ Hormone hypoglycémiante

- sMrYlkarnaM glucose eTAeGayekasikaeRbIR)as;CaBiesssac ;dMu nig Calika adipeux

29
- bnßykarsMeyaK Secondes messagers (AMPc et Ca++) CaehtunaMeGaymankaeERbRbYl métabolisme
kñúgekasika ³
* Néoglucogenèse

* Glycogénolyse

* Lipolyse

* Glycogénogénèse

* Lipogenèse

- Le glucagon :
pliteday Cellule  des îlots de Langerhans du pancréas pSMeLIgBI 29 AA.
Ca Hormone hyperglycémiante (Antagonisme de l’Insuline).vaeFVIeGaymankaeERbRbYl
ú BI insuline³
métabolisme kñúgekasika pÞy
Hormone Edlføwg glycémie :
- begáIn glycémie : glucagon, cortisol, ACTH, …..
- bnßy glycémie : insuline

2.3.5.4- Hormones peptidiques epSgeTót

- La thyrocalcitonine (Calcitonine : CT) :
. Ca Hormone thyroidienne pSMeLIgBI 32 AA
. Ca Hormone hypocalcémiante

- La parathormone (PTH) :
. Ca Hormone parathyroidienne pSMeLIgBI 78 AA
. Ca Hormone hypercalcémiante et hypophosphorémiante
Hormone Edlføwg Calcémie et phosphorémie
-Calcitriol ou 1,25-diOHD3 : hypercalcémiante
- parathormone (PTH) : hypercalcémiante et hypophosphorémiante
- thyrocalcitonine (Calcitonine : CT) : hypocalcémiante
- Les angiotensines :
. Angiotensine I : pSMeLIgBI 10 AA (inactif)
H2N-Asp-Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe-His-Leu-COOH
. Angiotensine II : pSMeLIgBI 8 AA (actif) manGMeBIeTAelI ³
H2N-Asp-Arg-Val-Tyr-Ile-His-Pro-Phe-COOH
- Muscles lisses: eFVIeGayman vasoconstriction dUcenHnaMeGayman hypertension artérille
- Corticosurrénales begánI karsMeyaK Aldostérone (hormone assurant la rétention du Na+ et
30
 l’excrétion du K+), catécholamine
- Cœur : effet inotrope positif direct (bradycardie)
-Cerveau : begáInkarERskTwk (soif), appétit de sel
- bradykinine (ជាពួរ kinines ), nonapeptide: Arg - Pro - Pro - Gly - Phe - Ser - Pro - Phe –

Arg. Ca peptides hypotenseurs et vasodilatateurs

. Kallicréine : enzyme protéolytique
Système rénine-angiotensine Système Kallicréine-kinine

Angiotensinogène (substrat) (Synthèse par le f oie) Kininogène (substrat)

Pré-rénine (Synthèse par le rein ..) Pré-kallicréine

Rénine Inhibiteur ex: H-142.. K allicréine

Angiotensine I (10AA, inactif) Inhibiteur ex:Captopril, Enalapril.. Bradykinine (actif )
Enzyme de conversion( EC)

Antagonisme ex:salarasine Heptapeptide (inactif )

Angiotensine II (8AA,actif )
Angiotensinase (peptidase)
Peptide inactif
Peptide inactif

Hormone Edlføwg tension artérielle (TA)

- begáIn TA : angiotensine II, vasopressine(ou ADH)…..
- bnßy TA : Bradykinine….

2.3.5.5- Les peptides antibiotiques

)anmkBIkarbNþúHBYk)ak;etrI. CaBYk D-amino-acide EdlmanGMeBICa Bactéricide dUcCa ³
La tyrocidine A, les gramicidines, les penicillines (rkeXIjeday Fleming ), les
actinomycines, les bacitracines, les polymixines,…

2.3.5.6- Les peptides toxiques

eKeXIjmanenAkñúgpSitBYk peptides toxiques EdlGacBulrhUtdl;søab; ³ la phalloidine et les
amanitines de l’amanite phalloide.

2.4- LES PROTEINES

Ca macromolécules pSMeLIgBI AA cgP©ab;KñaedaysmÁn§½ peptidique
2.4.1-rcnasmÁn§½ (Structure)

Protéine manrcnasmÁn§½enAkñúglMh (configuration) BitR)akdrbs;va. Configuration enHefrEtman

karERbRbYledaysItuNðPaB nig pH biologique. eKEckCarcnasmÁn§½ protéine Ca ³

31
 2.4.1.1- Structure primaire :bB¢aak;BIExS AA EdlmanlMdab;c,as;las;TaMgRbePT
nigelxerogrbs ;vaEdlcgP¢ab;Kñaeday smÁn§½ peptide.
R1 H O R3 H

CH N C CH N
N C CH N C CH

H O R2 H O R4

kñúg Structure primaire eKeXIjmansmÁn§½ ³

- Liaison peptidique : -CO-NH-
- Liaison disulfure : -S-S-
karrk AA enAkñúg Structure primaire RbRBwtþeTAdUcenAkñúg peptide Edr .
sarsMxan;rbs; Structure primaire KW ³ kalNamankarbþÚr AA NamYykñúgExS peptide naM
eGaymanplvi)ak.
Ex :FmµtakñúgExS ß TaMgBIrrbs; Hémoglobine, AA TI6 Ca Glu EtRtUvCMnYseday Val

dUcenHkñúgcMeNam 574 AA man2 EdlxusCaehtunaMeGaymanCMgW Drépanocytose

(Hémoglobine anormale).

2.4.1.2- Structure secondaire

CaTRmg;rbs;ExS peptide (configuration spatiale)enAkñúglMhmanBIrEbbKW ³
- Type  (Hélice ) : 1 spire = 5,4 Ao = 3,6 AA  5 spires = 18 AA liaison hydrogène rvag -
C=O et –N-H EdleFVIeGay Hélice  stable. Hélice  sMbUrenAkñúg protéine globulaire.
- Type  (le feuillet plissé ou conformation ) : manBIrEbb ³

. Parallèle : ExSTaMgBIrmanTisedAEtmYy.

. Antiparallèle : ExSTaMgBIrmanTisedApÞúyKña. sMbUrenAkñúg protéine fibrillaire (fibroine du soie) .

Structure secondaire mancMNg ³

. Liaison peptidique
. Liaison disulfure
. Liaison faible (liaison hydrogène entre CO et NH)

32
2.4.1.3- Structure tertiaire : bB¢aak ;BI conformation globale dans l’espace (arrangement
dans l’espace) .kñúgenaH eKeXIjman ³
- Liaison peptidique
- Liaison disulfure
- Liaisons faibles( sm<½n§exSay) :
. Liaisons électrovalentes rvag acides et bases rbs;ExSlatén AA EdlenAEk,rKña.
. Liaison hydrophobe type Van der Walls rvag résidusVal, Ala, Ile, Leu.

. Liaison hydrogène : acide-alcool ou phénol-imidazol rvag 2 Phe, rvag 2

liaisons peptidiques EdlenAEk,rKña.

sar³sMxan;KW ³
- Activités biologiques des protéines Tak;TgeTAnwg structure III
- Structure II et III xUceKfa protéine enaH ERbePT (dénaturée) eKeXIjman ³
. Dénaturation réversible : naMeGaymankar)at;bg;skmµPaBCIvviTüarbs; protéinemYyry³.
. Dénaturation irréversible : naMeGayman kar)at;bg;TaMgRsugskmµPaBCIvviTüarbs; protéine.

33
Agents dénaturants ( Pñak;garERbePT) :
Pñak;garrUb (Agents physiques) Pñak;garKImI (Agents chimiques)
. La chaleur( kMedA) . GasuItxøaMg nig )as

. kaMrsµIUV et ionisants . GMbilelahF¶n;

34
 . bMErbMrYl pH .sUluysüúg urée et de guanidine
. FaturMlaysrIr³

. sarFatuEdlkat;(détergents)
1ExS peptideGacmanrcnasmÁn§½kñúglMhRtwmEtfñak ;TI3. eRcInExS peptidecUleTAkñúg structure quaternaire
2.4.1.4- Structure quaternaire : Protéine PaKeRcInpSMeLIgBIeRcIn Sous-unités dUcenH
Structure IV CaTRmg;én association des sous- unités (arrangement spatiale des sous-unités).
Sous-unités = Protomère   protomère = Oligomère = Protéine
Ex : - Hémoglobine pSMeLIgBI 4 sous-unités (2 et 2)
- Glutamate déshydrogénase pSMeLIgBI 6 sous-unités
- Lacticodéshydrogénase (LDH) pSMeLIgBI 4 sous-unités
- eRsamrbs; Virus de la mosaique de tabac pSMeLIgBI 2130 sous-unités.

* Remarque :
edIm,IrkcMnYn nigTm¶n;rbs; sous-unités eKeRbI méthode électrophorèse en gel-SDS
(dodécylsulfate de sodium : SDS).

- elÇÓnénkarrត់ (Vitesse de migration) Tak;TgeTAnwg masse rbs; sous-unités

- SDS pþac;Etsm<½n§exSay (liaison ionique, liaison hydrogène, liaison hydrophobe)

35
 Etminkat; sm<n½ (ponts) disulfures eT.
- bnÞab;mkkarrkGasuItGamIeN dUckarrkenAkñg
ú Peptide Edr.
2.4.2- lkçN³rUb (Propriétés physiques des protéines)
2.4.2.1- karrlay (Solubilité)

- kñúgTwk ³ protéines tUc²PaKeRcInmanbNþúM Polaire eRcIndUcenHrlay. Protéines epSgeTót

karrlayTak;TgeTAnwg ³
-TwkGMbil nig kmøaMgGuIy:ug

Force ionique  Soluble rlay

Force ionique  kkrprécipitation (Relargage des protéines)

Ex : karEjk Albumine-globine eday Sulfate d’ammonium

- pH :
pH = pHi  solubilité minimum ( TMenabegáItCa Agrégrats)
-រនុងធាតុរ ំលាយសរ ីរៈ(Dans les solvants organiques) :

Ethanol ou acétone + Protéine krkr (précipité) nigERbePT

(dénaturation du protéine) enAsItuNPð aBFmµta. enAsItuNðPaB 0 ċ b¤ 4 ċ eKeXIjmaneLIgkkrEt Gt;ERbePTeT
rebóbenHeKeRbIsMrab;EjkRbUetGuInenAkñúgQam.
- Détergents xøHbegááInkarrlayrbs;RbUetGuIn.
Ex : désoxycholate de sodium, le triton…..

2.4.2.2- Le caractère amphotère

Double ionisation des protéines Tak;TgeTAnwg ³
-COOH et - NH2 terminaux

Liaisons faibles
a-Electrovalence entre bases (Arg, Lys, His) et acides (Glu et Asp).
b-Liaison hydrphobe entre Leu, Ile, Val, Ala.
c-Liaison hydrophobe entre Phe.
d-Liaison hydrogène entre deux liaisons peptidiques.
e-Liaison hydrogène entre acide et alcool (Ser).
f-Liaison hydrogène entre phénol (Tyr) et imidazol (His)

36
Représentation schématique de la structure primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire d’une
protéine.

Interaction entre des résidus acides aminés d’une chaîne polypeptidique :

1- Interaction électrostatique
2- Liaison hydrogène
3- Interaction hydrophobe
4- Liaison disulfure

37
 Structure primaire de l’insuline

BIGMbUmYyeTAGMbUmYy xusKñaEtGasIutGamIeNTI 8, 9 nigTI 10 enAExS A dUcCaRCUKman Ala, Gly, Val

RtI)aELnman Ala, Ser, Thr mnusSman Thr, Ser, Ile esHman Thr, Gly, Ile
- bNþMGIuyugEdkmanenAExSlatrbs;GasIutGamuIeN :
. COOH d’Asp, Glu . -SH de Cys
. NH2 de Lys . –OH (phénol) de Tyr
. Imidazol de His . -OH de Ser etThr
. Guanidine de Arg
bnÞúksrubrbs; Protéine pøas;bþÚreTAtam pH
Ex : Protéinogramme sérique sur acétate de cellulose en tampon véronal à pH 8,
.
(Electrophorèse du protéine sérique)

eKeXIjman 5 bandes EdlsmRsbeTAnwg 5 groupes de protéines sériques :

- La sérumalbumine : sMbUrCageKehIyrt;elOnCageKenA pH=8,6 (la plus acide des protéines

sériques) .
38
 - Les globulines : man 1 , 2,  et  eKcMNat;fñak;eTAtamel,Ónénkarrt;ekIneLIg.
2.4.3-lkçN³KImI (Propriétés chimiques)
dUcenAkñúg AAEdr Protéines GacmanRbtikmµCamYy Acéthyle, dinitrobengène, méthyle…
2.4.4-lkçN³CIvviTüa (Propriétés biologiques)
2.4.4.1- lkçN³Ca antigène: Protéines xøHmanlkçN³Ca Antigènes. enAeBlEdl Antigènes
cUleTAkñúgsarBagÁkayeKeXIjmanekIt protéines spécifiques sMrab;Tb;Tl; Antigènes ehA Anticorps (ou
immunoglobuline). Antigènes et anticorpsGacP¢ab;Kña)anedaymankareRCIs

erIsédKUc,as;las; nigCa Biess naMeGaymankarbnßyPaBBul (toxique) rbs; Antigènes (Réactions

immunologiques). Anticorps mYymankEnøgP¢ab; Antigènes (Site de fixation) ya:gticBIr. Antigènes et

anticorps cg P¢ab;KñaedaycMNgexSay (liaisons faibles) CaTUeTAcMNg Hydrogène. Rbtikmµ Antigène-

anticorps (Réaction antigène-anticorps) EdlminmanbgáCakkr KWCaRbtikmµeTAmk. Techniques immuno-

chimiques CaeRcIneRbIRbtikmµ Antigène-anticorps.

Ex : - kareFVIetsrkPaBsuT§rbs;RbUetGun I.
- karepÞógpÞat; nigrkkMhab;rbs;RbUetGunI enAkñúgQam.

2.4.4.2- skmµPaBBiessenAkñúgCIvviTüarbs; RbUetGIun ³ Enzymes TaMgGs;CaRbUetGuInEdlman

tYnaTICakatalIkr. RbUetGIunxøHeTótCa Hormones, Toxines, Antibiotiques…
2.4.5- cMNat;fñak;RbUetGIun (Classification des protéines)
2.4.5.1- Protéines simples (Holoprotéines)

* Holoprotéines globulaires solubles :

- Protamines : man AA basiques eRcIn (pHi = 10 à 12)
Protamine + Insuline + Zn = Insuline retard
- Histones :sMbUr AA basiques (pHi = 10)
Protamines et histones manenAkñúg noyau (Nucléoprotéines)

- Prolamines : rlaykñúg Ethanol 70% sMbUr Glu, Gln, Pro, Asn,man Lys tic
Ex : Gliadine du blé
- Glutélines : sMbUr Glu, Arg, Pro, Ex : Gluténines du blé
- Albumine :
. Ovalbumine : Protéine manenAkñúgs‘tu

39
. Lactalbumine : ProtéinemanenAkñúgTwkedaH
. Sérumalbumines : Protéine manenAkñúg Sérum manRbEhl 60% des protéines sériques

(PM = 68000). CaRbUetGIunEdlmanclnaxøaMgkñúg Electrophorèse. CaRbUetGIunTTYlbnÞúkFana

sma<F osmotique rbs;esrUm nigmanmuxgardwknaM Acides gras, »sf enAkñúg esrUm (Sérum).
Protéines TaMgGs;enHman pHi 5 rlaykñúgTwk nigTwkGMbilrav. eLIgkkr b¤ RkamCamYyl,ay

Sulfate d’ammonium Eq¥t. Coaguler edaykMedA .

- Globulines :
. Ovoglobuline : Protéine manenAkñúgs‘ut
. Lactoglobuline : Protéine manenAkñúgTwkedaH

. Sérumglobuline : Protéine manenAkñg ú Sérum.

RbUetGIunTaMgenHmanTMhMFMCag Albumine (PM  150000) rlaykñúgTwk (elIkElgBYk Euglobulines
minrlay) nigTwkGMbilrav. vaeLIgkkrCamYy Sulfate d’ammonium à 50% de saturation.
Globulines manRbEhl 40% kñúgcMeNam protéines enAkñúg Sérum.

eKdak;cMNat;fñak;eTA tam clnakñúgkareFVI électrophorèse enA pH=8,6 (,  et  Globulines).

vaGacCa hétéroprotéines kalNavaP¢ab;eTAnwg sá (Sucre) ehA Glycoprotéine (,  et 
globulines) P¢ab;eTA lipides ehA lipoprotéines (Chylomicron, VLDL, IDL, LDL et HDL).

GlobulinesmanmuxgarsMxan; ³

- dwknaMBYk Lipides, Hormones elah³

- Ca Anticorps (gamma-globulines)
- Ca Hormones protéiques et enzymes
- Ca Facteurs de coagulation
- Ca Isoagglutinine EdlCa Agglutinine sMrab;bBa¢ak;Rkumrbs;QamEdldUcKña.
* Holoprotéines fibrillaires solubles :

mUlRTEvg (forme ellipsoide allongée) (PM= 340000, beNþay=460 Aº) 40%

- Le fibrinogène :

én molécule manrUbPaBCa hélice. vapSMeLIgBI 6 sous unités dUcKñaBIr² (,  et ) structure

manlMngw edayman 28 ponts disulfures.

40
 FIBRINOGENE Prothrombine Facteurs :
Thromboblastine plaquettaires
Ca++ tissulaires
Thrombine plasmatiques

Fibrine S (soluble)

Transamidase
Fibrine I (insoluble) CYyeGayQamkk
- Protéines musculaires :

Myofibrille : CaEpñkkRnþak;rbs;sac;duMpSMeLIgBI filaments épais et filaments fins.

* Filaments épais : pSMeLIgBI ³

- La myosine : Ca protéineEvgxøaMg (PM=460000)pSMeLIgBI ³

. 2 grandes subunités (PM=200000) ³ Subunité nimYy²mank,al (tête globulaire) mYynig

knÞúyEvgvijcUlKñaEdlmanrUbPaBCa Hélice alpha. (longueur=1340 Aº) b¤ehA Chaîne lourde.

. 2 à 4 petites subunités (PM=16500-20000) mank,al (tête globulaire) Edlman diamètre

RbEhl 90 Aº b¤ehA Chaîne légère.

Trypsine pancréatique kac;pþac; Myosine (grande subunité)CaBIr Méromyosines H et L.

Myosineman Activité enzymatique atépasique.

skmµPaBrbs; ATPRbRBwtþenAnwg tête globulaire

. Actine : Ca ProtéineEdlmanBIrrUbPaB ³
* Forme G (globulaire): PM = 42000
* Forme F (fibfilaire) :

41
 karkRnþak;rbs;sac;dKuM WCaplitplén glissement des filaments fins le long des filaments épais qui
provoque un racourcissement de la myofibrilleedayman ATP, Ca++ et Mg++ cUlrYm.

* Holoprotéines fibrillaires insolubles :

Ca protéine de structure des tissus. minrlaykñúgTwkrlayticb¤ minrlaykñúgTwkGMbil.
]TahrN_ ³
- La collagène : CaFatupSMrbs;Calika conjonctif sMbUrCageKenA Peau, cartilage, ligaments,

tendons, parois vasculaires, os, dents (dégrader par collagènage). CaTUeTAsMbUrBYk

Gly, Ala, Pro, OHPro, OHLys enAkñúg Structure.

- Elastine : sMbUrenAkñúg tissus conjonctif Edr (aorte, poumon et peau)

. AA principaux : Gly, Ala, Pro
. Dégrader par élastase
- Kératine : CaFatupSMrbs; cellules épithélium de revêtement. eKeXIjman ³
. Kératine molle au niveau de la peau (structure de type alpha)
. Kératine dûre : cheveux, poil, ongle (structure de type  et )
- Fibroine de soie :
. Structure de type 
. AA principaux : Gly, Ala et Pro Kµan Cys
2.4.5.2- Hétéroprotéines (Protéines conjuguées) :protéine + non protéine
eKcMNat;fñak;tam groupements prosthétiques(bNþMbinEmnRbUetGIun) eKeXIjman ³
- Phosphoprotéines : CaBYkRbUetGIunEdlman H3PO4 enAkñúg molécule (H3PO4 GacP¢ab;Ca mYy

OH rbs; Ser ou Thr) Ex : caséine (,  et ) du lait. La vitelline et la vitellénine

enABN’elÓgrbs;s‘ut
Protéine + ATP Protéine kinase (PK) Protéine phosphorylée + ADP

Enzyme eQµaH Protéine kinase xøHmanskmµPaBTal;Etman AMP cyclique CaGñkCYy.

Enzyme PK xøHeTótmanBIrrUbPaB ³ Phosphorylée et non Phosphorylée ehIyCaTUeTAman

rUbPaBmYyskmµ mYyeTótGskmµ.
42
-Les chromoprotéines (hétéroprotéines colorées) :
Ex. : . Hémoglobine (Hb) : Ca pigment respiratoire du globule rouge. mnusSFmµtaman
Hémoglobine 3 Ebb ³
- Hémoglobine rbs;mnusSeBjv½yFmµta HbA = 2 et 2ß
- mnusSeBjv½yFmµtak¾GacmanmYycMnYntUcnUv HbA2 = 2 et 2δ
- ekµgmunekIt nig eRkayeBlekItbnþicman HbF = 2 et 2γ
Hémoglobine rbs;mnusSpSMeLIgBI 4 ExS Peptides dUcKñaBIr². kñúgExS Peptide nimYy²man

1mU:elKul Hème.
Hémoglobine mantYnaTIdk w naM O2, CO2 et H+

43
 Structure la chaîne ß de l’hémoglobine
- Lipoprotéines : (lipide + protéine)
eKeXIjman ³
* Lipoprotéines CaFatupSMrbs; membranes cellulaires, mitochondrie, Reticulum
endoplasmique .
* Lipoprotéines EdlenAkñúgQam ³ eKcMNat;fñak;eTAtam maDfycuH nig densité ekIneLIg.
eKeXIjman ³
-Chylomicrons :
/CamUlelKulFMCageKekIteLIgeRkayhUbcMNIGaharenAkúñgeBaHevón ( cellules
épithéliales intestinales ) ehIyGtßiPaB ry³eBlxäI .
/CaGñkdWknaMxäaj;Edl)anmkBIcMNIGahar( triglycérides exogènes )
/FatupSMrbs;vasMbUr triglycéride CageK .
-VLDL(very low density lipoprotein ): lipoprotéine de très faibles
densité ou pré-β lipoprotéines

.sMeyaKenAefäIm CaGñknMaxäaj;EdlsMeyaKxagkñúgxäÜn ( triglycérides endogènes )

eTAkan;CalikaEdlRtUvkareRbIR)as; nig Calika Adipeux
.FatupSMrbs;vak_sMbUr triglycéride
-LDL( low density lipoprotein ) : lipoprotéine de faible densité ou
β lipoprotéines

.CaGñkdWknMa cholestéol et ester du cholestéroleTAkan; CalikaEdlenACMuvij

-HDL (high density lipoprotein ) : lipoprotéine de haute densité ou
α lipoprotéines
FatupSMrbs ;va 50% Ca protéine(apoprotéines).CaGñkdWknMa cholestérol nig phospholipides
- Glycoprotéines : (glucide + protéine)

eKeXIjman ³
- Glycoprotéines plasmatiques : eKcMNat;fñak;eTAtamel,Ónénkarrt;enAkñúg Electrophorèse :
.
α1, α2 et β glycoprotéines

*CaFatupSMrbs;sarFatumYycMnYnEdlmanplRbeyaCn_kñúgCIvviTüadUcCa ³
- Hormones anté-hypophysaires :
. La FSH (follicule stimulating hormone)
. La LH (luteinizing hormone)
. La TSH (thyroid stimulating hormone)

- Le facteur intrinsèque
- Les facteurs des groupes sanguins
- Les glycoprotéines des membranes plasmiques
- L’haptoglobine
44
 Fonction biologique de la parathormone(PTH)
Ca ++
Intestin pas d'action
la résorption ostéoclastique
PTH Os
le rejet du Ca par le système des ostéocytes
la réabsorption du calcium
Rein
la réabsorption des phosphates
Fonction biologique de la calcitonine(CT)
Ca
extracellulaire Intestin pas d'action
la résorption ostéoclastique
CT Os
le rejet du Ca par le système des ostéocytes
la réabsorption du calcium
Rein
la réabsorption des phosphates
Fonction biologique du calcitriol(ou1,25-diOHD3)
absorption du calcium
Intestin
absorption des phosphates
Calcitriol la résorption ostéoclastique de l'os ancien
Os
minéralisation du tissu ostéoide

Rein

FIN

45
 III. ENZYMES
ENZYME
-Protéine
Protéine -Catalyseur Protéine + non protéine
(Apoenzyme) (Coenzyme)
NH2 COOH

Site actif -le site de liaison/f ixation/reconnaissance( site de régulation) Site actif
-site catalytique
Cofacteur métaux :Mg,Co,Cu,Zn, Fe,Mo, Mn..
ou Coenzyme Organique : les vitamines ( coenzyme)
Composés tétrapyrolique
3.1- lkçN³TUeTA
3.1.1- niymn½y ³ Enzyme KWCaRbUetGIunEdlmanma:s;m:Ulx<s; (masse moléculaire élevée)

xUcnwgkemþA (thermolabile) CaCIvkatalIkredayELk (biocatalyseur spécifique) rbs;RbtikmµKImI én

métabolismeEdlekItmaneLIgkñg ú Pav³rs. katalIkenHGac ³
. dMeNIrkar)annUvkMhab;exSay

. begáInel,ÓnRbtikmµ (10 - 10 dg)EtKµankarERbRbYllT§plbB©ab; (minERbRbYl Constante

8 11

d’équilibre rbs;Rbtikmµ)

. ekIteLIgvijdEdleBlcb;Rbtikmµ minERbRbYlRbePT (nature) lMnwg (équilibre), bilan

thermodynamique rbs;RbtikmµKImI

Enzyme
Substrat Produit

3.1.2- skmµPaBrbs; Enzymes (activité enzymatique)

Quantité transformée (mol.produit S-1}

Sans enzyme
cMnYnbMElgedayKµanGg;sIum
Quantité transformée en présence d’enzyme
cMnYnbMElgedaymanGg;sIum 1catal (cat)
cMnYnGg;sIumEdlbegáIn
Activité enzymatique (mol.S-1 =cat) karbMElg)an 1mol.S-1
skmµPaBrbs;Gg;sIum

46
 3.1.3- Spécification (PaBedayELk)
PaBedayELkman2Ebb ³
3.1.3.1- PaBedayELkCamYynwgFatubgá (Spécificité vis-à-vis du substrat) : Enzyme

mYymanGMeBIEtelIFatubgámYy b¤ RKYsarénFatubgáenHEdlmanecnasm<n½ §dUcKñaEmnETn.

Ex : Arginase kat; Arginine Ca Ornithine nig Urée. Uréase bMElg Urée Ca Carbonate

d’ammonium. BYk Lipases eFVIGIuRdatkmµBYk Triglycérides. BYk esterases eFVIGIuRdatkmµBk

Y esters
mYycMnYnFM.
3.1.3.2- PaBedayELkCamYynwgRbtikmµ (Spécificité de la réaction ou d’action)
Enzyme mYymanGMeBIEteTAelIRbtikmµmYyEbb dUcCaRbtikmµ GIuRdatkmµ epÞrbNþMú méthyle…

3.2- namvlI nig karcMNat;fñak; (NOMENCLATURE ET CLASSIFICATION) :

3.2.1- Nomenclature
. eQµaH Fatubgá + Suffixe: ASE Ex : peptide  peptidase, oside  osidase…
. BYk enzymes protéolytiques xøHminGnuvtþtamk,ÜnxagelIeTrkSaeQµaHedImdEdl

] ³ pepsine, Chymotrepsine, trypsine,….

. edaysarGg;sIummaneRcIn eKeGayeQµaHtamRbB½n§ (nom systématique) EdlbB¢aak;BIeQµaH

Substrat nigEbbEpnRbtikmµKW eQµaH Fatubgá + EbbEpnRbtikmµ + suffixe : Ase.

] ³ glucose-6-phosphate déshydrogénase CakatalIkrkñúgRbtikmµ dk hydrogène ecjBI

glucose-6-phosphate. Isocitrate lyase. Pyruvate carboxylase….
kñúgkrNI Enzyme eRbI 2 substrats eQµaHrbs;va = eQµaH Fatubgá[ radical + eQµaH FatubgáTTYl
radical + eQµaH radical + EbbEpnRbtikmµ + suffixe ase.
Ex. : ATP-glucose phosphotransférase, UDP glucose-fructose glucosyltransférase,
Glutamate pyruvate aminotransférase…
. Enzymes xøHeTótrkSa eQµaHrYm (nom commun) kñúgkareRbI ]³ phosphatase alcaline,
hexokinase,…

.edIm,IgayRsYleKGaceRbIelxkUd (Numéro de code) ou la nomenclature officielle :

EC X1.X2.X3.X4.
X1 : type de réaction (groupe ou classe)
X2 : mécanisme d’action (sous-classe)
X3 : nature du molécule qui sert d’accepteur (sous-sous-classe)
X4 : numéro d’ordre
dUcenH Enzyme mYymaneQµaHrYm (nom commun)eQµaHtamRbB½n§ (nom systématique) nigelxkUd
(numéro de code).

47
 Ex : - Lactate déshydrogénase (nom commun)
- Lactate : NAD+ oxydoréductase (nom systématique)
- E.C.1.1.1.27 (numéro de code)

3.2.2- Classification
qñaM 1961 Union internationale de Biochimie )ancMNat;fñak;CapøÚvkarCa 6 Rkum (groupe ou classe)
tamEbbEpnRbtikmµEdlmanvaCakatalIkr. kñgú RkumnimYy² eKEckCaGnuRkum (sous-groupe ou
sous-classe) CaGnu-GnuRkum (sous-sous-groupe ou sous-sous-classe) nigelxlMdab; (numéro

d’ordre) .

edIm,IgayRsYleKtageGayGg;sIumnimYy² CaelxkUd (numéro de code) nigenABImuxman GkSr BIrtYKW

EC tageGay Enzyme Commission.

* elxTI1tageGayRkum ³ eKcMNat;fñak;RbtikmµTMagGs;Ca 6 Rkum ³

3.2.2.1-RkumTI1BYkGuksIudeU rdukkmµ (1 classe : les oxydoréductases) : CaBYkGg;sIumEdl

ère

CakatalIkrkñúgRbtikmµ GuksIudUerdukkmµEdlmantYnaTICaGñkepÞr Electrons, Protons b¤P¢ab;

Oxygène. Exemples des principales enzymes d’oxydoréduction :

- Déshydrogénase des fonctions alcool, carbonyl ou carboxyliques :

Ex : Alcool déshydrogénase, malate déshy, aldéhyde déshy, pyruvate déshy…

- Déshydogénase faisant apparaître des doubles liaisons : succinate déshy.

- Déshydogénase agissant sur les fonctions azotées :L-glutamate déshy.

- Enzyme participant au transfert d’électrons dans la mitochondrie : Succinate coenzyme G

réductase, Cytochrome c oxydase….

- Oxygénases : monooxygénase, dioxygénase.

3.2.2.2-RkumTI 2 BYkepÞr (2 classe: les transférases) : CaBYkGg;sIumEdlCakatalIkrkñúg

ème

Rbtikmµ epÞrBYk Radicaux b¤ bNþúMGatUmrbs;mU:elKulmYyeTAeGaymU:elKuleTót.

BYk Radicaux enHGacmankabUn1 b¤eRcIn (Ex. : méthyle, hydroxyméthyle, groupemen carbonné
comportant des fonctions aldéhydes ou cétone, groupe acyle, amine, phosphoryle etc…)

Ex. : Protéine-N-méthyl transférase EC2.1.1.23

La trancétolase EC2.1.1.1
Acyltransférase (transacylase), Créatine kinase, Glycogène synthétase, Glycérol kinase,
Hexokinase, Glucokinase .
Aspartate aminotransférase, Alanine aminotransférase…

3.2.2.3- RkumTI3 Hydrolases (3 ème

classe: les Hydrolases) : CaBYkGg;sIumEdlCakatalIkr
48
kñúgRbtikmµFøak;cuH (dégradation) manGMeBIkat;pþac; (clivage) mU:elKuledaymanTwkcUlrYm nigP¢ab;Fatu
pSMrbs;TwkeTAnwgmU:elKulEdlkat; (hydrolyse). eKEbgEckBYk Hydrolases Edkkat; BYk glucides
ehA Osidase BYk Esters phosphoriques ehA Phosphatase BYk Lipides ehA Lipase, etc…
Ex : Glucose 6 –phosphatase, Fructose 1,6 biphosphatase, triglycéride lipase, phospholipase
(A1, A2, C, D), les peptidase, les nucléosidases, ribonucléase…

3.2.2.4- RkumTI 4 Lyases (4 classe : les Lyases ou synthase) : CaBYkGg;sIumEdlCakata lIkr

ème

kñúgRbtikmµdk (enlever) bNþMúecjBImU:elKuledayKµaneFVItam Hydrolyse eTKWCaBYk Décarboxylases,

Déshydratases, Carboxylases,aldéhydes lyases, citrate synthase, fumarase ou fumarate
hydratase, énolase etc…

3.2.2.5- RkumTI 5 Isomérases (5 classe : les Isomérases) : CaBYkGg;sIumEdlCa katalIkr

ème

kñúgRbtikmµbMErbMrYlrcnasm<½n§kñúgmU:elKul EtKµanERbRbYlrUbmnþsrub (formule globale).

vaGacCaGg;suImEdlCYyeGaymankarpøas;bþÚr configuration rbs; Carbone asymétrique (Racéma-
ses, Epimérases) rMkil (déplacer) radical enAkñúgmU:elKul RbtikmµGuksIudUerdukkmµ kñúgm:UelKul

(oxydo-réduction intramoléculaire) ehA Dismutase.

Ex. : Ribulose 5P 3-épimérase , triose phosphate isomérase, phosphoglycérate mutase, métyl

malonylCoa, carboxymutase, glucoe 6-phosphate isomérase etc…
3.2.2.6- RkumTI 6 Ligases (6 classe : les Ligases ou synthétases) :
ème

CaBYkGg;sIumEdlCa katalIkr kñúgRbtikmµbegáItsm<n§½ C-C, C-O, C-S, C-N, O-P famBl

eRbIR)as;)anmkBI hydrolyse BYkcMNgsMbUrfamBl (liaison riche en énergie).
Ex. : pyruvate carboxylase, acétylCoA carboxylase, propionylCoA carboxylase,
acéthylCoA synthétase, glutamine synthétase…

* elxTI2 tageGayGnuRkum (sous classe) ³ bB¢aak;BIRbePTKImIrbs;bNþúMEdleGay .

] ³ kñúgRkum oxydoréductases manBYk Déshydrogénases EdlCakatalIkrkñúgkarepÞr
Hydrogène, oxygénases CakatalIkrkñúgkarepÞr Oxygène.

* elxTI3 tageGayGnu-GnuRkum (Sous-sous classe) ³ bB¢aak;BIRbePTKImIrbs;GñkTTYl

(accepteur).

*elxTI4 tageGayelxlMdab; (numéro d’ordre) ³ bB¢aak;BIelxerógrbs;va

Ex.: E.C.1.1.1.27 : oxydoréductase (classe) CakatalIkrkñúkarepÞr hydrgène edaymanGMeBI

49
 eTAelIbNMþú CHOH (sous classe 1) GñkTTYl hydrogène KW NAD (sous-sous classe1), enzyme
+

enHCa Lactate déshydrogénase EdlmanelxerógTI 27 kñúgGnu-GnuRkum.

3.3- rcnasm<n½ § (STRUCTURE)

Enzymes CaRbUetGIunmanlkçN³rUb KImIdUcBYk Macromolécules.

3.3.1- Enzymes mYycMnYnpSMeLIgBIRbUetGIunsuT§ dUcenHEpñkskmµrbs;vaehA Site actif KWCa BYk

Acides aminés mYycMnYntUcEdlenAkñúgrcnasm<½n§rbs;Gg;sIum.

. Enzymes xøHpSMeLIgBI 1ExS polypeptide CaBYk Enzyme monomérique EdlGacman rcnasm<n½ §

fñak;TI1 TI2 nig TI3 Ex. : chymotrypsine, trypsine, élastase, carboxypeptidase A, pepsine
(pSMeLIgBI 100eTA 300 GasIutGamIeN nigman PM= 1300-3500).

. Enzyme xøHeTótpSMeLIgBIeRcInExS polypeptide (sous-unités) CaBYk Enzyme oligomé-riques

Edlmanrcnasm<½n§ fñak;TI 4 Ex. : lactate déshydrogénase (LDH), tryptophane synthase,

pyruvate déshydrogénase, etc….

LDH pSMeLIgBI 4 sous-unités (tétramère). Sous-unité enHman 2EbbehA Cœur (A) et Muscle

(B). A nig B GacP¢ab;Kña)an 5 Ebb begáItCa Isozymes Tétramères (AAAA, AAAB, AABB,

ABBB et BBBB) Edlrt;xus²KñaenAkñúg Electrophorèse. AAAA (LDH5) rt;elÓnCageK

ehIymaneRcInenAkñgú ebHdUg BBBB (LDH1) rt;yWtCageKehIymaneRcInenAkñúg muscle squelettique

nigeføIm.
cathode (-)
………... origine
LDH1
\ LDH2
LDH3
LDH4
LDH5
Anode (+)

3.3.2- Enzyme mYycMnYnFMpSMeLIgBIRbUetGuInehA Apoenzyme nigbNþúMminEmnRbUetGIun

(groupement prosthétique) ehA Cofacteurs EdlCaEpñkskmµrbs; Enzyme.

50
3.3.2.1- Cofacteurs
CaGgÁFatuKImIEdlcaM)ac;RtUvcUlrYmkñúgRbtikmµEdlmanGg;sIumCakatalIkr (Réaction enzymatique) ³
- edIm,I dwknaMb¤bMeBjbEnßmFatubgá (Substrat)

51
52
 Biotine(vitamin B8 ou vitamin H)
Acide folique (folate ou vitamine B9)
Nicotinamide (vitamine PP ou vitamine B3ou niacine)
La vitamine B5 ou acide pantothénique
- edIm,ITTYlykplitpl (produit)
- CaGñkcUlrYmkñúgrcnasm<½n§rbs;Gg;sIum Cofacteurs GacCasarFatusrIr³ehA Coenzyme b¤
minEmnCasarFatusrIr³dUcCaGIuyu:gelah³ (Ca , Mg , Mn ,…) .
2+ 2+ 2+

53
Enzymes comportant un coenzyme métallique ( cofacteur métallique)
Alcool déshydrogénase, anhydrase carbonique ................................................Zn
Arginase, aminopeptidase.................................................................................Mn
Dipeptidase.......................................................................................................Co
Phosphatase , phosphokinase............................................................................Mg
Thyrosine hydroxylase.....................................................................................Cu
Succinodéshydrgénase......................................................................................Fe
Xanthine oxydase............................................................................................Mo
Groupement prosthétique + Apoenzyme = Holoenzyme

3.3.2.2- Site actif de l’enzyme

Enzyme
Substrat A Produit B RbtikmµenHdMeNIrkarkñúgEpñkmYyskmµrbs;
enzyme ehA site actif.
- Site actif KWCasMNuMGasItu GamIeNmYycMnYntUcenAkúñúgrcnasm<½n§rbs;Gg;sIumEdlmanGMeBICa
mYyFatubgá. eKGacEbgEckGasuItGamIeNrbs; Site actif Ca2 Epñk ³
. Site de fixation : CaBYkGasuItGamIueNsMrab;P¢ab;eTAnwgFatubgáedaysm<½n§gexSay (liaisons

hydrogènes, hydrophobes et Van Der Vaals).

. Site catalytique : CaBYkGasuItGamIeNEdlmantYnaTICakalIkr (liaison ionique, covalence)

kñúgRbtikmµKmI I.
Ex. : Ribonucléase Ca enzyme mantYnaTI hydrolyse BYk RNA. Ribonucléase pSMeLIgBI1 ExS

peptide (124 AA) nigman 4 cMNg disulfure. Site catalytiqueCaGasIutGamIeNeQµaH Histidine TI

12 nig TI 119. His TI 12 manGMeBIelI OH rbs; Ribose nig His TI 119 manGMeBIelI Phosphoryle.

Acides aminés BITI 31-41 (Ca site de fixation) man 5 GasuItGamIeN. Basiques

EdlmantYnaTIP¢ab;eTA RNA.

54
 -Acétycholine esterase (Nachmanson)
Site de fixation estérasique CH3 NH2
Sérine

O C OH CH COOH
HOOC HC H2C
O HO CH2 CH COOH
NH2 HN N
CH2 NH2
Histidine
CH2 Tyrosine

N+
CH3
H3C
CH3

Site de fixation anionique

CH3

CH3 C O C C N+ CH3 H2O

CH3COOH + HOH2C-CH2-N+(CH3)3
O H2 H2
CH3
acétylcholine A.acétique choline
Acétylcholine esterase

- Sites de fixation rbs;vaman 2 Epñk ³

. Un site estérasique P¢ab; Acétyle Rtg;cMNg ester.

. Un site anionique P¢ab;Rtg; Azote EdlmanbnÞúkviC¢man

- Site catalytiqueman 3 Acides aminés :

. Sérine et histidine P¢ab;eTA Carboxyle

. Tyrosine P¢ab;eTAGakul

karrMkil électron naMeGaycMNg ester RsYyCaehtunaMeGaydac;.

- cMNg disulfure et cMNgexSaymantYnaTIRKwHkñúgkarRbmUl (rapprocher) acides aminés rbs; site

actif.

- kñúg sites catalytiques rbs;Gg;sIumEdleKsÁal;mYycMnYnFMman Acides aminés : sérine, cystéine,

histidine, tyrosine et lysine mYy b¤ eRcIn.

- Enzymes hydrolytiques CaeRcIn (Enzymes protéolytiques, phosphatase alcaline,

acétylcholine esterase man sérine enAkñúg site actif.

- eKeXIjman cystéine enAkñúg site actif rbs;Gg;sIummYycMnnY FMdUcCa phosphoglycéraldéhyde

déshydrogénase, aicool déshydrogénase, BYk enzymes protéolytiques dUcCa papaine.

55
 rebóbrk Site actf : Cajwkjab;eKeRbIsarFatumYyeTAP¢ab; CaBiessCamYyGasIutGamIeN . ebI AA
enaHCa AA rbs; site actif eKeXIjGg;sIumenaHGskmµ.
Ex. :
P¢ab;edayELkeTAnwg sérine . vaCa inhibiteur des
- Le diisopropylfluorophosphate ou DFP

enzymes hydrolytiques CaBiess Acétylcholine esterase.

DFP ou diisopropylfluorophosphate
H3C O O
Sérine
H3C O
P
H3C
H3C O F H OH2C CH C OH

NH2

- Le parachloromercuribenzoate ou PCMB P¢ab;edayELkeTAnwg Cystéine.

Cystéine
O

Hg Cl H S-CH2 CH C OH

NH2

Parachloromercuribenzoate ( PCMB )
COOH

3.4- MECANISME D’ACTION DES ENZYMES

3.4.1- La réaction enzymatique

Ex. :
- 2H2O2  2H2O + O2 RtUvkarfamBl 18 Kcal/mole edIm,IeTAdl; état de Transition. ebI
eRbIelah³CakatalIkr (platine) eKeRbIfamBlGs; 12Kcal/mole. EtebIeRbI Enzyme spécifique (catalase)
eKeRbIfamBlGs;Et 7Kcal/mole.
- Hydrolyse des protéines ebIeRbI HCL CakatalIkr eRbIfamBlGs; 20Kcal/mole. EtebI eRbI
Enzyme (Trypsine) eKeRbIfamBlGs;Et 12Kcal/mole.

3.4.1.1- Energie d’activation

.Rbtikmµcab;dMeNIkarBI état transitoire, ∆G CafamBldMeNIkarRbtikmµ (énergie de la réaction).
.famBlEdleRbIBI état initial dl; état transitoire ehA énergie d’activation

56
 . Enzyme manGMeBIticeTAelI état final rbs;lMnwg (équilibre) CacMNucmYysMxan;eRBaHkñúgeka
sikasMbUreTAedayRbtikmµeTAmk (réaction réversible).
Ex:

R-COOR’ + H2O R-COOH + R’OH

Ester Twk Hydrolyse GasIutem Gakul
20% 80%
 glucoside + H2O glucose + alcool
75% 25%

eK)anlT§plbBa©b;dUcKñaebIeKecjdMeNIrBI glucoside b¤l,ay glucose et alcool. dUcenHRbtikmµ man

enzyme lMnwgbBa©b; (équilibre final) enAdEdlbu:EnþRbtikmµelÓnCagmun.

57
 eK)anlT§plbBa©b;dUcKñaebIeK
ecjdMeNIrBI ester(courbe b)
b¤l,ay acide gras et alcool
(courbe a) dUcenHRbtikmµman

enzyme lMnwgbBa©b;enAdEdl

bu:EnþRbtikmµelOnCagmun .

Acides gras libres (%)

temps (minute)

Rbtikmµman enzyme eRcIn (réactions polyenzymatiques ) : kñúgekasikaFatubgámYy GaccUlkñúg

3.4.1.2-

voies métabolique eRcIn.

1 C D  E
A + B

2 L M  N

CaeKalkarN_ enzyme minERbRbYlFatupSMrbs;lnM wgeT EtERbRbYlbrimaNeTAtamcMnYn enzyme

EdlmaneRcIn b¤ ticenAkñúgekasika .

3.4.2- sItuNðPaB nig RbtikmµeRbI enzyme (température et réaction enzymatique)

58
 Rbtikmµmanb¤Gt; enzyme Vitesse de
réaction
sItuNðPaBbegáInel,Ón
Rbtikmµ. EtsItuNðPaBeFVI
eGay enzyme ERbePT
dUcenHel,ÓnRbtikmµman
enzymeCalT§plsrub

rvag courbe a et b KW
courbe R

3.4.3- Le pH et activité enzymatique

RbtikmµmanGg;sIumERbRbYlxøaMgCamYy pH rbs;mCÄdæan. eKeXIjmanktþa 3 ³

- pH extreme ou pH d’arrêt bMErbMrYl mineTAmk (irréversible) nUvrcnasm<½n§rbs;Gg;sIum eday

ERbePTRbUetGuIn nig krNIxøHbMErbMrYlcMNgrvag Apoenzyme et coenzyme.

- kñúgkrNImYycMnYnFM pH GacbMErbMrYl ionisation rbs;Fatubgá (substrat)
- pH GacmanGMeBIeTAelIRbtikmµ enzyme-substrat nigelI catalyse edaybMErbMrYlkarpþac; Acides
aminés rbs; Site actif.

59
activité pH
enzymatique coube B en plateau -1
-2 Pepsine

-3

-4

courbe A -5 Phosphatase acide

en cloche
-6 α glucosidase
Uréase
-7 Amylase pancréatique
Carboxypeptidase
-8 Trypsine

pH dárrêt pH optimum pH d’arrêt -9 Phosphatase alcalin

-10 Arginase

. Enzyme PaKeRcInman pH optimum BI 5eTA8.

. kñúg biologie cliniqueeKeFIV dosage d’activité enzymatiqueenA pH optimum.
. Enzymes BIrmanlkçN³edayELk (spécificité) dUcKñaEtmkBICalikaxusKñaman pH optimum
xusKña.
] ³ - Phosphatase alcaline hépatique man pH optimum ≈ 9,0
- Phosphatase acide prostatique man pH optimum ≈ 5,0

3.5- CINETIQUE ENZYMATIQUE

KWsikSaBIel,ÓnRbtikmµKImI nig ktþaEdlTak;Tg.

. rkel,ÓnRbtikmµ (la vitesse de réaction) : KWrkcMnYnplitpl (produit) EdlekIteLIgeday sar
enzyme b¤ rkcMnYnFatubgá (substrat) Edl)at;kñúgmYyxñateBl.

. skmµPaBénmU:elKulGg;sIum (l’activité moléculaire d’un enzyme) : KWCacMnYnmU:elKulFatu

bgáEdlbMElgkñúgmYynaTIeday 1 mU:elKul enzyme kñúglkçN³l¥bMput (condition optimum).
3.5.1 - Vitesse de réaction en fonction du temps
el,ÓnRbtikmµ (vitesse de réaction) : V= -dS/dt =dP/dt
S=Fatubgá (substrat), P=plitpl (produit), t= eBl (temps) enAeBl t eK)an S
1 1 et P1

enAeBl t eK)an S et P
2 2 2

dS = S2 - S1
dP = P2 - P1

60
 dt = t2 - t1
- Réaction d’ordre zéro: KWCaRbtikmµEdlcMnYnFatubgábMElgkñúg 1 xñateBlefrehIyminBak;
B½n§eTAnwgkMhab;rbs;FatubgáEdlcUlrYmeLIy. eK)an el,ÓnRbtikmµ = -dc/dt = K
- dc CacMnYnfycuHrbs;Fatubgá

dt Ca variation du temps

concentration

Réaction d’ordre zéro

KWCaRbtikmµEdlcMnYnFatubgábMElgkñúg 1 xñateBlsmamaRt
- Réaction d’ordre un :

(proportionnelle) eTAnwgcMnYnFatubgáEdlkMBugmankñúgRbtikmµ.

eK)an el,ÓnRbtikmµ = -dc/dt = Kc

courbe exponentielle

décroissante

concentration

Réaction d’ordre un
3.5.2- Vitesse de réaction en fonction de la concentration d’enzyme
CaTUeTARbtikmµmanGg;sIumRbRBwtþeTAedaymanFatubgáeRcInhYs (excès). kñúglkçN³enH
el,ÓnRbtikmµsmamaRteTAnwgcMnYnGg;suImEdlmanenAkñúgmCÄdæan.

Vitesse
De réaction minecjBI origine eRBaH
RbtikmµekItmundak; enzyme

Concentratiom d’enzyme

61
 3.5.3- Vitesse de réaction en fonction de la concentration de substrat
- sikSaeday Victor Henri (1905) bnÞab;mk Michaelis et Menten (1913).
- el,ÓnRbtikmµminsmamaRtnwgkMhab;rbs;Fatubgá. vaekIneLIgtamkMhab;rbs;Fatubgá rYcefr
dUcenHel,ÓnRbtikmµekIneLIgy:agelOndl;kRmitGtibrma (maximum) KWCael,ÓnGtibrma (vitesse
maximum : Vmax )
Rbtikmµman enzyme :
V1 K1 V3 K3
E + S ES E + P
V2 K2

S : kMhab;rbs;Fatubgá
E : kMhab;rbs; enzyme TaMgGs;

ES : kMhab;rbs;; enzyme-substrat Edl)an KWkMhab;rbs; enzyme EdlP¢ab;

P : kMhab;rbs;plitplEdl)an

(E - ES) : kMhab;rbs; enzyme EdlminTan;P¢ab;Fatubgá (enzyme libre)

K1 : constante de vitesse de formation du complexe ES
K2 : constante de vitesse de dissociation du complexe ES
K3 : constante de vitesse de formation du produit P
RbtikmµenHGacEckCa 2 dMNak;kal (2 étapes) :
- dMNak;kalTI 1 ³ karbegáIt complexe ES (RbtikmµeTAmk)
- dMNak;kalTI 2 ³ karpþac; complexe ES edIm,I)an E nig P
- tam loi d’action de masse :
V1 = K1 E S
V2 = K2 ES
V3 = K3 ES
- Equation de Michaelis-Menten : el,ÓnRbtikmµman Enzyme smamaRt ES. el,Ónkar begáIt
ES smamaRtnwg S et enzyme libre (E - ES) edaykMhab;rbs; S x<s; (élevée) dUcenH

eKGacminKit (négliser) cMnYn S EdlP¢ab;eTA enzyme. eKGacsresr ³ dES/dt = K S ( E -

1

ES ) (1) el,Ónkar)at; ES smamaRtnwg ES dUcenHeK)an ³ -dES/dt = K ES+K ES (2)
2 3

enAeBlel,ÓnRbtikmµman Enzyme : V = el,Ónkar)at;Fatubgá S = -dS/dt = el,ÓnkarekIteLIg

plitpl P = +dP/dt eK)an (1) = (2)
K1S (E - ES) = K2ES+K3ES (3)

K 2  K3
  Km ou (K2 + K3) / K1 = Km = constante de Michaelis
K1

62
ebI K mantémøtUceRbóbeFób
3 K2 => Km K2 => (3) Gacsresr ³
Km = S (E - ES) / ES (4) => ES = S E / Km + S (5)
La vitesse initiale de réaction est proportionnelle ( smamaRt) à ES :
V = K3ES
ebIeKdak;FatubgáeRcInelIslub (grand excès) eK)an vitesse maximale EdlsmamaRtnwgcMnYn enzyme
enAkñúgmCÄdæan. eKGaccat;Tuk enzyme TaMgGs;manTRmg;Ca ES ³
V = K3E
kñúg (5) CMnYs ES et E edayel,ÓnEdlsmamaRtnwgcMnYnrbs;vaeK)an ³
V = Vmax S / Km + S (6) équation de Michaelis-Menten

ebI V = ½ valeur maxima eK)an ³ S / Km + S = 1/2=> Km = S

Km Ca constante de dissociation du complexe ES témørbs;vabBa¢ak;BITMenarrbs; enzyme

eTAelIFatubgá ³
Km↑ => enzyme manTMenarexSayeTAelIFatubgá

Km↓ => enzyme manTMenarxøMageTAelIFatubgá

K et K bBa¢ak;BITMenar (affinité) rbs;Gg;suImeTAelIFatubgá

1 2

K bBa¢ak;Bk
3 I arbMElg (transformation) ES Ca P (bBa¢ak;BIGMeBIrbs;Gg;suIm ).
Vitesse

Vmax ------------------------------------------- parabole

Vmax -----

Km concentration du substrat

L’équation en inverse :
(7)

1 Km + S Km 1 1
V Vmax  S Vmax S Vmax

63
K/ Vmax Ca constante. ebIeKKU courbe 1/V eTAtamkarERbRbYl 1/S
eK)anbnÞat;Rtg; (droite) Edlman pente = Km/ V . bnÞat;enHkat; ordonnées Rtg; 1/V
max ma

(puisque 1/S tend alors vers zéro) kat; abscisse Rtg; -1/ Km

l,ÓnRbtikmµtamkarERbRbYlénkMhab;rbs;Fatubgá ³ rUbtMNag Lineweaver-Burk

1/V y
-
-
-
-
- 1/Km
2/Vmax --------
-
-
1/Vmax -
-

. . . . . . . . . . . . . . .

-1/Km 1/S x

3.5.4- Enzyme agissant sur plusieurs substrats simultanément

Enzymes CaeRcInmanGMeBIeTAelIFatubgá 2 EdlcUlrYmRbtikmµ. eKeXIjGacekItman ³
3.5.4.1- Complexe ternaire : Enzyme man Site de fixation rbs;FatubgáedayELkBIKña man

2krNI ³

- lMdab;fñak;karP¢ab;FatubgáminBak;B½n§Kña (indifférente) ³ A et B Fatubgá E=enzyme, P et R

plitpl
E + A  EA

EAB E + P + R
E + B  EB

- lMdab;fñak;karP¢ab;FatubgáBak;B½n§Kña (TisedAEtmYy univoque) :

E + A  EA + B  EAB E + P + R
Ex. : oxydation du substrat Edlman coenzyme Ca déshydrogénase.
3.5.4.2- Complexe binaire (système ping-pong)

E + A  EA  E* + P
E* + B  E*B  E + R
Ex: Transaminase : Acide aminé (substrat) e)aHbg; amine eTAeGay enzyme ehIy enzyme epÞr
64
 Amine enHeTAeGayFatubgámYyeTót .
3.6- EFFECTEURS ENZYMATIQUES
CasarFatuKImIEdlbMErbMrlY Rbtikmµman enzyme KWCaBYk :
- Activateurs : BYkbegáInel,ÓnRbtikmµ

- Inhibiteurs : BYkbnßyel,ÓnRbtikmµ

3.6.1- Les inhibiteurs : eKeXIjman ³

3.6.1.1- Inhibiteurs compétitfs : manrcnasm<½n§Rbhak;RbEhlnwgFatubgá. vamanTMenar

xøaMgCagFatubgákñúgkarP¢ab;eTA enzyme edayykkénøgrbs;Fatubgá.

I= inhibiteur
E + S  ES  EP  E + P
E + I  EI => Ki = E I / EI => équation (7) Gacsresr ³
1 Km  1  1 1
  1    
V V max  Ki  S  V max
Equation bgðajfa cMnYn inhibiteur enAdEdlEtkMhab;rbs;FatubgáekIneLIg
=>1/S → zéro => Produit = o => V → Vmax
témørbs; vitesse maximale enAdEdldUcGt;man inhibiteur.
Ex. :
- Acide malonique (HOOC-CH2–COOH) Ca inhibiteur compétitif rbs;
succinodéshydrogénase EdlmanFatubgáCa Acide succinique (diacide à 4 carbones). inhiteur
enHxøMageRBaHebIeKdak; 50 dgticCagFatubgá (Acide succinique) eKeXIjskmµPaB inhibition )an
50% .

- Acide fluorocitrique Ca inhibiteur compétitif rbs; Aconitase Ca enzyme manGMeBIeTA elI

Acide citrique .
CH2 –COOH CH F–COOH
| |
C(OH)-COOH C(OH)-COOH
| |
CH2 –COOH CH2 –COOH
Acide citrique Acide fluorocitrique
- Amine quaternaire Ca inhibiteur compétitif rbs; acétylcholine estérase EdlCaGñk Hydrolyse
l’acétylcholine .
H3C R1

H3C N CH2 CH2 OCOCH3 R2 N+ R4

H3C R3
acétylcholine Amine quaternaire
65
. Inhibiteurs compétitifs mYycMnYnmanrcnasm<n§½Rbhak;RbEhlnwg Acides aminés, bases
puriques et pyrimidique EdlCaFatupSMrbs; protéines et acides nucléiques dUcCa ³
fluorophénylalanine dUc Phe, 5-fluorouracile dUc uracile, 2-amino-adénine dUc adénine.

. edaysarKMnitenHehIyeKGacbBa¢ak;BI Antimétabolites EdlmanmuxgarsMxan;kñúgkar Büa)al.

EX : sulfamides et dérivés manrcnasm<n§½dUc para-aminobenzoique CaEpñkmYyrbs; Coenzyme

Edl)anmkBI Acide folique. kgVH Acide folique naMeGayemeraKxøH minGacrIklUtlas; )an.

enHbBa¢ak;BIGMeBI Antibactérienne rbs; Sulfamides .

NH2 NH2

COOH SO2NH2
Acide para-aminobenzoique Sulfamide

3.6.1.2- Inhibiteurs non compétitifs : Ca inhibiteurs EdlP¢ab;nwg Enzyme CalkçN³eTA

mkenATItaMgxusBI site actif .
Ex :
- BYkelah³F¶n;EdlGacP¢ab;eTA –SH kñúg enzyme EdlCa Cys manmuxgasMxan;.
- Fluorure GacP¢ab;eTA Mg++.
- Ethylène-diamine-tétracétate ou EDTA GacP¢ab;eTAnwgelah³mYycMnYnFM. Inhibiteurs
enHeFVIeGayEpñkmYyrbs; enzyme GskmµCaehtunaMeGayel,ÓnRbtikmµ nig vitesse maximale fy
cuHEt constante de Michaelis minERbRbYl.
3.6.2- Effecteurs allostériques
mansarsMxan;kñúgekasikaeRBaHvaCaGñkføwgsm<½n§Rbtikmµ. Effecteurs manlkçN³ 3 ³
1- CaTUeTArcnasm<n§½xusq¶ayBIFatubgárbs; enzyme

2- GMeBIrbs;vamanlkçN³edayELk. ÉsarFatuEdlman rcnasm<n§½dUcKñaminmanGMeBIeTAelI eLIy.

3- vamanGMeBIeTAelI enzyme sMxan;TImYyrbs; chaîne métabolique

rUbtagBIlkçN³TueTArbs; effecteurs allostériques :

66
* A→ B →C → D →E E man effet allostérique
Rétroinhibition ou Feedback

Ex : kñúg E. Coli karsMeyaK L-isoleucine BI L-thréonine

L-thréonine B → C → D → E → L-isoleucine

Thréonine désaminase

D- Isoleucine manenAFmµCatiEtminmantYnaTICa inhibiteur eT.

H MG CoA Réductase
HMG CoA Mévalonate

xøHbBaÄb;karsMeyaKsarFatuEdlekasikaminRtUvkar edayminb:HBal;karsMeyaK
* Inhibiteurs

EpñkmYyeTótenAkñúg métaboliisme complexe.

D → E → F

A → B → C
L → M → N

* Précurseur rbs;Fatubgá b¤ FatubgáxøÜnÉg GacCa Activateur de l’enzyme.

L → M → N → A → B → C → D

A → B → C → D

FIN

67
 IV. ACIDES NUCLEIQUES

4.1- lkçN³TUeTA
4.1.1-niymn½y ³ Acides nucléiques dUceQµaHrbs;vaCasarFatumYyEdleKrkeXIjdMbUgenA kñúg
noyau bnÞab;mk)aneKrkeXIjenAeRkA noyau dUcCaenAkñúg cytoplasme rbs;ekasika bu:EnþeKenA

rkSaeQµaHenHdEdl.
eKman Acides nucléiques 2 Ebb ³
- Le DNA (acide désoxyribonucléique) sßitenACaBiesskñúg noyau rbs;ekasika.

- Les RNA (acides ribonucléiques) sßitenACaBiesskñúg cytoplasme rbs;ekasika.

68
 4.1.2- plRbeyaCn_ ³
. kñúgkarsMeyaKRbUetGInu
. FatupSMRKwHrbs;ekasika
. Support de la plupart des activités biologiques

- Le DNA : manBt’mansMxan;²rbs;karsMeyaK ³ kmµviFI (programme) . DNA CaFatupSM GciéRnþ

(permanent) rbs;ekasika. Bt’manEdlvaman RtUvepÞreTAeGayGñkbnÞab;. dUcenH)anCaeKfa DNA

CaTRménkarbnþBUC (support de l’hérédité ).

- Les RNA CaGñkGnuvtþ (exécution) karsMeyaKRbUetGIun.
4.1.3- rcnasm<n½ § ³ CamU:elKulEvgpSMeLIgBI sous-unité dEdl² ehA nucléotides.

4.2- LES NUCLEOTIDES

4.2.1- FatupSMrbs; nucléotide : pSMeLIgBIFatupSM 3 (3 éléments) :

4.2.1.1- La base : kñúgmU:elKulrbs;vaman base 2 Ebb ³

- Bases pyrimidiques
- Bases puriques
rUbmnþrbs; noyaux mYycMnYn ³
4 6 7
3
N 5
5 N
1 N
8
2 6
2
N N 4 N
1 9
3

a)- Bases pyrimidiques : man cycle pyrimidique. eKeXIjman 3 ³ uracile, cytosine et

thymine .

69
- Base nimYy²mannMnwgrvagTRmg; tautomère 2 Ebb.
Ex : Uracile : TRmg; Tautomère rbs; uracile

Des analogues de l’uracile (5-halogéno-uracile) បរបើជាanti-tumorale.

-បៅ pH physiologique ទំរង់ C=O(forme cétone) មានបររើនជាងទំរង់C-OH(forme énol)

-ឯទំរង់ C-NH2 (forme amino) មានបររើនជាងទំរង់C=NH(forme imino)បៅក្នុងបោសិោ។

NH2 NH

N H HN 4
H
4 3 5
3 5
2 6
2 6 1
1 H
H O N
O
H

TRmg;EdlGtßiPaBenA pH physilogique rbs; bases pyrimidiques TaMg 3 (formes tautomères)

70
មាន bases purimidiques modifiées ដូរជា

NH2 O
NH2
CH3 CH2OH HN 4
X
N 4 N 4 3 5
3 5 3 5 2 6
2 6 1
2 6
1 1 O N H
O N H O N H
H
H H

b)- Bases puriques : man noyau purine. eKeXIjman 3 ³ hypoxanthine, adénine et guanine .
TRmg; tautomères C-OH rbs; bases puriques

Hypoxanthine minmanenAkñúg Bases TaMg5 (A, T, C, G et U) EdlcUlrYmkñúgkarsMeyaK Acides

nucléiques eT. Hypoxanthine eKGaceXIjmanenAkñúg tRNA tamry³karsMeyaK dMNak;kalTI

2 edaydknaTI Amine ecjBI Adénine rbs; AMP mYyEdlmanRsab;enAkñúg tRNA.

71
- kñúgkrNI bases puriques enA pH physiologique TRmg; C=O maneRcInCag TRmg; C-OH dUc bases
pyrimidiques Edr.

TRmg; tautomères C=O rbs; bases puriques enA pH physiologique

4.2.1.2- L’ose :eKeXIjman Oses 2EbbenAkñúg Acides nucléiques :

a)- Ribose (D-ribose) : Ca ose Edlman 5 GatUmkabUn.

b)- Désoxyribose (2’-désoxy-D-ribose) : dUcxagelIEtKµan OH enA C2’

D-ribose D-désoxyribose
(2’-désoxyribose)
5’ 5’
HOH2C O OH HOH2C O OH
4’ 1’ 4’ 1’

3’ 2’ 3’ 2’

OH OH OH H
ARN ADN

4.2.1.3- L’acide phosphorique : naTI Acide 2 kñgú cMeNam 3 naTIGasIutrbs;vaRtUveFVI

Estérification enAkñúg DNA et RNA.

pKa = 2 O
pKa = 10
P
H-O O-H
pKa = 7 O-H

4.2.2- karP¢ab;FatupSMTaMg 3 rbs; Nucléotide :

72
4.2.2.1-cMNg Ose-base : Ca sm<½n§Ng -osidique : sm<½n rvag OH rbs; semi-aldéhyde
rbs; ose nig H EdlenA N1 rbs; base pyrimidique b¤ N9 rbs; base purique.
N
N 4 N 6 7
3 5 1 5
8
2 6 2 4
1 3 9
N H2O N N H 2O
5’ H 5’
H
HOH2C O OH HOH2C O OH
4’ 1’ 4’ 1’

3’ 2’ 3’ 2’

OH OH / H OH OH / H

cMNg H PO -Ose : Ca sm<½n ester ³ sm<n½ rvag OH mYyrbs; H3PO4 nig H rbs; OH
4.2.2.2- 3 4

EdlenA C5’ rbs; ose.

OH
5’
O P OH HO-H2C O OH
O
- 4’ 1’

3’ 2’

H 2O OH OH / H
OH
5’
O P O CH2 O OH
O- 4’ 1’

3’ 2’

OH OH / H

4.2.3- eQµaHrbs; Nucléotides

4.2.3.1- Nucléotides Edlman base Ca noyau pyrimidique
a/-ក្រណីទី ១៖ Ose ជា Ribose (nucléotideរ្ស់ RNA)
B = Base
SB = Nucléoside : Radical + IDINE (S=sucre)
PSB = Nucléotide : Radical + IDYLIQU(P=phosphate)

b/-ក្រណីទី ២ ៖ Ose ជា Désoxyribose(រ្ស់DNA) : ប្មោះដូរខាងបលើដដររាន់ ដែដែម

dពីមុខ
Ex : dCMP = acide désoxyribocytidylique, dTMP= acide

73
 désoxyribothymidylique
NH2 O
H3C H
4 N 6 N
5 3 5 1
4 2
OH 6
1
2 OH 3
5’ 5’
N O N O
O P O CH2 O O P O CH2 O
- -
O 4’ 1’ O 4’ 1’
3’ 2’ 3’ 2’

HO H HO H
désoxycytosine-5’-monophosphate désoxythymidine-5’-monophosphate
(dCMP) (dTMP)

4.2.3.2- Nucléotides Edlman base Ca noyau purique

a/-ក្រណីទី ១៖ Ose ជា Ribose

B = Base
SB = Nucléoside : Radical + OSINE
PSB = Nucléotide : Radical + YLIQUE

Hypoxanthine ( krNIelIkElg )

IMP មានបៅដែក្នុង RNA de transfert (tRNA)

b/-ក្រណីទី ២ ៖ Ose ជា Désoxyribose : ប្មោះដូរខាងបលើដដរាន ដែ់ដែម d ពីមុខ

Ex : dAMP = acide désoxyriboadénylique .
NH2 O
N N 6 N
7
6 N 7
5 1
OH 8
5
4
1
2
OH 8 4
3
2
3 5’ 9
5’ 9
O P O CH2 O N N O P O CH2 O N N NH2
- -
O 4’ 1’ O 4’ 1’
3’ 2’
3’ 2’

HO H HO H
désoxyadénosine-5’-monophosphate désoxyguanosine-5’-monophosphate
(dAMP) (dGMP)

74
 NOMENCLATURE
type de base
nucléoside nucléotide
base azotée

purine adénine (ADN/ARN) adénosine adénylate

purine guanine (ADN/ARN) guanosine guanylate
pyrimidine thymine (ADN) thymidine thymidylate
pyrimidine uracile (ARN) uridine uridylate
pyrimidine cytosine (ADN/ARN) cytidine cytidylate
Le préfixe désoxy- ou désoxyribo- est ajouté aux nucléosides ou nucléotides
qui comportent du désoxyribose. Le préfixe ribo- est ajouté aux nucléosides ou
nucléotides qui comportent du ribose.

-យៅរនុងយោសិោ nucléotide អាចមានទំរង់ជា mono-, di-, trinucléotide

NH2
N
7
5
6
1
N
O O O 8 4
3
2
5’ 9
HO P O P O P O CH2 O N N
- - -
O O O 4’ 1’
3’ 2’ ATP
OH OH
adénylate NH2
cyclase N
7
5
6 N
1
8 4 2
5’ 9 3

O O CH2 O N N
HO P O P OH + O 4’ 1’

- - 3’ 2’
O O O=P
O OH
-O

PPi AMPc

75
ATP យរោមអំយពររ្ស់enzyme adénylate cyclase សំយោគ AMPcyclique (AMPc)
4.2.4- karP¢ab; nucléotide nig nucléotide kñúg acides nucléiques
4.2.4.1- សមព័នធរវាង nucléotide និង nucléotide : ជាសមព័នធ Ester រវាង OH របស់ H3PO4
និង H របស់ OH ដដលបៅ Carbone 3’ របស់ ose
ទិសយៅacides nucléiques 5’→3’

4.2.4.2- Karsnµt; (convention) Gan Acides nucléiques : eKemIlRbUetGIun BIcug NH2 eTA cug
COOH. dUcKñaenHEdrk_manc,ab;sMrab;GanExS Acides nucléique :

- xagcugmanbNþúM phosphate EdlmannaTI OH esrI 2 ehAcug 5’Phosphate (extrémité 5’P)

- cugmçageTótmannaTI OH esrIenAkabUn 3’rbs; ose ehA cug 3’OH (extrémité 3’OH)

eKsnµt;GanExS Acides nucléiques BI 5’Phosphate eTA 3ÓH. edIm,IgayRsYleKTmøab;tag kMNat;

DNA Et Caelx 5’ et 3’.

4.3- LE DNA

4.3.1- rcnasm<n½ § nig lkçN³rbs; DNA

4.3.1.1- FatupSM (constituants) rbs; DNA : DNApSMeLIgBIeRcIn nucléotides tP¢ab;Kñaeday cMNg

ester nigmanlkçN³pÞal; 3 EbbxusBI RNA :

a)- L’ose : Ca désoxyribose xusBI RNA Ca Ribose.

b)- Les bases : A G C T
eKeXIjman ³
76
- 2 bases puriques : Adénine (A), Guanine (G)
- 2 bases pyrimidiques : Cytosine (C), Thymine (T) kñúg RNA Thymine RtUvCMnYseday Uracile
vij.
man 2 ExS nucléotides (2 chaînes ou 2 brins) Et
c)- Les deux chaînes de nucléotides : DNA

RNA manEt1ExS (une chaîne ou un brin) nucléotide elIkElgEtenAkñúg Virus xøH.

4.3.1.2- lkçN³énExSTaMgBIrrbs; DNA : manlkçN³ 3 EdlsMxan; ³

- Antiparallèles;
- Complémentaires;
- Hélicoidales.

a)- Antiparallèles

Les 2 chaînes de AND antiparallèles

77
b)- Complémentaires : c,ab; Complémentaire KW ³
78
 -A រងភ្ជាប់ជាមួយ T យោយ២សមពន័ធ hydrogène
-C រងភ្ជាប់ជាមួយ G យោយ៣សមពន័ធ hydrogène
dUcenHebIeKsÁal; bases rbs; Brin 1eTAtamc,ab;xagelI eKGacsresr bases rbs; Bin 2 )an .
Ex: Brin I : 5’ A C G A 0 0 0 0 C 3’
Brin II : 3’ T G C T 0 0 0 0 G 5’ rebobP¢ab;enHEp¥keTAelIkarsMGag
(raison) 2 Ebb ³
α)- Pour des raisons stériques : KWsMGagelITIkEnøgkuMeGayTeTIsTETg (des raisons de
place d’encombrement) .

5’ 3’ base purine (2 cycles)

base pyrimidique (1 cycle)

3’ 5’

β)- Pour une raison de liaison hydrogène : KWsMGageTAelI bases TaMgBIrRtUvcgP¢ab;Kña

edaysm<½n§ Hydrogène .
- enAmux A (6-aminopurine) man T (4-cétopyrimidine)

- enAmux C (4-aminopyrimidine) man G (6-cétopurine)

cMeBaHKU G-C nig A-T man man sm<n½ § hydrogène mYyeTótKW (1N-purine et 3N-pyrimidine)
cMeBaHKU C-G manEfm sm<n½ § hydrogène mYyeTótKW ³
- enAmux C (2-cétopyrimidine) man G (2-aminopurine)

cMnYn sm<n½ § Hydrogène KUTaMgBIr :

NH2 H
NH O

N N 6 N HN
4 CH3
N 5
7 1
8 2 2
9 3 1 Thymine
retourner O
N N N N N

Adénine désoxyribose--P
P--désoxyribose

79
 H
O O NH

HN N 6 NH N 4
N 5
7 1
8 2 2
H2N 9 3 1 Cytosine
retourner NH O
N N N N N
H
Guanine désoxyribose--P
P--désoxyribose

sm<½n§ C-N EdlP¢ab; base nimYy²eTAnwgsár (sucre = désoxyribose) man configuration BIrEbbKW ³
syn nig anti .

dUcenH DNA manTRmg; ³

. A-DNA b¤ B-DNA kalNa bases puriques et pyrimidique man configuration anti.

. Z-DNA kalNa cytosine manTRmg; anti, guanine manTRmg; syn (eKeXIj base Gacvil

CMuvij sm<½n§ glycosidique). Configuration anti et syn enHqøas;KñaeTAmk.

Ex: les 2 conformation syn et anti

Syn Anti
O Guanine Guanine O

HN N N 6 NH
5 1
7
8 2
9 3
H2N NH2
N N N N
O O
HOH2C HOH2C
C (H) C (H)

O O

4 4 NH
HN

2 1 O
O 1
N N
O O
HOH2C HOH2C
C (H) C (H)

Uracile Uracile

kartagKMnUrbMRBYj (représentation schématique) : eKGactagmU:elKul DNA CaKMnUrbMRBYj

edayminKitBI forme spatiale :

80
 edIm,IgayRsYleKsresrEt Bases ebs;vaCabnÞat;Q b¤bnÞat;epþk
5' C G 3'
TA
AT
GC 5' C T A G C G G A 3'
CG ou
3' G A T C G C C T 5'
GC
GC
3' A T 5'
Et Base enHtageGaymU:elKul Nucléotide : C Ca nucléotide à cytosine ; T Ca nucléotide à
thymine ; A Ca nucléotide à adénine ; G Ca nucléotide à guanine.

c)- Hélicoidalesរូ្ B-DNA

Grand sillon (sillon majeur) = 1,2 nm de large (្យណា

ោ យ)

Petit sillon (sillon mineur) = 0,6 nm de large (្យណា

ោ យ) ).

81
 -ដខែទំងពីររបស់ DNA មានទំរង់ជា Hélicoidale បៅក្នុងលំហ ។ ដខែទំងពីរបនោះវ ិលជុំវ ិញ

Axe central បបងកើែជា double hélice droite: AND droite ( សំបូរបៅក្នុង DNA

មួយរំនួនធំដូរជា ៖A-DNA, B-DNA etc…) ឬ double hélice gauche : ADN

gauche ( Ex: Z-DNA… ) ។

-B-DNA ជាទំរង់សំខាន់បៅក្នុងជីវវ ិទាដដលមាន plans de bases ដក្ងនិង axe របស់

Hélice.
.1 ជុំ (spire)មាន 10 pdb(tension minimale) ou 10,5pdb(sans tension)
.distance entre 2 spires (1pas) =3,4nm
.diamètre d’hélice = 2,4nm
.Bases puriques et pyrimidiques យៅខាងរនុង hélice
.Désoxyriboses et groupement phosphate យៅខាងយរៅ hélice
karERbePTrbs; DNA (la dénaturation du DNA)
4.3.1.3-

-DNA + température↑(ពុោះ) → brins ទំពីរដារ់បរញពីានបដាយសាដារ់

សមព័នធបខោយរវាងBases ទំពីរ ( DNA dénaturé :ដរបបភទ ).
-សីតណ្ហភាពរ ំពុោះយររនយ រងឬថយចុោះអាស្ស័យយលរចំនួន(ភាគរយ) G+C មានយរចរនឬតិច

-ោរដរបបភទ DNA នំបោយលក្ខណៈរូបរបស់វាមួយរំនួនដរបរបួលដូរជា ៖

-la viscosité ថយចុោះ
-ោរចា្់យរពនលឹ ultraviolet យររនយ រង;
-la densité យររនយ រង .
-ោរដរបបភទ DNA ោរបៅមក្ ( réversible )បៅបពលណាដដលបេបនថយសីែណហភ្ជពមក្វ ិញ
បនតិរមតងៗ brins ទំងពីរភ្ជាប់ាន (hybride)ជាែមី ( renaturation ) .
-យោយសាមាន bases puriques et pyrimidiques acides nucléiques
(ADN et ARN) អាចចា្់ យរពនលឹ UV (260nm)

82
Z-DNA de gauche មិនមមនជារូ្ភាពរនុងរញ្ជរ់រ្ស់ DNA de droite យទ។
វាមានconformation ខុសគ្ននដូចជា :
- Squelette sucre-phosphate មានទំរង់ zig-zag មិនមមនជា spirale régulièreដូច B-
DNAយទ ដូចយនោះបានជាយគឲ្យយ្មោះ Z-DNA ។
-Z-DNA មានទំរង់ជា hélice svelte ជាងនិងមិនសូវ torsadée ដូច B-DNA
Z-DNA B-DNA
un tour de spire 12 pdb 10/10,5 pdb
un pas de l’hélice 4,6nm 3,4nm
diamètre 1,8nm 2,4nm
- Bas រ្ស់ :
.Z-DNA :-សថិតយៅខាងរនុង double hélice
-conformation anti ចំយ ោះ cytosine(ou la thymine) et syn ចំយ ោះ guanine
(ou l’adénine )។ ោរឆ្លលស់គ្នន anti-syn្យងករតបានជាទំរង់ zig-zag du squelette de
l’hélice Z
-présente sur une même brin l’oxygène du cycle pentagonal pointant
alternativement en haut et en bas.
.B-DNA : -សថិតយៅខាងរនុង double hélice
-conformation anti ទំអស់
DNAរ្ស់ procaryote្យងករតជា Z-DNAងាយជាង DNAរ្ស់eucaryote.
រនុង solutions physiologiques Z-DNAមិនសូវយថដូចB-DNA

83
4.3.2- Le DNA des différents êtres vivants : :

DNA របស់សែវ រុក្ខជាែិ បាក្់បែរ ី virus មាន ៖

-ដបបដផនររនសមព័នដធ ូរាន ៖ 2 Brins ( បលើក្ដលង DNA របស់ virus ខលោះ ) ផែំបឡើងពីបររើន

ពាន់ nucléotides .
-លក្ខណៈដដលខុសានពីរបបភទ (espèce) មួយបៅរបបភទ មួយេឹ ៖

.រំនួនមូបលេុល DNA បៅក្នុងបោសិោ ឬ virus : 1 molécule de DNA បៅក្នុង

virus ou E. coli . ឯបៅក្នុងបោសិោសែវ និង រុក្ខជាែិមានបររើនមូបលេុល ។

.របដវង៖មានពីរ បីពាន់ nucléotides ឬ បររើនបោដ nucléotides

(មចរជាយរចរនchromosomes ).
Généticiens បរបើខានែជា centimorgan(1 centimorgan=1000 kb = 1 mégabase )
សំរាប់វាស់របដវង DNA .
.ទំរង់ (forme) : មខែលាត(linéaire) ouមខែ្ិទ (circulaire)
.ទីតង
ំ បៅក្នុងបោសិោ៖ DNA ខលោះសថិែបៅដញក្ដារ់ពី cytoplasmeបដាយ membrane
nucléaire ឬខលោះបទៀែ អែ់ ដញក្ពី cytoplasmeបទ។

.ជាពិបសសេឹ séquence des bases ដដលបញ្ជ

ា ក្់ពីលក្ខណៈខុសានរបស់ DNA :
Séquence des bases មានមុខងារសំខាន់ក្ុងជី
ន វវ ិទាបរពាោះ séquence des bases

ខុសានបោយសា (message) ខុសាន ។

84
4.3.2.1- Les virus :
.ជាពួក្ភ្ជវៈរស់ដដលមាន Acides nucléiques ខលីជាងបេ ។ បេដបងដរក្ ៖ Virus à DNA
(double brin ex : variole, varicelle, peste.. et simple brin.) et Virus à RNA ex :
VIH (responsables du SIDA), le virus du SRAS, le virus de la grippe et le virus de l'hépatite
C.. ។
.DNA របស់ virus à DNA មាន ពី ២-៣ ពាន់បៅរបមាណ ១០ ពាន់ nucléotides.

4.3.2.2- Les procaryotes :

.DNA របស់វាមិនបៅក្នុង noyau បទ ដែបៅក្នុង cytoplasme (មាន Chromosome
មតមួយគត់ )
.DNA មនទំរង់ជាដខែបិទឬ មូល ( circulaire ) បហើយដវងជាងរបស់virus របដហល

១០០០ ដង។

.Ex: DNA របស់ E-coli មនរបដហល ៤លានេូ nucléotides .

ក្នុង Procaryotes ជួនោលបេប ើញមនក្ំណាែ់ DNA ខលីៗរាងមូលសថិែបៅដក្ប

chromosome ឯក្រាជយ ពី DNA ប ម (DNA principale) បៅ Plasmide .

4.3.2.3- Les eucaryotes :

ពួក្ដដលមាន noyau ក្នុងបោសិោដូរបនោះ DNA របស់វាសថិែបៅក្នុង noyau ។

Chromosome និមួយៗមនដខែមូបលេុល DNA យ៉ា ងដវងបហើយវ ិញជាដខែបែ់រុោះបឡើង

( repliée, pélotonnée ) .
DNA របស់មនុសែរបដហល ១០០០ ដងធំជាង ( សរុបរបដហល 3 រយបោដិ ៖ 3 millards de
paires de nucléotides dans les molécules de DNA constituant les 46
chromosomes humains ) DNA របស់ bactéries ។ DNA បនោះភ្ជាប់របូបែអុីនបបងកើែ
ជា Chromatine ។មាន DNA របស់ពួក្រុក្ខជាែិខឆោះ មណុឌ ក្សែវខឆោះ ៣០ ដងធំជាងដូរបនោះ

chromosome ដវងជាងរបស់មនុសែបររើនណាស់ ។

ពួក្ eucaryotes ខឆោះមាន DNA បៅបរៅ noyau េឹក្ុង

ន mitochondries ( ពួក្សែវ )
និងក្នុង chloroplasme ( ពួក្រុក្ខជាែិ ).

4.3.3- Le DNA des mitochondries (mtDNA)

Mitochondries KWCasrIragÁtcU ² (organite ou organelle) manenAkñgú cytoplasme rbs; ekasikaBYk
eucaryotes. kñúg mitochondries CaBiessmanRbUetGIun EdlcUlrYmkñúgkardkdegIðm éneka sika

nigkasMeyaK ATP. Protéines rbs; mitochondrie )anmkBIRbPB 2. Protéines mYycMnYnFM codée

eday DNA du noyau sMeyaKkñúg cytoplasme nigdwknaMeTAkñúg mitochondries bu:Enþ protéines
tictYcbMputEdl codée eday DNA mitochondrial. Mitochondrie manm:asuIn (ribosome,
ARN,code génétique..)pÞal;sMrab;sMeyaKRbUetGIun.

85
 mtDNA rbs;mnusSmanlkçN³
- 2 brins
- Circulaire clos (16569 pdb)
- va code BYk rRNA, tRNA et mRNA rbs; mitochondries. Brin mYyman gènes eRcInCag brin
mYyeTót.
- Kµan Intron (DNA des mitochondries rbs;BYkpSit (levure) man intron).
- Code génétique mitochondrial xusKñatictYcBI code génétique nucléaire.
-karbnþBUC ³ kUnman mtDNA(mitochondrie) et DNA(n0yau) rbs; ovule (mþay) nigDNA
(noyau)rbs; Spermatozoite (»Buk) dUcenHebI»BukmanCMgWBak;B½n§nig mitochondrie kUnekItmk

Gt;cmøgmkeT . mann½yfa Mitochondries )anmkBImþaydUcenHenAeBlEdl mtDNA

rbs;mþaymankarERbRbYl (mutation) naMeGayExSdkdegðImkñúgekasikamanplvi)ak
(CMgWenHmanRbPBmkBI mitochondries rbs;mþay).

4.4- LES RNA (ACIDES RIBONUCLEIQUES)

4.4.1-lkñçN³rbs; RNA : man

1- L’ose : Ca ribose
2- Les bases : A, C, G et U
3- Une seule chaîne de nucléotides : ExSxøICagExS DNA .
4.4.2- Les règles d’appariement :
Appariement GacekItmanrvag 2 mU:elKul RNA xusKña (eRBaH RNA mYyman 1 brin) b¤ kñúg RNA
EtmYyRtg;kEnøgbt;dUcdegáób (Repliée en épingle à cheveu) KWCatMbn;Edlman
Autocomplémentarité . k,Ün Appariement rvag 2brins de RNA dUcenA DNAEdrRKan;Et

CMnYs T eday U vij.

Structure secondaire du RNA(រចនាសមពន័ថ្ន

ធ ន រ់ទី២រ្ស់ RNA)

86
 4.4.3- Les différents RNA
ekasikamanCaBiess 4 Ebb (types) RNA :
- rRNA (RNA ribosomique) manenAkñg ú ekasikaRbEhl 82% én RNA srub
- tRNA (RNA de transfert) manenAkñúgekasikaRbEhl 16% én RNA srub

- mRNA (RNA messager) manenAkñg ú ekasikaRbEhl 2% én RNA srub

- snRNA (RNA small nuclear) manenAkñúgekasikaCit 1% én RNA srub

4.4.3.1- RNA ribosomiques (rRNA)

Les rRNA et r-protéines : Ribosome CaPaKl¥it (particule ribonucléoprotéinique) sMxan;
sßitenAkñúg cytoplasme CaTItaMgRKwHsMeyaKRbUetGIunkñúgekasika. eKk_eXIjman ribosome enAkñúg
mitochondries EdlcUlrYmsMeyaK protéines rbs; mitochondries Edr. CaTUeTA ribosomes pþúMKñaCa

Rkum ³ unites fonctionnelles ehA Polysome P¢ab;eTAelIm:UelKulrbs; mRNA. Ex : polysome

sMrabsMeyaK hémoglobine dMeNIrkar)aneday 7 ribosomes ÉkarsMeyaK myosine eKeXIjman
100 ribosomes.
* Ribosome (70S) rbs; E-coli (procaryote) pSMeLIgBI 2 sous-unités :
- Une grande sous-unité (50S)
- Une petite sous-unité (30S) (S pour Svedberg – l’unité Svedberg étant l’unité de mesure de
la vitesse de sédimentation) .
Le coefficient de sédimentation d’une particule dépend non seulement de sa masse mais aussi
.
de sa forme et de sa rigidité

Sous-unité nimYy²pSMeLIgBIl,ay ³
- Protéines : « r-protéines »
- RNA : « rRNA »
rRNA CaFatupSMemrbs; ribosome (environ 65%)
* Ribosome (80S) rbs;BYk Eucaryotes FMCagpSMeLIgBI 2 sous-unités EdrKW (40S) et (60S)
Procaryotes Eucaryotes
80S
70S

2 rRNA(5S, 23S) 3rRNA(5S; 5,8S; 28S)

50S 60S 45 r-protéines
34 r-protéines
sillon
30S
1 rRNA(16S) SillonsMrab; mRNA qøgkat;
21 r-protéines 1 rRNA (18S)
40S
33 r-protéines

eKBMuTan;dwgmuxgarc,as;las;rbs; rRNA enAeLIyEteKeXIjvamanmuxgar ³

87
- cUlrYmkñúgrcnasm<½n§eRBaHvaCaEpñkmYyrbs; ribosome.
- sRmYlkarP¢ab; RNA (tRNA, mRNA) epSgeTóteTAelI ribosome.
- cMeBaHBYk)ak;etrIvaCaGñkTTYlsÁal;elIExS mRNA site d’initiation de la traductio (AUG).

4.4.3.2- RNA de transfert (tRNA) : tRNA CaGñkepÞr dwknaM (transférer, véhicular) acides aminés
enAkñúg cytoplasm eTAeGay ribosome. vamanrcnasm<½n§TUeTAdUc RNA EtvamanlkçN³
edayELkmYycMnYn ³
- tRNA man nucléotides atipiques (minFmµta)
- ExSrbs; tRNA bt;cuHeLIgmanTRmg;dUcsøwk trèfle :
. Branche du trèfle mancMNg hydrogène rvag bases complémentaires KWCa doubles-hélices xøI².
. pÞúyeTAvijenA boucles pSMeLIgBI nucléotides non appari EdlenAkñúgenaHman nucléotides
atypiques.
Forme en trèfle d'un tRNA
5' 3'
tag 3' 5'

tRNA

5' 3'

mRNA

tRNA et mRNA sont antiparallèles

Boucle

88
 kñúg tRNA manTItaMg (site) 2 EdlsMxan; ³
- L’extrémité 3’OH : bB©ab;eday 3 nucléotides CCA EdlCakEnøgP¢ab; Acide aminé (aa)

EdlRtUvdwknaM (à transporter).
- L’anticodon : CabNþúM 3 nucléotides (on dit triplet) sßitenA boucle mYyrbs; tRNA.

Anticodon enHmanmuxgarsMxan;kñúgkarTTYlsÁal; codon (codon pSMeLIgBI 3 nucléotides sßitenAelI

mRNA. karbMeBj)asrvag codon-anticodon P¢ab;Kñaeday sm<n ½ §exSay (liaisons faibles :

liaisons hydrogènes) tamrebob ³
. Antiparallèle;
. Complémentaire ( bMeBj)as) entre les bases du codon et de l’anticodon.
eKsresr codon kñúgTisedA 5’→ 3’ É anticodon TisedApÞúyKña. eKGacbBa¢ak;edaysresr
elxEfm 3’et 5’ enAsgxag anticodon (3’UAC 5’ = 5’CAU3’) Kµan tRNA NaEdlman
anticodon complémentaire (et antiparallèle) nig codon stopeTelIkElg tRNA suppresseurs.

Liaison tRNA-acide aminé (aa-tRNA) : CacMNg ester rvag OH (naTI acide) rbs; aa nig Hrbs;

tRNA (naTI alcool «OH»enA 3’ rbs; ribose én nucléotide cugeKxag 3’OH KW AMP).
3'
aa-ACC 3' 5'
aa ACC 5'
tRNA

U A C Anticodon

acide aminé (aa) P¢ab;xagcug A U G Codon

3' rbs; tRNA 5'
3'

mRNA
Anticodon (sur le tRNA) est complémentaire
et antiparallèle au codon (sur le mRNA)
ester
3'
5'
H2N CO OH HO (ACC)
CH (ribose)

acide aminé(aa)
cMNgrvag aa et tRNA t RNA

RbtikmµenHcaM)ac;RtUvkarfamBlEdl)anmkBIGIuRdatkmµ ATP. RbtikmµRbRBwtþeTACa2 dMNak; kal ³

89
- dMNak;kalTI 1 ³ P¢ab; aaeTA AMP ehA Activation de l’acide aminé eK)an
Aminoacyl~AMP (aa~AMP)

aa + ATP aa ~AMP + P P
Pyrophosphate
Pyrophosphatase
2Pi

cMNgsMbUrfamBl Phosphate inorganique

Ca sm<½n§ Anhydride d’acide rvagnaTIrbs;GasIutGamIeN nig naTIGasIut (H3PO4) rbs; AMP.

sm<½n§ enHk_Ca sm<½n§ sm,ÚrfamBlEdr.
- dMNak;kalTI 2 ³ karepÞr Acide aminé BI aa~AMP eTA tRNA begáItCa Aminoacyl~tRNA

( aa~tRNA ). Molécule enHP¢ab;Kñaeday sm<½n§ ester KWrvag OHenA 2’b¤ 3’ rbs; ribose EdlenAkñúg

nucléotide cugeK (A=AMP) nig naTIGasIutrbs; Acide aminé. sm<½n ester enHCaFmµta

minsm,ÚrfamBleT EteRkayeBldac; sm<½n sm,ÚrfamBl Anhydride d’acide famBlTaMgenH

RtUvepÞreTAeGay sm<½n ester  eTACa sm<½n§ ester sm,ÚrfamBldUcenH tRNA dwknaM aa
nigfamBlpg edIm,IykeTAeRbIkñúgkarP¢ab; aa BImYyeTA aa mYyeTóteday sm<½n§ Amide b¤ liaison
peptidique.

edIm,IsMeyaK sm<½n§ ester sm,ÚrfamBlrbs; aa~tRNA RtUveRbIR)as;Gs; 2 sm<½n§sm,Úr famBl

Edl)anmkBI 1 molécule ATP.
aa ~ AMP +tRNA aa ~ tRNA + AMP

Bilan final de ces deux équations eK)an ³

aa + tRNA + ATP aa ~ tRNA + AMP + 2Pi

(2~) (1~)

karsMeyaK sm<½n§ ester rbs; aminoacyl~tRNA enAkñúg cytoplasme man Enzyme CakatalIkrehA
Aminoacyl~tRNA synthétase. Enzyme enHTTYlsÁal;RBmKñanUv acide aminé EdlRtUvdwknaM

(bon acide aminé) nig (bon tRNA) tRNA EdlsmRsb. enAelI enzyme enHehIy EdlekItman ³

- L’activation de l’acide aminé en aa~AMP (acide aminé skmµ)

- cgP¢ab; acide aminé skmµenHeTAnwg tRNA edIm,IbegáItCa Aminoacyl~tRNA

90
 Formule ATP
NH2

anhydride ester N N
d'acide

OH OH OH N N
O béta-osidique
OH P ~O P ~ O P OH2C
C (H)
O O O

phosphate adénosine
AMP
NH2
Aminoacyl~AMP
N N
anhydride d'acide
acide aminé
OH N N
O
H2N CO ~ O P OH2C
C (H)
CH O

phosphate adénosine
H

C 5'

NH2

O C
N

P OH2C O
O
3' C (H)
O
O OH

NH2
tRNA
N N

A
N N
O
O P OH2C
3' 2' C (H)
O 3'
H2N CO ~O OH

acide aminé
CH
ester sMbUrfamBl
R

dUcenH enzyme Aminoacyl~tRNA synthétase TTYl acide aminé, ATP, tRNA nigRKb;Rbtikmµ
Edl cUlrYmplit Aminoacyl~tRNA edaymineGay acide aminé skmµdac;ecjBI enzyme eLIy.
* Aminoacyl~tRNA synthétase TTYlsÁal; acide aminé: Aminoacyl~tRNA synthétase Ca

91
enzyme manlkçN³edayELkxøaMgNas; eRBaHCadMNak;kalsMxan;kñúgkarsMeyaK
Aminoacyl~tRNA edaymineGaymanxusqÁgeLIykñúgkarTTYlsÁal; aa.

Ex. : Val Rbhak;REhlnwg Ile. ebImankarxusqÁgedayRcLMeGay Val skmµ (Val~AMP) Val

skmµenHminGacP¢ab;eTAnwg tRNA rbs; Ile )aneT KWman enzyme eQµaH Isoleucyl~tRNA

synthétase CaGñkEkkMhuspÞal;enHedayeFVI Hydrolyse Val~AMP enHenAnwg site hyrolytique xusBI

site de synthèse.

* Aminoacyl~tRNA synthétase TTYlsÁal; tRNA : tRNA manGMeBIeTAelI ribosome dUc

enHRtUvmanrcnasm<½n§Rbhak;RbEhlKña. tRNA k_manFatupSMedayELk² edIm,ITTYlsÁal; mYy
Aminoacyl~tRNA synthétase kñúgcMeNam 20 Aminoacyl~tRNA synthétase xus²Kña. RbePTFatu

(élément) Edl Aminoacyl~tRNA synthétase TTYlsÁal;CasMxan;man 2 krNI ³

- FatuEdlvaTTYlsÁal;Ca Anticodon :
Ex : kñúg E-coli eKeXIjman ³ tRNA , tRNA , tRNA , tRNA etc... cMeBaH tRNA man
Gly Lys Arg Met Met

Anticodon Ca 3’UAC5’ CaFatuem (élément majeur) kñúgkarTTYlsÁal; Méthionyl~tRNA

synthétase.

- FatuEdlvaTTYlsÁal;Ca)as1KU (Paire de bases) : cMeBaH tRNA epSgeTótdUcCa ³ tRNA Ser

tRNA rbs; E-coli Anticodon minmanmuxgarsMxan;kñúgkarTTYlsÁal;eday aminoacyl~tRNA

Ala

synthétase eT. kargarRsavRCavrbs;elak Hou et Schimmel (1988) )anbgaðjfakrNI tRNA Ala

KW paire de base GU enATItaMgTI 3 nigTI 70 manmuxgarsMxan;kñúgkarTTYlsÁal; tRNAeday

Alanyl~tRNA synthétase.
Forme en trèfle d'un tRNA
3'
3'
5' CCA
tag Ala
5'
GU(3) GU(70)
GU(70) GU(3)
tRNA

Anticodon
5' 3'

Codon mRNA
Anticodon
tRNA et mRNA sont antiparallèles
Boucle

4.4.3.3- RNA messager (mRNA) : Ca RNA EdlnaMBN’manBI géne rbs; DNA rhUtdl;
92
 Ribosome EdlCakEnøgsMeyaK protéine.
mRNA manGayuxøI (BYk)ak;etrIRbEhl 2-3 naTI BYk eucaryote efrCag 2-3 naTIeTA

2-3 éf¶) tRNA GayuEvgCageRBaHvaGacdwknaM aa )aneRcIndg. dUenH mRNA Føak;cuH (dégrader)

el,ÓnekIneLIg. rcnasm<½n§ mRNA dUc RNA d_éTeTótEdrKWpSMeLIgBImYyExS nucléotide AUCG.
GñknaMsarKW nucléotides (CaBiessKW séquance des bases) EdlmanTRmg;Ca Code < secrer >.
Code nimYy²pSMeLIgBI 3 nucléotides ehA codon. Codon mYy coder edayELkEt acide aminé

mYy. karedaHelxkUt (décodage) rbs; codon EdldwknaMedaymRNARbRBwtþeTAenAnwg ribosome.

Ex : codon AUG mann½yfaP¢ab; Méthionine eTAnwg protéine kMBugsMeyaK, le codon UUU

mann½yfaP¢ab; Phénylalanine eTAnwg protéine kMBugsMeyaK.

4.4.3.4- snRNA (small nuclear RNA) ou RNA nucléaire :
RNA EdlmanmuxgarenAkñúg Excision-épissage nigmanlkçN³edayELkdUcteTA ³
- CamU:elKultUc²pSMeLIgRbEhl 100-300 nucléotides.
- sßitenAkñúg noyau rbs;ekasika Gt;manenAkñg
ú cytoplasme eT.
- FatupSMsm,ÚreTAeday Uracile (UMP).
- vaP¢ab;CamYyRbUetGIunbegáItCa complexes ehA snRNP (small nuclear ribonucleoprotein
particles) ou snurps EdlCam:UelKulskmµ.
snRNP = 1 snRNA + Plusieurs protéines
eTAtamrcnasm<½n§rbs;vaeKeXIjman snRNP eRcInEbb ³ U1, U2, U4, U5, U6 (U : bBa¢ak;fa snRNP
sm,Úr Uracile) .
លរខណ្ោះខុសគ្ននរវាង RNA និង DNA :
1. រ្មវងខលីជាង (70 à 10 000 nucléotides)
2. pentoses: ribose ជារ្ស់ ARN, désoxyribose ជារ្ស់ ADN
3. ជាទូយៅbases azotées l’uracile (U) ជំនួសយោយ thymine (T) ( មត T et hypoxanthine អាចមានយៅ
boucle
រ្ស់ tRNA
4. RNA ជាទូយៅមាន១មខែមតរមនលងខលោះមាន្ំយពញបាសខលីៗយោយសាមាន្ត់ ដូចដយងកៀ្យរៀ្សរ់

FIN

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 Éksareyag

1- Kruh J. Biochimie tome 1. Paris: Hermann, Editeurs des Sciences et Arts ; 1995
2- Figarella J, Zonszain F. Biochimie des aliments.
3- Figarella J, Zonszain F. Biochimie structurale.
4- David JC. Biochimie métabolique.
5- Hebert E. Biochimie.
6- Horton, Moran, Ochs, Rawn, Scrimgeour. Principe de Biochimie.
7- Koolman J, Rohm K H. Atlas de poche de biochimie. Paris: Flammarion Médecine- Sciences;
2004
8- Boulanger P, Polonovski J, Biserte G, Dautrevaux M. Abrégé de biochimie médicale. Tome 1.
Paris: Masson; 1979.

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