Cycle de Krebs

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Licence 2 Médecine dentaire

2022/2023
PLAN
INTRODUCTION
I. ENTREE DU PYRUVATE DANS LE CYCLE
II. ETAPES DU CYCLE
III. BILAN ENERGETIQUE
IV. FONCTIONS
V. REGULATION
VI. ANOMALIES DU CYCLE
CONCLUSION
2
Introduction (1)
q DEFINITION

Ø Cycle des acides tricarboxyliques ou Cycle du


citrate ou Cycle de Krebs;

Ø Voie finale commune de l’oxydation des


molécules énergétiques;

Ø Séquence de réactions enzymatiques dont le


1er substrat régénéré en fin de cycle.

3
Introduction (2)

ØProduction des intermédiaires énergétiques : production


d’ATP dans la chaîne respiratoire.

Ø Point final catabolisme glucides (glycolyse / VPP), des


lipides (β oxydation) et des protides (aa), formation
d’acétyl- coenzyme A.

Ø mitochondries ( animaux); cytoplasme (bactéries).

4
Introduction (3)

Dans les mitochondries conditions aérobies

Acetyl CoA
Energie
CoA
Voie finale commune de l’oxydation des molécules
énergétiques ( acides gras, glucides, acides aminés )

5
Introduction (4)

6
Introduction (5)
q Intérêt

7
I. ENTREE DU PYRUVATE DANS LE CYCLE

8
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (1)
1.Décarboxylation oxydative du Pyruvate en Acetyl-
COA (aérobie)

9
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (2)
2. Complexe Pyruvate Déshydrogénase (1)

10
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (3)
2. Complexe Pyruvate Déshydrogénase (2)
• 3 enzymes
Ø Pyruvate déshydrogénase(enzyme E1)
Ø dihydrolipoyl transacétylase(Enzyme E2)
Ø dihydrolipoyl déshydrogénase (enzyme E3)
• 5 cofacteurs
Ø TPP(thiamine pyrophosphate)
Ø NAD
Ø FAD
Ø Lipoamide
Ø Coenzyme A
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (4)
2. Complexe Pyruvate Déshydrogénase (3)
§ La pyruvate déshydrogénase (enzyme E1),
thiamine pyrophosphate (TPP) : décarboxylation du
pyruvate et transfert du radical obtenu sur le lipoate.

§ La dihydrolipoyl transacétylase (Enzyme E2)


Transfère le radical acétyle du lipoate sur le coenzyme A,
permettant ainsi la libération de l’ acétyl-CoA.
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (5)
2. Complexe Pyruvate Déshydrogénase (4)

§ La dihydrolipoyl déshydrogénase (enzyme E3)


Flavoprotéine oxyde le dihydrolipoate et transfère les
électrons et les protons sur le NAD+.
I. Entrée du pyruvate dans le cycle (6)
3. Mécanisme d’action du complexe
II. ETAPES DU CYCLE DE KREBS
II. Etapes du cycle de KREBS (1)
II. Etapes du cycle de KREBS (2)
1. PREMIERE ETAPE: Formation du Citrate (1)
II. Etapes du cycle de KREBS (3)
1. PREMIERE ETAPE: Formation du Citrate (2)
II. Etapes du cycle de KREBS (4)
2. DEUXIEME ETAPE: Isomérisation du Citrate en
isocitrate (1)
II. Etapes du cycle de KREBS (5)
2. DEUXIEME ETAPE: Isomérisation du Citrate en
isocitrate (2)
II. Etapes du cycle de KREBS (6)
3. TROISIEME ETAPE: Décarboxylation oxydative de
l'isocitrate (1)

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II. Etapes du cycle de KREBS (7)
3. TROISIEME ETAPE: Décarboxylation oxydative de
l'isocitrate (2)
II. Etapes du cycle de KREBS (8)
4. QUATRIEME ETAPE: Décarboxylation oxydative de
l’alpha cetoglutarate en succinyl-COA (1)
II. Etapes du cycle de KREBS (9)
4. QUATRIEME ETAPE: Décarboxylation oxydative de
l’alpha cetoglutarate en succinyl-COA (2)
II. Etapes du cycle de KREBS (10)
5. CINQUIEME ETAPE: Conversion du Succinyl-CoA
en Succinate (1)
§ Liaison thioester très riche en énergie.
à Utilisée pour la synthèse du GTP en présence du
phosphate et du GDP;

§ Réaction catalysée par une succinyl-CoA synthétase,


ou une succinate thiokinase.

§ Formation du succinate oxydé dans la séquence des


réactions terminales du cycle pour régénérer
l’oxaloacétate.
II. Etapes du cycle de KREBS (11)
5. CINQUIEME ETAPE: Conversion du Succinyl-Coa
en Succinate (2)
le GTP est généré à partir du succinyl CoA

ou
II. Etapes du cycle de KREBS (12)
6. Sixième étape : déshydrogenation du
Succinate en fumarate (1)
§ 3e réaction de déshydrogénation.

§ Réaction catalysée par la succinate déshydrogénase à


FAD (une flavoprotéine) comme accepteur des
électrons et des protons.

§ Conduit à la formation d’une double liaison.

§ Succinate oxydé en fumarate.


II. Etapes du cycle de KREBS (13)
6. Sixième étape : déshydrogenation du
Succinate en fumarate (2)
II. Etapes du cycle de KREBS (14)
7. Septième étape : Hydratation du fumarate
et formation du malate
Réaction catalysée par une lyase (hydratase) :
la fumarase ou fumarate hydratase.

Fumarase
II. Etapes du cycle de KREBS (15)
8. Huitième étape: déshydrogenation du malate en
oxaloacetate
II. Etapes du cycle de KREBS (16)
Vue globale du cycle:

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II. Etapes du cycle de KREBS (17)
III. BILAN ÉNERGÉTIQUE
III. Bilan énergétique (1)
§ Deux atomes de carbone entrent dans le cycle sous
forme d’acétyl-CoA et en ressortent sous forme de 2
CO2 ;
§ Quatre paires d'hydrogène sortent du cycle,
trois sous forme de NADH,H+ ,une sous forme
de FADH2 ;
§ Une liaison phosphate riche en énergie sous forme
GTP;
III. Bilan énergétique (2)

§ Régénération du NAD+ et du FAD+ conduit à la


formation de 3ATP et 2ATP respectivement dans la
chaine respiratoire.

( 3x3 ) + ( 2x1 ) + ( 1x1 )=12 ATP


III. Bilan énergétique (3)

q Remarque :
Certaines mesures montrent que l’oxydation de
NADH,H+ correspondrait à 2,5 ATP et celle de
FADH2 à 1,5 ATP.
à bilan énergétique du cycle serait donc 10 ATP
III. Bilan énergétique (4)
III. Bilan énergétique (5)
Bilan énergétique de l’oxydation complète
d’une molécule de glucose

Voie directe Phosphorylation


oxydative
Glycolyse 2 ATP 2 NADH,H+ = 6 ATP
Décarboxylation 2 NADH,H+ = 6 ATP
oxydative
Cycle de Krebs 2 GTP = 2 ATP 6 NADH,H+ = 18 ATP
2 FADH2 = 4 ATP
4 ATP 34 ATP
TOTAL 38 ATP
IV. FONCTIONS
IV. Fonctions (1)
ØRôle de production d’énergie:
Formation de cofacteurs réduits riches en énergie,
NADH,H+ et FADH2 pour la synthèse de l’ ATP.
Ø Génération de précurseurs biosynthétiques:

Intermédiaires pour la synthèse de molécules


essentielles.
IV. Fonctions (2)

acides α-cétoniques

acides aminés

synthèse des protéines


IV. Fonctions (3)

Ø Citrate : précurseur de la synthèse acides gras;

Ø Malate : précurseur de la synthèse de glucose


par la voie de la néoglucogenèse.
IV. Fonctions (4)

Ø Autres fonctions cataboliques :

Production intermédiaires du cycle

processus de renouvellement des structures.

nature amphibolique de ce cycle

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CYCLE DE KREBS: AUTRES FONCTIONS
V. RÉGULATION
V. Régulation (1)
Trois principes gouvernent la régulation du cycle

Ø Disponibilité en substrats énergétiques


(glucose, pyruvate, acétyl-CoA)

Ø Inhibition par les produits accumulés :


régulation allostérique

Ø Régulation en amont au niveau du complexe


multi-enzymatique de la pyruvate DH.
V. Régulation (2)
Ø Disponibilité des substrats
Fonctionnement coordonné entre le cycle de Krebs
et la glycolyse;

ü Certains produits leur sont communs( ATP,


NADH,H+) et contribuent à leur régulation;

ü Activité de la citrate synthase limitée par


disponibilité de l’OA et acétylCoA.
V. Régulation (3)
Ø Régulation allostérique interne au cycle
Dans les conditions où les besoins énergétiques de la
cellule sont satisfaits.

ü Accumulation NADH,H+ entraînant élévation du


rapport NADH,H+/NAD+.
blocage à la fois de l’isocitrate DH et l’a-cétoglutarate
DH.

ü L’ ATP inhibe citrate synthase et l’a-cétoglutarate DH.


L’inhibition de la citrate synthase par l’ATP est levée par
l’ADP.
V. Régulation (4)
Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (1)
Régulation en amont au niveau du complexe
multienzymatique( PDH)
ü Conversion pyruvate en acetyl CoA est une réaction
irréversible
ü Elle engage 2 voies:
- Celle de l’oxydation complète en CO2 avec production
d’énergie;
- Celle de la transformation en acides gras (lipogenèse).
V. Régulation (5)

Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (2)


Deux modes interviennent :
§ Rétro-inhibition

L’activité de la PDH peut être directement affectée


par l’accumulation des deux produits de la séquence
catalysée par le complexe multi-enzymatique à
savoir l’acétyl- CoA et le NADH,H+.
V. Régulation (6)
Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (3)

§ Régulation par phosphorylation


/déphosphorylation
L’enzyme peut exister sous deux formes : une forme

active (PDH déphosphorylée),et une forme inactive


(PDH phosphorylée).
V. Régulation (7)
Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (3)

Rapports ATP/ADP; NADH,H+/NAD+; Acétyl


CoA/CoA élevés

Activation pyruvate DH kinase( PDH Kinase)


à Phosphorylation de la PDH
V. Régulation (8)
Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (4)

ü Autres effecteurs positifs de la PDH phosphatase


à insuline, Ca2+ et Mg2+

ü Effecteurs positifs de la PDH kinase sont des


effecteurs négatifs de la PDH phosphatase et
vice versa.
V. Régulation (9)
Ø Régulation au niveau de la Pyruvate DH (5)

50
V. Régulation (10)
Inhibiteurs du cycle de Krebs

ØFluoroacétate : blocage du passage du


citrate à l’isocitrate;
ØArsénic : blocage passage de l’αKG au succinyl
CoA;
ØMalonate : blocage passage du succinate au
fumarate.
VI. ANOMALIES DU CYCLE
VI. Anomalies du cycle (1)

• Tout déficit enzymatique entraine un blocage du


cycle et une accumulation de métabolites en
amont;

• PDH: enzyme clé dans le démarrage du cycle un


déficit même partiel entraine des perturbations
dans le métabolisme de l’organisme.
VI. Anomalies du cycle (2)
q PATHOLOGIES LIEES AUX DEFICIENCES EN PDH

ü Première cause d’acidose lactique congénitale


primitive;

ü En cas de déficit, la glycolyse anaérobie reste la


seule voie de production de l’énergie à partir du
glucose

ü Proportion faible/ énergie susceptible d’être


VI. Anomalies du cycle (3)
q PATHOLOGIES LIEES AUX DEFICIENCES EN PDH
ü Blocage de la transformation du pyruvate en
acétyl-CoA;
ü Ce dernier substrat, nécessaire ne peut ainsi être
fourni que par les corps cétoniques et par la b-
oxydation des acide gras;
ü Les sources d’ ATP sont donc limitées surtout au
niveau du système nerveux central où l’activité
de PDH est la plus forte.
VI. Anomalies du cycle (4)
q PATHOLOGIES LIEES AUX DEFICIENCES EN PDH

Le déficit en activité de PDH est une des causes


majeures de perturbation du métabolisme
énergétique chez l’enfant. Il provoque :
Ø Une augmentation anormale du lactate dans
le sang et le liquide céphalo-rachidien,
Ø Un développement anormal du système
nerveux central.
Conclusion
ü Voie finale de métabolisme;
ü Rôle amphibolique;
ü Source d’énergie de l’organisme;
ü Régulation à plusieurs niveaux;
ü Perturbations de la régulation peuvent entrainer
des anomalies.
MERCI DE VOTRE AIMABLE
ATTENTION

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