NNT/NL : 0000AIXM0000/000ED000

THÈSE DE DOCTORAT
Soutenue à Aix-Marseille Université
le 09 novembre 2021 par

Lauren PERIERES
Epidémiologie de l’hépatite B chez les
enfants au Sénégal

Discipline Composition du jury

Biologie santé
Christian LAURENT Rapporteur
Spécialité IRD UMI 233 TransVIHMI, Montpellier
Recherche clinique et Santé Publique
Christian PRADIER Rapporteur
École doctorale
Centre Hospitalier Universitaire de Nice
ED 62 – Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire Maud LEMOINE Examinatrice
UMR 257 VITROME (Vecteurs – Infections Imperial College London
Tropicales et Méditerranéennes) Valériane LEROY Examinatrice
UMR 1295 CERPOP, Toulouse

Stéphanie GENTILE Présidente du jury

Aix-Marseille Université

Cheikh SOKHNA Directeur de thèse

UMR 257 VITROME, Marseille

Sylvie BOYER Co-directrice de thèse

UMR 1252 SESSTIM, Marseille
Affidavit

Je soussigné, Lauren Périères, déclare par la présente que le travail présenté dans ce
manuscrit est mon propre travail, réalisé sous la direction scientifique de Cheikh Sokhna
et Sylvie Boyer, dans le respect des principes d’honnêteté, d'intégrité et de responsabilité
inhérents à la mission de recherche. Les travaux de recherche et la rédaction de ce
manuscrit ont été réalisés dans le respect à la fois de la charte nationale de déontologie
des métiers de la recherche et de la charte d’Aix-Marseille Université relative à la lutte
contre le plagiat.
Ce travail n'a pas été précédemment soumis en France ou à l'étranger dans une version
identique ou similaire à un organisme examinateur.

Fait à Marseille, le 3 septembre 2021

Cette œuvre est mise à disposition selon les termes de la Licence Creative
Commons Attribution - Pas d'Utilisation Commerciale - Pas de Modification 4.0
International.

2
Résumé

Contexte : L’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a fixé l’objectif d’éliminer l’hépatite

B d’ici 2030. L’Afrique sub-Saharienne (ASS) est l’une des régions la plus touchée, et
l’élimination de l’hépatite B dans cette région repose sur la prévention de l’infection chez
les jeunes enfants. En effet, l’infection à un jeune âge est le principal facteur de
progression vers l’infection chronique et le cancer du foie et en ASS, le virus de l’hépatite
B (VHB) se transmet principalement pendant l’enfance. Au Sénégal, pays visant à éliminer
l’hépatite B, il n’existe aucune donnée sur l’épidémiologie de l’infection chez les enfants
en population générale et en zone rurale. Dans ce contexte, des données épidémiologiques
dans cette population sont nécessaires.

Objectifs : L’objectif principal de cette thèse est de décrire l’épidémiologie de l’hépatite B

chez les enfants nés après l’introduction du vaccin contre l’hépatite B au Sénégal. Cet
objectif principal est décliné en quatre objectifs spécifiques :

1) Estimer la prévalence de l’infection chronique par le VHB en population

générale et selon les groupes d’âge, et les besoins en traitement
2) Identifier les facteurs associés à une infection par le VHB chez les enfants
3) Estimer la couverture vaccinale contre l’hépatite B chez les enfants et les
facteurs associés au non-respect du schéma vaccinal (schéma incomplet ou
doses non administrées dans les délais)
4) Identifier les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants et
adolescents en ASS

Sources de données : Ce travail de recherche s’appuie sur les données du projet AmBASS
(ANRS 12356), une enquête transversale sur l’ampleur et les conséquences de l’infection
chronique par le VHB menée d’octobre 2018 à mai 2019 à Niakhar, au Sénégal. De plus,
une revue systématique de la littérature a été effectuée en utilisant les bases de données
PubMed, Web of Science, PsycINFO, African Index Medicus et African Journals Online.

Résultats : La prévalence de l’infection chronique par le VHB était de 6.9% [Intervalle de

confiance à 95% : 5.6-8.1] dans la population générale de la zone de Niakhar.
D’importantes différences selon les groupes d’âge ont été observées : la prévalence était
très basse chez les enfants de moins de cinq ans (<1%), mais élevée chez les adultes nés
avant l’introduction du vaccin contre le VHB (>10%). Les analyses ont mis en évidence
que les enfants plus âgés, ayant un tatouage, ayant eu des points de suture, ayant un frère
ou une sœur infecté(e) par le VHB et les enfants nés à domicile présentaient un risque
plus important d’être infecté par le VHB.
Malgré une augmentation de la couverture de la dose à la naissance chez les enfants
nés ≥2016 (67% en 2017-2018), près de la moitié n’avait pas reçu ≥3 doses selon le
3
schéma vaccinal recommandé par l’OMS. Plusieurs facteurs, incluant la naissance à
domicile, la naissance pendant la saison sèche et la distance éloignée au poste de santé,
étaient associés au non-respect du schéma vaccinal. La revue de la littérature a également
permis d’identifier les raisons de vaccination incomplète des enfants et adolescents en
ASS. Celles-ci étaient principalement liées aux contraintes de temps des parents, à leurs
croyances et leurs connaissances vis-à-vis de la vaccination, ainsi qu’à l’organisation des
services de vaccination.

Conclusion : Les résultats de cette thèse fournissent les premières données

épidémiologiques sur l’infection par le VHB chez les enfants en population générale au
Sénégal. Ces résultats montrent le succès du programme de vaccination contre l’hépatite
B et suggèrent que le pays est proche d’atteindre l’objectif de l’OMS d’une réduction de
l’incidence de l’infection chronique par le VHB de 90% d’ici 2030. Par ailleurs, des
interventions pour améliorer et renforcer les mesures de prévention et de contrôle de
l’infection sont proposées.

Mots-clés : hépatite B, épidémiologie, enfants, vaccination, Sénégal

4
Abstract

Background: The World Health Organisation (WHO) has set the goal of eliminating
hepatitis B by 2030. Sub-Saharan Africa (SSA) is one of the most affected regions, and
elimination of hepatitis B in this region relies on the prevention of infection in young
children. Indeed, infection at a young age is associated with a higher risk of progression
to chronic infection and liver cancer and in SSA, hepatitis B virus (HBV) is mainly
transmitted during childhood. In Senegal, a country aiming to eliminate hepatitis B, there
are no data on the epidemiology of HBV in children in the general population, and in rural
areas. In this context, epidemiological data in this population are needed.

Objectives: The main objective of this thesis is to describe the epidemiology of hepatitis B
in children born after the introduction of the hepatitis B vaccine in Senegal. This main
objective is broken down into four specific objectives:

1) Estimate the prevalence of chronic HBV infection in the general population and
according to age groups, as well as treatment needs
2) Identify the factors associated with HBV infection in children
3) Estimate hepatitis B vaccination coverage in children and the factors
associated with non-adherence to the vaccination schedules (incomplete or
untimely vaccination)
4) Identify the reasons of non-vaccination and under-vaccination of children and
adolescents in SSA

Data sources: This research is based on data from the AmBASS project (ANRS 12356), a
cross-sectional survey on the burden and impact of chronic HBV infection in rural Senegal,
conducted from October 2018 to May 2019 in Niakhar, Senegal. In addition, a systematic
review of the literature was performed using PubMed, Web of Science, PsycINFO, African
Index Medicus and African Journals Online databases.

Results: The prevalence of chronic HBV infection was 6.9% [95% confidence interval: 5.6-
8.1] in the general population of the Niakhar area. The prevalence varied markedly
according to age group: the prevalence was very low in children under five (<1%), but
high in adults born before the introduction of the HBV vaccine (>10%). Analyses showed
that older age, tattoos, stitches, home birth, and having a sibling infected with HBV were
associated with HBV infection in children.
Despite an increase in birth dose vaccine coverage in children born ≥2016 (67% in
2017-2018), nearly half did not receive ≥3 doses according to the WHO-recommended
schedule and several factors, including home birth, birth during the dry season, and living
far from a healthcare post, were associated with non-adherence to the vaccination
5
schedule. Reasons for incomplete vaccination of children and adolescents in SSA were
identified in the literature review. These were mainly related to parents’ time constraints,
their beliefs and knowledge about vaccination, as well as the organisation of vaccination
services.

Conclusion: The results of this thesis provide the first epidemiological data on HBV
infection in children in the general population in Senegal. These results show the success
of the hepatitis B vaccination program and suggest that the country is close to meeting the
WHO’s target of reducing the incidence of chronic HBV infection by 90% by 2030. In
addition, interventions to improve and strengthen HBV prevention and control measures
are suggested.

Key words : hepatitis B, epidemiology, children, vaccination, Senegal

6
Remerciements

Qu’il me soit d’abord permis d’avoir une pensée particulière envers Yolande Obadia
pour m’avoir incitée à entreprendre un travail de thèse immédiatement après mon master
puis présentée aux équipes de VITROME et du SESSTIM, ainsi que pour sa bienveillante
attention et ses encouragements au cours de ces trois années.

Mes remerciements vont tout spécialement à Cheikh Sokhna qui a accepté de diriger ce
travail de thèse, qui m’a fait confiance et laissé beaucoup d’autonomie pour mener à bien
ce projet, tout en sachant être présent dans les moments cruciaux. Merci de m’avoir
accueillie au sein de l’équipe de VITROME à Dakar.

J’adresse également mes sincères remerciements à Sylvie Boyer, qui a co-dirigé cette
thèse. Malgré la distance, j’ai toujours pu compter sur son aide et sa réactivité. Sa rigueur
scientifique et ses relectures attentives m’ont permis de structurer mes réflexions
scientifiques et d’améliorer ce travail.

Mes remerciements à Fabienne Marcellin et Camelia Protopopescu pour leur appui

méthodologique et statistique, ainsi que pour leurs relectures attentives des articles. Je
remercie aussi Patrick Peretti-Watel d’avoir supervisé ma revue systématique de la
littérature.

Je souhaite remercier particulièrement Philippe Parola, directeur de VITROME, de

m’avoir permis d’effectuer ma thèse au sein de son équipe et de m’avoir intégrée à
d’autres travaux de recherche de l’unité.

Je remercie vivement les membres extérieurs de mon jury de thèse pour leur
disponibilité et l’intérêt qu’ils ont bien voulu porter à ce travail : Stéphanie Gentile,
Christian Laurent, Maud Lemoine, Valériane Leroy et Christian Pradier. C’est un honneur
pour moi de pouvoir bénéficier d’un entourage d’une telle qualité pour juger de mon
travail, et vos observations et suggestions contribueront à son amélioration.

Mes remerciements vont également aux membres extérieurs de mon comité de thèse :
Philippe Colson, Antoine Jaquet, et Maud Lemoine pour leurs précieux conseils.

Merci à l’Institut de Recherche pour le Développement d’avoir financé le contrat qui

m’a permis d’être affectée à l’équipe de VITROME à Dakar pendant la durée de ma thèse.

J’adresse mes remerciements à toute l’équipe du projet AmBASS sans qui ce travail
n’aurait pas pu se concrétiser, en particulier : Aldiouma Diallo, Elhadji Ba, Marion Coste,

7
Morgane Bureau, Bilal Faye, Baba Sow, Marie Nishimwe, Gwenaelle Maradan, les équipes
partenaires de l’IRESSEF et de l’Hôpital Européen. Je tiens à remercier toute l’équipe
terrain pour leur travail de qualité et tous les moments partagés à Niakhar : Assane
Ndiaye, Assane Diouf, Fatima Sène, Khadija Ba Gaye, Fadiène Ndiaye, Khadim Gueye,
Ibrahima Ndaw, Modou Diome, Ndèye Selbé Diouf, Moussa Gueye, Mayé Ndour, Coumba
Sandiane Sène, Assane Faye et Etienne Silmang Ndong. Un grand merci à tous les
participants du projet AmBASS et aux personnels de santé de la zone de Niakhar.

Mes remerciements vont aussi aux membres l’équipe de VITROME à Dakar et aux
autres membres du campus de l’Institut de Recherche pour le Développement pour leur
accueil chaleureux. Mes remerciements vont aussi aux membres de l’équipe VITROME à
Marseille, et en particulier à Sacy Nadaradjane pour son appui administratif et sa
bienveillance tout au long de cette thèse.

J’adresse également mes remerciements à l’ensemble de l’équipe SanteRCom du

SESSTIM pour leur accueil lors de mes séjours à Marseille, j’ai pris un réel plaisir à
travailler au sein de votre équipe.

Enfin, je souhaite remercier de tout cœur mes proches pour leur soutien sans failles et
leurs encouragements. Merci à mes cousines, mes cousins, mes amies et mes amis d’avoir
toujours été présents, à mes côtés de près ou de loin, que ce soit dans la vie quotidienne,
les sorties de surf, d’escalade, ou autour d’un bon repas, … merci de m’avoir permis de me
sentir toujours chez moi aussi bien à Dakar qu’à Marseille ! Enfin, merci à mes parents,
d’avoir été présents à chaque instant et de m’avoir toujours encouragée et soutenue.

8
Table des matières

Affidavit 2
Résumé 3
Abstract 5
Remerciements 7
Table des matières 9
Liste des tableaux et figures 11
Définition des sigles et abréviations 12
Valorisation scientifique 13
Introduction 15
1. Contexte 17
1.1. Epidémiologie de l’hépatite B en Afrique sub-Saharienne 17
1.1.1. Poids de l’hépatite B 17
1.1.2. Principaux modes de transmission en Afrique sub-Saharienne 19
1.2. Mesures de contrôle de l’hépatite B 22
1.2.1. Prévention 22
1.2.2. Dépistage et traitement 27
1.3. La réponse de l’Organisation Mondiale de la Santé en Afrique 29
1.4. Etat des lieux et enjeux du contrôle de l’hépatite B en Afrique sub-Saharienne
32
1.4.1. Etat des lieux de l’élimination de l’hépatite B 32
1.4.2. Enjeux du contrôle de l’hépatite B 33
1.5. Contexte de l’hépatite B au Sénégal 37
1.5.1. Epidémiologie de l’hépatite B 37
1.5.2. La lutte contre l’hépatite B 38
2. Justification et objectifs de la recherche 41
2.1. Problématique 41
2.2. Objectifs de recherche 42
3. Méthodes 45
3.1. L’étude AmBASS (ANRS 12356) 45
3.1.1. Objectifs de l’étude 45
3.1.2. Schéma de l’étude 46
3.1.3. Lieu de l’étude 47
3.1.4. Population d’étude et sélection des participants 48
3.1.5. Recueil de données 50
3.1.6. Gestion des données 54
3.1.7. Contribution personnelle à la collecte de données 54

9
 3.2. Utilisation des données AmBASS 55
3.2.1. Données AmBASS utilisées 55
3.2.2. Analyses statistiques 57
3.3. Revue systématique de la littérature 58
4. Résultats 60
4.1. Article 1 – Hépatite B au Sénégal : Succès du programme de vaccination mais un
besoin urgent d’améliorer l’accès au dépistage et au traitement à grande échelle 60
4.2. Article 2 – Le statut VHB de la fratrie, la naissance à domicile, les tatouages et
les points du suture sont des facteurs de risque de l’infection par le VHB chez les enfants
Sénégalais : Une enquête transversale 79
4.3. Article 3 – Vaccination contre l’hépatite B chez les enfants Sénégalais :
Couverture vaccinale, délais de vaccination et déterminants socio-démographiques du non-
respect des schémas vaccinaux (ANRS 12356) 91
4.4. Article 4 – Raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants et
adolescents en Afrique sub-Saharienne : Une revue systématique de la littérature 110
5. Discussion 134
5.1. Synthèse des résultats 134
5.2. Forces et limites des études réalisées 135
5.2.1. Forces 135
5.2.2. Limites 136
5.3. Implications en santé publique 137
5.3.1. Vers l’élimination de l’hépatite B : Le succès de la vaccination chez les enfants
137
5.3.2. Renforcer la prévention de l’hépatite B 138
5.3.3. Mettre à niveau le dépistage, les soins et le traitement de l’hépatite B 145
5.4. Perspectives de recherche 147
Conclusion générale 148
Bibliographie 149
Annexes 160
A. Rappels sur l’hépatite B : histoire naturelle et complications 160
B. Dépistage de l’hépatite B 164
C. Annexes article 1 165
D. Annexes article 2 168
E. Annexes article 3 173
F. Annexe article 4 179

10
Liste des tableaux et figures

Tableau 1. Indications au traitement antiviral selon les recommandations de l’OMS ...... 28

Tableau 2. Cibles pour l’élimination de l’hépatite B en Afrique d’ici 2030 ............................ 31
Tableau 3. Marqueurs biologiques du projet AmBASS (ANRS 12356) .................................... 51
Tableau 4. Données cliniques du projet AmBASS (ANRS 12356) .............................................. 51
Tableau 5. Données du questionnaire cuisine (AmBASS ANRS 123456) ............................... 52
Tableau 6. Données du questionnaire adulte (nés avant le 1 septembre 2003) (AmBASS
ANRS 12356) .................................................................................................................................................. 53
Tableau 7. Données du questionnaire enfant (nés après le 1 septembre 2003) (AmBASS
ANRS 12356) .................................................................................................................................................. 53
Tableau 8. Données AmBASS (ANRS 12356) utilisées pour la thèse ....................................... 56

Figure 1. Prévalence de l’AgHBs dans le monde en population générale en 2016 ............. 17

Figure 2. Prévalence de l’AgHBs dans le monde chez les enfants de cinq ans en 2016 .... 18
Figure 3. Les trois phases de l’étude AmBASS – ANRS 12356 .................................................... 46
Figure 4. Carte du Sénégal et de l'observatoire de démographie et de santé de Niakhar 47

11
Définition des sigles et abréviations

Ac anti-HBc Anticorps anti-HBc

Ac anti-HBs Anticorps anti-HBs
AgHBe Antigène HBe
AgHBs Antigène de surface de l’hépatite B
ALAT Alanine aminotransférase
APRI AST to platelet ratio index
aOR Odds ratio ajusté
ASAT Aspartate aminotransférase
ASS Afrique sub-Saharienne
DBS Dried blood spot
IC Intervalle de confiance
IRD Institut de Recherche pour le Développement
IRESSEF Institut de Recherche En Santé de Surveillance Epidémiologique et de
Formation
LSN Limite supérieure de la normale
NFS Numération de formule sanguine
OMS Organisation Mondiale de la Santé
OR Odds ratio
PEV Programme Elargi de Vaccination
PNLH Programme National de Lutte contre les Hépatites
SESSTIM Sciences Economiques et Sociales de la Santé et Traitement de
l’Information Médicale
TME Transmission mère-enfant
TP Taux de prothrombine
TREAT-B Treatment elibility in Africa for the hepatitis B virus
UMR Unité mixte de recherche
VHB Virus de l’hépatite B
VHC Virus de l’hépatite C
VIH Virus de l'immunodéficience humaine
VITROME Vecteurs – Infections Tropicales et Méditerranéennes

12
Valorisation scientifique

1. Articles sur le sujet de thèse

Lauren Périères, Fabienne Marcellin, Gora Lo, Camelia Protopopescu, El Hadji Ba, Marion
Coste, Coumba Touré Kane, Gwenaëlle Maradan, Aldiouma Diallo, Cheikh Sokhna, Sylvie
Boyer. Hepatitis B Vaccination in Senegalese Children: Coverage, Timeliness, and
Sociodemographic Determinants of Non-Adherence to Immunisation Schedules (ANRS
12356 AmBASS Survey). Vaccines (Basel). 2021 May 15;9(5):510. doi:
10.3390/vaccines9050510.

Lauren Périères, Camelia Protopopescu, Gora Lo, Fabienne Marcellin, El Hadji Ba, Marion
Coste, Coumba Touré Kane, Aldiouma Diallo, Cheikh Sokhna, Sylvie Boyer. Sibling status,
home birth, tattoos and stitches are hepatitis B virus infection risk factors in Senegalese
children: a cross-sectional study. J Viral Hepat. 2021 Aug 6. doi: 10.1111/jvh.13589.

Lauren Périères, Aldiouma Diallo, Fabienne Marcellin, Marie Libérée Nishimwe, El Hadji
Ba, Marion Coste, Gora Lo, Philippe Halfon, Coumba Touré Kane, Gwenaëlle Maradan,
Patrizi Carrieri, Assane Diouf, Yusuke Shimakawa, Cheikh Sokhna, Sylvie Boyer. Hepatitis
B in Senegal: Successful infant vaccination program but urgent need to scale up screening
and treatment (ANRS 12356) [soumis à BMJ Global Health]

Lauren Périères, Valérie Séror, Patrick Peretti-Watel. Reasons given for non-vaccination
and under-vaccination of children and adolescents in sub-Saharan Africa: A systematic
review [en cours de finalisation]

2. Articles hors du sujet de thèse

Ndiaw Goumballa, Van Thuan Hoang, Lauren Périères, Tran Duc Anh Ly, Papa
Mouhamadou Gaye, Fatou Samba Diouf, Philippe Parola, Cheikh Sokhna, Philippe Gautret.
Respiratory infections among pilgrims at the Grand Magal of Touba: A comparative cohort
controlled survey. Travel Med Infect Dis. 2021 Jun 4;43:102104. doi:
10.1016/j.tmaid.2021.102104.

Patrick Peretti-Watel, Sébastien Cortaredona, Ndiaw Goumballa, Lauren Périères,

Philippe Parola, Valérie Séror, Philippe Gautret, Cheikh Sokhna. Risk perceptions of
infectious diseases at the Grand Magal of Touba. A pilot study in two Senegalese villages.
Travel Med Infect Dis. Nov-Dec 2020; 38:101767. doi:10.1016/j.tmaid.2020.101767. Epub
2020 Jun 3.

13
Ndiaw Goumballa, Van Thuan Hoang, Lauren Périères, Philippe Parola, Cheikh Sokhna,
Philippe Gautret. Lack of Neisseria meningitidis among pilgrims during the 2017, 2018
and 2019 Grand Magal of Touba, Senegal. Clin Microbiol Infect. 2020 Dec;26(12):1697-
1698. doi: 10.1016/j.cmi.2020.06.010. Epub 2020 Jun 21.

Tchadine Djaogol, Fabienne Marcellin, Lauren Périères, Gora Lo, Maria Patrizia Carrieri,
Aldiouma Diallo, Sylvie Boyer. Hepatitis B prevention, care, and treatment needs in
women in rural West African women (ANRS 12356 AmBASS survey, Senegal) [soumis à
Liver International]

3. Communications orales sur le sujet de thèse

Lauren Périères, Coste M, Ndiour S, Halfon P, Sokhna C, Ba E, Diallo A, Boyer S. Hepatitis

B vaccination status and vaccine immune response among children in rural Senegal. 12th
European Public Health Conference. 20-23 Nov 2019. Marseille, France

Lauren Périères, Marion Coste, Samba Ndiour, Halfon P, Sokhna C, Ba E, Diallo A, Boyer S.
Impact de l’introduction du vaccin contre l’hépatite B dans le Programme Elargi de
Vaccination sur l’épidémiologie de l’infection chez les enfants dans la zone de Niakhar,
Sénégal. 10e Conférence Internationale Francophone VIH Hépatite Santé Sexuelle. 19-22
Avr 2020. Dakar, Sénégal.

Lauren Périères, Marion Coste, Samba Ndiour, Philippe Halfon, Cheikh Sokhna , Elhadji
Ba, Aldiouma Diallo, Sylvie Boyer. Statut vaccinal et immunité vaccinale contre l’hépatite
B chez les enfants. XXI èmes Journées de Gastroentérologie d'Afrique Francophone ; II
èmes Journées de la Société Sénégalaise de Gastroentérologie et d'Hépatologie. 28-30 Nov
2019. Dakar, Sénégal

4. Communication affichée sur le sujet de thèse

Assane Diouf, Lauren Périères, Marion Coste, Elhadji Ba, Gora Lo, Sylvie Boyer, Aldiouma
Diallo. Caractéristiques cliniques et biologiques des porteurs chroniques du virus de
l’hépatite B en population générale à Niakhar au Sénégal. 10e Conférence Internationale
Francophone VIH Hépatite Santé Sexuelle. 19-22 Avr 2020. Dakar, Sénégal.

14
Introduction

D’après les dernières estimations de l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), 296

millions d’individus étaient infectés par le virus de l’hépatite B (VHB) en 2019.1 Au niveau
mondial, la mortalité liée au VHB cette même année représentait 820 000 décès,
principalement par cirrhose ou par carcinome hépatocellulaire1 ; elle était supérieure à
celle du virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et du paludisme (680 0001 et 409
0002 respectivement) mais inférieure à celle liée à la tuberculose (1.4 millions3).
L’hépatite B est particulièrement endémique en Afrique, avec 82 millions de personnes
infectées, 990 000 nouvelles infections et 80 000 décès par an.1

En Afrique sub-Saharienne (ASS), le poids de l’hépatite B est principalement dû à des

infections acquises pendant l’enfance. Dans cette région, le VHB est en effet
principalement transmis pendant l’enfance via la transmission horizontale et la
transmission périnatale, et le jeune âge au moment de l’infection est l’un des principaux
facteurs de progression vers l’infection chronique et les complications liées à l’hépatite
B.4–6
Ainsi, la prévention du VHB chez les enfants représente un enjeu primordial pour
contrôler l’hépatite B sur le long-terme dans cette région. La vaccination à la naissance
suivie d’un schéma vaccinal multidoses, ainsi que le dépistage des femmes enceintes et la
mise sous traitement antiviral des mères infectées constituent des interventions clés pour
réduire l’infection chez les enfants.

Dans le cadre du Programme de Développement Durable à l’horizon 2030, l’Assemblée

Mondiale de la Santé a adopté la Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite
virale 2016-2021, visant à éliminer l’hépatite B en tant que problème de santé publique.7
Bien que cette stratégie ait été approuvée et adoptée par les états membres de l’OMS en
Afrique, le continent est particulièrement en retard pour enrayer l’épidémie. Les enjeux
majeurs concernent la mise en œuvre effective des mesures de la prévention de la
transmission mère-enfant (TME), la couverture vaccinale (≥3 doses de vaccin), et
l’accroissement des taux de dépistage et de mise sous traitement.

Au Sénégal, pays où l’hépatite B est endémique, les données sur cette infection
proviennent majoritairement d’études en milieu urbain parmi des population d’adultes
spécifiques ou à risque. Afin d’informer et/ou d’orienter les politiques de santé publique
nationales visant à éliminer l’hépatite B d’ici 2030, des données épidémiologiques chez
les enfants en population générale et en milieu rural sont nécessaires.
Ainsi, ce travail de thèse a pour objectif de décrire l’épidémiologie de l’hépatite B chez
les enfants nés après l’introduction du vaccin contre l’hépatite B au Sénégal. Pour ce faire,

15
cette thèse s’appuie sur les données du projet AmBASS (ANRS 12356), une enquête
transversale sur l’ampleur et les conséquences de l’infection chronique par le VHB à
Niakhar, au Sénégal.

La première partie de cette thèse présente le contexte de la recherche en offrant un

aperçu de l’épidémiologie et du contrôle de l’hépatite B en ASS et au Sénégal.
La deuxième partie est consacrée aux objectifs de la thèse.
La troisième partie présente la méthodologie de la recherche.
Dans la quatrième partie, les résultats obtenus sont présentés sous forme de quatre
articles scientifiques publiés ou soumis dans des revues internationales à comité de
lecture.
Enfin, la cinquième partie est consacrée à la discussion générale des résultats et
présente les perspectives offertes par ces travaux.

16
1. Contexte

1.1. Epidémiologie de l’hépatite B en Afrique

sub-Saharienne
1.1.1. Poids de l’hépatite B
1.1.1.1. Population générale

L’infection par le VHB est un problème de santé publique majeur, affectant 296 millions
d’individus (soit 3.8% de la population mondiale).1 Cependant, l’infection est inégalement
répartie dans le monde (voir figure 1). L’Afrique est la région la plus touchée (82 millions
d’individus infectés) après le Pacifique occidental (116 millions).1 Les sous-régions
d’Afrique Centrale et de l’Ouest sont particulièrement concernées, avec une prévalence de
l’antigène de surface de l’hépatite B (AgHBs) en population générale de 10.1% et de 9.8%
respectivement.8 L’hépatite B est endémique (prévalence en population générale ≥8%9)
en République centrafricaine (12.1%), au Nigeria (11.2%), au Tchad (10.5%), au Ghana
(10.3%), en Angola (10.2%), en Mauritanie (9.3%), en Côte d’Ivoire (8.9%) et au Sénégal
(8.1%).8 Selon les estimations de 2019, 990 000 personnes en Afrique contractaient une
nouvelles infection par le VHB chaque année.1

Figure 1. Prévalence de l’AgHBs dans le monde en population générale en 2016

Source : Observatoire Polaris8

17
 Les complications liées à une infection chronique par le VHB (ex : cirrhose, carcinome
hépatocellulaire) entrainent une charge de morbidité et une mortalité importante en ASS.
En 2019, l’infection par le VHB a causé 2 938 516 Disability Adjusted Life Years en
Afrique.10 Dans la région, la prévalence de la cirrhose varie de 4 à 13% chez les individus
AgHBs-positif sans traitement11 et le cancer du foie est le quatrième cancer avec
l’incidence la plus élevée (deuxième chez les hommes et quatrième chez les femmes). 12
L’infection chronique par le VHB est la cause principale de carcinome hépatocellulaire en
ASS ; 50-60% des patients avec un carcinome hépatocellulaire sont AgHBs-positifs.13
En terme de mortalité, l’hépatite B a causé 80 000 (Intervalle de confiance [IC] à 95%,
47 000-110 000] décès en 20201 et 2 890 401 années de vie perdues10 en 2019 en Afrique.
Le cancer du foie est le troisième cancer avec la mortalité la plus élevée sur le continent.12
Néanmoins, le véritable fardeau des complications liées à l’infection par le VHB est sous-
estimé. En effet, la cause virale d’une cirrhose ou d’un carcinome hépatocellulaire chez les
patients avec des stades avancés d’infection par le VHB est rarement renseignée sur les
certificats de décès.14
Les rappels sur l’histoire naturelle et les complications liées au VHB sont présentés
dans l’Annexe A.

1.1.1.2. Enfants

La distribution géographique de l’hépatite B chez les enfants est similaire à celle en

population générale (voir figure 2).5 Cependant, la prévalence chez les enfants est
nettement plus faible qu’en population générale et illustre le succès des mesures de
prévention du VHB au cours des dernières décennies, en particulier la mise en place de la
vaccination.8,15 La prévalence de l’hépatite B chez les enfants est la plus élevée en Afrique
(autour de 3%14), en particulier en Afrique de l’Ouest (5.8%, IC à 95% 5.2-6.7).8
Le risque de développer des complications liées au VHB et de décès chez les enfants
sont très faibles.16

Figure 2. Prévalence de l’AgHBs dans le monde chez les enfants de cinq ans en 2016

Source: Observatoire Polaris8

18
 1.1.2. Principaux modes de transmission en Afrique
sub-Saharienne
Le VHB se transmet par l’exposition des muqueuses ou de la peau lésée à du sang d’une
personne infectée ou d’autres fluides corporels contaminés, tels que la salive, le liquide
séminal, les sécrétions vaginales et l’exsudat d’une plaie.17 Le VHB est très contagieux et
sa concentration est plus élevée dans le sang et l’exsudat des plaies. La concentration du
virus est modérée dans le liquide séminal et les sécrétions vaginales, et basse dans la
salive.18 Le VHB peut survivre à l’extérieur de l’organisme et rester infectieux pendant au
moins sept jours.19
Les principaux modes de transmission du VHB sont la transmission: (i) périnatale de
la mère à l’enfant, (ii) horizontale (surtout entre enfants de jeune âge), (iii) sexuelle ; (iv)
iatrogène via l’exposition à des aiguilles, des seringues, ou des produits sanguins
contaminés.17,20

En ASS, le VHB est principalement transmis pendant l’enfance via la transmission

horizontale et la transmission périnatale.4,21
Avant l’introduction de la vaccination contre le VHB en ASS (dans les années 1990-
2000),22 90% des individus avec une infection chronique par le VHB étaient infectés
horizontalement pendant l’enfance, et 10% étaient infectés par voie périnatale.4
Cependant, la proportion d’infections attribuables à la TME est en train d’augmenter pour
trois raisons principale : (i) la proportion élevée d’enfants vaccinés contre l’hépatite B
pendant l’enfance entraine une réduction des infections par transmission horizontale ; (ii)
la faible couverture de la dose à la naissance ; et (iii) la faible couverture du traitement
antiviral chez les femmes enceintes éligibles.23 En 2030, 50% des nouvelles infections par
le VHB dans le monde seront attribuables à la TME.23

Les infections par le VHB en ASS se concentrent au niveau de la famille ou du ménage. La

transmission intrafamiliale du VHB est donc la cause principale de l’acquisition du VHB
pendant l’enfance en ASS.24
Des analyses phylogénétiques ont mis en évidence la transmission intrafamiliale du
VHB. Dans une étude en Gambie, les séquences virales du VHB étaient similaires chez 22
des 32 familles étudiées.24 Plusieurs enfants du même village mais de familles différentes
avaient également la même séquence virale, suggérant que les enfants d’autres ménages
pourraient être une source importante de transmission du VHB dans ce contexte.24 Au
Cameroun, la transmission intrafamiliale du virus était apparente dans sept des onze
ménagés étudiés (séquences virales identiques ou similaires entre les membres des
mêmes ménages).21 Dans cette même étude, les séquences virales d’une mère et de ses
deux enfants étaient également similaires.21
Des études transversales sur les facteurs associés à une infection par le VHB ont
également montré l’importance de la transmission intrafamiliale. Par exemple, en Gambie,
le risque pour le benjamin d’une famille d’être AgHBs-positif était corrélé au nombre de

19
frères et sœurs AgHBs-positifs.25 Au Ghana, le nombre d’individus infectés par le VHB
dans le ménage était associé à une augmentation de la prévalence des marqueurs du VHB
chez les enfants. Cette association n’a pas été retrouvée au niveau de la concession.26

Les sous-parties ci-dessous offrent un aperçu des deux modes de transmission

principaux du VHB en ASS chez les enfants.

1.1.2.1. Transmission horizontale

La transmission horizontale du VHB est liée à un contact répété direct avec les liquides
biologiques d’une personne infectée, ou par l’intermédiaire d’objets (ex : serviette de bain,
brosse à dent) ou d’aliments (ex : chewing-gum, bonbons) partagés.4,26–28 Cependant, les
mécanismes exacts de la transmission horizontale ne sont pas encore bien définis.4

Plusieurs études menées avant l’introduction du vaccin anti-hépatite B en ASS ont

montré que la transmission horizontale pendant l’enfance et la préadolescence était le
principal mode de transmission du VHB. Dans ces études, la prévalence de l’infection par
le VHB (déterminée par la présence de l’AgHBs) ou de l’exposition au VHB (déterminée
par la présence d’au moins un marqueur du virus) était basse pendant la première année
de vie et augmentait pendant l’enfance. A l’âge de 15 ans, la plupart des individus avaient
déjà été en contact avec le VHB.29 L’augmentation de la prévalence de l’hépatite B au cours
de l’enfance témoigne d’une transmission horizontale du VHB, plutôt que d’une
transmission périnatale ou via des produits contaminés. 29
Par exemple, dans une étude menée en milieu rural au Ghana en 1994, la prévalence
de l’AgHBs était de 9.3% chez les 1-5 ans, d’environ 25% chez les 6-10 ans, de 35.4% chez
les 11-15 ans, et de 9.4% chez les plus de 15 ans.26 En Gambie, une étude dans deux
villages a montré que la proportion d’enfants positifs à au moins un marqueur sérologique
du VHB augmentait avec l’âge. A l’âge de 13 ans plus de 80% des enfants étaient déjà
exposés au virus.25 Cette tendance a également été observée au Sénégal30, en Zambie31,
en Ethiopie,32 en Afrique du Sud,33,34 au Liberia35 et en Tanzanie.36

1.1.2.2. Transmission mère-enfant

Dans la majorité des cas, la TME s’effectue pendant la période périnatale, au moment
de l’accouchement. La transmission intra-utérine transplacentaire et pendant la période
post-natale sont rares.20,37,38 L’incidence de la TME dépend de la prévalence de l’AgHBs
chez les mères, du risque de transmission d’une mère à son enfant, et de la disponibilité
des soins préventifs.37

En ASS, la prévalence de l’AgHBs chez les femmes enceintes et les femmes en âge de
procréer varie d’un pays à l’autre (allant de 2.4% à 25%), et est la plus élevée en Afrique

20
de l’Ouest.39 Chaque année, environ 367 250 nourrissons nés en ASS (soit 1%) sont
infectés par le VHB, soit deux fois plus que par le VIH.37 Le risque de TME d’une mère avec
une infection chronique par le VHB à son enfant dépend de la présence de l’antigène HBe
(AgHBe) (marqueur d’une forte réplication virale) et du niveau d’ADN VHB (indique la
quantité de virus) dans le sang de la mère.37,40 D’après une revue systématique de la
littérature, le risque de TME du VHB en ASS est de 38.3% (IC à 95% 7.0-74.4) chez les
femmes AgHBe-positives et de 4.8% (IC à 95% 0.1-13.3) chez les femmes AgHBe-
négatives, en l’absence de prophylaxie chez les nourrissons.37
Plusieurs études de prévalence en ASS ont mis en évidence la présence de la TME.39
Une étude hospitalière au Ghana a estimé que la prévalence de la TME était de 5.9%.41 En
effet, 3/51 enfants nés de mères AgHBs-positives étaient AgHBs-positifs à leur naissance.
Les mères des trois enfants étaient toutes AgHBe-positives. Parmi les 51 enfants, 67% ont
reçu la dose à la naissance (le statut vaccinal des trois enfants AgHBs-positifs n’a pas été
rapporté séparément), 60% ont reçu les immunoglobulines spécifiques de l’hépatite B et
un seul avait une mère qui a reçu le traitement antiviral. Par ailleurs, en Gambie, une étude
longitudinale a estimé que 16% des porteurs chroniques du VHB étaient infectés via la
TME.42 Parmi les 977 participants non vaccinés inclus entre 1974 et 2008, 230 ont
développé une infection chronique par le VHB parmi lesquels 32.2% avaient une mère
AgHBs-positive. En analyses multivariées, avoir une mère AgHBs-positive était associé à
une infection par le VHB (odds ratio [OR] 2.0, IC à 95% 1.3-3.1%), la population
attributable fraction était donc de 16% (IC à 95% 8.6-22.9%).

1.1.2.3. Pratiques à risque de transmission en ASS chez les

enfants

Des études transversales sur les facteurs associés à une infection par le VHB chez les
enfants ont identifié des pratiques à risques pour la transmission du VHB en ASS.
Les pratiques traditionnelles, telles que la scarification et les tatouages, sont des
pratiques associées à l’hépatite B. Au Burkina Faso,43 une étude en milieu rural a montré
que les enfants scarifiés étaient plus à risque d’être exposés au VHB (AgHBs ou anticorps
anti-HBc [Ac anti-HBc] positifs) que les enfants non-scarifiés (OR ajusté [aOR] 2.7, IC à
95% 1.1-6.7). Des résultats similaires ont été mis en évidence au Nigeria,44 mais
uniquement en analyses univariées (les auteurs n’ont pas effectué d’analyses
multivariées). De plus, deux études au Nigeria ont montré que les enfants avec des
tatouages avaient plus de risque d’être infectés par le VHB (analyses univariées).27,44
Par ailleurs, certaines pratiques de soins sont également associées à une infection par
le VHB. Par exemple, une étude en population générale au Nigeria45 a mis en évidence que
les adultes et les enfants ayant eu recours à des interventions dentaires en dehors d’un
centre de santé avaient un risque plus élevé d’être infectés par le VHB que ceux qui
n’avaient pas eu recours à ces interventions (aOR 3.32, IC à 95% 1.38-7.97). De plus, des
études ont également montré que la chirurgie27,44 et la transfusion sanguine,27 sont des
facteurs à risque de transmission (en analyses univariées). Enfin, dans une étude en

21
Ethiopie, les enfants ayant eu des médicaments injectables avaient un risque plus élevé
d’être AgHBs-positifs que ceux n’en n’ayant pas eu (aOR 5.02, IC à 95% 1.14-22.07).

Epidémiologie de l’hépatite B en ASS : points clés

- L’hépatite B est un problème de santé publique majeur, en particulier en Afrique
de l’Ouest.
- La majorité des infections en ASS sont acquises pendant l’enfance, via la TME et
la transmission horizontale.
- La proportion d’infections attribuables à la TME est en train d’augmenter.
 Les enfants sont une population clé dans le contrôle de l’hépatite B en ASS.

1.2. Mesures de contrôle de l’hépatite B

Chez les enfants, l’intervention principale pour contrôler l’hépatite B est la prévention
de l’infection via la vaccination. Chez les adultes, l’amélioration de l’accès au dépistage et
au traitement de l’hépatite B sont les mesures principales pour réduire la morbidité et la
mortalité liées au VHB.16

1.2.1. Prévention
Les premières années de vie sont critiques pour prévenir l’hépatite B car : (i) la majorité
des infections en ASS sont acquises pendant la petite enfance, (ii) la proportion d’infections
attribuables à la TME est en train d’augmenter, et (iii) le jeune âge au moment de l’infection
par le VHB est un des principaux facteurs de progression vers l’infection chronique et les
complications liées au VHB.
En effet, le risque d’évolution vers une infection chronique après une exposition au
VHB est de 80-90% chez les individus infectés pendant les six premiers mois de vie, alors
que ce risque n’est que de 30% chez les 1-6 ans et de 5% chez ceux infectés à l’âge
adulte.4,5 Par ailleurs, le jeune âge au moment de l’infection est associé à un risque plus
élevé de réplication virale persistante, ainsi que de progression vers la cirrhose et le
carcinome hépatocellulaire.6 Enfin, la majorité des cas qui nécessitent un traitement
antiviral en ASS sont infectés par voie périnatale.42

Les sous-parties suivantes présentent les interventions de prévention de l’hépatite B

chez les enfants, et se basent sur les recommandations de l’OMS de juillet 2017 sur les
vaccins anti-hépatite B17 et la prévention de la TME.40 D’autres mesures de prévention,
telles que la sécurité transfusionnelle et les pratiques sexuelles à moindre risque sont

22
également nécessaires mais ne seront pas traitées ici, car elles concernent principalement
des modes de transmission chez les adultes.

1.2.1.1. Vaccination
(a) Schéma vaccinal multidoses

La vaccination est la clé de la prévention du VHB. La vaccination à la naissance permet

de prévenir la TME, tandis que la vaccination pendant la petite enfance empêche la
transmission horizontale.

Des vaccins sûrs et efficaces contre le VHB sont disponibles depuis 1982.17 La dose
d’AgHBs (substance active des vaccins) nécessaire pour induire une réponse immunitaire
protectrice est de 5-10µg pour la dose pédiatrique et de 10-20µg pour la dose adulte.17 Le
vaccin est disponible sous forme monovalent pour les doses à la naissance, et en
combinaison avec d’autres vaccins pour la vaccination des nourrissons.17

L’OMS a recommandé l’introduction du vaccin contre l’hépatite B pendant l’enfance

dans les programmes nationaux de vaccination dès 1991,46 et recommande l’introduction
de la dose à la naissance depuis 2009.47
La dose à la naissance doit être administrée de préférence dans les 24 heures après la
naissance. Les nourrissons qui n’ont pas pu être vacciné dans les 24 heures peuvent
recevoir cette dose avant la première dose de primovaccination lors de leur premier
contact avec un service de soin.17 Depuis 2017, l’OMS recommande que tous les enfants
reçoivent au moins trois doses de vaccin contre l’hépatite B. Un des deux schémas
vaccinaux suivants est recommandé :

• Trois doses : vaccin monovalent à la naissance suivi de deux doses additionnelles

• Quatre doses : vaccin monovalent à la naissance suivi de trois doses additionnelles

Les doses doivent être administrées à au moins quatre semaines d’intervalle.17

Efficacité
L’efficacité du vaccin anti-hépatite B est mesuré par la concentration d’anticorps anti-
HBs (Ac anti-HBs) dans le sang. Une concentration ≥10 UI/mL dans les deux mois suivant
la dernière dose du schéma vaccinal est considéré comme un marqueur sérologique de
protection longue durée contre le VHB.17
Trois doses de vaccin induisent un taux d’Ac anti-HBs protecteurs chez 95% des
individus en bonne santé.17 Une revue systématique de la littérature n’a montré aucune
différence dans la proportion d’enfants avec une séroprotection lorsqu’ils reçoivent deux
ou trois doses de primovaccination après la dose à la naissance.48

23
 En ASS, la majorité des données sur l’efficacité de la vaccination anti-hépatite B
pendant l’enfance sur la réduction de la prévalence de l’AgHBs et de l’infection chronique
par le VHB proviennent de la Gambia Hepatitis Intervention Study.13 Quelques études au
sein de la Gambia Hepatitis Intervention Study ont montré qu’un schéma vaccinal avec
plusieurs doses de vaccin est efficace à 95% contre l’infection chronique par le VHB, et à
85% contre l’infection par le VHB.49,50
Les conséquences d’un schéma vaccinal incomplet n’ont pas encore été évaluées en
ASS.13 A Taiwan, une étude de cohorte sur 3.8 millions d’individus vaccinés a montré
qu’un schéma vaccinal incomplet était associé à un risque plus élevé d’insuffisance
hépatique fulminante, de maladie hépatique chronique et de carcinome
hépatocellulaire.51

Respect des délais de vaccination

De manière générale, il est important de respecter les délais d’administration des
vaccins pour garantir leur efficacité. Des doses de vaccin reçues trop tôt ou à des délais
trop rapprochés entrainent une protection immunitaire sous-optimale,52 tandis que des
retards dans l’administration des doses augmentent la susceptibilité de contracter des
infections.53 De plus, les enfants qui ne sont pas vaccinés selon les délais recommandés
sont plus à risque de ne pas compléter le schéma vaccinal.53
Nous n’avons pas identifié d’études évaluant l’impact du non-respect des délais de
vaccination contre l’hépatite B (schéma multidoses) sur l’efficacité vaccinale.

Durée de la protection vaccinale

Plusieurs études montrent que le vaccin contre l’hépatite B est efficace pendant au
moins vingt ans, et qu’une dose de rappel n’est pas nécessaire chez les individus
immunocompétents.
Une revue systématique de la littérature publiée en 2010 a montré que trois à quatre
doses de vaccin monovalent contre l’hépatite B pouvaient induire une protection contre
le VHB pendant au moins vingt ans chez la majorité des individus immunocompétents.
Même si certains individus développent une infection subclinique (anticorps anti-HBc
transitoires ou persistants), les cas d’infections chronique par le VHB sont rares.54
Dans une étude de cohorte en Alaska, le vaccin a permis de prévenir toutes formes
cliniques apparentes d’hépatite B et l’infection chronique par le VHB chez 90% des
individus vaccinés pendant au moins 30 ans.55 Une étude de cohorte menée à Hong Kong
a également a montré que parmi des individus nés de mères AgHBs-positives le vaccin
était efficace pendant au moins 30 ans.56 Par ailleurs, en Gambie, seul 0.8% des individus
vaccinés 20 ans auparavant étaient infectés par le VHB.50

(b) Efficacité de la dose à la naissance

L’efficacité de la dose à la naissance a été démontrée dans des études comparant le risque
de TME chez les enfants nés de mères AgHBs-positives ayant reçu la dose à la naissance et le
risque chez ceux ne l’ayant pas reçu.

24
 D’après une méta-analyse d’essais contrôlés randomisés, les enfants nés de mères
AgHBs-positives et vaccinés à la naissance ont moins de risque relatif d’être infecté
(positif à l’un des marqueurs suivants : AgHBs, AgHBe ou Ac anti-HBc) comparé à ceux qui
ont reçu un placebo ou n’ont pas reçu de vaccin (risque relatif 0.28, IC à 95% 0.20-0.40).57

La dose à la naissance réduit significativement le risque de TME chez les enfants nés de
mères AgHBe-négatives.
Une méta-analyse d’études observationnelles et interventionnelles en ASS a montré
que l’administration de la dose à la naissance était associée à une réduction du risque de
TME chez les enfants nés de mères AgHBe-négatives.37 En effet, parmi les enfants nés de
mères AgHBe-négatives, le risque de TME était plus faible chez les enfants ayant reçu la
dose à la naissance (>1 semaine après la naissance, 0.0%, IC à 95M 0.0-0.0% ; ≤24 heures
0.0%, IC à 95% 0.0-0.0%) comparé à ceux qui n’avaient pas reçu de prophylaxie (38.3%,
IC à 95% 7.0-74.4%, p=0.01 et 0.02 respectivement).
Parmi les enfants nés de mère AgHBe-positives, le risque de TME était similaire entre
ceux qui avaient reçu la dose à la naissance et ceux qui ne l’avaient pas reçu. En effet, le
risque de TME parmi ceux ayant reçu la dose à la naissance >1 semaine après la naissance
(36.6%, IC à 95% 8.3-69.9%) et ceux l’ayant reçu ≤24 heures (32.4%, IC à 95% 10.2-
58.3%) n’était pas différent du risque de transmission sans mesure de prévention (38.3%,
IC à 95% 7.0-74.4%, p=0.9 et 0.8 respectivement). Comparé aux enfants nés de mères
AgHBe-négatives, les enfants nés de mère AgHBe-positives ont donc un risque plus élevé
de TME en absence de prophylaxie, mais également lorsque la dose à la naissance est
administrée. Malgré la dose à la naissance, le risque résiduel d’infection est plus important
dans ce groupe.

L’ajout de la dose à la naissance dans le schéma vaccinal multidoses (commençant

quelques semaines après la naissance) permet d’avoir une meilleure réponse immunitaire.
Une étude menée au Bénin a comparé l’efficacité d’un schéma à quatre doses de vaccin
(dose à la naissance et trois doses de pentavalent) à celle d’un schéma à trois doses de
pentavalent seulement, et a trouvé que les enfants ayant reçu les quatre doses de vaccins
avaient un taux d’Ac anti-HBs plus élevé que ceux ayant reçu le schéma de trois doses
(5579 UI/L vs 386.9 UI/L, p=0.03) neuf mois après la naissance. De plus, la proportion
d’enfants avec une bonne réponse immunitaire (Ac anti-HBs ≥100 UI/L) était également
plus élevé chez les enfants ayant reçu les quatre doses.58 Une revue systématique de la
littérature a trouvé des résultats similaires.48

Des études ont montré une diminution de l’efficacité vaccinale lorsque la dose à la
naissance est reçue plus d’une semaine après la naissance.
Par exemple, en Chine, la prévalence de l’AgHBs était plus basse chez les enfants qui
avaient reçu la première dose de vaccin dans les 24 heures après la naissance suivi de
deux ou trois doses additionnelles, que chez les enfants qui avaient reçu la dose à la
naissance plus de sept jours après. Cependant, la prévalence de l’AgHBs était similaire

25
chez les enfants ayant reçu la dose dans les 24 heures et ceux l’ayant reçu 1-7 jours après
la naissance.59

1.2.1.2. Autres interventions pour prévenir la

transmission mère-enfant

La vaccination à la naissance seule ne suffit pas pour prévenir la TME et doit être
combinée à d’autres stratégies de prévention.23

(a) Dépistage anténatal systématique des femmes enceintes

Lorsque la prévalence de l’AgHBs en population générale est supérieure à 2% ou à 5%
(en fonction des recommandations locales et du contexte épidémiologique), l’OMS
recommande de dépister gratuitement toutes les femmes enceintes lors des consultations
prénatales, le plus tôt possible au cours de la grossesse.60 Les tests peuvent être offerts en
même temps que le dépistage du VIH.60 Le dépistage permet d’identifier les femmes
enceintes nécessitant un traitement antiviral et de cibler les interventions de prévention
de la TME.60

(b) Immunoglobulines spécifiques de l’hépatite B

Les immunoglobulines spécifiques de l’hépatite B sont une préparation faite à partir de
plasma humain contenant un taux élevé d’immunoglobulines (IgG) d’Ac anti-HBs. Les
immunoglobulines sont destinées aux enfants nés de mères infectées par le VHB, afin
d’induire une immunité temporaire (immunité passive) et de réduire le risque de TME. La
dose est administrée rapidement après la naissance et elle est généralement combinée
avec la dose à la naissance.40
Une méta-analyse publiée en 2006 a évalué l’efficacité des immunoglobulines et de la
dose à la naissance dans la réduction du risque de TME, comparé à l’administration seule
de la dose à la naissance. La combinaison des immunoglobulines et de la dose à la
naissance permet de réduire l’infection par le VHB de manière significative chez les
enfants nés de mères AgHBs-positives comparées à l’administration seule de la dose à la
naissance (risque relatif 0.54, IC à 95% 0.41-0.73).57
Cependant, l’administration d’immunoglobulines avec la dose à la naissance n’est pas
100% efficace pour prévenir la TME, en particulier chez les enfants nés de mères avec une
charge virale élevée (≥200 000 UI/L), généralement AgHBe-positives.40 Par exemple, une
méta-analyse a montré qu’en Asie, malgré l’administration des immunoglobulines et de la
dose à la naissance, le risque de TME était de 5-10% chez les enfants nés de mères AgHBe-
positives.37 Des interventions de prévention supplémentaires doivent donc être utilisées
pour réduire le risque de TME.
Dû aux coût élevé des immunoglobulines et aux contraintes logistiques liées à leur
administration (ex : nécessité de maintenir la chaîne du froid et stocks limités), les

26
immunoglobulines ne peuvent pas être recommandées au niveau mondial et ne sont pas
recommandées en Afrique.61

(c) Antiviraux pendant le troisième trimestre de grossesse

En juillet 2020, l’OMS a publié des recommandations sur la prise d’antiviraux pendant
la grossesse chez les femmes AgHBs-positives.40 Toutes les femmes enceintes AgHBs-
positives avec ADN VHB≥ 5.3 log10 UI/mL (≥200,000 UI/mL) doivent recevoir du
ténofovir à partir de la 28ème semaine de grossesse jusqu’à ce que l’enfant soit vacciné.40
Dans les endroits où le test de charge virale n’est pas disponible, l’AgHBe peut être utilisé
pour déterminer l’éligibilité au ténofovir.40,62 Une méta-analyse visant à déterminer
l’efficacité et la sureté de la prophylaxie antivirale comparé à un placebo ou sans la prise
de ténofovir a montré que le ténofovir disoproxil fumarate est très efficace pour réduire
le risque de TME (l’OR dans les études randomisés était de 0.10, 95% 0.03-0.35 et de 0.17,
IC à 95% 0.10-0.29 dans les études non-randomisées).63 D’après les nouveaux critères
d’éligibilité au traitement de l’OMS, peu de femmes en âge de procréer sont éligibles au
traitement long-terme.40

1.2.2. Dépistage et traitement

Le dépistage de l’hépatite B est la première étape de la cascade de soins du VHB. Les
objectifs du dépistage du VHB sont : (i) d’identifier et de faire entrer en soins les individus
infectés par le VHB et leurs proches ; (ii) d’identifier les patients éligibles au traitement ;
(iii) d’orienter les individus vers des mesures préventives et ; (iv) de surveiller la réponse
au traitement antiviral.60 En 2015, l’OMS a publié les premières recommandations de
dépistage de l’infection par le VHB.60 Les stratégies et techniques de dépistage
recommandées par l’OMS sont présentées dans l’annexe B.

L’objectif principal du traitement de l’infection chronique par le VHB est d’améliorer la

survie et la qualité de vie des patients en empêchant la progression de la maladie vers les
complications hépatiques.9 Le traitement vise également à prévenir la TME, la
réactivation de l’hépatite B et à prévenir et les manifestations extra-hépatiques liées au
VHB (ainsi que de les traiter).64 Le stade de la maladie auquel le traitement est initié ainsi
que l’âge du patient déterminent le succès du traitement.64
Les critères d’évaluation de la réponse au traitement sont les suivants : la suppression
à long-terme de l’ADN VHB (objectif principal du traitement), la perte de l’AgHBe (avec ou
sans une séroconversion de l’anticorps anti-HBe [Ac anti-HBe]), la normalisation du taux
d’alanine aminotransférase (ALAT), et la perte de l’AgHBs (avec ou sans séroconversion
vers l’Ac anti-HBs). 9,64
Les critères de mise sous traitement sont présentés dans le tableau 1.9

27
Tableau 1. Indications au traitement antiviral selon les recommandations de l’OMS

OMS
Doivent être traités -Patients atteints d’une hépatite B chronique et présentant
des signes cliniques de cirrhose (ou un score APRI>2)a ,
quel que soient les taux ALAT, statut AgHBe ou le niveau
ADN VHB

-Patients avec une hépatite B chronique sans signe clinique

de cirrhose (ou APRI<2)a , de plus de 30 ans et avec un
niveau d’ALAT élevé de façon persistanteb et ADN
VHB>20 000 UI/mL, quel que soit le statut AgHBe

Peuvent être traités -Patients atteints d’une hépatite B chronique avec des taux
d’ALAT élevés de façon persistante.b

a ScoreAPRI [AST-to-platelet-ratio] (OMS) : test non-invasif recommandé pour évaluer la présence

de cirrhose dans la pays en voie de développement (seulement chez les plus de 18 ans): APRI = *
(ASAT/LSN) x 100) / plaquettes (109/L).
b Niveau d’ALAT persistent anormal : trois déterminations des taux d’ALAT>LSN pendant les 6-12

derniers mois, ou pendant une période de 12 mois à intervalle régulier.

Source : OMS9

Peu de recherches ont été menées sur les stratégies de dépistage et de traitement de
l’hépatite B chez les enfants et adolescents. En effet, il y’a peu de données sur le VHB chez
les enfants dans les pays à ressources limitées pour informer la gestion pédiatrique du
VHB, alors que les cas pédiatriques sont nombreux.16
La majorité des enfants ne nécessitent pas de traitement antiviral. Le traitement par
analogues nucéos(t)idiques avec une haute résistance, tels que le ténofovir ou l’encétavir
sont recommandés chez les plus de 12 ans. Chez les enfants de 2-11 ans, l’encétavir est
recommandé.9

Mesures de contrôle de l’hépatite B : points clés

- Le jeune âge au moment de l’infection est un des principaux facteurs de

progression vers l’infection chronique et les complications liées à l’hépatite B.
- La vaccination pendant l’enfance, via une dose à la naissance suivi d’au moins
deux autres doses de vaccin, est la clé de la prévention de l’hépatite B.
 Des outils efficaces de prévention, de dépistage et de traitement sont
disponibles pour lutter contre l’hépatite B. Afin de réduire le fardeau de la
maladie sur le long-terme, il est essentiel de prévenir l’infection chez les
enfants, principalement via la vaccination.

28
 1.3. La réponse de l’Organisation Mondiale de
la Santé en Afrique
Les hépatites virales ont longtemps été négligées au niveau international. En effet,
celles-ci ne figuraient pas dans les Objectifs du millénaire pour le développement (2000-
2015) et ne sont pas considérées comme des maladies tropicales négligées. Les premières
mesures visant à contrôler les hépatites virales au niveau mondial ont été développées à
partir des années 1990. Certaines de ces mesures incluent la première résolution de l’OMS
sur un vaccin contre l’hépatite B en 1992, l’estimation de la mortalité liée aux hépatites
virales dans le Global Burden of Disease à partir de 2000, et le financement des premiers
vaccins anti-hépatite B par Gavi en 2001.14

En 2010, l’Assemblée Mondiale de la Santé a adopté une résolution qui prenait acte de
la gravité des hépatites virales en tant que problème mondial de santé et appelait les états
membres à instaurer des mesures de prévention, de diagnostic et de traitement.65 Cette
résolution a été un tournant dans la lutte contre les hépatites virales. Par la suite, l’OMS a
créé le Programme mondial de lutte contre l’hépatite en 2011.14
En parallèle, les hépatites virales ont bénéficié d’une plus grande visibilité dans
l’agenda de la santé en ASS depuis les années 2010. Suite à l’appel de Dakar de 2011,
l’Initiative Panafricaine de Lutte contre les Hépatites a été créée en juillet 2012.66 Celle-ci
regroupe une vingtaine de pays dans le but de rassembler les acteurs de la lutte contre les
hépatites dans les pays africains francophones. En juillet 2013, l’Initiative Panafricaine de
Lutte contre les Hépatites a organisé la Conférence Internationale sur les Hépatites à
Dakar, à la suite de laquelle a été publié Le Consensus de Dakar. Les points focaux du
Consensus de Dakar étaient : le calendrier vaccinal inadapté pour la prévention de la TME
en ASS, le manque de ressources financières en faveur de la lutte contre les hépatites
virales, et le manque de moyens pour une prise en charge convenable des porteurs
chroniques du VHB et du virus de l’hépatite C (VHC).66 Les acteurs de la lutte contre
l’hépatite B se sont prononcés en faveur de l’adoption d’une approche intégrée pour lutter
contre les hépatites, une mutualisation de moyens, une approche régionale pour
développer des stratégies pertinentes ainsi que l’amélioration des outils de diagnostic et
des programmes de traitement appropriés aux malades.66

En 2014, l’Assemblée Mondiale de la Santé a adopté une nouvelle résolution

encourageant les pays à développer des plans nationaux de lutte contre les hépatites
virales, et demandant à l’OMS d’évaluer la faisabilité de l’élimination des hépatites B et
C.67
En réponse, le Comité régional de l’OMS pour l’Afrique a adopté les résolutions sur les
hépatite virales, en invitant les états membres à : (i) élaborer et mettre en œuvre des
stratégies pour le contrôle des hépatites virales ; (ii) mettre en place un système de
surveillance; (iii) sensibiliser les communautés, décideurs et agents de santé ; (iv)

29
intensifier les activités de prévention ; (v) former les agents de soins de santé primaires
au diagnostic, aux soins et au traitement ; et (vi) élargir l’accès au dépistage, aux conseils
et au traitements.68 Un plan stratégique pour la vaccination a également été publié.69

Cependant, ce n’est qu’en 2015 que le contrôle des hépatites virales a été reconnu
comme une nécessité pour la santé et le développement dans le monde. Dans le cadre du
Programme de Développement Durable à l’horizon 2030, l’Organisation des Nations
Unies a intégré l’objectif suivant dans les Objectifs de Développement Durable : « D’ici à
2030, mettre fin à l’épidémie de sida, à la tuberculose, au paludisme et aux maladies
tropicales négligées et combattre l’hépatite, les maladies transmises par l’eau et autres
maladies transmissibles ».70
Par la suite, l’Assemblée Mondiale de la Santé a adopté la première Stratégie mondiale
du secteur de la santé contre l’hépatite virale 2016-2021 en mai 2016. 7 Cette stratégie est
la première stratégie mondiale sur les hépatites virales, et couvre les six premières années
du Programme de Développement Durable à l’horizon 2030. En août 2016, les 47 états
membres de l’OMS en Afrique ont approuvé la Stratégie mondiale du secteur de la santé
contre l’hépatite virale 2016-2021.
La vision de la Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale 2016-
2021 est celle d’un monde où la transmission de l’hépatite virale est stoppée et où toute
personne atteinte d’hépatite virale a accès à des soins et des traitements sûrs, abordables
et efficaces. L’objectif général est d’éliminer l’hépatite virale en tant que grave menace
pour la santé d’ici 2030.7
En 2017, les états membres de l’OMS en Afrique ont publié le rapport Prévention, soins
et traitement de l’hépatite virale dans la région Africaine : cadre d’action 2016-2020,71 en
reprenant les cibles de la Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale
2016-2021. Les cibles sont présentées dans le tableau 2.

30
 Tableau 2. Cibles pour l’élimination de l’hépatite B en Afrique d’ici 2030
Domaine ciblé Cibles pour 2020 Cibles pour 2030
Cibles d’impact

Réduction de 30%
Incidence : nouveaux cas Réduction de 90% (équivalent à une
(Équivalent à une
d’hépatites virales B et C prévalence de 0.1% des AgHBs chez
prévalence de 1% des
chroniques les enfants)
AgHBs chez les enfants)

Mortalité : décès dus aux

Réduction de 10% Réduction de 65%
hépatites virales B et C

Cibles de couverture des services

Vaccination contre le VHB :

couverture vaccinale des enfants 90% 90%
(trois doses)

Prévention de la TME du VHB :

50%
couverture par la dose de
Introduire la dose à la
naissance du vaccin contre 90%
naissance dans au moins
l’hépatite B ou autre méthode de
25 pays
prévention de la TME

95% des dons sont soumis

100% des dons sont soumis à un
Sécurité transfusionnelle à un dépistage de qualité
dépistage de qualité garantie
garantie

Sécurité des injections :

pourcentages d’injections
pratiquées avec du matériel 50% 90%
sécurisé dans les établissements
de santé et à l’extérieur

Réduction des effets nocifs :

nombre d’aiguilles et de
seringues stériles fournies par an 200 300
et par personne s’injectant des
drogues
Diagnostic des hépatites virales
20% 90%
B et C
80% des personnes atteintes
d’hépatite B chronique et
remplissant les conditions
1 million de personnes
bénéficient d’un traitement ; 80%
Traitement des hépatites virales auront reçu un traitement
des personnes atteintes d’hépatite C
B et C contre le VHB et 300 000
chronique et remplissant les
millions contre le VHC
conditions bénéficient d’un
traitement

Sources : Prévention, soins et traitement de l’hépatite virale dans la région Africaine : cadre d’action
2016-202071 et Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale 2016-2021 7

31
 Réponse de l’OMS en Afrique : points clés

- Le contrôle du VHB a été reconnu comme une nécessité pour la santé et le

développement dans le monde dans le cadre du Programme de Développement
Durable à l’horizon 2030.
- L’Assemblée Mondiale de la Santé a adopté la Stratégie mondiale du secteur de
la santé contre l’hépatite virale 2016-2021. Celle-ci vise à éliminer l’hépatite B en
tant que problème de santé publique d’ici 2030 en réduisant l’incidence du VHB
de 90% et la mortalité liée au VHB de 65%. La Stratégie a été approuvée et
adoptée par les états membres de l’OMS en Afrique.
 Pour atteindre les objectifs d’élimination, il est essentiel d’améliorer la
couverture des services de prévention chez les enfants (90% des enfants
ayant reçu trois doses de vaccin et 90% des enfants ayant reçu une
intervention contre la TME).

1.4. Etat des lieux et enjeux du contrôle de

l’hépatite B en Afrique sub-Saharienne

1.4.1. Etat des lieux de l’élimination de l’hépatite B

Un tableau des scores a été publié par le bureau régional de l’OMS en Afrique en 2019
afin de documenter les progrès des pays vers certaines cibles de l’OMS. 72 Celui-ci montre
que 28 pays disposent de plans d’action nationaux de lutte contre l’hépatite virale, mais
la majorité sont encore en phase de brouillon (seulement 13 pays ont publié leur plan
d’action), seulement sept pays ont une couverture de la dose à la naissance et du
pentavalent de plus de 90% et huit pays subventionnent des tests de dépistage et le
traitement (ex : Ouganda, Rwanda). Les efforts de contrôle de l’hépatite B sont
globalement insuffisants.

Par ailleurs, l’étude de modélisation de Shevanti Nayagam et collègues23 montre que

même en intensifiant les interventions de contrôle de l’hépatite B au niveau requis pour
atteindre les cibles d’impact de 2030, l’objectif de réduction de la mortalité ne sera pas
atteint en ASS avant 2090 et l’Afrique de l’Ouest sera la dernière région à atteindre les
objectifs d’élimination de l’hépatite B.

Les parties ci-dessous exposent les enjeux liés au contrôle de l’hépatite B en ASS.

32
 1.4.2. Enjeux du contrôle de l’hépatite B
1.4.2.1. Vaccination

Tous les pays d’ASS ont inclus le schéma vaccinal multidoses chez les nourrissons dans
leur Programme Elargi de Vaccination (PEV).22 La majorité ont recours au vaccin
pentavalent (combinant les vaccins contre la diphtérie, le tétanos, la coqueluche,
l’Haemophilus influenzae de type B, et l’hépatite B) avec des doses administrées 6, 10 et 14
semaines après la naissance.22 Cependant, en 2015, seul 74% des enfants en Afrique
avaient reçu trois doses de vaccin contre l’hépatite B, alors que la moyenne mondiale était
de 84%.14 La couverture est la plus faible en Afrique de l’Ouest (autour de 66%).8

La mise en place de la dose à la naissance en ASS est très lente. En 2019, seulement 10
pays avaient introduit la dose à la naissance dans leur PEV (l’Angola, le Botswana, le Cap
Vert, la Gambie, la Mauritanie, l’Ile Maurice, la Namibie, le Nigeria, Sao Tome et Principe
et le Sénégal).72
Peu de données sur la couverture de la dose à la naissance en ASS sont disponibles, et
les études menées jusqu’à présent montrent que très peu d’enfants reçoivent le vaccin
dans les délais recommandés. Une méta-analyse publiée en 2021 a montré que dans trois
pays d’ASS ayant introduit la dose à la naissance (Nigeria, Gambie, Afrique du Sud), seul
1.3% des enfants recevaient le vaccin dans les 24 heures suivant la naissance (IC à 95%
0.0-4.5%) et 21.5% (IC à 95%9.4-36.8%) dans les sept jours suivant la naissance.73 Par
exemple, dans le système de surveillance de santé et de démographie de Farafenni en
Gambie, 1.1% des enfants étaient vaccinés dans les 24 heures après la naissance, 5.4%
dans les sept jours, 58.4% dans les 28 jours, 93.1% dans les six mois et 93.6% dans l’année
suivant la naissance.74

Les barrières à l’administration de la dose à la naissance en ASS incluent :

• Le coût du vaccin : Jusqu’en 2021, le vaccin monovalent à la naissance n’était pas

financé par Gavi et peu de gouvernements africains achetaient le vaccin malgré son
faible coût (US$20 centimes par dose).13,61 Cependant, le vaccin monovalent est
financé par Gavi depuis 2021, ce qui devrait faciliter son introduction dans
plusieurs pays.75
• Les accouchements à domicile : En ASS, les accouchements à domicile sont
fréquents, surtout dans les zones rurales ou isolées.13,17,22,61,76,77 Dans ce contexte,
les enfants sont souvent amenés en structure sanitaire plus de 24 heures après la
naissance ou n’y sont pas amenés du tout. Certaines pratiques culturelles peuvent
également retarder l’administration de la dose à la naissance. Par exemple, en
Gambie et au Nigeria, il faut attendre que l’enfant soit nommé (environ sept jours
après la naissance) avant de pouvoir l’amener en structure sanitaire.22 Par ailleurs,
il n’y a pas suffisamment de personnel de santé formé pour accompagner les
naissances à domicile, administrer le vaccin et effectuer les visites post-natales.22
33
 • La conservation du vaccin : Le transport du vaccin dans des zones isolées peut être
limité par les capacités de stockage dans la chaîne du froid.22,76 Cependant, des
données récentes de l’OMS montrent que le vaccin monovalent peut être stocké en
dehors de la chaine du froid et exposé à des températures ambiantes pendant une
période limitée (jusqu’à 45 degrés Celsius pendant une semaine, et jusqu’à 40
degrés pendant plusieurs semaines).78
• L’organisation des structures de santé : Le manque de communication entre les
services de maternité et ceux d’immunisation17 ainsi que le manque
d’organisation, ou de procédures opératoires pour le personnel chargé de
l’administration de la dose à la naissance sont des obstacles importants. 79
• Les connaissances sur l’hépatite B : Souvent, les personnels de santé et les
communautés ne connaissent pas suffisamment les bénéfices de la vaccination à la
naissance.17,79

1.4.2.2. Contrôle de la transmission mère-enfant

En ASS, les autres interventions de prévention de la TME (en plus de la dose à la

naissance) ont longtemps été négligées car ce mode de transmission était considéré
comme mineur.13,37 En conséquence, peu de pays ont inclus le dépistage du VHB chez les
femmes enceintes dans les politiques de santé nationales.61 Aujourd’hui, moins de 20%
des femmes en ASS sont dépistées au cours de leur grossesse.38
Le diagnostic de l’hépatite B chez les femmes enceintes est également compliqué. La
mesure de l’ADN VHB est coûteuse et nécessite des laboratoires avec une technicité
suffisante et du personnel formé.38,61 L’AgHBe est donc la seule mesure d’infectiosité chez
la plupart des femmes AgHBs-positives en ASS.9 Néanmoins, la présence de l’AgHBe en
ASS n’indique pas toujours une haute réplication virale.80 Des recherches sur la faisabilité
d’un test de diagnostic rapide pendant les consultations prénatales sont actuellement en
cours.81
Par ailleurs, moins d’1% des femmes à risque élevé de TME sont mises sous traitement
pendant leur grossesse8 et les immunoglobulines ne sont pas disponibles dans la majorité
des pays en raison de leur coût élevé (150-200 USD14) et des contraintes logistiques
associées.76

1.4.2.3. Cascade des soins de l’hépatite B

En ASS, chaque étape de la cascade du soin de l’hépatite B souffre d’un manque de

ressources et de volonté politique.82 D’après les données de l’Observatoire Polaris , parmi
les 78 166 000 (IC à 95% 68 191 000-88 606 000) individus AgHBs-positifs en Afrique en
2016, seul 1 486 000 (2%) étaient dépistés et moins d’1% de ceux éligibles au traitement
avaient été mis sous traitement.8

34
 (a) Dépistage
Selon les recommandations de l’OMS,60 une stratégie de dépistage en population
générale devrait être adoptée en ASS. Cependant, les programmes de dépistage et de
traitement de l’infection chronique par le VHB en population général sont quasi-
inexistants sur le continent,83 et peu de personnes sont dépistées en dehors des études
cliniques.82 De plus, la plupart des individus sont dépistés et pris en soins à un stade
avancé de la maladie.60,84
Les obstacles principaux au dépistage sont le coût des tests et le manque de
connaissance du personnel de santé vis-à-vis du dépistage. En effet, les tests sont souvent
coûteux76 et à la charge du patient.82 Dans une étude en milieu urbain au Sénégal, seul
24% des médecins savaient que les tests de diagnostic rapide pouvaient être utilisés pour
dépister le VHB.85

(b) Evaluation clinique et biologique de l’infection

Inflammation du foie
Il est possible de mesurer l’ALAT et l’aspartate aminotransférase (ASAT) dans la
plupart des structures de soins primaires en ASS. Ces mesures sont donc incluses dans
tous les critères de mise sous traitement.82

Mesure de charge virale

Peu de pays en ASS ont des laboratoires capables de mesurer l’ADN VHB. En effet, les
tests sont coûteux (30-100 USD)14 et nécessitent des infrastructures et du personnel
spécifique.13,82

Evaluation de la fibrose
La biopsie hépatique est l’examen de référence pour détecter une fibrose. Cependant,
cet examen n’est pas disponible dans beaucoup de pays à faible revenu en raison de son
coût élevé, ainsi que la nécessité d’avoir du personnel formé et une infrastructure dédiée.
De plus, l’examen peut être inconfortable pour le patient et peut entrainer des
complications.82
L’élastographie transitoire (Fibroscan) est actuellement la meilleure alternative pour
la biopsie du foie en raison de son excellente capacité à quantifier la fibrose hépatique et
la cirrhose. Le Fibroscan peut être utilisé par du personnel de santé non-spécialiste mais
il est peu utilisé dans les pays à ressources limitées en raison de son coût élevé.82
Lorsque la biopsie hépatique ou le Fibroscan ne sont pas disponibles, l’OMS
recommande d’utiliser des tests non-invasifs basés sur des marqueurs sériques.9 Le score
APRI et le score FIB-4 ont été validés par l’OMS. Le score APRI est le test non-invasif à
utiliser de préférence et se base sur la mesure de marqueurs facilement disponibles dans
les contextes à ressources limités : les ASAT et les plaquettes.9 Le score FIB-4 se base sur
la mesure des ALAT, ASAT, des plaquettes et l’âge du patient.9 Cependant, ces tests non-
invasifs n’ont pas été suffisamment évalués en ASS et des études ont montré que leur

35
performance était limitée dans certains contextes.76 Une étude en Ethiopie a montré que
ces tests avaient une bonne capacité à détecter les fibroses et cirrhoses chez les patients
avec une infection chronique par le VHB, mais que les tests avaient une faible sensibilité.86
Le score Gamma-glutamyl transpeptidase-to-platelet ratio a récemment été développé
en Gambie et semble plus fiable que les scores APRI et FIB-4 chez des patients en Afrique
de l’Ouest87 et en Ethiopie.86 Néanmoins, ce score n’a pas encore été testé et validé dans
d’autres pays d’ASS.

(c) Traitement

Critères de mise sous traitement

En ASS, les recommandations ou guides nationaux de traitement de l’hépatite B sont
rares. La plupart des praticiens se réfèrent aux recommandations de sociétés savantes
internationales ou de l’OMS. En 2019, seulement 10 pays avaient des directives nationales
de mise sous traitement.72
Des études menées en ASS ont montré que les critères simplifiés de l’OMS ne
permettent pas d’identifier correctement tous les patients à mettre sous traitement. Dans
une étude en Ethiopie, seulement la moitié des individus nécessitant un traitement
antiviral selon les recommandations de la European Association for the Study of the Liver
était éligible au traitement selon les critères de l’OMS. Parmi ces individus, la majorité
était à un stade avancé de maladie hépatique (cirrhose décompensée).88
D’autres critères alternatifs de mise sous traitement ont été développés. Par exemple,
le score TREAT-B (Treatment elibility in Africa for the hepatitis B virus) détermine
l’éligibilité au traitement selon la présence de l’AgHBe et le niveau d’ALAT.89 Ce score est
obtenu en ajoutant le score AgHBe (négatif = 0 point ; positif = 1 point) et le score ALAT
(<20 UI/L ) 0 point ; 20-39 =1 point ; 40-79 = 2points ; ≥80 = 3 points). 89 Dans une cohorte
d’individus avec une infection chronique par le VHB en Gambie, le score TREAT-B avait
une sensibilité de 85% et une spécificité de 77% (lorsque TREAT-B ≥2 si AgHBe positif et
ALAT≥20 U/L ; ou AgHBe négatif et ALAT≥40 U/L).89 D’autres études menées en ASS ont
montré que le score TREAT-B permet une meilleur identification des patients éligibles au
traitement que les critères de l’OMS. 90,91 Cependant, d’autres études sont nécessaires afin
de valider ce score.

Proportion d’individus nécessitant un traitement antiviral

Il y’a peu de données disponibles sur la proportion d’individus nécessitant un
traitement antiviral en ASS.82 Quelques études montrent que cette proportion est
inférieure à 20%.76 Par exemple, des études menées en Gambie ont montré que moins de
10% des individus avec une infection chronique par le VHB nécessitaient un
traitement.42,83 Une étude parmi des prisonniers Sénégalais et Togolais, des travailleuses
du sexe et des hommes ayant des relations sexuelles avec des hommes a montré que 10%
de ceux infectés par le VHB étaient éligibles au traitement antiviral selon les critères de
l’OMS.92

36
 Accès au traitement
Le ténofovir disporixil fumarate est disponible gratuitement pour les individus co-
infectés par le VIH, mais pour les individus mono-infectés le traitement est payant.76

Etat des lieux et enjeux du contrôle de l’hépatite B en ASS : points clés

- L’Afrique de l’Ouest sera la dernière région du monde à atteindre les objectifs
d’élimination de l’hépatite B de l’OMS.
- Les principaux freins au contrôle de l’hépatite B sont les suivants : (i) une
couverture vaccinale trop basse ; (ii) des tests de dépistage et de diagnostic peu
accessibles et/ou chers ; (iii) une entrée en soins et une mise sous traitement
des patients infectés tardive et insuffisante ; (iv) des critères de mises sous
traitement non adaptés au contexte local.
 Des données au niveau local sont nécessaires pour établir l’état des lieux
de l’élimination de l’hépatite B et adapter les interventions de santé
publique.

1.5. Contexte de l’hépatite B au Sénégal

1.5.1. Epidémiologie de l’hépatite B

Le Sénégal est un pays d’Afrique de l’Ouest de 17 millions d’habitants où l’hépatite B
est endémique. La prévalence de l’AgHBs en population générale est estimée à 11.06% (IC
à 95% 10.72-11.40% ; 1 432 032 individus) selon une revue systématique de la littérature
(données publiées entre 1965-2013)93 et 8.1% (IC à 95%, 7.5-9.0% ; 1 249 000 individus)
selon une étude de modélisation (données pour 2016).8 Cependant, les données de
prévalence du VHB publiées au cours des 20 dernières années proviennent
majoritairement d’études transversales menées en milieu urbain au sein de groupes
d’adultes à risque (ex : usagers de drogue, patients coinfectés par le VIH, prisonniers) ou
spécifiques (ex : militaires, donneurs de sang, femmes enceintes).94–104 Dans ces
populations, entre 10-17% des individus étaient infectés.
Très peu de données récentes sur la prévalence du VHB sont disponibles chez les
enfants. Deux études menées dans des hôpitaux à Dakar montrent que la prévalence de
l’AgHBs est très faible chez les enfants nés après l’introduction du vaccin anti-hépatite B
dans le pays (1.1%105 et 0.2%106). L’étude de modélisation de l’Observatoire Polaris
estime que la prévalence de l’AgHBs est de 1.6% (1.5-1.8% ; 7 900 enfants) chez les
enfants de cinq ans.8

37
 En 2020, le cancer du foie était le troisième cancer avec l’incidence la plus élevée dans
le pays (deuxième chez les hommes et troisième chez les femmes) et le deuxième cancer
avec la mortalité la plus élevée.107 En 2019, 1190 individus (IC à 95% 799-1671) sont
décédés suite à une infection par le VHB en 2019 : 70 (IC à 95% 22-184) dû à une hépatite
B aiguë, 96 (IC à 95% 67-128) dû à un cancer de foie et 1024 (IC à 95% 663-1523) dû à
une cirrhose ou une autre maladie du foie.108

1.5.2. La lutte contre l’hépatite B

1.5.2.1. Acteurs

La lutte contre le VHB dispose de peu de moyens au Sénégal, malgré la volonté

commune des autorités et des professionnels de santé. Trois acteurs principaux sont
impliqués :

Programme National de Lutte contre les Hépatites

Le Programme National de lutte contre l’hépatite B a été créé en 1999. Celui-ci a été
remplacé en 2006 par le Programme National de Lutte contre les Hépatites (PNLH).109 Le
PNLH est l’organe national de coordination et d’appui des activités relatives à la lutte
contre les hépatites.109 Les objectifs généraux du PNLH sont les suivants : (i) réduire
l’incidence des hépatites B et C ; (ii) diminuer la morbidité et la mortalité attribuables aux
hépatites chroniques B et C ; et (iii) maintenir en dessous de 2% la prévalence de
l’infection par le VHC dans la population générale. Le PNLH intervient dans les domaines
du dépistage, de la prévention, du suivi, de la prise en charge thérapeutique, de la
surveillance épidémiologique, de l’information/éducation/communication et de la
recherche.109

Société Sénégalaise de Gastro Entérologie et d’Hépatologie

La plupart des experts des hépatites virales du pays sont regroupés au sein de la Société
Sénégalaise de Gastro Entérologie et d’Hépatologie, fondée en 2007.

Saafara Hépatites
L’Association communautaire de patients atteints par le VHB Saafara Hépatites Sénégal
a été créée en novembre 2011. L’association a pour but de sensibiliser la population à
l’hépatite B et d’apporter un soutien à ceux testés positif. L’objectif est d’inciter les
groupes à risque à se faire dépister. Les activités de l’association incluent la prévention et
le dépistage des groupes à risque, la sensibilisation de l’opinion publique sur les hépatites,
la préparation de supports de communication, le développement de campagnes
spécifiques pour les populations cibles, et l’accompagnement des personnes infectées par
une hépatite.110

38
 1.5.2.2. Politiques de santé mises en place

(a) Prévention
Bien que le Sénégal ait été le site d’essais vaccinaux concluants en 1979-1981, la
vaccination systématique contre l’hépatite B au sein du PEV a été mise en place à partir
de 2004 seulement.111 Entre 1999 et 2004, le PNLH a assuré la vaccination contre
l’hépatite B à la naissance des nouveau-nés, à travers les structures de santé publiques et
privées et des enfants de 24 à 59 mois dans les établissements préscolaires publics et
privés.109 Cependant, l’action était très ciblée et surtout effectuée en ville. Depuis 2004, la
vaccination contre le VHB a été incluse dans le PEV, avec l’administration de trois doses
de vaccin pentavalent 6, 10 et 14 semaines après la naissance. La dose à la naissance a été
ajoutée au PEV en 2016.
Les travailleurs de santé en cours de formation sont dépistés et vaccinés contre le VHB
si besoin.112

(b) Dépistage et suivi

Le pays a mis en place le dépistage systématique de l’AgHBs chez les donneurs de sang
depuis 1982.112 Le dépistage des femmes enceintes n’est pas obligatoire.
Les tests de dépistage en structure sanitaire coûtent environ 2000 FCFA (3.1€).
Le bilan pré thérapeutique et de suivi des malades est difficile à établir. Peu de
laboratoires sont équipés pour réaliser les tests et les coûts sont très élevés (entre 45000
et 80 000 FCFA – 68.7€ à 122.1€ – par test). 109 Par ailleurs, le personnel médical formé à
la prise en charge de l’hépatite B ainsi que les moyens de traitement se trouvent
principalement en ville et la plupart des spécialistes formés dans la prise en charge des
malades exercent dans le privé plutôt que dans le public.109

(c) Traitement
Les recommandations nationales de mise sous traitement ont été élaborées par un
groupe de travail en 2019 sur la base des recommandations de la European Association
for the Study of the Liver de 2012 et adaptées au contexte (par exemple le recours à la
biopsie n’est pas recommandé). Néanmoins, ces recommandations n’ont pas encore été
officiellement validées.
Les patients avec les critères suivants doivent être mis sous traitement :

- ADN VHB>2000 UI/mL et ALAT>limite supérieure à la normale (LSN) et fibrose>F1

- ADN VHB>20 000 UI/mL + ALAT>2LSN
- Cirrhose + ADN VHB détectable
- Enfants : ADN VHB élevé et ALAT>LSN

Le ténofovir doit être utilisé chez les adultes et enfants de plus de 12 ans éligibles au
traitement. Chez les moins de 12 ans, l’entécavir est recommandé.

L’accès au traitement antiviral pour les patients mono-infectés par le VHB a été long au
Sénégal. Ce n’est qu’en 2017 que le Ministère de la Santé a officiellement autorisé la mise

39
à disposition du ténofovir pour le VHB.82 Actuellement, le ténofovir est disponible à la
Pharmacie Nationale d’Approvisionnement, dans les principaux hôpitaux de Dakar et au
PNLH. 109 Le ténofovir coûte 5000 FCFA/mois (7,6€) pour les individus disposant d’une
couverture médicale, 2500 FCFA (3,8€) pour les malades n’ayant pas de couverture
médicale et est gratuit pour les indigents figurant dans la base de données des
bénéficiaires de bourses familales.109

1.5.2.3. Perspectives : Le Plan Stratégique National (2019-

2023)

Le PNLH a récemment publié le Plan Stratégique National 2019-2023112 qui s’inscrit

dans le cadre du Programme de développement durable à l’horizon 2030 et s’aligne sur
les objectifs de la Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale 2016-
2021, à savoir l’élimination de l’hépatite B en tant que problème de santé publique d’ici
2030. Il couvre les cinq premières années du plan d’action. La vision du Plan Stratégique
National est celle d’un Sénégal sans nouvelles infections par les hépatites virales, et où
tous les individus infectés connaissent leur statut et ont accès à des services de santé de
qualité et des traitements sans discrimination et/ou stigmatisation.
Les objectifs spécifiques sont de :

- Sensibiliser les communautés, réduire la stigmatisation et la discrimination

- Renforcer les données épidémiologiques sur les hépatites virales à travers la
recherche et la surveillance
- Empêcher la transmission des hépatites virales
- Améliorer le diagnostic et le traitement de l’hépatite chronique

Les interventions incluent la vaccination des professionnels de santé, la vaccination à

la naissance, le dépistage de l’AgHBs et le traitement antiviral du VHB et du VHC. Par
ailleurs, dans cette perspective, la décentralisation de ces services au niveau des régions
et les districts du pays a été initiée, avec comme région pilote la région de Fatick.

Contexte de l’hépatite B au Sénégal : points clés

- L’hépatite B est endémique au Sénégal, mais les données épidémiologiques

actuellement disponibles proviennent majoritairement d’études menées au sein
de groupes d’adultes spécifiques ou à risque en milieu urbain.
- Le Plan Stratégique National 2019-2023 s’inscrit dans le cadre du Programme
de développement durable à l’horizon 2030 et s’aligne sur les objectifs de la
Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale 2016-2021.
 Des données épidémiologiques sur l’hépatite B chez les enfants en
population générale en milieu rural au Sénégal sont nécessaires pour
évaluer les progrès du pays vers l’élimination de l’hépatite B et proposer
des interventions pour atteindre les objectifs nationaux et de l’OMS.

40
2. Justification et objectifs de la recherche

2.1. Problématique
L’hépatite B a longtemps été un problème de santé publique négligé, tant au niveau
local qu’international. Ce n’est que récemment, et plus particulièrement depuis que les
hépatites virales ont été incluses dans les objectifs du Programme de Développement
Durable à l’horizon 2030 en 2015, que l’hépatite B a été mise sur l’agenda international et
a gagné en visibilité.
Malgré l’ampleur de l’infection par le VHB en ASS, les données sur l’hépatite B sont
insuffisantes et les recherches cliniques et épidémiologiques se développent
lentement.71,82 En effet, peu d’études ont évalué la mise en œuvre et l’efficacité des
stratégies de prévention de l’hépatite B39 et les programmes de surveillance sont peu
performants sur le continent.71 Par ailleurs, peu de pays ont défini des stratégies ou des
plans nationaux de lutte contre l’hépatite virale,71 et la plupart des outils actuellement
disponibles pour le diagnostic et le suivi de l’infection sont inaccessibles ou trop coûteux.
Le dépistage des individus infectés (en particulier ceux infectés pendant l’enfance),
leur suivi, et leur traitement, sont essentiels pour éliminer l’hépatite B.

Les jeunes enfants sont une population clé dans la lutte contre l’hépatite B ; c’est
la prévention et le contrôle de l’infection par le VHB dans cette population qui
permettra l’élimination de l’hépatite B en ASS sur le long-terme car :

- D’une part, le VHB se transmet principalement pendant l’enfance en ASS, et

- D’autre part, l’infection à un jeune âge est le principal facteur de progression vers
l’infection chronique et le cancer du foie.

Ainsi, la vaccination à la naissance suivie d’un schéma vaccinal multidoses, ainsi

que le dépistage des femmes enceintes et la mise sous traitement antiviral des
mères AgHBs-positives constituent des interventions clés pour réduire l’infection
chez les enfants.

Afin d’évaluer et d’orienter les politiques de santé publique en ASS, il est nécessaire
d’avoir des données sur :

- La prévalence de l’infection par le VHB en population générale.8,13,22,23,93,113

- La prévalence de l’infection par le VHB chez les enfants et les adolescents nés après la
mise en place de la vaccination,16,22,113 afin d’évaluer l’impact des programmes de
prévention.

41
 - La couverture vaccinale du vaccin anti-hépatite B et plus particulièrement de la dose
à la naissance. D’après l’OMS, la proportion d’enfants recevant la dose à la naissance
dans les 24 heures suivant la naissance doit être considérée comme une mesure de
performance de tous les programmes d’immunisation ou de performance des
systèmes d’immunisation.17
- Les principaux déterminants épidémiologiques et cliniques de l’hépatite B,82 afin
d’orienter les mesures de prévention et de contrôle.
- L’estimation du nombre d’individus infectés et nécessitant un traitement antiviral,114
afin de proposer une offre de soins adaptée.

En ce qui concerne plus précisément le Sénégal, le taux de prévalence de l’infection

chronique par le VHB est élevé. Néanmoins, le PNLH ne dispose ni de données sur
l’ampleur de l’infection en zone rurale et en population générale, ni sur ses conséquences
sanitaires et socio-économiques sur les populations. Il n’y a également aucune donnée
épidémiologique sur le VHB et sur la vaccination contre l’hépatite B chez les enfants.
Pour pouvoir contrôler et éliminer l’hépatite B au Sénégal, il est nécessaire de pouvoir
disposer de réponses précises aux questions suivantes :

- Quelle est la prévalence de l’infection chronique par le VHB chez les adultes et les
enfants à l’ère de la vaccination ?
- Qui sont les enfants les plus susceptibles d’être infectés ?
- Quelle est la couverture vaccinale du vaccin contre l’hépatite B chez les enfants et
qui sont les enfants à risque de ne pas être vaccinés ?
- Quelles sont les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants ?

Ces questions constituent les questions de recherche de cette thèse.

2.2. Objectifs de recherche

Pour pouvoir répondre aux questions soulevées ci-dessus, l’objectif principal de cette
thèse est de décrire l’épidémiologie de l’hépatite B chez les enfants nés après
l’introduction du vaccin contre l’hépatite B dans le PEV au Sénégal. Cet objectif principal
peut être décliné en quatre objectifs spécifiques :

1. Estimer la prévalence de l’infection chronique par le VHB (en population

générale et selon les groupes d’âge) et les besoins en traitement

Cet objectif vise à :

- Déterminer la prévalence de l’infection chronique par le VHB en population

générale et par tranches d’âge.
- Décrire les caractéristiques cliniques et biologiques des individus infectés par le
VHB.
- Estimer les besoins en traitement des personnes infectées par le VHB.

42
 La prévalence de l’infection par le VHB au Sénégal est actuellement estimée à partir
d’échantillons de populations spécifiques et/ou à risque en zone urbaine, non
représentatives de la population générale. Les données disponibles sont parcellaires et
nécessitent d’être confirmées et complétées par des données en milieu rural et en
population générale afin de disposer de données de prévalence fiables permettant
d’évaluer les besoins de prise en charge et de traitement.
Les résultats de cet objectif permettront d’établir un état des lieux de l’épidémie de
l’hépatite B au Sénégal, en particulier dans la population cible de cette recherche : les
enfants.

2. Identifier les facteurs associés à une infection par le VHB chez les enfants

L’objectif est d’identifier les facteurs associés à une infection par le VHB chez les
enfants nés après la mise en place de la vaccination au Sénégal.
Peu d’études en ASS ont identifié les facteurs associés à une infection par le VHB chez
les enfants. Cependant, l’identification des comportements et facteurs socio-
démographiques associés à l’hépatite B est une des clés pour adapter les politiques de
santé publique et prévenir l’infection par le VHB. Les résultats de ces analyses vont
également permettre d’identifier des modes probables de transmission du VHB au
Sénégal, particulièrement concernant la transmission horizontale.

3. Estimer la couverture vaccinale du vaccin contre l’hépatite B chez les

enfants et les facteurs associés au non-respect des schémas vaccinaux

Cet objectif s’intéresse :

- A la couverture de la dose à la naissance et du schéma vaccinal complet contre

l’hépatite B (dose à la naissance et au moins deux doses de pentavalent) en prenant
en compte les délais de vaccination.
- Aux facteurs associés au non-respect de ces deux schémas vaccinaux (dose à la
naissance et ≥3 doses).

Des études menées en ASS ont montré que la mesure seule de la couverture vaccinale
(proportion d’enfants recevant les doses de vaccins) masquait des délais importants dans
l’administration des vaccins. Or, recevoir des doses de vaccin de manière trop rapprochée,
ou trop éloignée peut avoir un impact sur l’efficacité de la vaccination. Les résultats de ces
analyses vont permettre d’estimer la couverture vaccinale complète (proportion
d’enfants ayant reçu toutes les doses) et la couverture vaccinale correcte (proportion
d’enfants ayant reçu toutes les doses dans les délais recommandés) du programme de
vaccination contre l’hépatite B.
Par ailleurs, s’intéresser aux enfants à risque de vaccination incomplète ou incorrecte
permet d’identifier les facteurs en cause et d’élaborer des stratégies pour améliorer
l’efficacité des programmes de vaccination.

43
 4. Identifier les raisons de non-vaccination ou de sous-vaccination des
enfants et adolescents en ASS

Cet objectif vise à passer en revue les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination

des enfants et adolescents, telles qu’exprimées par les communautés en ASS. Il vient
compléter le troisième objectif.
En effet, la majorité des études évaluant la couverture vaccinale chez les enfants en ASS
s’intéresse à la non-vaccination ou sous-vaccination des enfants en étudiant les facteurs
socio-démographiques associés. Cependant, on trouve peu d’études s’intéressant aux
raisons de non-vaccination ou de sous-vaccination exprimées par les communautés. Alors
que les facteurs sont mis en avant par des analyses statistiques et révèlent des barrières
objectives à la vaccination, les raisons nous informent des barrières subjectives perçues
par les communautés.
Ces deux approches (sur les facteurs et sur les raisons) sont complémentaires pour
avoir une image plus globale des éléments influençant la vaccination des enfants, et
d’identifier des stratégies adaptées.

44
3. Méthodes

Ce travail de thèse s’appuie sur les données du programme de recherche

AmBASS (ANRS 12356) et utilise des outils d’épidémiologie descriptive et analytique.

3.1. L’étude AmBASS (ANRS 12356)

L’étude AmBASS (ANRS 12356) est une enquête transversale sur l’ampleur et les
conséquences de l’infection chronique par le VHB à Niakhar au Sénégal. L’étude est
financée par l’ANRS Maladies Infectieuses Emergentes.
L’étude associe des équipes de chercheurs de l’unité mixte de recherche (UMR) 257
Vecteurs – Infections Tropicales et Méditerranéennes (VITROME) (Dakar, Sénégal), de
l’UMR 1252 Sciences Economiques et Sociales de la Santé et Traitement de l’Information
Médicale (SESSTIM) (Marseille, France), de Institut de Recherche En Santé de Surveillance
Epidémiologique et de Formation (IRESSEF) (Dakar, Sénégal) et de l’Hôpital Européen de
Marseille (France). L’étude est coordonnée par les docteurs Aldiouma Diallo (VITROME)
et Sylvie Boyer (SESSTIM).
Le protocole de l’étude AmBASS a été publié dans BMJ Open.115

3.1.1. Objectifs de l’étude

L’objectif général de l’étude AmBASS est d'évaluer l’ampleur et les conséquences
sanitaires et socio-économiques de l'infection chronique par le VHB au niveau des
individus, des ménages et de la population au Sénégal.
Les objectifs spécifiques sont les suivants :

1. Documenter l’épidémiologie de l’infection chronique par le VHB en population

générale dans la zone rurale de Niakhar. En particulier : (i) d’estimer la
prévalence de l’infection chronique, (ii) d’identifier les facteurs de risque
comportementaux et environnementaux de l’infection chez les enfants, et (iii)
d’estimer la couverture vaccinale du vaccin anti-hépatite B chez les enfants.
2. Evaluer l’acceptabilité du dépistage du VHB à domicile et du bilan clinique et
biologique initial chez les individus infectés.
3. Etudier les conséquences de l’infection chronique par le VHB sur les conditions
de vie des personnes atteintes et de leurs ménages.

45
 4. Estimer l'impact de santé publique de l'infection chronique par le VHB au
niveau de la population et la faisabilité de la mise en place d’un modèle
décentralisé de prise en charge de l’hépatite B.

3.1.2. Schéma de l’étude

L’enquête s’est déroulée en trois phases successives représentées sur la figure 3.

Figure 3. Les trois phases de l’étude AmBASS – ANRS 12356

3.1.2.1. Phase préparatoire

La phase préparatoire comprenait l’information et la communication sur la recherche

au sein de la communauté. Cette première phase a permis d’obtenir l’accord des autorités
locales pour poursuivre la recherche dans les concessions des différents villages.
Une formation des personnels de santé de la zone de Niakhar sur le dépistage, la
prévention, le traitement et la prise en charge de l’hépatite B ainsi que sur certains aspects
spécifiques de la recherche a été organisé avec l’appui de la Société Sénégalaise de
Gastroentérologie et d’Hépatologie et de l’association Saafara Hépatites Sénégal. Les
relais communautaires (« bajenu gox ») qui jouent un rôle clé dans la sensibilisation des
communautés, ont pu bénéficier de certains volets de la formation. L’équipe d’enquêteurs
et de superviseurs en charge du recueil de données auprès des ménages ont été formés.
Une enquête pilote a été conduite auprès d’un échantillon de 10 ménages vivant dans
deux villages de la zone de l’observatoire de Niakhar non sélectionnés pour participer à
l’enquête.

46
 3.1.2.2. Enquête en population générale

La deuxième phase de l’étude a porté sur la conduite d’une enquête à domicile dans les
ménages, comprenant : (i) la sensibilisation des ménages sélectionnés et le recueil du
consentement individuel pour participer à la recherche ; (ii) des conseils et des
informations sur l’infection par le VHB ; (iii) le dépistage de l’hépatite B reposant sur la
détection de l’AgHBs sur papier buvard Dried Blood Spot (DBS) ; (iv) l’administration d’un
questionnaire socio-économique mené en face à face avec les participants et ; (v) et
l’administration d’un questionnaire portant sur les caractéristiques du ménage au chef du
ménage.

3.1.2.3. Rendu des résultats et de collecte de données

complémentaires auprès des individus AgHBs-positifs

La troisième phase de l’enquête s’est déroulée dans les postes de santé de la zone de
Niakhar. Tous les participants ont reçu le résultat de leur test de dépistage accompagné
d’un counseling post-test (informations sur les mesures de prévention de l’hépatite B, le
traitement et les soins). De plus, les participants dépistés avec une infection chronique
par le VHB (AgHBs-positifs) ayant donné leur consentement ont bénéficié d’un bilan
clinique et biologique pour évaluer le stade de l’infection et l’atteinte hépatique.

3.1.3. Lieu de l’étude

La recherche a eu lieu au sein de l’observatoire de Niakhar. Créé en 1962, ce système
de surveillance démographique et sanitaire est le plus ancien du Sénégal. Situé à 135
kilomètres à l’est de Dakar (voir figure 4), il couvre une zone de 203 km2, comprenant 30
villages et une population de 44 854 habitants en 2018.115

Figure 4. Carte du Sénégal et de l'observatoire de démographie et de santé de Niakhar

47
 Initialement développé afin de produire des indicateurs démographiques de qualité,
l’observatoire est devenu une base solide en santé publique pour le développement
d’études cliniques et épidémiologiques. La station de Niakhar dispose d’infrastructures et
de personnel sur place, comprenant notamment des enquêteurs et des techniciens formés
à la passation de questionnaires et à la réalisation des prélèvements biologiques
nécessaires selon les études. La population est suivie régulièrement et les évènements
comme les migrations, mariages, grossesses, vaccinations et décès sont enregistrés dans
la base de données de l’observatoire.
La zone de l’observatoire de Niakhar comprend quatre postes de santé (structures de
santé de niveau primaire) dans trois villages. Les structures de référence de ces postes de
santé sont situées à proximité de la zone : à Niakhar pour le centre de santé (référence au
niveau district) et à Fatick, à une quinzaine de kilomètres, pour l’hôpital régional (centre
de référence au niveau régional).

Par ailleurs, bien qu’il n’existe pas de données permettant de déterminer si la zone de
l’observatoire est davantage touchée par l’hépatite B que d’autres régions du pays, celle-
ci présente plusieurs facteurs de risque d’évolution de l’hépatite vers la cirrhose ou le
carcinome hépatocellulaire, dont notamment une forte consommation locale d’arachides
à concentration élevée d’aflatoxine. Une analyse des causes de mortalité chez les adultes
de la zone, effectuée dans le cadre du développement du projet de recherche, a également
montré que les tumeurs malignes du foie et des voies biliaires intrahépatiques
représentent la première cause de mortalité identifiée dans cette zone (données non
publiées, issues de l’analyse des autopsies verbales collectées sur une longue période
auprès de la population de la zone de Niakhar).
De plus, bien que l’observatoire soit le site d’une surveillance démographique et de
nombreuses recherches, il est assez représentatif d’une zone rurale intermédiaire au
Sénégal en termes de structure démographique, d’activité économique (reposant
majoritairement sur l’agriculture et l’élevage) et d’infrastructures sanitaires. Il n’existe
pas de services de santé spécifiques liés à l’observatoire, ni d’intervention particulière
dans le domaine de l’hépatite B qui pourraient impacter les résultats de l’étude.
La région de Fatick, dans laquelle se trouve l’observatoire de Niakhar, a été choisie par
le PNLH comme région pilote pour la décentralisation des soins et du traitement de
l’hépatite B.

3.1.4. Population d’étude et sélection des

participants
3.1.4.1. Calcul de la taille de l’échantillon

La taille de l’échantillon a été calculée : (i) en faisant l’hypothèse d’une prévalence

moyenne minimum de 10% et maximale de 17% sur la base des études disponibles; (ii)

48
de façon à être représentatif de la zone de l’observatoire de Niakhar, en termes de
localisation géographique et de classes d’âges ; (iii) afin d’être de taille suffisante pour
pouvoir fournir une estimation de la prévalence du VHB chronique dans la population
générale de la zone avec une précision d’au moins 1,2% et une estimation de la prévalence
du VHB chronique chez les femmes en âge de procréer (15-49 ans) et dans les tranches
d’âge 0-14 ans ; 15-34 ans ; ≥35 ans avec une précision d’au moins 3%. L’hypothèse d’un
taux de participation de 90% et d’un taux de déperdition des prélèvements DBS de 3% a
également été prise en compte.

Sur la base de ces hypothèses et des précisions souhaitées d’estimation de la

prévalence dans les différents groupes, le nombre de sujets à inclure dans l’enquête était
de 3200 individus.

L’échantillonnage était basé sur un sondage stratifié à deux degrés :

- Au premier degré, les villages dans lesquels s’est déroulée la recherche ont été tirés
au sort. Les 30 villages situés dans la zone de Niakhar se répartissent en deux
strates (milieu rural et milieu semi-urbain) selon leurs infrastructures et
équipements. Les trois villages de la strate « milieu semi-urbain » ont été
sélectionnés et huit villages de la strate « milieu rural » ont été tirés au sort.
- Au second degré, un échantillon de ménages dans les villages sélectionnés a été tiré
au sort par tirage systématique à probabilités égales. La taille moyenne des
ménages de la zone étant de 11 individus, le nombre de ménages à tirer au sort était
estimé à 3200/11 = 291 ménages.

3.1.4.2. Sélection des ménages participants et des individus

participants

(a) Critères d’inclusion

La population de l’étude comprenait toutes les personnes, âgées d’au moins six mois,
résidant dans les ménages de la zone de l’observatoire de Niakhar tirés au sort pour
participer à la recherche, et qui ont accepté d’y participer. Un individu était considéré
comme résidant de la zone s’il vivait au sein des ménages enquêtés au moins six mois dans
l’année (y compris s’il ne résidait pas de façon permanente dans les ménages, par exemple
les travailleurs temporaires ou personnes étudiant en dehors de la zone de
l’observatoire).

(b) Critères de non-inclusion

Il n’y avait aucun critère de non-inclusion au niveau du ménage. Au niveau individuel,
les critères de non-inclusion étaient d’être un adulte en incapacité de signer un
consentement éclairé ou d’être un enfant mineur dont les parents ou le tuteur légal étaient
absents au moment du passage à domicile.

49
 3.1.5. Recueil de données
Le projet AmBASS-ANRS 12356 est une étude multidisciplinaire combinant des
données biologiques, cliniques et socio-comportementales.
La collecte de données du projet AmBASS a eu lieu entre octobre 2018 et mai 2019.
L’équipe terrain présente à l’observatoire de Niakhar était constituée d’un coordinateur
terrain, d’un médecin, de deux infirmières, de huit enquêteurs et de deux chauffeurs.

3.1.5.1. Données biologiques

L’OMS recommande l’utilisation des DBS dans les zones où il n’y a pas de structure ou
d’expertise pour effectuer des prélèvements de sang total, où les tests de diagnostic
rapides ne sont pas disponibles ou leur utilisation n’est pas envisageable, ou lorsqu’il est
compliqué d’effectuer un prélèvement veineux chez les individus.60 Les DBS ont une
bonne sensibilité (92.9%, IC à 95% 86.2-96.5%) et spécificité 99.9% (IC à 95% 96.2-
99.7%) comparé aux prélèvements sur plasma ou sur sérum pour détecter l’AgHBs.60
Pour l’étude AmBASS, un seuil de positivité de l’AgHBs a été fixé à 1.5 UI/L sur DBS,
d’après les données de doubles mesures sur DBS et sur sérum de 36 participants de
l’enquête pilote. Un prélèvement capillaire de cinq gouttes de sang total sur DBS
Whatman 903 a été effectué à domicile auprès de l’ensemble des participants à la
recherche.
Chez les individus AgHBs-positifs, le niveau d’ADN VHB ainsi que la présence
d’AgHBe/Ac anti-HBe ont été mesurés sur DBS. Lors de l’enquête en dispensaire, les
infirmières du projet ont également effectué un prélèvement veineux de sang total afin
d’évaluer l’atteinte hépatique chez les patients ayant donné leur consentement.

Les DBS et les prélèvements veineux ont été conditionnés selon les procédures définies
et acheminés à la fin de chaque journée d’enquête à la station l’Institut de Recherche pour
le Développement (IRD) à Niakhar, où ils ont été conservés. Les échantillons ont été
transportés à l’IRESSEF chaque semaine pour les analyses. Le tableau 3 présente les
différents marqueurs biologiques mesurés auprès des participants.

50
Tableau 3. Marqueurs biologiques du projet AmBASS (ANRS 12356)
Marqueurs biologiques Signification en cas de positivité
Dépistage du VHB pour tous les participants
AgHBs Infection chronique par le VHB
Examens complémentaires chez les individus AgHBs-positifs
AgHBe Réplication virale très active, risque de transmission élevé
Arrêt de la réplication virale (ou virus mutant si réplication
Ac anti-HBe
virale en cours)
ADN VHB Niveau élevé = réplication virale en cours
VIH Co-infecté par le VIH
VHD Co-infecté par le VHD
Numération formule
Thrombopénie = symptôme de l’aggravation de la maladie
sanguine (NFS)/ plaquettes
ALAT/ ASAT Niveau élevé = marqueur de maladie chronique du foie
Taux de prothrombine (TP) Allongement du TP = probable insuffisance hépatocellulaire

3.1.5.2. Données cliniques

Lors du rendu des résultats en dispensaire, le médecin du projet administrait à chaque

participant avec une infection chronique par le VHB un questionnaire complémentaire
afin de mieux caractériser leur état de santé et antécédents individuels et familiaux (voir
tableau 4).

Tableau 4. Données cliniques du projet AmBASS (ANRS 12356)

Thème principal Thèmes spécifiques

Mesure des principaux paramètres médicaux (poids,

taille, tension artérielle, température, indice de masse
Examen clinique
corporelle) et recherche des symptômes cliniques d’une
hépatite et d’une maladie du foie

Infections diagnostiquées, hospitalisation récente,

Antécédents médicaux individuels traitements des hépatites en cours ou passés, antécédents
et familiaux de carcinome hépatocellulaire et cirrhose dans la famille,
traitements en cours
Facteurs de risque d’évolution de
l’infection par le VHB (chez les Consommation d’alcool, consommation de tabac,
participants « adultes »1) comportements sexuels, incarcérations
1 nés après le 1 septembre 2003

51
 3.1.5.3. Données socio-économiques

Les questionnaires socio-économiques ont été administrés par les enquêteurs à

domicile, en face-à-face, après le pré-counseling sur le dépistage de l’hépatite B et le
prélèvement capillaire sur papier buvard.

(a) Questionnaire sur les caractéristiques du ménage

Pour chaque ménage participant, un questionnaire était administré au chef de ménage
ou au représentant du chef de ménage ayant accepté de participer à la recherche.
Il comprenait des informations sur la composition du ménage ainsi que sur le statut et
l’activité du chef de ménage. Il reprenait également les indicateurs classiques sur les
conditions de vie, les revenus du ménage, la sécurité alimentaire et les caractéristiques de
l’habitat afin de caractériser la situation socioéconomique et le niveau de vie du ménage
(voir tableau 5).

Tableau 5. Données du questionnaire cuisine (AmBASS ANRS 123456)

Thème principal Thèmes spécifiques

Nombre de ménages dans la concession, nombre d’individus

Information générale
dans le ménage (adultes, enfants)
Activité agricole, possession de terres agricole, participation
du ménage à l’activité agricole, main-d’œuvre extra-familiale,
Production agricole
culture du mil, culture de l’arachide, culture du bissap, culture
d’autres produits, animaux de trait, matériel agricole
Bétail Animaux nourriciers
Argent venant de parents/famille vivant au Sénégal ou à
Autres sources de revenu l’étranger, bourse de sécurité familiale du gouvernement du
Sénégal
Sécurité alimentaire Aide alimentaire, mil reçu
Biens de consommation, boutique, source
Caractéristiques du ménage
d’approvisionnement en eau, source d’énergie
Statut d’occupation du logement, nombre de pièces pour
Type d’habitat dormir, nombre de chambres à louer, caractéristiques de la
pièce à vivre

(b) Questionnaire individuel

Un questionnaire a été administré aux adultes (nés avant le 01 septembre 2003) des
ménages tirés au sort pour participer à la recherche, sous réserve de leur consentement.
Le tableau 6 présente les thèmes abordés dans le questionnaire.

52
Tableau 6. Données du questionnaire adulte (nés avant le 1 septembre 2003) (AmBASS ANRS
12356)
Thème principal Thèmes spécifiques
Sexe, âge, situation matrimoniale, nombre d’enfants,
Information générale études/formations au cours des 12 derniers mois, niveau
d’instruction

Participation aux travaux agricoles du ménage, travaux agricoles

Activité économique rémunérés, travail agricole indépendant, autres types d’activité
économique

Santé perçue et qualité de Santé perçue (échelle EQ-5D), la fatigue ressentie (échelle de
vie Piper abrégée), handicap

Grossesses menées à terme (nombre de grossesses,

Santé maternelle (pour les
accouchement par césarienne, personnes présentes lors de
femmes en âge de procréer
l’accouchement), participation aux consultations prénatales,
15-49 ans)
grossesse en cours

Maladies du foie (connaissances, antécédents familiaux),

Dépistage VHB et maladies
connaissances sur l’hépatite B, connaissances et perception de la
du foie
vaccination, dépistage de VHB
Hospitalisation au cours des 12 derniers mois, maladie au cours
Recours aux soins et
des trois derniers mois, assurance maladie, dépenses de santé au
dépenses de sante
cours des trois derniers mois, statut/certificat d’indigence

Pour les enfants (nés après le 1er septembre 2003), un questionnaire spécifique a été
administré à la mère ou au tuteur légal de l’enfant, avec l’assentiment de ce dernier. Le
questionnaire a permis d’évaluer leur état de santé, la vaccination ainsi que leur
exposition à des pratiques/comportements favorisant la transmission horizontale du
VHB (voir tableau 7).

Tableau 7. Données du questionnaire enfant (nés après le 1 septembre 2003) (AmBASS ANRS
12356)
Thème principal Thèmes spécifiques

Sexe, âge, ordre de naissance, niveau de scolarisation, travail

Information générale
agricole, travail domestique, travail rémunéré

Handicap, maladie chronique, hospitalisation au cours de l’année

Santé
précédente, maladie au cours des trois mois précédents

Statut vaccinal anti-hépatite B, lieu de naissance, voie de

naissance, assistance pendant la naissance, antécédents
Vaccination VHB et
médicaux, scarification, tatouages, piercings, soins avec des
facteurs de risque
aiguilles, partage de matériel d’hygiène corporelle,
consommation d’aliments prémâchés, circoncision

53
 3.1.6. Gestion des données
Les données biologiques ont été saisies par l’équipe de l’IRESSEF sur Excel et
contrôlées par les gestionnaires de données de l’équipe de VITROME.

Le questionnaire médical a été renseigné sous format papier par le médecin du projet,
qui a ensuite saisi les données sous Access. Un contrôle qualité a été fait par les
gestionnaires de données de l’équipe VITROME.

Les questionnaires à domicile ont été saisis sur tablette à l’aide du logiciel Voxco par
les enquêteurs. Le paramétrage imposait une réponse systématique à toutes les questions.
Tous les soirs, le coordinateur terrain récupérait les tablettes et transmettait les données
au data manager de la plateforme logistique du SESSTIM via une connexion internet. Une
vérification des identifiants et du suivi des questionnaires a été effectuée régulièrement
pour s’assurer du bon déroulement du recueil des données socio-économiques.

Les données ont été nettoyées et les bases de données élaborées par les gestionnaires
de base de VITROME et du SESSTIM.

3.1.7. Contribution personnelle à la collecte de

données
J’ai effectué mon doctorat au sein de l’équipe 3 « Maladies infectieuses persistantes et
émergentes en Afrique de l’Ouest » de l’UMR VITROME basée à la représentation de l’IRD
d’Hann Maristes à Dakar, Sénégal.
Le début de mon doctorat en novembre 2018 a coïncidé avec le début de la collecte de
données du projet AmBASS, qui s’est achevée en mai 2019. Pendant toute cette période
j’ai contribué à la coordination entre les différentes équipes du projet (Marseille, Dakar,
Niakhar), au suivi des activités sur le terrain, au contrôle qualité et au pilotage du projet.

3.1.7.1. Activités de terrain

J’ai effectué des missions régulières à l’observatoire de Niakhar avec l’équipe terrain, à
raison de deux semaines par mois, afin :

- D’assurer la bonne conduite du projet suivant le protocole de l’étude.

- De faire prendre les dispositions pour que soit atteinte la qualité requise pour les
données socio-comportementales, cliniques et biologiques.
- D’identifier les problèmes rencontrés sur le terrain et d’en informer les chefs de
projets et responsables scientifiques du projet.

54
 - De veiller à la disponibilité du matériel nécessaire à la collecte de données et à
l’approvisionnement des équipes sur le terrain.

3.1.7.2. Contrôle qualité

En parallèle, j’ai effectué le contrôle qualité des tableaux de bord et des outils de suivi :
vérification de la correspondance entre les identifiants des participants inclus (outil
Access) et les questionnaires complétés, suivi des informations manquantes en lien avec
le coordonnateur terrain, et le contrôle du tableau de bord du suivi de l’enquête.

3.1.7.3. Pilotage

J’ai participé aux réunions de suivi du projet AmBASS dont les réunions hebdomadaires
de coordination, le comité de pilotage, les conseils scientifiques, l’atelier à Marseille avec
les équipes de VITROME et du SESSTIM pour échanger sur les premiers résultats de
l’étude (décembre 2019), et à la restitution des résultats du projet à Dakar et à Fatick
auprès d’acteurs impliqués dans la lutte contre l’hépatite B au Sénégal (juillet 2021).

3.1.7.4. Bases de données

Avec les gestionnaires de base de VITROME et du SESSTIM, j’ai encadré le nettoyage

des bases de données à Dakar. J’ai organisé une mission de deux semaines en juillet 2019
à l’observatoire de Niakhar afin de corriger et de compléter certaines données
manquantes ou incohérentes. En particulier, je suis allée dans les centres de santé de
l’observatoire afin de corriger et de compléter les données de vaccination des enfants à
partir des registres de vaccination.

J’ai également effectué des séjours réguliers à Marseille au sein de l’équipe

SanteRCom « Santé et Recherche Communautaire » du SESSTIM, afin de travailler sur
l’analyse et la valorisation des données AmBASS.

3.2. Utilisation des données AmBASS

3.2.1. Données AmBASS utilisées
Ce travail de thèse utilise les données biologiques, cliniques et socio-
comportementales du projet AmBASS. Les données utilisées sont indiquées dans le
tableau 8.

55
Tableau 8. Données AmBASS (ANRS 12356) utilisées pour la thèse

Données
Données du projet AmBASS
utilisées
Données biologiques
AgHBs (tous les participants) ✓
AgHBe (AgHBs-positifs) ✓
Ac anti-HBe (AgHBs-positifs) ✓
ADN VHB (AgHBs-positifs) ✓
VIH (AgHBs positifs) ✓
VHD (AgHBs positifs) ✓
NFS/ plaquettes (AgHBs positifs) ✓
Transaminases ALAT/ ASAT (AgHBs positifs) ✓
TP (AgHBs positifs)
Données cliniques
Examen clinique ✓
Antécédents médicaux individuels et familiaux ✓
Facteurs de risque d’évolution de l’infection par le VHB (chez les participants
« adultes »)
Données socio-économiques (questionnaire ménage)
Information générale ✓
Production agricole ✓
Bétail ✓
Autres sources de revenu ✓
Sécurité alimentaire ✓
Caractéristiques du ménage ✓
Type d’habitat ✓
Données socio-économiques (questionnaire adulte)
Information générale ✓
Activité économique ✓
Santé perçue et qualité de vie
Santé maternelle (pour les femmes en âge de procréer 15-49 ans)
Dépistage VHB et maladies du foie

Recours aux soins et dépenses de sante

Données socio-économiques (questionnaire enfant)
Information générale ✓
Santé ✓
Vaccination VHB et facteurs de risque ✓

Des données de la base de l’observatoire de Niakhar ont également été utilisées pour
corriger et compléter certaines données du projet AmBASS (date de naissance, sexe,
numéro de cuisine ou de concession, identifiants de la mère ou du père de l’enfant, …).
Afin d’avoir des données de vaccination les plus complètes possibles, trois sources de
données ont été utilisées : (i) les données renseignées sur les carnets de vaccination des
enfants collectées lors de l’enquête principale ; (ii) les données de l’observatoire de
Niakhar (au moins deux fois par an, les données de vaccination des enfants résidant dans
au sein de l’observatoire sont collectées et mises à jour à partir des carnets de
vaccination) ; (iii) les données des registres de vaccination des postes de santé de la zone.

56
 3.2.2. Analyses statistiques
J’ai mené et effectué les analyses statistiques avec l’appui des équipes du SESSTIM.

3.2.2.1. Pondération et redressement des données AmBASS

Les données du projet AmBASS ont été pondérées et redressées afin d’être
représentatives des résidents de la zone de Niakhar en termes de sexe (masculin, féminin)
et d’âge (0-14 ans ;15 à 34 ans ; ≥35 ans).

D’abord, le poids de sondage P1 (l’inverse de la probabilité d’inclusion dans

l’échantillon) a été calculé pour chaque participant.
1
𝑃1 =
(𝑛𝑏. 𝑝𝑎𝑟𝑡𝑖𝑐𝑖𝑝𝑎𝑛𝑡𝑠 𝑖𝑛𝑐𝑙𝑢𝑠 𝑑𝑎𝑛𝑠 𝑙𝑎 𝑐𝑢𝑖𝑠𝑖𝑛𝑒 ÷ 𝑛𝑏. é𝑙𝑖𝑔𝑖𝑏𝑙𝑒𝑠 𝑝𝑟é𝑠𝑒𝑛𝑡𝑠 𝑑𝑎𝑛𝑠 𝑙𝑎 𝑐𝑢𝑖𝑠𝑖𝑛𝑒)
𝑛𝑏. 𝑐𝑢𝑖𝑠𝑖𝑛𝑒𝑠 𝑝𝑎𝑟𝑡𝑖𝑐𝑖𝑝𝑎𝑛𝑡 à 𝑙’𝑒𝑛𝑞𝑢ê𝑡𝑒 𝑑𝑎𝑛𝑠 𝑙𝑒 𝑣𝑖𝑙𝑙𝑎𝑔𝑒 ÷ 𝑛𝑏. 𝑐𝑢𝑖𝑠𝑖𝑛𝑒𝑠 𝑡𝑖𝑟é𝑒𝑠 𝑎𝑢 𝑠𝑜𝑟𝑡
× ( )
𝑑𝑎𝑛𝑠 𝑙𝑒 𝑣𝑖𝑙𝑙𝑎𝑔𝑒
× (𝑛𝑏. 𝑣𝑖𝑙𝑙𝑎𝑔𝑒𝑠 𝑡𝑖𝑟é𝑠 𝑎𝑢 𝑠𝑜𝑟𝑡 𝑝𝑜𝑢𝑟 𝑝𝑎𝑟𝑡𝑖𝑐𝑖𝑝𝑎𝑡𝑖𝑜𝑛 à 𝑙’𝑒𝑛𝑞𝑢ê𝑡𝑒 ÷ 𝑛𝑏. 𝑣𝑖𝑙𝑙𝑎𝑔𝑒𝑠 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑧𝑜𝑛𝑒)

Le poids de sondage P1 a été corrigé sur le temps de présence dans le ménage (P2).
Pour les enfants, une hypothèse d’une présence en continu sur les 12 derniers mois de
l’année a été retenue.

𝑃1
𝑃2 =
𝑛𝑏. 𝑚𝑜𝑖𝑠 𝑑𝑒 𝑝𝑟é𝑠𝑒𝑛𝑐𝑒 𝑑𝑎𝑛𝑠 𝑙𝑎 𝑐𝑢𝑖𝑠𝑖𝑛𝑒 𝑎𝑢 𝑐𝑜𝑢𝑟𝑠 𝑑𝑒 𝑙′𝑎𝑛𝑛é𝑒

Les données ont ensuite été redressées post-stratification. D’abord, six post-strates ont
été définis selon les caractéristiques choisies (sexe en 2 modalités et âge en 3 modalités) :
1. hommes 0-14 ans
2. hommes 15 à 34 ans
3. hommes ≥ 35 ans
4. femmes d’âge 0-14 ans
5. femmes d’âge 15 à 34 ans
6. femmes d’âge ≥ 35 ans

Ensuite, la proportion d’individus dans chaque post-strate a été calculée dans la

population du HDSS avec la base de 2017 (% théorique) et dans l’échantillon (% réel). Le
rapport % théorique ÷ % réel donne un coefficient post-strate.

Le poids final (P) a été calculé de la manière suivante:

𝑃 = 𝑃2 × 𝑐𝑜𝑒𝑓𝑓𝑖𝑐𝑖𝑒𝑛𝑡

Toutes les analyses utilisant les données du projet AmBASS ont été effectuées avec les
données pondérées et redressées.

57
 3.2.2.2. Analyses descriptives et univariées/multivariées

Le premier article de cette thèse sur la prévalence de l’infection chronique par le VHB
et les besoins en traitement dans la zone de Niakhar utilise uniquement des analyses
descriptives. Des analyses univariées et multivariées ont été effectuées dans le deuxième
article sur les facteurs associés à une infection par le VHB chez les enfants et le troisième
article sur la couverture vaccinale contre le VHB et les facteurs associés au non-respect
des schémas vaccinaux.

Pour les analyses descriptives, les données catégorielles ont été présentées sous forme
de proportion, et les données continues sous forme de moyenne. Les comparaisons entre
les proportions ont été effectuées par les tests du Chi2 ou le test exact de Fischer. Le t-test
de Student a été utilisé pour comparer les moyennes.

Des analyses univariées ont permis de croiser l’ensemble des variables explicatives
(socio-démographiques, comportementales, …) avec les variables d’intérêts. Différentes
méthodes de régression ont été utilisées.
Pour le deuxième article sur les facteurs associés à une infection par le VHB chez les
enfants, un modèle de régression binomial négatif a été utilisé en raison du faible effectif
de la variable d’intérêt (n=17/1327 enfants AgHBs-positifs). Les résultats sont présentés
en incidence risk ratio.
Dans le troisième article sur la couverture vaccinale contre le VHB et les facteurs
associés au non-respect des schémas vaccinaux, un modèle Heckman a permis de vérifier
s’il y’avait un biais de sélection dans la population d’étude (si les enfants avec des données
de vaccination disponibles avaient des caractéristiques différentes de ceux sans données
de vaccination, et si cela biaisait les estimations des associations). Etant donné qu’il n’y
avait pas de biais de sélection, un modèle de régression logistique a été utilisé et les
résultats sont présentés en OR.
Les variables explicatives avec une p-valeur<0.25 dans l’analyse univariée ont été
testées dans le modèle multivarié. Les variables significatives au seuil de 5% et au seuil
de 10% ont été retenues dans les modèles multivariés finaux pour le deuxième et le
troisième article, respectivement. La méthode descendante (backward stepwise
regression) a été utilisée pour obtenir le modèle multivarié final dans les deux articles.

Toutes les analyses ont été effectuées avec le logiciel STATA version 14.2 pour
Windows (StataCorp, College Station, TX, USA).

3.3. Revue systématique de la littérature

J’ai effectué une revue systématique de la littérature avec l’équipe Dilemme et Décision,
Risques et Actes Médicaux de VITROME sous la supervision du Dr Patrick Peretti-Watel

58
(en collaboration initiale avec Dr Valérie Séror) sur les raisons de non-vaccination et de
sous-vaccination des enfants et adolescents en ASS.
Le protocole de la revue a été publié sur la base de données de revues systématiques
de la littérature PROSPERO (CRD42020178123).116 La revue a été effectuée en suivant les
critères Preferred Reporting Items for Sytematic Reviews and Meta-Analyses.117

Les bases de données PubMed, Web of Science, African Index Medicus et African
Journals Online ont été utilisées pour identifier les articles publiés entre 2010 et 2020 sur
les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants et adolescents, telles
qu’exprimées par les communautés en ASS. Les références des articles éligibles ont
également été examinées.
Les critères étaient les suivants :

- Population : enfants et adolescents (jusqu’à 19 ans) en population générale, vivant

en ASS et éligibles à la vaccination
- Exposition : vaccins pour enfants et adolescents, peu importe la stratégie vaccinale
(ex : vaccination de routine, campagnes de vaccination)
- Variables d’intérêt : raisons de non-vaccination (recevoir aucune dose de vaccin),
de sous-vaccination (recevoir au moins une dose de vaccin mais pas toutes les
doses recommandées) et de vaccination incorrecte (recevoir les vaccins mais pas
dans les délais recommandés).

Les titres et abstracts ont d’abord été filtrés. Etant donné que très peu d’articles ont
étudié les raisons de vaccination incorrecte, cette variable d’intérêt a été exclue. Les
articles publiés avant 2010 ont aussi été exclus car une revue de Rainey et collègues sur
les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants dans les pays à faible et
moyen revenu, en utilisant les données d’articles publiés entre 1999 et 2009, a déjà été
publiée.118 Après avoir sélectionné les abstracts éligibles, le texte intégral des articles a
été évalué.

Pour sélectionner les articles de la revue, un score de pertinence basé sur 5 critères a
été développé : 1) un des objectifs de l’étude était d’étudier les raisons de non-vaccination
et/ou de sous-vaccination ; 2) l’étude s’est déroulée en milieu communautaire ; 3) le
statut vaccinal de l’enfant/adolescent était connu ; 4) les résultats étaient suffisamment
détaillés, et 5) les résultats de l’étude ont été comparés aux résultats d’autres études.
Seules les études avec un score d’au moins 3 sur 5 ont été inclus dans la revue de
littérature.
Nous avons ensuite classé les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination en 11
thèmes, en utilisant une version modifiée des catégories de la revue de Rainey et
collègues,118 qui étaient basées sur la “Classification of Factors Affecting Receipt of
Vaccines” de Vaccines (5ème edition).119

59
4. Résultats

4.1. Article 1 – Hépatite B au Sénégal : Succès

du programme de vaccination mais un besoin
urgent d’améliorer l’accès au dépistage et au
traitement à grande échelle
Bien que la majorité des pays en ASS aient introduit la vaccination contre l’hépatite B
dans leurs PEV, il y’a peu de données sur la situation épidémiologique du VHB dans la
région. Afin d’éliminer l’hépatite B en tant que problème de santé publique d’ici 2030, des
données épidémiologiques robustes et récentes au niveau local sont donc nécessaires.

Les objectifs de cet article sont : (i) de documenter la prévalence de l’infection chronique
par le VHB en population générale dans la zone de Niakhar au Sénégal, et (ii) d’estimer la
proportion d’individus nécessitant un traitement antiviral.

Pour répondre à ces objectifs, nous avons utilisé les données du projet AmBASS. Tous
les participants ont été dépistés pour l’infection par le VHB (détection de l’AgHBs sur DBS)
et ont répondu à un questionnaire socio-économique. Les participants AgHBs-positifs ont
effectué un bilan clinique et biologique. Nous avons évalué leur éligibilité au traitement
antiviral en utilisant les recommandations nationales et de l’OMS.

Parmi les 3118 participants, 206 étaient AgHBs-positifs. La prévalence de l’infection

chronique par le VHB était de 6.9% (IC à 95%, 5.6-8.1%) en population générale, avec
d’importantes différences selon les groupes d’âge. Tandis que la prévalence était très
basse chez les enfants : (0.00% [IC à 95% 0.00-0.01%] chez les 0-4 ans et 1.5% [IC à 95%
0.0-2.3%] chez les 5-14 ans), elle était élevée chez les adultes nés avant l’introduction du
vaccin contre l’hépatite B dans le PEV (12.4% [IC à 95% 9.1-15.6%] et 8.8% [IC à 95% 6.1-
11.5%] chez les 15-34 et ≥35 ans, respectivement). Parmi les individus ayant fait un bilan
clinique et biologique, la moitié avait une infection chronique active et cinq (4.1% [IC à
95% 1.5-10.7%]) étaient éligibles au traitement antiviral.

En conclusion, la faible prévalence du VHB chez les enfants montre le succès de la

vaccination contre l’hépatite B au Sénégal. En effet, le pays a atteint l’objectif de l’OMS
d’une prévalence inférieure à 1% chez les moins de 5 ans en 2020 et est proche d’atteindre
l’objectif d’une réduction de l’incidence de l’infection chronique par le VHB de 90% d’ici

60
2030. Néanmoins, la prévalence élevée chez les adultes souligne la nécessité d’un
dépistage communautaire à large échelle et de l’amélioration de l’accès aux soins et au
traitement contre l’hépatite B.

L’article a été soumis à BMJ Global Health. Les annexes de l’article sont présentées
dans l’annexe C.

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 4.2. Article 2 – Le statut VHB de la fratrie, la
naissance à domicile, les tatouages et les
points du suture sont des facteurs de risque
de l’infection par le VHB chez les enfants
Sénégalais : Une enquête transversale
L’épidémie de l’hépatite B en ASS est principalement due à des infections acquises
pendant l’enfance. En effet, l’infection par le VHB à un jeune âge est le principal facteur de
progression vers l’infection chronique et le cancer du foie et en ASS, le VHB se transmet
surtout pendant l’enfance. Cependant, peu d’études en ASS ont identifié les facteurs de
risques associés à une infection par le VHB chez les enfants.

Les objectifs de ce deuxième article étaient : (i) d’estimer la prévalence de l’infection

chronique par le VHB chez les enfants Sénégalais nés après l’introduction du vaccin contre
l’hépatite B, et (ii) d’identifier les facteurs de risque associés.

Nous avons pris comme population d’étude les enfants inclus dans le projet AmBASS
nés entre 2004 et 2015 ; après l’introduction du vaccin pentavalent dans le PEV (2004) et
avant la mise en place de la dose à la naissance (2016). Des DBS ont été utilisés pour
identifier les enfants AgHBs-positifs. Un questionnaire socio-économique a été administré
à un parent ou tuteur légal. Nous avons utilisé un modèle de régression binomial négatif
pour identifier les facteurs de risque associés à une infection par le VHB.

Parmi les 1327 enfants inclus, 17 étaient AgHBs-positifs (prévalence 1.23%, IC à 95%
0.61-1.85%). Les enfants plus âgés, ayant un tatouage, ayant eu des points de suture, ayant
un frère ou une sœur (issu de la même mère) infecté par le VHB et les enfants nés à la
maison (plutôt qu’en structure de santé) étaient plus à risque d’être infectés par le VHB.

Ces résultats montrent le succès de la vaccination contre l’hépatite B au Sénégal. Par

ailleurs, ces résultats suggèrent l’importance de la transmission intrafamiliale et mettent
en évidence, pour la première fois, les risques liés à certaines pratiques. Afin de réduire
davantage l’infection par le VHB chez les enfants, il est nécessaire de dépister les groupes
à risque (en particulier les femmes enceintes et les frères et sœurs des enfants AgHBs-
positifs), d’encourager l’accouchement en structure de santé, et de renforcer les pratiques
de prévention et de contrôle des infections des personnels de santé et des communautés.

L’article a été publié dans Journal of Viral Hepatitis. Les annexes de l’article sont
présentées annexe D.

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 4.3. Article 3 – Vaccination contre l’hépatite B
chez les enfants Sénégalais : Couverture
vaccinale, délais de vaccination et
déterminants socio-démographiques du non-
respect des schémas vaccinaux (ANRS 12356)
La vaccination est la principale mesure de prévention de l’hépatite B. L’OMS
recommande l’administration d’un vaccin monovalent à la naissance suivi d’au moins
deux doses additionnelles. Cependant, peu d’études en ASS ont estimé la couverture de la
dose à la naissance, outil majeur pour la prévention de la TME. De plus, les estimations de
la couverture du vaccin pentavalent au Sénégal ne prennent pas en compte le respect des
délais de vaccination, alors que le non-respect de ces délais impacte l’efficacité du vaccin.

Les objectifs de ce troisième article étaient : (i) d’estimer la couverture des vaccins contre
l’hépatite B au Sénégal en prenant en compte le respect des délais de vaccination, ainsi que
(ii) d’identifier les facteurs associés au non-respect des schémas vaccinaux.

Pour répondre à ces objectifs, nous avons pris comme population d’étude les enfants
inclus dans le projet AmBASS nés après la mise en place de la dose à la naissance en 2016.
Nous avons estimé leur statut vaccinal à partir des données des carnets de vaccination, de
la base de l’observatoire de Niakhar et des registres de vaccination dans les postes de
santé. Un questionnaire socio-économique a été complété par un parent ou le tuteur légal
des enfants.
Les deux variables d’intérêt étaient : (i) le non-respect du schéma vaccinal de la dose à
la naissance, et (ii) le non-respect du schéma vaccinal à trois doses (dose à la naissance
suivie d’au moins deux doses de pentavalent). L’OMS recommande d’administrer (i) la
dose à la naissance ≤24 heures suivant la naissance, (ii) la première dose de pentavalent
≥6 semaines après la naissance, et (iii) la deuxième dose de pentavalent ≤4 semaines
après la première dose. Nous avons identifié les facteurs associés à la non-respect des
deux schémas vaccinaux à partir d’un modèle de régression logistique.

Parmi les 241 enfants avec des données de vaccination disponibles, pour 2016 et 2017-
2018 respectivement, 31.0% et 66.8% avaient reçu la dose à la naissance dans les 24
heures suivant la naissance, et 24.3% et 53.7% avaient reçu le schéma vaccinal à trois
doses dans les délais recommandés. La naissance à la maison, la naissance pendant la
saison sèche et la naissance en 2016 étaient associés au non-respect des deux schémas
vaccinaux. Vivre à plus de 3 kilomètres du centre de santé le plus proche, être l’aîné de la

91
fratrie et vivre dans un ménage agricole pauvre étaient associés au non-respect du schéma
vaccinal à trois doses.

En conclusion, la proportion élevée d’enfants non vaccinée selon les schémas vaccinaux
recommandés montre qu’il est important de prendre en compte le respect des délais de
vaccination dans les estimations de couverture vaccinale. Afin d’améliorer la couverture
de la dose à la naissance, des incitations pour amener les enfants nés à domicile au centre
de santé dans les 24 heures suivant la naissance devraient être mises en place. Par ailleurs,
les stratégies avancées de vaccination pourraient être renforcées afin d’améliorer la
couverture vaccinale des enfants vivant dans les villages les plus éloignés, ceux nés à
domicile et ceux vivant dans des ménages agricoles pauvres.

L’article a été publié dans Vaccines. Les annexes de l’article sont présentées dans
l’annexe E.

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 4.4. Article 4 – Raisons de non-vaccination et
de sous-vaccination des enfants et
adolescents en Afrique sub-Saharienne : Une
revue systématique de la littérature
Bien que les taux de couverture vaccinale des enfants en ASS aient nettement augmenté
depuis les années 2000, ceux-ci restent en dessous des objectifs de l’OMS. En
conséquence, les maladies évitables par la vaccination demeurent un problème de santé
publique majeur sur le continent. Afin de maitriser davantage ces maladies, il est essentiel
de comprendre les causes sous-jacentes d’une couverture vaccinale insuffisante en
identifiant les obstacles à la vaccination au niveau local.

Ce quatrième article avait pour objectif de passer en revue les raisons de non-vaccination
et de sous-vaccination des enfants et adolescents, telles qu’exprimées par les communautés
en ASS.

Pour répondre à cet objectif, nous avons réalisé une revue systématique de la
littérature. Nous avons utilisé les bases de données PubMed, Web of Science, African Index
Medicus et African Journals Online pour identifier les articles publiés entre 2010 et 2020
sur les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination des enfants et adolescents en
ASS, telles qu’exprimées par les communautés. Nous avons développé un score de
pertinence, et seules les études avec un score d’au moins 3 sur 5 ont été sélectionnées
pour l’analyse finale. Nous avons classé les raisons de non-vaccination et de sous-
vaccination en 11 thèmes différents.

Nous avons inclus 37 articles dans la revue. Cependant, moins de la moitié des articles
ont rapporté séparément les raisons de non-vaccination et de sous-vaccination. Nous
avons donc regroupé ces deux variables d’intérêt en « vaccination incomplète ».
Les raisons de vaccination incomplète les plus couramment citées étaient liées au
manque de temps des parents (ex : dû au travail, aux files d’attente dans les centres de
vaccination, ou aux horaires de vaccination inconvénients), aux croyances et
connaissances des communautés vis-à-vis de la vaccination (ex : manque de
connaissances sur les vaccins ou les horaires/lieu de vaccination, peur des effets
secondaires) ainsi qu’à des problèmes liés aux services de vaccination (ex : occasions
manquées de vaccination, personnel absent, matériel insuffisant).

Cette revue est la première revue systématique de la littérature à identifier les raisons
de vaccination incomplète des enfants et adolescents en ASS, telles qu’exprimées par les
communautés. Nos résultats montrent que peu d’études séparent les raisons de non-

110
vaccination et de sous-vaccination, alors que les raisons sous-jacentes, et donc les
interventions requises, sont différentes dans ces deux situations. Les résultats mettent
également en évidence que les raisons de vaccination incomplète sont multiples. Une
communication efficace et pertinente autour de la vaccination, ainsi que l’adaptation de
l’organisation des services de vaccination au contexte local sont deux interventions clés
pour améliorer la vaccination en ASS.

L’article est en cours de finalisation. Les annexes de l’article sont présentées dans
l’annexe F.

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5. Discussion

5.1. Synthèse des résultats

L’élimination de l’hépatite B en ASS sur le long-terme repose sur la prévention et le
contrôle de l’infection chez les jeunes enfants. Afin d’informer et d’adapter les politiques
de santé publique en vue de l’atteinte des objectifs d’élimination à l’horizon 2030, des
données épidémiologiques au niveau local sont nécessaires. Ce travail de thèse, en
s’appuyant sur les données du projet AmBASS, fourni les premières données sur
l’épidémiologie de l’hépatite B au Sénégal chez les enfants en population générale et en
milieu rural depuis la mise en place de la vaccination en 2004.
Par ailleurs, les résultats de cette thèse sont les premiers au Sénégal et parmi les rares
en ASS :

(i) à estimer la prévalence de l’hépatite B chez les enfants en population générale

et à identifier les facteurs associés à une infection par le VHB
(ii) à estimer la couverture vaccinale de la dose à la naissance et les barrières à la
vaccination et
(iii) à passer en revue les raisons de vaccination incomplète des enfants, telles
qu’exprimées par les communautés en ASS

Les résultats montrent que la prévalence de l’hépatite B était très basse chez les enfants
de moins de cinq ans (<1%), mais restait élevée chez les adultes nés avant l’introduction
du vaccin contre l’hépatite B (>10%).
Les enfants plus âgés, ayant un tatouage, ayant eu des points de suture, ayant un frère
ou une sœur infecté(e) par le VHB et les enfants nés à domicile présentaient un risque
plus important d’être infectés par le VHB. Ces résultats montrent l’importance de la
transmission intrafamiliale (notamment par les contacts étroits entre enfants d’une
même fratrie) et mettent en évidence, pour la première fois, les risques liés à certaines
pratiques tels que les tatouages, les points de suture et les accouchements à domicile.
Malgré la faible prévalence de l’infection par le VHB chez les enfants, près de la moitié
n’était pas vaccinée (≥3 doses) selon les recommandations de l’OMS. Néanmoins, la
proportion d’enfants ayant reçu la dose à la naissance ≤24 heures suivant la naissance a
augmenté entre 2016 (31%, année d’introduction du vaccin dans le PEV) et 2017-2018
(67%). Plusieurs caractéristiques socio-démographiques, telles que la naissance à
domicile, la naissance pendant la saison sèche et vivre à plus de trois kilomètres du poste
de santé le plus proche, étaient associées au non-respect du schéma vaccinal.
La revue de la littérature a également permis de compléter ces résultats en identifiant
les raisons de vaccination incomplète des enfants et adolescents en ASS. Celles-ci étaient
principalement liées aux contraintes de temps des parents (ex : dû au travail ou aux tâches

134
ménagères), aux croyances et connaissances des parents et de la communauté vis-à-vis
de la vaccination (ex : manque de connaissances sur les vaccins ou les horaires/lieu de
vaccination) ainsi qu’à des problèmes liés aux services de vaccination (ex : occasions
manquées de vaccination, personnel absent).

Les résultats de cette thèse mettent en évidence l’impact du programme de vaccination

contre l’hépatite B chez les enfants au Sénégal et permettent de dégager les principaux
enjeux à prendre en compte pour atteindre les objectifs nationaux et internationaux
d’élimination de l’hépatite B.

Les résultats du travail de recherche ont permis de montrer :

- Une prévalence très basse du VHB chez les enfants de moins de 5 ans (<1%)
- Une augmentation du taux d’enfants recevant la dose à la naissance : de 31%
en 2016 à 67% en 2018

et mis en évidence
- L’importance de la transmission intrafamiliale et pour la première fois, les
risques liés à certaines pratiques (tatouages, points de suture,
accouchements à domicile)
- Une couverture insuffisante du schéma vaccinal complet (≥3 doses)
- Des facteurs socio-démographiques (ex : naissance à domicile, naissance
pendant la saison sèche, vivre ≥3 km du poste de santé le plus proche, …) et des
raisons (ex : contraintes de temps, connaissances et croyances vis-à-vis de la
vaccination, problèmes liés aux services de vaccination) de vaccination
incomplète et/ou incorrecte

5.2. Forces et limites des études réalisées

5.2.1. Forces
La taille importante de l’échantillon du projet AmBASS ainsi que la représentativité des
données des habitants de la zone de Niakhar en termes d’âge et de sexe (via la pondération
et le redressement des données) constituent deux forces de ces études.
Une autre force du projet AmBASS est son approche multidisciplinaire. Dans cette
thèse, des données biologiques, comportementales et socio-démographiques ont été
utilisées pour obtenir une vision multifactorielle de l’épidémie d’hépatite B. De plus :

- Le biais de désirabilité sociale a été minimisé lors de l’administration des

questionnaires du projet AmBASS car les participants ne connaissaient pas leur
statut VHB au moment de l’enquête à domicile.
- Nous avons testé un grand nombre de facteurs socio-démographiques,
économiques et comportementaux pour leur association à l’infection par le VHB et
au non-respect des schémas vaccinaux.

135
 - Nous avons également pu identifier des facteurs de risque qui n’avaient pas été
identifiés dans la littérature auparavant.
- Nous avons effectué plusieurs analyses de sensibilité afin de voir si les facteurs
associés à une infection par le VHB et ceux associés au non-respect des schémas
vaccinaux variaient en fonction de la population d’étude ou des délais de
vaccination choisis, respectivement.
- Dans le troisième article, l’utilisation d’un modèle Heckman nous a permis de
vérifier s’il y’avait un biais de sélection (si les enfants avec des données de
vaccination manquantes avaient des caractéristiques différentes de ceux avec des
données de vaccination disponibles et si cela biaisait les résultats des estimations).
- La revue systématique de la littérature était consacrée aux raisons de vaccination
incomplète des enfants telles qu’exprimés par les communautés, alors que la
majorité des revues publiées jusqu’à présent se concentrent sur les facteurs
associés à une vaccination incomplète.

5.2.2. Limites
Cependant, il y’a plusieurs limites à ces études.
Une des limites principales des études basées sur les données du projet AmBASS
concerne la validité externe des résultats. En effet, bien que la zone de Niakhar soit
représentative d’une zone rurale intermédiaire au Sénégal (zone dans laquelle 20-50% de
la population habite l’espace rural), les résultats de l’étude ne peuvent pas être extrapolés
au niveau national. Par ailleurs :

- Nous ne pouvons pas exclure la possibilité d’un biais de mémoire lors de

l’administration des questionnaires AmBASS, en particulier dans le deuxième
article sur les facteurs associés à une infection par le VHB chez les enfants. En effet,
les parents ou tuteurs ont pu oublier l’exposition des enfants à des facteurs de
risque de transmission de l’hépatite B, en particulier pour les enfants plus âgés.
- Les estimations des associations entre des facteurs de risques et l’infection par le
VHB chez les enfants dans le deuxième article étaient peu précises en raison de la
faible proportion d’enfants infectés par le VHB.
- Les associations que nous avons mises en évidence n’impliquent pas forcément
une causalité, du fait de la nature transversale et observationnelle du projet
AmBASS.
- Dans le troisième article sur les facteurs associés au non-respect des schémas
vaccinaux, nous n’avons pas pu étudier l’influence des facteurs liés à l’offre de soins
car ces données n’ont pas été collectées dans le cadre du projet AmBASS.
- Nous n’avons pas pu étudier la transmission intrafamiliale du VHB dans la zone.
En effet, nous n’avons pas pu faire des analyses phylogénétiques du VHB chez les
enfants infectés et les membres infectés de leur famille car il ne restait plus
suffisamment de spots sur les DBS.
Concernant la revue systématique de la littérature, certains articles ont pu être omis,
en particulier ceux de la littérature grise, et les catégories utilisées pour classer les raisons

136
de vaccination incomplète ne peuvent pas capturer la multi-causalité des raisons. De plus,
nous n’avons pas classé les raisons par type de vaccin, pays ou contexte.

5.3. Implications en santé publique

Les résultats de cette thèse offrent un état des lieux de l’épidémie au Sénégal, pays où
l’hépatite B est endémique, et fournissent des données essentielles aux autorités de santé
du Sénégal et des autres pays de la sous-région pour adapter les politiques et stratégies
nationales de lutte contre l’hépatite B en vue de l’atteinte des objectifs d’élimination à
l’horizon 2030.

5.3.1. Vers l’élimination de l’hépatite B : Le succès

de la vaccination chez les enfants
Au niveau global, l’expansion de la vaccination contre l’hépatite B a permis de réduire
la prévalence du VHB chez les moins de cinq ans de 4.7% avant la mise en place de la
vaccination à 0.9% en 2019.120 Plusieurs pays ont rapporté une baisse de la prévalence de
l’infection par le VHB à la suite de l’introduction de la vaccination, mais jusqu’à présent,
aucune donnée n’était disponible au Sénégal en population générale.
Les résultats de cette thèse montrent le large succès du programme de vaccination
contre l’hépatite B au Sénégal : celui-ci a contribué à réduire significativement la
prévalence de l’infection chez les enfants dans l’observatoire de Niakhar. L’amélioration
progressive de la couverture par le vaccin pentavalent et l’introduction de la dose à la
naissance ont ainsi permis d’atteindre l’objectif du PNLH et de l’OMS d’une prévalence de
l’hépatite B inférieure à 1% chez les enfants de moins de 5 ans en 2020.7,112 Ces données
suggèrent que le pays est proche d’atteindre l’objectif national et international d’une
réduction de l’incidence de l’infection chronique par le VHB de 90% (équivalent à une
prévalence de 0.01% chez les moins de 5 ans) d’ici 2030.

Vers l’élimination de l’hépatite B : points clés

- La vaccination a permis d’atteindre l’objectif du PNLH et de l’OMS d’une

prévalence de l’hépatite B ≤1% chez les moins de 5 ans en 2020 au Sénégal.
- Le pays est proche d’atteindre une réduction de l’incidence de l’infection
chronique par le VHB de 90% d’ici 2030.
 L’élimination de l’hépatite B chez les enfants est envisageable. Il est
également important de poursuivre les efforts pour augmenter la
couverture vaccinale et améliorer les programmes de prévention, de
dépistage et de traitement.

137
 5.3.2. Renforcer la prévention de l’hépatite B
5.3.2.1. Prévenir la transmission mère-enfant

(a) Améliorer la couverture de la dose à la naissance

Comparé à d’autres pays d’ASS, la proportion d’enfants ayant reçu la dose à la naissance
≤24 heures après la naissance dans l’observatoire de Niakhar (67% en 2017-2018) est
relativement élevée.
En effet, une méta-analyse publiée en 2020 a montré qu’au Nigeria, en Gambie et en
Afrique du Sud, seul 1.3% des enfants recevaient le vaccin ≤24 heures après la naissance
(IC à 95% 0.0-4.5%) et 21.5% (IC à 95%9.4-36.8%) le recevaient ≤7 jours.73 Une autre
étude a également rapporté une faible couverture de la dose à la naissance ≤24 heures
après la naissance en Gambie (7%) et au Nigeria (13%).79
Bien que, dans ces pays, la couverture de la dose à la naissance soit bien plus faible
qu’au Sénégal, ces études ne permettent pas d’identifier avec certitude les raisons pour
lesquelles la couverture est meilleure au Sénégal. Par exemple, ces études ont évoqué des
barrières telles que la proportion élevée de naissances à domicile et la distance des
ménages aux postes de santé, mais ces facteurs ont également été mis en évidence dans
nos travaux au Sénégal. Cependant, à l’inverse de ces études, nous n’avons pas exploré
l’importance d’autres barrières telles que le manque de communication entre les services
de vaccination et de maternité.
Dans une des études, la couverture de la dose à la naissance au Botswana (74%) était
élevée, et comparable à celle que nous avons trouvé à Niakhar. La couverture élevée au
Botswana pouvait s’expliquer par le fait que beaucoup de femmes (presque 100%)
accouchaient en structure de santé et assitaient aux consultations prénatales, comparé
aux autres pays de l’étude (Nigeria, Gambie, Sao Tome et Principe, Naminie).79 De plus, les
structure de santé avaient la capacité d’administrer la dose à la naissance tous les jours.79

Une des cibles de la Stratégie mondiale du secteur de la santé contre l’hépatite virale
2016-2021 et des états de l’OMS en Afrique est d’atteindre une couverture de la dose à la
naissance de 50% d’ici 2020.7 Les résultats de cette thèse suggèrent que cet objectif a été
atteint dans la zone de Niakhar et que la proportion d’enfants ayant reçu la dose à la
naissance dans les 24 heures suivant la naissance est en train d’augmenter depuis 2016.
Néanmoins, afin d’atteindre une couverture du vaccin à la naissance de 90% d’ici 2030,
il est important de poursuivre les efforts pour augmenter le taux de couverture vaccinale.
Nous proposons ci-dessous quelques actions clés, notamment : (i) encourager les
accouchements en structure de santé, et (ii) pour les femmes accouchant à domicile,
mettre en place des interventions complémentaires pour les encourager à amener leur
nouveau-né en structure de santé le plus rapidement possible après la naissance et pour
vacciner les nouveau-nés à domicile dans les meilleurs délais.

138
 I- Encourager les accouchements en structure de santé

Dans nos analyses, nous avons montré qu’une proportion significative d’enfants était
née à domicile (plus de 15%) et que la naissance à domicile était associée au non-respect
du schéma vaccinal de la dose à la naissance.
Ce problème est connu dans la zone de Niakhar. En effet, les accouchements à domicile
ont été évoqués par les personnels de santé de la région de Fatick comme un obstacle
principal à l’administration de la dose à la naissance (lors des ateliers de restitution des
résultats du projet AmBASS en juillet 2021). De plus, une enquête qualitative menée avant
la mise en place du projet AmBASS dans la région a également mis en évidence cette
barrière.77
Dans certains pays d’Afrique, l’accouchement en structure de santé et l’accouchement
médicalement assisté étaient associés à l’administration du vaccin dans les 24 heures
suivant la naissance.121

Les accouchements à domicile peuvent avoir plusieurs effets sur l’administration de la

dose à la naissance.
Premièrement, les enfants nés à domicile n’ont pas accès à la dose à la naissance car
celle-ci est uniquement disponible en structure de santé ou lors de stratégies de
vaccination avancées. De plus, les personnels de structures de santé de la zone de Niakhar
ne se déplacent pas à domicile pour administrer la dose à la naissance.
Deuxièmement, les parents des enfants nés à domicile sont peut-être moins adhérents
à la vaccination. Par exemple, une étude au Kenya a émis l’hypothèse que les femmes
accouchant en centre de santé avaient plus de contact avec les centres de santé et
connaissaient donc mieux les calendriers de vaccination que celles accouchant à
domicile.122 Cependant, nous n’avons pas testé l’association entre les connaissances de la
mère sur la vaccination et l’accouchement à domicile.

Bien que nous n’ayons pas directement étudié l’influence d’un accouchement
médicalement assisté sur l’administration de la dose à la naissance, quasiment tous les
enfants nés à domicile dans le projet AmBASS ont été mis au monde par des proches
(famille, amis de la famille). Nous avons donc raisonnablement fait l’hypothèse que les
naissances à domicile n’étaient pas médicalement assistées dans les ménages du projet
AmBASS.

Les résultats de nos études suggèrent qu’encourager les accouchements en structure

de santé permettrait également d’empêcher l’infection par le VHB chez les enfants. En
effet, nous avons montré que les enfants nés à domicile étaient plus à risque d’être infectés
par le VHB que ceux nés en structure de santé ; probablement en raison du risque plus
élevé du non-respect des schémas de vaccination des enfants nés à domicile, et/ou de
pratiques à risque lors des accouchements à domicile (ex : utilisation de matériel non-
stérilisé).123

139
 Ainsi, encourager les accouchements en structure de santé pourrait permettre
d’améliorer la couverture de la dose à la naissance et réduire les risques d’infection par le
VHB.
Certains éléments contextuels s’y prêtent particulièrement :

- La majorité des femmes dans la zone de Niakhar assistant aux consultations

prénatales (97% ont assisté à ≥1 consultation prénatale lors de leur dernière
grossesse, et 72% ont effectué ≥4 consultations prénatales – article de Djaogol et
al. en cours de revue), les professionnels de santé devraient davantage pouvoir
sensibiliser les femmes enceintes à l’importance d’accoucher en structure de santé.
- Une autre intervention possible consisterait à donner des incitations financières
aux professionnels de santé. Par exemple, le ministère de la santé au Cambodge a
donné des incitations financières aux sage-femmes pour accoucher les enfants en
structure de santé, et les sage-femmes partageaient leurs incitations avec les
accoucheuses traditionnels si celles-ci amenaient des femmes en structure de
santé pour l’accouchement. Ceci a permis d’augmenter les accouchements en
structure de santé et d’améliorer la couverture de la dose à la naissance. 124,125
Cette intervention pourrait être évaluée au Sénégal.

Cependant, les interventions visant à augmenter les accouchements en structure de

santé n’auront un impact bénéfique sur l’administration de la dose à la naissance que si
les structures disposent d’une quantité suffisante de vaccins, d’une capacité à assurer la
conservation du vaccin dans la chaine du froid, d’un personnel de santé formé sur son
administration, d’une communication efficace entre les services de vaccination et ceux de
maternité, et s’il y a des directives claires l’administration du vaccin. 121 77

II- Encourager les femmes accouchant à domicile à amener leur nouveau-né en

structure de santé le plus rapidement possible et renforcer les activités de
vaccination en dehors des structures de santé

Certaines femmes choisissent volontairement d’accoucher à domicile, tandis que

d’autres ne peuvent pas faire autrement. Par exemple, lors des ateliers de restitution des
résultats du projet AmBASS en juillet 2021, le personnel de santé de la région de Fatick a
rapporté que le manque de transport entre les villages est un obstacle important pour
l’accouchement en structure de santé, en particulier lorsque les femmes accouchent au
milieu de la nuit.
Pour les femmes accouchant à domicile, il faut donc mettre en place des stratégies pour
vacciner les nouveau-nés dans les 24 heures suivant la naissance, notamment (i) en
encourageant les femmes à amener leur nouveau-né en structure de santé le plus
rapidement possible après la naissance, et (ii) en vaccinant les nouveau-nés à domicile
dans les meilleurs délais possibles.

140
 Pour inciter les femmes à amener leur nouveau-né en structure de santé le plus tôt
possible après la naissance, plusieurs actions peuvent être entreprises.
Premièrement, dans les centres de santé de l’observatoire de Niakhar, les femmes qui
accouchent à domicile sont incitées à se rendre au poste de santé le plus tôt possible après
l’accouchement (≤48 heures) pour vacciner leur nouveau-né contre l’hépatite B. Il faut
donc maintenir et si besoin, renforcer cette sensibilisation.
Deuxièmement, sensibiliser davantage les parents et les communautés sur les
bénéfices de la dose à la naissance pourrait encourager les parents à venir rapidement au
poste de santé après la naissance. En effet, bien que des causeries aient été organisées
dans la zone pour sensibiliser les femmes à la dose à la naissance (en particulier l’année
de l’introduction de la dose dans le PEV), seul 11.6% des femmes en âge de procréer (15-
49 ans) incluses dans le projet AmBASS savaient qu’il existe un vaccin contre l’hépatite B
(article de Djaogol et al. en cours de revue).
Enfin, les agents de santé communautaires pourraient informer les personnels de
santé dès qu’il y’a une naissance à domicile et encourager les familles à amener l’enfant
au poste de santé le plus rapidement possible.121

Il est également essentiel d’avoir des stratégies innovantes pour vacciner les nouveau-nés
en dehors des structures de santé.
En effet, la possibilité de conserver le vaccin monovalent en dehors de la chaine du
froid pourrait permettre au personnel de santé (ou les agents de santé communautaires,
accoucheuses traditionnelles, …) d’aller vacciner le nouveau-né à domicile ≤24 heures
après la naissance.
Cependant, peu de pays en Afrique ont des programmes pour vacciner les nouveau-nés
nés en dehors des structures de santé.79 Une étude menée dans cinq pays (Botswana,
Gambie, Namibie, Nigeria, Sao Tome et Principe) a montré qu’aucun des centres de santé
enquêtés n’effectuait de stratégies avancées de vaccination pour les enfants nés à
domicile.79 Dans la zone de l’observatoire de Niakhar, les nouveau-nés qui n’ont pas reçu
la dose à la naissance peuvent la recevoir lors des stratégies avancées de vaccination ou
des vaccinations de rattrapages qui ont lieu mensuellement, mais la dose est
généralement reçue plus de 24 heures après la naissance.
A l’inverse, l’administration de la dose à la naissance à domicile a permis d’augmenter
la couverture vaccinale dans plusieurs pays d’Asie pays.121
Ainsi, une étude au Vietnam a montré que dans certains villages, la proportion
d’enfants recevant la dose à la naissance ≤24 heures après la naissance était élevée car les
agents de santé communautaires connaissaient les dates d’accouchement à domicile en
avance (par l’intermédiaire des village health workers), et pouvaient ainsi rapidement se
déplacer à domicile pour vacciner les nouveau-nés dans les plus brefs délais.126
En Indonésie, plusieurs projets ont testé et évalué des interventions pour administrer
la dose à la naissance en milieu rural, en particulier chez les enfants nés à domicile.127 Par
exemple, dans un projet, les accoucheuses traditionnelles étaient incitées à prévenir les
sage-femmes et infirmières lorsqu’un accouchement à domicile avait lieu, pour que les
sages femmes et infirmières aillent vacciner les enfants à domicile. En échange, les

141
accoucheuses recevaient du matériel pour les soins de l’accouchement (ex : soins pour le
cordon ombilical).127

III- Autres éléments à considérer

Nos analyses ont montré qu’être né pendant la saison sèche était associé au non-
respect du schéma vaccinal de la dose à la naissance. Nous faisons l’hypothèse que la
migration pendant la saison sèche, particulièrement des femmes, peut expliquer cette
couverture vaccinale plus faible. En effet, lors des ateliers de restitution des résultats
AmBASS, le personnel de santé de la région de Fatick a souligné que les migrations
temporaires (notamment vers Dakar) et saisonnières ont beaucoup d’impact sur les
activités de santé dans la zone. Davantage de recherches devraient être menées pour
comprendre l’influence des saisons sur la vaccination des enfants.

La couverture vaccinale relativement élevée dans l’observatoire de Niakhar suggère

une bonne acceptabilité des vaccins de la part du personnel de santé et des communautés.
Ceci a été confirmé lors des ateliers de restitution des résultats AmBASS et dans une étude
menée auprès de personnels de la santé dans la région de Fatick (99% pensaient que la
vaccination dans les 24 heures suivant la naissance était utile et nécessaire, 90%
pensaient que le vaccin était efficace et sûre, et le personnel de santé a également rapporté
que le vaccin à la naissance était bien accepté par les mères).77

(b) Dépister systématiquement les femmes enceintes

Le dépistage anténatal systématique est une étape essentielle pour l’élimination du

VHB et permet de cibler davantage les interventions de prévention chez les enfants les
plus à risque.
Au Sénégal, le dépistage systématique du VHB chez les femmes enceintes n’est pas
obligatoire mais est généralement proposé lors de consultations prénatales. Néanmoins,
une étude a montré que moins de 70% des personnels de santé proposaient le test de
dépistage aux femmes enceintes.77 De plus, même lorsque le personnel de santé propose
le test, les femmes refusent par manque d’argent. En effet, le test de dépistage est payant
(2000 FCFA=3.1€).

Le dépistage de l’hépatite B au cours de la grossesse pourrait être proposé via un test

de diagnostic rapide gratuit lors de la première consultation prénatale, tel que
recommandé par l’OMS.60 En cas de résultat positif, des mesures préventives
additionnelles pourraient prévenir la TME du VHB au nouveau-né en plus de la
vaccination à la naissance, incluant le traitement préventif de la mère par ténofovir.
En complément, une stratégie de dépistage des enfants du ménage et du conjoint de la
mère dépistée positive, ou des frères et sœurs d’un enfant positif, pourrait être proposé.

142
Nos données suggèrent que cette stratégie permettrait de dépister la majorité des
personnes atteintes de l’infection chronique par le VHB.

5.3.2.2. Prévenir l’infection pendant l’enfance

(a) Améliorer la couverture vaccinale du schéma multidoses et le

respect des délais de vaccination

Les résultats de nos analyses sur les facteurs associés au non-respect du schéma
vaccinal complet (≥3 doses) ont mis en évidence des interventions clés pour améliorer la
couverture vaccinale et le respect des délais de vaccination, par exemple :

- Renforcer les « stratégies avancées » de vaccination (lorsque les vaccinateurs se

rendent dans les villages les plus éloignés des postes de santé). En effet, nous avons
montré que les enfants nés à domicile et loin des postes de santé étaient plus à
risque de ne pas recevoir le schéma vaccinal recommandé.
- Rappeler aux mères les rendez-vous de vaccination. Actuellement, dans les postes
de santé de la zone de Niakhar, une journée par semaine est dédiée à la vaccination.
Ce jour-là, la vaccination est l’activité principale des postes de santé. Après la
vaccination, le prochain rendez-vous est marqué sur le carnet de santé et
communiqué oralement à la mère. Pour les vaccinations de rattrapage, les
infirmiers chefs de poste recensent pour chaque village les enfants qui ne se sont
pas présentés au rendez-vous, et les agents de santé communautaire informent les
mères du nouveau rendez-vous. Il est important de poursuivre et de renforcer ces
activités.
- Sensibiliser les mères primipares à l’importance de la vaccination et au respect des
délais de vaccination. En effet, être l’aîné était associé au non-respect du schéma
vaccinal à trois doses.
- Comprendre les barrières à la vaccination pour les ménages agricoles pauvres.

Les résultats de la revue de la littérature sur les raisons de vaccination incomplète des
enfants, telles qu’exprimées par les communautés en ASS, viennent compléter les résultats
du troisième article sur les facteurs associés au non-respect des schémas vaccinaux.
Bien qu’aucun article de la revue ne présente des études menées au Sénégal, les résultats
mettent en évidence deux interventions clés qu’il faut adapter au contexte local pour
améliorer la couverture vaccinal,.
Premièrement, une communication efficace et pertinente autour de la vaccination
est essentielle pour adresser les connaissances et croyances des parents et des
communautés. Il faut également privilégier une bonne communication entre personnels
de santé pour améliorer les services de vaccination (ex : éviter les occasions manquées de
vaccination).
Deuxièmement, il est clé d’adapter l’organisation des services de vaccination au
contexte local. Par exemple, réaménager occasionnellement les horaires de vaccination

143
faciliterait l’accès aux services pour les parents occupés en journée (devant travailler ou
s’occuper des tâches ménagères). De plus, une meilleure gestion des stocks de vaccins et
des ressources permettrait d’améliorer la couverture vaccinale dans certains contextes.

Nous avons également souligné l’importance de prendre en compte le respect des

délais de vaccination pour évaluer la performance des programmes de vaccination.128 En
effet, nos analyses ont montré des disparités importantes entre la proportion d’enfants
recevant ≥3 doses de vaccin (72%) et celle d’enfants recevant ces doses dans les délais
recommandés par l’OMS (44%). Ce non-respect des délais peut avoir des conséquences
importantes sur l’efficacité des vaccins.
A noter qu’il n’y a actuellement pas de définition universelle d’une vaccination « dans
les délais » ; les calendriers de vaccination varient d’un pays à l’autre, et certaines études
utilisent des mesures catégorielles pour évaluer le respect des schémas de vaccination
(par exemple, être vacciné dans les délais versus ne pas être vacciné dans les délais) tandis
que d’autres utilisent des mesures continues (par exemple, le nombre médian de jours
entre chaque doses de vaccin).128

(b) Réduire les risques d’infection pendant les pratiques à risque

Même si les tatouages (0.2%), ou les points de suture (6%) sont peu courant dans
l’observatoire de Niakhar (les tatouages sont pratiqués notamment dans certains groupes
ethniques de la zone), il faut réduire les risques d’infection pendant ces pratiques.Par
exemple, en s’assurant que le matériel est stérilisé avant l’emploi et en sensibilisant les
individus pratiquant ces activités aux mesures de prévention et de contrôle des infections.

Renforcer la prévention de l’hépatite B : points clés

Pour agir efficacement sur l’hépatite B, nos résultats mettent l’accent sur le besoin de
renforcer la prévention de la TME, en particulier via :

- L’augmentation de la couverture de la dose à la naissance en encourageant les

femmes à accoucher en structure de santé, et en mettant en place des
interventions complémentaires pour vacciner les nouveau-nés à domicile
dans les meilleurs délais
- Le développement du dépistage des femmes enceintes et de leurs proches

D’autres stratégies essentielles pour éliminer la transmission du VHB pendant

l’enfance incluent :

- L’augmentation du taux d’enfants bénéficiant d’un schéma vaccinal complet

(≥3 doses)
- L’amélioration de l’accès au traitement prophylactique chez les femmes à
risque élevé de TME

144
 5.3.3. Mettre à niveau le dépistage, les soins et le
traitement de l’hépatite B
Bien que l’élimination de l’hépatite B chez les enfants semble envisageable,
l’importance de la prévalence chez les adultes pose la question de l’élargissement du
dépistage de l’hépatite B ainsi que de la facilitation de l’accès aux soins et aux traitements.
Ces actions permettraient d’obtenir une réduction significative de la morbidité et la
mortalité liées au VHB et d’atteindre les objectifs fixés par le PNLH et l’OMS dans ce
domaine.

5.3.3.1. Mettre en place un dépistage communautaire à large

échelle

Au Sénégal, seul 4% des individus AgHBs-positifs sont dépistés et moins d’1% de ceux
éligibles au traitement sont mis sous traitement.8 Des études en milieu rural ont montré
que la plupart des individus présentant des symptômes d’une infection hépatique ont
recours à la médecine traditionnelle en premier lieu.77,129 Ces patients se présentent dans
les systèmes de soins seulement lorsque la maladie est à un stade avancé.

Une approche communautaire est recommandée pour promouvoir le dépistage et le

traitement de l’hépatite B dans les pays d’endémicité intermédiaire à forte.60
La bonne acceptabilité du dépistage AgHBs avec DBS dans le projet AmBASS (75.1% et
91.5% de participation au niveau du ménage et individuel, respectivement), la proportion
relativement élevée d’individus qui sont entrés dans les soins (74.6% de ceux AgHBs-
positifs ont fait les examens cliniques et biologiques), ainsi que la faible proportion
d’individus nécessitant une mise sous traitement (4.1%) montre que le dépistage
communautaire associé au traitement des sujets infectés à large échelle dans la
communauté est faisable.
L’étude PROLOFICA menée entre 2011 et 2014 en Gambie a montré que le dépistage
associé au traitement des sujets infectés était faisable, bien accepté et cout-efficace.83

Dans le cadre d’une approche communautaire, des tests de diagnostic rapide peuvent
être utilisés pour dépister rapidement un grand nombre de personnes, sans avoir à
attendre les résultats. Ce type de campagne peut aussi combiner de façon efficace le
dépistage de plusieurs infections ou pathologies afin d’optimiser l’organisation de la
campagne et de limiter les éventuelles réticences de la population. Pour cela, des outils de
diagnostiques doivent être disponibles dans les structures de soins primaires.

145
 5.3.3.2. Simplifier les algorithmes de suivi et élargir l’accès
aux soins

Une fois dépistés, l’enjeu est de suivre régulièrement les individus infectés, la majorité
n’étant pas immédiatement éligible au traitement.

Pour la plupart des individus au Sénégal, le suivi est souvent rendu difficile par
l’insuffisance de ressources financières et l’éloignement des lieux de résidence.
Les examens de suivi sont généralement à la charge du patient, qui bénéficient
rarement d’une assurance santé ou d’une mutuelle. Ils occasionnent des dépenses
importantes qui peuvent constituer une réelle barrière pour l’accès aux soins.
Le second obstacle est l’inaccessibilité géographique des examens de suivi : certains
examens recommandés sont en effet peu, voire pas disponibles en zone rurale, comme la
mesure de la charge virale ou le Fibroscan.

Nos résultats montrent le besoin de repenser le modèle actuel de soins de façon à proposer
des modalités de suivi et de prise en charge adaptées aux contraintes locales.
En effet, les algorithmes de suivi médical pourraient être simplifiés, par exemple en
mesurant la charge virale lors du bilan initial puis seulement lorsqu’une anomalie de
transaminases est identifiée, ou en recourant à des outils alternatifs à la charge virale pour
mesurer la réplication virale.
Par exemple, le test Loop-mediated isothermal amplification est un test rapide (60
minutes) et peu cher (8 USD/test) permettant de diagnostiquer les patients avec une
charge virale ≥200,000 UI/L. Le test a été développé et testé dans une étude menée en
France et au Sénégal.130 La mesure du HBV core-related antigen pourrait également être
une alternative à faible coût (15 USD/test) pour identifier les patients avec une charge
virale élevée parmi les individus non traités. Une revue a montré que le test a une
sensibilité de 85.2% et une spécificité de 84.7% pour diagnostiquer les individus avec
ADN VHB≥2000 UI/L et de 91.8% et 90.5% lorsque ADN VHB≥20,000 UI/L.131

5.3.3.3. Valider les critères d’éligibilité au traitement au

niveau national, et redéfinir les critères de l’Organisation
Mondiale de la Santé

Nous avons montré que le nombre de patients éligibles au traitement variait selon les
recommandations utilisées. En effet, seulement un participant était éligible au traitement
selon les recommandations de l’OMS alors que quatre étaient éligibles selon les
recommandations nationales. D’autres études ont aussi montré que les recommandations
simplifiées de l’OMS semblent peu adaptées au contexte Africain. 86
Il est donc nécessaire d’avoir des nouvelles recommandations de l’OMS, spécifiques au
contexte Africain. Par ailleurs, les critères nationaux de mise sous traitement doivent être

146
validés officiellement car les personnels de santé sur le terrain sont actuellement
confrontés à des recommandations différentes.

Mettre à niveau le dépistage, les soins et le traitement de l’hépatite B : points

clés

- La prévalence élevée du VHB chez les adultes pose la question de

l’élargissement du dépistage de l’hépatite B ainsi que de la facilitation de l’accès
aux soins et aux traitements.
 Pour atteindre les objectifs du PNLH et de l’OMS sur la couverture des
services, quelques pistes sont proposées, en particulier : mettre en place
une approche communautaire pour le dépistage du VHB avec des tests de
dépistage rapide, simplifier les algorithmes de suivi et valider des critères
nationaux d’éligibilité au traitement.

5.4. Perspectives de recherche

Quelques pistes de recherche découlent de ce travail :

- Développer et évaluer des stratégies d’administration de la dose à la naissance à

domicile en ASS. C’est notamment l’objectif du projet Néovac actuellement mené
par l’Institut Pasteur au Sénégal, au Burkina Faso, et à Madagascar.132 Le projet
utilise des méthodes d’épidémiologie et d’anthropologie afin de développer une
intervention pour administrer la dose à la naissance à domicile. L’intervention sera
évaluée à travers un essai clinique randomisé par grappes .
- Identifier les raisons de vaccination incomplète et incorrecte des enfants au Sénégal,
telles qu’exprimées par les communautés. Ceci permettrait de confirmer si les
résultats de la revue de la littérature menée dans le cadre de cette thèse reflètent
les perspectives des communautés au Sénégal. En 2020, il était prévu d’intégrer
des questions autour de la perception de la vaccination VHB dans le guide
d’entretien d’une enquête qualitative sur les leviers et les obstacles à l'entrée dans
le suivi et le traitement du VHB à Niakhar. Cependant, cette enquête a été reportée
en raison de la COVID-19.
- Etudier l’impact de la vaccination sur la mortalité et la morbidité liée au VHB. A
notre connaissance, aucune étude en ASS n’a été menée sur ce sujet. L’effet de la
vaccination sur les complications liées au VHB est seulement visible plusieurs
décennies après la mise en place de la vaccination.76 Quelques pays d’Asie ayant
introduit la vaccination anti-hépatite B très tôt ont mis en évidence la réduction
des complications liées au VHB.
D’autres pistes de recherche incluent la confirmation de la transmission intrafamiliale
du VHB au Sénégal via des analyses phylogénétiques ainsi que l’évaluation de l’impact des
saisons, notamment de la migration saisonnière, sur l’accès à la vaccination contre
l’hépatite B.

147
Conclusion générale

Ce travail de thèse répond au besoin urgent de disposer de données épidémiologiques

fiables sur l’infection par le VHB chez les enfants en ASS, une population clé pour éliminer
l’hépatite B comme problème de santé publique sur le long-terme. En s’appuyant sur les
données d’une enquête transversale en population générale en milieu rural au Sénégal,
les résultats de ce travail offrent un état des lieux de l’épidémie de l’hépatite B chez les
enfants dans ce pays et permettent de dégager les principaux enjeux à prendre en compte
pour atteindre les objectifs nationaux et internationaux d’élimination de l’hépatite B.

Les travaux ont montré que l’élimination de l’hépatite B chez les enfants est
envisageable au Sénégal. En effet, grâce au programme de vaccination contre l’hépatite B,
la prévalence de l’hépatite B chez les enfants est très faible et le pays est proche
d’atteindre l’objectif national et de l’OMS d’une réduction de l’incidence de l’infection
chronique par le VHB de 90% d’ici 2030. Par ailleurs, les résultats ont mis en évidence
pour la première fois les risques d’infection liés à certaines pratiques et l’importance de
la transmission intrafamiliale. Enfin, la couverture vaccinale contre l’hépatite B (dose à la
naissance, et ≥3 doses) est encore en dessous des objectifs de 2030, malgré une
augmentation de la couverture de la dose à la naissance depuis son introduction en 2016.
Plusieurs facteurs et raisons de vaccination incorrecte et/ou incomplète ont été identifiés
(ex : naissance à domicile, vivre ≥3 kilomètres du poste de santé le plus proche, naissance
en saison sèche, contraintes de temps des parents, manque de connaissances des parents
vis-à-vis de la vaccination).

Pour agir efficacement sur l’élimination de l’hépatite B, nos données mettent l’accent
sur le besoin de renforcer la prévention de la TME, en particulier via i) l’augmentation de
la couverture de la dose à la naissance en encourageant les femmes à accoucher en
structure de santé, et en mettant en place des interventions complémentaires pour
vacciner les nouveau-nés nés à domicile dans les meilleurs délais ; ii) le développement
du dépistage des femmes enceintes et de leurs proches (notamment conjoint et enfants),
en cas de dépistage positif. Augmenter le taux d’enfants bénéficiant d’un schéma vaccinal
complet (au moins 3 doses administrées dans les délais recommandés) et améliorer
l’accès au traitement prophylactique du VHB chez les femmes dépistées AgHBs positives
et à risque élevé de TME sont d’autres stratégies essentielles pour éliminer la
transmission de l’hépatite B durant l’enfance. Les résultats de cette thèse fournissent des
données essentielles aux autorités de santé du Sénégal et des autres pays de la sous-
région pour adapter les politiques et stratégies nationales de lutte contre l’hépatite B en
vue de l’atteinte des objectifs d’élimination à l’horizon 2030.

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159
Annexes

A. Rappels sur l’hépatite B : histoire

naturelle et complications
La période d’incubation du VHB est de 75 jours en moyenne, pouvant aller de 30 à 180
jours.17 L’histoire naturelle du VHB est dynamique et complexe.60
Le diagnostic de l’infection par le VHB se fait par les marqueurs directs (AgHBs, AgHBe,
ADN VHB) ou indirects (Ac anti-HBs, Ac anti-HBe et les Ac anti-HBc) de l’infection. La
définition des marqueurs est présentée dans le tableau A1.

Tableau A1. Définition des marqueurs du VHB

Marqueurs Définition
-Indique une infection par le VHB
-Premier marqueur sérologique à apparaître (détectable environ 38 jours après
AgHBs
l’infection)
-Présent pendant l’infection aiguë et chronique
-Apparaissent environ 3 mois après l’infection
Ac anti-HBc
-En présence de l’Ac anti-HBs, indiquent une infection passée et résolue
(total)
-Pas protecteurs, et ne persistent pas à vie
Ac anti-HBc Niveaux élevés pendant infection aiguë, mais peuvent être détectés jusqu’à 6
type IgM mois après l’infection
-Indique la réplication active du VHB dans le foie et donc une infectiosité élevée
AgHBe du sang et des autres liquides biologiques
-Associé à une progression de la maladie du foie
-Indiquent une diminution du niveau d’ADN VHB et donc de l’infectiosité de
l’individu.
Ac anti-HBe
-Peuvent co-exister avec l’AgHBe pendant les périodes de séroconversion de
l’AgHBe vers l’Ac anti-HBe
- Protègent de l’infection par le VHB et leur présence indique une immunité au
Ac anti-HBs VHB à la suite d’une infection (lorsqu’ils sont associés à la présence d’Ac anti-
HBc) ou d’une vaccination (lorsqu’il n’y a pas d’Ac anti-HBc)
-Peuvent co-exister en même temps que l’AgHBs
-Présent pendant l’infection chronique et aiguë et reflète l’intensité de la
réplication virale.
ADN VHB
-Hépatite B occulte : AgHBs indétectable alors que l’ADN VHB est présent dans le
sérum
Source : OMS60

160
 L’apparition de l’AgHBe dans le sang est suivie par celle de l’AgHBe. Les Ac anti-HBc
peuvent apparaitre tôt dans l’infection, généralement une ou deux semaines après
l’apparition de l’AgHBs et les Ac anti-HBC IgM sont très élevés et disparaissent après.

Hépatite virale aiguë B

L’infection initiale par le VHB peut être asymptomatique, peut se manifester sous
forme d’hépatite aiguë (clinique) avec ou sans ictère, ou peut donner lieu à une hépatite
fulminante. L’histoire naturelle est présentée dans la figure A1 ci-dessous.

Figure A1. Histoire naturelle de l’hépatite virale aiguë B

Source : OMS60

Les manifestations cliniques de l’hépatite virale aiguë et l’issue de l’infection

dépendent de l’âge de l’individu au moment de l’infection.133 Les nourrissons et nouveau-
nés sont généralement asymptomatiques, tandis que 30% des adultes ont une hépatite
aiguë ictérique. L’hépatite fulminante survient dans moins d’1% des cas d’hépatite B aiguë
et le taux de mortalité est d’environ 80% sans greffe du foie.133 Environ 95% des adultes
immunocompétents guérissent spontanément d’une hépatite B aiguë.

Hépatite chronique virale B

Cette dernière est caractérisée par la persistance de l’AgHBs pendant au moins six
mois. Dans le cas d’une hépatite chronique, la séroconversion vers l’Ac anti-HBe peut être
retardée de plusieurs années et l’AgHBe peut persister. La présence de ces anticorps en
faible quantité pendant l’infection chronique peut indiquer la réactivation de l’infection
chronique. L’histoire naturelle est présentée dans la figure A2 ci-dessous.

Figure A2. Histoire naturelle de l’hépatite chronique virale B

Source : OMS60

161
 L’histoire naturelle de l’infection chronique par le VHB peut être divisée en plusieurs
phases, en fonction de la présence de certains marqueurs du VHB (AgHBs, AgHBe, Ac anti-
HBe et ADN VHB) et de la maladie du foie (taux d’ALAT et la présence de fibrose).64 La
European Association for the Liver of the Cancer (EASL) a publié en 2017 une nouvelle
classification des phases naturelles de l’infection chronique par le VHB basée sur les
principales caractéristiques de la chronicité : l’infection et l’hépatite.64 Néanmoins, dans
la plupart des cas, la seule mesure des marqueurs ne permet pas de classer les patients
dans une de ces phases. De plus, les phases de ne sont pas toujours séquentielles et cette
nouvelle nomenclature n’a pas encore été adoptée par d’autres sociétés
professionnelles.16 Les phases naturelles de l’infection chronique sont présentées dans le
tableau A2. L’histoire naturelle et les phases de l’infection sont moins délimitées chez les
enfants.16

Tableau A9. Phases d’infection chronique par le VHB

AgHBe positif AgHBe negatif
Infection Infection Hépatite
Hépatite chronique
chronique chronique chronique
AgHBs Elevé Elevé/intermédiaire Bas Intermédiaire
AgHBe Positif Positif Négatif Négatif
ADN VHB >107 UI/mL 104 - 107 UI/mL <2000 UI/mL >2000 UI/mL
ALAT Normal Elevé Normal Elevé (persistent
ou intermittent)
Maladie du Aucune/minimale Modéré/sévère Aucun Modéré/sévère
foie
Remarques + fréquente et + Se développe Perte ou Lésions nécro-
longue chez les plusieurs années séroconversion de inflammatoires
individus infectés après la première l’AgHBs peut hépatiques et
par la TME . phase survenir chez 1- une fibrose
3% des cas par an, significatives
Taux de perte + rapidement généralement présents
spontanée de atteinte chez les chez les patients
l’AgHBe très bas individus infectés à avec un niveau Faible taux de
l’âge adulte d’AgHBs <1000 rémission
Patients IU/L. spontanée.
contagieux séroconversion de
(niveau élevé l’AgHBe avec une
d’ADN VHB) suppression de
l’ADN VHB possible.

Source : EASL64

Enfin, la phase de clairance de l’AgHBs est caractérisée par la disparition de l’AgHBs et

la présence d’anti-HBc, avec ou sans Ac anti-HBs. Le taux d’ALAT est normal, et le niveau
d’ADN VHB est indétectable ou faible. C’est la phase « d’infection occulte au VHB ». Si
l’AgHBs est perdu avant le début d’une cirrhose, il y’a une réduction du risque d’évolution
vers la cirrhose, la décompensation de la maladie hépatique et le carcinome

162
hépatocellulaire. Cependant, si l’AgHBs est perdu pendant le développement d’une
cirrhose, le risque de carcinome hépatocellulaire persiste et une surveillance des patients
est recommandé. L’immunosuppression peut induire une réactivation virale chez ces
patients.

163
 B. Dépistage de l’hépatite B
Stratégies de dépistage
L’OMS recommande les approches de dépistage suivantes60 :

• Dépistage en population générale : dépister tous les adultes lorsque la prévalence

de l’AgHBs en population générale est supérieure à 2% ou à 5% (en fonction des
recommandations locales et du contexte épidémiologique).
• Dépistage des femmes enceintes : dépister systématiquement toutes les femmes
enceintes lors de consultations prénatales lorsque la prévalence de l’AgHBs en
population générale est supérieure à 2% ou 5% (en fonction des recommandations
locales et du contexte épidémiologique). Les couples et partenaires se présentant
dans les services de soins prénatals doivent également avoir accès au dépistage du
VHB.
• Dépistage des populations spécifiques : dépister (i) les adultes et adolescents des
populations les plus affectées par l’hépatite B; (ii) les individus avec une suspicion
clinique d’infection chronique par le VHB ; (iii) les partenaires sexuels, enfants et
membres de la famille ou du ménage d’individus infectés par le VHB et ; (iv) les
professionnels de santé.
• Dépistage des donneurs de sang : dépister obligatoirement les donneurs de sang.

Pour toutes ces approches, il est important de créer des passerelles entre les services
de dépistage et les services de soins et de traitement. 60

Techniques de dépistage
Le dépistage de l’infection par le VHB chez les adultes, adolescents et enfants se fait par
la détection de l’AgHBs via un test sérologique (par immunodosage ou par un test de
diagnostic rapide).60 Le test peut être répété six mois plus tard pour confirmer une
infection chronique.16 Tester les enfants de moins de six mois n’est pas recommandé.16
L’OMS recommande d’utiliser les tests par immunodosage dans les lieux où les
laboratoires ont la capacité nécessaire. Un test de diagnostic rapide est recommandé dans
certaines situations (par exemple, lorsque les laboratoires n’ont pas le matériel ou
l’expertise requis, ou sont difficiles d’accès).60
Lorsque la séroprévalence de l’AgHBs est supérieure à 0.4% en population général, un
seul test sérologique est suffisant pour détecter l’AgHBs. Dans les lieux où la
séroprévalence de l’AgHBs est inférieure à 0.4%, un deuxième test est nécessaire pour
confirmer la positivité à l’AgHBs. 60

164
C.Annexes article 1

165
166
167
D. Annexes article 2

168
169
170
171
172
E. Annexes article 3

173
174
175
176
177
178
F. Annexe article 4

179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190