Cour de Virologie PDF

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Université Mohammed V Faculté des Sciences

Agdal Rabat

Eléments de virologie
Préparé par
Pr El Bekkay BERRAHO

Laboratoire de Microbiologie et Biologie Moléculaire, B.P. 1014, Rabat – Maroc.


Tél. (212) 37 77 54 61, e--mail: [email protected]
 Caractères généraux des virus
Qu'est-ce qu'un virus ?

En 1953 André LWOFF a énoncé les 4 caractères fondamentaux


faisant des virus des entités originales:
originales

 Un virus ne contient qu’un seul type d’acide nucléique (ADN ou ARN)


qui constitue le génome viral.
 Un virus se reproduit toujours à partir de son matériel génétique et
par réplication.

 Un virus est doué de parasitisme intracellulaire absolu.


 Un virus a une structure particulaire.
particulaire
Malgré leurs aspects et structures très rudimentaires, les virus
constituent une forme très élaborée de parasitisme.

En effet, ne possédant aucun système d’énergie et à l’aide de quelques


gènes, ils peuvent altérer, modifier et orienter les programmes de
fonctions intracellulaires à leur profit pour se répliquer et assurer leur
pérennité.

 Taille et structure des virus


2. 1.Taille
La taille d’un petit virus comme le poliovirus est d’environ 20 nm (≈ taille
d’un ribosome). Le plus gros virus comme celui de la vaccine est long de
400 nm et large de 200nm (≈ taille d’une rickettsie : petite bactérie parasite
intracellulaire).
10 000 nm

cellule eucaryote

noyau cellulaire 2 800 nm

E. coli 2 000 nm

Virus

Rage 150 nm

Influenza et VIH 100 nm

Rhinovirus 70 nm

Polio 27 nm

10 000 nm
Dimension et morphologie des principaux virus.
Les virus sont dessinés à l’échelle Taille relative des virus et des
( voir la ligne représentant 1 µm au bas de la figure) bactéries
2. 2. Structure virale
Toute particule virale est composée de 2 éléments obligatoires:

 Le Génome
= Unité fonctionnelle: la nucléocapside
 la Capside

Pour certains virus, la nucléocapside est elle aussi entourée


d'une structure externe :

 Enveloppe ou Peplos

2. 2. 1. Le génome viral
La nature du matériel génétique (ADN ou ARN) est
exceptionnellement varié chez les virus,
Ces particules virales utilisent les 4 types possibles d’acide nucléique:
 ADN simple brin (monocaténaire)  ADN double brin (bicaténaire)

 ARN simple brin (monocaténaire)  ARN double brin (bicaténaire)

Les 4 types de molécules sont rencontrés chez les virus d’animaux;

Les virus des végétaux possèdent le plus souvent des génomes en ARN
simple brin;
Les bactériophages contiennent généralement de l’ADN double brin
bien qu’ils peuvent contenir de l’ADN ou de l’ARN simple brin

De manière générale:
Virus à ADN Virus à ARN

Le plus souvent ADN  soit linéaire ARN soit linéaire


bicaténaire monocaténaire
 soit circulaire soit segmenté

 ADN partiellement bicaténaire


et circulaire ARN bicaténaire segmenté
Rarement
 ADN monocaténaire
Le matériel génétique viral varie aussi fortement par sa taille:

 Les génomes les plus petits (phages MS2 et Qβ) ont une taille d’environ
106 daltons, juste pour coder 3 ou 4 protéines (3 ou 4 gènes)

 Les génomes les plus géants (phages T-pairs, herpèsvirus et virus de la


vaccine) ont une taille de 1 à 1,6 108 daltons, largement pour coder un
peu plus de 100 protéines (+ de 100 gènes)

2. 2. 2. La capside
De nature protéique protégeant le génome viral

Résulte de la polymérisation de sous-unités protéiques identiques


codées par le génome, protomères,

L’assemblage de ces unités donne des Capsomères

L’organisation des capsomères selon une symétrie, constitue la capside


Rôles:
 Protection du génome viral dans le milieu extracellulaire

 Porte des déterminants viraux qui se lient spécifiquement aux


récepteurs cellulaires quand le virus est nu
la capside s’organise selon 3 types de symétrie:
a. Capside à symétrie hélicoïdale
D'aspect tubulaire, les sous-unités
unités s'assemblent en un ruban autour
de l'acide nucléique, et le ruban enroulé autour d'un axe central
constitue un tube plus ou moins rigide.
rigide
Virus de la mosaïque du tabac
Virus végétaux : VMT
Nucléocapside rigide. Disposition
en hélice des sous-unités autour
du génome.
Virus animaux Virus de la rage
Nucléocapside plus ou moins flexible,
enroulée sur elle-même et toujours
incluse dans une enveloppe.

b. Capsides à symétrie icosaédrique

Il s'agit d'un polyèdre comprenant 12 sommets et 20 faces égales qui


sont des triangles équilatéraux entourant une sphère. Un icosaèdre
possède 3 axes de symétrie.

La capside est formée par l’assemblage


d’unités morphologiques: Capsomères

 252 capsomères pour un Adénovirus


 70 capsomères pour un Poliovirus

Adénovirus
c. Capsides à symétrie complexe

La capside des virus à symétrie complexe est composée de 2 parties:

 une tête à symétrie polyédrique formée de


152 capsomères contenant un ADN

 une queue à symétrie hélicoïdale reliée à la


tête par un collier

Queue
 Constituée d’une gaine contractile
délimitant un canal creux central

 Terminée par une plaque basale porteuse


de spicules et de fibres caudales

Bactériophages T 4
2. 2. 3. L’enveloppe ou Peplos
 Membrane qui entoure certains virus (virus enveloppés)
 L’enveloppe est constitué d’une bicouche de phospholipides et des
glycoprotéines spécifiques qui apparaissent sous forme de spicules

Fonctions:  Site d'attachement à des récepteurs cellulaires


 Reconnaissance de récepteurs
 Antigénique, hémagglutinante, enzymatique
L'enveloppe virale est acquise par bourgeonnement du virion à travers une
des membranes cellulaires de la cellule hôte pendant la réplication du virus

Trois origines possibles


 Membrane nucléaire (herpès)  Membrane intra cytoplasmique:
 Membrane cytoplasmique (grippe)  Appareil de Golgi
Exocytose du virus  Réticulum endoplasmique
Endocytose du virus
(rubéole :Togavirus)

membrane

Formation de l’enveloppe du virus par


bourgeonnement de la membrane
de la cellule hôte
L’enveloppe est très sensible aux actions physico-chimiques. Elle ne
constitue pas un élément de protection de la particule virale.

C'est un élément de fragilité


dû à son caractère lipidique

Virus nus

 Survivent dans le milieu hydrique ( les entérovirus survivent à 4°:


4
10 à 15 jours, à 20 °:: 296 jours )

 Résistent aux solvants des lipides y compris le savon

 Seuls les antiseptiques halogénés ( l' eau de javel) sont actifs


(Hépatite A résiste)

 Sensibles aux ultraviolets qui provoquent l'altération des acides


nucléiques
Virus enveloppés

 Ne persistent pas dans le milieu extérieur,

 Ne se retrouvent pas dans les selles:


selles élimination par les sels biliaires,

 Sensibles aux solvants organiques (alcool, acétone,…

 Inactivés par les antiseptiques et les désinfectants,

 Eau de Javel est le meilleur virulicide,

 Sensibles aux ultraviolets qui provoquent l'altération des acides


nucléiques,

 Leur transmission se fait par contact direct, immédiat et rapproché


entre les individus,

 Transport rapide et dans un milieu de survie du produit pathologique au


laboratoire pour le diagnostic
Conclusion

La perte de l’enveloppe inactive le virus puisqu’ il a perdu en même temps


les déterminants qui lui permettent de se fixer aux cellules sensibles.

Les virus nus sont assez résistants

 Virus poliomyélitiques (isoler de l’eau des égouts)

 Virus responsables d’infection intestinales


(transmission oro-fécale)
fécale)

Les virus enveloppés sont très fragiles


Virus de l’herpès ou du sida
Transmission sexuelle ou sanguine

Exceptions : les Poxvirus (variole) et les Hepadnavirus (hépatite B)


Virus enveloppés mais résistants
 Eléments de classification des virus
4 critères (Lwoff Horne et Tournier)
A. Nature de l'acide nucléique: ADN, ARN, simple ou double brin, un ou
plusieurs segments, taille,

B. Capside avec (virus enveloppé) ou sans (virus nu) enveloppe

C. Symétrie de la capside: hélicoïdale, icosaédrique ou complexe (hexagonale)

D. Taille et forme du virus


 Le nombre de capsomères et le diamètre de la particule virale
pour les virus à symétrie cubique.
cubique

 La longueur et l'épaisseur des nucléocapsides pour les virus à


symétrie hélicoïdale.
 cycle de multiplication des virus
Comment se multiplie un virus ?
 C’est un parasite intracellulaire strict

 Le caractère original de cette multiplication c’est que le virus


détourne à son profit, les voies métaboliques de la cellule hôte; à
savoir les systèmes producteurs d'énergie, les ARN de transfert
et les ribosomes de la cellule.

Pourquoi ? Car, il ne possède aucun de ces éléments

Conséquences: inhibition des synthèses cellulaires


Mais, le génome viral commande la synthèse des enzymes inconnues pour la
cellule mais nécessaires pour sa réplication
Cas du cycle de multiplication des bactériophages
Deux types d’infection (ou deux types de cycle de multiplication):


 Dans le cas du cycle lytique, les phages
sont qualifiés de virulents ex. phage T4

 Dans le cas du cycle lysogénique, les


 p
phages sont qualifiés de phages
tempérés ex. phage λ

cycle lytique:
le génome viral est répliqué de façon intensive et la cellule synthétise (sous l’ordre de l’ADN
 viral) en grande quantité les protéines constituant l'enveloppe du phage.

 Pendant une durée d'environ 45 minutes, une centaine de nouveaux virus sont ainsi fabriqués à
l'intérieur de la cellule.

 Au bout de cette période, la cellule meurt et sa membrane se perce pour libérer les nouveaux
virus qui vont ainsi chercher à infecter de nouveaux hôtes.
Les nouveaux virions libérés vont
infecter de nouvelles bactéries

Fixation du virus à des récepteurs


Libération des nouveaux virions
membranaires spécifiques

Cycle lytique du
phage T4
Injection de l’acide nucléique
Maturation des nouveaux virions dans la bactérie

Synthèse et assemblage des capsomères Phase d’éclipse :


en capside et insertion de l’acide nucléique prise en charge du métabolisme cellulaire par le génome
dans la capside viral ce qui entraîne la réplication de celui-
celui-ci
cycle lysogène:
 Les phages tempérés peuvent se reproduire sans détruire la cellule hôte. En fait, ils ont 2 modes
de vie: un cycle lytique ou un cycle lysogénique.

 Durant la lysogénie, l’ADN phagique s’intègre au chromosome bactérien (il est dit prophage la
bactérie hôte est dite lysogénique); L’ADN viral est alors répliqué avec le génome bactérien.

 Lorsque la bactérie rencontre certaines conditions stressantes de la croissance (ex: radiations


UV), le virus décide de rompre la lysogénie et d’induire un cycle lytique.

Cycle lysogénique
du phage λ
Etapes 1, 2, 8, 9 et 10 :
cycle lysogène

Etapes de 1 à 7:
cycle lytique

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