Manipulacion Del DNA
Manipulacion Del DNA
Manipulacion Del DNA
MANIPULACIN
DEL DNA
Si se conoce la secuencia de
nucletidos de un gen responsable de
cierta anomala, se puede diagnosticar
si este gen anmalo est presente en
cierto individuo.
El proceso en la comprensin de la
regulacin gentica requera de tcnicas que
permitieran cortar selectivamente el ADN en
trozos homogneos.
An siendo pequeos los genomas muy
purificados eran muy complejos para ser
descifrados.
La identificacin, purificacin y
caracterizacin de endonucleasas de
restriccin que cortan con precisin las
molculas de ADN en secuencias especficas.
Reconocindose as genes y regiones de
regulacin.
Tipo II:
a. Slo tienen actividad de restriccin.
b. Cortan de manera consistente y
predecible dentro de la secuencia que
reconocen.
c. Slo requieren Mg++ como cofactor.
d. No necesitan ATP.
Aplicaciones de las enzimas de restriccin:
1. Hacer mapa de restriccin de un plsmido o
bacterifago.
2. Fragmentar DNA genmico para separacin
de electroforesis y Southern Blot.
3. Generacin de fragmentos para ser usados
como sondas marcadas en Southerny
Northern blotting.
4. Generacin de fragmentos para ser
subclonados en los vectores apropiados,
creacin de DNA recombinante.
co = especie coli
R = cepa RV 13
VECTOR DE EXPRESIN
Plsmidos fagos que
poseen regiones
promotores para expresar
las secuencias clonadas de
DNA
VECTOR DE CLONACIN
Molcula de DNA capaz de
replicarse autnomamente
en la clula husped y en la
cual se incorpora
covalentemente el
fragmento de DNA a
clonar.
Puede generarse
considerable cantidad de
ADN para anlisis
VECTOR CLONADO
Ligacin
Secuencia del inserto y del
vector
Transformacin
Clulas transformantes se
siembran en medios selectivos
(slo crecen aquellas que
contienen la secuencia vector)
Clonacin por
PCR
Ligacin
Amplificacin
De ADNc: determina
Se producen:
1. Se dirige parcialmente el
ADN genmico
2. El vector se corta por una
enzima de restriccin
compatible
3. Se liga el ADN digerido y el
vector
4. Se transforma la clula
husped apropiada con el
ADN ligado
5. Se seleccionan y cultivan las
transformantes que
contienen el vector y el
inserto
Plsmidos, comidos, YAC y BAC
Transfeccin qumica:
DNA + Cloruro de Calcio
Precipitado
Se asienta en membrana
plasmtica
Captado por endocitosis
DEAEdextran
Detergente
polibreno
Lipofeccin:
Complejo lipoplex
Captado por endocitosis
Electroporacin :
Clula sometida a un pulso elctrico
Poros pasajeros
Recombinacin Gentica
In Vitro
Mtodo actualmente
obsoleto para
identificar a una
persona con propsitos
legales o forenses
basado en sondeos
Southern blot con una
sonda mini-satlite
hipervariable.
Existencia de 2 o ms variantes
(alelos, fenotipos, variantes de
secuencia, variantes de estructura
cromosmica) a frecuencias importantes
en la poblacin. Los usos mas laxos entre
genetistas moleculares incluyen:
1. Cualquier variante de secuencia que
se encuentra a una frecuencia mayor
a 1% en una poblacin.
2. Cualquier variante de secuencia no
patognica, prescindiendo de la
frecuencia.
BIOMOLCULAS TERAPUTICAS
El principal requisito para el desarrollo de terapias gnicas
es la identificacin y caracterizacin de secuencias
nucleotdicas que podran estar directa o indirectamente
implicadas en procesos patolgicos. Ello incluye tanto genes
para el tratamiento de enfermedades genticas especficas,
como secuencias utilizadas para conferir nuevas
propiedades a clulas, para el tratamiento de enfermedades
adquiridas y del cncer.
Secuencias codificadoras de protenas
Las biomolculas ms utilizadas para terapia gnica
son copias de ADN complementario obtenidas a partir
de ARN mensajeros. stos, a su vez, provienen de genes
que codifican protenas de inters teraputico.
Sondas antisentido
La tecnologa de las sondas antisentido
se basa en la utilizacin de oligodesoxinucletidos (ODN)
de pequeo tamao para inhibir la expresin gnica.
La inhibicin de la expresin tiene lugar por hibridacin de los
ODN antisentido a la cadena complementaria codificadora
de ARN en el interior de la clula.
A la interaccin entre la sonda antisentido y
el ARN se aplican las reglas de apareamiento de bases de
Watson-Crick, lo cual permite disear ODN dirigidos a cualquier gen
de inters. En teora, una sonda antisentido de 15 nucletidos
de longitud tiene suficiente especificidad para interaccionar con
un determinado gen dentro del genoma humano completo. Debido
principalmente a su reducido tamao, las sondas antisentido suelen sintetizarse
qumicamente y se administran como un frmaco convencional, aunque tambin
se ha examinado su expresin in vivo mediante vectores vricos o plsmidos.
ADN triplex
Se denomina ADN triplex a la asociacin
colineal de tres cadenas de ODN.
Ello se produce cuando una cadena de ODN se une a la hendidura
o canal ancho de una doble hlice de ADN.
La tecnologa del ADN triplex, paralelamente a la de las
sondas antisentido, tiene un gran potencial teraputico
como modulador gnico. La unin de un ODN formador
de ADN triplex a un gen diana puede bloquear la transcripcin del ARN,
lo cual anulara su expresin. La diferencia de dicha tcnica con
las sondas antisentido radica en que en el primer caso el ODN se une
directamente al gen en lugar de unirse a su ARN mensajero.
Como el ADN triplex acta a nivel transcripcional, en teora slo son necesarias
unas pocas molculas de ODN para producir un efecto inhibidor.
El ODN formador de ADN triplex puede componerse de polipurinas o
polipirimidinas y se une a la cadena rica en purinas de la doble hlice mediante
puentes de hidrgeno.
La especificidad de unin resulta de la complementariedad de secuencia entre la
regin polipurnica de una de las hlices de ADN y el ODN formador de triplex.
Ribozimas
Los ribozimas son molculas de ARN con
capacidad de catalizar la escisin especfica
de otras molculas deARN. La especificidad de secuencia
del ribozima se determina por su capacidad para aparearse
o hibridarse con nucletidos complementarios de la molcula de
ARN diana cerca del sitio de escisin. Dicha escisin produce un
ARN mensajero incompleto e inestable, lo cual inhibe la expresin proteica.
En teora, los ribozimas se pueden sintetizar o manipular para actuar
sobre cualquier molcula de ARN comprendida en el conjunto del ARN celular.
Por lo tanto, cualquier ARN mensajero que codifique una protena asociada a una
determinada enfermedad puede escindirse selectivamente mediante ribozimas
expresados a partir de un vector de transferencia gnica adecuado.
Debido a su flexibilidad de diseo y su extraordinaria especificidad de secuencia, los
ribozimas llamados hammerhead y hairpin podran resultar muy tiles como agentes
teraputicos.
Los ribozimas tienen varias ventajas respecto a las protenas cuando se considera su uso en
aplicaciones de terapia gnica: a) el ARN es menos susceptible a provocar una respuesta
inmunitaria que la expresin de una protena exgena o modificada; b) los ribozimas son
molculas de pequeo tamao, lo que facilita su inclusin en los vectores utilizados para
terapia gnica, y c) en un nico vector se pueden insertar incluso varios ribozimas dirigidos
contra diferentes regiones de una molcula de ARN mensajero, o contra diferentes
molculas de ARN mensajero, lo cual puede ser til para actuar sobre los distintos dominios
de un genoma viral o sobre mltiples mediadores de un determinado estado patolgico.
ESTRATEGIAS
GNICA
MTODOS
DE
TRANSFERENCIA
Vectores vricos
La capacidad de algunos virus de ADN y
ARN de producir transformaciones tumorales
mediante la introduccin de su material
gentico
a clulas hospedadoras fue la que condujo
a su utilizacin
como vectores para transferencia gnica.
La lista de virus que se han estudiado como
vectores es considerable e incluye papovirus,
adenovirus, virus de la vacuna, adenovirus
asociados, virus del herpes, retrovirus, etc.
Vectores retrovricos
Los vectores vricos ms estudiados provienen
de los retrovirus. Los retrovirus ms estudiados
son los oncovirus sencillos, como el virus del
sarcoma de Rous (VSR) y el virus de la leucemia
murina de Moloney (Mo-MLV).
Cada partcula retrovrica (virin) contiene dos
copias de ARN genmico vrico empaquetadas
dentro de un complejo proteico que, a su vez,
est rodeado por una envuelta proteolipdica. La
propiedad ms interesante de los retrovirus es
la produccin de transcriptasa inversa, una
polimerasa de ADN dependiente de ARN
Las principales ventajas de los vectores
retrovricos como vehculos de transferencia son
su extraordinaria eficiencia, que les permite
transducir cerca del 100 % de las clulas diana, y
su capacidad para integrar de manera estable en
los cromosomas celulares el material gentico
que contienen.
Vectores adenovricos
Los adenovirus son patgenos dbiles que afectan
principalmente las vas respiratorias y no se han
asociado a enfermedades malignas. Cada partcula
vrica contiene una molcula de ADN de doble cadena
de tamao considerable y entra en las clulas
mediante endocitosis mediada por receptores,
seguido de la rotura del correspondiente endosoma y
migracin del genoma adenovrico al ncleo donde
permanece en forma extracromosmica.
El genoma adenovrico comprende una serie de genes
que se expresan al principio de la infeccin y codifican
protenas reguladoras, y una serie de genes tardos,
que codifican protenas estructurales Cuando el
genoma vrico entra en la clula, se activan los genes
que se expresan inicialmente. Ellos a su vez activan
otros genes reguladores importantes.
En la segunda fase de replicacin se expresan los
genes tardos, produciendo ms virus que finalmente
provocan la muerte de la clula. El actual
conocimiento de la gentica molecular del adenovirus
posibilita su manipulacin como vehculo para terapia
gnica.
Deficiencia de adenosn-desaminasa
Inmunodeficiencia combinada grave
La deficiencia de adenosn-desaminasa (ADA) es una enfermedad gentica
poco frecuente en la que los nios afectados carecen de esta enzima
necesaria para la funcin normal de su sistema inmunitario.
En septiembre de 1990, una nia de 4 aos que sufra deficiencia de ADA
recibi una infusin de sus propios linfocitos T que haban sido manipulados
ex vivo para introducirles una copia normal del gen de la ADA. Se escogi
esta deficiencia de ADA como la primera enfermedad susceptible para
terapia gnica por varias razones: a) el gen haba sido clonado y su
correspondiente ADN complementario era del tamao adecuado para
insertarse fcilmente en un vector retrovrico; b) estudios previos de
trasplante de mdula sea sugeran que solamente era necesario corregir
los linfocitos T para curar la enfermedad; c) la cantidad de enzima necesaria
para mantener la funcin del sistema inmunolgico en determinados casos
puede ser el 5-10 % del nivel normal, y d) las clulas T corregidas tienen una
ventaja selectiva sobre las clulas deficientes en ADA.
Enfermedad de Gaucher
Est causada por una deficiencia de la enzima lisosmica
glucocerebrosidasa, que hidroliza glucosilceramidaen
ceramida y glucosa.
La acumulacin de dicho glucolpido se produce principalmente
en los macrfagos del sistema reticuloendotelial, lo cual produce
esplenomegalia, lesiones dolorosas en los huesos y en
determinados
casos lesiones neurolgicas.
Espordicamente se ha utilizado con xito el trasplante alognico
de mdula sea como modalidad teraputica. Al igual que para la
deficiencia de ADA, conocer la secuencia de ADN complementario del
gen que codifica la glucocerebrosidasa y el hecho de que el principal
tipo celular afectado derive del sistema hemopoytico, ha llevado a
proponer a la terapia gnica ex vivo utilizando vectores retrovricos
como tratamiento alternativo.
En este caso, las clulas diana son tambin las clulas hemopoyticas
precursoras con capacidad de producir macrfagos corregidos en el
paciente.
Fibrosis qustica
En la fibrosis qustica se ha observado un defecto
en el gen que
codifica para el canal de cloro conocido como CFTR, que resulta
en un transporte anormal de electrlitos en las glndulas exocrinas
y conduce
a una enfermedad crnica obstructora de los pulmones,
insuficiencia pancretica exocrina y aumento de la cantidad
de electrlitos en el sudor. Utilizando como transgn el gen
de CFTR y como clulas diana las clulas
del epitelio del tracto respiratorio, se han realizado estudios
utilizando liposomas y adenovirus como vectores.
Los riesgos de toxicidad parecen descartados en los primeros
intentos
y basta algo tan sencillo como un inhalador para conseguir la
expresin
del gen y aliviar en un 30%
los sntomas de la enfermedad.