Cours de Python

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Chapitre 1

Introduction

1.1 C’est quoi Python ?


Le langage de programmation Python a été créé en 1989 par Guido van Rossum, aux Pays-Bas. Le nom Python vient d’un
hommage à la série télévisée Monty Python’s Flying Circus dont G. van Rossum est fan. La première version publique de ce
langage a été publiée en 1991.
La dernière version de Python est la version 3. Plus précisément, la version 3.7 a été publiée en juin 2018. La version 2
de Python est désormais obsolète et cessera d’être maintenue après le 1er janvier 2020. Dans la mesure du possible évitez de
l’utiliser.
La Python Software Foundation 1 est l’association qui organise le développement de Python et anime la communauté de
développeurs et d’utilisateurs.
Ce langage de programmation présente de nombreuses caractéristiques intéressantes :
— Il est multiplateforme. C’est-à-dire qu’il fonctionne sur de nombreux systèmes d’exploitation : Windows, Mac OS X,
Linux, Android, iOS, depuis les mini-ordinateurs Raspberry Pi jusqu’aux supercalculateurs.
— Il est gratuit. Vous pouvez l’installer sur autant d’ordinateurs que vous voulez (même sur votre téléphone !).
— C’est un langage de haut niveau. Il demande relativement peu de connaissance sur le fonctionnement d’un ordinateur
pour être utilisé.
— C’est un langage interprété. Un script Python n’a pas besoin d’être compilé pour être exécuté, contrairement à des
langages comme le C ou le C++.
— Il est orienté objet. C’est-à-dire qu’il est possible de concevoir en Python des entités qui miment celles du monde réel
(une cellule, une protéine, un atome, etc.) avec un certain nombre de règles de fonctionnement et d’interactions.
— Il est relativement simple à prendre en main 2 .
— Enfin, il est très utilisé en bioinformatique et plus généralement en analyse de données.
Toutes ces caractéristiques font que Python est désormais enseigné dans de nombreuses formations, depuis l’enseignement
secondaire jusqu’à l’enseignement supérieur.

1.2 Conseils pour installer et configurer Python


Pour apprendre la programmation Python, il va falloir que vous pratiquiez et pour cela il est préférable que Python soit
installé sur votre ordinateur. La bonne nouvelle est que vous pouvez installer gratuitement Python sur votre machine, que
ce soit sous Windows, Mac OS X ou Linux. Nous donnons dans cette rubrique un résumé des points importants concer-
nant cette installation. Tous les détails et la marche à suivre pas à pas sont donnés à l’adresse https://python.sdv.
univ-paris-diderot.fr/livre-dunod.

1.2.1 Python 2 ou Python 3 ?


Ce cours est basé sur la version 3 de Python, qui est désormais le standard.

1. https://www.python.org/psf/
2. Nous sommes d’accord, cette notion est très relative.

8
1.3. Notations utilisées Chapitre 1. Introduction

Si, néanmoins, vous deviez un jour travailler sur un ancien programme écrit en Python 2, sachez qu’il existe quelques
différences importantes entre Python 2 et Python 3. Le chapitre 21 Remarques complémentaires vous apportera plus de préci-
sions.

1.2.2 Miniconda
Nous vous conseillons d’installer Miniconda 3 , logiciel gratuit, disponible pour Windows, Mac OS X et Linux, et qui
installera pour vous Python 3.
Avec le gestionnaire de paquets conda, fourni avec Miniconda, vous pourrez installer des modules supplémentaires qui
sont très utiles en bioinformatique (NumPy, scipy, matplotlib, pandas, Biopython), mais également les notebooks Jupyter.
Vous trouverez en ligne 4 une documentation pas à pas pour installer Miniconda, Python 3 et les modules supplémentaires qui
seront utilisés dans ce cours.

1.2.3 Éditeur de texte


L’apprentissage d’un langage informatique comme Python va nécessiter d’écrire des lignes de codes à l’aide d’un éditeur
de texte. Si vous êtes débutants, on vous conseille d’utiliser notepad++ sous Windows, BBEdit ou CotEditor sous Mac OS X
et gedit sous Linux. La configuration de ces éditeurs de texte est détaillée dans la rubrique Installation de Python disponible
en ligne 5 . Bien sur, si vous préférez d’autres éditeurs comme Atom, Visual Studio Code, Sublime Text, emacs, vim, geany. . .
utilisez-les !
À toute fin utile, on rappelle que les logiciels Microsoft Word, WordPad et LibreOffice Writer ne sont pas des éditeurs de
texte, ce sont des traitements de texte qui ne peuvent pas et ne doivent pas être utilisés pour écrire du code informatique.

1.3 Notations utilisées


Dans cet ouvrage, les commandes, les instructions Python, les résultats et les contenus de fichiers sont indiqués avec cette
police pour les éléments ponctuels ou
1 sous cette forme ,
2 sur plusieurs lignes ,
3 pour les é l é ments les plus longs .

Pour ces derniers, le numéro à gauche indique le numéro de la ligne et sera utilisé pour faire référence à une instruction
particulière. Ce numéro n’est bien sûr là qu’à titre indicatif.
Par ailleurs, dans le cas de programmes, de contenus de fichiers ou de résultats trop longs pour être inclus dans leur
intégralité, la notation [...] indique une coupure arbitraire de plusieurs caractères ou lignes.

1.4 Introduction au shell


Un shell est un interpréteur de commandes interactif permettant d’interagir avec l’ordinateur. On utilisera le shell pour
lancer l’interpréteur Python.
Pour approfondir la notion de shell, vous pouvez consulter les pages Wikipedia :
— du shell Unix 6 fonctionnant sous Mac OS X et Linux ;
— du shell PowerShell 7 fonctionnant sous Windows.
Un shell possède toujours une invite de commande, c’est-à-dire un message qui s’affiche avant l’endroit où on entre des
commandes. Dans tout cet ouvrage, cette invite est représentée systématiquement par le symbole dollar $, et ce quel que soit
le système d’exploitation.
Par exemple, si on vous demande de lancer l’instruction suivante :
$ python
il faudra taper seulement python sans le $ ni l’espace après le $.
3. https://conda.io/miniconda.html
4. https://python.sdv.univ-paris-diderot.fr/livre-dunod
5. https://python.sdv.univ-paris-diderot.fr/livre-dunod
6. https://fr.wikipedia.org/wiki/Shell_Unix
7. https://fr.wikipedia.org/wiki/Windows_PowerShell

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 9


Chapitre 1. Introduction 1.5. Premier contact avec Python

1.5 Premier contact avec Python


Python est un langage interprété, c’est-à-dire que chaque ligne de code est lue puis interprétée afin d’être exécutée par
l’ordinateur. Pour vous en rendre compte, ouvrez un shell puis lancez la commande :
python
La commande précédente va lancer l’interpréteur Python. Vous devriez obtenir quelque chose de ce style pour Windows :
1 PS C :\ Users \ pierre > python
2 Python 3.7.1 ( default , Dec 10 2018 , 22:54:23) [ MSC v .1915 64 bit ( AMD64 )] [...]
3 Type " help " , " copyright " , " credits " or " license " for more information .
4 >>>

pour Mac OS X :
1 iMac - de - pierre : Downloads$ python
2 Python 3.7.1 ( default , Dec 14 2018 , 19:28:38)
3 [ Clang 4.0.1 ( tags / RELEASE_401 / final )] :: Anaconda , Inc . on darwin
4 Type " help " , " copyright " , " credits " or " license " for more information .
5 >>>

ou pour Linux :
1 pierre@jeera :~ $ python
2 Python 3.7.1 ( default , Dec 14 2018 , 19:28:38)
3 [ GCC 7.3.0] :: Anaconda , Inc . on linux
4 Type " help " , " copyright " , " credits " or " license " for more information .
5 >>>

Les blocs
— PS C:\Users\pierre> pour Windows,
— iMac-de-pierre:Downloads$ pour Mac OS X,
— pierre@jeera:~$ pour Linux.
représentent l’invite de commande de votre shell. Par la suite, cette invite de commande sera représentée simplement par
le caractère $, que vous soyez sous Windows, Mac OS X ou Linux.
Le triple chevron >>> est l’invite de commande (prompt en anglais) de l’interpréteur Python. Ici, Python attend une
commande que vous devez saisir au clavier. Tapez par exemple l’instruction :
print("Hello world!")
puis validez cette commande en appuyant sur la touche Entrée.
Python a exécuté la commande directement et a affiché le texte Hello world!. Il attend ensuite votre prochaine instruc-
tion en affichant l’invite de l’interpréteur Python (>>>). En résumé, voici ce qui a dû apparaître sur votre écran :
1 >>> print (" Hello world !")
2 Hello world !
3 >>>

Vous pouvez refaire un nouvel essai en vous servant cette fois de l’interpréteur comme d’une calculatrice :
1 >>> 1+1
2 2
3 >>> 6*3
4 18

À ce stade, vous pouvez entrer une autre commande ou bien quitter l’interpréteur Python, soit en tapant la commande
exit() puis en validant en appuyant sur la touche Entrée, soit en pressant simultanément les touches Ctrl et D sous Linux et
Mac OS X ou Ctrl et Z puis Entrée sous Windows.
L’interpréteur Python est donc un système interactif dans lequel vous pouvez entrer des commandes, que Python exécutera
sous vos yeux (au moment où vous validerez la commande en appuyant sur la touche Entrée).
Il existe de nombreux autres langages interprétés comme Perl 8 ou R 9 . Le gros avantage de ce type de langage est qu’on
peut immédiatement tester une commande à l’aide de l’interpréteur, ce qui est très utile pour débugger (c’est-à-dire trouver et
corriger les éventuelles erreurs d’un programme). Gardez bien en mémoire cette propriété de Python qui pourra parfois vous
faire gagner un temps précieux !

8. http://www.perl.org
9. http://www.r-project.org

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1.6. Premier programme Chapitre 1. Introduction

1.6 Premier programme


Bien sûr, l’interpréteur présente vite des limites dès lors que l’on veut exécuter une suite d’instructions plus complexe.
Comme tout langage informatique, on peut enregistrer ces instructions dans un fichier, que l’on appelle communément un
script (ou programme) Python.
Pour reprendre l’exemple précédent, ouvrez un éditeur de texte (pour choisir et configurer un éditeur de texte, reportez-
vous si nécessaire à la rubrique Installation de Python en ligne 10 ) et entrez le code suivant :
print("Hello world!")
Ensuite, enregistrez votre fichier sous le nom test.py, puis quittez l’éditeur de texte.

Remarque
L’extension de fichier standard des scripts Python est .py.

Pour exécuter votre script, ouvrez un shell et entrez la commande :


python test.py
Vous devriez obtenir un résultat similaire à ceci :
1 $ python test . py
2 Hello world !

Si c’est bien le cas, bravo ! Vous avez exécuté votre premier programme Python.

1.7 Commentaires
Dans un script, tout ce qui suit le caractère # est ignoré par Python jusqu’à la fin de la ligne et est considéré comme un
commentaire.
Les commentaires doivent expliquer votre code dans un langage humain. L’utilisation des commentaires est rediscutée
dans le chapitre 15 Bonnes pratiques en programmation Python.
Voici un exemple :
1 # Votre premier commentaire en Python .
2 print ( ' Hello world ! ')
3
4 # D ' autres commandes plus utiles pourraient suivre .

Remarque
On appelle souvent à tort le caractère # « dièse ». On devrait plutôt parler de « croisillon 11 ».

1.8 Notion de bloc d’instructions et d’indentation


En programmation, il est courant de répéter un certain nombre de choses (avec les boucles, voir le chapitre 5 Boucles et
comparaisons) ou d’exécuter plusieurs instructions si une condition est vraie (avec les tests, voir le chapitre 6 Tests).
Par exemple, imaginons que nous souhaitions afficher chacune des bases d’une séquence d’ADN, les compter puis afficher
le nombre total de bases à la fin. Nous pourrions utiliser l’algorithme présenté en pseudo-code dans la figure 1.1.
Pour chaque base de la séquence ATCCGACTG, nous souhaitons effectuer deux actions : d’abord afficher la base puis
compter une base de plus. Pour indiquer cela, on décalera vers la droite ces deux instructions par rapport à la ligne précédente
(pour chaque base [...]). Ce décalage est appelé indentation, et l’ensemble des lignes indentées constitue un bloc
d’instructions.
Une fois qu’on aura réalisé ces deux actions sur chaque base, on pourra passer à la suite, c’est-à-dire afficher la taille de
la séquence. Pour bien préciser que cet affichage se fait à la fin, donc une fois l’affichage puis le comptage de chaque base
terminés, la ligne correspondante n’est pas indentée (c’est-à-dire qu’elle n’est pas décalée vers la droite).
10. https://python.sdv.univ-paris-diderot.fr/livre-dunod
11. https://fr.wikipedia.org/wiki/Croisillon_(signe)

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Chapitre 1. Introduction 1.9. Autres ressources

F IGURE 1.1 – Notion d’indentation et de bloc d’instructions.

Pratiquement, l’indentation en Python doit être homogène (soit des espaces, soit des tabulations, mais pas un mélange
des deux). Une indentation avec 4 espaces est le style d’indentation recommandé (voir le chapitre 15 Bonnes pratiques en
programmation Python).
Si tout cela semble un peu complexe, ne vous inquiétez pas. Vous allez comprendre tous ces détails chapitre après chapitre.

1.9 Autres ressources


Pour compléter votre apprentissage de Python, n’hésitez pas à consulter d’autres ressources complémentaires à cet ou-
vrage. D’autres auteurs abordent l’apprentissage de Python d’une autre manière. Nous vous conseillons les ressources sui-
vantes en langue française :
— Le livre Apprendre à programmer avec Python 3 de Gérard Swinnen. Cet ouvrage est téléchargeable gratuitement sur
le site de Gérard Swinnen 12 . Les éditions Eyrolles proposent également la version papier de cet ouvrage.
— Le livre Apprendre à programmer en Python avec PyZo et Jupyter Notebook de Bob Cordeau et Laurent Pointal, publié
aux éditions Dunod. Une partie de cet ouvrage est téléchargeable gratuitement sur le site de Laurent Pointal 13 .
— Le livre Apprenez à programmer en Python de Vincent Legoff 14 que vous trouverez sur le site Openclassroms.
Et pour terminer, une ressource incontournable en langue anglaise :
— Le site www.python.org 15 . Il contient énormément d’informations et de liens sur Python. La page d’index des mo-
dules 16 est particulièrement utile (et traduite en français).

12. http://www.inforef.be/swi/python.htm
13. https://perso.limsi.fr/pointal/python:courspython3
14. https://openclassrooms.com/fr/courses/235344-apprenez-a-programmer-en-python
15. http://www.python.org
16. https://docs.python.org/fr/3/py-modindex.html

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Chapitre 2

Variables

2.1 Définition
Une variable est une zone de la mémoire de l’ordinateur dans laquelle une valeur est stockée. Aux yeux du programmeur,
cette variable est définie par un nom, alors que pour l’ordinateur, il s’agit en fait d’une adresse, c’est-à-dire d’une zone
particulière de la mémoire.
En Python, la déclaration d’une variable et son initialisation (c’est-à-dire la première valeur que l’on va stocker dedans)
se font en même temps. Pour vous en convaincre, testez les instructions suivantes après avoir lancé l’interpréteur :
1 >>> x = 2
2 >>> x
3 2

Ligne 1. Dans cet exemple, nous avons déclaré, puis initialisé la variable x avec la valeur 2. Notez bien qu’en réalité, il
s’est passé plusieurs choses :
— Python a « deviné » que la variable était un entier. On dit que Python est un langage au typage dynamique.
— Python a alloué (réservé) l’espace en mémoire pour y accueillir un entier. Chaque type de variable prend plus ou moins
d’espace en mémoire. Python a aussi fait en sorte qu’on puisse retrouver la variable sous le nom x.
— Enfin, Python a assigné la valeur 2 à la variable x.
Dans d’autres langages (en C par exemple), il faut coder ces différentes étapes une par une. Python étant un langage dit de
haut niveau, la simple instruction x = 2 a suffi à réaliser les 3 étapes en une fois !
Lignes 2 et 3. L’interpréteur nous a permis de connaître le contenu de la variable juste en tapant son nom. Retenez ceci
car c’est une spécificité de l’interpréteur Python, très pratique pour chasser (debugger) les erreurs dans un programme. Par
contre, la ligne d’un script Python qui contient seulement le nom d’une variable (sans aucune autre indication) n’affichera pas
la valeur de la variable à l’écran lors de l’exécution (pour autant, cette instruction reste valide et ne générera pas d’erreur).
Sachez par ailleurs que l’opérateur d’affectation = s’utilise dans un certain sens. Par exemple, l’instruction x = 2 signifie
qu’on attribue la valeur située à droite de l’opérateur = (ici, 2) à la variable située à gauche (ici, x). D’autres langages de
programmation comme R utilisent les symboles <- pour rendre l’affectation d’une variable plus explicite, par exemple x <-
2.
Enfin, dans l’instruction x = y - 3, l’opération y - 3 est d’abord évaluée et ensuite le résultat de cette opération est
affecté à la variable x.

2.2 Les types de variables


Le type d’une variable correspond à la nature de celle-ci. Les trois principaux types dont nous aurons besoin dans un
premier temps sont les entiers (integer ou int), les nombres décimaux que nous appellerons floats et les chaînes de caractères
(string ou str). Bien sûr, il existe de nombreux autres types (par exemple, les booléens, les nombres complexes, etc.). Si vous
n’êtes pas effrayés, vous pouvez vous en rendre compte ici 1 .
Dans l’exemple précédent, nous avons stocké un nombre entier (int) dans la variable x, mais il est tout à fait possible de
stocker des floats, des chaînes de caractères (string ou str) ou de nombreux autres types de variable que nous verrons par la
suite :
1. https://docs.python.org/fr/3.7/library/stdtypes.html

13
Chapitre 2. Variables 2.3. Nommage

1 >>> y = 3.14
2 >>> y
3 3.14
4 >>> a = " bonjour "
5 >>> a
6 ' bonjour '
7 >>> b = ' salut '
8 >>> b
9 ' salut '
10 >>> c = """ girafe """
11 >>> c
12 ' girafe '
13 >>> d = ''' lion ' ' '
14 >>> d
15 ' lion '

Remarque
Python reconnaît certains types de variable automatiquement (entier, float). Par contre, pour une chaîne de caractères, il
faut l’entourer de guillemets (doubles, simples, voire trois guillemets successifs doubles ou simples) afin d’indiquer à Python
le début et la fin de la chaîne de caractères.
Dans l’interpréteur, l’affichage direct du contenu d’une chaîne de caractères se fait avec des guillemets simples, quel que
soit le type de guillemets utilisé pour définir la chaîne de caractères.
En Python, comme dans la plupart des langages de programmation, c’est le point qui est utilisé comme séparateur décimal.
Ainsi, 3.14 est un nombre reconnu comme un float en Python alors que ce n’est pas le cas de 3,14.

2.3 Nommage
Le nom des variables en Python peut être constitué de lettres minuscules (a à z), de lettres majuscules (A à Z), de nombres
(0 à 9) ou du caractère souligné (_). Vous ne pouvez pas utiliser d’espace dans un nom de variable.
Par ailleurs, un nom de variable ne doit pas débuter par un chiffre et il n’est pas recommandé de le faire débuter par le
caractère _ (sauf cas très particuliers).
De plus, il faut absolument éviter d’utiliser un mot « réservé » par Python comme nom de variable (par exemple : print,
range, for, from, etc.).
Enfin, Python est sensible à la casse, ce qui signifie que les variables TesT, test ou TEST sont différentes.

2.4 Écriture scientifique


On peut écrire des nombres très grands ou très petits avec des puissances de 10 en utilisant le symbole e :
1 >>> 1 e6
2 1000000.0
3 >>> 3.12 e -3
4 0.00312

On appelle cela écriture ou notation scientifique. On pourra noter deux choses importantes :
— 1e6 ou 3.12e-3 n’implique pas l’utilisation du nombre exponentiel e mais signifie 1 × 106 ou 3.12 × 10−3 respecti-
vement ;
— Même si on ne met que des entiers à gauche et à droite du symbole e (comme dans 1e6), Python génère systématique-
ment un float.
Enfin, vous avez sans doute constaté qu’il est parfois pénible d’écrire des nombres composés de beaucoup de chiffres, par
exemple le nombre d’Avogradro 6.02214076 × 1023 ou le nombre d’humains sur Terre (au 26 août 2020) 7807568245. Pour
s’y retrouver, Python autorise l’utilisation du caractère « souligné » (ou underscore) _ pour séparer des groupes de chiffres.
Par exemple :
1 >>> av og a dr o_ nu m be r = 6.022 _140_76e23
2 >>> print ( a vo ga dr o_ n um be r )
3 6.02214076 e +23
4 >>> hu ma n s_ on _e a rt h = 7 _807_568_245
5 >>> print ( h um an s_ on _ ea rt h )
6 7807568245

Dans ces exemples, le caractère _ est utilisé pour séparer des groupes de 3 chiffres mais on peut faire ce qu’on veut :

14 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


2.5. Opérations Chapitre 2. Variables

1 >>> print (7 _80_7568_24_5 )


2 7807568245

2.5 Opérations
2.5.1 Opérations sur les types numériques
Les quatre opérations arithmétiques de base se font de manière simple sur les types numériques (nombres entiers et floats) :
1 >>> x = 45
2 >>> x + 2
3 47
4 >>> x - 2
5 43
6 >>> x * 3
7 135
8 >>> y = 2.5
9 >>> x - y
10 42.5
11 >>> ( x * 10) + y
12 452.5

Remarquez toutefois que si vous mélangez les types entiers et floats, le résultat est renvoyé comme un float (car ce type
est plus général). Par ailleurs, l’utilisation de parenthèses permet de gérer les priorités.
L’opérateur / effectue une division. Contrairement aux opérateurs +, - et *, celui-ci renvoie systématiquement un float :
1 >>> 3 / 4
2 0.75
3 >>> 2.5 / 2
4 1.25

L’opérateur puissance utilise les symboles ** :


1 >>> 2**3
2 8
3 >>> 2**4
4 16

Pour obtenir le quotient et le reste d’une division entière (voir ici 2 pour un petit rappel sur la division entière), on utilise
respectivement les symboles // et modulo % :
1 >>> 5 // 4
2 1
3 >>> 5 % 4
4 1
5 >>> 8 // 4
6 2
7 >>> 8 % 4
8 0

Les symboles +, -, *, /, **, // et % sont appelés opérateurs, car ils réalisent des opérations sur les variables.
Enfin, il existe des opérateurs « combinés » qui effectue une opération et une affectation en une seule étape :
1 >>> i = 0
2 >>> i = i + 1
3 >>> i
4 1
5 >>> i += 1
6 >>> i
7 2
8 >>> i += 2
9 >>> i
10 4

L’opérateur += effectue une addition puis affecte le résultat à la même variable. Cette opération s’appelle une « incrémen-
tation ».
Les opérateurs -=, *= et /= se comportent de manière similaire pour la soustraction, la multiplication et la division.

2.5.2 Opérations sur les chaînes de caractères


Pour les chaînes de caractères, deux opérations sont possibles, l’addition et la multiplication :
2. https://fr.wikipedia.org/wiki/Division_euclidienne

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 15


Chapitre 2. Variables 2.6. La fonction type()

1 >>> chaine = " Salut "


2 >>> chaine
3 ' Salut '
4 >>> chaine + " Python "
5 ' Salut Python '
6 >>> chaine * 3
7 ' SalutSalutSalut '

L’opérateur d’addition + concatène (assemble) deux chaînes de caractères.


L’opérateur de multiplication * entre un nombre entier et une chaîne de caractères duplique (répète) plusieurs fois une
chaîne de caractères.

Attention
Vous observez que les opérateurs + et * se comportent différemment s’il s’agit d’entiers ou de chaînes de caractères : 2
+ 2 est une addition alors que "2" + "2" est une concaténation. On appelle ce comportement redéfinition des opérateurs.
Nous serons amenés à revoir cette notion dans le chapitre 19 Avoir la classe avec les objets.

2.5.3 Opérations illicites


Attention à ne pas faire d’opération illicite car vous obtiendriez un message d’erreur :
1 >>> " toto " * 1.3
2 Traceback ( most recent call last ):
3 File " < stdin >" , line 1 , in < module >
4 TypeError : can ' t multiply sequence by non - int of type ' float '
5 >>> " toto " + 2
6 Traceback ( most recent call last ):
7 File " < stdin >" , line 1 , in < module >
8 TypeError : can only concatenate str ( not " int ") to str

Notez que Python vous donne des informations dans son message d’erreur. Dans le second exemple, il indique que vous
devez utiliser une variable de type str c’est-à-dire une chaîne de caractères et pas un int, c’est-à-dire un entier.

2.6 La fonction type()


Si vous ne vous souvenez plus du type d’une variable, utilisez la fonction type() qui vous le rappellera.
1 >>> x = 2
2 >>> type ( x )
3 < class 'int ' >
4 >>> y = 2.0
5 >>> type ( y )
6 < class ' float ' >
7 >>> z = '2 '
8 >>> type ( z )
9 < class 'str ' >

Nous verrons plus tard ce que signifie le mot class.

Attention
Pour Python, la valeur 2 (nombre entier) est différente de 2.0 (float) et est aussi différente de '2' (chaîne de caractères).

2.7 Conversion de types


En programmation, on est souvent amené à convertir les types, c’est-à-dire passer d’un type numérique à une chaîne
de caractères ou vice-versa. En Python, rien de plus simple avec les fonctions int(), float() et str(). Pour vous en
convaincre, regardez ces exemples :
1 >>> i = 3
2 >>> str ( i )
3 '3 '
4 >>> i = '456 '
5 >>> int ( i )

16 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


2.8. Note sur la division de deux nombres entiers Chapitre 2. Variables

6 456
7 >>> float ( i )
8 456.0
9 >>> i = '3.1416 '
10 >>> float ( i )
11 3.1416

On verra au chapitre 7 Fichiers que ces conversions sont essentielles. En effet, lorsqu’on lit ou écrit des nombres dans un
fichier, ils sont considérés comme du texte, donc des chaînes de caractères.
Toute conversion d’une variable d’un type en un autre est appelé casting en anglais, il se peut que vous croisiez ce terme
si vous consultez d’autres ressources.

2.8 Note sur la division de deux nombres entiers


Notez bien qu’en Python 3, la division de deux nombres entiers renvoie par défaut un float :
1 >>> x = 3 / 4
2 >>> x
3 0.75
4 >>> type ( x )
5 < class ' float ' >

Remarque
Ceci n’était pas le cas en Python 2. Pour en savoir plus sur ce point, vous pouvez consulter le chapitre 21 Remarques
complémentaires.

2.9 Note sur le vocabulaire et la syntaxe


Nous avons vu dans ce chapitre la notion de variable qui est commune à tous les langages de programmation. Toutefois,
Python est un langage dit « orienté objet », il se peut que dans la suite du cours nous employions le mot objet pour désigner
une variable. Par exemple, « une variable de type entier » sera pour nous équivalent à « un objet de type entier ». Nous verrons
dans le chapitre 19 Avoir la classe avec les objets ce que le mot « objet » signifie réellement (tout comme le mot « classe »).
Par ailleurs, nous avons rencontré plusieurs fois des fonctions dans ce chapitre, notamment avec type(), int(), float()
et str(). Dans le chapitre 1 Introduction, nous avons également vu la fonction print(). On reconnaît qu’il s’agit d’une
fonction car son nom est suivi de parenthèses (par exemple, type()). En Python, la syntaxe générale est fonction().
Ce qui se trouve entre les parenthèses d’une fonction est appelé argument et c’est ce que l’on « passe » à la fonction.
Dans l’instruction type(2), c’est l’entier 2 qui est l’argument passé à la fonction type(). Pour l’instant, on retiendra qu’une
fonction est une sorte de boîte à qui on passe un (ou plusieurs) argument(s), qui effectue une action et qui peut renvoyer un
résultat ou plus généralement un objet. Par exemple, la fonction type() renvoie le type de la variable qu’on lui a passé en
argument.
Si ces notions vous semblent obscures, ne vous inquiétez pas, au fur et à mesure que vous avancerez dans le cours, tout
deviendra limpide.

2.10 Minimum et maximum


Python propose les fonctions min() et max() qui renvoient respectivement le minimum et le maximum de plusieurs entiers
et / ou floats :
1 >>> min (1 , -2 , 4)
2 -2
3 >>> pi = 3.14
4 >>> e = 2.71
5 >>> max (e , pi )
6 3.14
7 >>> max (1 , 2.4 , -6)
8 2.4

Par rapport à la discussion de la rubrique précédente, min() et max() sont des exemples de fonction prenant plusieurs
arguments. En Python, quand une fonction prend plusieurs arguments, on doit les séparer par une virgule. min() et max()
prennent en argument autant d’entiers et de floats que l’on veut, mais il en faut au moins deux.

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 17


Chapitre 2. Variables 2.11. Exercices

2.11 Exercices
Conseil : utilisez l’interpréteur Python pour les exercices suivants.

2.11.1 Prédire le résultat : opérations


Essayez de prédire le résultat de chacune des instructions suivantes, puis vérifiez-le dans l’interpréteur Python :
— (1+2)**3
— "Da" * 4
— "Da" + 3
— ("Pa"+"La") * 2
— ("Da"*4) / 2
— 5 / 2
— 5 // 2
— 5 % 2

2.11.2 Prédire le résultat : opérations et conversions de types


Essayez de prédire le résultat de chacune des instructions suivantes, puis vérifiez-le dans l’interpréteur Python :
— str(4) * int("3")
— int("3") + float("3.2")
— str(3) * float("3.2")
— str(3/4) * 2

18 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


Chapitre 3

Affichage

3.1 La fonction print()


Dans le chapitre 1, nous avons rencontré la fonction print() qui affiche une chaîne de caractères (le fameux "Hello
world!"). En fait, la fonction print() affiche l’argument qu’on lui passe entre parenthèses et un retour à ligne. Ce retour à
ligne supplémentaire est ajouté par défaut. Si toutefois, on ne veut pas afficher ce retour à la ligne, on peut utiliser l’argument
par « mot-clé » end :
1 >>> print (" Hello world !")
2 Hello world !
3 >>> print (" Hello world !" , end ="")
4 Hello world ! > > >

Ligne 1. On a utilisé l’instruction print() classiquement en passant la chaîne de caractères "Hello world!" en argu-
ment.
Ligne 3. On a ajouté un second argument end="", en précisant le mot-clé end. Nous aborderons les arguments par mot-clé
dans le chapitre 9 Fonctions. Pour l’instant, dites-vous que cela modifie le comportement par défaut des fonctions.
Ligne 4. L’effet de l’argument end="" est que les trois chevrons >>> se retrouvent collés après la chaîne de caractères
"Hello world!".
Une autre manière de s’en rendre compte est d’utiliser deux fonctions print() à la suite. Dans la portion de code suivante,
le caractère « ; » sert à séparer plusieurs instructions Python sur une même ligne :
1 >>> print (" Hello ") ; print (" Joe ")
2 Hello
3 Joe
4 >>> print (" Hello " , end ="") ; print (" Joe ")
5 HelloJoe
6 >>> print (" Hello " , end =" ") ; print (" Joe ")
7 Hello Joe

La fonction print() peut également afficher le contenu d’une variable quel que soit son type. Par exemple, pour un
entier :
1 >>> var = 3
2 >>> print ( var )
3 3

Il est également possible d’afficher le contenu de plusieurs variables (quel que soit leur type) en les séparant par des
virgules :
1 >>> x = 32
2 >>> nom = " John "
3 >>> print ( nom , " a " , x , " ans ")
4 John a 32 ans

Python a écrit une phrase complète en remplaçant les variables x et nom par leur contenu. Vous remarquerez que pour
afficher plusieurs éléments de texte sur une seule ligne, nous avons utilisé le séparateur « , » entre les différents éléments.
Python a également ajouté un espace à chaque fois que l’on utilisait le séparateur « , ». On peut modifier ce comportement en
passant à la fonction print() l’argument par mot-clé sep :
1 >>> x = 32
2 >>> nom = " John "
3 >>> print ( nom , " a " , x , " ans " , sep ="")

19
Chapitre 3. Affichage 3.2. Écriture formatée

4 Johna32ans
5 >>> print ( nom , " a " , x , " ans " , sep =" -")
6 John -a -32 - ans

Pour afficher deux chaînes de caractères l’une à côté de l’autre, sans espace, on peut soit les concaténer, soit utiliser
l’argument par mot-clé sep avec une chaîne de caractères vide :
1 >>> ani1 = " chat "
2 >>> ani2 = " souris "
3 >>> print ( ani1 , ani2 )
4 chat souris
5 >>> print ( ani1 + ani2 )
6 chatsouris
7 >>> print ( ani1 , ani2 , sep ="")
8 chatsouris

3.2 Écriture formatée


La méthode .format() permet une meilleure organisation de l’affichage des variables (nous expliquerons à la fin de ce
chapitre ce que le terme « méthode » signifie en Python).
Si on reprend l’exemple précédent :
1 >>> x = 32
2 >>> nom = " John "
3 >>> print ("{} a {} ans ". format ( nom , x ))
4 John a 32 ans

— Dans la chaîne de caractères, les accolades vides {} précisent l’endroit où le contenu de la variable doit être inséré.
— Juste après la chaîne de caractères, l’instruction .format(nom, x) fournie la liste des variables à insérer, d’abord la
variable nom puis la variable x. La méthode .format() agit sur la chaîne de caractères à laquelle elle est attachée par
le point.

Remarque
Il est possible d’indiquer entre les accolades {} dans quel ordre afficher les variables, avec 0 pour la variable à afficher en
premier, 1 pour la variable à afficher en second, etc. (attention, Python commence à compter à 0). Cela permet de modifier
l’ordre dans lequel sont affichées les variables.
1 >>> x = 32
2 >>> nom = " John "
3 >>> print ("{0} a {1} ans ". format ( nom , x ))
4 John a 32 ans
5 >>> print ("{1} a {0} ans ". format ( nom , x ))
6 32 a John ans

Imaginez maintenant que vous vouliez calculer, puis afficher, la proportion de GC d’un génome. La proportion de GC
s’obtient comme la somme des bases Guanine (G) et Cytosine (C) divisée par le nombre total de bases (A, T, C, G) du génome
considéré. Si on a, par exemple, 4500 bases G et 2575 bases C, pour un total de 14800 bases, vous pourriez procéder comme
suit (notez bien l’utilisation des parenthèses pour gérer les priorités des opérateurs) :
1 >>> prop_GC = (4500 + 2575) / 14800
2 >>> print (" La proportion de GC est " , prop_GC )
3 La proportion de GC est 0 . 4 7 8 0 4 0 5 4 0 5 4 0 5 4 0 5

Le résultat obtenu présente trop de décimales (seize dans le cas présent). Pour écrire le résultat plus lisiblement, vous
pouvez spécifier dans les accolades {} le format qui vous intéresse. Dans le cas présent, vous voulez formater un float pour
l’afficher avec deux puis trois décimales :
1 >>> print (" La proportion de GC est {:.2 f }". format ( prop_GC ))
2 Le proportion de GC est 0.48
3 >>> print (" La proportion de GC est {:.3 f }". format ( prop_GC ))
4 La proportion de GC est 0.478

Détaillons le contenu des accolades de la première ligne ({:.2f}) :


— Les deux points : indiquent qu’on veut préciser le format.
— La lettre f indique qu’on souhaite afficher la variable sous forme d’un float.
— Les caractères .2 indiquent la précision voulue, soit ici deux chiffres après la virgule.

20 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


3.2. Écriture formatée Chapitre 3. Affichage

Notez enfin que le formatage avec .xf (x étant un entier positif) renvoie un résultat arrondi.
Il est par ailleurs possible de combiner le formatage (à droite des 2 points) ainsi que l’emplacement des variables à
substituer (à gauche des 2 points), par exemple :
1 >>> print (" prop GC (2 d é ci .) = {0:.2 f } , prop GC (3 d é ci .) = {0:.3 f }". format ( prop_GC ))
2 prop GC (2 d é ci .) = 0.48 , prop GC (3 d é ci .) = 0.478

Vous remarquerez qu’on utilise ici la même variable (prop_GC) à deux endroits différents.
Vous pouvez aussi formater des entiers avec la lettre d :
1 >>> nb_G = 4500
2 >>> print (" Ce g é nome contient {: d } guanines ". format ( nb_G ))
3 Ce g é nome contient 4500 guanines

ou mettre plusieurs nombres dans une même chaîne de caractères.


1 >>> nb_G = 4500
2 >>> nb_C = 2575
3 >>> print (" Ce g é nome contient {: d } G et {: d } C , soit une prop de GC de {:.2 f }" \
4 ... . format ( nb_G , nb_C , prop_GC ))
5 Ce g é nome contient 4500 G et 2575 C , soit une prop de GC de 0.48
6 >>> perc_GC = prop_GC * 100
7 >>> print " Ce g é nome contient {: d } G et {: d } C , soit un % GC de {:.2 f } %" \
8 ... . format ( nb_G , nb_C , perc_GC )
9 Ce g é nome contient 4500 G et 2575 C , soit un % GC de 47.80 %

Remarque
Le signe \ en fin de ligne permet de poursuivre la commande sur la ligne suivante. Cette syntaxe est pratique lorsque vous
voulez taper une commande longue.

Enfin, il est possible de préciser sur combien de caractères vous voulez qu’un résultat soit écrit et comment se fait l’ali-
gnement (à gauche, à droite ou centré). Dans la portion de code suivante, le caractère ; sert de séparateur entre les instructions
sur une même ligne :
1 >>> print (10) ; print (1000)
2 10
3 1000
4 >>> print ("{: >6 d }". format (10)) ; print ("{: >6 d }". format (1000))
5 10
6 1000
7 >>> print ("{: <6 d }". format (10)) ; print ("{: <6 d }". format (1000))
8 10
9 1000
10 >>> print ("{:^6 d }". format (10)) ; print ("{:^6 d }". format (1000))
11 10
12 1000
13 >>> print ("{:*^6 d }". format (10)) ; print ("{:*^6 d }". format (1000))
14 **10**
15 *1000*
16 >>> print ("{:0 >6 d }". format (10)) ; print ("{:0 >6 d }". format (1000))
17 000010
18 001000

Notez que > spécifie un alignement à droite, < spécifie un alignement à gauche et ˆ spécifie un alignement centré. Il
est également possible d’indiquer le caractère qui servira de remplissage lors des alignements (l’espace est le caractère par
défaut).
Ce formatage est également possible sur des chaînes de caractères avec la lettre s (comme string) :
1 >>> print (" atom HN ") ; print (" atom HDE1 ")
2 atom HN
3 atom HDE1
4 >>> print (" atom {: >4 s }". format (" HN ")) ; print (" atom {: >4 s }". format (" HDE1 "))
5 atom HN
6 atom HDE1

Vous voyez tout de suite l’énorme avantage de l’écriture formatée. Elle vous permet d’écrire en colonnes parfaitement
alignées. Nous verrons que ceci est très pratique si l’on veut écrire les coordonnées des atomes d’une molécule au format PDB
(pour en savoir plus sur ce format, reportez-vous à l’annexe A Quelques formats de données rencontrés en biologie).
Pour les floats, il est possible de combiner le nombre de caractères à afficher avec le nombre de décimales :
1 >>> print ("{:7.3 f }". format ( perc_GC ))
2 47.804
3 >>> print ("{:10.3 f }". format ( perc_GC ))
4 47.804

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 21


Chapitre 3. Affichage 3.3. Écriture scientifique

L’instruction 7.3f signifie que l’on souhaite écrire un float avec 3 décimales et formaté sur 7 caractères (par défaut justifiés
à droite). L’instruction 10.3f fait la même chose sur 10 caractères. Remarquez que le séparateur décimal . compte pour un
caractère.
Enfin, si on veut afficher des accolades littérales et utiliser la méthode .format() en même temps, il faut doubler les
accolades pour échapper au formatage :
1 >>> print (" Accolades litt é rales {{}} et pour le formatage {}". format (10))
2 Accolades litt é rales {} et pour le formatage 10

La méthode .format() agit sur la chaîne de caractères à laquelle elle est attachée par un point et n’a rien à voir avec
la fonction print(). Si on donne une chaîne de caractères suivie d’un .format() à la fonction print(), Python évalue
d’abord le formatage et c’est la chaîne de caractères qui en résulte qui est affichée à l’écran. Tout comme dans l’instruction
print(5*5), c’est d’abord la multiplication (5*5) qui est évaluée, puis son résultat qui est affiché à l’écran. On peut s’en
rendre compte de la manière suivante dans l’interpréteur :
1 >>> "{:10.3 f }". format ( perc_GC )
2 ' 47.804 '
3 >>> type ("{:10.3 f }". format ( perc_GC ))
4 < class 'str ' >

Python affiche le résultat de l’instruction "{:10.3f}".format(perc_GC) comme une chaîne de caractères et la fonction
type() nous le confirme.

3.3 Écriture scientifique


Pour les nombres très grands ou très petits, l’écriture formatée permet d’afficher un nombre en notation scientifique (sous
forme de puissance de 10) avec la lettre e :
1 >>> print ("{: e }". format (1 _000_000_000 ))
2 1.000000 e +09
3 >>> print ("{: e }". format (0.000 _000_001 ))
4 1.000000 e -09

Il est également possible de définir le nombre de chiffres après la virgule. Dans l’exemple ci-dessous, on affiche un nombre
avec aucun, 3 et 6 chiffres après la virgule :
1 >>> av og a dr o_ nu m be r = 6.022 _140_76e23
2 >>> print ("{:.0 e }". format ( a vo g ad ro _n um b er ))
3 6 e +23
4 >>> print ("{:.3 e }". format ( a vo g ad ro _n um b er ))
5 6.022 e +23
6 >>> print ("{:.6 e }". format ( av og ad r o_ nu mb er ))
7 6.022141 e +23

3.4 Ancienne méthode de formatage des chaînes de caractères


Conseil : Pour les débutants, vous pouvez passer cette rubrique.
Dans d’anciens livres ou programmes Python, il se peut que vous rencontriez l’écriture formatée avec le style suivant :
1 >>> x = 32
2 >>> nom = " John "
3 >>> print ("% s a % d ans " % ( nom , x ))
4 John a 32 ans
5 >>> nb_G = 4500
6 >>> nb_C = 2575
7 >>> prop_GC = ( nb_G + nb_C )/14800
8 >>> print (" On a % d G et % d C -> prop GC = %.2 f " % ( nb_G , nb_C , prop_GC ))
9 On a 4500 G et 2575 C -> prop GC = 0.48

La syntaxe est légèrement différente. Le symbole % est d’abord appelé dans la chaîne de caractères (dans l’exemple ci-
dessus %d, %d et %.2f) pour :
— Désigner l’endroit où sera placée la variable dans la chaîne de caractères.
— Préciser le type de variable à formater, d pour un entier (i fonctionne également) ou f pour un float.
— Éventuellement pour indiquer le format voulu. Ici .2 signifie une précision de deux décimales.
Le signe % est rappelé une seconde fois (% (nb_G, nb_C, prop_GC)) pour indiquer les variables à formater.
Cette ancienne façon de formater une chaîne de caractères vous est présentée à titre d’information. Ne l’utilisez pas dans
vos programmes.

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3.5. Note sur le vocabulaire et la syntaxe Chapitre 3. Affichage

3.5 Note sur le vocabulaire et la syntaxe


Revenons quelques instants sur la notion de méthode abordée dans ce chapitre avec .format(). En Python, on peut
considérer chaque variable comme un objet sur lequel on peut appliquer des méthodes. Une méthode est simplement une
fonction qui utilise et/ou agit sur l’objet lui-même, les deux étant connectés par un point. La syntaxe générale est de la forme
objet.méthode().
Dans l’exemple suivant :
1 >>> " Joe a {} ans ". format (20)
2 ' Joe a 20 ans '

la méthode .format() est liée à "Joe a {} ans" qui est un objet de type chaîne de caractères. La méthode renvoie une
nouvelle chaîne de caractères avec le bon formatage (ici, 'Joe a 20 ans').
Nous aurons de nombreuses occasions de revoir cette notation objet.méthode().

3.6 Exercices
Conseil : utilisez l’interpréteur Python pour les exercices 2 à 5.

3.6.1 Affichage dans l’interpréteur et dans un programme


Ouvrez l’interpréteur Python et tapez l’instruction 1+1. Que se passe-t-il ?
Écrivez la même chose dans un script test.py que vous allez créer avec un éditeur de texte. Exécutez ce script en tapant
python test.py dans un shell. Que se passe-t-il ? Pourquoi ? Faites en sorte d’afficher le résultat de l’addition 1+1 en
exécutant le script dans un shell.

3.6.2 Poly-A
Générez une chaîne de caractères représentant un brin d’ADN poly-A (c’est-à-dire qui ne contient que des bases A) de 20
bases de longueur, sans taper littéralement toutes les bases.

3.6.3 Poly-A et poly-GC


Sur le modèle de l’exercice précédent, générez en une ligne de code un brin d’ADN poly-A (AAAA. . . ) de 20 bases suivi
d’un poly-GC régulier (GCGCGC. . . ) de 40 bases.

3.6.4 Écriture formatée


En utilisant l’écriture formatée, affichez en une seule ligne les variables a, b et c dont les valeurs sont respectivement la
chaîne de caractères "salut", le nombre entier 102 et le float 10.318. La variable c sera affichée avec 2 décimales.

3.6.5 Écriture formatée 2


Dans un script percGC.py, calculez un pourcentage de GC avec l’instruction suivante :
perc_GC = ((4500 + 2575)/14800)*100
Ensuite, affichez le contenu de la variable perc_GC à l’écran avec 0, 1, 2 puis 3 décimales sous forme arrondie en utilisant
.format(). On souhaite que le programme affiche la sortie suivante :
1 Le pourcentage de GC est 48 %
2 Le pourcentage de GC est 47.8 %
3 Le pourcentage de GC est 47.80 %
4 Le pourcentage de GC est 47.804 %

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 23


Chapitre 4

Listes

4.1 Définition
Une liste est une structure de données qui contient une série de valeurs. Python autorise la construction de liste contenant
des valeurs de types différents (par exemple entier et chaîne de caractères), ce qui leur confère une grande flexibilité. Une liste
est déclarée par une série de valeurs (n’oubliez pas les guillemets, simples ou doubles, s’il s’agit de chaînes de caractères)
séparées par des virgules, et le tout encadré par des crochets. En voici quelques exemples :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> tailles = [5 , 2.5 , 1.75 , 0.15]
3 >>> mixte = [ ' girafe ' , 5 , ' souris ' , 0.15]
4 >>> animaux
5 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
6 >>> tailles
7 [5 , 2.5 , 1.75 , 0.15]
8 >>> mixte
9 [ ' girafe ' , 5 , ' souris ' , 0.15]

Lorsque l’on affiche une liste, Python la restitue telle qu’elle a été saisie.

4.2 Utilisation
Un des gros avantages d’une liste est que vous pouvez appeler ses éléments par leur position. Ce numéro est appelé indice
(ou index) de la liste.
1 liste : [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 indice : 0 1 2 3

Soyez très attentifs au fait que les indices d’une liste de n éléments commence à 0 et se termine à n-1. Voyez l’exemple
suivant :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> animaux [0]
3 ' girafe '
4 >>> animaux [1]
5 ' tigre '
6 >>> animaux [3]
7 ' souris '

Par conséquent, si on appelle l’élément d’indice 4 de notre liste, Python renverra un message d’erreur :
1 >>> animaux [4]
2 Traceback ( innermost last ):
3 File " < stdin >" , line 1 , in ?
4 IndexError : list index out of range

N’oubliez pas ceci ou vous risquez d’obtenir des bugs inattendus !

4.3 Opération sur les listes


Tout comme les chaînes de caractères, les listes supportent l’opérateur + de concaténation, ainsi que l’opérateur * pour la
duplication :

24
4.4. Indiçage négatif Chapitre 4. Listes

1 >>> ani1 = [ ' girafe ' , ' tigre ']


2 >>> ani2 = [ ' singe ' , ' souris ']
3 >>> ani1 + ani2
4 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
5 >>> ani1 * 3
6 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' girafe ' , ' tigre ' , ' girafe ' , ' tigre ']

L’opérateur + est très pratique pour concaténer deux listes.


Vous pouvez aussi utiliser la méthode .append() lorsque vous souhaitez ajouter un seul élément à la fin d’une liste.
Dans l’exemple suivant nous allons créer une liste vide :
1 >>> a = []
2 >>> a
3 []

puis lui ajouter deux éléments, l’un après l’autre, d’abord avec la concaténation :
1 >>> a = a + [15]
2 >>> a
3 [15]
4 >>> a = a + [ -5]
5 >>> a
6 [15 , -5]

puis avec la méthode .append() :


1 >>> a . append (13)
2 >>> a
3 [15 , -5 , 13]
4 >>> a . append ( -3)
5 >>> a
6 [15 , -5 , 13 , -3]

Dans l’exemple ci-dessus, nous ajoutons des éléments à une liste en utilisant l’opérateur de concaténation + ou la méthode
.append(). Nous vous conseillons dans ce cas précis d’utiliser la méthode .append() dont la syntaxe est plus élégante.
Nous reverrons en détail la méthode .append() dans le chapitre 11 Plus sur les listes.

4.4 Indiçage négatif


La liste peut également être indexée avec des nombres négatifs selon le modèle suivant :
1 liste : [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 indice positif : 0 1 2 3
3 indice n é gatif : -4 -3 -2 -1

ou encore :
1 liste : [ 'A ' , 'B ' , 'C ' , 'D ' , 'E ' , 'F ']
2 indice positif : 0 1 2 3 4 5
3 indice n é gatif : -6 -5 -4 -3 - 2 -1

Les indices négatifs reviennent à compter à partir de la fin. Leur principal avantage est que vous pouvez accéder au dernier
élément d’une liste à l’aide de l’indice -1 sans pour autant connaître la longueur de cette liste. L’avant-dernier élément a lui
l’indice -2, l’avant-avant dernier l’indice -3, etc.
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> animaux [ -1]
3 ' souris '
4 >>> animaux [ -2]
5 ' singe '

Pour accéder au premier élément de la liste avec un indice négatif, il faut par contre connaître le bon indice :
1 >>> animaux [ -4]
2 ' girafe '

Dans ce cas, on utilise plutôt animaux[0].

4.5 Tranches
Un autre avantage des listes est la possibilité de sélectionner une partie d’une liste en utilisant un indiçage construit sur le
modèle [m:n+1] pour récupérer tous les éléments, du émième au énième (de l’élément m inclus à l’élément n+1 exclu). On
dit alors qu’on récupère une tranche de la liste, par exemple :

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 25


Chapitre 4. Listes 4.6. Fonction len()

1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> animaux [0:2]
3 [ ' girafe ' , ' tigre ']
4 >>> animaux [0:3]
5 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ']
6 >>> animaux [0:]
7 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
8 >>> animaux [:]
9 [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
10 >>> animaux [1:]
11 [ ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
12 >>> animaux [1: -1]
13 [ ' tigre ' , ' singe ']

Notez que lorsqu’aucun indice n’est indiqué à gauche ou à droite du symbole deux-points, Python prend par défaut tous
les éléments depuis le début ou tous les éléments jusqu’à la fin respectivement.
On peut aussi préciser le pas en ajoutant un symbole deux-points supplémentaire et en indiquant le pas par un entier.
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> animaux [0:3:2]
3 [ ' girafe ' , ' singe ']
4 >>> x = [0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9]
5 >>> x
6 [0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9]
7 >>> x [::1]
8 [0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9]
9 >>> x [::2]
10 [0 , 2 , 4 , 6 , 8]
11 >>> x [::3]
12 [0 , 3 , 6 , 9]
13 >>> x [1:6:3]
14 [1 , 4]

Finalement, on se rend compte que l’accès au contenu d’une liste fonctionne sur le modèle liste[début:fin:pas].

4.6 Fonction len()


L’instruction len() vous permet de connaître la longueur d’une liste, c’est-à-dire le nombre d’éléments que contient la
liste. Voici un exemple d’utilisation :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> len ( animaux )
3 4
4 >>> len ([1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8])
5 8

4.7 Les fonctions range() et list()


L’instruction range() est une fonction spéciale en Python qui génère des nombres entiers compris dans un intervalle.
Lorsqu’elle est utilisée en combinaison avec la fonction list(), on obtient une liste d’entiers. Par exemple :
1 >>> list ( range (10))
2 [0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9]

La commande list(range(10)) a généré une liste contenant tous les nombres entiers de 0 inclus à 10 exclu. Nous
verrons l’utilisation de la fonction range() toute seule dans le chapitre 5 Boucles et comparaisons.
Dans l’exemple ci-dessus, la fonction range() a pris un argument, mais elle peut également prendre deux ou trois argu-
ments, voyez plutôt :
1 >>> list ( range (0 , 5))
2 [0 , 1 , 2 , 3 , 4]
3 >>> list ( range (15 , 20))
4 [15 , 16 , 17 , 18 , 19]
5 >>> list ( range (0 , 1000 , 200))
6 [0 , 200 , 400 , 600 , 800]
7 >>> list ( range (2 , -2 , -1))
8 [2 , 1 , 0 , -1]

26 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


4.8. Listes de listes Chapitre 4. Listes

L’instruction range() fonctionne sur le modèle range([début,] fin[, pas]). Les arguments entre crochets sont
optionnels. Pour obtenir une liste de nombres entiers, il faut l’utiliser systématiquement avec la fonction list().
Enfin, prenez garde aux arguments optionnels par défaut (0 pour début et 1 pour pas) :
1 >>> list ( range (10 ,0))
2 []

Ici la liste est vide car Python a pris la valeur du pas par défaut qui est de 1. Ainsi, si on commence à 10 et qu’on avance par
pas de 1, on ne pourra jamais atteindre 0. Python génère ainsi une liste vide. Pour éviter ça, il faudrait, par exemple, préciser
un pas de -1 pour obtenir une liste d’entiers décroissants :
1 >>> list ( range (10 ,0 , -1))
2 [10 , 9 , 8 , 7 , 6 , 5 , 4 , 3 , 2 , 1]

4.8 Listes de listes


Pour finir, sachez qu’il est tout à fait possible de construire des listes de listes. Cette fonctionnalité peut parfois être très
pratique. Par exemple :
1 >>> enclos1 = [ ' girafe ' , 4]
2 >>> enclos2 = [ ' tigre ' , 2]
3 >>> enclos3 = [ ' singe ' , 5]
4 >>> zoo = [ enclos1 , enclos2 , enclos3 ]
5 >>> zoo
6 [[ ' girafe ' , 4] , [ ' tigre ' , 2] , [ ' singe ' , 5]]

Dans cet exemple, chaque sous-liste contient une catégorie d’animal et le nombre d’animaux pour chaque catégorie.
Pour accéder à un élément de la liste, on utilise l’indiçage habituel :
1 >>> zoo [1]
2 [ ' tigre ' , 2]

Pour accéder à un élément de la sous-liste, on utilise un double indiçage :


1 >>> zoo [1][0]
2 ' tigre '
3 >>> zoo [1][1]
4 2

On verra un peu plus loin qu’il existe en Python des dictionnaires qui sont également très pratiques pour stocker de
l’information structurée. On verra aussi qu’il existe un module nommé NumPy qui permet de créer des listes ou des tableaux
de nombres (vecteurs et matrices) et de les manipuler.

4.9 Minimum, maximum et somme d’une liste


Les fonctions min(), max() et sum() renvoient respectivement le minimum, le maximum et la somme d’une liste passée
en argument.
1 >>> liste = list ( range (10))
2 >>> liste
3 [0 , 1 , 2 , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9]
4 >>> sum ( liste )
5 45
6 >>> min ( liste )
7 0
8 >>> max ( liste )
9 9

Même si en théorie ces fonctions peuvent prendre en argument une liste de strings, on les utilisera la plupart du temps
avec des types numériques (liste d’entiers et / ou de floats).
Nous avions déjà croisé min(), max() dans le chapitre 2 Variables. On avait vu que ces deux fonctions pouvaient prendre
plusieurs arguments entiers et / ou floats, par exemple :
1 >>> min (3 , 4)
2 3

Attention toutefois à ne pas mélanger entiers et floats d’une part avec une liste d’autre part, car cela renvoie une erreur :

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 27


Chapitre 4. Listes 4.10. Exercices

1 >>> min ( liste , 3 , 4)


2 Traceback ( most recent call last ):
3 File " < stdin >" , line 1 , in < module >
4 TypeError : '<' not supported between instances of 'int ' and ' list '

Soit on passe plusieurs entiers et / ou floats en argument, soit on passe une liste unique.

4.10 Exercices
Conseil : utilisez l’interpréteur Python.

4.10.1 Jours de la semaine


Constituez une liste semaine contenant les 7 jours de la semaine.
1. À partir de cette liste, comment récupérez-vous seulement les 5 premiers jours de la semaine d’une part, et ceux du
week-end d’autre part ? Utilisez pour cela l’indiçage.
2. Cherchez un autre moyen pour arriver au même résultat (en utilisant un autre indiçage).
3. Trouvez deux manières pour accéder au dernier jour de la semaine.
4. Inversez les jours de la semaine en une commande.

4.10.2 Saisons
Créez 4 listes hiver, printemps, ete et automne contenant les mois correspondants à ces saisons. Créez ensuite une
liste saisons contenant les listes hiver, printemps, ete et automne. Prévoyez ce que renvoient les instructions suivantes,
puis vérifiez-le dans l’interpréteur :
1. saisons[2]
2. saisons[1][0]
3. saisons[1:2]
4. saisons[:][1]. Comment expliquez-vous ce dernier résultat ?

4.10.3 Table de multiplication par 9


Affichez la table de multiplication par 9 en une seule commande avec les instructions range() et list().

4.10.4 Nombres pairs


Répondez à la question suivante en une seule commande. Combien y a-t-il de nombres pairs dans l’intervalle [2, 10000]
inclus ?

28 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


Chapitre 5

Boucles et comparaisons

5.1 Boucles for


5.1.1 Principe
En programmation, on est souvent amené à répéter plusieurs fois une instruction. Incontournables à tout langage de pro-
grammation, les boucles vont nous aider à réaliser cette tâche de manière compacte et efficace.
Imaginez par exemple que vous souhaitiez afficher les éléments d’une liste les uns après les autres. Dans l’état actuel de
vos connaissances, il faudrait taper quelque chose du style :
1 animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 print ( animaux [0])
3 print ( animaux [1])
4 print ( animaux [2])
5 print ( animaux [3])

Si votre liste ne contient que 4 éléments, ceci est encore faisable mais imaginez qu’elle en contienne 100 voire 1000 ! Pour
remédier à cela, il faut utiliser les boucles. Regardez l’exemple suivant :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for animal in animaux :
3 ... print ( animal )
4 ...
5 girafe
6 tigre
7 singe
8 souris

Commentons en détails ce qu’il s’est passé dans cet exemple :


La variable animal est appelée variable d’itération, elle prend successivement les différentes valeurs de la liste animaux
à chaque itération de la boucle. On verra un peu plus loin dans ce chapitre que l’on peut choisir le nom que l’on veut pour
cette variable. Celle-ci est créée par Python la première fois que la ligne contenant le for est exécutée (si elle existait déjà son
contenu serait écrasé). Une fois la boucle terminée, cette variable d’itération animal ne sera pas détruite et contiendra ainsi
la dernière valeur de la liste animaux (ici la chaîne de caractères souris).
Notez bien les types des variables utilisées ici : animaux est une liste sur laquelle on itère, et animal est une chaîne
de caractères car chaque élément de la liste est une chaîne de caractères. Nous verrons plus loin que la variable d’itération
peut être de n’importe quel type selon la liste parcourue. En Python, une boucle itère toujours sur un objet dit séquentiel
(c’est-à-dire un objet constitué d’autres objets) tel qu’une liste. Nous verrons aussi plus tard d’autres objets séquentiels sur
lesquels on peut itérer dans une boucle.
D’ores et déjà, prêtez attention au caractère deux-points « : » à la fin de la ligne débutant par for. Cela signifie que la
boucle for attend un bloc d’instructions, en l’occurrence toutes les instructions que Python répétera à chaque itération de la
boucle. On appelle ce bloc d’instructions le corps de la boucle. Comment indique-t-on à Python où ce bloc commence et se
termine ? Cela est signalé uniquement par l’indentation, c’est-à-dire le décalage vers la droite de la (ou des) ligne(s) du bloc
d’instructions.

Remarque
Les notions de bloc d’instruction et d’indentations avait été abordées rapidement dans le chapitre 1 Introduction.

29
Chapitre 5. Boucles et comparaisons 5.1. Boucles for

Dans l’exemple suivant, le corps de la boucle contient deux instructions : print(animal) et print(animal*2) car elles
sont indentées par rapport à la ligne débutant par for :
1 for animal in animaux :
2 print ( animal )
3 print ( animal *2)
4 print (" C ' est fini ")

La ligne 4 print("C'est fini") ne fait pas partie du corps de la boucle car elle est au même niveau que le for (c’est-
à-dire non indentée par rapport au for). Notez également que chaque instruction du corps de la boucle doit être indentée de
la même manière (ici 4 espaces).

Remarque
Outre une meilleure lisibilité, les deux-points et l’indentation sont formellement requis en Python. Même si on peut in-
denter comme on veut (plusieurs espaces ou plusieurs tabulations, mais pas une combinaison des deux), les développeurs
recommandent l’utilisation de quatre espaces. Vous pouvez consulter à ce sujet le chapitre 15 Bonnes pratiques de program-
mation en Python.
Faites en sorte de configurer votre éditeur de texte favori de façon à écrire quatre espaces lorsque vous tapez sur la touche
Tab (tabulation).

Si on oublie l’indentation, Python renvoie un message d’erreur :


1 >>> for animal in animaux :
2 ... print ( animal )
3 File " < stdin >" , line 2
4 print ( animal )
5 ^
6 I n d e n t a t i o nE r r o r : expected an indented block

Dans les exemples ci-dessus, nous avons exécuté une boucle en itérant directement sur une liste. Une tranche d’une liste
étant elle même une liste, on peut également itérer dessus :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for animal in animaux [1:3]:
3 ... print ( animal )
4 ...
5 tigre
6 singe

On a vu que les boucles for pouvaient utiliser une liste contenant des chaînes de caractères, mais elles peuvent tout aussi
bien utiliser des listes contenant des entiers (ou n’importe quel type de variable).
1 >>> for i in [1 , 2 , 3]:
2 ... print ( i )
3 ...
4 1
5 2
6 3

5.1.2 Fonction range()


Python possède la fonction range() que nous avons rencontrée précédemment dans le chapitre 4 sur les Listes et qui est
aussi bien commode pour faire une boucle sur une liste d’entiers de manière automatique :
1 >>> for i in range (4):
2 ... print ( i )
3 ...
4 0
5 1
6 2
7 3

Dans cet exemple, nous pouvons faire plusieurs remarques importantes :


Contrairement à la création de liste avec list(range(4)), la fonction range() peut être utilisée telle quelle dans une
boucle. Il n’est pas nécessaire de taper for i in list(range(4)): même si cela fonctionnerait également.
Comment cela est-ce possible ? Et bien range() est une fonction qui a été spécialement conçue pour cela 1 , c’est-à-
dire que l’on peut itérer directement dessus. Pour Python, il s’agit d’un nouveau type, par exemple dans l’instruction x =
1. https://docs.python.org/fr/3/library/stdtypes.html#typesseq-range

30 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


5.1. Boucles for Chapitre 5. Boucles et comparaisons

range(3) la variable x est de type range (tout comme on avait les types int, float, str ou list) à utiliser spécialement avec les
boucles.
L’instruction list(range(4)) se contente de transformer un objet de type range en un objet de type list. Si vous vous
souvenez bien, il s’agit d’une fonction de casting, qui convertit un type en un autre (voir chapitre 2 Variables). Il n’y au-
cun intérêt à utiliser dans une boucle la construction for i in list(range(4)):. C’est même contre-productif. En effet,
range() se contente de stocker l’entier actuel, le pas pour passer à l’entier suivant, et le dernier entier à parcourir, ce qui re-
vient à stocker seulement 3 nombres entiers et ce quelle que soit la longueur de la séquence, même avec un range(1000000).
Si on utilisait list(range(1000000)), Python construirait d’abord une liste de 1 million d’éléments dans la mémoire puis
itérerait dessus, d’où une énorme perte de temps !

5.1.3 Nommage de la variable d’itération


Dans l’exemple précédent, nous avons choisi le nom i pour la variable d’itération. Ceci est une habitude en informatique et
indique en général qu’il s’agit d’un entier (le nom i vient sans doute du mot indice ou index en anglais). Nous vous conseillons
de suivre cette convention afin d’éviter les confusions, si vous itérez sur les indices vous pouvez appeler la variable d’itération
i (par exemple dans for i in range(4):).
Si, par contre, vous itérez sur une liste comportant des chaînes de caractères, mettez un nom explicite pour la variable
d’itération. Par exemple :
for prenom in ['Joe', 'Bill', 'John']:

5.1.4 Itération sur les indices


Revenons à notre liste animaux. Nous allons maintenant parcourir cette liste, mais cette fois par une itération sur ses
indices :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for i in range (4):
3 ... print ( animaux [ i ])
4 ...
5 girafe
6 tigre
7 singe
8 souris

La variable i prendra les valeurs successives 0, 1, 2 et 3 et on accèdera à chaque élément de la liste animaux par son
indice (i.e. animaux[i]). Notez à nouveau le nom i de la variable d’itération car on itère sur les indices.
Quand utiliser l’une ou l’autre des 2 méthodes ? La plus efficace est celle qui réalise les itérations directement sur les
éléments :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for animal in animaux :
3 ... print ( animal )
4 ...
5 girafe
6 tigre
7 singe
8 souris

Toutefois, il se peut qu’au cours d’une boucle vous ayez besoin des indices, auquel cas vous devrez itérer sur les indices :
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for i in range ( len ( animaux )):
3 ... print (" L ' animal {} est un ( e ) {}". format (i , animaux [ i ]))
4 ...
5 L ' animal 0 est un ( e ) girafe
6 L ' animal 1 est un ( e ) tigre
7 L ' animal 2 est un ( e ) singe
8 L ' animal 3 est un ( e ) souris

Python possède toutefois la fonction enumerate() qui vous permet d’itérer sur les indices et les éléments eux-mêmes.
1 >>> animaux = [ ' girafe ' , ' tigre ' , ' singe ' , ' souris ']
2 >>> for i , animal in enumerate ( animaux ):
3 ... print (" L ' animal {} est un ( e ) {}". format (i , animal ))
4 ...
5 L ' animal 0 est un ( e ) girafe
6 L ' animal 1 est un ( e ) tigre
7 L ' animal 2 est un ( e ) singe
8 L ' animal 3 est un ( e ) souris

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 31


Chapitre 5. Boucles et comparaisons 5.3. Boucles while

5.2 Comparaisons
Avant de passer à une autre sorte de boucles (les boucles while), nous abordons tout de suite les comparaisons. Celles-ci
seront reprises dans le chapitre 6 sur les Tests.
Python est capable d’effectuer toute une série de comparaisons entre le contenu de deux variables, telles que :

Syntaxe Python Signification


== égal à
!= différent de
> supérieur à
>= supérieur ou égal à
< inférieur à
<= inférieur ou égal à

Observez les exemples suivants avec des nombres entiers.


1 >>> x = 5
2 >>> x == 5
3 True
4 >>> x > 10
5 False
6 >>> x < 10
7 True

Python renvoie la valeur True si la comparaison est vraie et False si elle est fausse. True et False sont des booléens (un
nouveau type de variable).
Faites bien attention à ne pas confondre l’opérateur d’affectation = qui affecte une valeur à une variable et l’opérateur
de comparaison == qui compare les valeurs de deux variables.
Vous pouvez également effectuer des comparaisons sur des chaînes de caractères.
1 >>> animal = " tigre "
2 >>> animal == " tig "
3 False
4 >>> animal != " tig "
5 True
6 >>> animal == ' tigre '
7 True

Dans le cas des chaînes de caractères, a priori seuls les tests == et != ont un sens. En fait, on peut aussi utiliser les
opérateurs <, >, <= et >=. Dans ce cas, l’ordre alphabétique est pris en compte, par exemple :
1 >>> " a " < " b "
2 True

"a" est inférieur à "b" car le caractère a est situé avant le caractère b dans l’ordre alphabétique. En fait, c’est l’ordre
ASCII 2 des caractères qui est pris en compte (à chaque caractère correspond un code numérique), on peut donc aussi comparer
des caractères spéciaux (comme # ou ~) entre eux. Enfin, on peut comparer des chaînes de caractères de plusieurs caractères :
1 >>> " ali " < " alo "
2 True
3 >>> " abb " < " ada "
4 True

Dans ce cas, Python compare les deux chaînes de caractères, caractère par caractère, de la gauche vers la droite (le premier
caractère avec le premier, le deuxième avec le deuxième, etc). Dès qu’un caractère est différent entre l’une et l’autre des deux
chaînes, il considère que la chaîne la plus petite est celle qui présente le caractère ayant le plus petit code ASCII (les caractères
suivants de la chaîne de caractères sont ignorés dans la comparaison), comme dans l’exemple "abb" < "ada" ci-dessus.

5.3 Boucles while


Une autre alternative à l’instruction for couramment utilisée en informatique est la boucle while. Le principe est simple.
Une série d’instructions est exécutée tant qu’une condition est vraie. Par exemple :

2. http://fr.wikipedia.org/wiki/American_Standard_Code_for_Information_Interchange

32 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


5.4. Exercices Chapitre 5. Boucles et comparaisons

1 >>> i = 1
2 >>> while i <= 4:
3 ... print ( i )
4 ... i = i + 1
5 ...
6 1
7 2
8 3
9 4

Remarquez qu’il est encore une fois nécessaire d’indenter le bloc d’instructions correspondant au corps de la boucle (ici,
les instructions lignes 3 et 4).
Une boucle while nécessite généralement trois éléments pour fonctionner correctement :
1. Initialisation de la variable d’itération avant la boucle (ligne 1).
2. Test de la variable d’itération associée à l’instruction while (ligne 2).
3. Mise à jour de la variable d’itération dans le corps de la boucle (ligne 4).
Faites bien attention aux tests et à l’incrémentation que vous utilisez car une erreur mène souvent à des « boucles infinies
» qui ne s’arrêtent jamais. Vous pouvez néanmoins toujours stopper l’exécution d’un script Python à l’aide de la combinaison
de touches Ctrl-C (c’est-à-dire en pressant simultanément les touches Ctrl et C). Par exemple :
1 i = 0
2 while i < 10:
3 print (" Le python c ' est cool !")

Ici, nous avons omis de mettre à jour la variable i dans le corps de la boucle. Par conséquent, la boucle ne s’arrêtera jamais
(sauf en pressant Ctrl-C) puisque la condition i < 10 sera toujours vraie.
La boucle while combinée à la fonction input() peut s’avérer commode lorsqu’on souhaite demander à l’utilisateur une
valeur numérique. Par exemple :
1 >>> i = 0
2 >>> while i < 10:
3 ... reponse = input (" Entrez un entier sup é rieur à 10 : ")
4 ... i = int ( reponse )
5 ...
6 Entrez un entier sup é rieur à 10 : 4
7 Entrez un entier sup é rieur à 10 : -3
8 Entrez un entier sup é rieur à 10 : 15
9 >>> i
10 15

La fonction input() prend en argument un message (sous la forme d’une chaîne de caractères), demande à l’utilisateur
d’entrer une valeur et renvoie celle-ci sous forme d’une chaîne de caractères. Il faut ensuite convertir cette dernière en entier
(avec la fonction int()).

5.4 Exercices
Conseil : pour ces exercices, créez des scripts puis exécutez-les dans un shell.

5.4.1 Boucles de base


Soit la liste ['vache', 'souris', 'levure', 'bacterie']. Affichez l’ensemble des éléments de cette liste (un
élément par ligne) de trois manières différentes (deux avec for et une avec while).

5.4.2 Boucle et jours de la semaine


Constituez une liste semaine contenant les 7 jours de la semaine.
Écrivez une série d’instructions affichant les jours de la semaine (en utilisant une boucle for), ainsi qu’une autre série
d’instructions affichant les jours du week-end (en utilisant une boucle while).

5.4.3 Nombres de 1 à 10 sur une ligne


Avec une boucle, affichez les nombres de 1 à 10 sur une seule ligne.
Conseil : n’hésitez pas à relire le début du chapitre 3 Affichage qui discute de la fonction print().

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 33


Chapitre 5. Boucles et comparaisons 5.4. Exercices

5.4.4 Nombres pairs et impairs


Soit impairs la liste de nombres [1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21]. Écrivez un programme qui, à partir
de la liste impairs, construit une liste pairs dans laquelle tous les éléments de impairs sont incrémentés de 1.

5.4.5 Calcul de la moyenne


Voici les notes d’un étudiant [14, 9, 6, 8, 12]. Calculez la moyenne de ces notes. Utilisez l’écriture formatée pour
afficher la valeur de la moyenne avec deux décimales.

5.4.6 Produit de nombres consécutifs


Avez les fonctions list() et range(), créez la liste entiers contenant les nombres entiers pairs de 2 à 20 inclus.
Calculez ensuite le produit des nombres consécutifs deux à deux de entiers en utilisant une boucle. Exemple pour les
premières itérations :
1 8
2 24
3 48
4 [...]

5.4.7 Triangle
Créez un script qui dessine un triangle comme celui-ci :
1 *
2 **
3 ***
4 ****
5 *****
6 ******
7 *******
8 ********
9 *********
10 **********

5.4.8 Triangle inversé


Créez un script qui dessine un triangle comme celui-ci :
1 **********
2 *********
3 ********
4 *******
5 ******
6 *****
7 ****
8 ***
9 **
10 *

5.4.9 Triangle gauche


Créez un script qui dessine un triangle comme celui-ci :
1 *
2 **
3 ***
4 ****
5 *****
6 ******
7 *******
8 ********
9 *********
10 **********

34 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


5.4. Exercices Chapitre 5. Boucles et comparaisons

F IGURE 5.1 – Parcours d’une matrice.

5.4.10 Pyramide
Créez un script pyra.py qui dessine une pyramide comme celle-ci :
1 *
2 ***
3 *****
4 *******
5 *********
6 ***********
7 *************
8 * ** ** ** * ** ** ** *
9 *****************
10 *******************

Essayez de faire évoluer votre script pour dessiner la pyramide à partir d’un nombre arbitraire de lignes N. Vous pourrez
demander à l’utilisateur le nombre de lignes de la pyramide avec les instructions suivantes qui utilisent la fonction input() :
1 reponse = input (" Entrez un nombre de lignes ( entier positif ): ")
2 N = int ( reponse )

5.4.11 Parcours de matrice


Imaginons que l’on souhaite parcourir tous les éléments d’une matrice carrée, c’est-à-dire d’une matrice qui est constituée
d’autant de lignes que de colonnes.
Créez un script qui parcourt chaque élément de la matrice et qui affiche le numéro de ligne et de colonne uniquement avec
des boucles for.
Pour une matrice 2 × 2, le schéma de la figure 5.1 vous indique comment parcourir une telle matrice. L’affichage attendu
est :
1 ligne colonne
2 1 1
3 1 2
4 2 1
5 2 2

Attention à bien respecter l’alignement des chiffres qui doit être justifié à droite sur 4 caractères. Testez pour une matrice
3 × 3, puis 5 × 5, et enfin 10 × 10.
Créez une seconde version de votre script, cette fois-ci avec deux boucles while.

5.4.12 Parcours de demi-matrice sans la diagonale (exercice ++)


En se basant sur le script précédent, on souhaite réaliser le parcours d’une demi-matrice carrée sans la diagonale. On peut
noter que cela produit tous les couples possibles une seule fois (1 et 2 est équivalent à 2 et 1), en excluant par ailleurs chaque
élément avec lui même (1 et 1, 2 et 2, etc). Pour mieux comprendre ce qui est demandé, la figure 5.2 indique les cases à
parcourir en gris :
Créez un script qui affiche le numéro de ligne et de colonne, puis la taille de la matrice N × N et le nombre total de cases
parcourues. Par exemple pour une matrice 4 × 4 (N=4) :

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 35


Chapitre 5. Boucles et comparaisons 5.4. Exercices

F IGURE 5.2 – Demi-matrice sans la diagonale (en gris).

F IGURE 5.3 – Sauts de puce.

1 ligne colonne
2 1 2
3 1 3
4 1 4
5 2 3
6 2 4
7 3 4
8 Pour une matrice 4 x4 , on a parcouru 6 cases

Testez votre script avec N=3, puis N=4 et enfin N=5.


Concevez une seconde version à partir du script précédent, où cette fois on n’affiche plus tous les couples possibles mais
simplement la valeur de N, et le nombre de cases parcourues. Affichez cela pour des valeurs de N allant de 2 à 10.
Pouvez-vous trouver une formule générale reliant le nombre de cases parcourues à N ?

5.4.13 Sauts de puce


On imagine une puce qui se déplace aléatoirement sur une ligne, en avant ou en arrière, par pas de 1 ou -1. Par exemple,
si elle est à l’emplacement 0, elle peut sauter à l’emplacement 1 ou -1 ; si elle est à l’emplacement 2, elle peut sauter à
l’emplacement 3 ou 1, etc.
Avec une boucle while, simuler le mouvement de cette puce de l’emplacement initial 0 à l’emplacement final 5 (voir le
schéma de la figure 5.3). Combien de sauts sont nécessaires pour réaliser ce parcours ? Relancez plusieurs fois le programme.
Trouvez-vous le même nombre de sauts à chaque exécution ?
Conseil : vous utiliserez l’instruction random.choice([-1,1]) qui renvoie au hasard les valeurs -1 ou 1 avec la même
probabilité. Avant d’utiliser cette instruction vous mettrez au tout début de votre script la ligne
import random
Nous reverrons la signification de cette syntaxe particulière dans le chapitre 8 Modules.

5.4.14 Suite de Fibonacci (exercice +++)


La suite de Fibonacci 3 est une suite mathématique qui porte le nom de Leonardo Fibonacci, un mathématicien italien
du XIIIe siècle. Initialement, cette suite a été conçue pour décrire la croissance d’une population de lapins, mais elle peut
3. https://fr.wikipedia.org/wiki/Suite_de_Fibonacci

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5.4. Exercices Chapitre 5. Boucles et comparaisons

également être utilisée pour décrire certains motifs géométriques retrouvés dans la nature (coquillages, fleurs de tournesol. . . ).
Pour la suite de Fibonacci (xn ), le terme au rang n (avec n > 1) est la somme des nombres aux rangs n − 1 et n − 2 :
xn = xn−1 + xn−2
Par définition, les deux premiers termes sont x0 = 0 et x1 = 1.
À titre d’exemple, les 10 premiers termes de la suite de Fibonacci sont donc 0, 1, 1, 2, 3, 5, 8, 13, 21 et 34.
Créez un script qui construit une liste fibo avec les 15 premiers termes de la suite de Fibonacci puis l’affiche.
Améliorez ce script en affichant, pour chaque élément de la liste fibo avec n > 1, le rapport entre l’élément de rang n et
l’élément de rang n − 1. Ce rapport tend-il vers une constante ? Si oui, laquelle ?

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 37


Chapitre 6

Tests

6.1 Définition
Les tests sont un élément essentiel à tout langage informatique si on veut lui donner un peu de complexité car ils permettent
à l’ordinateur de prendre des décisions. Pour cela, Python utilise l’instruction if ainsi qu’une comparaison que nous avons
abordée au chapitre précédent. Voici un premier exemple :
1 >>> x = 2
2 >>> if x == 2:
3 ... print (" Le test est vrai !")
4 ...
5 Le test est vrai !

et un second :
1 >>> x = " souris "
2 >>> if x == " tigre ":
3 ... print (" Le test est vrai !")
4 ...

Il y a plusieurs remarques à faire concernant ces deux exemples :


— Dans le premier exemple, le test étant vrai, l’instruction print("Le test est vrai !") est exécutée. Dans le se-
cond exemple, le test est faux et rien n’est affiché.
— Les blocs d’instructions dans les tests doivent forcément être indentés comme pour les boucles for et while. L’inden-
tation indique la portée des instructions à exécuter si le test est vrai.
— Comme avec les boucles for et while, la ligne qui contient l’instruction if se termine par le caractère deux-points
« : ».

6.2 Tests à plusieurs cas


Parfois, il est pratique de tester si la condition est vraie ou si elle est fausse dans une même instruction if. Plutôt que
d’utiliser deux instructions if, on peut se servir des instructions if et else :
1 >>> x = 2
2 >>> if x == 2:
3 ... print (" Le test est vrai !")
4 ... else :
5 ... print (" Le test est faux !")
6 ...
7 Le test est vrai !
8 >>> x = 3
9 >>> if x == 2:
10 ... print (" Le test est vrai !")
11 ... else :
12 ... print (" Le test est faux !")
13 ...
14 Le test est faux !

On peut utiliser une série de tests dans la même instruction if, notamment pour tester plusieurs valeurs d’une même
variable.

38
6.4. Tests multiples Chapitre 6. Tests

Par exemple, on se propose de tirer au sort une base d’ADN puis d’afficher le nom de cette dernière. Dans le code suivant,
nous utilisons l’instruction random.choice(liste) qui renvoie un élément choisi au hasard dans une liste. L’instruction
import random sera vue plus tard dans le chapitre 8 Modules, admettez pour le moment qu’elle est nécessaire.
1 >>> import random
2 >>> base = random . choice ([" a " , " t " , " c " , " g "])
3 >>> if base == " a ":
4 ... print (" choix d ' une ad é nine ")
5 ... elif base == " t ":
6 ... print (" choix d ' une thymine ")
7 ... elif base == " c ":
8 ... print (" choix d ' une cytosine ")
9 ... elif base == " g ":
10 ... print (" choix d ' une guanine ")
11 ...
12 choix d ' une cytosine

Dans cet exemple, Python teste la première condition, puis, si et seulement si elle est fausse, teste la deuxième et ainsi de
suite. . . Le code correspondant à la première condition vérifiée est exécuté puis Python sort du bloc d’instructions du if.

6.3 Importance de l’indentation


De nouveau, faites bien attention à l’indentation ! Vous devez être très rigoureux sur ce point. Pour vous en convaincre,
exécutez ces deux exemples de code :
Code 1
1 nombres = [4 , 5 , 6]
2 for nb in nombres :
3 if nb == 5:
4 print (" Le test est vrai ")
5 print (" car la variable nb vaut {}". format ( nb ))

Résultat :
1 Le test est vrai
2 car la variable nb vaut 5

Code 2
1 nombres = [4 , 5 , 6]
2 for nb in nombres :
3 if nb == 5:
4 print (" Le test est vrai ")
5 print (" car la variable nb vaut {}". format ( nb ))

Résultat :
1 car la variable nb vaut 4
2 Le test est vrai
3 car la variable nb vaut 5
4 car la variable nb vaut 6

Les deux codes pourtant très similaires produisent des résultats très différents. Si vous observez avec attention l’indentation
des instructions sur la ligne 5, vous remarquerez que dans le code 1, l’instruction est indentée deux fois, ce qui signifie qu’elle
appartient au bloc d’instructions du test if. Dans le code 2, l’instruction de la ligne 5 n’est indentée qu’une seule fois, ce
qui fait qu’elle n’appartient plus au bloc d’instructions du test if, d’où l’affichage de car la variable nb vaut xx pour
toutes les valeurs de nb.

6.4 Tests multiples


Les tests multiples permettent de tester plusieurs conditions en même temps en utilisant des opérateurs booléens. Les deux
opérateurs les plus couramment utilisés sont le OU et le ET. Voici un petit rappel sur le fonctionnement de l’opérateur OU :

Condition 1 Opérateur Condition 2 Résultat


Vrai OU Vrai Vrai
Vrai OU Faux Vrai
Faux OU Vrai Vrai
Faux OU Faux Faux

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 39


Chapitre 6. Tests 6.5. Instructions break et continue

et de l’opérateur ET :

Condition 1 Opérateur Condition 2 Résultat


Vrai ET Vrai Vrai
Vrai ET Faux Faux
Faux ET Vrai Faux
Faux ET Faux Faux

En Python, on utilise le mot réservé and pour l’opérateur ET et le mot réservé or pour l’opérateur OU. Respectez bien la
casse des opérateurs and et or qui, en Python, s’écrivent en minuscule. En voici un exemple d’utilisation :
1 >>> x = 2
2 >>> y = 2
3 >>> if x == 2 and y == 2:
4 ... print (" le test est vrai ")
5 ...
6 le test est vrai

Notez que le même résultat serait obtenu en utilisant deux instructions if imbriquées :
1 >>> x = 2
2 >>> y = 2
3 >>> if x == 2:
4 ... if y == 2:
5 ... print (" le test est vrai ")
6 ...
7 le test est vrai

Vous pouvez aussi tester directement l’effet de ces opérateurs à l’aide de True et False (attention à respecter la casse).
1 >>> True or False
2 True

Enfin, on peut utiliser l’opérateur logique de négation not qui inverse le résultat d’une condition :
1 >>> not True
2 False
3 >>> not False
4 True
5 >>> not ( True and True )
6 False

6.5 Instructions break et continue


Ces deux instructions permettent de modifier le comportement d’une boucle (for ou while) avec un test.
L’instruction break stoppe la boucle.
1 >>> for i in range (5):
2 ... if i > 2:
3 ... break
4 ... print ( i )
5 ...
6 0
7 1
8 2

L’instruction continue saute à l’itération suivante, sans exécuter la suite du bloc d’instructions de la boucle.
1 >>> for i in range (5):
2 ... if i == 2:
3 ... continue
4 ... print ( i )
5 ...
6 0
7 1
8 3
9 4

40 Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant


6.6. Tests de valeur sur des floats Chapitre 6. Tests

6.6 Tests de valeur sur des floats


Lorsque l’on souhaite tester la valeur d’une variable de type float, le premier réflexe serait d’utiliser l’opérateur d’égalité
comme :
1 >>> 1/10 == 0.1
2 True

Toutefois, nous vous le déconseillons formellement. Pourquoi ? Python stocke les valeurs numériques des floats sous forme
de nombres flottants (d’où leur nom !), et cela mène à certaines limitations 1 . Observez l’exemple suivant :
1 >>> (3 - 2.7) == 0.3
2 False
3 >>> 3 - 2.7
4 0.2999999999999998

Nous voyons que le résultat de l’opération 3 - 2.7 n’est pas exactement 0.3 d’où le False en ligne 2.
En fait, ce problème ne vient pas de Python, mais plutôt de la manière dont un ordinateur traite les nombres flottants
(comme un rapport de nombres binaires). Ainsi certaines valeurs de float ne peuvent être qu’approchées. Une manière de s’en
rendre compte est d’utiliser l’écriture formatée en demandant l’affichage d’un grand nombre de décimales :
1 >>> 0.3
2 0.3
3 >>> "{:.5 f }". format (0.3)
4 '0.30000 '
5 >>> "{:.60 f }". format (0.3)
6 '0.299999999999999988897769753748434595763683319091796875000000 '
7 >>> "{:.60 f }". format (3.0 - 2.7)
8 '0.299999999999999822364316059974953532218933105468750000000000 '

On observe que lorsqu’on tape 0.3, Python affiche une valeur arrondie. En réalité, le nombre réel 0.3 ne peut être
qu’approché lorsqu’on le code en nombre flottant. Il est donc essentiel d’avoir cela en tête lorsque l’on effectue un test .

Conseil
Pour les raisons évoquées ci-dessus, il ne faut surtout pas tester si un float est égal à une certaine valeur. La bonne pratique
est de vérifier si un float est compris dans un intervalle avec une certaine précision. Si on appelle cette précision delta, on peut
procéder ainsi :
1 >>> delta = 0.0001
2 >>> var = 3.0 - 2.7
3 >>> 0.3 - delta < var < 0.3 + delta
4 True
5 >>> abs ( var - 0.3) < delta
6 True

Ici on teste si var est compris dans l’intervalle 0.3±delta. Les deux méthodes mènent à un résultat strictement équivalent :
— La ligne 3 est intuitive car elle ressemble à un encadrement mathématique.
— La ligne 5 utilise la fonction valeur absolue abs() et est plus compacte.

6.7 Exercices
Conseil : pour ces exercices, créez des scripts puis exécutez-les dans un shell.

6.7.1 Jours de la semaine


Constituez une liste semaine contenant le nom des sept jours de la semaine.
En utilisant une boucle, écrivez chaque jour de la semaine ainsi que les messages suivants :
— Au travail s’il s’agit du lundi au jeudi ;
— Chouette c'est vendredi s’il s’agit du vendredi ;
— Repos ce week-end s’il s’agit du samedi ou du dimanche.
Ces messages ne sont que des suggestions, vous pouvez laisser libre cours à votre imagination.
1. https://docs.python.org/fr/3/tutorial/floatingpoint.html

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 41


Chapitre 6. Tests 6.7. Exercices

6.7.2 Séquence complémentaire d’un brin d’ADN


La liste ci-dessous représente la séquence d’un brin d’ADN :
["A","C","G","T","T","A","G","C","T","A","A","C","G"]
Créez un script qui transforme cette séquence en sa séquence complémentaire.
Rappel : la séquence complémentaire s’obtient en remplaçant A par T, T par A, C par G et G par C.

6.7.3 Minimum d’une liste


La fonction min() de Python renvoie l’élément le plus petit d’une liste constituée de valeurs numériques ou de chaînes de
caractères. Sans utiliser cette fonction, créez un script qui détermine le plus petit élément de la liste [8, 4, 6, 1, 5].

6.7.4 Fréquence des acides aminés


La liste ci-dessous représente une séquence d’acides aminés :
["A","R","A","W","W","A","W","A","R","W","W","R","A","G"]
Calculez la fréquence des acides aminés alanine (A), arginine (R), tryptophane (W) et glycine (G) dans cette séquence.

6.7.5 Notes et mention d’un étudiant


Voici les notes d’un étudiant : 14, 9, 13, 15 et 12. Créez un script qui affiche la note maximum (utilisez la fonction max()),
la note minimum (utilisez la fonction min()) et qui calcule la moyenne.
Affichez la valeur de la moyenne avec deux décimales. Affichez aussi la mention obtenue sachant que la mention est «
passable » si la moyenne est entre 10 inclus et 12 exclus, « assez bien » entre 12 inclus et 14 exclus et « bien » au-delà de 14.

6.7.6 Nombres pairs


Construisez une boucle qui parcourt les nombres de 0 à 20 et qui affiche les nombres pairs inférieurs ou égaux à 10 d’une
part, et les nombres impairs strictement supérieurs à 10 d’autre part.
Pour cet exercice, vous pourrez utiliser l’opérateur modulo % qui renvoie le reste de la division entière entre deux nombres
et dont voici quelques exemples d’utilisation :
1 >>> 4 % 3
2 1
3 >>> 5 % 3
4 2
5 >>> 4 % 2
6 0
7 >>> 5 % 2
8 1
9 >>> 6 % 2
10 0
11 >>> 7 % 2
12 1

Vous remarquerez qu’un nombre est pair lorsque le reste de sa division entière par 2 est nul.

6.7.7 Conjecture de Syracuse (exercice +++)


La conjecture de Syracuse 2 est une conjecture mathématique qui reste improuvée à ce jour et qui est définie de la manière
suivante.
Soit un entier positif n. Si n est pair, alors le diviser par 2. Si il est impair, alors le multiplier par 3 et lui ajouter 1. En
répétant cette procédure, la suite de nombres atteint la valeur 1 puis se prolonge indéfiniment par une suite de trois valeurs
triviales appelée cycle trivial.
Jusqu’à présent, la conjecture de Syracuse, selon laquelle depuis n’importe quel entier positif la suite de Syracuse atteint
1, n’a pas été mise en défaut.
Par exemple, les premiers éléments de la suite de Syracuse si on prend comme point de départ 10 sont : 10, 5, 16, 8, 4, 2,
1. . .
2. http://fr.wikipedia.org/wiki/Conjecture_de_Syracuse

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6.7. Exercices Chapitre 6. Tests

Créez un script qui, partant d’un entier positif n (par exemple 10 ou 20), crée une liste des nombres de la suite de Syracuse.
Avec différents points de départ (c’est-à-dire avec différentes valeurs de n), la conjecture de Syracuse est-elle toujours vérifiée ?
Quels sont les nombres qui constituent le cycle trivial ?

Remarque
1. Pour cet exercice, vous avez besoin de faire un nombre d’itérations inconnu pour que la suite de Syracuse atteigne
le chiffre 1 puis entame son cycle trivial. Vous pourrez tester votre algorithme avec un nombre arbitraire d’itérations,
typiquement 20 ou 100, suivant votre nombre n de départ.
2. Un nombre est pair lorsque le reste de sa division entière (opérateur modulo %) par 2 est nul.

6.7.8 Attribution de la structure secondaire des acides aminés d’une protéine (exercice +++)
Dans une protéine, les différents acides aminés sont liés entre eux par une liaison peptidique. Les angles phi et psi sont
deux angles mesurés autour de cette liaison peptidique. Leurs valeurs sont utiles pour définir la conformation spatiale (appelée
« structure secondaire ») adoptée par les acides aminés.
Par exemples, les angles phi et psi d’une conformation en « hélice alpha » parfaite ont une valeur de -57 degrés et -47
degrés respectivement. Bien sûr, il est très rare que l’on trouve ces valeurs parfaites dans une protéine, et il est habituel de
tolérer une déviation de ± 30 degrés autour des valeurs idéales de ces angles.
Vous trouverez ci-dessous une liste de listes contenant les valeurs des angles phi et psi de 15 acides aminés de la protéine
1TFE 3 :
1 [[48.6 , 53.4] ,[ -124.9 , 156.7] ,[ -66.2 , -30.8] , \
2 [ -58.8 , -43.1] ,[ -73.9 , -40.6] ,[ -53.7 , -37.5] , \
3 [ -80.6 , -26.0] ,[ -68.5 , 135.0] ,[ -64.9 , -23.5] , \
4 [ -66.9 , -45.5] ,[ -69.6 , -41.0] ,[ -62.7 , -37.5] , \
5 [ -68.2 , -38.3] ,[ -61.2 , -49.1] ,[ -59.7 , -41.1]]

Pour le premier acide aminé, l’angle phi vaut 48.6 et l’angle psi 53.4. Pour le deuxième, l’angle phi vaut -124.9 et l’angle
psi 156.7, etc.
En utilisant cette liste, créez un script qui teste, pour chaque acide aminé, s’il est ou non en hélice et affiche les valeurs des
angles phi et psi et le message adapté est en hélice ou n’est pas en hélice.
Par exemple, pour les 3 premiers acides aminés :
1 [48.6 , 53.4] n ' est pas en h é lice
2 [ -124.9 , 156.7] n ' est pas en h é lice
3 [ -66.2 , -30.8] est en h é lice

D’après vous, quelle est la structure secondaire majoritaire de ces 15 acides aminés ?

Remarque
Pour en savoir plus sur le monde merveilleux des protéines, n’hésitez pas à consulter la page Wikipedia sur la structure
secondaire des protéines 4 .

6.7.9 Détermination des nombres premiers inférieurs à 100 (exercice +++)


Voici un extrait de l’article sur les nombres premiers tiré de l’encyclopédie en ligne wikipédia 5 .
Un nombre premier est un entier naturel qui admet exactement deux diviseurs distincts entiers et positifs (qui sont alors 1
et lui-même). Cette définition exclut 1, qui n’a qu’un seul diviseur entier positif. Par opposition, un nombre non nul produit
de deux nombres entiers différents de 1 est dit composé. Par exemple 6 = 2 × 3 est composé, tout comme 21 = 3 × 7, mais 11
est premier car 1 et 11 sont les seuls diviseurs de 11. Les nombres 0 et 1 ne sont ni premiers ni composés.
Déterminez les nombres premiers inférieurs à 100. Combien y a-t-il de nombres premiers entre 0 et 100 ? Pour vous aider,
nous vous proposons plusieurs méthodes.
3. https://www.rcsb.org/structure/1TFE
4. https://fr.wikipedia.org/wiki/Structure_des_prot%C3%A9ines#Angles_di%C3%A8dres_et_structure_secondaire
5. http://fr.wikipedia.org/wiki/Nombre_premier

Cours de Python / Université de Paris / UFR Sciences du Vivant 43


Chapitre 6. Tests 6.7. Exercices

Méthode 1 (peu optimale mais assez intuitive)


Pour chaque nombre de 2 à 100, calculez le reste de la division entière (avec l’opérateur modulo %) depuis 1 jusqu’à
lui-même. Si c’est un nombre premier, il aura exactement deux nombres pour lesquels le reste de la division entière est égal à
0 (1 et lui-même). Si ce n’est pas un nombre premier, il aura plus de deux nombres pour lesquels le reste de la division entière
est égal à 0.

Méthode 2 (plus optimale et plus rapide, mais un peu plus compliquée)


Parcourez tous les nombres de 2 à 100 et vérifiez si ceux-ci sont composés, c’est-à-dire qu’ils sont le produit de deux
nombres premiers. Pratiquement, cela consiste à vérifier que le reste de la division entière (opérateur modulo %) entre le
nombre considéré et chaque nombre premier déterminé jusqu’à maintenant est nul. Le cas échéant, ce nombre n’est pas
premier. Attention, pour cette méthode, il faudra initialiser la liste de nombres premiers avec le premier nombre premier (donc
2 !).

6.7.10 Recherche d’un nombre par dichotomie (exercice +++)


La recherche par dichotomie 6 est une méthode qui consiste à diviser (en général en parties égales) un problème pour en
trouver la solution. À titre d’exemple, voici une discussion entre Pierre et Patrick dans laquelle Pierre essaie de deviner le
nombre (compris entre 1 et 100 inclus) auquel Patrick a pensé.
— [Patrick] « C’est bon, j’ai pensé à un nombre entre 1 et 100. »
— [Pierre] « OK, je vais essayer de le deviner. Est-ce que ton nombre est plus petit ou plus grand que 50 ? »
— [Patrick] « Plus grand. »
— [Pierre] « Est-ce que ton nombre est plus petit, plus grand ou égal à 75 ? »
— [Patrick] « Plus grand. »
— [Pierre] « Est-ce que ton nombre est plus petit, plus grand ou égal à 87 ? »
— [Patrick] « Plus petit. »
— [Pierre] « Est-ce que ton nombre est plus petit, plus grand ou égal à 81 ? »
— [Patrick] « Plus petit. »
— [Pierre] « Est-ce que ton nombre est plus petit, plus grand ou égal à 78 ? »
— [Patrick] « Plus grand. »
— [Pierre] « Est-ce que ton nombre est plus petit, plus grand ou égal à 79 ? »
— [Patrick] « Égal. C’est le nombre auquel j’avais pensé. Bravo ! »
Pour arriver rapidement à deviner le nombre, l’astuce consiste à prendre à chaque fois la moitié de l’intervalle dans lequel
se trouve le nombre. Voici le détail des différentes étapes :
1. le nombre se trouve entre 1 et 100, on propose 50 (100 / 2).
2. le nombre se trouve entre 50 et 100, on propose 75 ( 50 + (100-50)/2 ).
3. le nombre se trouve entre 75 et 100, on propose 87 ( 75 + (100-75)/2 ).
4. le nombre se trouve entre 75 et 87, on propose 81 ( 75 + (87-75)/2 ).
5. le nombre se trouve entre 75 et 81, on propose 78 ( 75 + (81-75)/2 ).
6. le nombre se trouve entre 78 et 81, on propose 79 ( 78 + (81-78)/2 ).
Créez un script qui reproduit ce jeu de devinettes. Vous pensez à un nombre entre 1 et 100 et l’ordinateur essaie de le
deviner par dichotomie en vous posant des questions.
Votre programme utilisera la fonction input() pour interagir avec l’utilisateur. Voici un exemple de son fonctionnement :
1 >>> lettre = input (" Entrez une lettre : ")
2 Entrez une lettre : P
3 >>> print ( lettre )
4 P

Pour vous guider, voici ce que donnerait le programme avec la conversation précédente :
1 Pensez à un nombre entre 1 et 100.
2 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 50 ? [+/ -/=] +
3 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 75 ? [+/ -/=] +
4 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 87 ? [+/ -/=] -
5 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 81 ? [+/ -/=] -

6. https://fr.wikipedia.org/wiki/Dichotomie

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6.7. Exercices Chapitre 6. Tests

6 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 78 ? [+/ -/=] +
7 Est - ce votre nombre est plus grand , plus petit ou é gal à 79 ? [+/ -/=] =
8 J ' ai trouv é en 6 questions !

Les caractères [+/-/=] indiquent à l’utilisateur comment il doit interagir avec l’ordinateur, c’est-à-dire entrer soit le
caractère + si le nombre choisi est plus grand que le nombre proposé par l’ordinateur, soit le caractère - si le nombre choisi
est plus petit que le nombre proposé par l’ordinateur, soit le caractère = si le nombre choisi est celui proposé par l’ordinateur
(en appuyant ensuite sur la touche Entrée).

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