Feuilletage

9782100773688-Livre.fm Page I Mercredi, 15.
novembre 2017 6:13 18
de
biologie
moléculaire
Cours + QCM/QROC
Abderrahman Maftah
Professeur à l’université de Limoges
Jean-Michel Petit
Professeur à l’université de Limoges
Raymond Julien
Professeur émérite à l’université de Limoges
4e édition
9782100773688-Livre.fm Page II Dimanche, 22. octobre 2017 5:00 17
Les illustrations de cet ouvrage ont été réalisées par Sébastien ARICO.
Directeur d’ouvrage
Raymond JULIEN
© Dunod, Paris, 2007, 2011, 2015, 2018

11, rue Paul Bert, 92210 Malakoff
www.dunod.com
ISBN 978-2-10-077368-8
9782100773688-Livre.fm Page III Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
Table des matières
1 Structure de l’ADN et de l’ARN 1

1.1 Les composants des acides nucléiques 1
La structure des nucléotides 3
La structure des polynucléotides 5
1.2 La structure en double hélice de l’ADN 5
La règle de Chargaff et les appariements complémentaires 5
Les différentes formes d’ADN 8
Dissociation et réassociation des brins d’ADN 9
Les surenroulements de l’ADN 11
1.3 Le nucléosome, la chromatine et les chromosomes 13
La structure du nucléosome 13
La structure et le remodelage de la chromatine 15
La structure des chromosomes et le cycle cellulaire 16
1.4 La structure des génomes 19
Qu’est-ce qu’un génome ? 19
La taille des génomes 19
Les génomes viraux 21
Les génomes procaryotes 21
Les génomes eucaryotes 21
Les génomes d’organites 22
1.5 Les différents types d’ARN 23
Structure et fonction 23
Qu’est-ce qu’un ARN non codant ? 25
Qu’est-ce que l’ARN interférence ? 26
Points clefs 28
QCM - QROC 29
Réponses 31
9782100773688-Livre.fm Page IV Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
IV Biologie moléculaire
2 Réplication, réparation, recombinaison et transposition

de l’ADN 33
2.1 Les mécanismes de réplication de l’ADN 33
La chimie de synthèse cellulaire
des polydésoxyribonucléotides 34
L’action de l’ADN polymérase 35
La fourche de réplication 36
Les autres enzymes et protéines de la réplication 37
Les différentes ADN polymérases 40
Les différentes étapes de la réplication 41
2.2 Les erreurs de réplication de l’ADN et leur réparation 46
Les altérations de la structure de l’ADN 47
Les mécanismes de réparation 48
2.3 Les détériorations environnementales de l’ADN
et leur réparation 50
L’hydrolyse spontanée et les détériorations physico-
chimiques 50
Les agents intercalants 51
La réparation des détériorations 51
2.4 La recombinaison et la transposition de l’ADN 54
Les mécanismes de recombinaison homologue 54
La recombinaison en des sites spécifiques
et la transposition 61
Points clefs 69
QCM - QROC 70
Réponses 72
3 La transcription de l’ADN 75
3.1 Les mécanismes de la transcription 75
Les ARN polymérases 75
Les différentes étapes de la transcription 77
3.2 La transcription chez les bactéries 78
Les promoteurs bactériens 78
Le démarrage de la transcription 79
La phase d’allongement 79
L’arrêt de la transcription 81
9782100773688-Livre.fm Page V Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
Table des matières V
3.3 La transcription chez les eucaryotes 82

Les promoteurs eucaryotes et la polymérase II 82
Le démarrage : facteurs de transcription et complexe
médiateur 83
Les phases d’allongement et d’arrêt 86
Les modifications des transcrits 86
Les deux autres polymérases eucaryotes 89
3.4 L’épissage de l’ARN 90
Le mécanisme général 90
Le splicéosome 93
L’épissage alternatif et sa régulation 93
Exemples de rôles biologiques de l’épissage alternatif 95
3.5 L’« editing des transcrits » 96
Points clefs 99
QCM - QROC 101
Réponses 102
4 La traduction des ARN messagers 105

4.1 Le code génétique 106
Le code génétique est dégénéré 106
Le code a été établi expérimentalement 108
Le code est lu sur l’ARN messager dans le sens 5’-3’ 108
Les codons ne sont pas chevauchants 109
Les mutations modifiant le sens des codons 109
Le code génétique est universel 111
4.2 Les principaux acteurs de la traduction 111
Les ARN messagers 112
Les ARN de transfert 112
Le ribosome 116
4.3 La traduction des ARN messagers bactériens 120
Le démarrage (initiation) de la traduction 120
L’étape d’allongement (élongation) de la chaîne
polypeptidique 122
L’arrêt de la synthèse (terminaison) 125
9782100773688-Livre.fm Page VI Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
VI Biologie moléculaire
4.4 La traduction des ARN messagers eucaryotes 125

Le démarrage de la traduction eucaryote 125
Les étapes d’allongement et d’arrêt de la traduction
eucaryote 128
Traduction et demi-vie des ARN messagers eucaryotes 128
Points clefs 131
QCM - QROC 132
Réponses 135
5 Régulation de l’expression des gènes 139

5.1 Principes généraux 139
Les protéines régulatrices : activateurs et répresseurs 139
Le recrutement des ARN polymérases 140
Autres exemples de facteurs de régulation 141
5.2 Régulation chez les procaryotes 142
L’exemple historique : l’opéron lactose 142
Autres exemples 147
La régulation complexe du cycle vital
du bactériophage l 151
5.3 Régulation chez les eucaryotes 156
Les régulateurs transcriptionnels 157
Le contrôle des régulateurs transcriptionnels 161
Le contrôle de l’épissage alternatif des transcrits ARN 164
5.4 Régulation traductionnelle de l’expression
des gènes eucaryotes 165
Éléments de structure des ARN messagers influençant
la traduction 166
Le contrôle général par la phosphorylation des facteurs
de démarrage 167
Les mécanismes spécifiques régulant l’attachement
du ribosome à l’ARN messager 169
Les mécanismes de régulation plus tardifs 170
Les mécanismes de régulation de la traduction
par les micro-ARN 170
9782100773688-Livre.fm Page VII Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
Table des matières VII
L’irrésistible ascension de l’ARN comme régulateur

de l’expression des gènes 174
Points clefs 177
QCM-QROC 179
Réponses 182
6 Techniques de biologie moléculaire 185

6.1 La création de molécules d’ADN recombinant 185
Couper l’ADN : les enzymes de restriction 185
Ligaturer l’ADN 187
6.2 Les vecteurs de clonage 189
Les plasmides 190
Les vecteurs viraux 193
Les cosmides 193
Les chromosomes artificiels bactériens 194
Les vecteurs pour levures 194
Les vecteurs pour les eucaryotes supérieurs 196
6.3 Les banques d’ADN 196
Les banques d’ADN génomique 196
Les banques d’ADN complémentaire 197
6.4 Les techniques d’analyse de l’ADN 197
Le séquençage des acides nucléiques 197
Les nouvelles techniques de séquençage 201
Application au séquençage de l’ARN 203
Application à la métagénomique 205
Une nouvelle révolution dans le séquençage 207
La réaction de polymérisation en chaîne (PCR) 210
La PCR quantitative en temps réel 210
Les techniques d’hybridation des acides nucléiques 213
Les techniques de localisation des sites de liaison à l’ADN 215
6.5 Le criblage de cellules recombinées 217
Criblage par PCR 217
Criblage à l’aide de sites de restriction 218
9782100773688-Livre.fm Page VIII Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
VIII Biologie moléculaire
6.6 Les applications de la technologie de l’ADN recombinant 219

La mutagenèse 219
Le système double-hybride 223
Transfert et expression de gènes eucaryotes
chez les procaryotes 224
Transfert et expression de gènes dans les levures 228
Génie génétique et cellules eucaryotes supérieures 229
Utilisation de vecteurs rétroviraux pour la transfection
des cellules 231
Les gènes rapporteurs et études des séquences promotrices 232
Un nouvel outil remarquable d’ingénierie des génomes :
le système CRISPR-Cas 9 235
Les techniques d’analyse de l’épigénome 239
Points clefs 241
QCM-QROC 243
Réponses 246
Glossaire 249
Index 259
9782100773688-Livre.fm Page 1 Mercredi, 15. novembre 2017 6:13 18
1 Structure
de l’ADN
et de l’ARN
1.1 Les composants des acides nucléiques

1.2 La structure en double hélice de l’ADN
PLAN
1.3 Le nucléosome, la chromatine et les chromosomes

1.4 La structure des génomes
1.5 Les différents types d’ARN
➤ Définir les structures chimiques des acides nucléiques, notamment

OBJECTIFS
celle de la double hélice de l’ADN

➤ Étudier les assemblages complexes auxquels participe l’ADN (nucléosome,
chromatine)
➤ Répertorier d’un point de vue structural et fonctionnel les différents
types d’ARN
1.1 LES COMPOSANTS DES ACIDES NUCLÉIQUES

Les acides nucléiques (ADN et ARN) sont des macromolécules compo-
sées d’un enchaînement d’unités structurales appelées nucléotides.
Ce sont donc des polynucléotides.
À l’état libre, chaque nucléotide est constitué :
➤ d’une base (Fig. 1-1), qui peut être une purine (composée de deux
hétérocycles azotés) ou une pyrimidine (un seul hétérocycle azoté) ;
➤ d’un pentose (ose à cinq atomes de carbone, Fig. 1-2) ;
➤ d’un à trois groupes phosphate (Fig. 1-3).
Les atomes des bases (C et N) portent les chiffres 1 à 6 pour les
pyrimidines et 1 à 9 pour les purines, alors que les atomes C du
pentose portent les chiffres 1’ à 5’. Le signe prime ajouté à ces
derniers les distingue de ceux des bases. L’ose, par son carbone 1’,
établit une liaison N-glycosidique avec l’azote 1 des pyrimidines ou
l’azote 9 des purines. Par son carbone 5’, il forme une liaison ester
avec un premier groupe phosphate (désigné pour cette raison phos-
phate a). Ce dernier peut former des liaisons anhydride d’acide
(Fig. 1-3) avec des groupes phosphate b et g ou des liaisons ester avec
un groupe OH porté par le carbone 3’ du pentose précédent (Fig. 1-4).
2 Chapitre 1 • Structure de l’ADN et de l’ARN
H H
O
N
N C N C
7 6 7 C5 6
C5 1 N 1 N H
H C 8 H C 8
4 2 4 2
9 C 3 C H
9 C 3 C
N N N N N H
H
Adénine Guanine
(6 aminopurine) (2 amino, 6 oxopurine)
H H
N O
H C H3C C H
4 4
C5 3 N C5 3 N
2
C6 1
2
C C6 1 C
O O
H N H N
Cytosine Thymine
(2 oxo, 4 aminopyrimidine) (5méthyl-uracile)
H H
O
N
H 3C C H C H
4 4
C5 3 N C5 3 N
6 2 6 2
C 1 C C 1 C
O O
H N H N
5 méthyl-cytosine Uracile
(2,4 dioxopyrimidine)
Figure 1-1 Structures chimiques des bases puriques (Adénine, Guanine) et des
bases pyrimidiques (Cytosine, Thymine, Uracile) des acides nucléiques ADN et ARN.
Des formes méthylées peuvent aussi être rencontrées (5-méthyl cytosine).
L’union d’une base et d’un pentose s’appelle un nucléoside. Dès

qu’un groupe phosphate est présent, l’ensemble est désigné par le
terme nucléotide. Il en résulte toute une nomenclature dont un
exemple est donné (Fig. 1-3).
1.1 • Les composants des acides nucléiques 3
5' CH2 OH O OH 5' CH 2 OH O OH
4' C H H C 1' 4' C H H C 1'
3' C C 2' C C
H H 3' 2'
H H
OH OH OH H
β-D-ribose β-D-désoxyribose
Figure 1-2 Les deux pentoses respectifs de l’ARN et de l’ADN.
H H
N
N C
- - O- H
7
C5 6
N
O O 1
- γ β α H C 8
O P O P O P O C H 4 2
5' 9 C 3 C
O O O O H
N N
4' C C 1'
H H
H
3'
C C 2'
OH H
Base (A)
Désoxyribonucléoside (dA)
Désoxyribonucléoside 5' monophosphate (dAMP)
Désoxyribonucléoside 5' diphosphate (dADP)
Désoxyribonucléoside 5' triphosphate (dATP)
Figure 1-3 Structure détaillée d’un désoxyribonucléoside triphosphate. En

remplaçant la lettre A (Adénine) par les lettres G, C, T/U et le désoxyribose par
le ribose, la nomenclature est généralisable à tous les nucléotides de l’ADN et
de l’ARN.
La structure des nucléotides

Dans l’ADN, l’ose est le 2’-désoxyribose (Fig. 1-2) et les nucléotides
sont des désoxyribonucléosides monophosphates (Fig. 1-4). Ils ne
comportent qu’un seul groupe phosphate (le phosphate a) ;
➤ Les bases puriques de l’ADN sont l’adénine et la guanine.
➤ Les bases pyrimidiques de l’ADN sont la cytosine et la thymine
(Fig. 1-1).
a) O- H O- H
O O
P O C H P O C H
5' O A O-
5' O A
O-
C H C H H C
H C
H H
3' C C 3' C C
H H
O H O H
O O
P O C H P O C H
5' O T O-
5' O T
O-
C H C H H C
H C
H H
3' C C 3' C C
OH H H
POLYMÉRASE O H
O
P O C H
O-
5' O C
O- O- O- H
γ
-O P O P β O Pα O C H
C H H C
5' O C H
O O O 3' C C
4' C H H C1' OH H
H
3' C C2' O- O-
γ
OH H + - O P O Pβ O -
O O
pyrophosphate
b) A T C A C
T
3' 3' 3' POLYMÉRASE 3' 3' 3'
P
P
P P OH P OH P P P OH
5' 5' 5' 5' 5' 5'

O- O-
γ β
+ -O P
O
P
O-
O O
pyrophosphate
Figure 1-4 Principe de la formation d’un brin d’ADN par la polymérisation des
nucléotides. Noter que le brin matrice qui est normalement copié n’est pas ici
représenté. a) représentation développée ; b) représentation simplifiée.
Dans l’ARN, l’ose étant un ribose (Fig. 1-2), les nucléotides sont
des ribonucléosides monophosphates. Dans l’ARN, l’uracile remplace
la thymine. Dans l’ADN, la cytosine peut être méthylée sur le
carbone 5 pour donner la 5-méthyl-cytosine (Fig. 1-1). Les cytosines
méthylées sont souvent présentes dans des régions de séquences ADN
1.2 • La structure en double hélice de l’ADN 5
riches en répétition de nucléotides à guanine et cytosine (les îlots à

dinucléotides CpG).
La structure des polynucléotides

La structure d’un polynucléotide (polymère de nucléotides) repose sur la
formation d’un nombre parfois élevé (plusieurs millions) de liaisons
phosphodiester entre les nucléotides constitutifs (Fig. 1-4). Chaque
liaison phosphodiester s’établit entre le groupe OH du carbone 3’
d’un pentose et le groupe OH porté par le carbone 5’ du pentose
suivant. C’est la liaison phosphodiester 3’-5’. Il en résulte que l’orien-
tation du polynucléotide se trouve définie par la position du groupe
phosphate libre du premier nucléotide, généralement le phosphate
porté par le carbone 5’, et par le groupe OH libre porté par le carbone 3’
du dernier nucléotide. On dit ainsi que le polynucléotide est orienté
dans le sens 5’ vers 3’ (Fig. 1-4, voir aussi Fig. 1-6).
1.2 LA STRUCTURE EN DOUBLE HÉLICE DE L’ADN

La règle de Chargaff et les appariements
complémentaires
L’ADN est un acide nucléique bicaténaire, c’est-à-dire constitué de
deux brins associés par des liaisons hydrogène entre les bases. Les
liaisons hydrogène s’établissent toujours entre une purine de l’un des
brins et une pyrimidine de l’autre brin. Dans cet appariement complé-
mentaire, l’adénine (A) est toujours associée à la thymine (T) par deux
liaisons hydrogène et la guanine (G) interagit avec la cytosine (C) grâce
à trois liaisons hydrogène (Fig. 1-5).
Règle d’Erwin Chargaff. Le nombre de thymines est égal au nombre

d’adénines et celui des cytosines au nombre de guanines.
Ainsi, dans l’ADN, la quantité des purines (A+G) est égale à

celle des pyrimidines (C+T). Par contre le rapport A+T sur G+C
varie selon l’origine de l’ADN (Tableau 1-1). Le principe d’appa-
riement complémentaire des bases a une grande valeur pratique : il
permet au biologiste de déterminer avec exactitude la séquence
nucléotidique d’un brin d’ADN dès lors qu’il connaît celle du brin
complémentaire, qu’il s’agisse d’un brin ADN ou d’un transcrit ARN
(voir chap. 3).
L’orientation d’un brin d’ADN est définie par la présence des groupes
chimiques 5’-phosphate et 3’-OH portés par les carbones 5’ et 3’ des
deux désoxyriboses extrêmes (Fig. 1-6 a). Dans la double hélice, les
0,29 nm
7
8
5 4
0,30 nm
6 5 9
6 C 3 1
G 4
1 2 2 3
0,29 nm
1,08 nm
0,28 nm
7
8
5 4 0,30 nm 6 5 9
6
1
T2 3 1 A 4
2 3
1,11 nm
Figure 1-5 Appariements complémentaires

des bases G-C et A-T.
TABLEAU 1-1 COMPOSITION EN BASES

DE L’ADN DE DIFFÉRENTES ORIGINES
Bases (%)
Origine de l’ADN (A+T)/(G+C) (A+G)/(T+C) %GC
A G C T
Bactériophage T7 26,0 23,8 23,6 26,6 1,11 0,99 47,4
Escherichia coli B 23,8 26,8 26,6 23,1 0,88 1,01 53,2
Neurospora 23,0 27,1 26,6 23,3 0,86 1,00 53,8
Drosophile 30,7 19,6 20,2 29,5 1,51 1,01 39,8
Saumon 28,0 22,0 20,0 27,8 1,33 1,05 42.0
Poule 28,0 22,0 21,6 28,4 1,29 1,00 43,6
Rat 28,6 21,4 21,6 28,4 1,33 1,00 42,9
Vache 27,3 22,5 22,5 27,7 1,26 0,99 43,0
Homme 29,3 20,7 20,0 30,0 1,46 1,00 40,7

deux brins complémentaires d’ADN sont orientés en sens inverse

(Fig. 1-6). On dit qu’ils sont antiparallèles.
a) Extrémité 3'
Extrémité 5'
H OH
3'
O- 5' O-
O
O O
P O CH2 O H2C O P
O- O
H
H
O O-
O O O
P O CH2 O H2C O P
O- O
H
H
O O-
O O O
P O CH2 O H2C O P
O- O
H
H
O O-
O O O
P O CH2 O H2C O P
5'
O- O-
3'
OH H
Extrémité 5'
Extrémité 3'
Extrémité 3'
b) Extrémité 5'
P HO
3' 3'
5' 5'
P P
3' 3'
5' 5'
P P
3' 3'
5' 5'
P P
3' 3'
5' 5'
HO P
Extrémité 5'
Extrémité 3'
Figure 1-6 Structure des appariements complémentaires de deux brins anti-
parallèles d’ADN. a) Représentation développée ; b) représentation simplifiée.
L’association des deux brins par des liaisons hydrogène génère une
contrainte physique qui impose à l’ensemble l’adoption d’une struc-
ture en double hélice (Fig. 1-7). Dans le modèle original, proposé
par James Watson et Francis Crick en 1953, la double hélice a un
diamètre de 2 nm et présente deux périodicités. La première de 0,34 nm,
correspond à la distance séparant deux plateaux de bases appariées.
La seconde de 3,4 nm correspond au pas de l’hélice qui couvre une
longueur de 10,5 plateaux de bases (Fig. 1-7). À la surface de la molé-
cule d’ADN, les deux brins torsadés ménagent deux sillons hélicoïdaux
de largeur différente, un sillon majeur ou grand sillon et un sillon mineur
ou petit sillon (Fig. 1-7). Ces deux sillons, tout particulièrement le
grand sillon, exposent de nombreux groupes chimiques avec lesquels
interagissent dans les conditions physiologiques de la cellule des
protéines dites de liaison à l’ADN. Ces protéines jouent des rôles de
régulation de l’expression de l’information génétique portée par la
séquence en bases proprement dite (voir chap. 5).
0,34 nm Sillon
majeur
(1,2 nm)
3,54 nm
Sillon mineur
(0,6 nm)
2,37 nm
Sens d'enroulement
Figure 1-7 Représentation d’un fragment d’ADN en double hélice. À gauche,

avec les plateaux de bases ; à droite, les atomes sont représentés avec leurs
rayons de Van der Waals.
Les différentes formes d’ADN

En principe, les deux brins polynucléotidiques peuvent former une
hélice de pas droit (forme dextre) ou une hélice de pas gauche (forme
senestre). La première forme est la plus fréquente et existe en deux
variantes, l’ADN-A et l’ADN-B, qui diffèrent, entre autres, par la

taille de leurs hélices (Fig. 1-8). L’ADN-A a un diamètre plus large
(2,6 nm) que l’ADN-B (2 nm). Il est plus compact avec une distance
de 0,23 nm entre deux plateaux de bases successifs (11 plateaux par
tour). La forme A est observée notamment dans les hélices hybrides
ADN-ARN. En solution et dans la cellule, c’est la forme B de l’ADN
qui est prédominante. Une forme senestre de l’ADN étirée en zigzag
(ADN-Z), avec un diamètre de 1,8 nm, est parfois observée (Fig. 1-8),
mais sa signification physiologique reste incertaine.
Sens de l'enroulement
ADN A ADN B ADN Z
2,53 nm
11 paires de
bases par 3,54 nm
tour d'hélice 10,4 paires de
bases par 4,56 nm
tour d'hélice 12 paires de
bases par
tour d'hélice
2,55 nm
2,37 nm
1,84 nm
Figure 1-8 Représentation simplifiée des formes A, B et Z de l’ADN.
Dissociation et réassociation des brins d’ADN

En chauffant une solution d’ADN, l’agitation thermique provoque
la rupture des liaisons hydrogène et la séparation des deux brins
(Fig. 1-9 a). Cette dissociation est mise en évidence par la mesure de
l’absorption de la lumière ultraviolette à 260 nm (longueur d’onde
d’absorption maximale des bases puriques et pyrimidiques, due aux
systèmes des doubles liaisons conjuguées liant les atomes des hétéro-
cycles). Sous sa forme bicaténaire (en double hélice) l’ADN absorbe
modérément la lumière UV. Après dissociation des deux brins, sous
une forme monocaténaire, le démasquage des bases provoque une
absorption plus marquée de la lumière UV. L’enregistrement du

phénomène à 260 nm fournit une courbe en forme de sigmoïde,
typique de la dissociation de l’ADN (Fig. 1-9 b).
a)
dénaturation renaturation
(chaleur, urée) (baisse T°)
Absorbance de l'ADN à 260 nm
ADN monocaténaire
b)
100
(unités arbitraires)
Dénaturation (%)
50
ADN
bicaténaire
Tm Température (°C)
Tm = 69,3 + 0,41(% G + C)
Teneur en bases G+C (%)
100
c)
80
60
E.coli B
40
Homme
20 Tetrahymena
0 Tm (°C)
70 80 90 100 110
Figure 1-9 La dissociation de l’ADN et sa réassociation dépend de sa teneur en

G+C. a) Représentation simplifiée de la dissociation-réassociation de l’ADN sous
l’action d’agents dénaturants ; b) représentation simplifiée de la courbe sigmoïde
témoin du processus de dissociation. La formule établit la relation entre la teneur
en G+C de l’ADN et la température de fusion de l’ADN ; c) droite reliant teneur en
G+C et Tm de divers organismes.
La température pour laquelle on observe la dissociation de la moitié

des molécules d’ADN est dénommée température de fusion ou
Tm (« melting Temperature »).
Plus un ADN est riche en bases G et C qui sont appariées par des
triples liaisons hydrogène, plus grande sera l’énergie nécessaire pour
les rompre et plus élevée sera la température de fusion. À l’inverse, un
ADN riche en bases A et T liées par seulement deux liaisons hydro-
gène, aura une température de fusion plus basse. La présence d’ions
ou d’agents déstabilisants (urée ou formamide) peut modifier la Tm.
La teneur globale en bases G+C est une caractéristique variable suivant les grands
groupes d’organismes (Fig. 1-9 c). Cela ne préjuge pas cependant de la distribution
des paires AT et GC, souvent irrégulière, tout au long de la séquence.
Dans certaines conditions expérimentales, les deux brins de l’ADN
dissocié peuvent se réassocier et former à nouveau une double hélice.
Le phénomène s’observe lors d’un refroidissement lent de la solution
d’ADN préalablement chauffée (Fig. 1-9 a). Il est exploité pour réasso-
cier des brins d’ADN d’origine différente. On parle d’hybridation molé-
culaire, et cette propriété est largement exploitée dans la recherche de
séquences particulières dans l’ADN d’espèces différentes ou dans le
génome d’une même espèce. Des duplex hybrides peuvent aussi se
former de cette manière avec l’ARN et cette propriété est largement
exploitée expérimentalement. La dissociation thermique de l’ADN suivie
de sa réassociation par refroidissement est une étape de base utilisée dans
la réaction de polymérisation en chaîne (voir chap. 6).
Les surenroulements de l’ADN
Du fait même que l’ADN est un polymère flexible, sa structure

dépend largement de son environnement salin et aussi des protéines
avec lesquelles il peut se complexer.
Sous la forme linéaire souvent observée dans la plupart des cellules,

les extrémités de l’ADN sont libres et les contraintes physiques intro-
duites par ses divers ligands sont, pour cette raison, facilement ajustées.
L’ADN peut cependant exister sous une forme circulaire, c’est-à-dire
sans extrémités libres. C’est le cas de l’ADN bactérien, de beaucoup
d’ADN viraux et de l’ADN mitochondrial et chloroplastique ou de
levure (Tableau 1-2). C’est aussi le cas des plasmides, petits chromo-
somes bactériens surnuméraires capables de s’auto-répliquer de
façon autonome. L’ADN circulaire subit des contraintes physiques
qui sont amoindries par un jeu de surenroulements parfois nombreux

afin de stabiliser la molécule d’ADN dans son ensemble (Fig. 1-10).
Topoisomérases
Figure 1-10 Exemple du surenroulement de l’ADN circulaire d’un plasmide

bactérien et sa résolution par les topoisomérases.
TABLEAU 1-2 TOPOLOGIE DE L’ADN DE DIVERSES ORIGINES
Simple brin (S) Circulaire

Source Taille*
ou double brin (D) ou linéaire
Virus Simien 40 D circulaire 5243 pb
Virus X-f174 S circulaire 5386 b
Bactériophage M13 S circulaire 6407 b
Adénovirus AD-2 D linéaire 35 937 pb
Virus Epstein-Barr D circulaire 172 282 pb
Bactériophage T2 D linéaire 1,7 ¥ 105 pb
Escherichia coli D circulaire 4,7 ¥ 106 pb
Drosophile D « linéaire » 6,5 ¥ 107 pb
(*) b = base ; pb = paire de bases.

1.3 • Le nucléosome, la chromatine et les chromosomes 13
Dans l’ADN de très grande longueur des cellules eucaryotes, malgré

la linéarité de la molécule, les contraintes topologiques demeurent au
sein de la chromatine (voir plus loin). Il est donc important que ces
contraintes soient réduites afin que les processus fondamentaux que
sont la réplication et la transcription de l’ADN soient rendus possibles.
Une classe spéciale d’enzymes, nommées topoisomérases, peut intro-
duire des cassures spécifiques dans l’un ou l’autre brin ou même les deux.
Ces cassures réduisent les contraintes, relâchent les surenroulements et
rendent possibles les processus physiologiques.
Ceci est particulièrement important lors du processus nécessaire à la séparation des
deux molécules d’ADN résultant de la réplication et qui sont encore liées l’une à l’autre
avant leur adressage aux deux cellules résultant de la division cellulaire.
1.3 LE NUCLÉOSOME, LA CHROMATINE ET LES CHROMOSOMES

La structure du nucléosome
Dans les cellules eucaryotes, à la différence des procaryotes, l’ADN
est très fréquemment associé à des protéines basiques, les histones.
Le résultat de l’assemblage régulier entre ADN et histones est désigné

par le terme de nucléosome (Fig. 1-11).
a) b)
ADN Histone H1
Octamère d'histones Nucléosome
c)
Queues
N-terminales
ADN
2 x H2A
2 x H2B
2 x H3
Octamère
d'histones 2 x H4
Figure 1-11 Structure simplifiée d’un nucléosome. a) L’octamère d’histones ;

b) l’enroulement de l’ADN autour de l’octamère et sa consolidation par l’histone H1 ;
c) protubérance vers l’extérieur des queues N-terminales d’histones de l’octamère.
La formation des nucléosomes est la première étape d’un processus

qui assure l’empaquetage de l’ADN en structures compactes réduisant
énormément le volume occupé par la molécule. L’ensemble est désigné
sous le terme de chromatine.
Chacune des classes d’histones est constituée de petites protéines
riches en amino-acides chargés positivement (lysine et arginine). Leurs
séquences en amino-acides sont restées remarquablement identiques
au cours de l’évolution. Les histones H2A, H2B, H3 et H4 (11 à
15 kDa) sont en quantité égale et chacune en double exemplaire, elles
forment un octamère d’histones (Fig. 1-11 a) constituant un « cœur »
protéique discoïde autour duquel l’ADN nucléosomal d’une taille de
147 paires de bases est enroulé (Fig. 1-11 b). L’histone H1 (20 kDa)
ne fait pas partie du « cœur ». Elle est attachée d’une part, à l’ADN de
liaison situé entre les nucléosomes et, d’autre part, à l’ADN nucléo-
somal ce qui a pour effet de consolider l’ensemble (Fig. 1-11 et 1-12).
Nucléosome
ADN
Octamère
d'histones
ADN
internucléosomique
(20 - 60 pb)
Histone H1
Octamère Histone H1
d'histones
ADN
Figure 1-12 Représentation simplifiée d’un enchaînement de trois nucléosomes

montrant le rôle de l’histone H1 dans le resserrement de l’ADN autour de l’octa-
mère d’histones.
De nombreux contacts existent entre les histones de l’octamère et l’ADN

nucléosomal. Ils sont indépendants de la séquence en bases de l’ADN,
ce qui explique que la presque totalité de l’ADN des cellules euca-
ryotes est organisée en nucléosomes. Les histones du cœur possèdent

des extrémités N-terminales libres, désignées par le terme de « queues ».
Ces queues émergent du nucléosome en des positions très précises
(Fig. 1-11c). Elles facilitent la formation des structures d’ordre supé-
rieur résultant des surenroulements de nucléosomes donnant la struc-
ture finale de la chromatine (Fig. 1-13). Certains amino-acides des
queues d’histones sont parfois modifiés par des groupes acétyle et
méthyle (lysine, arginine) ou phosphate (sérine). Ces modifications
facilitent ou altèrent l’accessibilité de la chromatine. Elles constitue-
raient un « code » lu par les protéines impliquées dans la régulation
de l’expression des gènes et dans les diverses autres fonctions de
l’ADN. Les nucléosomes sont des structures dynamiques, constamment
modifiées par de nombreux complexes protéiques de remodelage
capables de les déplacer le long de la molécule d’ADN, de les trans-
férer d’une molécule d’ADN à une autre ou de les modifier afin
d’accroître l’accessibilité de l’ADN.
La structure et le remodelage de la chromatine

La présence de l’histone H1 solidifie et resserre la structure du nucléo-
some. L’ADN nucléosomal représente alors 160 pb. L’histone H1 favo-
rise aussi la formation de structure d’ordre supérieur. Les nucléosomes
s’organisent alors en une fibre de 30 nm de diamètre qui est en fait une
super-hélice comportant 6 nucléosomes par tour. Ceci ne suffit pas
cependant pour empaqueter les 1 à 2 mètres d’ADN dans un noyau
cellulaire de 10 –5 mètre de diamètre. Des repliements en forme de
boucles de la fibre de 30 nm sont donc nécessaires. Les boucles seraient
maintenues dans un ensemble compact par leur association à un support
protéique, aujourd’hui remis en question (Fig. 1-13).
Le modèle présenté à la Figure 1-13 malgré ses vertus pédagogiques donne une
vision trop simpliste de l’organisation tridimensionnelle de la chromatine et des
chromosomes. En effet, de récentes analyses biophysiques très performantes
(tomographie par microscopique électronique, cryo-microscopie électronique,
diffraction des rayons X aux petits angles) montrent que les chromosomes sont plus
élastiques que ne laisse supposer le schéma présenté et surtout que l’ADN y
contribue autant que les protéines. Ces analyses excluent la possibilité que les chro-
mosomes soient construits à partir d’un improbable échafaudage protéique ; ils
posséderaient plutôt les propriétés d’une tresse d’ADN et de protéines. Les observa-
tions indiquent que les fibres de chromatine s’entrecroisent et sont à de fréquents
intervalles liées entre elles par un complexe protéique de condensine jouant le rôle
de liant. Par ailleurs, ni la fibre de 30 nm ni aucune autre organisation hiérarchique
n’est observée avec ces techniques modernes. La structure la plus probable serait
donc celle d’une chaîne de nucléosomes dont l’auto-organisation serait modulée
grâce aux seules contraintes imposées par le complexe protéique de la condensine.
Double hélice d'ADN

(2 nm)
Nucléosomes formant
11 nm une structure en
« collier de perles »
Fibre compactée de
chromatine de 30 nm
de diamètre.
Structure en solénoïde
(6 nucléosomes/tour)
Filament de 300 nm
de diamètre.
Domaine en boucles
Support protéique
Filament superenroulé
de 700 nm de diamètre
Chromosome
métaphasique condensé
(1 400 nm)
Figure 1-13 Modèle hypothétique de l’organisation et de la compaction de la

chromatine.
La structure des chromosomes et le cycle cellulaire

Dans les cellules eucaryotes, le chromosome est le stade supérieur et
ultime d’organisation de l’ADN (voir Fig. 1-13).
Le nombre de chromosomes et leur composition sont des carac-

téristiques de chaque organisme.
Le séquençage complet d’un certain nombre de génomes a

montré que la quantité d’ADN effectivement utilisé pour coder les
protéines ou les ARN varie énormément d’un organisme à un autre.
Chez les bactéries, la presque totalité de l’ADN code des protéines
et des ARN. Chez les mammifères, seule une petite portion (moins
de 10 %) code réellement les protéines ou les divers ARN, le reste
ou ADN intergénique, est constitué largement de séquences répé-
tées (souvent des dinucléotides), appelées microsatellites (3 %) ou
composées de grands éléments de séquences transposables (plus
de 50 %).
La nécessaire et exacte duplication de la totalité de l’ADN à chaque division cellulaire

et le fait que 80 % serait effectivement transcrit en ARN (voir Mini-manuel de Génétique,
projet ENCODE) militent en faveur d’un rôle biologique majeur de l’ADN intergénique,
même s’il est encore largement incompris.
Pour être maintenu comme tels au cours de la division cellulaire,
chaque chromosome chez les eucaryotes doit posséder un centromère,
des télomères et plusieurs origines de réplication.
Les origines de réplication sont les nombreux sites (3 000 par chromo-
some en moyenne) où s’assemblent les divers composants protéiques,
dont les ADN polymérases (voir chap. 2), nécessaires au démarrage
de la réplication (duplication de l’ADN) opération qui précède la division
cellulaire.
Les centromères sont des séquences d’une taille supérieure à 40 kb
au contact desquelles se construit le kinétochore, un complexe
protéique nécessaire à la séparation et l’adressage corrects des deux
chromosomes-fils aux deux cellules filles.
Il est essentiel qu’un seul centromère soit présent par chromosome. Dans le cas
contraire, il en résulte des cassures, des pertes ou des duplications de chromosomes
dont les conséquences sont généralement graves.
Les télomères sont des séquences particulières localisées aux deux
extrémités du chromosome. Elles sont reconnues par des protéines
spécifiques qui protègent le chromosome des événements de recom-
binaison ou de dégradation, typiques des extrémités ADN libres. À
l’endroit des télomères se trouve une origine de réplication parti-
culière reconnue par une ADN polymérase spéciale, la télomérase,
qui réplique un certain nombre de fois la séquence correspondante
(voir chap. 2).
La duplication du chromosome puis sa ségrégation s’opèrent dans
des phases distinctes du cycle cellulaire. On distingue dans l’ordre
4 phases : G1, S, G2 et M (Fig. 1-14).
a) Mitose
Ségrégation des
chromatides soeurs
Entrée en
M
Ségrégation des quiescence
G2
chromosomes en
préparation
S G1
Duplication
de l'ADN
Duplication Division cellulaire

en chromosomes en préparation
b)
2Q
Quantité d'ADN
G1 S G2 M
Temps
Interphase
Interphase
Figure 1-14 Chromosomes et cycle cellulaire. a) Duplication et ségrégation des

chromosomes au cours du cycle cellulaire. b) Variation de la quantité d’ADN « Q »
au niveau des chromosomes à un instant t dans la cellule. Par simplification, l’ADN
est représenté sous forme de chromosomes à toutes les phases du cycle.
Au cours de la phase S s’opère la synthèse de l’ADN conduisant à

la duplication des chromosomes en deux chromatides sœurs mainte-
nues ensemble par un complexe protéique appelé cohésine, jusqu’à la
ségrégation.
Celle-ci s’opère durant la phase M (pour mitose). Chaque chroma-
tide s’attache grâce au kinétochore au fuseau mitotique fait de
protéines fibreuses appelées microtubules réunis aux centrosomes
situés aux deux pôles de la cellule. La désagrégation de la cohésine
favorise la séparation des deux chromatides sœurs. L’ensemble des
opérations est soigneusement coordonné afin que la séparation assure
un transfert complet et efficace des informations génétiques portées
par les deux chromosomes-fils.
1.4 • La structure des génomes 19
Les phases G1 et G2 (G pour gap) sont des phases de préparation

où des mécanismes de contrôle du cycle opèrent qui autoriseront ou
non sa poursuite jusqu’à son terme.
Au cours du processus complet de la division cellulaire, l’état de
condensation des chromosomes varie profondément. Durant les pha-
ses G1, S et G2 (groupées sous le terme d’interphase) il est plus faible
que durant la phase M bien que des changements discrets se produisent
constamment.
1.4 LA STRUCTURE DES GÉNOMES

Qu’est-ce qu’un génome ?
On désigne par le terme de génome (contraction des mots gène et
chromosome) l’ensemble des informations génétiques, codées par
l’ADN chez la plupart des organismes et parfois par l’ARN pour
certains virus. De façon plus précise, le terme désigne la séquence de
l’ADN correspondant à un jeu haploïde de chromosomes (n chromo-
somes). Une cellule somatique humaine, diploïde (2n chromosomes),
contient donc deux génomes (un génome paternel et un génome
maternel) alors qu’une cellule germinale (sexuelle), haploïde (ovule
ou spermatozoïde), en contient un seul. Le terme génome s’applique
aussi bien à l’ADN du noyau cellulaire (génome nucléaire) qu’à l’ADN
des organites (génome mitochondrial, génome chloroplastique).
On parle de génomique (contraction des mots génome et informa-
tique) pour désigner l’étude à grande échelle des propriétés générales
des génomes grâce à des moyens informatiques de plus en plus puissants.
Les premières questions intéressant l’étude des génomes portent sur
leur taille, le nombre de gènes qu’ils contiennent (au sens classique
du concept), le nombre de chromosomes constitutifs et la manière
dont les gènes sont distribués ou organisés.
La taille des génomes
Pour désigner la taille d’un génome on utilise habituellement une unité
exprimant le nombre de paires de nucléotides. Pour le millier de paires
de nucléotides ou de bases soit 103, l’unité est la kilopaire de bases
ou Kpb, pour le million soit 106, l’unité est la mégapaire de bases ou
Mpb. On pensait généralement qu’il existait une relation progressive
entre la taille des génomes, le nombre de gènes qu’ils contiennent et
la complexité des groupes d’organismes vivants (Fig. 1-15, Tableau 1-3).
En vérité, plus la connaissance intime de la structure et du fonctionne-
ment des génomes progresse, plus cette relation s’avère inexacte. En
effet, l’organisation des instructions génétiques au sein des génomes et
surtout leur mode d’expression semblent à la fois très diversifiés et
variables selon les organismes.
Plantes
Oiseaux
Mammifères
Reptiles
Amphibiens
Poissons osseux
Poissons cartilagineux
Echinodermes
Crustacés
Insectes
Mollusques
Vers
Moisissures
Algues
Champignons
Bactéries Gram+
Bactéries Gram–
Mycoplasmes
102 103 104 105 106 107 108
(en kb)
Figure 1-15 Quantité d’ADN présent dans les génomes de différents groupes d’organismes.
Structure Nombre
Génome Groupe Taille (kb)
du génome de gènes
Eucaryotes :
Saccharomyces Levures 13 500 (L) 6 000
cerevisae
Caenorhabditis Nématode 100 000 (L) 13 500
elegans
Arabidopsis Plante 120 000 (L) 25 000
thaliana
Homo sapiens Humain 3 000 000 (L) 22 000
Procaryotes :
Escherichia coli Bactérie 4 700 (C) 4 000
Haemophilus Bactérie 1 830 (L) 1 703
influenza
Methanococcus Bactérie 1 660 (L) 1 738
jannaschii
Virus :
Virus T4 Virus 172 (L/C) 300
bactérien
HCMV (virus Virus 229 (L) 200
de l’herpès) eucaryote
Organites
Mitochondrie Levure 78 (C) 34
de S. cerevisae
Mitochondrie Humain 17 (C) 37
de H. sapiens
Chloroplaste Plante 121 (C) 136
Séquences répétées Exons L : Linéaire

Introns C : Circulaire
TABLEAU 1-3 GÉNOMES DE DIVERS ORGANISMES : STRUCTURE, TAILLE

ET ESTIMATION DU NOMBRE DE GÈNES.
1.4 • La structure des génomes 21
Les génomes viraux

Bien que les virus ne soient pas considérés comme des organismes
vivants mais comme des parasites moléculaires, ils se reproduisent en
infectant des cellules vivantes dans lesquelles ils injectent leur génome
constitué par de l’ADN tels les adénovirus, protégé au sein d’une parti-
cule ou capside de nature essentiellement protéique. Certains virus,
comme les rétrovirus auxquels se rattache par exemple le VIH, ont un
génome constitué d’ARN. Quel que soit l’acide nucléique, il est pour
certains virus, sous une forme linéaire et pour d’autres, sous une forme
circulaire. Dans tous les cas, le génome viral existe au moins dans une
des phases de son cycle sous la forme d’un ADN double brins.
Les génomes viraux géants. Découverts récemment, les Mimivirus et Pandoravirus para-
sites d’eucaryotes unicellulaires (amibes) possèdent des génomes géants, parfois plus
grands (plus de 106 Kpb) et plus complexes (plus de 1 000 gènes) que des génomes
bactériens. Avec la découverte de l’existence de virus de virus (des « virophages » en
quelque sorte) ces nouveautés biologiques n’obligent-elles pas à réviser la place des
virus dans l’échelle du vivant ? À la conception du virus « parasite moléculaire non
vivant » ne faudrait-il pas substituer l’idée que les virus posséderaient les propriétés du
vivant à l’exclusion de la cellularité ?
Les génomes procaryotes

Le génome de la plupart des organismes procaryotes correspond à un
seul chromosome composé d’un ADN souvent circulaire et de très
peu de protéines associées. Une bactérie en cours de division peut
cependant contenir simultanément plusieurs copies de ce chromo-
some unique. Entre les gènes bactériens, il y a peu d’espaces intergé-
niques. Les gènes sont souvent organisés en unités, les opérons,
transcrits en un seul ARN messager (voir Fig. 4-3). L’ADN associé à
quelques protéines forme une masse dense, le nucléoïde qui se désor-
ganise en un écheveau filamenteux lorsque la cellule est broyée.
Un grand nombre de bactéries possède en supplément du chromo-
some bactérien des plasmides, éléments d’ADN circulaires et double
brins. Ces molécules d’ADN extrachromosomique peuvent se répliquer
indépendamment et bien qu’elles ne portent pas de gènes essentiels au
métabolisme de la bactérie, elles peuvent lui apporter des avantages
évolutifs comme la résistance à un antibiotique. En général, les bactéries
possèdent un ou plusieurs plasmides dont le nombre de copies varie.
Les génomes eucaryotes
Les espèces eucaryotes sont soit diploïdes (les cellules somatiques
des animaux et plantes à fleurs possèdent dans leur noyau, deux jeux
– 2n – de chromosomes) ou haploïdes (un seul jeu – n – de chromo-
somes par noyau cellulaire chez la plupart des champignons et les
algues). Les organismes diploïdes produisent généralement des cellules

spécialisées, les gamètes, haploïdes (n chromosomes) pour la repro-
duction (ovule et spermatozoïde chez les animaux) alors que les orga-
nismes haploïdes peuvent présenter au cours de la phase sexuée de
leur cycle vital des cellules spécialisées à 2n chromosomes. Le
nombre n de chromosomes présents dans les cellules d’un organisme
définit le niveau de ploïdie. Certains organismes (les végétaux
souvent) présentent des niveaux de ploïdie élevés (polyploïdie).
Dans une cellule diploïde, les chromosomes sont présents par paires
homologues qui possèdent une taille et un nombre de gènes identi-
ques aux mêmes positions. Le terme de caryotype est utilisé pour
désigner le nombre de chromosomes, établi par l’observation micros-
copique d’une cellule en métaphase. Au sein d’un génome, les chro-
mosomes peuvent différer fortement en taille et en nombre de gènes
portés. Chez l’homme, les chromosomes 1 (247 Mpb ; 2 200 gènes) et
2 (243 Mpb ; 1 400 gènes) ont une grande taille alors que les chromo-
somes 21 et 22 sont cinq fois plus petits (environ 48 Mpb) avec
respectivement 300 et 540 gènes. On constate qu’il n’y a pas de lien
direct entre la taille d’un chromosome et le nombre de gènes présents.
Le chromosome 19 est celui qui possède la plus forte densité de
gènes, 1 500 gènes qui se répartissent sur 64 Mpb.
Les génomes d’organites

À côté des chromosomes nucléaires qui représentent l’essentiel du
génome d’un organisme eucaryote, certains organites (les mitochon-
dries et les chloroplastes, présents parfois en grand nombre dans une
cellule) possèdent des chromosomes circulaires, d’une taille moyenne
avoisinant 104 à 105 paires de bases, souvent en de nombreuses copies
identiques. Pour ces raisons, il arrive que selon les organismes, le
nombre de génomes d’organites par cellule s’avère très élevé jusqu’à
plusieurs centaines parfois. En général, les génomes d’organites
possèdent de l’ordre de 50 à 100 gènes dont certains avec des introns.
Ces gènes sont spécifiques des fonctions assurées par l’organite lui-
même. Mais beaucoup des fonctions de l’organite sont spécifiées par
des gènes nucléaires sans qu’il y ait de redondance entre les gènes des
deux compartiments, mais plutôt une complémentarité.
Les épigénomes. La notion d’épigénome est une réponse, partielle sans doute, à la
question fondamentale posée en particulier chez l’homme : pourquoi les cellules d’un
individu diffèrent-elles d’un tissu à l’autre (et parfois au sein d’un même tissu), alors
qu’elles ont toutes le même génome nucléaire ?
Concrètement le terme « épigénome » désigne l’ensemble des marques (ou modifica-
tions chimiques) apposées sur les principaux constituants du génome (ADN et
histones) sans modification de la séquence en bases de l’ADN. Ces marques dites

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9782100773688-Livre.fm Page I Mercredi, 15.

novembre 2017 6:13 18

© Dunod, Paris, 2007, 2011, 2015, 2018

Table des matières

1 Structure de l’ADN et de l’ARN 1

2 Réplication, réparation, recombinaison et transposition

Table des matières V

3.3 La transcription chez les eucaryotes 82

4 La traduction des ARN messagers 105

4.4 La traduction des ARN messagers eucaryotes 125

5 Régulation de l’expression des gènes 139

Table des matières VII

L’irrésistible ascension de l’ARN comme régulateur

6 Techniques de biologie moléculaire 185

VIII Biologie moléculaire

6.6 Les applications de la technologie de l’ADN recombinant 219

1.1 Les composants des acides nucléiques

1.3 Le nucléosome, la chromatine et les chromosomes

➤ Définir les structures chimiques des acides nucléiques, notamment

celle de la double hélice de l’ADN

1.1 LES COMPOSANTS DES ACIDES NUCLÉIQUES

2 Chapitre 1 • Structure de l’ADN et de l’ARN

L’union d’une base et d’un pentose s’appelle un nucléoside. Dès

1.1 • Les composants des acides nucléiques 3

5' CH2 OH O OH 5' CH 2 OH O OH

4' C H H C 1' 4' C H H C 1'

Désoxyribonucléoside 5' monophosphate (dAMP)

Désoxyribonucléoside 5' diphosphate (dADP)

Désoxyribonucléoside 5' triphosphate (dATP)

Figure 1-3 Structure détaillée d’un désoxyribonucléoside triphosphate. En

La structure des nucléotides

4 Chapitre 1 • Structure de l’ADN et de l’ARN

5' 5' 5' 5' 5' 5'

1.2 • La structure en double hélice de l’ADN 5

riches en répétition de nucléotides à guanine et cytosine (les îlots à

La structure des polynucléotides

1.2 LA STRUCTURE EN DOUBLE HÉLICE DE L’ADN

Règle d’Erwin Chargaff. Le nombre de thymines est égal au nombre

Ainsi, dans l’ADN, la quantité des purines (A+G) est égale à

6 Chapitre 1 • Structure de l’ADN et de l’ARN

Figure 1-5 Appariements complémentaires

TABLEAU 1-1 COMPOSITION EN BASES

Escherichia coli B 23,8 26,8 26,6 23,1 0,88 1,01 53,2

Neurospora 23,0 27,1 26,6 23,3 0,86 1,00 53,8

Drosophile 30,7 19,6 20,2 29,5 1,51 1,01 39,8

Saumon 28,0 22,0 20,0 27,8 1,33 1,05 42.0

Poule 28,0 22,0 21,6 28,4 1,29 1,00 43,6

Rat 28,6 21,4 21,6 28,4 1,33 1,00 42,9

Vache 27,3 22,5 22,5 27,7 1,26 0,99 43,0

Homme 29,3 20,7 20,0 30,0 1,46 1,00 40,7

1.2 • La structure en double hélice de l’ADN 7

deux brins complémentaires d’ADN sont orientés en sens inverse

8 Chapitre 1 • Structure de l’ADN et de l’ARN

Figure 1-7 Représentation d’un fragment d’ADN en double hélice. À gauche,

Les différentes formes d’ADN

1.2 • La structure en double hélice de l’ADN 9

variantes, l’ADN-A et l’ADN-B, qui diffèrent, entre autres, par la

ADN A ADN B ADN Z

Figure 1-8 Représentation simplifiée des formes A, B et Z de l’ADN.

Dissociation et réassociation des brins d’ADN