Bioquímica

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BIOQUIMICA

Bios- vida
Es el conjunto de conocimientos de la química orgánica y la biología que facilitan la comprensión de los fenómenos
que ocurren en los seres vivos.
Campos: medicina,nutrición y agronomía.

Se divide en:
• Biológico: estudia la composición química de los organismos.
Clasificación:
• estática: moléculas que dan estructura a la célula, y lo que entra y sale.
• Dinámica: transformaciones derivadas de complicadas cadenas de reacciones tanto de sintesis como de
degradación. Metabolismos.

CÉLULA
Unidad estructural y funcional del ser vivo
• robert hooke 1665
• Grew y Malpihi 1670-1680
• Anton Van Leewenhoek 1674
• Schwann 1839 y schleiden 1838: formaron la teoría celular donde schwann dice que todos los organismos están
compuestos por células y que la célula es la unidad estructural de la vida
• Rudolf Virchow 1855: las células pueden originarse por división de una célula preexistente.

Cacarcterísticas:
1. Es un sistema abierto
2. Isótermico
3. Se ensambla y ajusta y perpetua por si misma.

Composición química:
Compuesta por componentes orgánicos e inorgánicos

I
Inorgánicos Orgánicos

Proteínas 10-20%
Agua 75-85% Lípidos 2-3%
Sales y iones minerales 1% Carbohidratos 1%
Ácidos nucleicos y otros 1%

Inorgánicos:
el agua es la más abundante (95%) en estado libre y 5% en forma combinada. Forma puentes de hidrógeno y es
bipolar por lo que tiene atracción ionica

AGUA
Funciones:
• componente estructural celular En el cuerpo humano:
• en membrana representa el 30-40% 1. Transporte de
• En mitocondrias y cloroplastos no menos de 60% nutrientes y O2
• Interviene en el mantenimiento y forma estructural de la célula 2. Medio de reacciones
• Es el medio de dispersión del contenido plasmático metabolicas
• Disolvente por excelencia de los componentes solubles 3. Regula temperatura
• Transporte de metabolitos residuales 4. Retira desechos de las
• Movimiento y distribución de sales y iones minerales dentro de la célula células
• Participa en reacciones metabólicas 5. Lubricante de organos
• presenta acción de termorregulación en el interior de la célula. 6. Circulacion sanguinea
IONES Y MINERALES= CHONPS MICROELEMENTOS TRAZAS: Fe.Cu,Mn,Zn.
(iones,precipitados,asociados a moléculas)

MACROMÓLECULAS NECESARIAS: I,Na,K,P,Mg SOLO EN ALGUNOS SERES VIVOS: AI,B,Si,V,Mo,I

BIOELEMENTOS
Primarios Secundarios Oligoelementos

96% 3.3% 0.1%

CHONPS Na,K,Ca,Mg,Cl Fe,Cu,Zn,F,I

COMPONENTES ORGÁNICOS
Bio moléculas: principales moléculas en el cuerpo humano
Carbohidratos,lípidos,proteínas y ácidos nucleicos
Vitaminas
Hormonas

BIO MOLÉCULAS. CONSTRUCCIÓN


Compuestos formados por C,H,O, y se les agrega P,S. Los aminoácidos se unen por: un radical amino,con
Material para repuesto de tejidos un radical ácido para formar un peptido
Funciones:
• estructuración de tejidos
• Transporte
• Reguladores
• Homeostáticas
• Defensivas
• Reserva
• Transporte
• Hormonales
• Enzimas

CLASIFICACIÓN DE LÍPIDOS
LÍPIDOS

Saponificables con ácidos grasos Insaponificables sin ácidos grasos

Simples Complejos Esteroides. Terpenos. Prostaglandinas

Acigliceridos y ceras Fosfolípidos,Esfingolípidos,


Grasas neutras
Glicolípidos
Ácidos grasos saturados e insaturados
ÁCIDOS GRASOS
Cadenas hidrocarbonadas con un carboxilo terminal
Es más fácil romper los insaturados por su doble enlace

Importancia:
• principal componente de lípidos simples
• Aparecen en trazas.
• Presentes en plantas y animales
• Cuerpo= número par de átomos de carbono (16 y 18 carbonos principalmente)
• Ácidos g insaturados más comunes en grasas simples
• Insaturación predomina en carbonos 9-10

Insaturado: óleico C17H33COOH


Los trigliceridos varian dependiendo su grupo carboxilo

Lípidos simples:
Acilgliceridos
Ceras
Glicerolípidos
Esfingolipidos

ACILGLICERIDOS
Son resultado de la esferificación de una glicerina y 1-3 ácidos grasos,por lo que se llaman mono,di o triglicéridos,
siendo estos últimos son más comunes en plantas y animales.
Son hidrolizables y sanonificables.

TRIGLICÉRIDOS
Componentes principales, en los depósitos de grasa en células animales y vegetales.
Los más abundantes son tripalmitilglicérido,trioleilglicerido.

CERAS
Insolubles en agua
Impermeabilizan piel,pelo,plumas,hojas,frutos.

GLICEROLÍPIDOS: LIPIDOS DE MEMBRANA


Gliceroglucolipidos y glicerofosfolipidos
Están formados por una molécula de glicerina,dos ácidos grasos y una molécula más, que puede ser un ácido fosfatídico
(fosfoaminolípido).

ESFINGOLÍPIDOS
Formados por:
aminoalcohol insaturado
Un ácido graso saturado
Tercer componente denominado por esfingomielinas,cerebrósidos y gangliósidos.

LÍPIDOS COMPLEJOS
• terpenos
• Esteroides
• Prostaglandinas

Funciones de lípidos:
Componentes estructurales de membrana
Material energético célular,debido a su contenido energetico
Constituyen sustancias de reserva
Función protectora: paredes celulares de bacterias y plantas, exoesqueleto de insectos.

CARBOHIDRATOS:
Son las bio moléculas más abundantes en la naturaleza, por ende en las células.
Su oxidación es la principal ruta de obtención de energía.
Son conocidos como hidratos de carbono (CHO)
Algunos pueden tener función estructural.
Clasificación general

MONOSACÁRIDOS
Son los carbohidratos más simples
Derivados de aldehídos o cetónicos
Unidos por medio de un enlace glucosídico para formar disacáridos y polisacaridos
Estructura lineal o ciclica
Participan en procesos metabólicos
Sabor dulce
CHO CHO
Clasificación por número de cabonos:
3- triosa
H. C. OH HO. C. H
4- tetrosa
5- pentosa
6-hexosa
CH2OH CH2OH
7-heptosa

Por grupo funcional:


• grupo funcional en el extremo de la cadena carbonada, es aldehído y recibe
nombre de aldosa
• Si el carbonilo está en otra posición es una cetosa.

Por su isometría espacial o estereoisomería


• OH a la derecha o izquierda, la posición del OH del carbón asimétrico más
alejado del grupo funcional,determina la configuración D o L

Por su estructura cíclica


• Si el anillo se asemeja al furano se denomina furanosa y si es al pirano es
piranosa

DISACÁRIDOS
Formados por monosacaridos
Unidos por un enlace covalente llamado glucosídico
Por hidrolisis dan lugar a dos monosacáridos
Son las azucares que consumimos en nuestra dieta

Principales disacáridos
POLISACÁRIDOS
ÁCIDOS NUCLÉICOS
• polimeros lineales de nucleotidos donde se deposita la información genética Bases nitrogenadas:
2 anillos puricas
Estructura de los nucleotidos: 1 anillo pirimidica

El ADN:
• En eucariontes está de forma lineal en el núcleo,mitocondrias y
cloroplastos
• En procariotas está en forma circular y está en el citoplasma dentro de El enlace es a partir del carbón 1
plasmidos del azucar,ahí se va a unir la base
• Tiene estructura primaria,secundaria y terciaria dependiendo su nitrogenada
empaquetamiento • purica (carbon 9)
• Primidica (carbón 1)
1. Estructura primaria: secuencias de nucleotidos a lo largo de la • Ácido fosfórico en el carbón
cadena, adenina,g,c y t. 5 por medio de un enlace
estér
• Los nucleótidos se unen por
medio del enlace
fosfodiester

2. Estructura secundaria: Watson y Crick (1953). Postularon un modelo


de estructura tridimensional de doble helice dextrogira.
Proporción 3´5´(una va y otra viene)

3. Estructura terciaria, está enrollado en histonas y en sí mismo para


formar el solenoide para plegarse y meterse en los genes de cada
cromosoma.

ARN:
Es monocatenario (de una sola cadena) Ribosoma
Tipos:
1. Arnm tiene una cola y una caperusa que lo protegen y facilitan su
función.
2. Arn r: se encuentra en los ribosomas,el ribosoma es de 80 sbeigers
También sirve para sintetizar proteínas. Todo está regido por
proteínas.
3. Arn t: es una cadena doblada y forma loops. Hace un dobles debido a
las diferente bases que se atraen y forman puentes de hidrógeno. Se
enrolla en si mismo formando una estructura terciaria.
Tiene un punto donde se une el aminoacido (es el unico arn)
CÉLULA
Unidad básica de la vida y proviene de toda célula preexistente
Propiedades:
1. Grado de complejidad y organización elevada.
2. Cuenta con un programa genetico (ADN) y un recurso para aplicarlo (ARN).
3. Capaces de reproducirse a si misma.
4. son capaces de captar y consumir energia. Por ejemplo la entrada de energia metabolica.
5. realiza reacciones quimicas, iguales o parecidas.
6. Participan en actividades mecanicas: movimiento,impulso electrico, contraccion.
7. Responden a estimulos
8. Se autor regulan

Tipos: eucariota y procariota.

Procariota: ADN circular, reproducción binaria.


Multicelulares trabajan en colonias.
1-10 micras
Eucariota: ADN lineal, reproducción de todos los tipos.
10-100 micras

Órganelos:
Membrana celular: delimita, transporta y selecciona.
Núcleo: inicia y sintetiza ARN normal, ribosomal y de transferencia, por medio de sus poros.
Citoplasma: coloidal y de aspecto rugoso en algunas ocasiones, contiene organelos,nutrientes y moleculas. Está
entre el nucleo y la membrana.

Formación de bicapas lípidicas de la membrana celular

Movimiento de sustancias a través de la membrana


Tipos de transporte:
• pasivo: osmosis,difusión simple y difusión facilitada. Va a favor del gradiente de concentración.
• Activo: primario,secundario. El activo va en contra del gradiente de concentración.
Soluto = solvente (isotonica)
Si hay más soluto que solvente es hipertonico y al revés es hipotónica
Lo normal es tener una minima cantidad de sales y una máxima de agua=hipotonica
Difusión facilitada:
• El agua entra a la célula por medio de las aquaporinas, obedeciendo a los con ayuda de
gradientes de concentración por medio de una difusión facilitada proteínas
La célula libera agua para regular la cantidad de sales que tiene dentro Difusión simple: sin
proteínas.
Bomba NaK: 3 sodios
Difusión simple: se pueden colar moléculas como oxígeno y CO2, así como algunas y 2 potasios
moléculas de agua.

• Transporte por excelencia activo primario: bomba de sodio y potasio, gracias a la


ATP asa
• Transporte activo secundario: una molécula gasta y la otra no (sodio entra a favor
y calcio sale en contra de su gradiente).

ENDOCITOSIS Y EXOCITOSIS

TRANSFERENCIA DE INFORMACIÓN
1. Forma básica: transferencia de ADN

• entre células: comunicación celular. Sirve para saber cuando reproducirse,etc.


Por medio de un ligando y un receptor: ejemplo: insulina
METABOLISMO
Conjunto de procesos físico-químico-fisiológicos que ocurren en los organismos capaces de intercambiar sus
componentes y energía con el entorno.
Funciones específicas:
1. Obtener energía química entorno a nutrientes,energia solar,etc.
2. Convertir nutrientes en precursores o bloques para macromoleculas
3. Reunir monomeros moleculares para formar proteinas,acidos n,lipidos,etc.
4. formar y degradar biomoleculas para las funciones vitales de la celula.

Se divide en tres partes:


• catabolismo: reacciones que liberan energía para romper nutrientes en moléculas más pequeñas para ser
procesadas.

• Anfibolismo: reacciones que dependen de reacciones y productos a través de hidrolisis,que se dan en el


catabolismo y que se van a convertir en ácidos,esteres,etc. para poder almacenarlos.
• Anabolismo: cuando entran las moleculas previamente convertidas en más pequeñas, hay que construir para
ciertos requerimientos estructuras más grandes y suele tener etapas reductoras.

Fuente Catabolismo. Anfibolismo. Anabolismo


orgánica de
energía Degradación Procesos intermedios Biosintesis de
oxidativa de Glucosa-fosfato aminoacidos,ácid
nutrientes Fosfoenolpiruvato os
Acetil CoA nucleicos,proteín
Nutrientes as,sustancias de
reserva.

ATP

Factores que regulan el matabolismo:


Intrínsecos:
• hereditarios
• Sintesis de proteínas específicas
• Síntesis enzimática y de regulación

Extrínsecos:
• fisiologicos y ambientales
• Determinantes del medio, como concentración osmótica, Ph y otros.
• La nutrición y su influencia en la nutrición célular.

RUTAS METABÓLICAS
Reacciones que inician y terminan con un sustrato que es el inicial de la siguiente.
Tipos:
• Lineales: inicia con un sustrato y el producto final sirve para entrar a otra
• Ciclica: el producto con el que inicia es con el que termina

Estado estacionario: un equilibrio basado en lo que entra y lo que sale.


Si el entorno (ph,o2,temperatura) cambia, los procesos metabólicos deben mantenerse a velocidad constante.
Procesos metabolicos=reflejo de tu estado estacionario.

TRANSFERENCIA DE ENERGÍA EN EL METABOLISMO


Leyes de la termodinamica
1. La energía no se crea ni se destruye
2. la energía solo se transforma

Tipos de energía:
Cinética
Calórica
Eólica
Metabólica

Energía en los seres vivos:


Puede provenir de varias fuentes como el sol, macrómoleculas (nutrientes) para pasar a ser ATP.

REACCIONES REDOX
Abreviatura de reacción oxidante, sirve para definir la disminución de oxígeno en el agua.
• Oxidación: pérdida de electrones y ganancia de o2.
• Reducción: perdida de oxigeno y ganancia de electrones.

Las redox espontaneas liberan energía que puede ser de utilidad.


La comida se descompone en azúcar, luego en glucosa y luego en energía
• El balance de reacciones es para tener una función celular normal.
Existen moleéculas que son reactivas por su contenido de oxígeno.
• Hay moléculas denominadas ROS porque pueden llevar redox, o lo pueden alterar por lo que dañan el
matabolismo celular.
• Algunas ros sirven como moleculas señalizadoras y algunas otras están asociadas con el cancer.

Redox como energía metabolica


Los procesos vitales obtienen energía mediante enlace químico o acomplamiento a reacciones oxidativas: ejemplo:
conversion de metabolito A (con liberación de energía) en B y acoplada en otra reacción a C en D, uno exérgonico y otro
endergónico.

Endergónico debe ser un componente de un sistema endergónico-exergónico acoplado.

Algunas reacciones exérgónicas y endergónicas en los sistemas biologicos,se acoplan


Por medio de un intermediario común.
Con este tipo de sistemas se tiene un control biologicodel índice de procesos oxidativos

Las reacciones de deshidrogenación (redox) que se acoplan a hidrogenaciones por


Medio de un acarreador intermediario proporcionan una extensión del concepto de
Acoplamiento
ATP
Molécula energética principal.
Nucleotido con 3 fosfatos

ENZIMAS
Proteínas compuestas por alfa aminoácidos, tienen acción catalitica y poder de reversibilidad.
Catalizadores orgánicos dentro de los seres vivos, permitiendo que funcione el metabolismo.
Propiedades:
• Presentes en pequeñas cantidades
• no sufren alteraciones irreversibles
• No tienen efecto termodinámico en la reacción
• No determina la relación entre el equilibrio de productos y reactantes.
• Pueden ser catalizadores de reacciones termodinamicamente favorecidas.

Características:
• Eficiencia catalítica
• Especifidad
• Sitio activo: hay contacto con los rectantes, es donde la enzima hace contacto con el sustrato. Llave cerradura).
Tiene cadenas laterales de aminoacidos que hacen contacto con el proceso.

Factores que afectan la velocidad de reacción de enzimas


• concentración del sustrato
• Concentración de la enzima
• Temperatura
• PH

Regulación de enzimas
La reacción de

Enzimas alóstericas: pueden cambiar de conformación si están activas o inactivas. Tienen centros alóstericos,donde
regula la forma que tendran las enzimas alostericas gracias a una molécula x (inhibidores o activadores,que en conjunto
son efectores).

Inhibición

Clasificación de enzimas
• simples: estructura proteína, y por una o varias cadenas. Ejemplo: ureasa, que cataliza la transformación de urea en
ácido nitrico
• Complejas; parte proteíca, factores denominados holoenzimas. Parte proteíca=apoenzima y no
proteíca=holoenzima. Si una apoenzima no tiene cofactor (enzima libre) no tiene actividad.
Factores de las holoenzimas:
1. Coenzimas
2. Grupor proteicos
3. Cofactores
4. Iones
5. Metales
Componentes:
• Apoenzima: formada por sitio activo,que hace clic con sustrato.
• Sustrato: molécula sobre la que se ejerce la acción
• Cosustrato: molécula diferente a el sustrato que no acepta ningún grupo que proviene del sustrato.
• Coenzimas: componentes organicos provenientes de vitaminas
• Nucleotidos (ATP,UTP,GTP.CDP)
• grupo prosteíco: constituido por átomos de metales
• Activadores: iones minerales que ayudan al sistema enzimatico para efectuar la transformación del sustrato.

Especificidad de las reacciones catabolicas: diferentes tipos de reacciones= diferentes tipos de enzimas
Puede ser tanto absoluta como relativa.

Especificidad y temperatura: cada enzima es más eficaz a una temperatura específica

Especificidad catalitica: principal propiedad por la que se pueden diferenciar enzimas del resto de proteínas.

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