TEMA 14.

TRADUCCIÓN DEL ADN

1. PRINCIPIOS GENERALES

La traducción, o síntesis de proteínas, es una etapa muy importante. Se produce a partir del
ARNm del núcleo celular, y la síntesis de proteínas tiene lugar en el citoplasma, gracias a los
ribosomas.

- Unidireccional: 5´→3´.
- Reiterativa: a partir de 1 ARNm, se pueden obtener muchas copias proteínicas.
- Selectiva: sólo se traduce el marco abierto de lectura (información entre un codón de
iniciación y codón de terminación). También hay secuencias que no se traducen como
las de los extremos:
▪ Extremo 5´: secuencia líder / 5´UTR.
▪ Extremo 3´: secuencia tráiler / 3´UTR.

Esto solo se aplica en eucariotas. En procariotas, a parte de esas dos zonas, como su ARNm es
policistrónico, entra cada secuencia que codifica una proteína hay pequeños tramos que no se
traducen.

2. CÓDIGO GENÉTICO

Código de la vida, es el diccionario para la correspondencia aminoácido-bases. Reúne las

asociaciones entre las bases y los 20 aas.

¿Cuántas bases necesito para codificar un aminoácido?

Necesitamos 3 bases. Como hay 4 bases distintas, sería 4^3: 64 combinaciones con algunas
repetidas. Pero solo hay 20 aminoácidos distintos. Las 44 combinaciones sobrantes se deben a
que más de una combinación va a codificar el mismo aminoácido.

A cada grupo de 3 bases se le llama triplete o codón. Hay mas codones que aminoácidos; un
aminoácido se codifica por más de un codón. Esto corresponde a la propiedad de
degeneración del código genético.

El c. genético es degenerado, pero no ambiguo. 1 codón codifica 1 aa, aunque varios codones
codifiquen un mismo aa.

De estos 64 codones, sólo 61 de ellos codifican aa, por lo que hay 3 que no codifican ninguno;
los tripletes o codones sin sentido. Éstos actúan como señales de terminación de síntesis de
proteínas. También se les llama codones de terminación, de parada o de stop:

- UAA/ ocre
- UAG/ ámbar
- UGA/ ópalo.

El código genético también tiene un codón de iniciación, AUG. Cuando el ribosoma lo lee,
comienza la síntesis proteica. Este codón también codifica para metionina.

Aunque AUG sea el más habitual, también pueden usarse otros como el GUG (valina), UUG y
CUG (ambos para valina, aunque son poco comunes).

Dentro de la degeneración, hay 3 aas codificados por el máximo de codones distintos, 6:

arginina, leucina, serina. Hay 2 aas que solo están codificados por 1 codón; metionina (AUG) y
triptófano (UGG).
¿Por qué algunos Aa están codificados por 6 codones y otros solo por 1?

Los que son codificados por más de un triplete son aquellos que aparecen con mayor
frecuencia. Por ejemplo, la leucina (codificada por 6 codones), presenta una abundancia del
9.1%. Los dos Aa con un solo codón, metionina y triptófano, aparecen en menor cantidad:
2,2% y 1,4%.

*¿Son poco abundantes porque son codificados por pocos codones, o porque son codificados
por pocos codones son menos abundantes? – Primero van las proteínas, por lo que si tienen
que aparecer menos, va a necesitar menos codones.

- Los codones que codifican el mismo Aa son parecidos.

- Los codones que codifican Aa parecidos, son parecidos entre sí.

Cuando la segunda base nitrogenada es una pirimidina (uracilo, citosina), van a codificar Aa
apolares, más pequeños. Cuando es púrica (guanina, adenina), van a codificar Aa polares, más
grandes.

El código genético es universal; un codón codifica el mismo Aa independientemente de la

especie. Sólo hay excepciones en el material genético de las mitocondrias:

- Mitocondrias de vertebrados: UGA no es parada, codifica triptófano; AUA no codifica

isoleucina, es metionina; AGG no codifica arginina, es parada.
- Mitocondrias de microorganismos como levaduras, son cosas similares a éstas.

En organismos como los protozoos ciliados, también hay excepciones en el citoplasma; su

único codón de parada es el UGA.

El código genético ni cambia ni evoluciona; si llegara a cambiar, produciría cambios en muchas

proteínas y la vida estaría en peligro.

El código genético estriba en la forma que se lee; el ribosoma interpreta las bases nitrogenadas
de 3 en 3.

Hay 2 tipos de mutaciones que pueden ser terribles: inserciones y deleciones cambian el
sentido de lectura y, por tanto, hay una mala conformación de la proteína. Hay virus que
utilizan estas mutaciones como ventajas, como los retrovirus. A este fenómeno se le llama
Frame shifting o desplazamiento del marco abierto de lectura.

Siempre se ha dicho que existen 20 Aa, pero también hay derivados de éstos que se obtienen
por modificaciones postraduccionales o sintetizando la proteína fuera del ribosoma. Dentro de
esta última forma tenemos:

➢ SEC-Seleniocisteína. Su cadena lateral es parecida a la de la cisteína, pero en el grupo

tiol, en vez de un S hay un Se. Es codificada por UGA, que es un codón de terminación
que comienza a tener sentido. Esto ocurre cuando las zonas 5´UTR o 3´UTR tienen una
secuencia que hace que cuando se lea este codón, se codifica para seleniocisteína. A
esta señal se le llama elemento SECIS o señal ópalo.
El paso por el que un codón de terminación pase a uno con sentido se llama:
reasignación de codones dependiente de contexto.
➢ PYL-Pirrolisina. Cadena lateral similar a la de la lisina (NH2O de la lisina → pirrol). Es
codificada por UAG. A estas señales se les llama elementos PYLIS o señales ámbar.
 3. BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS

La traducción necesita el código genético y un intérprete, que es el ARNt:

- En su extremo 3´, la secuencia es de CCA, que le permite unirse al Aa correspondiente.

- En el bucle frente a ese extremo, hay una secuencia de 3 bases llamada anticodón,
que va a interaccionar con los codones del ARNm por complementariedad de bases.

El paso previo a la síntesis de proteínas es unir los Aa al ARNt, para que éste lleve los Aa al
ribosoma y comience la síntesis proteica mientras es leído el ARNm. Para esta unión, se
necesita aminoacil ARNt sintetasa (hay 20), que catalizan la unión de un determinado Aa con
un ARNt específico. El proceso necesita ATP y AMP (procedente del ATP). Se liberan 2 fosfatos
y luego, la enzima que se ha unido al Aa va a unirlo también al extremo 3´. El complejo final es:
Aa unido a ARNt= aminoacil ARNt. Tras la unión, se libera el AMP.

1. Hay 20 aminoacil ARNt sintetasas distintas, una para cada Aa.

2. Se necesita energía para producir 2 enlaces energéticos.
3. Estas enzimas tienen capacidad de autocorrección.

¿Cómo es la unión química entre el Aa y el ARNt?

Es un enlace éster entre grupo carboxilo del Aa y el grupo -OH de la ribosa de la secuencia CCA
final. Se pierde un H2O.

¿Cómo sabe el ARNt qué Aa debe unir?

El ARNt se une a un Aa en el extremo 3´, y su anticodón (específico), interacciona con un codón

del ARNm, siendo complementarios.

Los ARNt que pueden unir el mismo Aa pero tienen distinto anticodón entre sí son ARNt
isoaceptores.

Sabiendo que los codones degenerados se suelen diferenciar entre ellos en la tercera base, se
ha comprobado que la interacción entre la tercera base del triplete del ARNm y la primera
base del anticodón no es estricta, pero la que se pueda dar entre las otras dos sí. A esta
hipótesis se le conoce como hipótesis de balanceo o de wobble.

Según esta hipótesis, para la tercera interacción, situándonos en el ARNt:

G → U, C

U → A, G

Iosina → A, C , U

DIFERENCIAS ENTRE EUCARIOTAS Y PROCARIOTAS

➢ Síntesis de proteínas es muy parecida en ambas, lo que cambian son los tipos de
proteínas que interaccionan; cada uno tiene distintos factores de
iniciación/terminación y distintos inhibidores.
➢ Ribosomas distintos: los procariotas tienen 50S Y 30S y los eucariotas de 60S Y 40S.
Cada ribosoma tiene en su interior 3 espacios con una entrada y sin salida, por lo que
va a introducirse un único triplete de ARNm. 3 lugares: sitio E (salida), sitio P
(peptidilo) y sitio A (aminoacil).
Conforme se va leyendo el ARNm, uno de los tripletes está en E, otro en P y otro en A, los 3
contiguos.

Los ribosomas están formados por: ARNr y proteínas

ribosomales.

El ribosoma se mueve en dirección 5´→ 3´y el orden de

los sitios es E, P, A.

ARNm de procariotas es policistrónico y el de

eucariotas, es monocistrónico.

SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

1) FASE INICIACIÓN: Ensamblaje de ARNm con los ribosomas. Se necesita ARNm,

ribosomas, proteínas (factores iniciación), GTP, y ARNt unido al Aa inicial (MET o
formil-MET, por ser el codón de iniciación). Tras tener todo esto en el mismo punto, el
ARNm se coloca en su sitio; AUG (metionina) está en el sitio P y para que pase esto es
importante la zona 5´UTR del ARNm, que tiene unas secuencias que se unen o
adhieren al sitio adecuado dentro del ribosoma. Estas secuencias son distintas en
procariotas y eucariotas:
▪ Procariotas: 5´UTR: AGGGAGGU, llamada secuencia de Shine-Dalgarno.
▪ Eucariotas: 5´UTR: GCCCAUG, secuencia de Kozak.

En esta fase, tenemos el AUG en el sitio P, además, en este sitio también ha entrado el
ARNt con secuencia UAC en su anticodón y con MET o formil-MET unido al extremo 3´.
El sitio A está libre.

2) FASE ELONGACIÓN: Se necesitan factores de elongación. En procariotas, se llaman

factores de elongación T. También se necesita GTP.
i) En el sitio A, entra ARNt con el Aa correspondiente (su anticodón es
complementario al codón del ARNm del sitio A).

ii) Cuando ya tengo 2 aminoácidos en los sitios P (MET) y A (ARG), se tienen que unir
por un enlace peptídico. De esto se encarga la peptidil transferasa, que es una
ribozima. En procariotas, el ARN es 23S y en eucariotas es de 28S.
Esta enzima corta el Aa unido en el extremo 3´del ARNt del sitio P (separa la MET),
y lo lleva al sitio A (donde está la ARG) para unirlos. En el sitio A queda un
dipéptido MET-ARG y el sitio P se queda vacío.

*Si se traduce en sentido 5´→3´, la proteína se orienta en sentido grupo amino →

carboxilo. La velocidad de síntesis es de 20Aa/seg.

iii) El último paso de esta fase es la translocación del ribosoma: el ribosoma se va a

mover sobre el ARNm 3 bases, por lo que lo que estaba en el sitio A va a pasar al
sitio P y lo que estaba en el sitio P, va a salir fuera del ribosoma (sitio E).
Este proceso continúa hasta que en el sitio A aparezca uno de los 3 codones de
terminación.
3) FASE DE TERMINACIÓN: Comienza cuando en el sitio A aparece uno de los 3 codones de
terminación. Se necesita una proteína llamada factor de terminación o releasing factor,
que elimina la cadena polipeptídica al producir un corte en la unión de ésta con el sitio A.

Tras liberarse la cadena polipeptídica, tendremos una proteína en su fase más temprana que
deberá sufrir modificaciones postraduccionales.

4. INHIBIDORES DE SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

Hay compuestos que inhiben la síntesis de proteínas que son utilizados como antibióticos )los
que la inhiben en procariotas).

➢ Cloranfenicol: inhibe la peptidil transferasa en procariotas. ( Puede producir sordera)

➢ Eritromicina: inhibe la elongación de la cadena y la translocación del ribosoma.
➢ Estreptomicina: produce lectura incorrecta del ARNm.
➢ Tetraciclina: unión incorrecta de ARNt y su Aa.
➢ Gentamicina: produce errores en la lectura del ARNm e inhibe la elongación.
➢ Klamicina: igual que la gentamicina.
➢ Neomicina: proceso de iniciación y lectura del ARNm.
➢ Puromicina: bloquea la elongación.

Estos antibióticos suelen usarse en personas con alergias a las penicilinas.

➢ DIFTERIA: se produce por contacto de una bacteria (Corynebacterium diphtheriae) y

actúa mediante una toxina. En ausencia de la toxina, se necesita un factor de
elongación que se une a la ribosa del extremo 3´del ARNt y le ayuda a llegar al
ribosoma. Con la toxina diftérica, que tiene 2 subunidades; uno de ellos se une al
factor de elongación y lo ribolisa. Al quedarse unido a una ribosa, ya no puede unirse
al extremo 3´.
Una característica de esta patología es la presencia de acúmulo de membranas que
produce un engrosamiento en el cuello conocido como cuello de toro. Otros síntomas
son cianosis y problemas cardiacos.

➢ RICINA: la toxina se extrae de la semilla del ricino y se ha empleado como arma

química. Puede provocar la muerte porque es una proteína inhibidora de los
ribosomas (RIP). Las proteínas de este grupo son enzimas con actividad N-glicosilasa;
rompen los enlaces entre ribosas y adeninas, dejando a los ARNr sin adeninas y los
ribosomas quedan inactivados.

5. MODIFICACIÓN POSTRADUCCIONAL

El lugar a donde vayan las proteínas depende de algunas secuencias del Aa que indican cual va
a ser su destino.

- Las que van al núcleo, en la parte interna suele aparecer LYS-LYS-LYS-ARG-LYS.

- Las que van al peroxisoma, en el extremo carboxilo aparece SER-LYS-LEU.
*Síndrome de Zellweger afecta a los peroxisomas porque no le llegan las proteínas
adecuadas.
Estos dos casos se dan en proteínas que se encuentran en el citosol. Otras proteínas siguen la
ruta biosintética secretora (proteínas del RE, Golgi, lisosoma...). Esta ruta comienza en los
ribosomas asociados al RER.

Las proteínas que participan suelen estar glicosiladas y suelen moverse dentro de vesículas del
citoplasma.

MODIFICACIONES CUANDO SE PRODUCE LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS

a) Siempre ocurre la desformilación de la formil-MET (procariotas): se quita el grupo

formilo.
b) Proteólisis parcial de la cadena polipeptídica: cortar trozos de cadena como en los
zimógenos o proenzimas (pasar de forma inactiva a activa).
c) Añadir grupos prostéticos en el caso de proteínas que sean conjugadas.
d) Plegamiento adecuado. Se encargan las chaperonas con ayuda de las chaperoninas. Es
muy importante que se establezcan puentes disulfuro entre dos cisteínas.
e) Glicosilación: ocurre en las proteínas de la ruta biosintética secretor. Les da
propiedades como mayor resistencia a proteasas y al calor, mayor solubilidad… La
parte glucídica que se une tiene información sobre el destino de la proteína.
f) Modificación de las cadenas laterales de Aa. Algunos se hidroxilan o se fosforilan

▪ Colágeno: proteína + abundante del tejido conjuntivo y necesita que la mayoría de

sus lisinas y prolinas estén hidroxiladas. Esto lo hacen la prolina hidroxilasa y lisina
hidroxilasa.

▪ Patologías donde no se han producido esas hidroxilaciones:

• Escorbuto: causada por hipovitaminosis de vitamina C, que participa en la
hidroxilación de lisina y prolina. El colágeno es defectuoso y conlleva a una
mala cicatrización, fragilidad capilar y caída de dientes.

• Síndrome de Ehlers-Danlos: no hay lisina hidroxilasa o hay muy poca. Esto

hace que el colágeno sea muy elástico dando lugar a hipermovilidad articular.
Este síndrome está considerado del tipo “células médicas”.