CAPÍTULO 3 - Bioenergética, Enzimas y Metabolismo

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Biología celular y molecular. Conceptos y experimentos, 8e
CAPÍTULO 3: Bioenergética, enzimas y metabolismo
TÚ NO ERES LO QUE COMES

El cuerpo humano es una máquina de una complejidad casi inimaginable. Cada día nuestro cuerpo gasta alrededor de 2 000 kcal de energía, que
utiliza para el movimiento, metabolismo y pensamientos. Esta energía se obtiene de los alimentos que consumimos, y a diferencia de un motor de
automóvil que puede convertir el combustible químico (gasolina) directamente a una fuerza mecánica, el organismo realiza una serie de reacciones
bioquímicas complejas para convertir los nutrientes de los alimentos, en la moneda universal de energía biológica una molécula pequeña conocida
como ATP (adenosina de trifosfato). Esta serie de reacciones es organizada por un grupo de enzimas que dirigen las biomoléculas que ingerimos hacia
reacciones que producen ATP para la obtención de energía, así como reacciones para la síntesis de los compuestos bioquímicos necesarios como
bloques para la elaboración de las células y los tejidos.
Pintura de Giuseppe Arcimboldo: Rudolf II de Habsburgo como Vertumnus.
FUENTE: pintura de Giuseppe Arcimboldo.

Diferentes personas tienen hábitos de alimentación distintos. Dietas con bajo contenido de carbohidratos, dietas veganas, y “dietas paleolíticas”, cada
una con cambios dramáticos en la composición bioquímica de los alimentos. Aun así, las personas que consumen estas diferentes dietas lucen igual,
se comportan igual y poseen el mismo tipo de células y moléculas. Si una persona consume maíz todos los días, no se convertirá en una planta de
maíz. ¿Cómo es que la composición química de nuestro cuerpo se mantiene constante cuando consumimos alimentos tan variados? Nuevamente la
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respuesta está en la serie de reacciones bioquímicas, realizadas por enzimas que pueden convertir un tipo de biomolécula en otro. No somos lo 1que
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comemos: somos lo que nuestras enzimas hacen de nosotros.
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3.1. LEYES DE LA TERMODINÁMICA

FUENTE: pintura de Giuseppe Arcimboldo. UAM UNIVERSIDAD AMERICANA
Diferentes personas tienen hábitos de alimentación distintos. Dietas con bajo contenido de carbohidratos, dietas veganas, y “dietas
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una con cambios dramáticos en la composición bioquímica de los alimentos. Aun así, las personas que consumen estas diferentes dietas lucen igual,
se comportan igual y poseen el mismo tipo de células y moléculas. Si una persona consume maíz todos los días, no se convertirá en una planta de
maíz. ¿Cómo es que la composición química de nuestro cuerpo se mantiene constante cuando consumimos alimentos tan variados? Nuevamente la
respuesta está en la serie de reacciones bioquímicas, realizadas por enzimas que pueden convertir un tipo de biomolécula en otro. No somos lo que
comemos: somos lo que nuestras enzimas hacen de nosotros.
3.1. LEYES DE LA TERMODINÁMICA

Una célula viva está llena de actividad. Macromoléculas de todos los tipos son ensambladas a partir de materias primas, productos de desecho son
producidos y excretados, las instrucciones genéticas fluyen desde el núcleo hasta el citoplasma, las vesículas se desplazan a lo largo de las vías
secretoras, los iones son bombeados a través de las membranas celulares, entre otras actividades. Para mantener ese nivel de actividad, la célula debe
adquirir y consumir energía. El estudio de los diversos tipos de transformaciones energéticas que ocurren en un organismo vivo se conoce como
bioenergética.
La energía se define como la capacidad para realizar un trabajo, es decir, la capacidad de cambiar o mover algo. La termodinámica es el estudio de
los cambios en la energía que acompañan a los eventos en el universo. En las siguientes secciones se revisan los diferentes conceptos que permiten
predecir la dirección de los eventos que se llevarán a cabo, y si se requiere de energía para que el evento ocurra. Sin embargo, las mediciones
termodinámicas no permiten determinar con qué rapidez ocurrirá un proceso específico o los mecanismos que utilizará la célula para llevar a cabo el
mismo.
Primera ley de la termodinámica
La primera ley de la termodinámica es la ley de la conservación de la energía. Establece que la energía no puede ser creada ni destruida. Sin
embargo, la energía puede convertirse (transformarse) de una forma a otra. La transformación de energía mecánica a energía eléctrica ocurre en
grandes turbinas eólicas que hoy en día se utilizan para generar energía a partir del viento (fig. 3–1a) y la energía química se convierte a energía
eléctrica a través de generadores impulsados por gas. La energía también puede almacenarse; por ejemplo, la energía eléctrica puede almacenarse en
forma química utilizando baterías recargables (fig. 3–1b) y la energía mecánica puede almacenarse en el resorte de un juguete de cuerda. La energía
almacenada puede transformarse de un sitio a otro, por ejemplo, la energía química almacenada en la gasolina puede ser transportada grandes
distancias en camiones cisterna. Así mismo, la energía almacenada puede trasnformarse de una forma de almacenamiento, a otra forma más útil, por
ejemplo, la energía eléctrica almacenada en una batería puede convertirse en trabajo mecánico mediante un motor eléctrico (fig. 3–1c).
FIGURA 3–1
Ejemplos de transformación de energía. a) Conversión de energía mecánica a energía eléctrica en una turbina eólica, b) almacenamiento de
energía eléctrica en forma química dentro de una batería recargable, c) conversión de energía eléctrica a energía mecánica mediante un motor
eléctrico, en este caso el movimiento de un ventilador, d) conversión de energía química a energía mecánica por parte de los músculos, e) conversión
de energía química a energía eléctrica en una anguila eléctrica, que puede generar 500 voltios mediante sus órganos eléctricos, f) conversión de
energía química en luz en organismos bioluminiscentes.

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Las células también tienen la capacidad de transformar, almacenar y transportar energía. Como se revisa más adelante, la energía química
almacenada en ciertas moléculas biológicas, como el ATP, es convertida en energía mecánica cuando los músculos se contraen (fig. 3–1d), a energía
energía eléctrica en forma química dentro de una batería recargable, c) conversión de energía eléctrica a energía mecánica mediante un motor
eléctrico, en este caso el movimiento de un ventilador, d) conversión de energía química a energía mecánica por parte de los músculos, e) conversión
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de energía química a energía eléctrica en una anguila eléctrica, que puede generar 500 voltios mediante sus órganos eléctricos, f) conversión de
energía química en luz en organismos bioluminiscentes.
FUENTE: a) pedrosala/Shutterstock.
Las células también tienen la capacidad de transformar, almacenar y transportar energía. Como se revisa más adelante, la energía química
almacenada en ciertas moléculas biológicas, como el ATP, es convertida en energía mecánica cuando los músculos se contraen (fig. 3–1d), a energía
eléctrica cuando los iones fluyen a través de la membrana (fig. 3–1e) o a energía térmica cuando una persona tiembla de frío. La transformación más
importante de energía en el mundo biológico es la conversión luz solar en energía química (el proceso de fotosíntesis) que proporciona el
combustible que da energía de manera directa o indirecta para las actividades de casi todas las formas de vida.1
Varios animales, incluyendo las luciérnagas y peces luminosos tienen la capacidad de convertir la energía química en luz (fig. 3–1f). Sin importar el
proceso de transformación, la cantidad total de energía en el universo permanece constante.
Para analizar la transformación energética que afecta a la materia es necesario dividir el universo en dos partes: el sistema en estudio y el resto del
universo, a lo que se hará referencia con el término entorno. Un sistema puede definirse en varias formas: por el espacio que ocupa en el universo o
por la cantidad de materia. Por ejemplo, un sistema podría ser una célula viva. Los cambios en la energía del sistema que ocurren durante un evento se
manifiestan de dos formas: cambios en el contenido de calor del sistema y la realización de un trabajo. Aunque el sistema puede ganar o perder
energía, la primera ley de la termodinámica indica que la pérdida o ganancia debe equilibrarse con la ganancia o pérdida correspondiente en el
entorno, de forma que la cantidad de energía en el universo permanezca constante. La energía del sistema se conoce como energía interna (E) y sus
cambios durante una transformación es ΔE (delta E). Una forma de describir la primera ley de la termodinámica es ΔE = Q − W, donde Q es la energía
trasnmitida en forma de calor y W es la energía transmitida en forma de trabajo mecánico. Si un sistema empuja o tira contra una fuerza F a lo largo de
una distancia d, entonces el trabajo realizado durante el movimiento es W = Fd. Esta definición se ajusta a la idea intuitiva sobre la palabra trabajo.
Imagínese al elevar un objeto pesado: si se eleva el doble de altura, se realizará el doble del trabajo y también realiza el doble del trabajo si el peso es
dos veces mayor, así que la fuerza de gravedad es dos veces mayor.
Dependiendo del proceso, al final, la energía interna del sistema puede ser mayor, igual o menor que su energía interna al inicio, dependiendo de su
relación con el entorno (fig. 3–2). En otras palabras, ΔE puede ser positiva, cero o negativa. Considérese un sistema contenido en un reactor químico.
Mientras no existan cambios en la presión o el volumen del contenido, el sistema no realizará trabajo sobre su entorno o viceversa. En tal caso, la
energía interna al final de la transformación será mayor que al inicio si se absorbe calor y menor si se libera calor. Las reacciones que pierden calor se
denominan exotérmicas y aquellas que ganan calor se denominan endotérmicas y existen algunas reacciones de ambos tipos. Como ΔE para una
reacción particular puede ser positivo o negativo, este no nos proporciona información sobre la posibilidad de que ocurra un evento determinado.
Para determinar la probabilidad de una transformación en particular, se necesita considerar algunos conceptos adicionales.
FIGURA 3–2
Cambio en la energía interna de un sistema. En este ejemplo, el sistema se definirá como una hoja de una planta. a) Durante el día, la luz solar es
absorbida por pigmentos fotosintéticos en los cloroplastos de la hoja, y se usa para convertir CO2 en carbohidratos, como la molécula de glucosa que
se muestra en el dibujo (que posteriormente se incorpora en la sacarosa o el almidón). A medida que la célula absorbe la luz, su energía interna
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aumenta; la energía 4:13 en
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a CO2 en la mitocondria,
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nocturnas de la célula.
FIGURA 3–2 UAM UNIVERSIDAD AMERICANA
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Cambio en la energía interna de un sistema. En este ejemplo, el sistema se definirá como una hoja de una planta. a) Durante el día, la luz solar es
absorbida por pigmentos fotosintéticos en los cloroplastos de la hoja, y se usa para convertir CO2 en carbohidratos, como la molécula de glucosa que
se muestra en el dibujo (que posteriormente se incorpora en la sacarosa o el almidón). A medida que la célula absorbe la luz, su energía interna
aumenta; la energía presente en el resto del universo tiene que disminuir. b) Por la noche, la relación de energía entre la célula y su entorno se invierte
a medida que los carbohidratos producidos durante el día se oxidan a CO2 en la mitocondria, y la energía se utiliza para ejecutar las actividades
nocturnas de la célula.
1Se sabe que varias comunidades de microorganismos no dependen de la fotosíntesis. Éstas incluyen comunidades que residen en respiraderos
hidrotérmicos en el fondo del océano, que dependen de la energía obtenida por quimiosíntesis bacteriana.
Segunda ley de la termodinámica
La segunda ley de la termodinámica expresa el concepto de que los eventos en el universo tienen dirección; tienden a ir “cuesta abajo” desde un
estado de alta energía a un estado de baja energía. Así, en cualquier transformación de energía hay disminución de la disponibilidad de energía para
realizar un trabajo adicional. Las rocas caen de un acantilado al suelo y una vez abajo, se reduce su capacidad de realizar un trabajo adicional; es poco
probable que por sí mismas puedan llegar nuevamente a la cima. En la misma forma, cargas opuestas normalmente se mueven en conjunto, no por
separado y el calor fluye de un cuerpo caliente a uno más frío, no en el sentido contrario. Se dice que tales eventos son espontáneos, un término que
indica que son termodinámicamente favorables y que pueden ocurrir sin la entrada de energía externa.
El concepto de la segunda ley de la termodinámica se formuló originalmente para máquinas de calor y la ley conllevaba la idea de que es
termodinámicamente imposible construir una máquina de movimiento perpetuo. En otras palabras, es imposible para una máquina ser 100%
eficiente, lo que sería necesario si funcionara de forma continua sin la aplicación de energía externa. Una relación similar puede sostenerse para los
organismos vivos. Por ejemplo, cuando una jirafa consume las hojas de un árbol o cuando un león toma como presa a la jirafa, gran parte de la energía
química de los alimentos no estará disponible para el animal que está comiendo.
La pérdida de energía disponible durante un proceso es el resultado de la tendencia a que la aleatoriedad o desorden del universo aumente cada vez
que hay una transferencia de energía. Esta ganancia en el desorden se cuantifica con el término entropía y la pérdida de energía disponible es igual a
TΔS, donde ΔS es el cambio de entropía entre los estados inicial y final. La entropía se asocia con el movimiento aleatorio de partículas de materia, las
cuales, por su naturaleza aleatoria, no pueden realizar un trabajo dirigido. De acuerdo con la segunda ley de la termodinámica, todo evento se
acompaña de un incremento en la entropía del universo. Por ejemplo, cuando un cubo de azúcar se deja caer en un vaso con agua caliente, ocurre un
cambio espontáneo de las moléculas de un estado de orden en cristal a un estado mucho más desordenado cuando las moléculas de azúcar se
extienden por toda la solución (fig. 3–3a). Conforme las moléculas del cubo de azúcar se disuelven en la solución, se incrementa su libertad de
movimiento, al igual que la entropía del sistema. Los cambios de un estado concentrado a un estado disperso son consecuencia de los movimientos
aleatorios de las moléculas. Las moléculas de azúcar finalmente se diseminan en forma equitativa a través del volumen disponible porque el estado de
distribución uniforme es el estado más probable.
FIGURA 3–3
Los eventos van acompañados por un aumento en la entropía del universo. a) Un cubo de azúcar contiene moléculas de sacarosa en una
disposición altamente ordenada en la que se restringe su libertad de movimiento. A medida que el cubo se disuelve, la libertad de movimiento Pagede
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moléculas de sacarosa aumenta enormemente, y su movimiento aleatorio hace que se distribuyan
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esto ocurre, no habrá más tendencia a la redistribución, y la entropía del sistema estará en su punto máximo. b) Las moléculas de azúcar diseminadas
aleatoriamente a través de una solución pueden regresar a un estado ordenado, pero solo si aumenta la entropía del entorno, como ocurre cuando
aleatorios de las moléculas. Las moléculas de azúcar finalmente se diseminan en forma equitativa a través del volumen disponible porque el estado de
distribución uniforme es el estado más probable.
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FIGURA 3–3
Los eventos van acompañados por un aumento en la entropía del universo. a) Un cubo de azúcar contiene moléculas de sacarosa en una
disposición altamente ordenada en la que se restringe su libertad de movimiento. A medida que el cubo se disuelve, la libertad de movimiento de las
moléculas de sacarosa aumenta enormemente, y su movimiento aleatorio hace que se distribuyan por igual en todo el espacio disponible. Una vez que
esto ocurre, no habrá más tendencia a la redistribución, y la entropía del sistema estará en su punto máximo. b) Las moléculas de azúcar diseminadas
aleatoriamente a través de una solución pueden regresar a un estado ordenado, pero solo si aumenta la entropía del entorno, como ocurre cuando
las moléculas de agua más ordenadas de la fase líquida se desordenan después de la evaporación.
La liberación de calor, por ejemplo, de la oxidación de glucosa en la célula o por la fricción generada por el flujo de sangre a través de un vaso
sanguíneo, es otro ejemplo de incremento en la entropía. La liberación de energía térmica por organismos vivos, incrementa la velocidad de
movimientos aleatorios de los átomos y moléculas; esta no puede redireccionarse para realizar un trabajo adicional. Así como la energía de los
movimientos moleculares y atómico se incrementa con la temperatura, de la misma forma lo hace la entropía. Es solo un cero absoluto (0K) cuando
cesan todos los movimientos, y la entropía es cero.
Al igual que con otros eventos espontáneos, se debe diferenciar entre el sistema y su entorno. La segunda ley de la termodinámica indica que sólo el
total de la entropía del universo debe incrementarse; el desorden dentro de una parte del universo (el sistema) puede disminuir a costa de su entorno.
En la figura 3–3a, el azúcar disuelta puede disminuir su entropía; puede cristalizarse nuevamente por evaporación del agua (fig. 3–3b). Sin embargo, la
consecuencia de este proceso es un incremento incluso mayor en la entropía del entorno. El incremento en la libertad de movimientos de las
moléculas de agua en fase gaseosa equilibra la disminución de la libertad de las moléculas de los cristales de azúcar.
La vida opera con un principio similar. Los organismos vivos son capaces de disminuir su propia entropía al incrementar la entropía de su entorno. La
entropía disminuye en un organismo cuando moléculas relativamente simples, como aminoácidos, se ordenan en moléculas más complejas, como la
proteína mioglobina en las células musculares. Para que esto ocurra, la entropía del entorno debe incrementarse, lo que se logra a medida que
moléculas complejas y ordenadas, como el glucógeno almacenado en el hígado o en el tejido muscular, se convierten en calor y compuestos más
pequeños y menos ordenados (como el CO2 y H2O) son liberados al entorno. Esta es la característica del metabolismo que permite a los organismos
vivos conservar un estado altamente ordenado e improbable, al menos por un tiempo.
CAPÍTULO
Otra medición3: del
Bioenergética, enzimas
estado de energía de ylosmetabolismo, Page
organismos vivos proviene de la información contenida en sus macromoléculas. Esta información es 5un/ 58
tema difícil de definir, pero fácil de reconocer. La información puede cuantificarse en términos de la disposición ordenada de las subunidades
estructurales. Por ejemplo, las proteínas y ácidos nucleicos, en los cuales, la secuencia lineal de las subunidades es altamente ordenada, son bajas en
entropía y contienen gran cantidad de información. Mantener un estado de alto contenido de información (baja entropía) requiere del consumo de
La vida opera con un principio similar. Los organismos vivos son capaces de disminuir su propia entropía al incrementar la entropía de su entorno. La
entropía disminuye en un organismo cuando moléculas relativamente simples, como aminoácidos, se ordenan en UAM moléculas más complejas,
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proteína mioglobina en las células musculares. Para que esto ocurra, la entropía del entorno debe incrementarse, Access
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se logra
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moléculas complejas y ordenadas, como el glucógeno almacenado en el hígado o en el tejido muscular, se convierten en calor y compuestos más
pequeños y menos ordenados (como el CO2 y H2O) son liberados al entorno. Esta es la característica del metabolismo que permite a los organismos
vivos conservar un estado altamente ordenado e improbable, al menos por un tiempo.
Otra medición del estado de energía de los organismos vivos proviene de la información contenida en sus macromoléculas. Esta información es un
tema difícil de definir, pero fácil de reconocer. La información puede cuantificarse en términos de la disposición ordenada de las subunidades
estructurales. Por ejemplo, las proteínas y ácidos nucleicos, en los cuales, la secuencia lineal de las subunidades es altamente ordenada, son bajas en
entropía y contienen gran cantidad de información. Mantener un estado de alto contenido de información (baja entropía) requiere del consumo de
energía. Considérese sólo una molécula de DNA ubicada en una célula del hígado. Dicha célula tiene docenas de diferentes proteínas con la única
función de vigilar el DNA, buscando los daños para repararlos (como se revisa en la sección 13.8). Un nucleótido dañado en una célula activa puede ser
tan grande que, sin este consumo de energía, el contenido de información del DNA se deterioraría rápidamente.
REVISIÓN
1. Describir las diferencias entre la primera y segunda ley de la termodinámica y explique cómo, cuando son consideradas en conjunto, son
capaces de describir la dirección de los eventos que tendrán lugar en el universo.
2. ¿De qué forma el mantenimiento de un estado vivo ordenado es compatible con la segunda ley de la termodinámica?
3. Describir dos ejemplos en los cuales la entropía de un sistema disminuye y dos ejemplos en los cuales la entropía de un sistema incrementa.
3.2. ENERGÍA LIBRE

En conjunto, la primera y segunda leyes de la termodinámica indican que la energía del universo es constante, pero la entropía continúa
incrementándose hacia un máximo. Los conceptos inherentes a la primera y segunda ley, fueron combinados por el químico estadounidense, J.
Willard Gibbs en 1878 mediante la expresión ΔH = ΔG + TΔS, donde ΔG (delta G) es el cambio en la energía libre, es decir el cambio durante un
proceso en la energía disponible para realizar un trabajo; ΔH es un cambio en la entalpía o energía total contenida en un sistema (para nuestros
propósitos, equivalente a ΔE), T es la temperatura absoluta (K = °C + 273) y ΔS es el cambio en la entropía del sistema. La ecuación establece que
cambios en el total de energía es igual a la suma de los cambios en la energía útil (ΔG y la energía que no está disponible para realizar trabajo (TΔS).
Cuando se reordena y se describe como ΔG = ΔH−TΔS, la ecuación proporciona una medición de la espontaneidad de un proceso particular. Permite
predecir la dirección en la cual el proceso puede proceder y la extensión a la cual ocurrirá. Toda la transformación espontánea de energía debe tener
un ΔG negativo; es decir, el proceso debe continuar hacia un estado de energía libre menor. La magnitud de ΔG indica la cantidad máxima de energía
que puede transferirse de un proceso a otro, pero no dice nada con respecto a la rapidez con que ocurrirá el proceso. Los procesos que pueden
ocurrir espontáneamente, es decir, los procesos favorables desde el punto de vista termodinámico (tienen un −ΔG) se describen como exergónicos.
Por el contrario, si el ΔG de un proceso es positivo, este no ocurrirá espontáneamente. Tales procesos son desfavorables desde el punto de vista
termodinámico y se describen como endergónicos. Como se verá, las reacciones que son normalmente endergónicas pueden ocurrir por
acoplamiento con procesos que liberan energía.
Los signos de ΔH y ΔS para una transformación dada pueden ser positivos o negativos, lo que depende de la relación entre el sistema y su entorno.
(por tanto, ΔH será positiva si el sistema gana calor y negativa si pierde calor; ΔS será positiva si el sistema se vuelve más desordenado y negativa si se
vuelve más ordenado). La interacción entre ΔH y ΔS se ilustra por la transformación de aguahielo. La conversión de agua desde el estado líquido al
estado sólido se acompaña de una disminución en la entropía (ΔS es negativo, como se ilustra en la fig. 3–4) y disminuye su entalpía (ΔH negativo).
Para que ocurra esta transformación (para que ΔG sea negativa), ΔH debe ser más negativa que TΔS, una condición que sólo ocurre por debajo de 0 °C.
Esta relación puede observarse en el cuadro 3–1, que indica los valores para diferentes términos, si un mol es convertido a hielo 10 °C, 0 °C o −10 °C. En
todos los casos, sin importar la temperatura, el nivel de energía del hielo es menor que el del agua líquida (ΔH es negativa). Sin embargo, a
temperatura más alta, el término entropía de la ecuación (TΔS) es más negativo que el término entalpía; por tanto, el cambio de energía libre es
positivo y el proceso no puede ocurrir espontáneamente. A 0 °C, el sistema se encuentra en equilibrio; a −10 °C se favorece el proceso de solidificación,
es decir, ΔG es negativa.
FIGURA 3–4
Cuando el agua se congela su entropía disminuye, porque las moléculas de agua del hielo existen en un estado más ordenado. La gran cantidad de
enlaces
CAPÍTULOde hidrógeno que se encuentran
3: Bioenergética, enzimas yen el hielo favorece la entalpía de la transición aguahielo, mientras que la entropía reducida hacePage
metabolismo, que la
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transición
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libre también depende de la temperatura, predomina a temperaturas más
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altas y hace que el agua líquida sea más favorable. A temperaturas más bajas, el término entrópico de la energía libre se vuelve de menor magnitud,
hasta que eventualmente la entalpía favorable de los enlaces de hidrógeno se hace dominante, punto en el cual el hielo se vuelve más favorable
positivo y el proceso no puede ocurrir espontáneamente. A 0 °C, el sistema se encuentra en equilibrio; a −10 °C se favorece el proceso de solidificación,
es decir, ΔG es negativa.
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FIGURA 3–4
Cuando el agua se congela su entropía disminuye, porque las moléculas de agua del hielo existen en un estado más ordenado. La gran cantidad de
enlaces de hidrógeno que se encuentran en el hielo favorece la entalpía de la transición aguahielo, mientras que la entropía reducida hace que la
transición sea desfavorable. Dado que la contribución entrópica a la energía libre también depende de la temperatura, predomina a temperaturas más
altas y hace que el agua líquida sea más favorable. A temperaturas más bajas, el término entrópico de la energía libre se vuelve de menor magnitud,
hasta que eventualmente la entalpía favorable de los enlaces de hidrógeno se hace dominante, punto en el cual el hielo se vuelve más favorable
energéticamente que el agua líquida.
FUENTE: Este trabajo está autorizado bajo la licencia Creative Commons Attribution ShareAlike 3.0.
TABLA 3–1
Termodinámica de la transformación aguahielo
Temp. (°C) Δ E (cal/mol) Δ H (cal/mol) Δ S (cal/mol· °C) T Δ S (cal/mol) Δ G (cal/mol)
−10 −1 343 −1 343 −4.9 −1 292 −51
0 −1 436 −1 436 −5.2 −1 436 0
+10 −1 529 −1 529 −5.6 −1 583 154
Fuente: I. M. Klotz, Energy Changes in Biochemical Reactions, Academic Press; 1967. Con permiso de Elsevier.
Cambios en la energía libre en las reacciones químicas
Ahora que se ha revisado el concepto de energía libre en términos generales, se puede aplicar esta información a las reacciones químicas en el interior
de la célula. Todas las reacciones químicas en las células son reversibles y, por tanto, debe considerarse que ocurren dos reacciones en forma
simultánea, una en una dirección y otra en sentido inverso. De acuerdo con la ley de acción de masas, la velocidad de una reacción es proporcional a la
concentración de los reactivos. Considérese por ejemplo la siguiente reacción:
La velocidad de la reacción es directamente proporcional al producto de las concentraciones molares de A y B. La velocidad de la reacción puede
expresarse como k1[A][B], donde k1 es la velocidad constante para la reacción. La velocidad de la reacción en sentido inverso equivale a k2[C][D]. Sin
embargo, todas las reacciones químicas ocurren con lentitud, hacia un estado de equilibrio; es decir, hacia un punto en el cual las velocidades de las
reacciones en ambos sentidos son iguales. En equilibrio, el mismo número de moléculas A y B son convertidas a C y D por unidad de tiempo, según se
forman. Por tanto, en equilibrio,

CAPÍTULO 3:reorganizar
Que se puede Bioenergética,
a enzimas y metabolismo, Page 7 / 58
La velocidad de la reacción es directamente proporcional al producto de las concentraciones molares de A y B. La velocidad de la reacción puede
expresarse como k1[A][B], donde k1 es la velocidad constante para la reacción. La velocidad de la reacción en sentido
UAMinverso equivale a kAMERICANA
UNIVERSIDAD 2[C][D]. Sin
embargo, todas las reacciones químicas ocurren con lentitud, hacia un estado de equilibrio; es decir, hacia un punto en el
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Provided las velocidades de las
reacciones en ambos sentidos son iguales. En equilibrio, el mismo número de moléculas A y B son convertidas a C y D por unidad de tiempo, según se
forman. Por tanto, en equilibrio,
Que se puede reorganizar a
En otras palabras, el equilibrio es una razón predecible de la concentración de productos con la concentración de reactivos. Esta proporción, que es
igual a k1/k2, se conoce como constante de equilibrio, K e q.
La constante de equilibrio permite predecir la dirección de la reacción (en un sentido o en el sentido inverso) en el cual se favorecerá la reacción bajo
unas condiciones dadas. Por ejemplo, supóngase que se está estudiando la reacción antes mencionada y que se acaban de mezclar los cuatro
componentes (A, B, C, D) de forma que cada uno de ellos se presente en una concentración inicial de 0.5 mol.
La dirección en la cual procederá la reacción dependerá de la constante de equilibrio. Si Keq es mayor de 1, la reacción procederá a una mayor
velocidad hacia la formación de los productos C y D que en la dirección inversa. Por ejemplo, si la Keq es de 9, entonces la concentración de reactivos y
productos en equilibrio en esta mezcla particular de reactivos será de 0.25 mol y 0.75 mol, respectivamente.
Por otra parte, si Keq es menor de 1, ocurrirá la reacción inversa a una mayor velocidad que la reacción que da origen a los productos, de forma tal que
la concentración de A y B se incrementará a expensas de C y D. Se deduce que la dirección en la cual procederá la reacción en cualquier momento
dependerá de la concentración relativa de todas las moléculas que participan y que puede predecirse a partir de la Keq. Si se conoce la Keq para la
reacción, puede calcularse si la reacción ocurrirá en un sentido o en otro, al escribir la ecuación para Keq, añadiendo las concentraciones reales de
todos los reactivos y productos, y comparando luego este valor con el valor esperado de la Keq. Si el resultado es igual a Keq, entonces la reacción se
encuentra en equilibrio. Sin embargo, si el resultado es menor que Keq, esto significa que la reacción procederá hacia la formación de los productos.
Vale la pena mencionar un tipo especial de constante de equilibrio: la constante de disociación, indicada por Kd. Esta constante de disociación es
una medición de qué tanto dos moléculas tienden a mantenerse unidas. Dadas dos moléculas A y B, por ejemplo, una proteína A que se une a un
ligando B, la reacción es
donde AB es el complejo de A unido a B. Por lo general, esto hace referencia a una interacción no covalente. Para esta reacción, la constante de
equilibrio se conoce como constante de disociación y se define como:
donde [AB] denota la concentración de A unida a B, mientras que [B] y [B] son las concentraciones de A y B libres (no unidas). Al examinar la ecuación
que define Kd, puede observarse que mientras más pequeño es el valor de Kd, mayor será [AB] con respecto a [B] y [B]. Así, si un químico farmacéutico
desea clasificar una serie de inhibidores y su capacidad para unirse a una proteína en particular, deberá medir la Kd; el inhibidor con la Kd más
pequeña sería aquel que se une con mayor fuerza.
Para volver al tema de la energía. La velocidad con la que ocurre la reacción de reactivos a productos alcanza el estado de equilibrio dependiendo de
los niveles de energía libre relativa de los reactivos y los productos. En tanto la energía libre total de los reactivos es mayor que la energía total libre de
los productos, entonces ΔG tendrá un valor negativo y la reacción se realizará en la dirección de formación de productos. Mientras más grande sea ΔG,
más lejana estará la reacción del equilibrio y el sistema podrá realizar más trabajo. Conforme procede la reacción, disminuye la diferencia en el
contenido de energía libre entre los reactivos y los productos (ΔG se vuelve menos negativa), hasta que en equilibrio la diferencia es de cero (ΔG = 0) y
no puede obtenerse más trabajo.
Como ΔG para una reacción dada depende de la mezcla de reacción presente en un momento dado, no es útil comparar la energía de diversas
reacciones. Para colocar las reacciones en una base comparable y permitir varios tipos de cálculos, como convención se ha adoptado considerar los
cambios de energía
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2024926 que ocurre
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han establecido de forma arbitraria en 25 °C (298 K) y 1 atmósfera de presión, con todos los reactivos y productos presentes en una concentración 58
1.0 mol, a excepción del agua, la cual se presenta a 55.6 mol y H+ a 10−7 mol (pH 7.0).2 El cambio estándar de energía libre (Δ G °′) describe la
energía libre liberada cuando los reactivos se convierten a productos bajo estas condiciones estándar. Debe tenerse en mente que en la célula no
más lejana estará la reacción del equilibrio y el sistema podrá realizar más trabajo. Conforme procede la reacción, disminuye la diferencia en el
contenido de energía libre entre los reactivos y los productos (ΔG se vuelve menos negativa), hasta que en equilibrio la diferencia es de cero (ΔG = 0) y
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no puede obtenerse más trabajo.
Como ΔG para una reacción dada depende de la mezcla de reacción presente en un momento dado, no es útil comparar la energía de diversas
reacciones. Para colocar las reacciones en una base comparable y permitir varios tipos de cálculos, como convención se ha adoptado considerar los
cambios de energía libre que ocurre durante la reacción bajo ciertas condiciones estandarizadas. Para las reacciones bioquímicas, las condiciones se
han establecido de forma arbitraria en 25 °C (298 K) y 1 atmósfera de presión, con todos los reactivos y productos presentes en una concentración de
1.0 mol, a excepción del agua, la cual se presenta a 55.6 mol y H+ a 10−7 mol (pH 7.0).2 El cambio estándar de energía libre (Δ G °′) describe la
energía libre liberada cuando los reactivos se convierten a productos bajo estas condiciones estándar. Debe tenerse en mente que en la célula no
prevalecen las condiciones estándar y por tanto debe tenerse precaución al utilizar estos valores para los cálculos de diferencias entre energía libre
estándar de la energética celular.
La relación entre la constante de equilibrio y el cambio estándar de energía libre se obtiene por la ecuación
Cuando el logaritmo natural (ln) se convierte a log10, la ecuación se transforma en
donde R es la constante de los gases (1.987 cal/mol∙K) y T es la temperatura absoluta (298 K).3 Recuérdese que logaritmo de 1.0 es cero. En
consecuencia, se deduce que en la reacción antes mencionada que tiene una constante de equilibrio mayor de 1.0 tendrá valores negativos de ΔG°′, lo
que indica que puede ocurrir espontáneamente bajo condiciones estándar. Las acciones con constantes de equilibrio de menos de 1 tendrán valores
de ΔG°′ positivos y no pueden ocurrir de forma espontánea bajo condiciones estándar. En otras palabras, dada la reacción escrita de la siguiente
forma: A + B ⇌ C + D si ΔG°′ es negativa, la reacción avanzará hacia la derecha cuando los reactivos y productos estén presentes en concentración de 1.0
mol a un pH de 7. Cuanto mayor sea el valor negativo, avanzará más la reacción a la derecha antes de alcanzar el equilibrio. Bajo las nuevas
condiciones, si ΔG°′ es positiva, la reacción ocurrirá hacia la izquierda; es decir, se favorece la reacción inversa. La relación entre ΔG°′ y K′eq se muestra
en el cuadro 3–2.
CUADRO 3–2
Relación entre Δ G ° ′ y K ′ e q a 25 °C
K ′e q Δ G °′ (kcal/mol)
106 −8.2
104 −5.5
102 −2.7
101 −1.4
100 0.0
10−1 1.4
10−2 2.7
10−4 5.5
10−6 8.2
2ΔG°′ indica las condiciones estándar que incluyen pH 7, mientras que ΔG° indica condiciones estándar en 1.0 MH+ (pH 0.0). La designación K′
eq
también indica reacción mixta a pH 7.
3El lado derecho de esta ecuación es equivalente a la cantidad de energía libre perdida a medida que ocurre la reacción en las condiciones Page
estándar de
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equilibrio.
Cambios en la energía libre en las reacciones metabólicas

10−6 8.2
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2ΔG°′ indica las condiciones estándar que incluyen pH 7, mientras que ΔG° indica condiciones estándar en 1.0 MH+ (pH 0.0). La designación K′
eq
también indica reacción mixta a pH 7.
3El lado derecho de esta ecuación es equivalente a la cantidad de energía libre perdida a medida que ocurre la reacción en las condiciones estándar de
equilibrio.
Cambios en la energía libre en las reacciones metabólicas
Una de las reacciones químicas más importantes en la célula es la hidrólisis del ATP (fig. 3–5). En la reacción
FIGURA 3–5
Hidrólisis del ATP. El trifosfato de adenosina (ATP) se hidroliza como parte de muchos procesos bioquímicos. En la mayoría de las reacciones, como
aquí se muestra, el ATP se hidroliza a ADP y fosfato inorgánico (Pi, inorganic phosphate); pero en algunos casos (no mostrados) se hidroliza a
monofosfato de adenosina (AMP, adenosine monophosphate) un compuesto con un solo grupo fosfato y pirofosfato (PPi). Ambas reacciones tienen
esencialmente el mismo ΔG°′ de −7.3 kcal/mol (−30.5 kJ/mol).
la diferencia estándar en energía libre entre los productos y reactivos es de −7.3 kcal/mol. Con base en esta información, es evidente que la hidrólisis
de ATP es una reacción altamente favorable (exergónica) es decir, una que tiende a una relación de [ADP]/[ATP] en equilibrio. Existen varias razones
que explican por qué esta reacción es favorable, una de las cuales es evidenciada en la figura 3–5. La repulsión electrostática creada por las cuatro
cargas negativas en poco espaciadas en ATP4– se alivia parcialmente por la formación de ADP3–.
Es importante tener clara la diferencia entre ΔG y ΔG°′. El ΔG°′ es un valor fijo para una reacción dada e indica la dirección en la cual la reacción podría
proceder cuando el sistema se encuentra en condiciones estándar. Debido a que las condiciones estándar no prevalecen dentro de la célula, los
valores de ΔG°′ no pueden utilizarse para predecir la dirección en la cual ocurrirá una reacción en particular en un momento dado dentro de un
compartimiento celular particular. Para hacer esto, debe conocerse ΔG, el cual está determinado por la concentración de los reactivos y productos que
están presentes en ese momento. A 25 °C
donde [A], [B], [C] y [D] son las concentraciones en ese momento. El cálculo de la ΔG revela la dirección en la cual procederá la reacción en la célula y
que tan cerca se encuentra esta de su equilibrio. Por ejemplo, las concentraciones celulares típicas de los reactivos y productos en la reacción para la
reacción de hidrólisis de ATP podrían ser [ATP] = 10 mM; [ADP] = 1 mM; [Pi] = 10 mM. Al sustituir estos valores en la ecuación,

donde [A], [B], [C] y [D] son las concentraciones en ese momento. El cálculo de la ΔG revela la dirección en la cual procederá la reacción en la célula y
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que tan cerca se encuentra esta de su equilibrio. Por ejemplo, las concentraciones celulares típicas de los reactivos y productos en la reacción para la
reacción de hidrólisis de ATP podrían ser [ATP] = 10 mM; [ADP] = 1 mM; [Pi] = 10 mM. Al sustituir estos valores en la ecuación,
Así, aunque ΔG°′ para la hidrólisis de ATP es −7.3 kcal/mol, el ΔG típico en la célula para esta reacción es de casi −12 kcal/mol, debido a que la célula
mantiene una proporción elevada de [ATP]/[ADP]. Este hecho ilustra una forma útil de pensar con respecto a ΔG, como el número que describe qué
tan lejos se encuentra el sistema del equilibrio. El ATP es una molécula de alta energía ya que la proporción de ATP a ADP se encuentra lejos de un
valor de equilibrio.
Las células realizan muchas reacciones con valores positivos de ΔG°′ dado que las concentraciones relativas de reactivos y productos favorecen el
progreso de las reacciones. Esto puede ocurrir en dos formas. La primera ilustra las diferencias importantes entre ΔG y ΔG°′ y la segunda revela la
manera en las cuales las reacciones con valores de ΔG°′ positivos pueden llevarse a cabo en la célula mediante el suministro de energía química
almacenada.
Considérese la reacción de la glucólisis (fig. 3–24) en la cual la dihidroxiacetona fosfato se convierte en gliceraldehído 3fosfato. El ΔG°′ para esta
reacción es de +1.8 kcal/mol, pero la formación de los productos de esta reacción tiene lugar en la célula. La reacción procede debido a que otras
reacciones celulares mantienen la proporción de reactivos a producto por encima de la definida por la constante de equilibrio. En tanto se mantenga
esta condición, la ΔG será negativa y la reacción ocurrirá de forma espontánea en la dirección de formación del gliceraldehído 3fosfato. Esto trae a
colación una característica importante del metabolismo celular, a saber, que las reacciones específicas no pueden considerarse de forma
independiente como si ocurrieran de forma aislada en un tubo de ensayo. Cientos de reacciones ocurren de forma simultánea en la célula. Todas
estas reacciones están interrelacionadas debido a que el producto de una reacción se convierte el reactivo de la siguiente en secuencia y así, de una
ruta metabólica a la siguiente. Para mantener la producción de gliceraldehído 3fosfato a expensas de dihidroxiacetona fosfato, la reacción se lleva a
cabo en una ruta metabólica en la cual el producto se elimina en la siguiente reacción en secuencia con una rapidez suficientemente rápida como para
mantener una proporción favorable entre estas dos moléculas.
REVISIÓN
1. Analizar las diferencias entre ΔG y ΔG°′, las velocidades relativas de las reacciones en ambos sentidos cuando el ΔG es negativo, con valor cero o
positivo. ¿Cuál es la relación entre ΔG°′ y K′eq? ¿Cómo la célula puede llevar a cabo reacciones con +ΔG°′?
2. ¿Cómo es posible que la célula mantenga una proporción [ATP]/[ADP] mayor de 1? ¿De qué forma esta proporción difiere de la esperada en
estado de equilibrio?
3. ¿Cómo es que la formación de hielo puede darse a temperaturas por arriba de 0 °C?
3.3. ACOPLAMIENTO DE REACCIONES ENDERGÓNICAS Y EXERGÓNICAS

Las reacciones con valores grandes de ΔG°′ positivo, normalmente son llevadas a cabo por el suministro de energía. Considérese la formación del
aminoácido glutamina a partir de ácido glutámico por acción de la enzima glutamina sintetasa:
Esta reacción endergónica tiene lugar en la célula gracias a que el ácido glutámico es convertido a glutamina en dos reacciones secuenciales, ambas
exergónicas:

Se dice que la formación de glutamina se acopla a la hidrólisis de ATP. Siempre que el ΔG de la hidrólisis de ATP sea más negativo que el ΔG positivo
aminoácido glutamina a partir de ácido glutámico por acción de la enzima glutamina sintetasa:
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Esta reacción endergónica tiene lugar en la célula gracias a que el ácido glutámico es convertido a glutamina en dos reacciones secuenciales, ambas
exergónicas:
Se dice que la formación de glutamina se acopla a la hidrólisis de ATP. Siempre que el ΔG de la hidrólisis de ATP sea más negativo que el ΔG positivo
para la síntesis de glutamina a partir de ácido glutámico, la reacción de hidrólisis “cuesta abajo” de ATP puede utilizarse para estimular la síntesis
“cuesta arriba” de la glutamina. Para el acoplamiento de las dos reacciones químicas, el producto de la primera reacción se convierte en el reactivo
para la segunda. El puente entre estas dos reacciones (el glutamil fosfato en este caso) se denomina producto intermediario común. En esencia, lo que
ocurre es que la hidrólisis exergónica de ATP tiene lugar en dos etapas. En la primera etapa el ácido glutámico actúa como aceptor del grupo fosfato, el
cual es desplazado por NH3 en el segundo paso.
La hidrólisis de ATP puede utilizarse en la célula para estimular las reacciones de formación de moléculas como glutamina, porque se mantienen las
concentraciones de ATP en concentraciones mucho más elevadas (en relación con las de ADP) de lo que se esperaría en equilibrio. Esto puede
demostrarse por el siguiente cálculo. Como se mencionó antes, la concentración celular típica de Pi podría ser de 10 mM. Para calcular la relación de
equilibrio de [ADP]/[ATP] bajo estas condiciones, se establece un valor de ΔG en equilibrio de 0 y se resuelve la siguiente ecuación para [ADP]/[ATP]:
Así, en equilibrio, sería de esperarse que las concentraciones de ADP sean 107 veces más que las de ATP pero, de hecho, las concentraciones de ATP en
la mayoría de las células es 10 a 100 veces mayor que las concentraciones de ADP. Éste es un punto crucial, porque lo que importa son las
concentraciones relativas de ATP y ADP. Si la célula mantuviera un equilibrio constante de la mezcla de ATP, ADP y Pi no tendría importancia cuanto
ATP esté presente y la célula no tendría capacidad de realizar un trabajo.
La hidrólisis de ATP se utiliza para estimular la mayor parte de procesos endergónicos en la célula, lo que incluye reacciones químicas como la que se
acaba de describir, la separación de cargas a través de la membrana, la concentración de un soluto, el movimiento de filamentos en una célula
muscular y los cambios en las propiedades de las proteínas (fig. 3–6). El ATP puede utilizarse para diversos procesos debido a que su grupo fosfato
terminal puede transferirse a diferentes tipos de moléculas, incluidos aminoácidos, azúcares, lípidos y proteínas. En la mayor parte de reacciones
acopladas, el grupo fosfato se transfiere en una etapa inicial a partir del ATP a uno de estos receptores y más tarde se elimina en un segundo paso
(véase la fig. 4–46 como un ejemplo).
FIGURA 3–6
Algunas funciones para la hidrólisis del ATP. En la célula, la energía de la hidrólisis de ATP se puede usar para a) separar la carga a través de una
membrana; b) concentrar un soluto particular dentro de la célula; c) promover una reacción química, desfavorable; d) deslizar filamentos entre sí,
como ocurre durante la contracción en las celulas musculares; e) donar un grupo fosfato a una proteína, y así cambiar sus propiedades y producir la
respuesta deseada. En este caso, los grupos de fosfato añadidos sirven como sitios de unión para otras proteínas.
FIGURA 3–6
Algunas funciones para la hidrólisis del ATP. En la célula, la energía de la hidrólisis de ATP se puede usar para a) separar
Access la carga a través de una
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membrana; b) concentrar un soluto particular dentro de la célula; c) promover una reacción química, desfavorable; d) deslizar filamentos entre sí,
como ocurre durante la contracción en las celulas musculares; e) donar un grupo fosfato a una proteína, y así cambiar sus propiedades y producir la
respuesta deseada. En este caso, los grupos de fosfato añadidos sirven como sitios de unión para otras proteínas.
REVISIÓN
1. ¿Cuál es la función de un producto intermediario común para estimular una reacción química desfavorable?
3.4. EQUILIBRIO EN COMPARACIÓN CON EL METABOLISMO EN ESTADO ESTACIONARIO

Conforme las reacciones tienden al equilibrio, la energía libre disponible para realizar trabajo disminuye hacia un mínimo y la entropía aumenta hacia
el máximo. por lo tanto, cuando más lejos se mantenga la reacción de su estado de equilibrio, la capacidad de realizar trabajo se pierde e incrementa
la entropía. El metabolismo celular es en esencia un metabolismo no equilibrado; es decir, se caracteriza por porciones no equilibradas de productos
y reactivos. Esto no significa que algunas reacciones no ocurran cerca del estado de equilibrio o cerca de él, en el interior de las células. De hecho,
muchas de las acciones de las vías metabólicas pueden encontrarse cerca al equilibrio (fig. 3–25). Sin embargo, al menos una y a menudo varias
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equilibrio, haciéndolas esencialmente irreversibles. Éstas son las reacciones que mantienen la vía en
una sola dirección. También, son las que están sujetas a regulación celular debido al flujo de materiales a través de la totalidad de la vía que pueden
incrementarse o disminuir, y así, estimular o inhibir la actividad de las enzimas que catalizan estas reacciones.
Los principios básicos de la termodinámica se formularon utilizando sistemas cerrados, no vivos (sin intercambio de material entre el sistema y su
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Conforme las reacciones tienden al equilibrio, la energía libre disponible para realizar trabajo disminuye hacia un mínimo AMERICANA
y la entropía aumenta hacia
el máximo. por lo tanto, cuando más lejos se mantenga la reacción de su estado de equilibrio, la capacidad de realizar trabajo se pierde e incrementa
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la entropía. El metabolismo celular es en esencia un metabolismo no equilibrado; es decir, se caracteriza por porciones no equilibradas de productos
y reactivos. Esto no significa que algunas reacciones no ocurran cerca del estado de equilibrio o cerca de él, en el interior de las células. De hecho,
muchas de las acciones de las vías metabólicas pueden encontrarse cerca al equilibrio (fig. 3–25). Sin embargo, al menos una y a menudo varias
reacciones en las vías, se encuentran lejos del equilibrio, haciéndolas esencialmente irreversibles. Éstas son las reacciones que mantienen la vía en
una sola dirección. También, son las que están sujetas a regulación celular debido al flujo de materiales a través de la totalidad de la vía que pueden
incrementarse o disminuir, y así, estimular o inhibir la actividad de las enzimas que catalizan estas reacciones.
Los principios básicos de la termodinámica se formularon utilizando sistemas cerrados, no vivos (sin intercambio de material entre el sistema y su
entorno) bajo condiciones de equilibrio reversible. Las características únicas del metabolismo celular requieren una perspectiva diferente. El
metabolismo celular puede mantenerse a sí mismo en condiciones irreversibles, sin equilibrio, porque a diferencia del entorno en un tubo de ensayo,
la célula es un sistema abierto. Los materiales y la energía fluyen de forma continua al interior de la célula desde el torrente sanguíneo o medio de
cultivo. La extensión de este ingreso a las células desde el exterior se hace aparente si simplemente se retiene la respiración. Los seres humanos
dependen minuto a minuto de una fuente externa de oxígeno porque este es un reactivo muy importante en el metabolismo celular. El flujo continuo
de oxígeno y otros materiales hacia el interior y exterior de la célula permite que exista el metabolismo celular en un estado de equilibrio (fig. 3–7).
En estado de equilibrio, las concentraciones de los reactivos y productos permanecen relativamente constantes, incluso si las reacciones individuales
no se encuentran necesariamente en equilibrio. Esto no sugiere que las concentraciones de los metabolitos celulares no cambien. Las células son
capaces de realizar continuamente ajustes en las concentraciones de sustancias clave en respuesta a las condiciones cambiantes. Un incremento o
disminución en la concentración de sustancias reguladoras, como por ejemplo la hormona insulina, puede causar un incremento o reducción en la
producción de azúcares, aminoácidos o grasas. En otras palabras, las células se encuentran en un estado de desequilibrio dinámico, en el cual la
velocidad de las reacciones en ambos sentidos puede instantáneamente incrementarse o disminuirse en respuesta a las condiciones cambiantes.
FIGURA 3–7
Equilibrio versus metabolismo de estado estacionario. a) Mientras esta ameba pueda continuar recibiendo nutrientes del mundo exterior,
podrá cosechar la energía necesaria para mantener las concentraciones de compuestos en un estado estable, que puede estar lejos del equilibrio. Las
concentraciones de ATP y ADP en estado estacionario se indican con puntos de color y el histograma. b) Cuando la ameba muere, las concentraciones
de ATP y ADP (así como otros productos bioquímicos) cambian hacia sus proporciones de equilibrio.

Equilibrio versus metabolismo de estado estacionario. a) Mientras esta ameba pueda continuar recibiendo nutrientes del mundo exterior,
podrá cosechar la energía necesaria para mantener las concentraciones de compuestos en un estado estable, que puede estar lejos del equilibrio. Las
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concentraciones de ATP y ADP en estado estacionario se indican con puntos de color y el histograma. b) Cuando la ameba muere, las concentraciones
de ATP y ADP (así como otros productos bioquímicos) cambian hacia sus proporciones de equilibrio.
REVISIÓN
1. ¿Que define a un sistema cerrado? ¿Las células son sistemas cerrados?
3.5 LAS ENZIMAS COMO CATALIZADORES BIOLÓGICOS

Al final del siglo XIX se debatía si para el proceso de formación del etanol, requería la presencia de células de levadura intactas. En un lado del debate se
encontraba el químico orgánico Justus von Liebig quien argumentaba que las reacciones de fermentación que producían el alcohol no eran diferentes
de los tipos de reacciones orgánicas que se habían estudiado en un tubo de ensayo. Por otra parte, el biólogo Louis Pasteur argumentaba, que el
proceso de fermentación sólo podría ocurrir dentro de una célula viva intacta, altamente organizada.
En 1897, dos años después de la muerte de Pasteur, Hans Büchner, un bacteriólogo y su hermano Eduard, un químico, prepararon un “jugo de
levadura”, un extracto elaborado mediante la molienda de células de levadura y granos de arena y después filtraron la mezcla a través de un filtro de
papel. Deseaban preservar el jugo de levadura para uso ulterior. Después de intentar preservar el extracto con antisépticos y fracasar, intentaron
proteger la preparación de la descomposición añadiendo azúcar, el mismo procedimiento utilizado para conservar jamones y jaleas. En lugar de
preservar la solución, el jugo de levadura produjo gas a partir del azúcar y burbujeo continuamente por días. Después de un análisis meticuloso,
Edwards descubrió que la fermentación produjo etanol y que las burbujas eran de dióxido de carbono. Büchner demostró que la fermentación no
requería la presencia de células intactas.
CAPÍTULO
Sin embargo,3:pronto
Bioenergética,
encontró enzimas y metabolismo,
que la fermentación
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era muy diferente de los tipos de reacciones llevadas a cabo por los químicos orgánicos. La
fermentación requería la presencia de un grupo singular de catalizadores que no tenían contraparte en un mundo sin vida. Estos catalizadores se
denominaron enzimas (derivado del griego para “en la levadura”). Las enzimas son los mediadores del metabolismo, responsables de prácticamente
levadura”, un extracto elaborado mediante la molienda de células de levadura y granos de arena y después filtraron la mezcla a través de un filtro de
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papel. Deseaban preservar el jugo de levadura para uso ulterior. Después de intentar preservar el extracto con antisépticos AMERICANA
y fracasar, intentaron
proteger la preparación de la descomposición añadiendo azúcar, el mismo procedimiento utilizado para conservarAccess
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preservar la solución, el jugo de levadura produjo gas a partir del azúcar y burbujeo continuamente por días. Después de un análisis meticuloso,
Edwards descubrió que la fermentación produjo etanol y que las burbujas eran de dióxido de carbono. Büchner demostró que la fermentación no
requería la presencia de células intactas.
Sin embargo, pronto encontró que la fermentación era muy diferente de los tipos de reacciones llevadas a cabo por los químicos orgánicos. La
fermentación requería la presencia de un grupo singular de catalizadores que no tenían contraparte en un mundo sin vida. Estos catalizadores se
denominaron enzimas (derivado del griego para “en la levadura”). Las enzimas son los mediadores del metabolismo, responsables de prácticamente
toda reacción que ocurre en una célula. Sin enzimas, las reacciones metabólicas ocurrirían de forma tan lenta que serían imperceptibles.
La primera evidencia de que las enzimas eran proteínas la obtuvo James Sumner de la Cornell University en 1926, cuando cristalizaron la enzima
ureasa a partir de semillas de frijol y determinaron su composición. Aunque este hallazgo no fue bien recibido en ese momento, se demostró que
muchas otras enzimas eran proteínas y durante las siguientes décadas se aceptó que todos los catalizadores biológicos eran proteínas. Al final se hizo
evidente que ciertas reacciones biológicas eran catalizadas por moléculas de RNA. Con fines de claridad, el término enzima se reserva para proteínas
catalíticas, mientras que el término ribozima se utiliza para el RNA catalizador. Se limitará el análisis en este capítulo a las proteínas catalíticas y las
propiedades del RNA catalítico se revisarán en el capítulo 11.
Aunque todas las enzimas son proteínas, muchas de ellas son proteínas conjugadas; es decir, contienen componentes no proteínicos denominados
cofactores que pueden ser inorgánicos (metales) u orgánicos (coenzimas). Las vitaminas y sus derivados a menudo funcionan como coenzimas.
Cuando están presentes, los cofactores son participantes importantes en el funcionamiento de las enzimas, a menudo llevando a cabo actividades
para las cuales los aminoácidos no son apropiados. Por ejemplo, como se revisó en el capítulo previo, en la mioglobina, el átomo de hierro del grupo
hemo es el sitio donde se une el oxígeno y se almacena hasta que sea requerido para el metabolismo celular.
Propiedades de las enzimas
Como ocurre para todos los catalizadores, las enzimas muestran las siguientes propiedades: 1) sólo se requieren en pequeñas cantidades; 2) no se
alteran de manera irreversible durante el transcurso de la reacción y por lo tanto, cada molécula de enzima puede participar de manera repetida en
reacciones individuales y 3) no tienen efecto sobre la termodinámica de la reacción. Este último punto es de particular importancia. Las enzimas no
suministran energía para una reacción química y por lo tanto, no determinan si la reacción es favorable o desfavorable desde el punto de vista
termodinámico. De la misma forma, las enzimas no determinan la proporción de productos con respecto a los reactivos en estado de equilibrio. Éstas
son propiedades inherentes de los reactivos químicos. Como catalizadores, las enzimas sólo aceleran la velocidad a la cual se lleva cabo una reacción
química favorable.
No existe necesariamente una relación entre la magnitud del ΔG para una reacción particular y velocidad a la cual tiene lugar dicha reacción. La
magnitud de ΔG muestra sólo la diferencia en la energía libre entre el estado inicial y el equilibrio. Es totalmente independiente de la vía o del tiempo
que toma para alcanzar el equilibrio. Por ejemplo, la oxidación de la glucosa es un proceso favorable, lo cual puede determinarse por la cantidad de
energía liberada durante su combustión. Sin embargo, los cristales de glucosa pueden dejarse en una habitación de manera prácticamente indefinida
sin una conversión detectable en materiales con menos energía. En otras palabras, la glucosa, es cinéticamente estable aún si es termodinámicamente
inestable. Incluso si el azúcar se disolviera, mientras la solución se mantenga estéril, no se deterioraría con rapidez. Sin embargo, si se añaden unas
cuantas bacterias en un periodo corto de tiempo, el azúcar será captado por las células y sufrirá degradación enzimática.
Las enzimas son catalizadores notablemente eficientes. Los catalizadores utilizados por los químicos orgánicos en el laboratorio, como ácidos o
platino metálico y magnesio, generalmente aceleran las reacciones de cientos a miles de veces en comparación con la velocidad sin catalizadores. Por
el contrario, las enzimas típicamente incrementan la velocidad de la reacción 108 a 1013 veces o incluso más (cuadro 3–3). Con base en estas cifras, las
enzimas pueden realizar en un segundo lo que podría requerir de tres a 300 000 años si no hubiera enzimas. Aún más notable, realizan esta tarea a la
temperatura y pH que por lo general se encuentran dentro de las células. Además, a diferencia de los catalizadores inorgánicos utilizados por los
químicos, las enzimas son muy específicas en los reactivos a los que pueden unirse y en las reacciones que catalizan. Los reactivos que se unen a una
enzima se denominan sustratos. Por ejemplo, si la enzima hexocinasa está presente en una solución con cientos de compuestos de bajo peso
molecular además de su sustrato la glucosa, la enzima sólo reconocerá a las moléculas de glucosa y ocurrirá la reacción. Para fines prácticos, los otros
compuestos podrían estar ausentes. Este tipo de especificidad ya sea entre enzimas y sustratos u otros tipos de proteínas y sustancias a las que se
unen, es crucial para el mantenimiento del orden requerido para la vida.
CUADRO 3–3
Actividad catalítica de una variedad de enzimas

CAPÍTULO 1
3: Bioenergética, enzimas yt 1metabolismo, 1 Page 16 / 58
Enzima / 2 no enzimática Número de recambio2 Incremento de velocidad3
OMP descarboxilasa 78 000 000 años 39 1.4 × 1017
enzima se denominan sustratos. Por ejemplo, si la enzima hexocinasa está presente en una solución con cientos de compuestos de bajo peso
molecular además de su sustrato la glucosa, la enzima sólo reconocerá a las moléculas de glucosa y ocurrirá la reacción. Para fines prácticos, los otros
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compuestos podrían estar ausentes. Este tipo de especificidad ya sea entre enzimas y sustratos u otros tipos de proteínas y sustancias a las que se
unen, es crucial para el mantenimiento del orden requerido para la vida.
CUADRO 3–3
Actividad catalítica de una variedad de enzimas
Enzima t 1 / 21 no enzimática1 Número de recambio2 Incremento de velocidad3
OMP descarboxilasa 78 000 000 años 39 1.4 × 1017
Nucleasa estafilocócica 130 000 años 95 5.6 × 1014
Adenosina deaminasa 120 años 370 2.1 × 1012
Nucleosidasa AMP 69 000 años 60 6.0 × 1012
Citidina deaminasa 69 años 299 1.2 × 1012
Fosfotriesterasa 2.9 años 2 100 2.8 × 1011
Carboxipeptidasa A 7.3 años 578 1.9 × 1011
Quetosteroide isomerasa 7 semanas 66 000 3.9 × 1011
Triosafosfato isomerasa 1.9 días 4,300 1.0 × 109
Corismato mutasa 7.4 horas 50 1.9 × 106
Anhidrasa carbónica 5 segundos 1 × 106 7.7 × 106
Ciclofilina, humana 23 segundos 13 000 4.6 × 105
1Tiempo a transcurrir para que la mitad de los reaccionantes se convirtiera en producto en ausencia de enzima.
2Número de reacciones catalizadas por una sola molécula de enzima por segundo cuando se opera a una concentración de sustrato saturada.
3Aumento en la velocidad de reacción alcanzada por la reacción catalizada por enzimas sobre la reacción no catalizada.
Fuente: A. Radzicka y R. Wolfenden. Science 1995;267:91. Copyright 1995. Reproducido con autorización de AAAS.
Además de su alto nivel de actividad y especificidad, las enzimas actúan como directores en el sentido de que las reacciones catalizadas por enzimas
son muy ordenadas; los únicos productos formados son los apropiados. Esto es muy importante ya que la formación de subproductos químicos
ocasionaría rápidamente la muerte de la célula frágil. Por último, a diferencia de otros catalizadores, la actividad enzimática puede regularse para
satisfacer las necesidades particulares de una célula en un momento en particular. Como se hará evidente en este capítulo y a lo largo del texto, las
enzimas son realmente una colección maravillosa de máquinas moleculares en miniatura.
Superando la barrera energética de activación
¿Cómo pueden las enzimas realizar una catálisis tan eficaz? La primera pregunta a considerar es por qué una reacción termodinámicamente favorable
no procede por sí misma a una velocidad relativamente rápida en ausencia de enzimas. Incluso el ATP, cuya hidrólisis es tan favorable, es estable en
las células hasta que se desdoble en una reacción enzimáticamente controlada. Si éste no fuera el caso, el ATP tendría poco uso biológico.
La transformación
Downloaded química
2024926 requiere
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IPciertos enlaces covalentes se desdoblen en reactivos. Para que esto ocurra, los reactivos deben contener
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suficiente energía
CAPÍTULO cinética (energía
3: Bioenergética, de movimiento)
enzimas para superar una barrera, que se conoce como activación energética (E A ). Esto se Page
y metabolismo, expresa
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figura 3–8, donde la energía de activación se representa por la altura de la curva. Los reactivos en una reacción química se comparan a menudo con
un objeto que se encuentra en reposo en la punta de un acantilado listo para desplomarse hacia el fondo. Si se le deja por sí mismo, el objeto
Superando la barrera energética de activación
¿Cómo pueden las enzimas realizar una catálisis tan eficaz? La primera pregunta a considerar es por qué una reacción termodinámicamente favorable
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no procede por sí misma a una velocidad relativamente rápida en ausencia de enzimas. Incluso el ATP, cuya hidrólisis es tan favorable, es estable en
las células hasta que se desdoble en una reacción enzimáticamente controlada. Si éste no fuera el caso, el ATP tendría poco uso biológico.
La transformación química requiere que ciertos enlaces covalentes se desdoblen en reactivos. Para que esto ocurra, los reactivos deben contener
suficiente energía cinética (energía de movimiento) para superar una barrera, que se conoce como activación energética (E A ). Esto se expresa en la
figura 3–8, donde la energía de activación se representa por la altura de la curva. Los reactivos en una reacción química se comparan a menudo con
un objeto que se encuentra en reposo en la punta de un acantilado listo para desplomarse hacia el fondo. Si se le deja por sí mismo, el objeto
probablemente permanecería allí indefinidamente. Sin embargo, si algo le proporcionara al objeto suficiente energía para superar la fricción u otra
pequeña barrera en su camino y ocasionara que alcanzara el borde del acantilado, este presentaría una caída espontánea hacia el fondo. El objeto
tiene el potencial de caer a un estado de menor energía una vez se ha superado la barrera cinética.
FIGURA 3–8
Energía de activación y reacciones enzimáticas. Aunque la formación de glucosa 6fosfato es una reacción termodinámicamente favorecida (ΔG°
′ = −4 kcal/mol), los reaccionantes deben poseer energía suficiente para lograr un estado activado en el que se puedan producir los reordenamientos
atómicos necesarios para la reacción. La cantidad de energía requerida se llama energía de activación (EA) y está representada por altura de la curva.
La energía de activación no es un valor fijo, sino que varía con la secuencia de reacción particular. EA se reduce mucho cuando los reaccionantes se
combinan con una enzima catalizadora. (Este diagrama muestra un mecanismo de reacción simple de un solo paso). Muchas reacciones enzimáticas
tienen lugar en dos o más pasos que conducen a la formación de intermediarios (como en la figura 3–13). Cada paso de la reacción tiene una EA
diferente y un estado de transición separado.
En una solución a temperatura ambiente, las moléculas se encuentran en un estado de movimiento aleatorio, cada una con cierta cantidad de energía
cinética en un momento dado. Entre la población de moléculas, su energía se distribuye en una forma de curva de campana (fig. 3–9), algunas tienen
muy poca energía y otras muchas más. Las moléculas con alta energía (moléculas activadas) permanecen en tal estado sólo por un breve periodo de
tiempo, perdiendo su exceso de energía al colisionar con otras moléculas. Consideremos una reacción en la cual una molécula se divide en dos
moléculas. Si una molécula reactante adquiere suficiente energía para superar la barrera de activación, entonces existe la posibilidad que se divida en
dos moléculas como productos. La velocidad de la reacción depende del número de moléculas reactantes que contengan la energía cinética necesaria
en un momento dado. Una forma de incrementar la velocidad de la reacción es incrementar la energía de los reactivos. Esto se realiza con mayor
facilidad en el laboratorio al calentar la mezcla de reacción (fig. 3–9). Por el contrario, al aplicar calor a una reacción mediada por enzimas lleva a una
rápida inactivación de la enzima debido a su desnaturalización.
FIGURA 3–9
El efecto de reducir la energía de activación en la velocidad de una reacción. Las curvas en forma de campana indican el contenido de
energía de una2024926
Downloaded población4:13de moléculas
P Your IPpresente en una mezcla reaccionante a dos temperaturas diferentes. El número de moléculas reactivas que
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contienen suficiente energía para experimentar la reacción se incrementa calentando la mezcla o añadiendo un catalizador enzimático. ElPage
CAPÍTULO 3: Bioenergética, enzimas y metabolismo, calor18 / 58
incrementa la velocidad de reacción al aumentar el contenido de energía de las moléculas para que una fracción más grande tenga energía suficiente
para superar la barrera de energía de activación (curvas rojas versus azules), mientras que la enzima lo hace al disminuir la energía de activación
facilidad en el laboratorio al calentar la mezcla de reacción (fig. 3–9). Por el contrario, al aplicar calor a una reacción mediada por enzimas lleva a una
rápida inactivación de la enzima debido a su desnaturalización. UAM UNIVERSIDAD AMERICANA
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FIGURA 3–9
El efecto de reducir la energía de activación en la velocidad de una reacción. Las curvas en forma de campana indican el contenido de
energía de una población de moléculas presente en una mezcla reaccionante a dos temperaturas diferentes. El número de moléculas reactivas que
contienen suficiente energía para experimentar la reacción se incrementa calentando la mezcla o añadiendo un catalizador enzimático. El calor
incrementa la velocidad de reacción al aumentar el contenido de energía de las moléculas para que una fracción más grande tenga energía suficiente
para superar la barrera de energía de activación (curvas rojas versus azules), mientras que la enzima lo hace al disminuir la energía de activación
requerida para que ocurra la reacción (líneas de puntos verticales).
Se dice que cuando los reactivos se encuentran en la cresta de la curva de energía y listos para convertirse en productos, se encuentran en estado de
transición (fig. 3–8). En este punto, los reactivos han formado un complejo momentáneo y activado, en el que se forman y rompen enlaces. Se puede
ilustrar la naturaleza de la estructura de un estado de transición al examinar la interconversión de los estereoisómeros D y L de prolina, una reacción
catalizada por la enzima bacteriana prolina racemasa.
Esta reacción procede en cualquier dirección a través de la pérdida de un protón del carbón α de la molécula de prolina. Como consecuencia, la
estructura del estado de transición contiene un carbanión de carga negativa en el cual se forman tres enlaces por el átomo de carbono, todos en el
mismo plano.
A diferencia de la energía libre estándar para una reacción, la energía de activación necesaria para alcanzar un estado de transición no es un valor fijo,
sino que varía con el mecanismo de reacción particular utilizado. Las enzimas catalizan reacciones al disminuir la magnitud de la barrera de energía de
activación. En consecuencia, a diferencia de la catálisis por calor, las enzimas hacen que sus sustratos sean muy reactivos sin tener que aumentar a
niveles de energía particularmente altos. En la figura 3–9 se muestra una comparación entre el porcentaje de moléculas capaces de reaccionar en una
reacción catalizada por enzimas en comparación con una reacción no catalizada. Las enzimas tienen la capacidad de reducir la energía de activación al
unirse de forma más estrechamente a un estado de transición que los reactivos, lo que estabiliza este complejo activado, disminuyendo su energía.
Como consecuencia, las diferencias en la forma y las propiedades de unión entre reactivos y el estado de transición son el objetivo de investigación en
los mecanismos enzimáticos. La importancia del estado de transición puede demostrarse de diversas formas. Por ejemplo:
Compuestos que simulan el estado de transición de una reacción tienden a ser inhibidores muy eficaces de la reacción, ya que son capaces de
unirse de manera estrecha a la región catalítica de la enzima.
Los anticuerpos normalmente no se comportan como enzimas, sino que simplemente son moléculas que se unen con gran afinidad. Sin
embargo, los anticuerpos que se unen a un compuesto que simula un estado de transición para una reacción, son a menudo capaces de actuar
reacción catalizada por enzimas en comparación con una reacción no catalizada. Las enzimas tienen la capacidad de reducir la energía de activación al
unirse de forma más estrechamente a un estado de transición que los reactivos, lo que estabiliza este complejo activado, disminuyendo su energía.
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Como consecuencia, las diferencias en la forma y las propiedades de unión entre reactivos y el estado de transición son el objetivo de investigación en
los mecanismos enzimáticos. La importancia del estado de transición puede demostrarse de diversas formas. Por ejemplo:
Compuestos que simulan el estado de transición de una reacción tienden a ser inhibidores muy eficaces de la reacción, ya que son capaces de
unirse de manera estrecha a la región catalítica de la enzima.
Los anticuerpos normalmente no se comportan como enzimas, sino que simplemente son moléculas que se unen con gran afinidad. Sin
embargo, los anticuerpos que se unen a un compuesto que simula un estado de transición para una reacción, son a menudo capaces de actuar
como enzimas y de catalizar el desdoblamiento de dicho compuesto.
Conforme el estado de transición se convierte a productos, la afinidad de las enzimas para la(s) molécula(s) unida(s), disminuye y los productos son
liberados.
Sitio de activación
Como catalizadores, las enzimas aceleran el proceso de rompimiento y formación de enlaces. Para lograr esta actividad, las enzimas se involucran
estrechamente en las actividades que tienen lugar entre los reactivos. Las enzimas llevan a cabo esto al formar complejos con los reactivos, que se
conocen como complejo enzimasustrato (ES). Un complejo ES se ilustra esquemáticamente en la figura 3–10 y en la imagen de la figura 3–14. En la
mayoría de los casos, la asociación entre enzimas y sustratos es no covalente, aunque se conocen algunos ejemplos en los cuales se forma un enlace
covalente de manera transitoria.
FIGURA 3–10
Formación de un complejo enzimasustrato. Dibujo esquemático de la reacción catalizada por la piruvato cinasa (véase figura 3–24) en la que los
dos sustratos, fosfoenolpiruvato (PEP, phosphoenolpyruvate) y ADP, se unen a la enzima para formar un complejo enzimasustrato (ES), que conduce
a la formación de los productos piruvato y ATP.
La parte de la molécula de la enzima que participa directamente en la unión al sustrato se denomina sitio activo. El sitio activo y el sustrato (o
sustratos) tienen formas complementarias, lo que les permite unirse con un alto grado de precisión. La unión del sustrato a la enzima se lleva cabo por
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los mismos tipos 4:13 P Your
de interacciones IP is 190.184.96.187
no covalente (enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, interacciones hidrófobas) que determinan la estructura de la
CAPÍTULO
proteína misma. Por ejemplo, la enzima yilustrada
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en la figura 3–11a, contiene varios residuos de carga positiva localizados estratégicamentePage 20 / 58
para
unirse a los átomos de carga negativa del sustrato. Además de unirse al sustrato, el sitio activo contiene una disposición particular de las cadenas
laterales de los aminoácidos que influyen en el sustrato y reducen la energía de activación de la reacción. La importancia de cada una de las cadenas
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La parte de la molécula de la enzima que participa directamente en la unión al sustrato se denomina sitio activo. El sitio activo y el sustrato (o
sustratos) tienen formas complementarias, lo que les permite unirse con un alto grado de precisión. La unión del sustrato a la enzima se lleva cabo por
los mismos tipos de interacciones no covalente (enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, interacciones hidrófobas) que determinan la estructura de la
proteína misma. Por ejemplo, la enzima ilustrada en la figura 3–11a, contiene varios residuos de carga positiva localizados estratégicamente para
unirse a los átomos de carga negativa del sustrato. Además de unirse al sustrato, el sitio activo contiene una disposición particular de las cadenas
laterales de los aminoácidos que influyen en el sustrato y reducen la energía de activación de la reacción. La importancia de cada una de las cadenas
laterales del sitio de activación puede valorarse mediante mutagénesis dirigida (sección 18.25), una técnica en la cual un aminoácido en particular es
sustituido por otro aminoácido con propiedades diferentes.
FIGURA 3–11
Sitio activo de una enzima. a) Diagrama del sitio activo de la enzima ribulosa bisfosfato carboxilasa oxigenasa que muestra los diversos sitios de
interacción entre los sustratos unidos (RuBP y CO2) y ciertas cadenas laterales de aminoácidos de la enzima. Además de determinar las propiedades de
unión al sustrato del sitio activo, estas interacciones no covalentes alteran las propiedades del sustrato de manera que aceleran su conversión a
productos. b) Mapa de densidad electrónica del sitio activo de una enzima de coagulación de la sangre llamada factor Xa con un inhibidor químico que
imita el sustrato, la protrombina, que se muestra superpuesta (roja). La superficie gris proporciona una indicación de los alcances externos de los
orbitales de electrones de los átomos que forman las cadenas laterales de la enzima, plasmando así una representación visual del espacio ocupado
por los átomos del sitio activo. Se puede ver claramente que el sustrato se une a una hendidura profunda en la proteína, típica de los sitios activos. El
sitio activo serina, Ser195, aparece en azul. Las regiones de proteínas importantes para determinar qué moléculas se pueden unir como sustratos,
conocidas como S1 y S4, están formadas por múltiples cadenas laterales y están indicadas en amarillo y verde.
FUENTE: a) D. A. Harris. Bioenergetics at a Glance, Blackwell; 1995, p. 88; b) de Yeh C. H., Fredenburgh J. C., Weitz J. I. Oral direct factor Xa
inhibitors. Circulation Research 2012;111,1069–1078.
El sitio activo está típicamente localizado en una hendidura o grieta que conduce desde el entorno acuoso hasta las profundidades de la proteína.
Cuando un sustrato entra en la hendidura del sitio activo, este normalmente pierde sus moléculas de agua (desolvación) y entra a un entorno
hidrófobo entre la enzima. La reactividad de las cadenas laterales en el sitio activo, pueden ser mucho mayores en este entorno protegido, en
comparación con un solvente acuoso en la célula. Los aminoácidos que constituyen el sitio activo por lo general están ubicados en puntos distantes a
lo largo de la cadena polipeptídica, pero son llevados en estrecha proximidad uno con otro, conforme el polipéptido se pliega en su estructura
terciaria final (fig. 3–11b). La estructura del sitio activo explica la actividad catalítica de la enzima y su especificidad. Como se mencionó antes, la
mayoría de las enzimas son capaces de unirse sólo a un número pequeño de moléculas biológicas estrechamente relacionadas.
REVISIÓN
1. ¿Cómo es posible tener una reacción caracterizada por un ΔG grande y una EA pequeña? ¿O un EA grande y ΔG pequeño?
2. Explique de qué forma las enzimas pueden ser específicas para los sustratos a los que se unen.
3.6. MECANISMOS DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA

¿De qué forma2024926
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velocidades indetectables en ausencia de la enzima? La respuesta yace en la formación del complejo enzimasustrato, el cual, permite quePage
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el sustrato
o sustratos sean captados de la solución y llevados a la superficie de una gran molécula catalítica. Una vez ahí, las propiedades físicas y químicas del
sustrato pueden ser afectados en diversas formas, varias de las cuales se describen en las secciones siguientes.
2. Explique de qué forma las enzimas pueden ser específicas para los sustratos a los que se unen.
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3.6. MECANISMOS DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA

¿De qué forma una enzima puede causar que ocurra una reacción cientos de veces por segundo cuando la misma reacción podría ocurrir a
velocidades indetectables en ausencia de la enzima? La respuesta yace en la formación del complejo enzimasustrato, el cual, permite que el sustrato
o sustratos sean captados de la solución y llevados a la superficie de una gran molécula catalítica. Una vez ahí, las propiedades físicas y químicas del
sustrato pueden ser afectados en diversas formas, varias de las cuales se describen en las secciones siguientes.
Orientación del sustrato
Supóngase que se coloca un puñado de tuercas y tornillos en una bolsa y se agita por cinco minutos. Es muy poco probable que alguno de los tornillos
se haya enroscado firmemente en una tuerca cuando acabe de sacudirse la bolsa. Por el contrario, si se sujeta un tornillo en una mano y una tuerca en
la otra, usted podría rápidamente guiar el tornillo al interior de la tuerca. Al sostener la tuerca y el tornillo en la orientación apropiada, se disminuye en
gran medida la entropía del sistema. Las enzimas reducen la entropía de sus sustratos en forma similar.
Los sustratos unidos a la superficie de una enzima son llevados muy estrechamente uno con otro en una orientación correcta para que se lleve a cabo
la reacción (fig. 3–12a). Por el contrario, cuando los reactivos están presentes en solución, tienen la libertad de presentar movimientos de rotación y
traslación, e incluso aquellos que poseen energía suficiente no necesariamente sufrirán una colisión que resulte en la formación de un complejo de
estado de transición.
Cambios en la reactividad del sustrato
Las enzimas están compuestas por aminoácidos que tienen diversos tipos de cadenas laterales, desde aquéllas con carga completa hasta compuestos
altamente no polares. Cuando un sustrato se une a la superficie de una enzima, la distribución de los electrones en la molécula sustrato se ven
influenciadas por las cadenas laterales cercanas de la enzima (fig. 3–12b). Esta influencia incrementa la reactividad del sustrato y estabiliza el complejo
de estado de transición formado durante la reacción. Estos efectos se llevan a cabo sin el suministro de energía externa, como el calor.
FIGURA 3–12
Tres mecanismos mediante los cuales las enzimas aceleran las reacciones: a) manteniendo una orientación precisa del sustrato, b)
cambiando la reactividad del sustrato al alterar su configuración electrostática, c) ejerciendo un estrés físico sobre los enlaces en el sustrato que se va
a romper.

FIGURA 3–12

Tres mecanismos mediante los cuales las enzimas aceleran las reacciones: a) manteniendo una orientación precisa del sustrato, b)
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cambiando la reactividad del sustrato al alterar su configuración electrostática, c) ejerciendo un estrés físico sobre los enlaces en el sustrato que se va
a romper.
Existen varios mecanismos generales por los cuales la reactividad de los sustratos se incrementa por la asociación con las enzimas. Básicamente, estos
mecanismos son similares a los identificados por químicos orgánicos que estudiaron los mecanismos de las reacciones orgánicas en tubos de ensayo.
Por ejemplo, la velocidad de reacción puede afectarse en gran medida por cambios en el pH. Aunque las enzimas no pueden modificar el pH de su
entorno, contienen numerosos aminoácidos con cadenas laterales ácidas o básicas. Estos grupos pueden aceptar o donar protones hacia y desde el
sustrato, alterando así las características electrostáticas del sustrato, haciéndolo más reactivo.
El sitio activo de muchas enzimas contiene cadenas laterales con cargas parcialmente positiva o negativa. Tales grupos tienen la capacidad de
interactuar con un sustrato para alterar sus propiedades electrostáticas (fig. 3–12b) y por tanto su reactividad. Tales grupos son capaces de reaccionar
con un sustrato para producir una unión covalente transitoria entre enzima y sustrato. La quimiotripsina, una enzima que digiere proteínas de la
comida en el intestino delgado, actúa de esta manera. En la figura 3–13 se muestra la serie de reacciones que tienen lugar mientras la quimiotripsina
hidroliza el enlace peptídico en un sustrato proteínico. La reacción que se muestra en la figura 3–13 se divide en dos pasos. En el primero, el átomo de
oxígeno electronegativo de la cadena lateral de la serina de la enzima “ataca” un átomo de carbono del sustrato. Como consecuencia, el enlace
peptídico del 2024926
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4:13 P YouryIP seisforma un enlace covalente entre la serina y el sustrato, desplazando el resto del sustrato como uno de sus
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productos. Como
CAPÍTULO se mencionaenzimas
3: Bioenergética, en la leyenda de la figura, la capacidad de la serina para llevar a cabo esta reacción depende del residuo dePage
y metabolismo, histidina
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el cual, atrae el Rights
protónReserved. Terms of
del grupo hidroxilo deUse • Privacy
la serina, Policy • Notice
incrementando • Accessibility
el poder nucleofílico del átomo del oxígeno del grupo. Las enzimas
también tienen la capacidad de utilizar moléculas de agua en la reacción que catalizan. En el segundo paso, que se muestra en la figura 3–13b, el
enlace covalente entre la enzima y sustrato se escinde por una molécula de agua, regresando la enzima a su estado original libre y liberando el resto
interactuar con un sustrato para alterar sus propiedades electrostáticas (fig. 3–12b) y por tanto su reactividad. Tales grupos son capaces de reaccionar
con un sustrato para producir una unión covalente transitoria entre enzima y sustrato. La quimiotripsina, una enzima UAM UNIVERSIDAD
que AMERICANA
digiere proteínas de la
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comida en el intestino delgado, actúa de esta manera. En la figura 3–13 se muestra la serie de reacciones que tienen lugar mientras la quimiotripsina
hidroliza el enlace peptídico en un sustrato proteínico. La reacción que se muestra en la figura 3–13 se divide en dos pasos. En el primero, el átomo de
oxígeno electronegativo de la cadena lateral de la serina de la enzima “ataca” un átomo de carbono del sustrato. Como consecuencia, el enlace
peptídico del sustrato sufre hidrólisis y se forma un enlace covalente entre la serina y el sustrato, desplazando el resto del sustrato como uno de sus
productos. Como se menciona en la leyenda de la figura, la capacidad de la serina para llevar a cabo esta reacción depende del residuo de histidina
cercano, el cual, atrae el protón del grupo hidroxilo de la serina, incrementando el poder nucleofílico del átomo del oxígeno del grupo. Las enzimas
también tienen la capacidad de utilizar moléculas de agua en la reacción que catalizan. En el segundo paso, que se muestra en la figura 3–13b, el
enlace covalente entre la enzima y sustrato se escinde por una molécula de agua, regresando la enzima a su estado original libre y liberando el resto
del sustrato como un segundo producto.
FIGURA 3–13
Diagrama del mecanismo catalítico de la quimotripsina. La reacción se divide en dos pasos. a) El átomo de oxígeno electronegativo de un
residuo de serina (Ser195) en la enzima, que lleva una carga negativa parcial, lleva a cabo un ataque nucleófilo en el átomo de carbono carbonilo del
sustrato, que lleva una carga positiva parcial, lo que divide el enlace péptido. El sustrato polipeptídico se muestra en azul. La serina se vuelve más
reactiva mediante un residuo de histidina aplicado de cerca (His57) que extrae el protón de la serina y posteriormente dona el protón al átomo de
nitrógeno del enlace peptídico escindido. La histidina puede hacer esto porque su cadena lateral es una base débil que es capaz de ganar y perder un
protón a un pH fisiológico. (Una base más fuerte como la lisina permanecería totalmente protonada a este pH). Parte del sustrato forma un enlace
covalente transitorio con la enzima por medio de la cadena lateral de serina, mientras que el resto del sustrato se libera como el primer producto. (Se
puede observar que los residuos de serina e histidina están situados a 138 aminoácidos uno del otro en la secuencia primaria, pero se juntan dentro
de la enzima mediante el plegamiento del polipéptido. Un ácido aspártico, el residuo 102 que no se muestra, también desempeña un papel en la
catálisis, influyendo en el estado iónico de la histidina). b) En el segundo paso, el átomo de oxígeno electronegativo de una molécula de agua desplaza
al sustrato unido en forma covalente de la enzima, y regenera la molécula de enzima no unida. Como en el primer paso, la histidina realiza un papel en
la transferencia de protones; en este paso, el protón se elimina del agua, por lo que es un nucleófilo mucho más fuerte. El protón se dona
posteriormente al residuo de serina de la enzima.

catálisis, influyendo en el estado iónico de la histidina). b) En el segundo paso, el átomo de oxígeno electronegativo de una molécula de agua desplaza
al sustrato unido en forma covalente de la enzima, y regenera la molécula de enzima no unida. Como en el primer paso, la histidina realiza un papel en
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la transferencia de protones; en este paso, el protón se elimina del agua, por lo que es un nucleófilo mucho más fuerte. El protón se dona
posteriormente al residuo de serina de la enzima.
Aunque las cadenas laterales de aminoácidos pueden participar en diversas reacciones, no son apropiadas para donar o aceptar electrones. Como se
verá en las siguientes secciones (de forma más amplia en los cap. 5 y 6), la transferencia de electrones es evento central en las reacciones de óxido
reducción que desempeñan una función vital en el metabolismo celular. Para catalizar estas reacciones, las enzimas contienen cofactores (iones
metálicos o coenzimas) que incrementan la reactividad de los sustratos al aceptar o donar electrones. En varios casos, las enzimas crean su propio
cofactor aceptor de electrones al modificar químicamente uno de los residuos de aminoácidos situados en su sitio activo.
Inducción de tensión en el sustrato
Aunque el sitio activo de una enzima puede ser complementario con su sustrato o sustratos, varios estudios muestran un desplazamiento en la
posición relativa de ciertos átomos de la enzima una vez que el sustrato se ha unido. En muchos casos, los desplazamientos conformacionales son
complementarios, lo que se mejora la unión entre la enzima y los reactivos (un ajuste inducido) y los grupos reactivos apropiados de la enzima se
desplazan. En la figura 3–14 se muestra un ejemplo de ajuste inducido. Estos tipos de movimiento en una molécula enzimática proporcionan un
buen ejemplo de las proteínas actuando como maquinaria molecular. Mientras estos cambios conformacionales ocurren, se realiza trabajo mecánico,
permitiendo que la enzima ejerza una fuerza física sobre ciertos enlaces en la molécula de sustrato. Esto tiene un efecto de desestabilización del
sustrato, ocasionando la formación de un estado de transición, en el cual se alivia la tensión (fig. 3–12c).
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una molécula glucosaPolicy
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a la enzima hexoquinasa, la proteína sufre un cambio conformacional que
encierra el sustrato dentro de la bolsa del sitio activo y alinea los grupos reaccionantes de la enzima y el sustrato.
desplazan. En la figura 3–14 se muestra un ejemplo de ajuste inducido. Estos tipos de movimiento en una molécula enzimática proporcionan un
buen ejemplo de las proteínas actuando como maquinaria molecular. Mientras estos cambios conformacionales ocurren, se realiza trabajo mecánico,
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permitiendo que la enzima ejerza una fuerza física sobre ciertos enlaces en la molécula de sustrato. Esto tiene un efecto de desestabilización del
sustrato, ocasionando la formación de un estado de transición, en el cual se alivia la tensión (fig. 3–12c).
FIGURA 3–14
Un ejemplo de ajuste inducido. Cuando una molécula de glucosa se une a la enzima hexoquinasa, la proteína sufre un cambio conformacional que
encierra el sustrato dentro de la bolsa del sitio activo y alinea los grupos reaccionantes de la enzima y el sustrato.
FUENTE: Cortesía de Thomas A. Steitz, Universidad de Yale.

Para entender por completo el mecanismo por el cual una enzima cataliza una reacción en particular, es necesario describir varios cambios en la
estructura atómica y electrónica tanto en la enzima como en el sustrato conforme se lleva cabo la reacción. En el capítulo anterior se mencionó cómo
las técnicas de cristalografía por rayos X pueden revelar detalles de la estructura de grandes moléculas enzimáticas. Como 40% al 60% del volumen de
proteína cristalizada consiste en solvente retenido, la mayor parte de las enzimas cristalizadas conservan un alto nivel de actividad enzimática. Podría
ser posible utilizar técnicas de difracción de rayos X para estudiar los mecanismos de reacción. Existe sólo una limitación importante, a saber, el
tiempo. En un estudio cristalográfico, las enzimas cristalizadas deben ser sometidas a un haz de rayos X por un periodo de horas o días mientras se
obtienen los datos necesarios. La imagen que surge de tales estudios captura la estructura promedio de la molécula a través del tiempo. Sin embargo,
innovaciones recientes han hecho posible utilizar técnicas de cristalografía con rayos X para observar los cambios estructurales que tienen lugar en el
sitio activo mientras una enzima cataliza un ciclo de reacción. Este método, que se denomina cristalografía de resolución temporal, y puede incluir:
El uso de rayos X de ultra alta intensidad generados por un sincrotrón, un instrumento utilizado por físicos nucleares para estudiar partículas
subatómicas. Éste puede acortar el periodo de exposición a rayos X a picosegundos, que es la misma escala de tiempo necesaria para que una
enzima catalice una transformación química simple.
proteína cristalizada consiste en solvente retenido, la mayor parte de las enzimas cristalizadas conservan un alto nivel de actividad enzimática. Podría
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ser posible utilizar técnicas de difracción de rayos X para estudiar los mecanismos de reacción. Existe sólo una limitación AMERICANA
importante, a saber, el
tiempo. En un estudio cristalográfico, las enzimas cristalizadas deben ser sometidas a un haz de rayos X por un periodo de horas
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obtienen los datos necesarios. La imagen que surge de tales estudios captura la estructura promedio de la molécula a través del tiempo. Sin embargo,
innovaciones recientes han hecho posible utilizar técnicas de cristalografía con rayos X para observar los cambios estructurales que tienen lugar en el
sitio activo mientras una enzima cataliza un ciclo de reacción. Este método, que se denomina cristalografía de resolución temporal, y puede incluir:
El uso de rayos X de ultra alta intensidad generados por un sincrotrón, un instrumento utilizado por físicos nucleares para estudiar partículas
subatómicas. Éste puede acortar el periodo de exposición a rayos X a picosegundos, que es la misma escala de tiempo necesaria para que una
enzima catalice una transformación química simple.
Enfriamiento de los cristales de la enzima entre 20 a 40°, lo que desacelera la reacción en un factor de hasta 10 mil millones de veces, e incrementa
en gran medida el tiempo de vida de los productos intermedios transitorios.
El uso de técnicas para desencadenar simultáneamente una reacción en un cristal completo, de forma que todas las moléculas de la enzima en el
cristal se encuentren en la misma etapa de reacción al mismo momento. Por ejemplo, en el caso de la reacción en el cual el ATP es un sustrato, los
cristales de la enzima pueden infiltrarse con moléculas de ATP que se habían vuelto no reactivas al unirlas a un grupo inerte (p. ej., un grupo
nitrofenilo) por un enlace fotosensible. Cuando los cristales se exponen a un pulso corto de luz, todas las moléculas de ATP “atrapada” se liberan,
iniciando la reacción simultáneamente en los sitios activos en todo el cristal.
El uso de enzimas producto de mutagénesis dirigida (sección 18.25) que imponen barreras cinéticas en etapas específicas de la reacción,
ocasionan un incremento del tiempo de vida para productos intermedios particulares.
La determinación de la estructura en resolución ultra alta (atómica) (p. ej., 0.8 Å), que permite la visualización de hidrógenos individuales que
pueden estar presentes en enlaces de hidrógeno o que están asociados con grupos acídicos en la proteína; la presencia o ausencia de moléculas
de agua unida; la conformación precisa de las cadenas del sitio catalítico y la tensión sutil que aparece en partes del sustrato durante la catálisis.
Los detalles notables que pueden ser extraídos de estas imágenes de alta resolución, se ilustra en el enlace de hidrógeno de la figura 3–15.
FIGURA 3–15
Mapa de densidad electrónica de un enlace simple de hidrógeno (línea de puntos verdes). Este mapa muestra una pequeña parte de la
enzima proteolítica subtilisina a una resolución atómica (0.78 Å). Se ve que el átomo de hidrógeno (amarillo) se comparte entre un átomo de
nitrógeno, en el anillo de un residuo de histidina, y un átomo de oxígeno de un residuo de ácido aspártico.

FIGURA 3–15

Mapa de densidad electrónica de un enlace simple de hidrógeno (línea de puntos verdes). Este mapa muestra una pequeña parte de la
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enzima proteolítica subtilisina a una resolución atómica (0.78 Å). Se ve que el átomo de hidrógeno (amarillo) se comparte entre un átomo de
nitrógeno, en el anillo de un residuo de histidina, y un átomo de oxígeno de un residuo de ácido aspártico.
FUENTE: De Peter Kuhn, et al. Biochemistry 1998;37:13450, cortesía de Richard Bott; © 1998 American Chemical Society.
Al combinar estas técnicas, los investigadores han sido capaces de determinar la estructura tridimensional de una enzima en etapas sucesivas durante
una reacción catalizada. Cuando éstas “instantáneas” individuales ponen en secuencia, producen una “película” que muestra varios productos
intermedios 3:
CAPÍTULO catalíticos que aparecen
Bioenergética, enzimasy desaparecen conforme se lleva a cabo la reacción. En la figura 3–16 se muestra un ejemplo de losPage
y metabolismo, datos28que
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FIGURA 3–16
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FUENTE: De Peter Kuhn, et al. Biochemistry 1998;37:13450, cortesía de Richard Bott; © 1998 American Chemical Society.
Al combinar estas técnicas, los investigadores han sido capaces de determinar la estructura tridimensional de una enzima en etapas sucesivas durante
una reacción catalizada. Cuando éstas “instantáneas” individuales ponen en secuencia, producen una “película” que muestra varios productos
intermedios catalíticos que aparecen y desaparecen conforme se lleva a cabo la reacción. En la figura 3–16 se muestra un ejemplo de los datos que
pueden obtenerse utilizando varios de estos métodos.
FIGURA 3–16
Mioglobina: la película. En este ejemplo de cristalografía de rayos X de resolución temporal, la estructura de la mioglobina (Mb) se determinó con
una molécula de CO unida al grupo hem y en varios instantes después de liberar la molécula de CO. (El CO se une al mismo sitio en Mb como el O2, pero
es más adecuado para este tipo de estudios). La liberación de CO se indujo simultáneamente a través del cristal por exposición a un destello de luz
láser (fotólisis). Cada una de las estructuras se determinó siguiendo un solo pulso de rayos X intenso de un sincrotrón. La molécula de mioglobina que
se estaba estudiando tenía una única sustitución de aminoácidos que la convertía en un mejor sujeto para el análisis. a) Corte de 6.5 Å de espesor a
través de una molécula Mb que muestra los cambios que ocurren en 100 picosegundos (1 ps = 1 billonésima de segundo) después de la liberación del
CO de su sitio de unión. La estructura de Mb antes del flash láser se muestra en magenta, y la estructura de la proteína 100 ps después del flash láser se
muestra en verde. Aquellas partes de la molécula que no cambiaron de estructura durante este periodo aparecen en blanco. Se pueden ver tres
desplazamientos a gran escala cerca del sitio de unión del CO (indicado por las flechas amarillas). Una vista ampliada de la región enmarcada en la
parte a). El CO liberado (círculo sólido) está situado a unos 2 Å de su sitio de unión original (círculo discontinuo). El movimiento del CO se acomoda por
la rotación de Phe29, que empuja la His64 hacia afuera, que a su vez desaloja una molécula de agua ligada. c) En 3.16 nanosegundos después del
destello láser, la molécula de CO ha migrado a cualquiera de las dos posiciones mostradas (etiquetadas 2 y 3), las Phe29 e His64 se han relajado hacia
sus estados iniciales, y el grupo hem ha sufrido un desplazamiento considerable como se indica por la mayor cantidad de sombreado verde en la
región del hem.

la rotación de Phe29, que empuja la His64 hacia afuera, que a su vez desaloja una molécula de agua ligada. c) En 3.16 nanosegundos después del
destello láser, la molécula de CO ha migrado a cualquiera de las dos posiciones mostradas (etiquetadas 2 y 3), las Phe29 e His64 se han relajado hacia
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sus estados iniciales, y el grupo hem ha sufrido un desplazamiento considerable como se indica por la mayor cantidad de sombreado verde en la
región del hem.
FUENTE: Reproducida con autorización de Friedrich Schotte, et al. Science 2003; 300:1946; Copyright © 2003, reimpreso con permiso de AAAS.
Mientras el centro de atención se ha dirigido a los cambios conformacionales que ocurren conforme una enzima transforma sus sustratos en
productos, se ha puesto considerable atención en años recientes a los cambios conformacionales que ocurren en la proteína misma. Como se
muestra en la figura 2–39, las proteínas son moléculas dinámicas capaces de producir movimiento (intrínseco) que puede tener relevancia funcional
importante. En el caso que se ilustra en la figura 2–39, este movimiento permite la entrada del sustrato al sitio activo de la enzima. El análisis de este
tipo de movimiento intrínseco a través de varias técnicas experimentales sugiere que las proteínas (aún en ausencia de sustrato) son capaces de
muchos de los movimientos que pueden detectarse durante el ciclo catalítico de la proteína. Si esto es cierto, sugiere que la evolución ha seleccionado
estructuras proteínicas capaces de movimiento intrínseco que pueden ser útiles para las funciones potenciales que podría cumplir una proteína. Más
que inducir un cambio conformacional específico, el sustrato o sustratos podría simplemente “esperar” que una proteína asuma una conformación a
la cual pueda unirse de manera eficaz.
REVISIÓN
1. Analice la figura 3–13 que ilustra los pasos en una reacción catalizada por medios enzimáticos y describa lo que ocurre sin leer la leyenda.
3.7. CINÉTICA ENZIMÁTICA
muchos de los movimientos que pueden detectarse durante el ciclo catalítico de la proteína. Si esto es cierto, sugiere que la evolución ha seleccionado
estructuras proteínicas capaces de movimiento intrínseco que pueden ser útiles para las funciones potenciales que podría cumplir una proteína. Más
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que inducir un cambio conformacional específico, el sustrato o sustratos podría simplemente “esperar” que una proteína asuma una conformación a
la cual pueda unirse de manera eficaz.
REVISIÓN
1. Analice la figura 3–13 que ilustra los pasos en una reacción catalizada por medios enzimáticos y describa lo que ocurre sin leer la leyenda.
3.7. CINÉTICA ENZIMÁTICA

Las enzimas varían en gran medida su capacidad para catalizar reacciones. La actividad catalítica de una enzima se revela al estudiar su cinética, es
decir, la tasa a la cual cataliza una reacción bajo diversas condiciones experimentales.
Modelo de cinética enzimática de Michaelis‐Menten
En el año 1913, Leonor Michaelis y Maud Menten reportaron una relación matemática entre la concentración del sustrato y velocidad de las reacciones
enzimáticas, cuantificadas por la velocidad de formación de los productos (también conocida como velocidad de la reacción). Esta relación puede
expresarse por una ecuación (que se muestra antes) que genera una hipérbola, como se muestra en la figura 3–17. Para determinar la velocidad de
una reacción a nivel experimental, se coloca una mezcla en incubación a una temperatura deseada, conteniendo todos los ingredientes necesarios
excepto uno, el cual se añade para iniciar la reacción. Si al momento que inicia la reacción no hay un producto presente en la mezcla, entonces la
cantidad de producto que aparece con el paso del tiempo proporciona una medida de la velocidad de la reacción. Existen factores que complican este
procedimiento. Si el tiempo de incubación es demasiado grande, la concentración del sustrato se reduce de manera considerable. Además, conforme
aparece el producto, este puede convertirse de nuevo a sustrato por una reacción inversa, la cual es también catalizada por la enzima. Idealmente,
cuando se desea determinar la velocidad inicial, es decir, la velocidad cuando aún no se ha formado producto. Para medir con precisión la velocidad
inicial de la reacción, se emplean tiempos de incubación cortos y técnicas de medición sensibles.
Para generar una curva como se muestra en la figura 3–17, la velocidad inicial es determinada por una serie de incubaciones mezcladas, que contienen
la misma cantidad de enzima, pero concentraciones crecientes de sustrato. Del análisis de la curva se hace evidente que la velocidad inicial de la
reacción varía notablemente con la concentración de sustrato. Con concentraciones bajas de sustrato, las moléculas de enzimas son sometidas a
relativamente pocas colisiones con el sustrato en un tiempo dado. En consecuencia, la enzima tiene un “tiempo de inactividad”; es decir, las moléculas
de sustrato limitan la velocidad. A concentraciones elevadas de sustrato, las enzimas condicionan con moléculas de sustrato con mayor rapidez de lo
que pueden convertirlas a producto. Así, con concentraciones altas de sustrato, las moléculas individuales de enzimas trabajan a su máxima
capacidad; es decir, las moléculas de enzima limitan la velocidad de la reacción. Así, mientras más grande sea la concentración de sustrato presente en
una mezcla de reacción, la enzima alcanza un estado de saturación. La velocidad inicial a este punto de saturación teórico se denomina velocidad
máxima (V m á x) .
FIGURA 3–17
Relación entre la velocidad de una reacción catalizada por enzima y la concentración del sustrato. Dado que cada molécula de enzima
solo puede catalizar un cierto número de reacciones en una cantidad de tiempo dada, la velocidad de la reacción (típicamente expresada como moles
de producto formados por segundo) se aproxima a una velocidad máxima a medida que aumenta la concentración de sustrato. La concentración de
sustrato a la que la reacción se encuentra a la mitad de la velocidad máxima (Vmáx/2) se denomina constante de Michaelis o KM.

solo puede catalizar un cierto número de reacciones en una cantidad de tiempo dada, la velocidad de la reacción (típicamente expresada como moles
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de producto formados por segundo) se aproxima a una velocidad máxima a medida que aumenta la concentración de sustrato. La concentración de
sustrato a la que la reacción se encuentra a la mitad de la velocidad máxima (Vmáx/2) se denomina constante de Michaelis o KM.
La medición más simple de la actividad catalítica de una enzima se obtiene por su número de recambio, que puede calcularse a partir de Vmáx. El
número de recambio (o constante catalítica, Kcat, como también se conoce) es el número máximo de moléculas de sustrato que pueden convertirse a
producto por una molécula de enzima por unidad de tiempo. Normalmente, el número de recambio para las enzimas es de 1 a 103 (por segundo),
aunque también se conocen valores de hasta 106 (cuadro 3–3). Según estos valores, se puede pensar que pocas moléculas de enzima pueden
convertir con rapidez grandes cantidades de moléculas de sustrato en producto.
El valor de Vmáx sólo es útil cuando se obtiene a partir de una gráfica como la que se muestra en la figura 3–17; otra medición es la constante de
Michaelis (K M ) que equivale a la concentración de sustrato cuando la velocidad de reacción es de la mitad de la Vmáx. Como su nombre lo implica, KM
es una constante para una enzima dada y por tanto, es independiente de la concentración de enzima o de sustrato. La relación entre Vmáx y KM se
aprecia mejor al considerar la ecuación de Michaelis‐Menten, la cual puede utilizarse para generar el gráfico que se muestra en la figura 3–17.
De acuerdo con la ecuación, cuando la concentración de un sustrato [S] es un grupo de valores equivalente a KM, entonces la velocidad de la reacción
(V) se vuelve igual a Vmáx/2 o la mitad de la velocidad máxima. Así, KM = [S], cuando V = Vmáx/2.
Para generar una curva en hipérbola como la que se muestra en la figura 3–17 y hacer una determinación precisa de los valores de Vmáx y KM, debe
graficarse un número considerable de puntos. Una descripción más fácil y precisa se obtiene al graficar los recíprocos de la velocidad y la
concentración de sustrato, uno contra otro, como lo formularon Hans Lineweaver y Dean Burk. Cuando se realiza esto, la hipérbola se convierte en
una línea recta (fig. 3–18) donde el punto de intersección con el eje de las x es igual a –1/KM, y su punto de intersección con el eje de las y, es igual a
1/Vmáx y la pendiente es igual a KM/Vmáx. Las cifras de KM y Vmáx pueden determinarse extrapolando una línea trazada a partir de relativamente pocos
puntos.
FIGURA 3–18
Un diagrama LineweaverBurk de los recíprocos de velocidad y concentración de sustrato a partir de los cuales se calculan con facilidad los valores
de Vmáx y KM.

FIGURA 3–18
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Un diagrama LineweaverBurk de los recíprocos de velocidad y concentración de sustrato a partir de los cuales se calculan con facilidad los valores
de Vmáx y KM.
En la mayor parte de los casos, el valor para KM proporciona una medición de la afinidad de la enzima por el sustrato. Mientras más elevado sea el valor
de KM, más grande será la concentración de sustrato necesaria para alcanzar el valor medio de la Vmáx y por tanto, menor es la afinidad de la enzima
por el sustrato. El valor de KM para la mayoría de las enzimas varía entre 10−1 y 10−7 con un valor típico cerca de 10−4 M. Otros factores que influyen
fuertemente la cinética enzimática son el pH y temperatura del medio de incubación. Cada enzima tiene un pH y temperatura óptimos a los cuales
operan con actividad máxima (fig. 3–19). La influencia de la temperatura sobre la actividad enzimática es demostrada mediante el efecto de la
refrigeración en la reducción de la proliferación de microorganismos.
FIGURA 3–19
Dependencia de la velocidad de una reacción catalizada por enzimas en función de a ) el pH, y b ) la temperatura. La forma de las curvas
y el pH y temperatura óptimos varían con la reacción particular. a) Los cambios en el pH afectan las propiedades iónicas del sustrato y la enzima, así
como la conformación de la enzima. b) A temperaturas más bajas, las velocidades de reacción aumentan al incrementarse la temperatura, a causa del
aumento de la energía de los reaccionantes. A temperaturas más altas, este efecto positivo se compensa con la desnaturalización enzimática.
FUENTE: a) De E. A. MoelwynHughes. En The Enzymes, J. B. Sumner y K. Myrback (Eds.), vol. 1. Academic Press; 1950. b) De K. Hayashi, et al.
Journal Biochem
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Inhibidores Hill. All Rights Reserved. Terms of Use • Privacy Policy • Notice • Accessibility
Los inhibidores enzimáticos son moléculas capaces de unirse a una enzima y disminuir su actividad. La célula depende de inhibidores para regular
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FUENTE: a) De E. A. MoelwynHughes. En The Enzymes, J. B. Sumner y K. Myrback (Eds.), vol. 1. Academic Press; 1950. b) De K. Hayashi, et al.
Journal Biochem 1968 64:93, reproducida con autorización de Oxford University Press.
Inhibidores enzimáticos
Los inhibidores enzimáticos son moléculas capaces de unirse a una enzima y disminuir su actividad. La célula depende de inhibidores para regular
la actividad de muchas de sus enzimas; los bioquímicos utilizan inhibidores para estudiar las propiedades de las enzimas y muchas compañías
farmacéuticas producen inhibidores enzimáticos que actúan como fármacos. Los inhibidores enzimáticos pueden dividirse en dos tipos: reversibles o
irreversibles.
Los inhibidores irreversibles son aquellos que se unen muy estrechamente a una enzima, a menudo formando enlaces covalentes con los residuos
de aminoácidos. Varios gases nerviosos, como el diisopropilfosfofluoridato y los pesticidas organofosforados, actúan como inhibidores irreversibles
de la acetilcolinesterasa, una enzima que desempeña una función crucial en la degradación de la acetilcolina, el neurotransmisor que causa la
contracción muscular. Cuando se inhibe la enzima el músculo permanece estimulado de forma continua y permanece en un estado de contracción
permanente. Como se revisa en la sección Perspectiva humana, el antibiótico penicilina actúa como inhibidor irreversible de una enzima fundamental
en la formación de la pared celular bacteriana.
Por otra parte, los inhibidores reversibles, pueden unirse débilmente a una enzima y por tanto son desplazados con facilidad. Con fines de
simplicidad, se analizará el caso más simple de inhibidores reversibles, en concreto, los de tipos competitivo y no competitivo. Los inhibidores
competitivos son inhibidores reversibles que compiten con el sustrato para acceder al sitio activo de una enzima. Como los sustratos tienen
estructura complementaria con el sitio activo al que se unen, los inhibidores competitivos deben simular ser el sustrato para competir por el mismo
sitio de unión, pero difieren en una forma que evita que se transformen en el producto (fig. 3–20). El análisis de los tipos de moléculas que pueden
competir con el sustrato para un sitio de unión en la enzima proporciona información sobre la estructura del sitio activo y naturaleza de la interacción
entre el sustrato y su enzima.
FIGURA 3–20
Inhibición competitiva. Debido a su similitud molecular, los inhibidores competitivos pueden competir con el sustrato por un sitio de unión en la
enzima. El efecto de un inhibidor competitivo depende de las concentraciones relativas del inhibidor y el sustrato.

FIGURA 3–20
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Inhibición competitiva. Debido a su similitud molecular, los inhibidores competitivos pueden competir con el sustrato por un sitio de unión en la
enzima. El efecto de un inhibidor competitivo depende de las concentraciones relativas del inhibidor y el sustrato.
La inhibición enzimática competitiva es el fundamento de acción de muchos fármacos comunes, como se ilustra con el siguiente ejemplo. La enzima
convertidora de angiotensina (ACE) es una enzima proteolítica que se une a un péptido de 10 residuos (angiotensina I), para producir un péptido de 8
residuos (angiotensina II). El aumento de la concentración de angiotensina II es el principal factor de riesgo para el desarrollo de hipertensión arterial.
En la década de 1960, John Vane et al. de la compañía Eli Lilly comenzaron una búsqueda de compuestos que podrían inhibir la ACE. Estudios previos
habían encontrado que el veneno de una víbora brasileña contenía inhibidores de enzimas proteolíticas y se encontró que uno de los componentes de
este veneno, un péptido denominado teprotido,

era un inhibidor competitivo potente de la ACE. Aunque se demostró que el teprotido disminuye la presión arterial en pacientes con hipertensión, no
era un fármaco útil ya que tenía una estructura peptídica que era rápidamente degradada si se administraba por vía oral. Esfuerzos subsiguientes para
residuos (angiotensina II). El aumento de la concentración de angiotensina II es el principal factor de riesgo para el desarrollo de hipertensión arterial.
En la década de 1960, John Vane et al. de la compañía Eli Lilly comenzaron una búsqueda de compuestos que podrían inhibir la ACE. Estudios previos
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habían encontrado que el veneno de una víbora brasileña contenía inhibidores de enzimas proteolíticas y se encontró que uno de los componentes de
este veneno, un péptido denominado teprotido,
era un inhibidor competitivo potente de la ACE. Aunque se demostró que el teprotido disminuye la presión arterial en pacientes con hipertensión, no
era un fármaco útil ya que tenía una estructura peptídica que era rápidamente degradada si se administraba por vía oral. Esfuerzos subsiguientes para
desarrollar inhibidores no peptídicos de la enzima llevaron a los investigadores a la síntesis de un compuesto denominado captopril
fue el primer fármaco antihipertensivo que actuaba al unirse a la ACE.
La efectividad de los inhibidores competitivos depende de su afinidad relativa por la enzima. Así, la inhibición competitiva puede superarse si la
relación entre sustrato/inhibidor es lo suficientemente grande. En otras palabras, si el número de colisiones entre la enzima y el inhibidor se hace
insignificante con respecto a aquellas entre la enzima y su sustrato, entonces el efecto del inhibidor será mínimo. Si se tiene una concentración
suficiente de sustrato, es teóricamente posible lograr la velocidad enzimática máxima incluso en presencia de un inhibidor competitivo. Dado que
muchos fármacos son utilizados para el tratamiento de enfermedades en humanos, es de extrema importancia poder desarrollar compuestos que
tengan una afinidad lo suficientemente alta para que pueda competir de manera eficaz por la enzima con el sustrato natural. En el capítulo 2 se ilustra
el proceso mediante el cual se desarrollaron tales compuestos, en el contexto del inhibidor de BCRABL, Gleevec (fig. 2–51).
En la inhibición no competitiva, el sustrato y el inhibidor no compiten por el mismo sitio de unión; por lo general, el inhibidor actúa en otro sitio
diferente al sitio activo de la enzima. El nivel de inhibición depende sólo de la concentración del inhibidor, incrementar la concentración del sustrato
no lo supera. Como en presencia de un inhibidor no competitivo cierta fracción de las moléculas enzimáticas se encuentran necesariamente inactivas
en un instante dado, no puede alcanzarse la velocidad máxima de las moléculas de enzima. El tipranavir es un potente inhibidor no competitivo de la
proteasa producida por VIH cuando infecta a un leucocito. A diferencia de otros inhibidores de esta enzima, como el ritonavir, tipranavir no se
comporta como sustrato peptídico de la enzima ni compite con el sustrato. El efecto sobre la cinética enzimática en presencia de inhibidores
competitivos y no competitivos se muestra en la figura 3–21. En un caso, la Vmáx se disminuye, y en el otro, el KM se incrementa. En ambos casos, se
incrementa la pendiente (KM/Vmáx) con respecto a la reacción no inhibida. Como se revisa más adelante, las células utilizan una versión de inhibición
no competitiva para regular la actividad de enzimas clave de las vías metabólicas.
FIGURA 3–21
Efectos de los inhibidores en la cinética de la enzima. El efecto de los inhibidores, tanto competitivos como no competitivos, se muestra
cuando la cinética de la reacción se representa gráficamente como la velocidad de reacción frente a la concentración de sustrato a) o su recíproco b).
El inhibidor no competitivo reduce la Vmáx sin afectar KM, mientras que el inhibidor competitivo aumenta KM sin afectar la Vmáx.

Efectos de los inhibidores en la cinética de la enzima. El efecto de los inhibidores, tanto competitivos como no competitivos, se muestra
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cuando la cinética de la reacción se representa gráficamente como la velocidad de reacción frente a la concentración de sustrato a) o su recíproco b).
El inhibidor no competitivo reduce la Vmáx sin afectar KM, mientras que el inhibidor competitivo aumenta KM sin afectar la Vmáx.
REVISIÓN
1. Mencione las diferencias entre KM y Vmáx.
3.8. PERSPECTIVA HUMANA

El problema creciente de la resistencia a los antibióticos
No hace mucho existía la creencia de que la salud humana ya no se vería amenazada por infecciones bacterianas graves. Enfermedades como lepra,
neumonía, gonorrea y docenas de otras infecciones se curaban mediante la administración de uno o varios antibióticos, compuestos que destruyen
selectivamente las bacterias sin lesionar al hospedador humano en el que estas proliferan. Esta situación cambió de manera drástica en las últimas
décadas, ya que las bacterias patógenas han incrementado la resistencia a estos “maravillosos fármacos” ocasionando la muerte de muchas
personas que alguna vez fueron tratadas con éxito. Incluso la tuberculosis, que prácticamente había desaparecido de los países desarrollados, ha
resurgido en todo el mundo en una forma referida como XDR (con resistencia extrema a los antibióticos [extremely Drug Resistant]) que es
prácticamente intratable. Se teme que la XDRTB se convierta en una gran crisis de salud global. Para empeorar las cosas, la industria farmacéutica
ha realizado recortes drásticos de los recursos dedicados al desarrollo de nuevos antibióticos. Éste cambio de acción en la industria farmacéutica,
se atribuye en términos generales a la falta de incentivos económicos: 1) Los antibióticos se administran sólo por un periodo corto de tiempo (a
diferencia de los fármacos prescritos para enfermedades crónicas como diabetes o depresión). 2) A diferencia de otros tipos de fármacos que
conservan su eficacia, los nuevos antibióticos corren el riesgo de tener una vida relativamente corta en el mercado, conforme las bacterias se
tornan resistentes a cada producto sucesivo. 3) Los antibióticos más eficaces, son restringidos en su uso y son utilizados como último recurso
cuando otros fármacos han fracasado. La idea de formar instituciones no lucrativas para el desarrollo de nuevos antibióticos ha sido un tema que
se ha discutido ampliamente.
A continuación, se revisará brevemente el mecanismo de acción de los antibióticos, particularmente aquellos que actúan sobre enzimas, que es el
tema de este capítulo, así como el desarrollo de resistencias bacterianas. La mayor parte de los antibióticos se derivan de productos naturales
producidos por microorganismos vivos en la tierra y que se cultivan con facilidad en el laboratorio. En el cuadro 1 se enumeran las principales
clases de antibióticos, ejemplos de cada clase, los blancos en las células bacterianas sobre los cuales estos compuestos actúan y los mecanismos
por medio de los cuales las bacterias han desarrollado resistencia a esta clase de compuestos. En primer lugar, se revisarán los principales tipos de
blancos farmacológicos.
1. Enzimas que participan en la síntesis de la pared celular bacteriana. Las penicilinas y sus derivados (p. ej., meticilina) son análogos estructurales
de sustratos de una familia de transpeptidasa las que catalizan la reacción de enlaces cruzados final que aportan la rigidez de la pared celular. Si
no ocurren estas reacciones, no se desarrolla una pared celular rígida. La penicilina es un inhibidor irreversible de las transpeptidasas; el
antibiótico se une al sitio activo de estas enzimas, formando un complejo unido covalentemente que no puede desplazarse. La vancomicina es
un antibiótico que inhibe la transpeptidación al unirse al sustrato peptídico de la transpeptidasa, en lugar de a la enzima. En condiciones
normales, el sustrato de transpeptidasa termina en el dipéptido DalaninaDalanina. Para volverse resistente a la vancomicina, la célula
bacteriana debe sintetizar una terminación alterna que no se una al fármaco, que es un proceso que requiere la adquisición de nuevas
actividades enzimáticas. Como consecuencia, la vancomicina es un antibiótico al cual las bacterias han demostrado menos capacidad para
desarrollar resistencia y por tanto, se administra como último recurso cuando han fracasado otros antibióticos. Por desgracia, en años
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patógenas resistentes a vancomicina, incluyendo Staphylococcus aureus. S. aureus es un
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de infecciones que ponen en riesgo la vida de pacientes hospitalizados con heridas abiertas o con tubos invasivos. Por años, las cepas de S.
aureus resistente a meticilina (MRSA), que son resistentes a muchos otros antibióticos, han causado estragos en las áreas hospitalarias. Las
antibiótico se une al sitio activo de estas enzimas, formando un complejo unido covalentemente que no puede desplazarse. La vancomicina es
un antibiótico que inhibe la transpeptidación al unirse al sustrato peptídico de la transpeptidasa, en lugar de aUAM UNIVERSIDAD
la enzima. AMERICANA
En condiciones
normales, el sustrato de transpeptidasa termina en el dipéptido DalaninaDalanina. Para volverse resistente Access
a la vancomicina,
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bacteriana debe sintetizar una terminación alterna que no se una al fármaco, que es un proceso que requiere la adquisición de nuevas
actividades enzimáticas. Como consecuencia, la vancomicina es un antibiótico al cual las bacterias han demostrado menos capacidad para
desarrollar resistencia y por tanto, se administra como último recurso cuando han fracasado otros antibióticos. Por desgracia, en años
recientes han surgido cepas de varias bacterias patógenas resistentes a vancomicina, incluyendo Staphylococcus aureus. S. aureus es un
comensal común de la piel y de las vías nasales. Aunque por lo general es relativamente inocuo, este microorganismo es la causa más frecuente
de infecciones que ponen en riesgo la vida de pacientes hospitalizados con heridas abiertas o con tubos invasivos. Por años, las cepas de S.
aureus resistente a meticilina (MRSA), que son resistentes a muchos otros antibióticos, han causado estragos en las áreas hospitalarias. Las
infecciones por este patógeno matan más de 10 000 pacientes cada año en Estados Unidos, que es mayor que el número de muertes en Estados
Unidos por sida. Las infecciones por MRSA han empezado a aparecer en entornos comunitarios, como gimnasios de escuelas secundarias o
guarderías, donde existen numerosos contactos entre los individuos. En muchos casos, la vancomicina es el único fármaco que puede detener
estas infecciones. En consecuencia, fue alarmante descubrir que MRSA puede volverse resistente a la vancomicina al adquirir un grupo de genes
de resistencia a vancomicina a partir de otra bacteria (E. faecium), que es también una causa común de infecciones nosocomiales. Los casos de
MRSA resistente a vancomicina son poco comunes y estas bacterias no han tenido la capacidad de lograr el acceso al entorno hospitalario o
comunitario, pero podría ser sólo cuestión de tiempo. Por esta razón, los especialistas en enfermedades infecciosas han pedido a los
hospitales, emplear mejores programas de higiene y a el aislamiento de pacientes con el primer signo de infección. Se ha demostrado que estas
prácticas reducen la incidencia de infecciones letales, lo que se ha demostrado al reducir la tasa de muertes por MRSA en 50% en años recientes.
2. Componentes del sistema por el cual las bacterias se duplican, transcriben y traducen su información genética. Aunque las bacterias y células
eucariotas tienen un sistema similar para almacenar y utilizar la información genética, existen algunas diferencias entre los dos tipos de células
de los cuales los fármacos toman ventaja. Por ejemplo, la estreptomicina y tetraciclinas se unen a los ribosomas bacterianos, pero no a los
ribosomas eucariotas. Las quinolonas, como la ciprofloxacina, son un ejemplo poco común de antibióticos sintéticos (no se basan en productos
naturales). Las quinolonas inhiben la enzima DNA girasa, que es necesaria para la replicación bacteriana.
3. Enzimas que catalizan reacciones metabólicas específicas en bacterias. Por ejemplo, las sulfonamidas son antibióticos efectivos porque se
parecen mucho al compuesto ácido paminobenzoico (PABA), que las bacterias convierten por medios enzimáticos en ácido fólico, una
coenzima esencial.
Como los seres humanos carecen de la enzima que sintetiza ácido fólico, deben obtener esta coenzima esencial en su dieta y en consecuencia, la
sulfonamidas no tienen efecto en el metabolismo de los seres humanos.
Casi todos los “nuevos” antibióticos aprobados para su uso en años recientes se derivan de compuestos existentes que han sido modificados
químicamente en el laboratorio. En otras palabras, estos compuestos poseen la misma estructura central y el andamiaje que los compuestos de los
cuales se derivan y por tanto pueden considerarse miembros de la misma clase química. Existen fármacos que han sido modificados químicamente
en un intento de hacerlos menos vulnerables a los mecanismos de resistencia empleados por las bacterias a las que se dirigen. Se esperaba que la
secuenciación del genoma de bacterias patógenas, que inició en 1995, permitiría la identificación de nuevos objetivos farmacológicos, pero este no
ha sido el caso. Sólo se han desarrollado dos nuevas clases de antibióticos que han sido aprobados desde 1963. Una de estas dos nuevas clases
incluye el antibiótico linezolida, introducido en el año 2000, que actúa específicamente en los ribosomas bacterianos e interfiere con la síntesis
proteínica. La otra nueva clase de antibióticos, introducido en el año 2003 y representado por la daptomicina, son lipopéptidos cíclicos, que alteran
la función de la membrana bacteriana. Muchos investigadores esperan que la linezolida y daptomicina se utilicen poco, de forma que la resistencia
se mantenga al mínimo; sin embargo, ya se han cultivado cepas de MRSA resistente a linezolida y los casos de E. faecium resistente a daptomicina
cada vez son más comunes. Existe una gran preocupación de que estemos entrando con rapidez a una “era postantibiótica” en la cual miles o
millones de personas empezarán a morir por lesiones y rasguños menores porque ya no habría antibióticos eficaces.

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muchos de los cuales pueden ilustrarse utilizando a la
penicilina como ejemplo. La penicilina es un betalactámico; es decir, contiene cuatro anillos betalactámicos (que se muestran en color).
la función de la membrana bacteriana. Muchos investigadores esperan que la linezolida y daptomicina se utilicen poco, de forma que la resistencia
se mantenga al mínimo; sin embargo, ya se han cultivado cepas de MRSA resistente a linezolida y los casos de E. faecium resistente a daptomicina
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cada vez son más comunes. Existe una gran preocupación de que estemos entrando con rapidez a una “era postantibiótica” en la cual miles o
millones de personas empezarán a morir por lesiones y rasguños menores porque ya no habría antibióticos eficaces.
Las bacterias se tornan resistentes a los antibióticos a través de diversos mecanismos, muchos de los cuales pueden ilustrarse utilizando a la
penicilina como ejemplo. La penicilina es un betalactámico; es decir, contiene cuatro anillos betalactámicos (que se muestran en color).
En la década de 1940, los investigadores habían descubierto que ciertas bacterias poseían una enzima denominada betalactamasa (o penicilinasa)
que podía abrir el anillo betalactámico, volviendo inocuo el compuesto para la bacteria. En el momento en que se introdujo por primera vez la
penicilina como antibiótico durante la Segunda Guerra Mundial, ninguna de las bacterias que causaban enfermedades graves portaban el gen para
la betalactamasa. Esto puede verificarse al examinar el DNA de bacterias descendientes de cultivos de laboratorio que iniciaron en la etapa previa a
los antibióticos. Hoy en día el gen de la betalactamasa está presente en una amplia variedad de bacterias infecciosas y la producción de
betalactamasa por estas células es principal causa de resistencia a la penicilina. ¿Cómo adquirieron el gen estas bacterianas? La aparición
generalizada del gen de la betalactamasa, muestra con qué facilidad los genes pueden diseminarse de una bacteria a otra, no sólo entre las células
de una especie dada, sino entre diferentes especies. Hay varias formas en que esto puede ocurrir, que incluye la conjugación (que se muestra en la
fig. 1–13), en la cual el DNA se pasa de una célula bacteriana a otra; la transducción, en la cual un gen bacteriano es transportado de célula en célula
a través de un virus y transformación, mediante el cual una célula bacteriana puede captar DNA desnudo de su entorno. Los farmacólogos han
intentado contrarrestar la diseminación de la betalactamasa, al sintetizar derivados de la penicilina que son más resistentes a la enzima hidrolítica.
La meticilina, que ya no se encuentra en uso, se produjo por primera vez en 1959 como un antibiótico resistente a la betalactamasa. Como debía
esperarse, la selección natural llevo con rapidez a la evolución de bacterias cuya betalactamasa puede hidrolizar las nuevas formas de antibióticos.
No todas las bacterias resistentes a penicilina han adquirido el gen de betalactamasa. Algunas son resistentes porque poseen modificaciones en
sus paredes celulares que bloquean la entrada de los antibióticos; otras son resistentes porque poseen una bomba de expulsión que les permite
extraer el antibiótico una vez que entrado a la célula; otras son resistentes porque poseen un blanco alterado, por ejemplo, una transpeptidasa
modificada que no se une al antibiótico. La meningitis bacteriana es causada por la bacteria Neisseria meningitidis, que ha mostrado evidencia de
haber adquirido betalactamasa. Estas bacterias se hayan vuelto resistentes a la penicilina porque su transpeptidasa ha perdido la afinidad para los
antibióticos como consecuencia de mutaciones en el gen que codifica a la enzima.
El problema de la resistencia farmacológica no se restringe a enfermedades bacterianas, sino que se ha vuelto un problema importante en el
tratamiento del sida. A diferencia de las bacterias, cuyas enzimas repican el ADN con un alto nivel de precisión, la enzima que replica el virus del sida
(VIH), denominada transcriptasa inversa, comete un gran número de errores, lo que ocasiona una elevada tasa de mutación. Esta alta tasa de error
(casi un error por cada 10 000 bases duplicadas), combinada con la elevada tasa de producción del virus (>108 partículas virales por persona por
día), hace muy probable que surjan variantes farmacorresistentes en un individuo conforme progresa la infección. Este problema se ha atendido de
las siguientes maneras:
Al administrar varios fármacos al paciente dirigidos a diferentes enzimas virales. Esto reduce en gran medida la probabilidad de que surja una
variante que sea resistente a todos los fármacos.
Al diseñar fármacos que interactúan con las porciones más conservadas de cada enzima blanco, es decir, aquellas porciones en donde es más
probable que una mutación produzca una enzima defectuosa. Este punto resalta la importancia de conocer la estructura y función de las
enzimas y la forma en la cual los fármacos podrían interactuar con su objetivo.
CUADRO 1
Antibióticos en uso clínico y modos de resistencia

Clase de antibiótico Ejemplos Objetivo Modo de resistencia
βlactamas Penicilinas (ampicilina) Biosíntesis de peptidoglicanos Hidrólisis
Cefalosporinas (cefamicina) Eflujo
CUADRO 1 Access Provided by:
Antibióticos en uso clínico y modos de resistencia
Clase de antibiótico Ejemplos Objetivo Modo de resistencia
βlactamas Penicilinas (ampicilina) Biosíntesis de peptidoglicanos Hidrólisis

Cefalosporinas (cefamicina) Eflujo
Carbapenémicos (meropenem) Objetivo alterado
Monobactámicos (aztreonam)
Aminoglucósidos Gentamicina Traslación Fosforilación

Estreptomicina Acetilación
Espectinomicina Nucleotidilación
Eflujo
Objetivo alterado
Glicopéptidos Vancomicina Biosíntesis de peptidoglucano Reprogramación de biosíntesis de peptidoglucano

Teicoplanina
Tetraciclinas Minociclina Traslación Monooxigenación

Tigeciclina Eflujo
Objetivo alterado
Marcrólidos Eritromicina Traslación Hidrólisis

Azitromicina Glicosilación
Fosforilación
Eflujo
Objetivo alterado
Lincosamidas Clindamicina Traslación Nucleotidilación

Eflujo
Objetivo alterado
Estreptograminas Sinercida Traslación Liasa C━O (estreptograminas tipo B)

Acetilación (estreptograminas tipo A)
Eflujo
Objetivo alterado
Oxazolidinones Linezolid Traslación Eflujo

Objetivo alterado
Fenicoles Cloranfenicol Traslación Acetilación

Eflujo
Objetivo alterado
Quinolones Ciprofloxacina Replicación de DNA Acetilación

Eflujo
Objetivo alterado
Pirimidinas Trimetoprima Replicación de DNA Eflujo

Objetivo alterado
Sulfonamidas Sulfametoxazol Replicación de DNA Eflujo

Objetivo alterado
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Objetivo alterado
Liopéptidos Daptomicina Membrana celular Objetivo alterado

Péptidos catiónicos Colistina Membrana celular Objetivo alterado
Eflujo
De Moror M. y Wright G. D. Enzymology of Antibiotic Resistance. Annual Review Genet 2010;44:27. Reproducida con permiso de ANNUAL REVIEWS, INC. En el formato
Textbook vía Copyright Clearance Center.
3.9. GENERALIDADES DEL METABOLISMO

El metabolismo es el conjunto de reacciones bioquímicas que ocurren en una célula, que incluyen una gran diversidad de conversiones moleculares.
La mayor parte de estas reacciones pueden agruparse en vías metabólicas que contienen una secuencia de reacciones químicas en las cuales cada
reacción es catalizada por una enzima específica y el producto de una reacción es el sustrato para la siguiente. Las enzimas que constituyen una vía
metabólica suele confinarse en una región específica de la célula, tal como las mitocondrias o el citosol. La evidencia sugiere que las enzimas de una
vía metabólica a menudo están físicamente unidas unas con otras, una característica que permite que el producto de una enzima sea suministrado
directamente como sustrato al sitio activo de la siguiente enzima en una secuencia de reacciones.
Los compuestos formados en cada paso a lo largo de la vía son intermediarios metabólicos (o metabolitos) que finalmente llevan a la formación de
un producto terminal. Los productos terminales son moléculas con una función particular en la célula, como un aminoácido que puede incorporarse
en un polipéptido o un azúcar que puede ser consumido por su contenido energético. Las vías metabólicas de las células están interconectadas en
varios puntos, de forma que un compuesto generado por una vía puede ser enviado en varias direcciones dependiendo de los requerimientos de la
célula en un momento dado. En esta sección se revisarán los aspectos del metabolismo que llevan a la transferencia y utilización de energía química y
este tema será revisado a lo largo de toda esta obra.
Las vías metabólicas pueden dividirse en dos grandes tipos. Las vías catabólicas que ocasionan el desensamble de moléculas complejas para formar
productos más simples. Las vías catabólicas tienen dos funciones: hacer que esté disponible la materia prima a partir de las cuales pueden sintetizarse
otras moléculas y proporcionar la energía química necesaria para muchas actividades celulares. Como se revisará ampliamente, la energía liberada
por las vías catabólicas se almacena de forma transitoria en dos formas: como fosfatos de alta energía (principalmente ATP) y como electrones de alta
energía (principalmente NADPH). Las vías anabólicas llevan a la síntesis de compuestos más complejos a partir de materiales simples. Las vías
anabólicas requieren consumo de energía y utilizan la energía química liberada por las vías catabólicas exergónicas.
En la figura 3–22 se muestra un perfil muy simplificado de las vías en las cuales se interconectan las principales vías anabólicas y catabólicas. Las
macromoléculas son primero desensambladas (hidrolizadas) en los bloques de construcción en los que están constituidas (etapa I, fig. 3–22). Una vez
que las macromoléculas han sufrido hidrólisis en sus componentes (aminoácidos, azúcares, ácidos grasos) la célula puede reutilizar los bloques de
construcción directamente para 1) formar otras macromoléculas de la misma clase (etapa I), 2) convertirlas en compuestos diferentes para la
elaboración de otros productos o 3) degradarlos aún más (etapas II y III, fig. 3–22) y extraer una parte de su contenido de energía libre.
FIGURA 3–22
Tres etapas metabólicas. La vía catabólica (flechas verdes hacia la derecha) convergen para formar metabolitos comunes y conducir a la síntesis de
ATP en la etapa III. Las vías anabólicas (flechas azules hacia la izquierda) comienzan a partir de ciertos precursores en la etapa III y utiliza ATP para
sintetizar gran variedad de materiales celulares. Las vías metabólicas para los ácidos nucleicos son más complejas y no se muestran en esta figura.

FIGURA 3–22

Tres etapas metabólicas. La vía catabólica (flechas verdes hacia la derecha) convergen para formar metabolitos comunes y conducir a la síntesis de
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ATP en la etapa III. Las vías anabólicas (flechas azules hacia la izquierda) comienzan a partir de ciertos precursores en la etapa III y utiliza ATP para
sintetizar gran variedad de materiales celulares. Las vías metabólicas para los ácidos nucleicos son más complejas y no se muestran en esta figura.
Las vías para degradación de diversos bloques de construcción de las macromoléculas varían de acuerdo con el compuesto particular catabolizado.
Por último, todas estas macromoléculas se convierten en diversos compuestos pequeños que pueden ser metabolizado de la misma forma. Así,
aunque sustancias que inician como macromoléculas aunque tengan una estructura muy diferente, son convertidas por vías catabólicas en los
mismos metabolitos de bajo peso molecular. Por esta razón, se dice que las vías catabólicas son convergentes.
Las reacciones químicas y las vías metabólicas descritas en este capítulo se encuentran en prácticamente cualquier célula viva, desde la bacteria más
simple hasta la célula vegetal o animal más compleja. Es evidente que estas vías aparecen muy temprano en la evolución biológica, aunque se
mantienen a lo largo de toda la evolución.
Oxidación y reducción: una cuestión de electrones
Las vías catabólicas y anabólicas incluyen reacciones fundamentales en las cuales se transfieren electrones de un reactivo al otro. Las reacciones que
involucran un cambio en el estado de los electrones de los reactivos se denominan reacciones de óxidoreducción (o redox). Los cambios de este
tipo, involucran la ganancia o pérdida de electrones. Considérese la conversión de hierro metálico (Fe0) al estado ferroso (Fe2+), en el cual el átomo de
hierro pierde un par de electrones, con lo que logra un estado más positivo. Cuando un átomo pierde uno o más electrones, se dice que se encuentra
en estado oxidado. La reacción es reversible, lo que significa que los iones ferrosos pueden convertirse hierro metálico, un estado más negativo,
mediante la adquisición de un par de electrones. Cuando un átomo gana uno o más electrones, se dice que se encuentra en estado reducido.
Para que el hierro metálico sufra oxidación, debe haber alguna sustancia que acepte los electrones que son liberados. Por el contrario, para que
ocurra la reducción de los iones ferrosos, debe haber alguna sustancia que done los electrones necesarios. En otras palabras, la oxidación de un
reactivo debe acompañarse de una reducción simultánea de otro de los reactivos y viceversa. Una posible reacción que involucra el hierro podría ser
La sustancia que se oxida durante una reacción redox, es decir, aquella que pierde electrones, se conoce como agente reductor y aquel que sufre la
reducción, aquel que gana electrones, se denomina agente oxidante.
La oxidación o reducción de metales, como hierro o cobre, involucra la pérdida o ganancia de electrones. No puede ocurrir lo mismo con la mayor
parte de los compuestos orgánicos por la siguiente razón: la oxidación y reducción de sustratos orgánicos durante el metabolismo celular involucra
átomos de carbono, que tienen enlaces covalentes con otros átomos. Como se revisa en el capítulo 2, cuando un par átomos diferentes comparten un
par de electrones, los electrones son atraídos más fuertemente a uno de los dos átomos polarizando el enlace. En un enlace C–H el átomo de carbono
aplica más fuerza sobre los electrones; por tanto, puede decirse que el átomo de carbono se encuentra en estado reducido. Por el contrario, si el
átomo de carbono está unido a un átomo más electronegativo, como en el caso de los enlaces C–O o C–N los electrones se alejan del átomo de
carbono, que por lo tanto se encuentra en estado oxidado. Como el carbono tiene cuatro electrones en su capa externa que puede compartir con
otros átomos, puede existir en diversos estados de oxidación. Esto se ilustra en el átomo de carbono en una serie de moléculas de un solo carbono
(fig. 3–23) que varían desde un estado de reducción completa en el metano (CH4) a un estado de oxidación completa en el dióxido de carbono (CO2).
El estado de oxidación relativa de una molécula orgánica puede determinarse en términos generales al contar el número de átomos de hidrógeno en
comparación con los átomos de oxígeno y nitrógeno por átomo de carbono. Como se verá poco más adelante, el estado de oxidación de los átomos de
carbono en una
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El estado de oxidación de un átomo de carbono depende de los otros átomos a los que está unido. Cada átomo de carbono puede
átomo de carbono está unido a un átomo más electronegativo, como en el caso de los enlaces C–O o C–N los electrones se alejan del átomo de
carbono, que por lo tanto se encuentra en estado oxidado. Como el carbono tiene cuatro electrones en su capa externa
UAM que puede compartir
UNIVERSIDAD con
AMERICANA
otros átomos, puede existir en diversos estados de oxidación. Esto se ilustra en el átomo de carbono en una serie de moléculas
Access Provided by:de un solo carbono
(fig. 3–23) que varían desde un estado de reducción completa en el metano (CH4) a un estado de oxidación completa en el dióxido de carbono (CO2).
El estado de oxidación relativa de una molécula orgánica puede determinarse en términos generales al contar el número de átomos de hidrógeno en
comparación con los átomos de oxígeno y nitrógeno por átomo de carbono. Como se verá poco más adelante, el estado de oxidación de los átomos de
carbono en una molécula orgánica proporciona una medición del contenido de energía libre de una molécula.
FIGURA 3–23
El estado de oxidación de un átomo de carbono depende de los otros átomos a los que está unido. Cada átomo de carbono puede
formar un máximo de cuatro enlaces con otros átomos. Esta serie de moléculas simples de carbono ilustra los diversos estados de oxidación en los
que puede existir el átomo de carbono. En su estado más reducido, el carbono está unido a cuatro hidrógenos (formando metano); en su estado más
oxidado, el átomo de carbono está unido a dos oxígenos (que forman dióxido de carbono).
Captura y utilización de la energía
Los compuestos que utilizan energía química para hacer funcionar hornos y automóviles son compuestos orgánicos altamente reducidos, como el gas
natural (CH4) y derivados del petróleo. La energía es liberada cuando estas moléculas se queman en presencia de oxígeno, convirtiendo los átomos de
carbono a un estado más oxidado, como el dióxido de carbono y monóxido de carbono. El grado de reducción de un compuesto también puede
medirse por su capacidad para realizar trabajo químico en la célula. Mientras más átomos de hidrógeno pueden ser separados de la molécula
“combustible”, mayor será la cantidad de ATP que finalmente se producirá. Los carbohidratos son ricos en energía química porque contienen cadenas
de unidades de . Las grasas contienen incluso mayor cantidad de energía por unidad de peso porque contienen cadenas de
unidades más reducidas . En la siguiente discusión nos centraremos en los carbohidratos.
Como único componente de las moléculas de almidón y de glucógeno, la glucosa es una molécula fundamental en el metabolismo energético de
plantas y animales. La energía libre liberada por oxidación completa de glucosa es muy grande.
En comparación, la energía libre necesaria para convertir ADP a ATP es relativamente pequeña:
A partir de estos números, es evidente que la oxidación completa de una molécula de glucosa a CO2 y H2O puede liberar suficiente energía para
producir una gran cantidad de ATP. Como se revisará en el capítulo 5, se forman hasta 36 moléculas de ATP por molécula de glucosa oxidada bajo las
condiciones que existen en la mayoría de las células. Para que se produzcan tantas moléculas de ATP, la molécula de azúcar debe ser desensamblada
en muchos pasos pequeños. Esos pasos en los cuales la diferencia de energía libre entre los reactivos y los productos es relativamente grande puede
acoplarse con reacciones que lleven a la formación de ATP.
Existen básicamente dos etapas en el catabolismo de la glucosa y son virtualmente idénticas en todos los organismos aerobios. La primera etapa, la
glucólisis ocurre en la fase soluble del citoplasma (citosol) y lleva a la formación de piruvato. La segunda etapa es el ciclo de los ácidos
tricarboxílicos (TCA) que ocurre en el interior de la mitocondria de células eucariotas y en el citosol de células procariotas y que lleva a la oxidación
final de los átomos de carbono a dióxido de carbono. La mayor parte de la energía química de la glucosa se almacena en forma de electrones de alta
energía, que son retirados conforme se oxidan las moléculas de sustrato durante la glucólisis y el ciclo TCA. Es la energía de estos electrones lo que
finalmente se
CAPÍTULO 3:utiliza para sintetizar
Bioenergética, ATP.yEn
enzimas las siguientes secciones se revisarán los pasos durante la glucólisis, la primera etapa en la oxidación
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captura de energía utilizada por los primeros ancestros
aneróbicos y permanece como la principal vía anabólica utilizada por organismos anaerobios que viven hoy en día. Se revisará por completo la
historia de la oxidación de la glucosa en el capítulo 5, cuando se analice la mitocondria y su participación en la respiración aerobia.
UAM
Existen básicamente dos etapas en el catabolismo de la glucosa y son virtualmente idénticas en todos los organismos UNIVERSIDAD
aerobios. AMERICANA
La primera etapa, la
glucólisis ocurre en la fase soluble del citoplasma (citosol) y lleva a la formación de piruvato. La segunda etapa esAccess
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tricarboxílicos (TCA) que ocurre en el interior de la mitocondria de células eucariotas y en el citosol de células procariotas y que lleva a la oxidación
final de los átomos de carbono a dióxido de carbono. La mayor parte de la energía química de la glucosa se almacena en forma de electrones de alta
energía, que son retirados conforme se oxidan las moléculas de sustrato durante la glucólisis y el ciclo TCA. Es la energía de estos electrones lo que
finalmente se utiliza para sintetizar ATP. En las siguientes secciones se revisarán los pasos durante la glucólisis, la primera etapa en la oxidación de la
glucosa, que ocurre sin la participación del oxígeno. Esta es presumiblemente la vía de captura de energía utilizada por los primeros ancestros
aneróbicos y permanece como la principal vía anabólica utilizada por organismos anaerobios que viven hoy en día. Se revisará por completo la
historia de la oxidación de la glucosa en el capítulo 5, cuando se analice la mitocondria y su participación en la respiración aerobia.
REVISIÓN
1. ¿Por qué las vías catabólicas se describen como convergentes, mientras que las vías anabólicas se describen como divergentes?
3.10. GLUCÓLISIS Y FERMENTACIÓN

En la figura 3–24 se muestran las reacciones de la glucólisis y las enzimas que la catalizan. Antes de analizar las reacciones específicas, debe
mencionarse un punto importante con respecto a la termodinámica del metabolismo. En una revisión previa, se hizo énfasis en las diferencias entre
ΔG y ΔG°′; es el ΔG para una reacción particular el que determina la dirección en la célula. La medición real de las concentraciones de los metabolitos
en las células puede revelar el valor de ΔG de una reacción en un momento dado. La figura 3–25 muestra los valores típicos de ΔG medidos para la
reacción de glucólisis. A diferencia de los valores de ΔG°′ de la figura 3–24, todas las tres reacciones tienen valores de ΔG cercanos a cero; es decir, se
encuentran casi en equilibrio. Las tres reacciones se encuentran lejos del equilibrio, lo que las hace esencialmente irreversibles en la célula,
proporcionando la fuerza motriz que mueve los metabolitos a través de la vía glucolíticas de forma dirigida.
FIGURA 3–24
Los pasos de la glucólisis.
FIGURA 3–25
Perfil de energía libre de la glucólisis en el tejido del músculo cardiaco. Los números en los pasos corresponden a las reacciones de la
glucólisis que se muestran en la figura 3–24. Todas las reacciones están en el equilibrio o cerca de él, excepto las que catalizan la hexocinasa, la
fosfofructocinasa y la piruvato cinasa (reacciones 1, 3 y 10), que presentan grandes diferencias en la energía libre.

FIGURA 3–25

Perfil de energía libre de la glucólisis en el tejido del músculo cardiaco. Los números en los pasos corresponden a las reacciones de la
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glucólisis que se muestran en la figura 3–24. Todas las reacciones están en el equilibrio o cerca de él, excepto las que catalizan la hexocinasa, la
fosfofructocinasa y la piruvato cinasa (reacciones 1, 3 y 10), que presentan grandes diferencias en la energía libre.
FUENTE: De Voet, Pratt, Fund of Biochemistry 4E. Reproducido con autorización de John Wiley & Sons, Inc.
En 1905, dos químicos británicos, Arthur Harden y William Young, se encontraban estudiando el desdoblamiento de la glucosa en células de levaduras,
un proceso que genera burbujas de CO2 gaseoso. Harden y Young observaron que las burbujas finalmente se producían con mayor lentitud y
finalmente se detenían, aunque había abundante glucosa para metabolizar. Aparentemente, otro componente esencial del caldo se había agotado.
Después de experimentar con numerosas sustancias, los químicos encontraron que la adición de fosfatos inorgánicos iniciaba nuevamente la
reacción. Concluyeron que las reacciones agotaban el fosfato, lo que constituyó el primer indicio de que los grupos fosfato participaban en las vías
metabólicas. La importancia del grupo fosfato se ilustra en las reacciones iniciales de la glucólisis.
La glucólisis inicia con la unión de un grupo fosfato al carbohidrato (paso 1, fig. 3–24) a expensas de una molécula de ATP. El uso de ATP en esta etapa
puede considerarse una inversión energética, el costo por iniciar el negocio de la oxidación de la glucosa. La fosforilación activa el carbohidrato,
haciéndolo capaz de participar en las reacciones subsiguientes mientras que los grupos fosfato son trasladados y transferidos a otros aceptores. La
fosforilación también retiene la glucosa en el interior de la célula, porque la glucosa fosforilada no puede cruzar la membrana celular. Esto permite
que la célula capte más glucosa del entorno. La glucosa6fosfato se convierte a fructosa6fosfato y después a fructosa 1, 6difosfato a expensas de
una segunda molécula de ATP (pasos 2, 3). El difosfato de seis carbonos se divide en dos monofosfatos de tres átomos de carbono (paso 4), que
establece la etapa para la primera reacción exergónica a la cual puede acoplarse la formación de ATP. A continuación, se revisará la formación de ATP.
Producción de ATP en la glucólisis
El ATP se forma de dos maneras básicamente diferentes, ambas ilustradas por una reacción química de glucólisis: la conversión de gliceraldehído 3
fosfato a 3fosfoglicerato (paso 6, 7). La reacción general es una oxidación de un aldehído a un ácido carboxílico (como se muestra en la fig. 3–23) y
ocurre en dos pasos catalizados por dos enzimas diferentes (fig. 3–24). La primera de estas enzimas requiere un cofactor no protéico (una coenzima)
denominada dinucleótido de nicotinamida y adenina (NAD). Como se revisa en este y los siguientes capítulos, NAD desempeña una función importante
en el metabolismo energético al aceptar y donar electrones. La primera reacción (fig. 3–26a, b) es una óxidoreducción en la cual dos electrones y un
protón (lo que equivale a un ion hidruro, :H−) son transferidos del gliceraldehído 3fosfato (que se oxida) a NAD+ (que se reduce). La forma reducida de
esta coenzima es NADH (fig. 3–27). La enzima que cataliza este tipo de reacción se conoce como deshidrogenasa; la enzima que cataliza la reacción
previa se denomina gliceraldehído 3fosfato deshidrogenasa. La molécula de NAD+, que se deriva de la vitamina niacina, actúa como una coenzima
asociada débilmente con la deshidrogenasa en posición para aceptar el ion hidruro (tanto los electrones como el protón). El NADH formado en la
reacción se libera de la enzima en intercambio por una molécula fresca de NAD+.
FIGURA 3–26
Transferencia de energía durante una oxidación química. La oxidación del gliceraldehído 3fosfato a 3fosfoglicerato, que es un ejemplo de la
oxidación de un aldehído a un ácido carboxílico, se produce en dos etapas catalizadas por dos enzimas. La primera reacción [partes a) y b)] la cataliza
la enzima gliceraldehído 3fosfato deshidrogenasa, que transfiere un ion hidruro (dos electrones y un protón) del sustrato al NAD+. Una vez reducidas,
las moléculas de NADH son desplazadas por las moléculas de NAD+ del citosol a) y el sustrato unido se fosforila y libera b). La enzima fosfoglicerato
quinasa cataliza
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una molécula
CAPÍTULO 3:de sustrato, en este
Bioenergética, caso 1,3bisfosfoglicerato
enzimas y metabolismo, al ADP, para formar ATP. Page 45 / 58
Transferencia de energía durante una oxidación química. La oxidación del gliceraldehído 3fosfato a 3fosfoglicerato, que es un ejemplo
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oxidación de un aldehído a un ácido carboxílico, se produce en dos etapas catalizadas por dos enzimas. La primeraAccess
reacción [partes
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la enzima gliceraldehído 3fosfato deshidrogenasa, que transfiere un ion hidruro (dos electrones y un protón) del sustrato al NAD+. Una vez reducidas,
las moléculas de NADH son desplazadas por las moléculas de NAD+ del citosol a) y el sustrato unido se fosforila y libera b). La enzima fosfoglicerato
quinasa cataliza la segunda reacción [parte c)], lo cual es un ejemplo de una fosforilación a nivel de sustrato en la que un grupo fosfato se transfiere de
una molécula de sustrato, en este caso 1,3bisfosfoglicerato al ADP, para formar ATP.
FIGURA 3–27
La estructura de NAD+ y su reducción a NADH. Cuando el 2′ OH del resto ribosa (indicado por la pantalla de color púrpura) se une en forma
covalente a un grupo fosfato, la molécula es NADP+/NADPH, cuya función se analiza más adelante en este capítulo.
En breve se retomará esta reacción, pero primero se revisarán las consecuencias de la formación de NADH. NADH se considera un compuesto rico en
energía por la facilidad con la cual es capaz de transferir electrones a otras moléculas que atraigan electrones (se dice que NADH tiene un potencial
elevado de transferencia de electrones con respecto a otros aceptores de electrones en la célula; véase el cuadro 5–1). Los electrones por lo general se
transfieren de NADH a través de una serie de transportadores de electrones incorporados en la membrana, que constituyen la cadena de transporte
de electrones. Conforme los electrones se desplazan a lo largo de esta cadena se mueven a estados de energía libre más y más bajos y finalmente
pasan al oxígeno molecular, reduciéndolo a agua. La energía liberada durante el transporte de electrones se utiliza para formar ATP por un proceso
conocido como fosforilación oxidativa. El transporte de electrones y fosforilación oxidativa se revisará en detalle en el capítulo 5.
CAPÍTULO
Además de la3:vía
Bioenergética,
indirecta paraenzimas y metabolismo,
la formación Page 46 / 3
de ATP que involucra NADH y la cadena transportadora de electrones, la conversión de gliceraldehído 58
fosfato a 3fosfoglicerato incluye una vía directa para la formación de ATP. En el segundo paso de esta reacción (paso 7, fig. 3–24 y 3–26c), un grupo
fosfato se transfiere desde el 1, 3difosfoglicerato a ADP para formar una molécula de ATP. Esta reacción es catalizada por la enzima fosfoglicerato
cinasa. Esta vía directa para la formación de ATP se conoce como fosforilación al nivel del sustrato porque ocurre por transferencia de un grupo
energía por la facilidad con la cual es capaz de transferir electrones a otras moléculas que atraigan electrones (se dice que NADH tiene un potencial
UAMLos
elevado de transferencia de electrones con respecto a otros aceptores de electrones en la célula; véase el cuadro 5–1). UNIVERSIDAD
electrones porAMERICANA
lo general se
transfieren de NADH a través de una serie de transportadores de electrones incorporados en la membrana, que constituyen cadena de transporte
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de electrones. Conforme los electrones se desplazan a lo largo de esta cadena se mueven a estados de energía libre más y más bajos y finalmente
pasan al oxígeno molecular, reduciéndolo a agua. La energía liberada durante el transporte de electrones se utiliza para formar ATP por un proceso
conocido como fosforilación oxidativa. El transporte de electrones y fosforilación oxidativa se revisará en detalle en el capítulo 5.
Además de la vía indirecta para la formación de ATP que involucra NADH y la cadena transportadora de electrones, la conversión de gliceraldehído 3
fosfato a 3fosfoglicerato incluye una vía directa para la formación de ATP. En el segundo paso de esta reacción (paso 7, fig. 3–24 y 3–26c), un grupo
fosfato se transfiere desde el 1, 3difosfoglicerato a ADP para formar una molécula de ATP. Esta reacción es catalizada por la enzima fosfoglicerato
cinasa. Esta vía directa para la formación de ATP se conoce como fosforilación al nivel del sustrato porque ocurre por transferencia de un grupo
fosfato de un sustrato (en este caso, 1, 3difosfoglicerato) al ADP. Las reacciones restantes de la glucólisis (pasos 8 a 10) incluyen una segunda
fosforilación a nivel de sustrato del ADP (paso 10), como se indica en la figura 3–24.
La fosforilación al nivel del sustrato de ADP ilustra un punto importante sobre el ATP. Su transformación no es tan endergónica. En otras palabras, el
ATP puede formarse con facilidad por reacciones metabólicas. Existen numerosas moléculas fosforiladas cuya hidrólisis tiene un ΔG°′ más negativo
que la del ATP. La figura 3–28 ilustra el ΔG°′ relativo para la hidrólisis de varios compuestos fosforilados. Cualquier mayor donador en la escala
puede utilizarse para fosforilar cualquier molécula de la porción inferior de la escala, y el ΔG°′ de esta reacción será igual a la diferencia entre los dos
valores mostrados en la figura. Por ejemplo, ΔG°′ para la transferencia de un grupo fosfato a partir del 1, 3difosfoglicerato al ADP para formar ATP es
igual a −4.5/ kcal mol (−11.8 kcal/mol + 7.3 kcal/mol). Este concepto de potencial de transferencia es útil para comparar cualquier serie de
donadores y a sectores, sin importar el grupo que se transfiera, ya sean protones, electrones, oxígeno o grupos fosfato. Aquellas moléculas más
elevadas en la escala, es decir, aquellas con mayor energía libre (mayor ΔG°′) son moléculas con menos afinidad por el grupo que será transferido
que aquellas en posición más baja en la escala. Mientras menor sea la afinidad, mejor es el donador; a mayor afinidad, mejor es el aceptor.
FIGURA 3–28
Clasificación de compuestos por potencial de transferencia de fosfato. Aquellos compuestos fosforilados más altos en la escala (los que
tienen un ΔG°′ de hidrólisis más negativa) tienen menor afinidad por su grupo fosfato que aquellos compuestos más bajos en la escala. Como
resultado, los compuestos más altos en la escala transfieren fácilmente su grupo de fosfato para formar compuestos que están más abajo. Por tanto,
los grupos fosfato pueden transferirse de 1,3bisfosfato o fosfoenolpiruvato a ADP durante la glucólisis.
Una característica importante de la glucólisis es que puede generar un número limitado de moléculas de ATP en ausencia de oxígeno. Ni la
fosforilación a nivel del sustrato del ADP por acción del 1, 3difosfoglicerato, ni la reacción posterior por fosfoenolpiruvato (paso 10, fig. 3–24)
requiere oxígeno molecular. Así, la glucólisis puede considerarse como una vía anaerobia para la producción de ATP, lo que indica que puede
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molecular para continuar proporcionando ATP. Se producen dos moléculas de ATP por fosforilación al nivel del
sustrato durante la glucólisis, a partir de cada molécula de gliceraldehído 3fosfato oxidado a piruvato. Como cada molécula de glucosa produce dos
moléculas de gliceraldehído 3fosfato, se generan cuatro moléculas de ATP por molécula de glucosa oxidada a piruvato. Por otro lado, deben
hidrolizarse dos moléculas de ATP para iniciar la glucólisis, lo que deja una ganancia neta para las células de dos moléculas de ATP por molécula de
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Una característica importante de la glucólisis es que puede generar un número limitado de moléculas de ATP en ausencia de oxígeno. Ni la
fosforilación a nivel del sustrato del ADP por acción del 1, 3difosfoglicerato, ni la reacción posterior por fosfoenolpiruvato (paso 10, fig. 3–24)
requiere oxígeno molecular. Así, la glucólisis puede considerarse como una vía anaerobia para la producción de ATP, lo que indica que puede
continuar en ausencia de oxígeno molecular para continuar proporcionando ATP. Se producen dos moléculas de ATP por fosforilación al nivel del
sustrato durante la glucólisis, a partir de cada molécula de gliceraldehído 3fosfato oxidado a piruvato. Como cada molécula de glucosa produce dos
moléculas de gliceraldehído 3fosfato, se generan cuatro moléculas de ATP por molécula de glucosa oxidada a piruvato. Por otro lado, deben
hidrolizarse dos moléculas de ATP para iniciar la glucólisis, lo que deja una ganancia neta para las células de dos moléculas de ATP por molécula de
glucosa oxidada. La ecuación neta para las reacciones de glucólisis puede escribirse
El piruvato, el producto final de la glucólisis, es un compuesto clave porque se encuentra en la unión de las vías anaeróbicas (independiente de
oxígeno) y aeróbicas (dependiente de oxígeno). En ausencia de oxígeno molecular, el piruvato sufre fermentación, como se revisa en la siguiente
sección. Cuando se dispone de oxígeno, el piruvato se cataboliza aún más por la respiración aerobia, como se revisan en el capítulo 5.
Oxidación anaerobia del piruvato: el proceso de fermentación
Se ha visto que la glucólisis es capaz de proporcionar a la célula una pequeña cantidad neta de ATP por cada molécula de glucosa convertida a
piruvato. Sin embargo, las reacciones glucolíticas ocurren a velocidades tan rápidas que las células tienen la capacidad de producir cantidades
significativas de ATP utilizando esta vía. De hecho, varias células, incluidas las levaduras, células tumorales y células musculares, dependen mucho de
la glucólisis como un medio para la formación de ATP. Sin embargo, existe un problema que deben afrontar dichas células. Uno de los productos de la
oxidación de gliceraldehído 3fosfato es el NADH. La formación de NADH ocurre a expensas de uno de los reactivos, NAD+, que escasea en las células.
Como el NAD+ es un reactivo necesario en este importante paso de la glucólisis, debe regenerarse a partir de NADH. De no ser así, ya no podrá ocurrir
la oxidación de gliceraldehído 3fosfato, ni ninguna de las reacciones sucesivas de la glucólisis. Sin embargo, sin oxígeno el NADH no puede oxidarse a
NAD+ por medio de la cadena de transporte de electrones porque el oxígeno es el aceptor final de electrones de la cadena. Sin embargo, las células
tienen la capacidad de regenerar NAD+ por fermentación, la transferencia de electrones de NADH a piruvato, el producto final de la glucólisis o a un
compuesto derivado del piruvato (fig. 3–29). Al igual que la glucólisis, la fermentación tiene lugar en el citosol. Para la mayor parte de los organismos,
que dependen del O2, la fermentación es una medida provisional para regenerar NAD+ cuando las concentraciones de O2 son bajas, de forma que la
glucólisis pueda continuar y se mantiene la producción de ATP.
FIGURA 3–29
Fermentación. La mayoría de las células llevan a cabo una respiración aeróbica, que depende del oxígeno molecular. Si los suministros de oxígeno
disminuyen, como ocurre en una célula de músculo esquelético sometida a una contracción extenuante, o en una célula de levadura que vive en
condiciones anaeróbicas, estas células pueden regenerar NAD+ por fermentación. Las células musculares logran la fermentación por formación de
lactato, mientras que las células de levadura lo hacen mediante la formación de etanol. La oxidación aeróbica de piruvato mediante el ciclo de TCA se
discute extensamente en el capítulo 5.

disminuyen, como ocurre en una célula de músculo esquelético sometida a una contracción extenuante, o en una célula de levadura que vive en
condiciones anaeróbicas, estas células pueden regenerar NAD+ por fermentación. Las células musculares logran la fermentación por formación de
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lactato, mientras que las células de levadura lo hacen mediante la formación de etanol. La oxidación aeróbica de piruvato mediante el ciclo de TCA se
discute extensamente en el capítulo 5.
El producto de la fermentación varía de un tipo de célula u organismo a otro. Cuando se requiere que las células musculares se contraigan
repetidamente, la concentración de oxígeno se torna demasiado baja para mantener el paso de las demandas metabólicas de la célula. Bajo estas
condiciones, las células del músculo esquelético regeneran NAD+ al convertir el piruvato a lactato. Cuando el oxígeno se encuentra disponible en
cantidades suficientes, el lactato puede convertirse de nuevo a piruvato para continuar la oxidación. Las levaduras han enfrentado los retos de la vida
anaerobia con diferentes soluciones metabólicas: convierten el piruvato a etanol, como se ilustra en la figura 3–29.
Aunque la fermentación es un complemento necesario para el metabolismo en muchos organismos y la única fuente de energía metabólica en
algunos microorganismos anaerobios, la energía ganada por glucólisis es poca cuando se compara con la oxidación completa de la glucosa a dióxido
de carbono y agua. Cuando un mol de glucosa se oxida por completo, se liberan 686 kilocalorías. En contraste, sólo se liberan 57 kilocalorías cuando la
misma cantidad de glucosa se convierte a etanol bajo condiciones estándar y se liberan sólo 47 kilocalorías cuando se convierte a lactato. En cualquier
caso, sólo se forman dos moléculas de ATP por molécula de glucosa oxidada mediante glucólisis y fermentación; más de 90% de la energía
simplemente se desecha en el producto de la fermentación (como se hace evidente por la inflamabilidad del alcohol etílico).
Durante las etapas iniciales de la vida en la tierra, cuando aún no había aparecido el oxígeno, la glucólisis y la fermentación eran probablemente la
principal vía metabólica por la cual las células procariotas primitivas extraían energía de los azúcares. Después de la aparición de la cianobacterias, el
oxígeno atmosférico se incrementó drásticamente y fue posible la evolución de una estrategia metabólica aerobia. Como consecuencia, los productos
de la glucólisis pueden oxidarse por completo y puede recolectarse mucho más ATP. En el capítulo 5 se revisará cómo se logra esto, cuando se revise la
estructura y función de la mitocondria.
REVISIÓN
1. Comparar la energía obtenida por una célula que oxida glucosa por medios aerobio y anaerobio. ¿Cuál es la diferencia en los productos
terminales
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potencial de transferencia de fosfatos del fosfoenolpiruvato se
compara con el del ATP? ¿Cuál es el significado termodinámico de esto (en términos de ΔG°′ relativo de hidrólisis)? ¿Qué significa el término de
afinidad por los grupos fosfato?
principal vía metabólica por la cual las células procariotas primitivas extraían energía de los azúcares. Después de la aparición de la cianobacterias, el
oxígeno atmosférico se incrementó drásticamente y fue posible la evolución de una estrategia metabólica aerobia. Como consecuencia, los productos
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de la glucólisis pueden oxidarse por completo y puede recolectarse mucho más ATP. En el capítulo 5 se revisará cómo se logra esto, cuando se revise la
estructura y función de la mitocondria.
REVISIÓN
1. Comparar la energía obtenida por una célula que oxida glucosa por medios aerobio y anaerobio. ¿Cuál es la diferencia en los productos
terminales de estos dos tipos de metabolismo?
2. Explicar qué significa el potencial de transferencia de fosfatos. ¿De qué forma el potencial de transferencia de fosfatos del fosfoenolpiruvato se
compara con el del ATP? ¿Cuál es el significado termodinámico de esto (en términos de ΔG°′ relativo de hidrólisis)? ¿Qué significa el término de
afinidad por los grupos fosfato?
3. En la reacción en la cual se oxida gliceraldehído 3fosfato a 3fosfoglicerato, ¿Cuál es el compuesto que actúa como agente reductor? ¿Cuál es el
agente oxidante? ¿Cuál es el compuesto que se oxida? ¿Cuál es el que se reduce?
4. ¿Qué reacciones de glucólisis se acoplan a la hidrólisis de ATP? ¿Qué reacciones participan en la fosforilación al nivel del sustrato? ¿Qué
reacciones dependen de la fermentación o de la respiración aerobia para continuar?
3.11. PODER REDUCTOR

La energía necesaria para sintetizar moléculas biológicas complejas, como proteínas, grasas y ácidos nucleicos se deriva en gran medida del ATP
generado por la glucólisis y el transporte de electrones. Pero muchos de estos materiales, en particular las grasas y otros lípidos, se encuentran más
reducidos que los metabolitos a partir de los cuales se construyen. La síntesis de grasas requiere la reducción de metabolitos, lo que se logra por la
transferencia de electrones ricos en energía a partir de NADPH, un compuesto estructuralmente similar al NADH, pero que contiene un grupo fosfato
adicional (descrito en la leyenda de la figura 3–27). El reservorio celular de NADPH representa su poder reductor, lo cual es una medida del
contenido de la energía disponible en la célula. El uso de NADPH puede ilustrarse en una de las acciones fundamentales de la fotosíntesis:
En esta reacción, un par de electrones (junto con un protón) se transfieren del NADPH al sustrato 1, 3difosfoglicerato, reduciendo un átomo de
carbono (que se señala en color rojo).
La forma oxidada de NADPH, NADP+ se forma a partir de NAD+ en la siguiente reacción:
NADPH puede formarse por la reducción de NADP+. Al igual que NADH, NADPH es un compuesto rico en energía por su elevado potencial de
transferencia de electrones. La transferencia de energía libre en la forma de estos electrones eleva al aceptor a un estado más reducido y energético.
La separación del poder reductor en dos moléculas distintas pero relacionadas, NADH y NADPH, refleja una separación de sus funciones metabólicas
primarias. NADH y NADPH son coenzimas reconocidas por diferentes enzimas. Las enzimas que tienen una función reductora en la vía anabólica
utilizan NADPH como su coenzima, mientras que aquellas que actúan como deshidrogenasa en la vía catabólica, utilizan NAD+. Aunque se utilizan de
forma diferente, una coenzima puede reducir como se muestra en la siguiente reacción, la cual es catalizada por la enzima transhidrogenasa:
Cuando la energía es abundante, se favorece la producción de NADPH, lo que proporciona un suministro de los electrones necesarios para la
biosíntesis de nuevas macromoléculas esenciales para el crecimiento. Sin embargo, cuando escasean los recursos energéticos, la mayor parte de los
electrones ricos en energía de NADH son “intercambiados” por ATP y sólo se genera el NADPH suficiente para satisfacer los requerimientos
biosintéticos mínimos de la célula.

REVISIÓN
1. ¿Por qué el poder reductor se considera una forma de energía?
Cuando la energía es abundante, se favorece la producción de NADPH, lo que proporciona un suministro de los electrones necesarios para la
biosíntesis de nuevas macromoléculas esenciales para el crecimiento. Sin embargo, cuando escasean los recursos energéticos, la mayor parte de los
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electrones ricos en energía de NADH son “intercambiados” por ATP y sólo se genera el NADPH suficiente para satisfacer los requerimientos
biosintéticos mínimos de la célula.
REVISIÓN
1. ¿Por qué el poder reductor se considera una forma de energía?
3.12. REGULACIÓN METABÓLICA

La cantidad de ATP presente en una célula en un momento dado es sorprendentemente pequeña. Por ejemplo, una célula bacteriana contiene
aproximadamente un millón de moléculas de ATP, cuya vida media es muy breve (en el orden de uno o dos segundos). Con un suministro limitado, es
evidente que el ATP no es una molécula en la cual se almacenen grandes cantidades de energía libre. Las reservas de energía de una célula se
almacenan en forma de polisacáridos y grasas. Cuando empiezan a disminuir las concentraciones de ATP, se activan las acciones para incrementar la
formación de ATP a expensas de formas de almacenamiento ricas en energía. De la misma forma, cuando las concentraciones de ATP son elevadas, se
inhiben las acciones que normalmente llevarían a la producción de ATP. Las células regulan estas reacciones liberadoras de energía al controlar
ciertas enzimas fundamentales en diversas vías metabólicas.
La función de una proteína está estrechamente relacionada con su estructura (conformación). Por tanto, no es de sorprender que las células regulan
la actividad proteínica al modificar la conformación de las moléculas proteínicas clave. En el caso de enzimas, la regulación de la actividad catalítica se
centra en la modificación de la estructura del sitio activo. Los dos mecanismos comunes para alterar la forma del sitio activo son las modificaciones
covalentes y la modulación alostérica, ambas desempeñan funciones clave para regular la oxidación de la glucosa.4
Alteración de la actividad enzimática mediante la modificación de enlaces covalentes
A mediados de la década de 1950, Edmond Fischer y Edwin Krebs de la University of Washington estaban estudiando la glucógeno fosforilasa, una
enzima que se encuentra en las células musculares y que degrada el glucógeno en subunidades de glucosa. La enzima podría existir en su estado
activo o inactivo. Fischer y Krebs prepararon un extracto crudo de células musculares y encontraron que las moléculas inactivas de enzima en el
extracto podrían activarse mediante la simple adición de ATP al tubo de ensayo. Un análisis más detallado reveló una segunda enzima en el extracto
(una “enzima convertidora”, como la denominaron) que transfería un grupo fosfato del ATP a uno de los 841 aminoácidos que constituían la molécula
de la glucógeno fosforilasa. La presencia del grupo fosfato alteraba la forma del sitio activo de la enzima e incrementaba su actividad catalítica. La
investigación subsiguiente demostró que la modificación covalente de las enzimas, dada por la adición (o eliminación) de fosfatos, es el mecanismo
general para cambiar la actividad enzimática. Las enzimas que transfieren grupos fosfato a otras proteínas se denominaban proteínas cinasas y
regulaban diversas actividades como la acción hormonal, división celular y expresión génica. La “enzima convertidora” descubierta por Krebs y
Fischer más tarde recibió el nombre de fosforilasa cinasa y su regulación se revisa en la sección 15.8. Existen básicamente dos tipos diferentes de
proteínas cinasas: un tipo añade grupos fosfato a residuos específicos de tirosina en la proteína sustrato; el otro tipo añade fosfatos a residuos de
serina o treonina específicos en el sustrato. La importancia de las proteínas cinasas se refleja en el hecho de que aproximadamente 2% de todos estos
genes de una levadura (113 de aproximadamente 6 200) codificaban miembros de esta clase de enzimas.
4El metabolismo también se regula controlando las concentraciones de enzimas. Las velocidades relativas a las cuales se sintetizan y degradan las
enzimas se consideran en capítulos posteriores.
Alteración de la actividad enzimática por modulación alostérica
La modulación alostérica es un mecanismo por el cual actividad de una enzima se inhibe o se estimula mediante un compuesto que se une a sitio,
denominado sitio alostérico que es especialmente distinto del sitio activo de la enzima. De acuerdo con esto, la unión de un compuesto al sitio
alostérico envía “una onda” a través de la proteína, produciendo un cambio definido en la forma del sitio activo, el cual puede estar localizado al lado
opuesto de la enzima o incluso en un polipéptido diferente en la molécula proteínica. Dependiendo de la enzima en particular y de su modulador
alostérico, el cambio en la forma del sitio activo puede estimular o inhibir su capacidad para catalizar la reacción. La modulación alostérica ilustra la
estrecha relación entre la estructura molecular y la función. Cambios muy pequeños en la estructura de la enzima inducidos por el modulador
alostérico puede causar cambios notables en la actividad enzimática.
Las células son plantas manufactureras muy eficientes que no desperdician energía y materiales produciendo compuestos que no serán utilizados.
Uno de los principales mecanismos que utilizan las células para detener las líneas de ensamble anabólico es un tipo de modulación alostérica
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en el cual la enzima que cataliza el primer paso en una vía metabólica, se inactiva
temporalmente cuando la concentración del producto
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vía simple ilustrada en la figura 3–30, en la cual dos sustratos, A y B, se convierten en un producto terminal E. Conforme la concentración de un
producto E se eleva, se une al sitio alostérico de la enzima BC, produciendo un cambio conformacional en el sitio activo que disminuye la actividad
alostérico, el cambio en la forma del sitio activo puede estimular o inhibir su capacidad para catalizar la reacción. La modulación alostérica ilustra la
estrecha relación entre la estructura molecular y la función. Cambios muy pequeños en la estructura de la enzima inducidos por el modulador
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alostérico puede causar cambios notables en la actividad enzimática.
Las células son plantas manufactureras muy eficientes que no desperdician energía y materiales produciendo compuestos que no serán utilizados.
Uno de los principales mecanismos que utilizan las células para detener las líneas de ensamble anabólico es un tipo de modulación alostérica
conocida como inhibición por retroalimentación, en el cual la enzima que cataliza el primer paso en una vía metabólica, se inactiva
temporalmente cuando la concentración del producto final de dicha vía, un aminoácido por ejemplo, alcanza cierta concentración. Esto se ilustra en la
vía simple ilustrada en la figura 3–30, en la cual dos sustratos, A y B, se convierten en un producto terminal E. Conforme la concentración de un
producto E se eleva, se une al sitio alostérico de la enzima BC, produciendo un cambio conformacional en el sitio activo que disminuye la actividad
enzimática. La inhibición por retroalimentación ejerce un control inmediato y sensible sobre la actividad anabólica de la célula.
FIGURA 3–30
Inhibición de retroalimentación. El flujo de metabolitos a través de una ruta metabólica se detiene cuando la primera enzima de la secuencia
(enzima BC) es inhibida por el producto final de esa secuencia (compuesto E), que se une a un sitio alostérico en la enzima. La inhibición de
retroalimentación evita que una célula desperdicie recursos al continuar produciendo compuestos que ya no son necesarios.
REVISIÓN
1. ¿Cómo se relacionan las concentraciones de AMP y ATP en la célula? ¿La glucólisis se inhibe por altas concentraciones de ATP o de AMP?
3.13. SEPARACIÓN DE LAS VÍAS CATABÓLICAS Y ANABÓLICAS
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REVISIÓN
1. ¿Cómo se relacionan las concentraciones de AMP y ATP en la célula? ¿La glucólisis se inhibe por altas concentraciones de ATP o de AMP?
3.13. SEPARACIÓN DE LAS VÍAS CATABÓLICAS Y ANABÓLICAS

Una breve revisión de la vía anabólicas que conduce a la síntesis de glucosa (gluconeogénesis) ilustrará algunos aspectos importantes sobre las vías
de síntesis. La mayoría de las células son capaces de sintetizar glucosa a partir de piruvato al mismo tiempo que oxidan glucosa como su principal
fuente de energía química. ¿Cómo son capaces las células de realizar estas dos vías opuestas? El primer punto importante es que, aunque las enzimas
pueden catalizar una reacción en ambas direcciones, las reacciones de gluconeogénesis no pueden simplemente proceder al contrario de las
reacciones de la glucólisis. La vía glucolítica contiene tres reacciones irreversibles desde el punto de vista termodinámico (fig. 3–25) y estos pasos
deben ser sobrepasados de alguna manera. Incluso si todas las reacciones de la glucólisis pudieran realizarse en sentido inverso, sería una forma
poco deseable para que las células manejaran sus actividades metabólicas, porque las dos vías no pueden controlarse de manera independiente una
de la otra. Así, una célula no podría detener la síntesis de glucosa y al mismo tiempo activar su degradación, ya que las mismas enzimas podían estar
activas en ambas direcciones.
Si se compara la vía por la cual se degrada la glucosa con su vía de síntesis, se puede ver que algunas reacciones son idénticas, aunque ocurren en
direcciones opuestas, mientras que otras son muy diferentes (pasos 1 a 3, fig. 3–31). Al utilizar diferentes enzimas para catalizar reacciones claves en
las dos vías opuestas, la célula puede resolver los problemas termodinámicos como regulatorios, inherentes a la capacidad de síntesis y degradación
de la misma molécula.
FIGURA 3–31
Glucólisis versus gluconeogénesis. Mientras que la mayoría de las reacciones son las mismas en las dos vías aunque se ejecutan en direcciones
opuestas, las tres reacciones irreversibles de la glucólisis (pasos 1 a 3 aquí) se reemplazan en la ruta gluconeogénica por diferentes reacciones
favorecidas termodinámicamente.

FIGURA 3–31

Glucólisis versus gluconeogénesis. Mientras que la mayoría de las reacciones son las mismas en las dos vías aunque se ejecutan en direcciones
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opuestas, las tres reacciones irreversibles de la glucólisis (pasos 1 a 3 aquí) se reemplazan en la ruta gluconeogénica por diferentes reacciones
favorecidas termodinámicamente.
Puede observarse esto mejor al observar de cerca las enzimas claves de la glucólisis y la gluconeogénesis. Como se señala en el paso 2 de la figura 3–
31, la fosfofructocinasa, una enzima de la glucólisis que cataliza la reacción
que tiene un ΔG°′ de −3.4 kcal/mol, lo que la hace esencialmente irreversible. Esta reacción tiene un −ΔG°′ grande porque se acopla a la hidrólisis de
ATP. En la gluconeogénesis, la formación de fructosa6fosfato es catalizada por la enzima fructosa 1,6difosfatasa mediante una simple hidrólisis:
Las enzimas particulares de la glucólisis y gluconeogénesis descritas son fundamentales en sus respectivas vías. Estas son reguladas en parte por AMP
y ATP. Téngase en mente que la concentración de AMP en las células está inversamente relacionada con la concentración de ATP; cuando las
concentraciones
CAPÍTULO de ATP son bajas,
3: Bioenergética, las concentraciones
enzimas y metabolismo,de AMP son altas y viceversa. En consecuencia, el aumento de las concentracionesPagede AMP
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ATP es un sustrato de la fosfofructocinasa, también es un inhibidor
alostérico, mientras que el AMP es un activador alostérico. Cuando las concentraciones de ATP son altas, la actividad de la enzima disminuye, de forma
que no se produce ATP adicional por glucólisis. Por el contrario, cuando las concentraciones de ADP y AMP son altas respecto a las de ATP, se
ATP. En la gluconeogénesis, la formación de fructosa6fosfato es catalizada por la enzima fructosa 1,6difosfatasa mediante una simple hidrólisis:
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Las enzimas particulares de la glucólisis y gluconeogénesis descritas son fundamentales en sus respectivas vías. Estas son reguladas en parte por AMP
y ATP. Téngase en mente que la concentración de AMP en las células está inversamente relacionada con la concentración de ATP; cuando las
concentraciones de ATP son bajas, las concentraciones de AMP son altas y viceversa. En consecuencia, el aumento de las concentraciones de AMP
envía señales a la célula de que las reservas de ATP se han agotado. Aunque el ATP es un sustrato de la fosfofructocinasa, también es un inhibidor
alostérico, mientras que el AMP es un activador alostérico. Cuando las concentraciones de ATP son altas, la actividad de la enzima disminuye, de forma
que no se produce ATP adicional por glucólisis. Por el contrario, cuando las concentraciones de ADP y AMP son altas respecto a las de ATP, se
incrementa la actividad de la enzima, lo que favorece la síntesis de ATP. Por el contrario, la actividad de la fructosa 1,6difosfatasa, una enzima clave de
la gluconeogénesis, se inhibe por el aumento de las concentraciones de AMP.
La importancia de la modulación alostérica en el control metabólico se ha demostrado en estudios recientes sobre la enzima proteína cinasa activada
por AMP (AMPK, AMPactivated protein kinase). Al igual que la fosforilasa cinasa antes analizada, la AMPK controla la actividad de otras enzimas al
añadir grupos fosfato a residuos de serina o treonina específicos en su estructura. La actividad de AMPK por sí misma es controlada por
modificaciones postraduccionales; la enzima se activa por la adición de un grupo fosfato y se inhibe por la eliminación de dicho grupo fosfato. Más
importante aún, es que la enzima AMPK se activa tanto por la presencia de AMP y ADP, los dos productos alternativos de la hidrólisis de ATP. El AMP
activa AMPK por unión a un sitio alostérico y ADP activa la AMPK al bloquear la eliminación del grupo fosfato antes mencionados. Conforme se
incrementa las concentraciones de AMP o ADP, AMPK es activada, lo que ocasiona que fosforile e inhiba de las enzimas fundamentales que participan
en la vía anabólicas, mientras que simultáneamente fosforila y activa las enzimas clave en las vías catabólicas, el resultado final de la activación de
AMPK es la disminución en la actividad de las vías que consumen ATP, y el incremento de la actividad de las vías que producen ATP, llevando a un
incremento en la concentración de ATP en la célula.
AMPK participa no sólo en la regulación de la energía celular, sino que, al menos en mamíferos, en la regulación del balance energético en todo el
cuerpo. En mamíferos, el apetito es controlado por centros en el hipotálamo del encéfalo que responden a la concentración de ciertos nutrientes y
hormonas en la sangre. Por ejemplo, una disminución en las concentraciones de glucosa actúa sobre el hipotálamo estimula el apetito, lo que parece
estar mediado a través de la activación de AMPK en las células nerviosas hipotalámicas. Por el contrario, la sensación de “plenitud” que se
experimenta después de comer, parece desencadenarse por acción de ciertas hormonas (p. ej., la leptina secretada por células adiposa) que inhibe la
actividad de AMPK en las mismas células cerebrales. Por su participación como “termostato energético”, AMPK se ha convertido en blanco para el
desarrollo de fármacos para el tratamiento de la obesidad y la diabetes. La metformina, un fármaco antidiabético, activa AMPK, lo que ocasiona
supresión de la gluconeogénesis en las células hepáticas y como consecuencia, disminución de las concentraciones de glucosa en sangre.
REVISIÓN
1. ¿Cuáles son los dos mecanismos comunes para la regulación de la actividad de una enzima al cambiar la conformación de su sitio activo?
3.14. PERSPECTIVA HUMANA

Restricción calórica y longevidad
En el capítulo 2 se revisa la teoría de que el envejecimiento es consecuencia del daño acumulado causado por radicales libres. A continuación, se
considerarán otros aspectos del envejecimiento, es decir, la observación de que la disminución del consumo calórico en muchos modelos animales
puede incrementar longevidad y disminuir el proceso de envejecimiento.
La red metabólica mostrada en la figura 3–22 incluye cada vía bioquímica en la célula y cada aspecto de la fisiología humana, y por tanto no parece
sorprendente que las alteraciones en la actividad metabólica general pudieran tener grandes efectos en nuestra salud y bienestar. Un ejemplo
importante es el riesgo potencial entre la actividad metabólica y la esperanza de vida. La idea inicial de que reducir el consumo calórico podría
ocasionar una vida más prolongada proviene de estudios en ratas y ratones. La disminución de la alimentación en 10% a 30%, les permitió tener
vidas más largas, con incremento en la esperanza de vida promedio y en la duración máxima de la vida. El efecto fue espectacular, pero estos
estudios dejaron sin respuesta dos preguntas. En primer lugar, ¿cuál es el mecanismo molecular y celular del efecto? y en segundo lugar, ¿se
observará el mismo efecto en seres humanos?
Los estudios del mecanismo de restricción calórica se han analizado en diferentes organismos modelo como las levaduras (Saccharomyces
cerevisiae), moscas de la fruta (Drosophila melanogaster) y nemátodos (Caenorhabditis elegans). Estos organismos tienen esperanza de vida corta,
de forma que los experimentos pueden realizarse con mayor rapidez que en el modelo de ratas o ratones y con una menor cantidad de dinero.
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Además, estos2024926
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genética potente y apropiada que permite la identificación de los genes con mayor facilidad que en roedores.
Los experimentos
©2024 McGraw Hill.confirmaron que la restricción
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1). Los experimentos genéticos en estos modelos han identificado una gran variedad de genes que median los efectos de la restricción calórica en el
envejecimiento. Un resultado interesante de estos experimentos ha sido que diferentes genes participan en el efecto dependiendo del momento en
estudios dejaron sin respuesta dos preguntas. En primer lugar, ¿cuál es el mecanismo molecular y celular del efecto? y en segundo lugar, ¿se
observará el mismo efecto en seres humanos?
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Los estudios del mecanismo de restricción calórica se han analizado en diferentes organismos modelo como las levaduras (Saccharomyces
cerevisiae), moscas de la fruta (Drosophila melanogaster) y nemátodos (Caenorhabditis elegans). Estos organismos tienen esperanza de vida corta,
de forma que los experimentos pueden realizarse con mayor rapidez que en el modelo de ratas o ratones y con una menor cantidad de dinero.
Además, estos modelos tienen una genética potente y apropiada que permite la identificación de los genes con mayor facilidad que en roedores.
Los experimentos confirmaron que la restricción calórica incrementa la esperanza de vida en moscas y gusanos, como se observó en roedores (fig.
1). Los experimentos genéticos en estos modelos han identificado una gran variedad de genes que median los efectos de la restricción calórica en el
envejecimiento. Un resultado interesante de estos experimentos ha sido que diferentes genes participan en el efecto dependiendo del momento en
la vida en que se aplique la restricción calórica, lo que sugiere, por ejemplo, que la restricción calórica de por vida en comparación con la restricción
calórica aplicada en etapas avanzadas de la vida podrían actuar a través de diferentes vías genéticas. Los estudios en organismos modelo, han
indicado que la restricción calórica puede incrementar la producción de especies reactivas de oxígeno. Como se revisa en la sección 2.2, se ha
asumido que los radicales de oxígeno aceleran el envejecimiento, pero experimentos han mostrado que en ocasiones también es cierto lo opuesto
y que los radicales de oxígeno pueden en realidad proporcionar protección contra el envejecimiento. El incremento de la longevidad logrado
durante la restricción calórica puede estar relacionado con este último tipo de efecto protector.
Sin importar los mecanismos moleculares, la posibilidad de que el envejecimiento puede retrasarse en seres humanos mediante una simple
reducción de 20% en el consumo calórico es tremendamente excitante. Aunque podría ser difícil consumir una cantidad sustancialmente menor en
la dieta, la promesa de tener la capacidad de retrasar o prevenir cualquiera de las múltiples complicaciones del envejecimiento es un aliciente
atractivo. Para investigar si la restricción calórica era eficaz en animales más similares a los seres humanos que los roedores que habían sido
utilizados previamente, se iniciaron dos grandes estudios en la época de 1980 utilizando monos rhesus, uno en el Wisconsin National Primate
Research Center (WNPRC) y otro en el National Institute of Aging (NIA), parte de los NIH. Como los primates tienen una esperanza de vida mucho más
prolongada que los ratones o ratas (sin mencionar a gusanos o moscas) estos experimentos se siguieron por décadas. Los dos estudios
proporcionaron resultados diferentes: el estudio del WNPRC mostró un incremento en la esperanza de vida en los monos sometidos a restricción
calórica, mientras que el estudio NIA no mostró efecto alguno. Una diferencia importante entre los estudios es que el realizado en la NIA alimentó a
los monos con base en ingredientes naturales, mientras que los monos del WNPRC recibieron alimentos sintéticos elaborados a partir de
componentes purificados como lactoalbúmina y sacarosa. Asumiendo que ingredientes más naturales hacen que los alimentos sean más
saludables, quizá reducir el consumo de alimentos poco saludables en el estudio WNPRC pudo tener un impacto positivo en la esperanza de vida, al
reducir las muertes causadas por cardiopatía y por otras enfermedades.
Los estudios realizados en WNPRC y NIA coincidieron en que mejoraron los indicadores de buena salud en los monos alimentados con restricción
calórica (p. ej., concentraciones de glucosa). Por tanto, es posible que la restricción calórica en seres humanos pueda ayudar a producir vidas más
saludables y activas en el envejecimiento, incluso si en realidad no se prolonga la vida. Es importante recordar que la mayor parte de las personas
no fallecen simplemente de viejos, por lo general, sufren de cáncer o una enfermedad cardiaca. Dado que la obesidad contribuye al desarrollo de
muchas enfermedades como diabetes, cardiopatías y cáncer, sería buena idea restringir nuestro consumo calórico de alguna forma, sin importar si
afecta por sí mismo al proceso de envejecimiento.
Sin importar si la restricción calórica haya demostrado ser eficaz como estrategia para incrementar la esperanza de vida, los estudios relacionados
con el consumo calórico y el envejecimiento nos han enseñado que el metabolismo puede afectar directamente nuestras vidas y que puede ser
modificada por los alimentos que consumimos.
FIGURA 1
Comer menos alimentos ayuda a los gusanos nematodos a vivir más tiempo. Este gráfico, conocido como curva de KaplanMeier, muestra el
porcentaje de animales que todavía están vivos en un número determinado de días después del nacimiento. Eventualmente, las curvas caen a cero ya
que hay un límite superior de cuánto puede vivir cualquier animal. La mejora de la longevidad se indica mediante curvas que se desplazan hacia la
derecha, porque eso significa que un mayor porcentaje de individuos que el de los animales normales sigue vivo a una edad determinada. Este gráfico
muestra cuatro tipos de gusanos mutantes que comen menos porque su faringe —su órgano de alimentación— no funciona correctamente. A modo
de comparación, los gusanos normales se trazan en la curva indicada con los cuadrados blancos. Mientras que los gusanos normales viven en
promedio por alrededor de 20 días, la esperanza de vida de los mutantes que comen menos aumenta a 30 días.

derecha, porque eso significa que un mayor porcentaje de individuos que el de los animales normales sigue vivo a una edad determinada. Este gráfico
muestra cuatro tipos de gusanos mutantes que comen menos porque su faringe —su órgano de alimentación— no funciona correctamente. A modo
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de comparación, los gusanos normales se trazan en la curva indicada con los cuadrados blancos. Mientras que los gusanos normales viven en
promedio por alrededor de 20 días, la esperanza de vida de los mutantes que comen menos aumenta a 30 días.
FUENTE: B. Lakowski y S. Hekimi. 1998. The genetics of caloric restriction in Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
95:13091−13096.
PREGUNTAS ANALÍTICAS
1. ¿De qué forma esperaría que una disminución del pH pueda afectar a una reacción catalítica en la que participe la quimiotripsina? ¿De qué forma el
incremento del pH afectaría dicha reacción?
2. La inhibición por retroalimentación típicamente altera la actividad de la primera enzima de la vía metabólica más que a otra enzima con actividad
más adelante en la ruta. ¿Por qué este es un mecanismo adaptativo?
3. Después de revisar las reacciones de la formación de glutamina en párrafos anteriores, explique por qué cada una de las siguientes aseveraciones
con respecto a la tercera reacción (o a las reacciones en general) son verdaderas o falsas.
a. Si la reacción se escribiera en sentido inverso, su ΔG°′ sería de +3.9 kcal/mol.
b. Si todos los reactivos y productos se encontraron en condiciones estándar al inicio del experimento, después de un periodo de tiempo la
proporción de [NH3]/[ADP] podría disminuir.
c. Conforme se lleva cabo la reacción, la ΔG°′ se acerca a cero.
d. En equilibrio, las reacciones en ambos sentidos son iguales y la razón de [ATP]/[ADP] se vuelve 1.
e. En la célula, es posible que la glutamina se forme cuando la relación de [glutamina]/[ácido glutámico] es mayor de 1.
4. Usted acaba de aislar una nueva enzima y ha determinado la velocidad de la reacción con tres diferentes concentraciones de sustrato. Se
encuentra que la pendiente de la curva del producto en comparación con el tiempo, es la misma para las tres concentraciones. ¿Qué podría
concluirse con respecto a las condiciones en la mezcla de reacción? ¿Cree usted que la velocidad podría cambiar si se modifican las
concentraciones de enzima en lugar de cambiar las concentraciones del sustrato?
5. Las lisozimas son enzimas de acción lenta que requieren aproximadamente dos segundos para catalizar una reacción. ¿Cuál es el número de
recambio de la lisozima?
6. ¿Qué significa en términos de proporciones de concentración cuando se dice que el ΔG de la hidrólisis de ATP en la célula es de aproximadamente
−12 kcal/mol, mientras que ΔG°′ es de −7.3 kcal/mol?
7. Las enzimas bajo regulación celular son aquellas cuyas acciones proceden típicamente bajo condiciones de no equilibrio. ¿Cuál sería el efecto de la
inhibición alostérica de una enzima que opera cerca del estado de equilibrio?
8. Considérense dos direcciones donde ΔG°′ para la primera reacción es −1 kcal/mol y ΔG°′ para la segunda reacciones de −4 kcal/mol. Bajo
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reacciones proceden de forma espontánea hacia la formación de productos, lo que indica que su ΔG°′ debe ser
CAPÍTULO
negativa. ¿Es el K′eq para la segunda yreacción
3: Bioenergética, enzimas metabolismo,
más grande o menor que el K′eq para la primera reacción? ¿En cuánto?
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9. Si la reacción XA + Y ⇌ XY + A tiene ΔG°′ de +7.3 kcal/mol, ¿podría esta reacción llevarse a cabo en la célula al acoplarlo con la hidrólisis de ATP? ¿Por
6. ¿Qué significa en términos de proporciones de concentración cuando se dice que el ΔG de la hidrólisis de ATP en la célula es de aproximadamente
−12 kcal/mol, mientras que ΔG°′ es de −7.3 kcal/mol? UAM UNIVERSIDAD AMERICANA
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7. Las enzimas bajo regulación celular son aquellas cuyas acciones proceden típicamente bajo condiciones de no equilibrio. ¿Cuál sería el efecto de la
inhibición alostérica de una enzima que opera cerca del estado de equilibrio?
8. Considérense dos direcciones donde ΔG°′ para la primera reacción es −1 kcal/mol y ΔG°′ para la segunda reacciones de −4 kcal/mol. Bajo
condiciones estándar, ambas reacciones proceden de forma espontánea hacia la formación de productos, lo que indica que su ΔG°′ debe ser
negativa. ¿Es el K′eq para la segunda reacción más grande o menor que el K′eq para la primera reacción? ¿En cuánto?
9. Si la reacción XA + Y ⇌ XY + A tiene ΔG°′ de +7.3 kcal/mol, ¿podría esta reacción llevarse a cabo en la célula al acoplarlo con la hidrólisis de ATP? ¿Por
qué sí o por qué no?
10. Supongamos que dos proteínas, A y B pueden asociarse una con otra para formar un complejo. Se mide la constante de disociación a diferentes
temperaturas y se encuentra que conforme se calienta la muestra, el Kd disminuye. ¿Esto significa que la unión de A y B se torna más o menos
favorable conforme se incrementa la temperatura?
11. La reacción del compuesto X con el compuesto Y para producir compuestos Z es una reacción desfavorable (ΔG°′ = +5 kcal/mol). Escriba la reacción
química que puede ocurrir si se utilizó ATP para activar la reacción.
12. El ATP ha evolucionado como la molécula central en el metabolismo energético. ¿Podría servir para la misma función el 1, 3difosfoglicerato? ¿Por
qué sí o por qué no?
13. Calcular la ΔG para la hidrólisis de ATP en una célula en la cual la proporción [ATP]/[ADP] se incrementó a 100:1, mientras que la concentración de
Pi permaneció en 10 mM. ¿Cómo se compara esto con la proporción [ATP]/[ADP] cuando la reacción se encuentra en equilibrio y la concentración
de Pi permanece en 10 mM? ¿Cuál sería el valor para ΔG cuando los reactivos y productos se encuentran en condiciones estándar (1 M)?
14. Considérese la reacción:
¿Cuál es la constante de equilibrio, K′eq, para esta reacción? (Nota: se ignora la concentración de agua). ¿El valor positivo de ΔG°′ en la reacción
antes mencionada significa que la reacción nunca podrá ocurrir de forma espontánea de izquierda a derecha?
15. Bajo condiciones fisiológicas, [glucosa] = 5 mM, [glucosa 6fosfato] = 83 mM y [Pi] = 1 mM. Bajo estas condiciones, ¿la reacción del problema 16
avanzará de izquierda a derecha espontáneamente? De no ser así, ¿qué concentración de glucosa se necesitaría para que la reacción ocurra de
izquierda a derecha, si las concentraciones de los otros reactivos y productos se encuentran como se mencionó antes?
16. Parece evidente que la síntesis de glutamina no puede ocurrir en una célula mediante la reacción descrita en el problema 18. La reacción real
acopla la síntesis de glutamina con la hidrólisis de ATP:
¿Cuál es la ΔG°′ para esta reacción? Supóngase que todos los reactivos y productos, con excepción del amoniaco, están presentes en 10 mM. ¿Qué
concentración de amoniaco sería necesario para que esta reacción ocurra hacia la derecha, es decir, para estimular la síntesis neta de glutamina?
17. Un inhibidor no competitivo no evita que la enzima se una a su sustrato. ¿Cuál será el efecto de incrementar la concentración de sustrato en
presencia de un inhibidor no competitivo? ¿Sería de esperarse que el inhibidor no competitivo afecte la Vmáx de la enzima? ¿O que afecte la KM?
Explique brevemente.


CAPÍTULO 3 - Bioenergética, Enzimas y Metabolismo

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Biología celular y molecular. Conceptos y experimentos, 8e

CAPÍTULO 3: Bioenergética, enzimas y metabolismo

TÚ NO ERES LO QUE COMES

Pintura de Giuseppe Arcimboldo: Rudolf II de Habsburgo como Vertumnus.

FUENTE: pintura de Giuseppe Arcimboldo.

3.1. LEYES DE LA TERMODINÁMICA

3.1. LEYES DE LA TERMODINÁMICA

Primera ley de la termodinámica

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Segunda ley de la termodinámica

3.2. ENERGÍA LIBRE

Temp. (°C) Δ E (cal/mol) Δ H (cal/mol) Δ S (cal/mol· °C) T Δ S (cal/mol) Δ G (cal/mol)

−10 −1 343 −1 343 −4.9 −1 292 −51

0 −1 436 −1 436 −5.2 −1 436 0

+10 −1 529 −1 529 −5.6 −1 583 154

Cambios en la energía libre en las reacciones químicas

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Que se puede reorganizar a

Cuando el logaritmo natural (ln) se convierte a log10, la ecuación se transforma en

Cambios en la energía libre en las reacciones metabólicas

Cambios en la energía libre en las reacciones metabólicas

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3.3. ACOPLAMIENTO DE REACCIONES ENDERGÓNICAS Y EXERGÓNICAS

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3.4. EQUILIBRIO EN COMPARACIÓN CON EL METABOLISMO EN ESTADO ESTACIONARIO

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1. ¿Que define a un sistema cerrado? ¿Las células son sistemas cerrados?

3.5 LAS ENZIMAS COMO CATALIZADORES BIOLÓGICOS

Propiedades de las enzimas

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Enzima t 1 / 21 no enzimática1 Número de recambio2 Incremento de velocidad3

OMP descarboxilasa 78 000 000 años 39 1.4 × 1017

Nucleasa estafilocócica 130 000 años 95 5.6 × 1014

Adenosina deaminasa 120 años 370 2.1 × 1012

Nucleosidasa AMP 69 000 años 60 6.0 × 1012

Citidina deaminasa 69 años 299 1.2 × 1012

Fosfotriesterasa 2.9 años 2 100 2.8 × 1011

Carboxipeptidasa A 7.3 años 578 1.9 × 1011

Quetosteroide isomerasa 7 semanas 66 000 3.9 × 1011

Triosafosfato isomerasa 1.9 días 4,300 1.0 × 109

Corismato mutasa 7.4 horas 50 1.9 × 106

Anhidrasa carbónica 5 segundos 1 × 106 7.7 × 106

Ciclofilina, humana 23 segundos 13 000 4.6 × 105

Superando la barrera energética de activación

3.6. MECANISMOS DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA

3.6. MECANISMOS DE LA CATÁLISIS ENZIMÁTICA

Orientación del sustrato

Cambios en la reactividad del sustrato

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Inducción de tensión en el sustrato

FUENTE: Cortesía de Thomas A. Steitz, Universidad de Yale.

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3.7. CINÉTICA ENZIMÁTICA

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βlactamas Penicilinas (ampicilina) Biosíntesis de peptidoglicanos Hidrólisis

Rifamicinas Rifampin Transcripción ADPribosilación

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