2021 Denis Clémentine Agroecology
2021 Denis Clémentine Agroecology
2021 Denis Clémentine Agroecology
Ingénieure Agronome ☐ de master d’AGROCAMPUS OUEST (École nationale supérieure des sciences
agronomiques, agroalimentaires, horticoles et du paysage), école interne de L’institut
Agro (lnstitut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et
Spécialisation (et option éventuelle) : l'environnement)
Agroecology ☐ de Montpellier SupAgro (étudiant arrivé en M2)
☐ d’un autre établissement (étudiant arrivé en M2)
Les analyses et les conclusions de ce travail d'étudiant n'engagent que la responsabilité de son auteur et non celle d’AGROCAMPUS OUEST
Merci également à Elodie Legal qui a été comme une seconde tutrice de stage, me guidant dans ce projet
qu’est la Litière Forestière Fermentée, me motivant et m’appuyant lorsque j’en avais besoin. Merci pour
ton écoute et ta disponibilité, malgré une charge de travail toujours plus importante.
Un immense merci également à Paula Fernandes, chercheuse au CIRAD, qui m’a aiguillée et conseillée
jusqu’au dernier moment sur le chemin de ce mémoire. Merci pour ta disponibilité malgré ton
éloignement, nos échanges très fructueux m’ont permis d’avancer toujours plus loin.
Toute l’équipe de Terre & Humanisme a aussi su me soutenir, m’aider et se tenir à l’écoute lorsque j’en
avais besoin, tout au long de ce stage. Un grand merci à vous tous pour votre bienveillance et cette belle
expérience humaine que vous avez su m’offrir.
Merci également à Milène Souvignet et Miguel Neau, deux experts dans leurs domaines grâce à qui j’ai
découvert de nouveaux concepts scientifiques. Merci pour les échanges enrichissants que nous avons
eus, sur les plans scientifiques théoriques comme agronomiques.
Je tiens également à remercier tous.tes les ami.es qui m’ont soutenu et aidé au cours des
expérimentations, pour aller arroser des laitues qui n’en finissaient pas de pousser, pour avoir supporté
et s’être intéressés.es aux discussions sur les racines, les feuilles, etc. Merci à Amandine, Lucille, Nelly,
Clémence, Pierre et Léa.
i
TABLE DES MATIERES
Remerciements ......................................................................................................................................... i
Liste des abréviations .............................................................................................................................. v
Liste des Annexes.................................................................................................................................. vii
Liste des illustrations .............................................................................................................................. ix
Liste des tableaux ................................................................................................................................... xi
Avant-propos ........................................................................................................................................ xiii
Introduction ............................................................................................................................................. 1
1 Etat de l’art : Généralités sur les microorganismes, leurs effets sur les sols et les plantes et leur
utilisation en agriculture .......................................................................................................................... 3
1.1 Importance et complexité des microorganismes dans leur interactions avec le sol et les
plantes 5
1.1.1 Les principaux microorganismes acteurs des interactions plante-sol-microorganisme... 5
1.2 Les différentes formes d’utilisation des microorganismes en agriculture ............................... 9
1.2.1 Concepts scientifiques et préparations existantes dans le commerce .............................. 9
1.2.2 Les alternatives : préparations agricoles artisanales à base de microorganismes .......... 11
1.2.3 Une alternative aux préparations commerciales : la Litière Forestière Fermentée........ 11
2 Matériels et méthodes .................................................................................................................... 15
2.1 Objectifs des expérimentations.............................................................................................. 15
2.2 Expérimentation n°1 : Effet de l’utilisation de la LiFoFer sur une culture de laitues de plein
champ (Lactuca sativa) ...................................................................................................................... 17
2.2.1 Localisation et historique du site de l’étude .................................................................. 17
2.2.2 Caractéristiques pédoclimatiques .................................................................................. 17
2.2.3 Matériel et dispositif expérimental ................................................................................ 17
2.2.4 Paramètres évalués ........................................................................................................ 23
2.3 Expérimentation n°2 : comparaison de l’application de différents extraits fermentés sur
tomates en pot.................................................................................................................................... 29
2.3.1 Matériel et dispositif expérimental ................................................................................ 29
2.3.2 Paramètres évalués ........................................................................................................ 29
2.4 Traitement statistique des données ........................................................................................ 31
3 Résultats ........................................................................................................................................ 31
3.1 Expérimentation n°1, cycle 1 : Résultats ............................................................................... 31
3.1.1 Suivi de la qualité du sol de la culture : diagnostique des plantes bio indicatrices ....... 31
3.1.2 Indicateurs de la croissance végétative des laitues ........................................................ 33
3.1.3 Indicateurs de la santé des plantes ................................................................................. 35
3.1.4 Indicateurs du rendement .............................................................................................. 35
3.2 Expérimentation n°1, cycle 2 : Résultats ............................................................................... 37
3.2.1 Indicateurs de la croissance végétative .......................................................................... 37
iii
3.2.2 Indicateurs de la santé des plantes ................................................................................. 37
3.2.3 Indicateurs du rendement .............................................................................................. 39
3.3 Expérimentation n°2 : Résultats ............................................................................................ 39
3.3.1 Indicateurs de la croissance végétative .......................................................................... 39
3.3.2 Indicateurs de la santé des plantes ................................................................................. 41
3.3.3 Indicateurs du rendement .............................................................................................. 43
4 Analyses et discussion des résultats .............................................................................................. 43
4.1 Expérimentation n°1, cycle 1 ................................................................................................ 43
4.2 Expérimentation n°1, cycle 2 ................................................................................................ 45
4.3 Expérimentation n°1 : Analyse croisée des cycles 1 et 2 ...................................................... 45
4.3.1 Comparaison du cycle 1 et 2 ......................................................................................... 45
4.3.2 Critique du dispositif expérimental ............................................................................... 47
4.4 Expérimentation n°2 .............................................................................................................. 47
4.5 Discussion autour des conditions d’expérimentation ............................................................ 49
4.5.1 Hétérogénéité du terrain ................................................................................................ 49
4.5.2 Les contraintes expérimentales : constats et perspectives ............................................. 49
5 Conclusions et perspectives ........................................................................................................... 51
Références bibliographiques ................................................................................................................. 53
Annexe I : Résumé du mémoire en anglais – Report summary .......................................................... 1
Annexe II : Analyses laboratoire de la méthode BRDA-Hérody ........................................................ 7
Annexe III : Liste des paramètres évalués ........................................................................................... 8
Annexe IV : Résultats des analyses NOVACROP Laitues cycle 2 ..................................................... 9
LISTE DES ABREVIATIONS
AMM : Autorisation de Mise sur le Marché
ACEPT-MAB : Adaptation, Caractérisation, Evaluation Paysanne et Transfert de la technologie des
Microorganismes Autochtones Bénéfiques pour l’autonomisation et l’écologisation des exploitations
familiales
CIRAD : Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
EM : Efficient Microorganisms
Traduit de l’anglais : Microorganismes Efficaces
EMRO : EM Research Organization
EF : Extrait Fermenté
FiBL : Forschungsinstitut für Biologischen Landbau
Traduit de l’Allemand : Institut de Recherche en Agriculture Biologique
GAB : Groupement des Agriculteurs Biologiques
IRD : Institut de Recherche pour le Développement
JICA : Japan International Cooperation Agency
Traduit de l’anglais : Agence Japonaise de Coopération Internationale
LiFoFer : Litière Forestière Fermentée
MAB : Microorganismes Autochtones Bénéfiques
MM : Microorganismos de Montañas
Traduit de l’espagnol : Microorganismes de Montagne
NF : Norme Française
PBI : Plantes Bio-Indicatrices
PNPP : Préparation Naturelle Peu Préoccupante
FG : Facteur de Germination
RFCP : Rhizobactéries Favorisant la Croissance des Plantes,
En anglais PGPR : Plant Growth Promotion Rhizobacteria
SB : Substance de Base
SNUB : Substance Naturelle à Usage Biostimulant
v
LISTE DES ANNEXES
Annexe I : Résumé du mémoire en anglais – Report summary………………………………………. 1
Annexe II : Analyses laboratoire de la méthode BRDA-Hérody…………………………………….. 7
Annexe III : Liste des paramètres évalués……………………………………………………………. 8
Annexe IV : Résultats des analyses NOVACROP Laitues cycle 2…………………………………... 9
vii
LISTE DES ILLUSTRATIONS
Figure 1: Schématisation des relations entre les différents acteurs du projet LiFoFer initié par Terre &
Humanisme.............................................................................................................................................. 2
Figure 2: Exemple de composition pondérale d'un horizon organique de sol de prairie tempérée
(Bachelier, 1978) ..................................................................................................................................... 4
Figure 3: Frise chronologique de l'historique du développement des produits artisanaux à base de
microorganismes depuis le Costa Rica jusqu’à Terre & Humanisme ................................................... 12
Figure 4: Localisation et vue satellite de la parcelle d'essai pour l'expérimentation n°1 ...................... 16
Figure 5: Géologie simplifiée du bassin versant du Chassezac (Syndicat du Chassezac, 2015) ........... 16
Figure 6: Processus de fabrication de la LiFoFer solide (photographies : C.Denis) ............................. 18
Figure 7: Matériel utilisé pour la fabrication de la LiFoFer liquide (photographies : C.Denis)............ 18
Figure 8: Interventions culturales au cours du cycle 1 de l'expérimentation n°1 .................................. 20
Figure 9: Interventions culturales au cours du cycle 2 de l'expérimentation n°1 .................................. 20
Figure 10: Design expérimental de l'expérimentation n°1 .................................................................... 20
Figure 11: Interventions culturales au cours de l'expérimentation n°2 ................................................. 28
Figure 12: Tableau de l'inventaire des plantes bio-indicatrices réalisé à T0 sur la parcelle
d'expérimentation n°1 ............................................................................................................................ 30
Figure 13: Schéma des placettes ayant des caractéristiques de sol positives (en vert) et négatives (en
rouge) .................................................................................................................................................... 32
Figure 14: Moyennes de la biomasse racinaire des laitues du cycle 1 en fonction des modalités ........ 32
Figure 15: Moyennes de la longueur racinaire des laitues du cycle 1 en fonction des modalités ......... 32
Figure 16: Diamètre moyen (cm) des laitues en fonction des modalités et des dates de mesure, cycle 1
............................................................................................................................................................... 32
Figure 17: Diamètre au collet moyen (cm) par modalité et par date de mesure .................................... 34
Figure 18: Taux de Brix moyen (°B) par modalité................................................................................ 34
Figure 19: Nombre de laitue cumulé par modalité et par niveau d'attaque de limace sur la période du
28/04 au 21/05 ....................................................................................................................................... 34
Figure 21: Biomasse fraîche moyenne (g) en fonction des modalités ................................................... 34
Figure 20: Biomasse sèche moyenne (g) en fonction des modalités ..................................................... 34
Figure 22: Diamètre moyen des laitues à la récolte (cm) par modalité et valeur moyenne (droite
orange) ................................................................................................................................................... 36
Figure 23: Taux de Brix moyen (°B) par modalité et moyenne globale (droite orange)....................... 36
Figure 24: Analyse des nutriments contenus dans la sève des laitues (cycle 2), principaux résultats .. 36
Figure 25: Biomasse fraîche moyenne (g) par modalité des laitues cycle 2 à la récolte ....................... 38
Figure 26: Perte de biomasse fraîche à la récolte (% de la biomasse initiale) par modalité.................. 38
Figure 27: Biomasse racinaire sèche moyenne (g) des tomates par modalité après récoltes ................ 38
Figure 28: Suivi de la hauteur de plant des pieds de tomate (cm) en fonction du temps ...................... 40
Figure 29: Facteur de croissance des pieds de tomate calculé par modalité ......................................... 40
Figure 30: Croissance (cm) des pieds de tomates entre deux périodes de mesure ................................ 40
Figure 31: Photographie d'un puceron aptère sur pied de tomate (photographie : C.Denis) ................. 40
Figure 32: Nombre moyen de pied de tomate attaqué par les pucerons par modalité ........................... 40
Figure 33: Nombre de pucerons moyen par pied de tomate par modalité ............................................. 40
Figure 34: Taux de Brix moyen des tomates (°B) par modalité et par récolte ...................................... 42
Figure 35: Poids moyen (g) récolté par pied de tomate par modalité pour les différentes récoltes ...... 42
Figure 36 : Photographies des laitues du cycle 2 de la modalité EF, répétition 1, illustrant les disparités
de stade de développement au sein d'une même placette expérimentale .............................................. 44
Figure 37: Relevés des températures minimales et maximales au cours de l'expérimentation sur tomate
............................................................................................................................................................... 48
ix
LISTE DES TABLEAUX
Tableau 1: Types de cultures, microorganismes et marchés agricoles des produits à base de
microorganismes ................................................................................................................................... 10
Tableau 2: Tableau récapitulatif des recherches menées et résultats obtenus sur les LiFoFers par les
partenaires du projet .............................................................................................................................. 14
Tableau 3: Proportions des éléments nécessaires à la fabrication de la LiFoFer .................................. 18
Tableau 4: Présentation des modalités et de leurs différents modes d'application, expérimentation n°1
sur laitues, cycle 1 et 2 .......................................................................................................................... 22
Tableau 5: Coefficient associé au pourcentage de couverture de la surface du sol d'une plante bio-
indicatrice .............................................................................................................................................. 22
Tableau 6: Facteurs de levée de dormance et manifestation du caractère indicateur ............................ 24
Tableau 7: Echelle d'attaque des limaces en fonction du pourcentage de surface foliaire détruit par le
ravageur ................................................................................................................................................. 26
Tableau 8: Présentation des modalités et de leurs différents modes d'application, expérimentation n°2
sur tomates............................................................................................................................................. 28
Tableau 9: Récapitulatif des données de rendement sur tomates .......................................................... 42
xi
AVANT-PROPOS
Ce stage a été réalisé au sein de l’association Terre & Humanisme, ci-après « T&H », une association
loi 1901 créée en 1994. Son objectif depuis 25 ans est l’accompagnement et le soutien de la transition
agroécologique via la sensibilisation du grand public et des acteurs de l’agriculture paysanne. Le siège
de l’association ainsi que le jardin pédagogique sont localisés en région Auvergne-Rhône-Alpes, en
Ardèche (07) sur la commune de Lablachère.
L’association regroupe au total 20 salariés. Depuis 2014, la gouvernance de l’association est horizontale,
aussi appelée « gouvernance partagée », avec la mise en place de différents organes de gouvernance se
substituants à une direction classique. L’équipe salariée et le conseil d’administration sont fortement
responsabilisés et impliqués dans ce mode de gouvernance. L’association est structurée en 3 pôles
principaux :
(i) Le pôle Conseil et Formation traite les expertises réalisées par l’association, les stages
(courts et longs) et la boutique de l’association.
(ii) Le pôle Supports est chargé de la communication, la recherche de fonds ainsi que la gestion
des activités administratives financières, juridiques et les ressources humaines.
(iii) Le pôle projet développe les actions de sensibilisation, de transmission, de solidarité, en
France et à l’internationale, et les expérimentations dans lesquelles s’inscrivent ce mémoire.
xiii
INTRODUCTION
Pour répondre à l’augmentation de la demande en denrées alimentaires, liée à la croissance de la
population mondiale, il est nécessaire d’améliorer l’impact environnemental de la production agricole.
Pour cela, l’un des défis majeurs actuels est de mettre en œuvre une agriculture durable et saine pour
l’environnement tout en maintenant les volumes produits. Les méthodes actuelles de production
agricole, tels que l'utilisation inappropriée de pesticides et d'engrais chimiques, créent des problèmes
environnementaux et sanitaires (Gunnell et al. 2007 ; Leach, Mumford 2008). Le développement de
nouveaux cultivars a permis une résistance accrue aux maladies, une plus grande tolérance à la
sécheresse et au sel, et une meilleure valeur nutritionnelle. Malheureusement, l'interaction bénéfique
entre les plantes et les microorganismes a souvent été ignorée dans les stratégies de sélection.
Aujourd’hui, certaines souches de microorganismes sont utilisées et reconnues pour lutter contre les
pathogènes, stimuler la croissance des plantes, comme les bactéries du genre Azospirillum ou Rhizobium
(Berg 2009). Il est primordial de considérer les échanges continuels de ces organismes avec d’autres,
parmi lesquels : bactéries, champignons, virus, protozoaires, etc. La complexité des phénomènes ayant
lieu dans le sol et dans/avec les plantes, conduit la recherche à prendre en considération le réseau
d’interactions (communications, antagonismes, interactions trophiques de type symbiose,
commensalisme, parasitisme…) dont les microorganismes font partie ; on parle alors d’holobionte, dans
lequel le « microbiote » (ensemble des microorganismes) est un élément essentiel (Vandenkoornhuyse
et al. 2015 ; Bordenstein, Theis 2015). Ces considérations sont de première importance pour
l’agriculture, dans la mesure où les microbes présents dans la phyllo- et la rhizosphère remplissent des
fonctions cruciales pour la nutrition des plantes et leur protection contre les pathogènes (Raaijmakers et
al. 2009). Certains agriculteurs mettent à profit depuis longtemps ces microorganismes via l’utilisation
de préparation fermentées, et plus récemment de préparations commerciales spécialisées, parmi
lesquelles les « Microorganismes Efficaces » du Pr. Teruo Higa (Higa, Parr 1994 ; Faessel 2014 ; Parnell
et al. 2016). Ces Microorganismes Efficaces (EM) font l’objet d’une littérature abondante, mais souvent
partiale et de qualité insuffisante – si bien que la question de leur utilité réelle reste un sujet de
controverses (Golec et al. 2013 ; Olle, Williams 2013). Cette préparation a ensuite été adaptée au Costa
Rica grâce à une étroite collaboration entre paysans et chercheurs et est appelée « microorganismes de
montagnes » (Felix 2015 ; Tencio 2014). Héritière de cette adaptation, la Litière Forestière Fermentée,
ci-après « LiFoFer », est une préparation à base de litière forestière, fermentée en conditions micro-
aérobie en présence de mélasse, de son de céréales, et de petit-lait (Felix 2015). La LiFoFer présenterait
deux principales spécificités : sa provenance locale et la grande diversité des souches microbiennes
présentes, lesquelles permettent potentiellement de respecter, rétablir et soutenir l’équilibre naturel des
agrosystèmes ciblés tout en augmentant l’accessibilité technique et financière de sa confection. Des
préparations de LiFoFer sont à l’étude en conditions sahéliennes (projet « ACEPT-MAB » mené par le
CIRAD) et en France visant sa caractérisation physico-chimique et microbiologique (P. Christen, IRD)
et l’évaluation de ses impacts sur les cultures maraîchères (GABs).
1
Figure 1: Schématisation des relations entre les différents acteurs du projet LiFoFer initié par Terre & Humanisme
Figure 1: Diagram of the relations between the different actors of the LiFoFer project initiated by Terre & Humanisme
De ce contexte a émergé la nécessité d’une évaluation scientifique de l’efficacité de la LiFoFer en
conditions tempérées, sur les productions maraichères, viticoles et fruitières, avec un focus spécifique
sur ses impacts sur la fertilité des sols et sur la santé des cultures. Dans une démarche de recherche-
action participative, et tel que présenté sur la Figure 1, Terre & Humanisme, le FiBL France, le CIRAD,
l’IRD et les groupements d’agriculteurs biologiques de quatre départements collaborent pour mieux
comprendre son action et, le cas échéant, optimiser son efficacité, crédibiliser, capitaliser et diffuser de
nouveaux savoir-faire au service d’une agriculture agroécologique. Des observations préliminaires
tendent à corroborer l’hypothèse d’une action bénéfique de la LiFoFer sur la biodisponibilité des
nutriments, le recyclage de la matière organique, et la résistance des plantes vis-à-vis d’agents
pathogènes.
Ainsi, ces résultats et la concertation des acteurs de ce projet de recherche participative sont à l’origine
du choix de la problématique de ce mémoire : Compte-tenu de sa complexité et du peu de
connaissances acquises, comment évaluer les différents effets de la LiFoFer dans une démarche
expérimentale au plus proche des conditions de production maraîchères biologiques ?
Le présent rapport présente un état des lieux des connaissances acquises sur les microorganismes en
agriculture, ainsi que le contexte dans lequel est née cette étude. Une synthèse des résultats est ensuite
présentée puis discutée. Enfin, des propositions d’amélioration et des perspectives sont proposées pour
la continuité de ce projet.
3
Figure 2: Exemple de composition pondérale d'un horizon organique de
sol de prairie tempérée (Bachelier, 1978)
Ainsi, le sol et les plantes regorgent d’une multitude de microorganismes. Les principaux acteurs sont
décrits dans les parties suivantes.
5
1.1.1.2 Les bactéries fixatrices d’azote
Les bactéries fixatrices d’azote sont des bactéries qui convertissent l’azote atmosphérique N2 en azote
assimilable par les plantes. Elles sont regroupées en plusieurs groupes : les bactéries libres (Azotobacter
et Azospirillium), les cyanobactéries et les symbiotes comme Rhizobium (Bhat et al. 2015). Ces bactéries
fixatrices d’azote de nature symbiotique peuvent fixer une dose d’azote entre 50 et 100 kg/ ha. Elles
colonisent les racines de fabacées spécifiques pour former des nodules racinaires, qui agissent en
symbiose en produisant de l’ammoniac en échange des exsudats racinaires produits par la plante (Bhat
et al. 2015 ; Peix et al. 2015).
7
Les levures permettent de structurer le sol, en particulier les genres Cryptococcus et Lipomyces, qui sont
capables de produire des composés extracellulaires qui lient les particules du sol entre elles (Lynch,
Bragg 1985). D’après la littérature, elles pourraient être utilisées comme agents de biocontrôle des
champignons phytopathogènes du sol et comme facteurs de croissance des plantes (El-Tarabily,
Sivasithamparam 2006 ; Arras et al. 1998 ; Mukherjee et al. 2020).
Aujourd’hui, de plus en plus de travaux sont menés afin de mobiliser la diversité des microorganismes
au service d’une agriculture exempte de produits chimiques. Certains microorganismes sont déjà
reconnus et utilisés pour promouvoir la croissance des plantes et leur développement en condition de
stress (Ahemad, Kibret 2014). Beaucoup d’industries agrochimiques produisent désormais des
biopesticides ou biofertilisants, notamment pour les agriculteurs en conduite biologiques (Garmendia et
al. 2018).
9
Tableau 1: Types de cultures, microorganismes et marchés agricoles des produits à base de microorganismes
1
Le Bokashi est un matériau organique similaire à un compost inoculé avec des microorganismes. Il est utilisé en
agriculture car il apporte matière organique et microorganismes aux plantes et au sol (Quiroz, Céspedes 2019).
2
Le thé de compost est une méthode de fermentation aérobie de compost dans l’eau, afin d’en multiplier les
microorganismes. Il utilisé pour des propriétés de biocontrôle et de fertilisation (Scheuerell, Mahaffee 2002).
11
Figure 3: Frise chronologique de l'historique du développement des produits artisanaux à base de microorganismes depuis
le Costa Rica jusqu’à Terre & Humanisme
Figure 3: Timeline of the development of microorganism-based artisanal products from Costa Rica to Terre et Humanisme
Commerce et est utilisée pour les mêmes raisons. Sa préparation consiste mettre en fermentation de la
litière forestière avec du lactosérum et des sources de sucres (mélasse de canne à sucre par exemple).
13
Tableau 2: Tableau récapitulatif des recherches menées et résultats obtenus sur les LiFoFers par les partenaires du projet
Table 2: Summary table of research conducted and results obtained on LiFoFers by the project partners
Organi-
Intitulé du projet Résultats et conclusions Date sme(s)
d’acceuil
Analyses microbiologiques de la - 91% de la communauté bactérienne est Universit
litière fermentée par séquençage constituée de Lactobacillus é de
- 7,8% de proteobacteria dont en majorité des Rennes 1
rhizobiales (symbiontes et fixatrices d’azote)
- 2,8% de gamma-protéobactéries
Compostage de fumier avec Litière Pas de différence significative observée 2020 Agribio-
Forestière Fermentée drôme
Influence de l’O2 sur la - Dégradation de la matière organique 2019 IMBE
fermentation de litière forestière, en inversement proportionnelle à la quantité d’O2
vue de la production d’un présente dans la LiFoFer liquide
biofertilisant. Caractérisation - Intérêt de travailler en micro-aérophile (2%
biochimique et microbiologique du d’O2) pour favoriser la dégradation de MO
produit tout en inhibant la croissance de
microorganismes pathogènes
Etude physico-chimique et - 107 UFC/ml de bactéries lactiques 2019 IMBE et
biologique d'un biofertilisant à base - 106 UFC/ml de bactéries anaérobies IRD
de litière forestière fermentée - présence de bactéries mésophiles,
champignons et levures
- Pas de microorganismes pathogènes détectés
- Diminution du pH au cours du temps
- La LiFoFer favorise la biomasse
microbienne active du sol en conditions
contrôlées
Validation scientifique des effets de - L’utilisation de LiFoFer améliore la santé et 2019 CIRAD,
la Litière Forestière Fermentée sur la résistance des animaux face aux maladies T&H,
des élevages agro-écologiques au - Ponte d’œufs plus gros EEPFIH
centre Ouest du Burkina Faso. Cas
des poules locales et des moutons
dans la ferme agro-écologique de
Réo
Effets de la litière forestière - Effet positif de la LiFoFer en début de cycle 2019 CIRAD,
fermentée (lff) sur les paramètres de culture sur le développement du sorgho T&H,
végétatifs et les rendements de - Augmentation des rendements en grain du Univ Ki
sorghum bicolor (sorgho blanc) et niébé et du sorgho en association de culture Zerbo
de vigna unguiculata (niébé) dans - Réduction de l’influence des thrips sur niébé
le plateau central du burkina faso
Depuis 6 ans, l’association T&H, en relation avec de nombreux partenaires du monde agricole et
scientifique, mène des essais sur la LiFoFer afin d’explorer ses effets et ses potentiels usages. Un
récapitulatif de ces résultats est présenté dans le Tableau 2.
Aux vues de (i) la grande diversité de microorganismes essentiels au fonctionnement du sol, (ii) de la
complexité de leurs interactions, (iii) compte tenu du manque de connaissance (iv) et de la non-
unanimité de la communauté scientifique au sujet des microorganismes bénéfiques et enfin (v)
constatant la variabilité des produits obtenus par le processus de fermentation de litière forestière,
l’association T&H met en place ses propres expérimentations pour tester les effets de la LiFoFer. Ce
travail bibliographique permet d’émettre des hypothèses de travail qui seront confirmées ou infirmées
grâce aux expérimentations mises en place et présentées dans la suite de ce mémoire. Du fait de la nature
et de la diversité des microorganismes qu’elle contient :
- La LiFoFer aurait des effets positifs sur le rendement et la croissance des plantes
- Elle possèderait un effet de biocontrôle sur certains pathogènes et ravageurs des cultures
- Du fait de son procédé de fabrication, ses effets seraient comparables aux produits du commerce
élaborés à base de microorganismes
- Elle aurait un effet stimulant sur la vie du sol
- La LiFoFer est compatible avec l’utilisation d’autres préparations naturelles utilisées par les
agriculteurs telles que le purin d’ortie
2 MATERIELS ET METHODES
15
Parcelle
d’expérimentation
Commanderie
de Jalès
Nord
Figure 4: Location and satellite view of the test plot for experiment 1
Commanderie de
Jalès
Figure 5 : Simplified geology of the Chassezac catchment area (Syndicat du Chassezac, 2015)
2.2 EXPERIMENTATION N°1 : EFFET DE L’UTILISATION DE LA LIFOFER SUR
UNE CULTURE DE LAITUES DE PLEIN CHAMP (LACTUCA SATIVA)
2.2.3.1 Matériel
17
Figure 6: Processus de fabrication de la LiFoFer solide (photographies : C.Denis)
Cuve en
inox pour
fermentation
de la
LiFoFer
liquide
Système de
régulation de
la
température
Figure 7: Matériel utilisé pour la fabrication de la LiFoFer liquide (photographies : C.Denis)
Figure 7: Materials used for the manufacture of liquid LiFoFer (photographs: C.Denis)
Cela consiste en une première fermentation grâce à laquelle on obtient de la LiFoFer solide puis une
deuxième fermentation permettant d’obtenir une solution à diluer avant utilisation sur les cultures.
19
Figure 8: Interventions culturales au cours du cycle 1 de l'expérimentation n°1
21
Tableau 4: Présentation des modalités et de leurs différents modes d'application, expérimentation n°1 sur laitues, cycle 1 et 2
Table 4: Presentation of the modalities and their different modes of application, experiment n°1 on lettuce, cycle 1 and 2
Tableau 5: Coefficient associé au pourcentage de couverture de la surface du sol d'une plante bio-indicatrice
Table 5: Coefficient associated with the percentage of soil surface cover of a bio-indicator plant
23
Tableau 6: Facteurs de levée de dormance et manifestation du caractère indicateur
25
Tableau 7: Echelle d'attaque des limaces en fonction du pourcentage de surface foliaire détruit par le ravageur
Table 7: Slug attack scale according to the percentage of leaf area destroyed by the pest
Pourcentage de surface
Niveau Description
foliaire détruite
Niveau 0 Aucun dégât 0%
Niveau 1 Attaque légère sur vieille feuille, petits trous 0% - 10%
Niveau 2 Attaque légère sur jeune feuille, feuille extérieure pâle, petits 10% - 20%
trous, feuilles extérieures avec petits à moyen trous
27
Figure 11: Interventions culturales au cours de l'expérimentation n°2
Tableau 8: Présentation des modalités et de leurs différents modes d'application, expérimentation n°2 sur tomates
Table 8: Presentation of the modalities and their different modes of application, experiment n°2 on tomatoes
29
Figure 12: Tableau de l'inventaire des plantes bio-indicatrices réalisé à T0 sur la parcelle d'expérimentation n°1
Figure 12: Table of the inventory of bio-indicator plants carried out at T0 on the experimental plot n°1
2.3.2.2 Indicateurs de la santé des plantes
3 RESULTATS
31
Figure 13: Schéma des placettes ayant des caractéristiques de sol positives (en vert) et négatives (en rouge)
Figure 13: Diagram of plots with positive (green) and negative (red) soil characteristics
Figure 15: Moyennes de la longueur racinaire des laitues du Figure 14: Moyennes de la biomasse racinaire
cycle 1 en fonction des modalités des laitues du cycle 1 en fonction des modalités
Figure 14: Root length averages of cycle 1 lettuces according to Figure 15: Average root biomass of cycle 1
modalities lettuce according to modalities
Figure 16: Diamètre moyen (cm) des laitues en fonction des modalités et des dates de mesure, cycle 1
Figure 16: Average diameter (cm) of lettuce according to modalities and measurement dates, cycle 1
3.1.1.2 Mesure réalisée le 16/06/2021 – Mesure de suivi
La seconde série d’inventaire réalisée environ 1 mois plus tard met en évidence les tendances de
certaines parcelles avec un bon potentiel agronomique ou non. Les résultats sont étudiés par placette et
par modalité. Ceux présentés ici sont le fruit du rapport de l’expert et des discussions qui s’en sont
suivies avec lui, permettant d’affiner la lecture des résultats et de se concentrer sur les placettes ayant
les critères les plus marquants. Au regard du diagnostic initial (T0), les critères pris en compte en priorité
sont les critères AIR (Asphyxie ou compactage du sol), EAU (engorgement du sol), MO(C) et MO(N)
(sols riches en matière organique équilibrée), LESS (lessivage), ERO (érosion) et AB (activité
biologique). D’après le classement de l’expert, les placettes ayant les critères les plus favorables à une
culture sont réparties dans chaque modalité. Les placettes sont représentées sur la Figure 13, la couleur
rouge signifie que les parcelles présentent des coefficients majoritairement à caractère négatif et la
couleur verte, des coefficients à caractères positifs. Les placettes EF.1, EF.4, EM_C.1, EM_C.2, T.4,
LFF+EF.2 possèdent notamment une bonne activité biologique et un sol ni engorgé ni séchant, et une
matière organique équilibrée en carbone et en azote. Au contraire, les placettes LFF.1, LFF.3, LFF.4,
T.1, T.3, LFF+EF.3, LFF+EF.4 et EF.3 présentent des adventices caractéristiques des sols compactés et
ayant une activité biologique faible. Sur les 4 répétitions, la modalité LFF en possède 3 dont les
adventices sont indicatrices d’un sol compacté et d’une activité biologique faible. Pour les autres
modalités, aucune tendance globale ne se dégage clairement.
33
Figure 17: Diamètre au collet moyen (cm) par modalité et par date de mesure
Figure 17: Average crown diameter (cm) by modality and measurement date
Limax
Figure 20: Biomasse fraîche moyenne (g) en fonction des Figure 21: Biomasse sèche moyenne (g) en fonction des
modalités modalités
Figure 20: Average fresh biomass (g) according to Figure 21: Average dry biomass (g) according to modalities
modalities
Les mesures de diamètre au collet permettent également d’évaluer la croissance végétative des laitues
et montrent des différences significatives lors des dernières semaines de croissance. A partir du
03/06/21, la modalité traitée à la LiFoFer et aux EF possède un diamètre au collet significativement
moins élevé (p-value < 0,05) que les modalités EF, EM_C et LiFoFer seule (LFF). Les différences sont
comprises en 0,14mm et 0,25mm de diamètre en moins. Toutefois, la modalité Témoin (T) ne présente
de différence avec aucune autre modalité. Les mesures de diamètre au collet et de diamètre de la laitue
présentent des similarités. Dans les deux cas la modalité LFF+EF est moins développée que les autres
modalités. Encore une fois, les différences sont visibles en fin de culture (2 dernières semaines) et sont
plus marquées sur les mesures de diamètre global de la laitue
3.1.4.1 Biomasse aérienne fraîche, biomasse aérienne sèche et taux de matière sèche
Les mesures de biomasse fraîche (Figure 20) et la biomasse sèche (Bmsec) des laitues (Figure 21)
présentent des tendances similaires entre elles et aux précédentes mesures de croissance végétative. Pour
la biomasse fraîche, les laitues des modalités LFF+EF et LFF pèsent moins lourd que les laitues des
modalité EF et Témoin. On retrouve jusqu’à 63 g de différence entre LFF+EF et EF. Pour la Bmsec, les
différences sont plus prononcées. La biomasse de la modalité LFF+EF est plus faible que toutes les
autres laitues, en moyenne entre 1,4 g de différence avec LFF et 3,2 g et de différence avec EF. Les taux
de matière sèche sont autour de 5%, ce qui est la valeur attendue (Mou 2009).
35
Figure 22: Diamètre moyen des laitues à la récolte (cm) par modalité et valeur moyenne (droite orange)
Figure 22: Average diameter of lettuce at harvest (cm) by treatment and overall average (orange line)
Figure 23: Taux de Brix moyen (°B) par modalité et moyenne globale (droite orange)
Figure 23: Average Brix level (°B) per modality and overall average (orange line)
Figure 24: Analyse des nutriments contenus dans la sève des laitues (cycle 2), principaux résultats
Figure 24: Nutrient analysis of lettuce sap (cycle 2), main results
Bien qu’il soit légèrement plus élevé pour la LFF (5,98%) et plus faible pour le témoin (4,87%), aucune
différence significative n’est observée entre les taux de matière sèche (%MS) des différentes modalités
ni concernant les pourcentages de perte à la récolte. Les rendements des laitues traitées à la LiFoFer et
LFF+EF sont globalement moins élevés.
37
Figure 25: Biomasse fraîche moyenne (g) par modalité des laitues cycle 2 à la récolte
Figure 25: Average fresh biomass (g) per modality of cycle 2 lettuce at harvest
Figure 26: Perte de biomasse fraîche à la récolte (% de la biomasse initiale) par modalité
Figure 27: Biomasse racinaire sèche moyenne (g) des tomates par modalité après récoltes
Figure 27: Average dry root biomass (g) of tomatoes per modality after harvesting
Les taux des vieilles feuilles sont décroissants en partant de la modalité EF (1007ppm), EM (930ppm)
puis on arrive autour de l’optimum avec la modalité LFF (815ppm), LFF+EF (634ppm) et la modalité
témoin (584ppm) Les valeurs sont globalement un peu élevées au regard de l’optimum fournit et de la
littérature (entre 180 et 360ppm). Les valeurs de phosphore (P) sont cohérentes avec l’optimum et la
littérature (entre 200 et 330 ppm) et sont plus élevées pour les jeunes feuilles des modalités EM
(393ppm) et LFF (376ppm). Les taux de sucre contenus de la sève diffèrent de manière importante. La
sève contenue dans les jeunes feuilles des laitues des modalités Témoin (0,7%), EF (0,6%) et LFF (0,4%)
présentent des taux de sucre compris dans l’optimum, entre 0,3% et 1,4% de la sève, et plus élevés que
les autres modalités. Les modalités EF et T se démarquent particulièrement. Aucune particularité n’est
notée pour les valeurs de potassium (K) qui sont globalement un peu élevées par rapport aux références.
Les taux d’azote minéral (NH4) sont plus élevés pour les modalités LFF+EF (248ppm) et EF (221ppm).
Pour le taux d’azote (N) total les valeurs sont proches mais toutes en dessous de l’optimum fournit par
le laboratoire. Globalement, il n’y a pas de signe de carences particulières. Les taux de sucres élevés
pour les modalités EF et Témoins témoigneraient d’une meilleure santé des laitues de ces modalités.
39
Figure 29: Facteur de croissance des pieds de tomate
calculé par modalité
Figure 28: Suivi de la hauteur de plant des pieds de Figure 29: Growth factor of tomato plants calculated
tomate (cm) en fonction du temps by modality
41
Figure 34: Taux de Brix moyen des tomates (°B) par modalité et par récolte
Figure 34: Average Brix level of tomatoes (°B) by modality and by harvest
Figure 35: Poids moyen (g) récolté par pied de tomate par modalité pour les différentes récoltes
Figure 35: Average weight (g) harvested per tomato plant by modality for the different harvests
43
Figure 36 : Photographies des laitues du cycle 2 de la modalité EF, répétition 1, illustrant les
disparités de stade de développement au sein d'une même placette expérimentale
Figure 36: Photographs of lettuce from cycle 2 of the EF model, replication 1, illustrating the
disparities in development stage within the same experimental plot
Aucun phytopathogène n’ayant été identifié au cours de l’expérimentation, nous ne pouvons pas
confirmer ou infirmer l’hypothèse concernant le potentiel de biocontrôle de la LiFoFer pour les maladies
provoquées par les microorganismes sur les laitues.
Enfin, la comparaison des résultats des EM_C et de la LiFoFer ne donne de tendance sur aucun
indicateur. De plus, les effets des EM_C sur la culture n’ont pas non plus été significatifs. Pour les
prochaines expérimentations, on peut envisager d’utiliser le produit de référence fabriqué par la société
EMRO. Ce produit ferait meilleure référence que le produit Synbiovie utilisé ici qui est peu évalué dans
la littérature.
45
Afin de mieux comprendre les interactions entre la LiFoFer et l’extrait fermenté d’ortie, il serait
intéressant de reconduire des expérimentations avec différentes modalités d’application de ces deux
préparations. En effet, les agriculteurs biologiques susceptibles d’utiliser la LiFoFer sont souvent déjà
sensibilisés à l’utilisation de purin d’ortie. En attendant d’étoffer ces résultats, il faut être vigilant sur
les recommandations faites aux agriculteurs qui voudraient utiliser de la LiFoFer et qui utilisent déjà de
l’extrait fermenté d’ortie, afin de ne pas pénaliser leurs récoltes.
Concernant les effets de la LiFoFer seule sur les laitues de plein champ, on ne constate pas d’effet
favorisant la croissance des plantes comparée à des laitues traitées à l’eau.
47
40
35
30
Température (°C)
25
20
15
10
5
0
Figure 37: Relevés des températures minimales et maximales au cours de l'expérimentation sur tomate
Figure 37: Minimum and maximum temperature readings during the tomato experiment
Ainsi, pour éviter les biais provoqués par les attaques de ravageurs et consolider les observations, il
serait intéressant de reconduire cet essai en pots sous un filet de protection évitant le passage des
pucerons. Globalement, il n’y a pas de différence de croissance entre les différentes modalités, et pas de
différences significatives avec la modalité témoin. La difficulté de mettre en évidence les effets de la
LiFoFer sur la culture de tomate est possiblement lié aux conditions de culture. Les températures élevées
du mois de juillet et août illustrée par le relevé de température ci-contre peuvent avoir limiter la
croissance des tomates (Figure 37). Une température supérieure à 35°C peut endommager la
germination, la phase végétative, la floraison, la nouaison et la phase de maturation des fruits (Faruq et
al. 2012). De plus, les tomates n’ont pas reçu d’ombre et l’irrigation n’a pas été suffisante tout au long
de la culture. Les symptômes tels que le jaunissement et l’assèchement de certaines feuilles témoignant
du stress hydrique sont accentués par un support de culture séchant. Ces éléments expliquent également
le rendement global faible comparé au rendement potentiel de ce cultivar, les fruits pouvant peser entre
15 et 30 g, faisant entre 5 et 18 fruits par grappe. Ainsi, dans le cas de cette expérience, les traitements
appliqués ne sont ni dommageables ni favorables à la croissance et au rendement des tomates.
49
5 CONCLUSIONS ET PERSPECTIVES
Face à la nécessité de développer des connaissances pratiques et des références scientifiques sur
l’utilisation de produits à base de microorganismes et leur fonctionnement, l’association Terre et
Humanisme, actrice du déploiement de l’agroécologie, forme un réseau important d’acteurs du monde
agricole technique et scientifique pour travailler en réponse à cette problématique. Dans ce cadre, ce
stage s’est particulièrement intéressé aux effets de la litière forestière fermentée (LiFoFer), testée
empiriquement depuis plusieurs années en France et en Afrique de l’Ouest.
Les expérimentations menées pendant ce stage sur Lactuca sativa (laitue) et Solanum lycopersicum
(tomate) ne permettent pas de mettre clairement en évidence un effet de la LiFoFer sur ces cultures.
Pour la laitue, aucun traitement n’a permis une amélioration significative de la culture par rapport aux
témoins traités à l’eau, que ce soit d’un point de vue de la santé de la plante, de la croissance végétative
ou du rendement. Au contraire, la modalité LiFoFer combinée aux extraits fermentés d’ortie sur laitue
semble même influencer négativement les indicateurs de croissance végétative et de rendement pour
cette culture. Pour la culture de laitue, les hypothèses initiales d’effets positifs de la LiFoFer sur la
croissance végétative, le rendement, la santé de la plante ainsi que de stimulation de la vie du sol ne
peuvent être vérifiées. Cependant, pour la culture de tomate, la croissance végétative semble avoir été
favorisée par l’application de LiFoFer au cours des stades « jeunes » de la plante (5ème semaine de
croissance).
Outre les biais expérimentaux constatés au cours de l’expérimentation menée sur les laitues, la méthode
d’évaluation des effets de la LiFoFer peut être améliorée. Le nombre important d’objectifs sous-tendus
pas les essais rend difficile la caractérisation précise des effets potentiels de la LiFoFer. En effet, avant
de pouvoir comparer la LiFoFer à d’autres produits similaires et avant d’explorer simultanément
plusieurs pistes d’applications possibles de ce produit, il semble prioritaire de se concentrer sur la
validation de l’effet d’augmentation du rendement des cultures. C’est une préoccupation importante qui
passe pour la LiFoFer par la précision des préconisations d’utilisation. La dose de produit pur, la
dilution, la fréquence et la période de traitement sont des éléments à préciser.
Au regard de la complexité et du peu de connaissances disponibles sur cette technologie qu’est la
LiFoFer, il est important de continuer à collaborer avec les organismes de recherche et
d’expérimentations partenaires du projet. Le développement d’un tel produit est très pertinent pour une
agriculture en transition agroécologique, non seulement en France mais dans le monde entier. Les
résultats obtenus sont encourageants, non seulement au travers du projet LiFoFer, mais aussi pour les
préparations à base de microorganismes développées à travers le monde. De plus, en considérant la part
des produits biologiques qui continue d’augmenter chaque année dans de nombreux pays, l’utilisation
de ces produits est prometteuse (Rani, Kumar 2019). Les agriculteurs biologiques, conventionnels, de
grandes et petites surfaces peuvent tous y trouver leur intérêt : les effets des bioproduits sont visibles sur
le long terme dans l’agrosystème, il n’y pas d’effets secondaires sur la santé humaine, ni sur
l’environnement et la fabrication est peu coûteuse. Face aux constats exposés par les experts du climat
dans le dernier rapport du GIEC (Groupe d’Experts Intergouvernemental sur l’Evolution du Climat), il
est urgent de développer des solutions résilientes pour l’agriculture, une des premières victimes du
changement climatique. Le développement de la LiFoFer est donc à poursuivre car elle répond à de
nombreux enjeux sociaux, économiques et environnementaux actuels.
51
RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
AERTS, Rien, 2003. The Role of Various Types of Mycorrhizal Fungi in Nutrient Cycling and Plant
Competition. In : VAN DER HEIJDEN, Marcel G. A. et SANDERS, Ian R. (éd.), Mycorrhizal
Ecology [en ligne]. Berlin, Heidelberg : Springer Berlin Heidelberg. Ecological Studies. pp. 117‑133.
[Consulté le 2 avril 2021]. ISBN 978-3-540-00204-8. Disponible à l’adresse :
http://link.springer.com/10.1007/978-3-540-38364-2_5.
AHEMAD, Munees et KIBRET, Mulugeta, 2014. Mechanisms and applications of plant growth
promoting rhizobacteria: Current perspective. In : Journal of King Saud University - Science. 1 janvier
2014. Vol. 26, n° 1, pp. 1‑20. DOI 10.1016/j.jksus.2013.05.001.
ARRAS, G., CICCO, V. De., ARRU, S. et LIMA, G., 1998. Biocontrol by yeasts of blue mould of
citrus fruits and the mode of action of an isolate of Pichia guilliermondii. In : The Journal of
Horticultural Science and Biotechnology. 1 janvier 1998. Vol. 73, n° 3, pp. 413‑418.
DOI 10.1080/14620316.1998.11510993.
BACHELIER, Georges, 1978. La faune des sols, son écologie et son action [en ligne]. Paris :
ORSTOM. [Consulté le 30 avril 2021]. Initiations-Documentations Techniques, 38. ISBN 978-2-
7099-0530-5. Disponible à l’adresse : http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:09691. Centre IRD de
Bondy
BERG, Gabriele, 2009. Plant–microbe interactions promoting plant growth and health: perspectives
for controlled use of microorganisms in agriculture. In : Applied Microbiology and Biotechnology. 1
août 2009. Vol. 84, n° 1, pp. 11‑18. DOI 10.1007/s00253-009-2092-7.
BHAT, Tauseef, AHMAD, Drlatief, GANAI, A et KHAN, Owais, 2015. Nitrogen Fixing
Biofertilizers; Mechanism and Growth Promotion: A Review. In : Journal of Pure and Applied
Microbiology. 1 juillet 2015. Vol. 9, pp. 1675‑1690.
BHATTI, Asma Absar, HAQ, Shamsul et BHAT, Rouf Ahmad, 2017. Actinomycetes benefaction role
in soil and plant health. In : Microbial Pathogenesis. 1 octobre 2017. Vol. 111, pp. 458‑467.
DOI 10.1016/j.micpath.2017.09.036.
BORDENSTEIN, Seth R. et THEIS, Kevin R., 2015. Host Biology in Light of the Microbiome: Ten
Principles of Holobionts and Hologenomes. In : PLOS Biology. 18 août 2015. Vol. 13, n° 8,
pp. e1002226. DOI 10.1371/journal.pbio.1002226.
BOTHA, Alfred, 2011. The importance and ecology of yeasts in soil. In : Soil Biology and
Biochemistry. 1 janvier 2011. Vol. 43, n° 1, pp. 1‑8. DOI 10.1016/j.soilbio.2010.10.001.
BOZSIK, A., 1996. Studies on aphicidal efficiency of different stinging nettle extracts. In : Anzeiger
für Schädlingskunde, Pflanzenschutz, Umweltschutz. 1 janvier 1996. Vol. 69, n° 1, pp. 21‑22.
DOI 10.1007/BF01905863.
BURGES, A. et RAW, F. (éd.), 1967. Soil biology. London : Academic Press. QL110 .B8 1967
CHARRIER, M., 2016. LIMACES DES CULTURES. Caractéristiques biologiques des Mollusques
Gastéropodes terrestres. In : ARVALIS - Institut du végétal [en ligne]. 18 mars 2016.
[Consulté le 30 juin 2021]. Disponible à l’adresse : https://docplayer.fr/129242630-Limaces-des-
cultures-caracteristiques-biologiques-des-mollusques-gasteropodes-terrestres-arvalis-institut-du-
vegetal-charrier-maryvonne.html.
53
CRIOLLO, Hernando, LAGOS, Tulio, PIARPUEZAN, Edwin et PÉREZ, Ruth, 2011. The effect of
three liquid bio-fertilizers in the production of lettuce (Lactuca sativa L.) and cabbage (Brassica
oleracea L. var. capitata). In : Agronomía Colombiana. décembre 2011. Vol. 29, n° 3, pp. 415‑421.
DAS, Surajit, LYLA, P. S. et AJMAL KHAN, S., 2008. Distribution and generic composition of
culturable marine actinomycetes from the sediments of Indian continental slope of Bay of Bengal. In :
Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 1 mai 2008. Vol. 26, n° 2, pp. 166‑177.
DOI 10.1007/s00343-008-0166-5.
DOMENICO, Prisa, 2019. Bat guano and Nettle slurry (Urtica dioica L.) used as biostimulants on
Delosperma cooperi and Sedum rubrotinctum plants. In : World Journal of Advanced Research and
Reviews. 2019. Vol. 3, n° 2, pp. 017‑023. DOI 10.30574/wjarr.2019.3.2.0058.
DUCERF, Gérard, 2018. Comment faire un diagnostic de sol dans une parcelle. In : L’encyclopédie
des plantes bioindicatrices alimentaires et médicinales, Guide de diagnostic des sols. 6. S.l. :
Promonature. pp. 56‑59. ISBN 2-9519258-7-5.
FERNANDES, Manlio Silvestre et ROSSIELLO, Roberto Oscar Pereyra, 1995. Mineral Nitrogen in
Plant Physiology and Plant Nutrition. In : Critical Reviews in Plant Sciences. janvier 1995. Vol. 14,
n° 2, pp. 111‑148. DOI 10.1080/07352689509701924.
FRAB, 2009. Les Fiches Techniques du réseau GAB/FRAB, Laitues, Batavias. 2009. S.l. : s.n.
GARMENDIA, Alfonso, RAIGÓN, María Dolores, MARQUES, Olmo, FERRIOL, María, ROYO,
Jorge et MERLE, Hugo, 2018. Effects of nettle slurry (Urtica dioica L.) used as foliar fertilizer on
potato (Solanum tuberosum L.) yield and plant growth. In : PeerJ. 7 mai 2018. Vol. 6, pp. e4729.
DOI 10.7717/peerj.4729.
GOBAT, J. M., ARAGNO, M. et MATTHEY, W., 2003. The living soil: basic pedology - soil
biology. In : The living soil: basic pedology - soil biology. [en ligne]. 2003.
[Consulté le 30 avril 2021]. Disponible à l’adresse :
https://www.cabdirect.org/cabdirect/abstract/20033067504.
GOLEC, Aníbal, LOKARE, Chinmay et GONZALEZ PEREZ, Pablo, 2013. Effective
Microorganisms: Myth or reality? In : Revista peruana de biología, ISSN 1727-9933, Vol. 14, No. 2,
2007, pags. 315-319. 1 avril 2013. Vol. 14. DOI 10.15381/rpb.v14i2.1837.
HIGA, T. et WIDIDANA, G.N., 1991. The concept and theories of effective microorganisms. In :
Proceedings of the First International Conference on Kyusei Nature Farming. 1 janvier 1991.
pp. 118‑124.
HIGA, Teruo et PARR, James, 1994. Beneficial and Effective Microorganisms for a Sustainable
Agriculture and Environment. In : . 1 janvier 1994. Vol. 9.
ISLAM, Saif ul, 2018. Microorganisms in the Rhizosphere and their Utilization in Agriculture: A
Mini-Review. In : PSM Microbiology. 15 octobre 2018. Vol. 3, n° 3, pp. 105‑110.
JEFFERY, S., GARDI, C., JONES, A., MONTANARELLA, L., MARMO, L., MIKO, L., RITZ, K.,
PERES, G., RÖMBKE, J. et VAN DER PUTTEN, W.H., 2010. Atlas Européen de la biodiversité des
sols. Bureau des publications de l’Union Européenne. Luxembourg : s.n.
JOHNS, Christopher, 2015. Under Our Feet: Soil Microorganisms as Primary Drivers of Essential
Ecological Processes. In : Future Directions International [en ligne]. 3 juillet 2015.
[Consulté le 29 juillet 2021]. Disponible à l’adresse :
https://www.futuredirections.org.au/publication/under-our-feet-soil-microorganisms-as-primary-
drivers-of-essential-ecological-processes/.
KATO, S., XU, Hui-lian, FUJITA, M., YAMADA, K. et UMEMURA, H., 1999. Effect of Organic
Fertilizations and EM Applications on Growth Pattern, Nutrient Uptake and Grain Yield of Sweet
Corn. In : . 1 janvier 1999.
KOBAYASHI, Michiharu et HAQUE, Mohammad Z., 1971. Contribution to nitrogen fixation and soil
fertility by photosynthetic bacteria. In : Plant and Soil. 1 décembre 1971. Vol. 35, n° 1, pp. 443‑456.
DOI 10.1007/BF02661870.
LAMONT, John R., WILKINS, Olivia, BYWATER-EKEGÄRD, Margaret et SMITH, Donald L.,
2017. From yogurt to yield: Potential applications of lactic acid bacteria in plant production. In : Soil
Biology and Biochemistry. 1 août 2017. Vol. 111, pp. 1‑9. DOI 10.1016/j.soilbio.2017.03.015.
55
LEACH, A. W. et MUMFORD, J. D., 2008. Pesticide Environmental Accounting: A method for
assessing the external costs of individual pesticide applications. In : Environmental Pollution. 1
janvier 2008. Vol. 151, n° 1, pp. 139‑147. DOI 10.1016/j.envpol.2007.02.019.
LEGIFRANCE, [sans date]. Arrêté du 18 avril 2011 autorisant la mise sur le marché du purin d’ortie
en tant que préparation naturelle peu préoccupante à usage phytopharmaceutique. S.l. : s.n.
LINDOW, Steven E. et BRANDL, Maria T., 2003. Microbiology of the Phyllosphere. In : Applied and
Environmental Microbiology. avril 2003. Vol. 69, n° 4, pp. 1875‑1883. DOI 10.1128/AEM.69.4.1875-
1883.2003.
LYNCH, J. M. et BRAGG, Elaine, 1985. Microorganisms and Soil Aggregate Stability. In : Advances
in Soil Science. 1985. pp. 133‑171. DOI 10.1007/978-1-4612-5088-3_3.
MARSCHNER, Horst, 2011. Marschner’s Mineral Nutrition of Higher Plants. S.l. : Academic Press.
ISBN 978-0-12-384906-9.
MEAGY, Md J., EATON, Touria E. et BARKER, Allen V., 2013. Nutrient Density in Lettuce
Cultivars Grown with Organic or Conventional Fertilization with Elevated Calcium Concentrations.
In : HortScience. 1 décembre 2013. Vol. 48, n° 12, pp. 1502‑1507.
DOI 10.21273/HORTSCI.48.12.1502.
MOU, Beiquan, 2009. Nutrient Content of Lettuce and its Improvement. In : Current Nutrition &
Food Science. 1 novembre 2009. Vol. 5, n° 4, pp. 242‑248. DOI 10.2174/157340109790218030.
MUKHERJEE, Arpan, VERMA, Jay Prakash, GAURAV, Anand Kumar, CHOUHAN, Gowardhan
Kumar, PATEL, Jai Singh et HESHAM, Abd El-Latif, 2020. Yeast a potential bio-agent: future for
plant growth and postharvest disease management for sustainable agriculture. In : Applied
Microbiology and Biotechnology. 1 février 2020. Vol. 104, n° 4, pp. 1497‑1510. DOI 10.1007/s00253-
019-10321-3.
OLLE, M. et WILLIAMS, I. H., 2013. Effective microorganisms and their influence on vegetable
production – a review. In : The Journal of Horticultural Science and Biotechnology. 1 janvier 2013.
Vol. 88, n° 4, pp. 380‑386. DOI 10.1080/14620316.2013.11512979.
PANDIYAN, Kuppusamy, KUSHWAHA, Prity, KASHYAP, Prem Lal, BAGUL, Samadhan Yuvraj,
KARTHIKEYAN, Nanjappan et SAXENA, Anil Kumar, 2021. 12 - Phyllosphere microbiome:
modern prospectus and application. In : SOLANKI, Manoj Kumar, KASHYAP, Prem Lal, ANSARI,
Rizwan Ali et KUMARI, Baby (éd.), Microbiomes and Plant Health [en ligne]. S.l. : Academic Press.
pp. 345‑366. [Consulté le 29 juillet 2021]. ISBN 978-0-12-819715-8. Disponible à l’adresse :
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780128197158000124.
PARNELL, J. Jacob, BERKA, Randy, YOUNG, Hugh A., STURINO, Joseph M., KANG, Yaowei,
BARNHART, D. M. et DILEO, Matthew V., 2016. From the Lab to the Farm: An Industrial
Perspective of Plant Beneficial Microorganisms. In : Frontiers in Plant Science. 2016. Vol. 7,
pp. 1110. DOI 10.3389/fpls.2016.01110.
PEIX, Alvaro, RAMÍREZ-BAHENA, Martha H., VELÁZQUEZ, Encarna et BEDMAR, Eulogio J.,
2015. Bacterial Associations with Legumes. In : Critical Reviews in Plant Sciences. 1 juin 2015.
Vol. 34, n° 1‑3, pp. 17‑42. DOI 10.1080/07352689.2014.897899.
PÉRÈS, Guénola, 2003. Identification et quantification in situ des interactions entre la diversité
lombricienne et la macro-bioporosité dans le contexte polyculture breton. Influence sur le
fonctionnement hydrique du sol [en ligne]. phdthesis. S.l. : Université Rennes 1.
[Consulté le 30 avril 2021]. Disponible à l’adresse : https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00007432.
RANI, Usha et KUMAR, Vivek, 2019. Microbial Bioformulations: Present and Future Aspects. In :
PRASAD, Ram, KUMAR, Vivek, KUMAR, Manoj et CHOUDHARY, Devendra (éd.),
Nanobiotechnology in Bioformulations [en ligne]. Cham : Springer International Publishing.
Nanotechnology in the Life Sciences. pp. 243‑258. [Consulté le 1 septembre 2021]. ISBN 978-3-030-
17060-8. Disponible à l’adresse : http://link.springer.com/10.1007/978-3-030-17061-5_10.
RITZ, Karl et YOUNG, Iain M., 2004. Interactions between soil structure and fungi. In : Mycologist.
mai 2004. Vol. 18, n° 2, pp. 52‑59. DOI 10.1017/S0269915X04002010.
SCHEUERELL, Steve et MAHAFFEE, Walter, 2002. Compost Tea: Principles and Prospects For
Plant Disease Control. In : Compost Science & Utilization. 1 septembre 2002. Vol. 10, n° 4,
pp. 313‑338. DOI 10.1080/1065657X.2002.10702095.
SHAKIR, Sara, ZAIDI, Syed Shan-e-Ali, DE VRIES, Franciska T. et MANSOOR, Shahid, 2021.
Plant Genetic Networks Shaping Phyllosphere Microbial Community. In : Trends in Genetics. 1 avril
2021. Vol. 37, n° 4, pp. 306‑316. DOI 10.1016/j.tig.2020.09.010.
57
SINGH, Jay Shankar, PANDEY, Vimal Chandra et SINGH, D. P., 2011. Efficient soil
microorganisms: A new dimension for sustainable agriculture and environmental development. In :
Agriculture, Ecosystems & Environment. 1 mars 2011. Vol. 140, n° 3, pp. 339‑353.
DOI 10.1016/j.agee.2011.01.017.
STARK, Christine, CONDRON, Leo M., STEWART, Alison, DI, Hong J. et O’CALLAGHAN,
Maureen, 2007. Effects of past and current crop management on soil microbial biomass and activity.
In : Biology and Fertility of Soils. 1 juin 2007. Vol. 43, n° 5, pp. 531‑540. DOI 10.1007/s00374-006-
0132-3.
TENCIO, Rolando, 2014. Uso de microorganismos beneficos en la agricultura organica en Costa Rica.
In : Ambientico. 1 mai 2014. n° 243, pp. 41‑49.
VORHOLT, Julia A., 2012. Microbial life in the phyllosphere. In : Nature Reviews Microbiology.
décembre 2012. Vol. 10, n° 12, pp. 828‑840. DOI 10.1038/nrmicro2910.
WANG, Yiming, PENG, Shuang, HUA, Qingqing, QIU, Chongwen, WU, Pan, LIU, Xiaoli et LIN,
Xiangui, 2021. The Long-Term Effects of Using Phosphate-Solubilizing Bacteria and Photosynthetic
Bacteria as Biofertilizers on Peanut Yield and Soil Bacteria Community. In : Frontiers in
Microbiology. 16 juillet 2021. Vol. 12, pp. 693535. DOI 10.3389/fmicb.2021.693535.
ANNEXE I : RESUME DU MEMOIRE EN ANGLAIS – REPORT SUMMARY
To meet the increasing demand for food due to the growing world population, it is necessary to improve
the environmental impact of agricultural production. One of the major challenges today is to achieve
sustainable and environmentally sound agricultural production while maintaining the volumes produced.
Current agricultural production methods, such as the inappropriate use of pesticides and chemical
fertilisers, create environmental and health problems (Gunnell et al. 2007; Leach, Mumford 2008).
Moreover, the beneficial interaction between plants and microorganisms has often been ignored in
breeding strategies. Today, some strains of microorganisms are used and recognised for pathogen
control and plant growth promotion, such as bacteria of the genus Azospirillum or Rhizobium (Berg
2009). These considerations are of primary importance as microbes perform crucial functions for plant
nutrition and protection against pathogens (Raaijmakers et al. 2009). Some farmers have long made use
of these microorganisms using fermented preparations (composts, lactic acid bacteria), and more
recently specialised commercial preparations, including Prof. Teruo Higa's "Effective Microorganisms"
(Higa, Parr 1994; Faessel 2014; Parnell et al. 2016). These Effective Microorganisms (EM) are the
subject of a large, but often biased and low-quality literature - so much so that the question of their
actual usefulness remains a controversial issue (Golec et al. 2013; Olle, Williams 2013). The EM
concept was then adapted first in Costa Rica through close collaboration between farmers and
researchers (Felix 2015; Tencio 2014). Heir to this adaptation, Fermented Forest Litter, hereafter
'LiFoFer', is a preparation based on forest litter, fermented under micro-aerobic conditions in the
presence of molasses, cereal bran, and whey (Felix 2015). LiFoFer has two main specificities: its local
origin and the great diversity of microbial strains used and supporting the natural balance of the targeted
agrosystems while increasing the technical and financial accessibility of its production. Preparations of
LiFoFer are being studied in France and in Western Africa (CIRAD) with the aim of characterising its
physicochemical and microbiological properties (P. Christen, IRD) and assessing its impact on market
garden crops (GABs). From this context emerged the need for a scientific evaluation of the effectiveness
of LiFoFer under temperate conditions, on vegetable production among others. In a participatory
research-action approach, Terre & Humanisme (T&H), FiBL France, CIRAD, IRD and organic farmers'
groups are collaborating to better understand its action and, if necessary, to optimise its effectiveness,
to give credibility to it, to capitalise on it and to disseminate new know-how in the service of
agroecological agriculture. Preliminary observations tend to corroborate the hypothesis of a beneficial
action of LiFoFer on the bioavailability of nutrients, the recycling of organic matter, and the resistance
of plants to pathogens.
Thus, these results and the consultation of the stakeholders in this participatory research project led to
the choice of the problematic of this thesis: Given its complexity and the limited knowledge acquired,
1
how can the various effects of LiFoFer be evaluated in an experimental approach that is as close
as possible to the conditions of organic market garden production?
To do this, two experiments were set up:
Experiment n°1 on lettuce is carried out in the field and is divided into 2 crop cycles, called cycle 1 and
cycle 2 respectively. These field trials make it possible to evaluate the effects of LiFoFer by considering
interactions with the environment, in particular the soil. As LiFoFer is intended for agricultural actors,
it is judicious to carry out this experimentation in conditions as close as possible to their own.
Experiment n°2 is carried out on a tomato crop in pots to guarantee a homogeneous crop support and to
focus on the effects of LiFoFer on the crop.
These two crops, lettuce, and tomato are chosen because they represent an important part of the market
in France and in Europe. Tomatoes are the most consumed vegetable in France. Lettuce, in addition to
being an everyday vegetable, has a relatively short growing cycle (2 to 4 months depending on the
season), which makes it a crop of choice for the experiments.
Methods
- LiFoFer production
LiFoFer is manufactured according to the protocol established by T&H which consists of a first
fermentation to obtain solid LiFoFer and a second fermentation to obtain a solution to be diluted before
use on crops.
There are two fermentation steps to make LiFoFer. The first fermentation consists in harvesting forest
litter geographically close to the plot to be treated (same soil and climatic conditions) and mixed into a
pile with wheat bran, goat's whey, a source of lactic acid bacteria, and organic sugarcane molasses, a
source of easily assimilated carbon. Once mixed, the water content is adjusted to 35-40%, and the pile
is transferred to a sealed container where it is tamped to remove as much air as possible. Fermentation
lasts for a total of 1 month, at a temperature of 25-30°C, during which time the canister is regularly
opened to vent the gas produced. The second fermentation consists in mixing the previously prepared
solid LiFoFer with organic sugarcane molasses and. The solution is poured into an airtight container, in
this case a stainless-steel tank, with a bung to allow the gas produced to escape without outside air
entering. Fermentation lasts one week at a temperature of between 25°C and 30°C with a final pH
between 3.5 and 4.
- Modalities
For both trials, the modalities are the same and they are described as follow. There are 5 modalities and
4 replicates per modality, i.e., 20 plots in all. Four blocks were delimited to avoid the variability of the
terrain as much as possible (see Figure 10). The 4 replicates per modality are randomly distributed. The
5 modalities tested are as follows:
- Modality T, Control: The lettuces of the control modality are treated with water only. If water is used
to treat the other modalities, the same amount is added here.
- Modality EF, Fermented Extract: To dissociate the potential effects of the fermented extract and
LiFoFer, and to compare LiFoFer to another growth stimulator, this modality is treated with fermented
nettle extract (Urtica dioica) alone, prepared at T&H as described in part 2.2.3.1.2.
- Modality EM_C, Commercially Effective Microorganism: In order to compare the efficacy of LiFoFer
to a commercial product, a commercially effective microorganism (EM_C) modality is set up. The Swiss
brand Synbiovie microorganism preparation presented is used because it is readily available and made
from sugarcane molasses, just like LiFoFer.
- LFF, LiFoFer modality: LiFoFer treatments are carried out with LiFoFer prepared at T&H according
to the method described in section 2.2.3.1.1 of this report.
- LFF+EF modality: The LiFoFer and Fermented Extract (LFF+EF) modality is a combination of the
two previous modalities. As FEs are commonly used in organic farming, it is desirable to see whether
they are compatible with the use of LiFoFer.
- Evaluated parameters
To assess the effect of LiFoFer, 3 main types of indicators are evaluated for each crop: plant health,
vegetative growth, and yield indicators. The parameters evaluated are chosen according to several
criteria: simplicity of execution, relevance of the measurement to the research objectives.
Plant health indicators include identification and count of pest and pathogens. Where pest or pathogen
symptoms are identified, an index of leaf area coverage or destruction is established according to the
severity of the symptoms. Brix content is also measured as it can evaluate part of the plant health.
Vegetative growth indicators consist in measuring regularly plant hight and size. Growth factor can be
calculated from those data, indicating if some plants are more developed than others.
Finally, yield indicator result from weighing the crops, possibly evaluating the dry matter content and
the percentage of loss at harvest.
Main results
- Experiment 1, cycle 1
Main results were obtained for vegetative growth and yield. Measurements for lettuce diameter after 8
weeks of crop show that the LFF+EF modality differs from the other modalities by having a smaller
average diameter than the other modalities (p-value < 0.05). This difference was maintained until
harvest. The LFF modality differs progressively from the other modalities. At harvest, the average
diameter was significantly smaller (p-value < 0.05) than the EF, EM_C and control modalities. The
measurements of the diameter at the neck also allow to evaluate the vegetative growth of the lettuce and
show significant differences during the last weeks of growth. From 03/06/21 onwards, the LiFoFer and
EF treated modality has a significantly lower collar diameter (p-value < 0.05) than the EF, EM_C and
LiFoFer only modalities (LFF). The differences are between 0.14mm and 0.25mm less diameter.
However, the Control (T) modality did not show any difference with any other modality. The
measurements of neck diameter and lettuce diameter show similarities. In both cases the LFF+EF
3
modality is less developed than the other modalities. Once again, the differences are visible at the end
of the crop (last 2 weeks) and are more marked on the overall diameter measurements of the lettuce
The measurements of fresh biomass and dry biomass (Bmsec) of the lettuces show similar trends to each
other. For fresh biomass, lettuces from the LFF+EF and LFF modalities weighed less than lettuces from
the EF and Control modalities. There was a difference of up to 63g between LFF+EF and EF. For Bmsec,
the differences are more pronounced. The biomass of LFF+EF is lower than all other lettuces, on average
between 1.4 g difference with LFF and 3.2 g difference with EF. The dry matter rates are around 5%
which is the expected value (Mou 2009). Although slightly higher for LFF (5.98%) and lower for the
control (4.87%), no significant difference was observed between the dry matter rates (%MS) of the
different modalities nor regarding the percentages of loss at harvest. The yields of the LiFoFer and
LFF+EF treated lettuces were globally lower.
- Experiment 1, cycle 2
As for cycle 1, main results are obtained for vegetative growth and yield indicators. There is no
difference in development between the lettuces and no trend in the first overall diameter measurement.
Three weeks later, there was still no significant difference (p-value > 0.05), but a trend emerged on the
average diameter and neck diameter measurements in favour of the larger EF variety. The LFF+EF
lettuces had the smallest diameters. At harvest, the non-parametric Kruskal-Wallis test revealed that EF
lettuces were 2.2 cm wider than LFF+EF lettuces (p-value < 0.05). For the neck diameter measurements,
the same results were observed, with a significant difference at harvest between LFF+EF and EF (p-
value < 0.05). The lettuces treated with EF and LiFoFer have a less good vegetative growth than the EF
modality but remain like the control modality.
- Experiment 2
For this experiment on tomato, main result is obtained of vegetative growth, as no differences were
found for yield and plant health. The height measurements are stopped on 12/07 because it is considered
that the vegetative growth is finished. Thus, the measurements used were taken between 10/05 (day of
the first treatment and the first measurements) and 12/07.
Overall, the differences in height between the modalities are small (see Figure 28). However, the growth
factor (Figure 29) calculated between the measurement at T0 (10/05) and the last height measurement
(12/07) is higher for the plants treated with LFF (2.7), followed by the Control (2.5), EF (2.4) and
LFF+EF (2.13) modalities and finally the EM_C modality (2.0). Monitoring the height taken between
each measurement (Figure 30) allows a more detailed analysis. Between the 3rd (T0) and 5th week of
growth (T+2), the LiFoFer-treated tomatoes grew significantly faster than the EM_C and LFF+EF
modalities, with an average gain of 5.1cm respectively. They are followed by tomato plants treated with
water (Control: + 4.6cm) and those treated with fermented nettle extract (+ 4.2cm). The modalities
treated with LFF+EF and EM_C have a slower growth (3.7 and 3.6 cm). Between 01/06 (T+4) and 15/06
(T+6) the LFF modality grew as much as the control modality (+10.1 and +9.8) and the tomato plants
treated with EM_C grew less quickly (+8.9 cm). During the other weeks of the measurement, there were
no significant differences between the different modalities. Similarly, there was no difference in height
gained between the first week of measurement and the 12th week of measurement, nor was there a trend
that emerged. The gains in total number of cm gained in height, from transplanting to the last harvest,
did not show any significant difference (p-value > 0.05) between the different modalities. Nevertheless,
a faster growth during the first weeks of growth was observed for the tomatoes treated with LiFoFer.
Neck diameter measurements were similar for the different modalities. The counts of suckers and the
number of clusters per plant did not differ either. On average, there were 3 suckers per vine and 1 cluster
per suckler. The average number of fruits per cluster and number of fruits per vine were also equivalent
for each modality.
Discussion
5
in height than the other modalities. On the same date, an aphid survey was carried out and revealed that
the modalities with the most attacked plants were also the EM_C and LFF+EF modalities.
Faced with the need to develop practical knowledge and scientific references on the use of products
based on microorganisms and their functioning, the Terre et Humanisme association is forming a large
network of actors from the technical and scientific agricultural world to work in response to this
problem. In this context, this internship was particularly interested in the effects of fermented forest
litter (LiFoFer), which has been empirically tested for several years in France and West Africa. The
experiments carried out on Lactuca sativa (lettuce) and Solanum lycopersicum (tomato) did not clearly
show any effect of LiFoFer on these crops. For lettuce, none of the treatments resulted in a significant
improvement of the crop compared to the water-treated controls, either in terms of plant health,
vegetative growth, or yield. On the contrary, the LiFoFer modality combined with fermented nettle
extracts on lettuce even seems to negatively influence the vegetative growth and yield indicators for this
crop. However, for the tomato crop, vegetative growth seems to have been enhanced by the application
of LiFoFer during the "young" stages of the plant (5th week of growth).
In addition to the experimental biases observed in the lettuce experiment, the method of assessing the
effects of LiFoFer can be improved. Indeed, before LiFoFer can be compared to other similar products
and before exploring several possible applications of this product, it seems to be a priority to focus on
validating the effect of increasing crop yield. This is an important concern, which for LiFoFer requires
more precise recommendations for use.
In view of the complexity and the limited knowledge available for this LiFoFer technology, it is
important to continue to collaborate with the project's partner research and experimental organisations.
The development of such a product is very relevant for an agriculture in agro-ecological transition, not
only in France but worldwide. The results obtained are encouraging, not only through the LiFoFer
project, but also for the micro-organism-based preparations developed throughout the world. Moreover,
organic, conventional, large, and small-scale farmers can all benefit: the effects of bioproducts are
effective on the long term, there are no side effects on human health or the environment, and production
is inexpensive. In view of the findings of the latest IPCC (Intergovernmental Panel on Climate Change)
report, it is urgent to develop resilient solutions for agriculture, one of the first victims of climate change.
The development of LiFoFer should therefore be pursued because it meets many of today's social,
economic, and environmental challenges.
ANNEXE II : ANALYSES LABORATOIRE DE LA METHODE BRDA-HERODY
Mesures Surface Profondeur Valeurs de
0-30cm 30-60cm référence
Pierrosité 2,7 2,4
Coefficient de Fixation du sol (CF) 0,5 0,9 0,3 - 0,6
% Particules fines (argiles à feuillet et 14 17
limons fins)
% Limons grossiers 0 0
% Sables 69 41
Carbonatation 3 3 0-3
% Calcaire actif 22
Alcalino-Terreux (AT) = Ca + Mg 7,95 8,05
% Magnésium présent dans les AT 1 10 à 15%
Ca/Mg 107,5 Optimum
entre 8 et 12
K/Mg 1,3 Optimum
entre 1 et 3
Fer de Liaison (Fer L) 44 52 70
% MO totale (dosage classique) 2,87
Humus stable 2,79 2,95
% MOF dans l'humus total (matière 7% TRACE 20-25%
organique facilement attaquable par les
microorganismes)
3 F (matière organique d'accumulation très 1,6 0,4 - 0,6
stable avec une activité biologique intense)
P 2 1% - 1,5%
K 3
Mg 2
Aluminium 0,2 0,2
Manganèse 1 1,7 1,3
Manganèse 2 1,7 1,3
7
ANNEXE III : LISTE DES PARAMETRES EVALUES
Indicateur Mesure Unité de mesure Récurrence N°Expérimentation
Santé des plantes
B° Taux de Brix, indice de (°B) Fin pépinière Toutes
sucre soluble dans l'eau et récolte
Teneur en nutriments de la Sucres totaux : % Récolte Expé n°1, cycle 2
sève (Sucres, pH, K, Ca, Autres : ppm
K/Ca, Mg, Na, NH4, NO3,
N dans nitrate, N total, Cl,
S, P, Si, Fe, Mn, Zn, B,
Cu, Mo, Al)
Ravageurs et pathogènes
Comptage des ravageurs Nombre 1/semaine si Toutes
d'individu/plant présence
Indice de recouvrement/ Indice (%) 1/semaine si Toutes
destruction foliaire présence
Indicateurs de la croissance végétative
Hauteur de plant* cm 1/semaine Expé n°1, cycle 1
Expé n°2
Nombre gourmand/pied nombre/plant Ponctuel Expé n°2
Nombre grappe/gourmand nombre/plant Ponctuel Expé n°2
Nombre de fleurs avortées nombre/plant Ponctuel Expé n°2
(fructification)
Nombre de fruits/grappe nombre/plant Récolte Expé n°2
Biomasse racinaire g Récolte Expé n°1, cycle 1
Expé n°2
Diamètre des plantes au cm 1/semaine Toutes
collet*
Longueur de racine mm Récolte Expé n°1, cycle 1
Facteur de croissance Fin croissance Expé n°2
végétative
Indicateurs du rendement
Biomasse aérienne fraîche g Récolte Toutes
totale
Biomasse aérienne fraîche g Récolte Expé n°1, cycle 1 et
après tri 2
Biomasse aérienne sèche g Récolte Expé n°1, cycle 1
après tri
Taux de matière sèche % de matière Récolte Expé n°1, cycle 1
fraîche
Indicateur de l’évolution des caractéristiques du sol
Plantes bio-indicatrices Expé n°1, cycle 1
ANNEXE IV : RESULTATS DES ANALYSES NOVACROP LAITUES CYCLE 2
Résultats des analyses NOVACROP : Laitues cycle 2, modalité Témoin
9
RESULTATS DES ANALYSES NOVACROP : Laitue cycle 2, modalité LFF
RESULTATS DES ANALYSES NOVACROP : Laitues cycle 2, modalité EF
11
RESULTATS DES ANALYSES NOVACROP : Laitues cycle 2, modalité EM_C
Résultats des analyses NOVACROP : Laitues cycle 2, modalité LFF+EF
13
15
Diplôme : Master 2
Master 2
Spécialité : Ingénieur Agronome
Spécialisation / option : Agroecology
Enseignant référent : Anne Jaffrezic
Auteur(s) : Clémentine DENIS Organisme d'accueil : Terre & Humanisme
TAdresse : 471 Mas de Beaulieu
Date de naissance* : 18/11/1996 07260 Lablachère
Nb pages : 26 Annexe(s) : 4 (13 pages)
Année de soutenance : 2021 Maître de stage : Pascal Dantinne
Titre français :Effets de la Litière Forestière Fermentée sur la croissance végétative, la santé et le
rendement de Lactuca sativa (laitue) et Solanum lycopersicum (tomate) en conditions expérimentales
Titre anglais : Effects of Fermented Forest Litter on vegetative growth, health and yield of Lactuca
sativa (lettuce) and Solanum lycopersicum (tomato) under experimental conditions
Résumé (1600 caractères maximum) : La mise en œuvre de techniques agroécologiques résilientes est
essentielle pour faire face aux enjeux agricoles environnementaux et socio-économiques actuels. Parmi
ces techniques, l'utilisation de microorganismes se développe sous forme de préparations commerciales
et artisanales. C’est le cas de la Litière Forestière Fermentée (LiFoFer) visant à stimuler la croissance,
le rendement et la santé des plantes. Néanmoins, la littérature scientifique est encore éparse à son sujet.
L’objectif de cette étude est de confirmer les effets précédemment cités de cette préparation sur deux
cultures maraîchères : Lactuca sativa et Solanum lycopersicum. Un essai en micro-parcelles sur 2 cycles
de culture de laitues compare l’effet de la LiFoFer à celui d’une préparation commerciale et à un extrait
fermenté d’ortie (EF), ainsi que la combinaison d’EF et de LiFoFer. La même expérience est répétée sur
une culture de tomate en pots. Les résultats sur les laitues montrent que la combinaison des EF et de
la LiFoFer ralentit la croissance végétative et diminue le rendement en biomasse fraîche jusqu’à 46%
(p-value < 0,05). Sur la culture de tomates, la croissance végétative est plus importante pour la LiFoFer
à la 5ème semaine de culture (+5,05cm) que pour les modalités utilisant la préparation commerciale
(+3,61cm) et la combinaison EF et LiFoFer (+3,66cm). Les effets agronomiques de la LiFoFer
concernant le rendement et la santé des plantes n’ont pas pu être confirmé dans cette étude. Les effets
sur la stimulation de la croissance sont à confirmer par une prochaine étude consacrée à cet effet.
Abstract (1600 caractères maximum) : The implementation of resilient agro-ecological techniques is
essential to face the current agricultural environmental, economic, and social challenges. Among these
techniques, the use of micro-organisms is developing in the form of commercial preparations but also in
the form of artisanal preparations. This is the case of Fermented Forest Litter (LiFoFer) which aims to
stimulate growth, yield, and health of plants. Nevertheless, the scientific literature on this subject is still
sparse. The objective of this study is to confirm the above-mentioned effects of this preparation on two
vegetable crops: Lactuca sativa and Solanum lycopersicum. A microplot trial on 2 cycles of lettuce crops
compares the effect of LiFoFer to that of a commercial preparation based on microorganisms and a
fermented nettle extract (EF), as well as the combination of EF and LiFoFer. The same experiment was
repeated on a tomato crop in pots. The results on lettuce show that the combination of EF and LiFoFer
slows down vegetative growth and decreases the fresh biomass yield by up to 46% (p-value < 0.05). In
the tomato crop, vegetative growth was greater for LiFoFer at the 5th week of cultivation (+5.05cm) than
for the modalities using the commercial preparation (+3.61cm) and the EF and LiFoFer combination
(+3.66cm). The agronomic effects of LiFoFer on yield and plant health could not be confirmed in this
study. The effects on growth promotion need to be confirmed in a further dedicated study.
Mots-clés : Litière Forestière Fermentée, EM, microorganismes efficaces, bioinoculant, purin d’ortie
Key Words: Fermented forest litter, EM, effective microorganisms, bioinoculant, nettle slurry
* Elément qui permet d’enregistrer les notices auteurs dans le catalogue des bibliothèques universitaires