Portafolio Bioquimica
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Bioquímica médica
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índice
Química General..................................................................................................................................................3
Enlaces químicos y reacciones...........................................................................................................................3
Propiedades del carbono....................................................................................................................................7
Agua y pH...........................................................................................................................................................15
Formación de puentes de hidrogeno en el agua...............................................................................................15
Ácidos, bases y pH............................................................................................................................................18
Proteínas y Enzimas...........................................................................................................................................20
Estructura de las proteínas...............................................................................................................................20
Mecanismo de acción y cinética enzimática.....................................................................................................27
Regulación de la actividad enzimática.............................................................................................................31
Bioenergética.......................................................................................................................................................35
Función del ATP...............................................................................................................................................35
Oxidación biológica.........................................................................................................................................37
Fosforilación oxidativa y cadena respiratoria.................................................................................................38
Metabolismo de los carbohidratos.....................................................................................................................43
Carbohidratos de importancia fisiológica........................................................................................................43
Ciclo del ácido cítrico......................................................................................................................................45
Glucolisis y oxidación del piruvato..................................................................................................................47
Metabolismo de glucógeno...............................................................................................................................49
Gluconeogénesis y control de la glucosa en sangre.........................................................................................51
Vía de la pentosa fosfato..................................................................................................................................53
Metabolismo de los lípidos.................................................................................................................................55
Lípidos de importancia fisiológica...................................................................................................................55
Beta oxidación y cetogénesis............................................................................................................................57
Transporte y almacenamiento de lípidos..........................................................................................................61
Síntesis, transporte y excreción del colesterol..................................................................................................63
Metabolismo de proteínas y aminoácidos.........................................................................................................65
Biosíntesis de aminoácidos no esenciales.........................................................................................................65
Catabolismo de proteínas y del nitrógeno de aminoácidos..............................................................................66
Catabolismo de los esqueletos de carbono de los aminoácidos........................................................................69
Temas especiales.................................................................................................................................................70
Micronutrientes: vitaminas y minerales...........................................................................................................70
Radicales libres y nutrientes antioxidantes......................................................................................................74
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ARREGLA ESTE PEDO ANTES DE IMPRIMIR PENDEJO
Química General
Enlaces químicos y reacciones
Los seres vivos se componen de átomos, pero en la mayoría de los casos, esos átomos
no están flotando por ahí individualmente. Por el contrario, generalmente están interactuando
con otros átomos (o grupos de átomos).
Como ejemplo, los átomos podrían estar conectados por enlaces fuertes y organizados
en moléculas o cristales; o podrían formar enlaces temporales y débiles con otros átomos con
los que chocan o rozan. Tanto los enlaces fuertes, que mantienen unidas a las moléculas,
como los enlaces más débiles que crean conexiones temporales, son esenciales para la
química de nuestros cuerpos y la existencia de la vida misma.
¿Por qué formar enlaces químicos? La respuesta fundamental es que los átomos están
tratando de alcanzar el estado más estable (de menor energía) posible. Muchos átomos se
vuelven estables cuando su orbital de valencia está lleno de electrones o cuando satisfacen la
regla del octeto (al tener ocho electrones de valencia). Si los átomos no tienen este arreglo,
“desearan” lograrlo al ganar, perder o compartir electrones mediante los enlaces.
LOS IONES Y LOS ENLACES QUIMICOS
Los iones pueden ser de dos tipos: Los cationes, son iones positivos que se forman al
perder electrones. Los iones negativos se forman al ganar electrones y se les llaman aniones.
Los aniones reciben nombres con terminación en “-uro”; por ejemplo, el anión del cloro (Cl -)
se llama cloruro.
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LA FORMACION DE UN ENLACE IONICO
Los enlaces iónicos son enlaces que se forman entre iones con cargas opuestas. Por
ejemplo, los iones sodio cargados positivamente y los iones cloruro cargados negativamente
se atraen entre sí para formar cloruro de sodio o sal de mesa.
Otra manera como los átomos se vuelven más estables es al compartir electrones (en
lugar de ganarlos o perderlos por completo), formando así enlaces covalentes. Estos enlaces
son más comunes que los enlaces iónicos en las moléculas de los organismos vivos.
Por ejemplo, los enlaces iónicos son clave para la estructura de las moléculas orgánicas
basadas en el carbono, como el ADN y las proteínas. También hay enlaces covalentes en
moléculas inorgánicas más pequeñas, tales como H 2O, CO2 y O2. Se pueden compartir uno,
dos o tres pares de electrones, lo que resulta en enlaces simples, dobles o triples ,
respectivamente. Entre más electrones compartan dos átomos, más fuerte será el enlace.
En una molécula de agua (arriba), el enlace que une al oxigeno con cada hidrogeno es
un enlace polar. El oxígeno es un átomo mucho más electronegativo que el hidrogeno, por
lo que el oxígeno del agua tiene una carga parcialmente negativa (tiene una densidad de
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electrones alta), mientras que los hidrógenos llevan cargas parcialmente positivas (tienen una
densidad electrónica baja).
ENLACES COVALENTES NO POLARES
Los enlaces covalentes no polares se forman entre dos átomos del mismo elemento o
entre átomos de diferentes elementos que comparten electrones de manera más o menos
equitativa. Por ejemplo, el oxígeno molecular (O 2) no es polar porque los electrones se
comparten equitativamente entre los dos átomos de oxígeno.
Tanto el enlace covalente como el iónico se consideran enlaces fueres. Sin embargo, también
se pueden formar otros tipos de enlaces más temporales entre átomos o moléculas. Dos tipos
de enlaces débiles que se ven con frecuencia en biología son los enlaces de hidrogeno y las
fuerzas de dispersión de London.
ENLACES DE HIDROGENO
En un enlace covalente polar que contiene hidrogeno (por ejemplo, un enlace O-H en
una molécula de agua), el hidrogeno tendrá una ligera carga positiva porque el otro elemento
jala los electrones de enlace más fuertemente. Debido a esta leve carga positiva, el hidrogeno
será atraído a cualquier carga negativa vecina. Esta interacción se llama un enlace de
hidrogeno.
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Los enlaces de hidrogeno son comunes, y las moléculas de agua en particular forman
muchos de ellos. Los enlaces de hidrogeno individuales son débiles y se rompen fácilmente,
pero muchos enlaces de hidrogeno juntos pueden ser muy fuertes.
Como los enlaces de hidrogeno, las fuerzas de dispersión de London son atracciones
débiles entre las moléculas. Sin embargo, a diferencia de los enlaces del hidrogeno, pueden
ocurrir entre átomos o moléculas de cualquier tipo y dependen de desequilibrios temporales
en la distribución de electrones.
Puesto que los electrones están en constante movimiento, habrá momentos en los
cuales los electrones en un átomo o molécula estén agrupados juntos, lo que crea una carga
parcialmente negativa en una parte de la molécula (y una carga parcialmente positiva en otra).
Si una molécula con este tipo de desequilibrio de cargas está muy cerca de otra molécula,
puede causar una redistribución de cargas similar en la segunda molécula, y las cargas
positivas y negativas temporales de las dos moléculas se atraerán entre sí.
De manera general, los enlaces entre los iones, moléculas de agua y moléculas polares,
continuamente se están formando y rompiendo en el ambiente acuoso de la célula. En este
medio, las moléculas de distintos tipos pueden interactuar entre si mediante atracciones
débiles basadas en las cargas.
REACCIONES QUIMICAS
Algunas reacciones químicas simplemente ocurren en una dirección hasta que los
reactivos se terminan. Estas reacciones se conocen como irreversibles. Sin embargo, otras
reacciones se clasifican como reversibles. Las reacciones reversibles suceden en dirección
hacia adelante y hacia atrás.
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En una reacción reversible, los reactivos se convierten en productos, pero también los
productos se convierten en reactivos. De hecho, tanto la reacción hacia adelante como la
opuesta suceden al mismo tiempo. Este ir y venir continua hasta llegar a un equilibrio relativo
entre reactivos y productos, un estado que se conoce como equilibrio. En él, las reacciones
hacia adelante y hacia atrás siguen sucediendo, pero las concentraciones relativas de los
productos y reactivos dejan de cambiar.
Cada reacción tiene su punto de equilibrio característico, que podemos describir con
un numero llamado constante de equilibrio. Cuando una reacción se clasifica como
reversible, generalmente se escribe con una pareja de flechas hacia adelante y hacia atrás, que
muestran que puede darse en ambos sentidos.
Dado que esta reacción es reversible, si se agregara acido carbónico al sistema, algo de
este se convertiría en iones bicarbonato e hidrogeno para restaurar el equilibrio. De hecho,
este sistema de amortiguamiento juega un papel clave en mantener estable y sano el pH
sanguíneo. 
Por un lado, los enlaces carbono-carbono son inusualmente fuertes, por lo que el
carbono puede formar un esqueleto estable y resistente para una molécula grande. Sin
embargo, tal vez lo más importante es su capacidad de formar enlaces covalentes. Dado que
un átomo de C puede formar enlaces covalentes hasta con otros cuatro átomos, es bastante
adecuado para formar el esqueleto básico de una macromolécula.
La capacidad del carbono para formar enlaces con otros cuatro electrones se debe a su
número y configuración de electrones. El carbono tiene un numero atómico de seis, así que
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los primeros dos electrones llenan la capa interna y los cuatro restantes se quedan en la
segunda capa, que es la capa de valencia (la más externa). Los átomos de carbono pueden
entonces formar enlace con otros cuatro átomos. Por ejemplo, en el metano (CH 4), el carbono
forma enlaces covalentes con cuatro átomos de hidrogeno.
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HIDROCARBUROS
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RAMIFICACION, ENLACES MULTIPLES Y ANILLOS EN LOS HIDROCARBUROS
Las cadenas de hidrocarburos están formadas por una serie de enlaces entre los
átomos de carbono. Estas cadenas pueden ser largas o cortas: por ejemplo, el etano contiene
solo dos carbonos en una fila, mientras que el decano contiene diez. No todos los
hidrocarburos son cadenas lineales. Por ejemplo, mientras que los diez átomos de carbono
del decano están alineados en una fila, otros hidrocarburos con la misma forma molecular
(C10H22) tienen cadenas primarias más cortas con varias ramas laterales.
El etano (C2H6), con un enlace sencillo entre los dos carbonos, adopta la forma de dos
tetraedros (un tetraedro sobre cada carbono). Es importante destacar que la rotación
se produce libremente sobre el enlace carbono-carbono.
En contraste, el eteno (C2H4), con un doble enlace entre los dos carbonos, es más plano
(todos sus átomos se encuentran en el mismo plano). Además, la rotación sobre el
doble enlace carbono-carbono está restringida. Esta es una característica general de los
dobles enlaces carbono-carbono.
Finalmente, el etino, (C2H2), con un triple enlace entre los dos carbonos, es tanto plano
como lineal. La rotación está completamente restringida sobre el triple enlace carbono-
carbono
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excepcionalmente estables. Estos anillos, llamados anillos aromáticos, se encuentran en
algunos aminoácidos, así como en hormonas como la testosterona y los estrógenos.
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ISOMEROS ESTRUCTURALES
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Históricamente, en biología, a los enantiómeros de los aminoácidos (y de otros
compuestos) se les han dado los prefijos L y D, terminología que se sigue utilizando por los
biólogos para nombrar aminoácidos y azúcares.
Por ejemplo, en el 2-buteno (C 4H8), los dos grupos metilo (CH 3) pueden ocupar
diferentes posiciones relativas al enlace covalente doble centran en la molécula. Si los grupos
metilo están del mismo lado del enlace doble, esto se conoce como configuración cis del 2-
buteno; si están en lados opuestos, esto es la configuración trans.
En grasas y aceites, las cadenas largas de carbono, llamadas ácidos grasos, a menudo
contienen dobles enlaces, que pueden estar en la configuración cis o trans. Los ácidos grasos
cis son aceites, mientras que la configuración trans son grasas solidas (a temperatura
ambiente).
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GRUPOS FUNCIONALES
Los grupos funcionales se pueden clasificar como hidrofóbicos e hidrofílicos por sus
características de carga y polaridad. Un ejemplo de un grupo fuertemente hidrófilo es el
grupo carboxilo (COOH), que puede actuar como un ácido y perder un protón para formar un
ion carboxilato cargado negativamente (COO-). Los grupos carboxilo se encuentran
comúnmente en aminoácidos, ácidos grasos y otras biomoléculas.
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La letra R se usa para representar el resto de la molécula a la que está unido un
grupo funcional.
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Agua y pH
Formación de puentes de hidrogeno en el agua
El arreglo más estable es el que los coloca lo más lejos posible uno del otro: un
tetraedro, con los enlaces O – H formando dos de las cuatro “patas”. Los pares solitarios son
ligeramente más repulsivos que los electrones de enlace, por lo que el ángulo entre los
enlaces O – H es un poco menos a los 109º de un tetraedro perfecto, alrededor de 104.5º.
Gracias a su polaridad, las moléculas de agua se atraen entre si con gran facilidad. El
lado positivo de una – un átomo de hidrogeno – se asocia con el lado negativo de otra – un
átomo de oxígeno.
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Las moléculas de agua también son atraídas por otras moléculas polares y por iones.
Una sustancia cargada o polar que interactúa con el agua y se disuelve en ella es conocida
como hidrofílica. En contraste, las moléculas no polares como los aceites y grasas no
interactúan bien con el agua. Estas más bien se apartan de ella en lugar de disolverse, por lo
que se les llama hidrofóbicas.
Un solvente es una sustancia que puede disolver otras moléculas y compuestos, a los
que se les conocen como solutos. Una mezcla homogénea de solvente y soluto se llama
solución. Buena parte de la química de la vida se lleva a cabo en soluciones acuosas, es
decir, soluciones en las que el agua es el solvente.
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COHESIÓN Y ADHESIÓN DEL AGUA
La cohesión se refiere a la atracción que tienen las moléculas por otras de su mismo
tipo, y las moléculas de agua tienen fuerzas cohesivas fuertes gracias a su habilidad para
formar puentes de hidrogeno entre ellas.
Las fuerzas cohesivas son las responsables de la tensión superficial, un fenómeno que
resulta en la tendencia de la superficie de un líquido a resistirse a la ruptura cuando se le
somete a tensión o estrés. Las moléculas de agua en la superficie (liquido) formaran puentes
de hidrogeno con sus vecinas, al igual que las moléculas que se encuentran a mayor
profundidad en el líquido. Sin embargo, como están expuestas al aire por uno de sus lados,
tendrán menos moléculas de agua con las cuales unirse y los enlaces formados entre ellas
serán más fuertes. La tensión superficial hace que el agua forme pequeñas gotas esféricas y le
permite soportar pequeños objetos, como un pedazo de papel o una aguja, si se colocan con
cuidado en su superficie.
El agua tiende a pegarse a sí misma, pero bajo ciertas circunstancias, se adhiere a otros
tipos de moléculas. La adhesión es la atracción de moléculas de un tipo por moléculas de
otro tipo, y para el agua, puede ser bastante fuerte, especialmente cuando las otras moléculas
tienen cargas positivas o negativas.
Por ejemplo, la adhesión permite que el agua “suba” a través de delgados tubos de
vidrio (capilares) colocados en un vaso de agua. Este movimiento ascendente en contra de la
gravedad conocido como capilaridad, depende de la atracción entre las moléculas de agua y
las paredes de vidrio del tubo (adhesión), así como de las interacciones entre las moléculas de
agua (cohesión).
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Ácidos, bases y pH
Una solución acida tiene una alta concentración de iones hidrogeno (H +), mayor que la
del agua pura, mientras que una solución básica tiene una concentración baja de H +, menor
que la del agua pura.
La concentración de H+ deja de ser neutra (7.0) cuando se añade un ácido o una base a
una solución acuosa (basada en agua). Para nuestros propósitos, un ácido es una sustancia
que aumenta la concentración de iones hidrogeno en una solución, usualmente al donar uno
de sus átomos de hidrogeno por disociación. Una base, en cambio, aumenta el pH al aportar
iones hidroxilo o algún otro ion o molécula que recoja los iones hidrogeno y los elimine de la
solución.
LA ESCALA DE PH
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menor a 0 o mayor a 14. Cualquier valor menor a 7.0 es acido y cualquier valor mayor a 7.0 es
básico o alcalino.
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El pH dentro de las células humanas (6.8) y el de la sangre (7.4) son muy cercanos al
neutro, los valores de pH extremos, por arriba o debajo de 7.0, generalmente se consideran
desfavorables para la vida.
SOLUCIONES AMORTIGUADORAS
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Proteínas y Enzimas
Estructura de las proteínas
Las proteínas son una de las moléculas orgánicas más abundantes en los sistemas vivos
y son mucho más diversas en estructura y función que otra clase de macromoléculas. Una sola
célula puede contener miles de proteínas, cada una con una función única. Aunque tanto sus
estructuras como sus funciones varían mucho, todas las proteínas se componen de una o más
cadenas y aminoácidos. Algunos ejemplos de proteínas son:
Las enzimas actúan como catalizadores en las reacciones bioquímicas (es decir,
las aceleran)
Las hormonas son señales químicas de larga distancia liberada por las células
endocrinas que controlan procesos fisiológicos específicos, tales como el
crecimiento, desarrollo, metabolismo y reproducción.
Los aminoácidos son los monómeros que componen las proteínas. Específicamente,
una proteína está compuesta de una o más cadenas lineales de aminoácidos, cada una de las
cuales se denomina polipéptido. Las proteínas contienen 20 tipos de aminoácidos.
Los aminoácidos comparten una estructura básica que consiste en un átomo central de
carbono, también llamado carbono alfa (α), unido a un grupo amino (NH2), un grupo
carboxilo (COOH) y un átomo de hidrogeno.
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Cada aminoácido, también tiene otro átomo o grupo de átomos unidos al átomo
central, conocido como el grupo R, que determina la identidad del aminoácido. Se muestran
los 20 tipos de aminoácidos más comunes, con su grupo R resaltado en azul.
Cada proteína de las células consiste en una o más cadenas polipeptídicas, cada una de
las cuales se compone de aminoácidos, unidos en un orden especifico. Las propiedades
químicas y el orden de los aminoácidos son clave en la determinación de la estructura y
función del polipéptido, y la proteína es parte de eso.
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Los aminoácidos de un polipéptido se unen a sus vecinos mediante un enlace
covalente conocido como enlace peptídico, que se forma en una reacción de síntesis por
deshidratación. Durante la síntesis de proteínas, el grupo carboxilo del aminoácido al final de
la creciente cadena polipeptídica reacciona con el grupo amino de un aminoácido entrante,
liberando una molécula de agua. El enlace resultante es un enlace peptídico.
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La secuencia de una proteína se determina con el ADN del gen que la codifica. Un
cambio en la secuencia del ADN del gen puede modificar la secuencia de aminoácidos de la
proteína. Incluso, cambiar tan solo un aminoácido en la secuencia de una proteína puede
afectar la estructura y la función generales de la misma.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
En una lámina-β, dos o más segmentos de una cadena polipeptídica se alinean uno
junto a otro, formando una estructura laminar que se mantiene unida por puentes de
hidrogeno. Dichos puentes se forman entre los grupos carbonilo y amino del esqueleto,
mientras que los grupos R se extienden por arriba y por debajo del plano de la hoja. Las
cadenas de una lámina β pueden ser paralelas al apuntar en la misma dirección o
antiparalelas al apuntar en direcciones opuestas.
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ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL
Las interacciones del grupo R que contribuyen a la estructura terciaria incluyen puentes
de hidrogeno, enlaces iónicos, interacciones dipolo-dipolo y fuerzas de dispersión de London:
básicamente, conforman toda la gama de enlaces no covalentes. Por ejemplo, los grupos R
con cargas similares se repelen entre sí, mientras que aquellos con cargas opuestas pueden
formar un enlace iónico. Asimismo, los grupos R polares pueden formar puentes de
hidrogeno y otro tipo de interacciones dipolo-dipolo. Las interacciones hidrofóbicas
también son importantes para la estructura terciaria, ya que los aminoácidos con grupos R no
polares hidrofóbicos se agrupan en el interior de la proteína, dejando a los aminoácidos
hidrofílicos en el exterior para interactuar con las moléculas de agua circundantes.
Finalmente, existe un tipo especial de enlace covalente que puede contribuir a la
estructura terciaria: los puentes disulfuro. Estos enlaces covalentes, formados entre los
azufres de cadenas laterales de las cisteínas, son mucho más fuertes que los otros tipos de
enlaces que contribuyen a la estructura terciaria. Actúan como “pasadores de seguridad”
moleculares al mantener todas las partes del polipéptido bien unidas entre sí.
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ESTRUCTURA CUATERNARIA
Muchas proteínas se componen de una cadena polipeptídica única y tienen solo tres
niveles de estructura. Sin embargo, algunas proteínas se componen de carias cadenas
polipeptídicas, también conocidas como subunidades. Cuando estas subunidades se unen,
general la estructura cuaternaria de la proteína. Por ejemplo, la hemoglobina, que transporta
el oxígeno en la sangre, está formada por cuatro subunidades: dos del tipo α y dos del tipo β.
cuaternaria.
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DESNATURALIZACION Y PLEGAMIENTO DE UNA PROTEINA
Muchas proteínas no se pliegan por su mismas, sino que reciben ayuda de proteínas
conocidas como chaperonas (chaperoninas).
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Mecanismo de acción y cinética enzimática
ENERGIA DE ACTIVACION
Para que la reacción se lleve a cabo deben romperse algunos o todos los enlaces
químicos de los reactivos para que puedan formarse los enlaces nuevos de los productos.
Para que los enlaces lleguen a un estado que les permita romperse, la molécula debe
retorcerse (doblarse o deformarse) en un estado inestable denominado estado de transición.
El estado de transición es un estado de alta energía y debe añadirse una cantidad de energía -
la energía de activación- para que la molécula lo alcance. Debido a que el estado de
transición es inestable, las moléculas de reactivo no se quedan ahí mucho tiempo, sino que
proceden al siguiente paso de la reacción química.
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reacción química. Esto se debe a que las moléculas solo pueden completar la reacción una vez
que han alcanzado la cima de la barrera de la energía de activación.
La mayoría de las reacciones que se llevan a cabo en las células son como el ejemplo
de la combustión de hidrocarburos: la energía de activación es demasiado alta para que las
reacciones ocurran de manera significativa a temperatura ambiente. Afortunadamente, es
posible disminuir la energía de activación de una reacción y con ello aumentar su velocidad
de reacción. Este proceso de aceleración de una reacción mediante la disminución de su
energía de activación se conoce como catálisis y el factor que se añade para bajar la energía
se llama catalizador. Los catalizadores biológicos se denominan enzimas.
ENZIMAS Y ENERGIA DE ACTIVACION
Las enzimas, son generalmente proteínas, aunque algunas moléculas de ARN también
actúan como enzimas. Las enzimas realizan la tarea fundamental de disminuir la energía de
activación, es decir, la cantidad de energía que se debe agregar a una reacción para que esta
comience. Las enzimas funcionan al unirse a las moléculas de reactivo y sostenerlas de tal
manera que los procesos que formar y rompen enlaces químicos sucedan más fácilmente.
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En cambio, las enzimas disminuyen la energía del estado de transición, un estado
inestable por el que deben pasar los reactivos para convertirse en productos.
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SITIOS ACTIVOS Y ESPECIFIDAD DEL SUSTRATO
Para catalizar una reacción, una enzima se une a una o más moléculas
de reactivo. Estas moléculas son los sustratos de la enzima. En algunas
reacciones, un sustrato se rompe en varios productos. En otras, dos
sustratos se unen para crear una molécula más grande o para intercambiar
partes.
Dado a que los sitios están finamente ajustados para ayudar a que suceda una reacción
química, pueden ser muy sensibles a los cambios en el ambiente de la enzima. Los factores
que afectan el sitio activo son:
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AJUSTE INDUCIDO
Algunas enzimas aceleran las reacciones químicas al acercar dos sustratos entre si con
la orientación correcta. Otras crean un ambiente dentro del sitio activo que es favorable para
la reacción. El complejo enzima-sustrato también puede reducir la energía de activación al
plegar las moléculas de sustrato de tal manera que se facilita el rompimiento de enlaces, lo
que ayuda a llegar al estado de transición.
Una propiedad característica de las enzimas es que no son alteradas por las reacciones
que catalizan. Cuando una enzima ha terminado de catalizar una reacción, solo libera el
producto (o productos) y queda lista para el siguiente ciclo de catálisis.
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Regulación de la actividad enzimática
Las enzimas pueden ser reguladas por otras moléculas que aumentan o disminuyen su
actividad. Las moléculas que aumentan la actividad de una enzima se conocen como
activadores, mientras que aquellas que disminuyen la actividad de una enzima se llaman
inhibidores.
Un inhibidor puede unirse a una enzima y bloquear la unión del sustrato, por
ejemplo, al pegarse al sitio activo. Esto se conoce como inhibición competitiva
porque el inhibidor “compite” con el sustrato por la enzima. Es decir, solo el
inhibidor o bien, el sustrato, puede estar unido a la enzima en un momento
dado.
En la inhibición no competitiva, el inhibidor no bloquea la unión del sustrato
con el sitio activo, sino que se pega a otro sitio y evita que la enzima haga su
función. Se dice que esta inhibición es “no competitiva” porque el inhibidor y el
sustrato pueden estar unidos a la enzima al mismo tiempo
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Se puede diferenciar entre un inhibidor competitivo y uno no competitivo por la forma
como afectan la actividad de una enzima a diferentes concentraciones del sustrato.
REGULACION ALOSTERICA
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Casi todos los casos de inhibición no competitiva son formas de regulación alostérica.
También hay activadores alostéricos. Algunos de ellos se unen a una enzima en lugares
que no son el sitio activo, y causan un aumento en la función de este. Además, en un proceso
conocido como cooperatividad, el sustrato mismo puede servir como un activador alostérico:
al unirse a un sitio activo, aumenta la actividad de otro sitio activo. Esto se considera
regulación alostérica porque el sustrato afecta los sitios activos que están lejos de su sitio de
unión.
COFACTORES Y COENZIMAS
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A menudo, las enzimas se encuentran en compartimentos, por ejemplo, en un organelo
en particular. La compartimentación significa que las enzimas que son necesarias para
procesos específicos se pueden conservar en lugares donde actúan, lo que asegura que
encuentran listos sus sustratos, no dañan la célula, y tienen el microambiente necesario para
funcionar bien.
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INHIBICION DE VIAS METABOLICAS POR RETROALIMENTACION
En este proceso, el producto final de una vía metabólica activa sobre la enzima clave
que regula el ingreso a esa vía para evitar sobreproducción del producto final.
Cuando hay poca cantidad del producto, la enzima no se inhibirá y la vía correrá todo
vapor para regenerar sus provisiones. Cuando hay demasiado producto acumulado, la enzima
se bloqueará para impedir la producción de producto nuevo hasta que se haya utilizado el
existente.
El ADP, por otro lado, sirve como un regulador alostérico positivo (un activador
alostérico) para algunas de las mismas enzimas que inhibe el ATP. Por ejemplo, el ADP puede
actuar al unirse a una enzima y cambiar su forma para que sea más activa.
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Bioenergética
Función del ATP
El trifosfato de adenina, o el ATP, es una molécula pequeña relativamente simple.
Esta puede ser considerada como la principal moneda energética de las células. La energía
liberada por la hidrolisis (degradación) del ATP se utiliza para impulsar muchas reacciones
celulares que requieren energía.
Los tres fosfatos se denominan: alfa, beta y gamma. El ATP es inestable debido a las
tres cargas negativas adyacentes en su cola fosfato, la cuales no se “quieren” e intentan
alejarse entre ellas. Los enlaces entre los grupos fosfato se llaman enlaces fosfoanhidridos y
puedes encontrar que se conocen como enlaces de alta energía.
HIDROLISIS DEL ATP
Lo que realmente significa que los enlaces fosfoanhidridos sean de alta energía se
refiere a que liberan una cantidad apreciable de energía cuando uno de estos enlaces se
rompe en una reacción de hidrolisis (ruptura mediada por agua).
En la mayoría de los casos, las células utilizan una estrategia denominada acoplamiento
de reacciones, en la que una reacción energéticamente favorable (como la hidrolisis de ATP)
se vincula directamente con una reacción energéticamente desfavorable (endergónica). La
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vinculación suele ocurrir mediante un compuesto intermedio compartido, lo que significa
que el producto de una reacción es “tomado” y utilizado como reactivo en la segunda
reacción.
Cuando dos reacciones se acoplan, estas pueden sumarse para dar una reacción
general y la ΔG de las reacciones individuales. Mientras el ΔG global sea negativo, ambas
reacciones pueden ocurrir. Incluso puede ocurrir una reacción muy endergónica si se acopla a
una muy exergónica.
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Oxidación biológica
En la respiración celular ocurren muchas recciones en las que pasan electrones de una
molécula a otra. Las reacciones en las que ocurren transferencia de electrones se conocen
como reacciones de oxido-reducción o reacciones redox.
Una reacción redox es cuando una molécula pierde electrones y se oxida, mientras que
otra molécula gana electrones (los que perdió la primera molécula) y se reduce.
En esta reacción el átomo de magnesio pierde dos electrones, por lo que se oxida.
Estos dos electrones los toma el cloro, que se reduce.
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3. Ciclo del ácido cítrico: El acetil-Coa obtenido en el paso anterior se combina con una
molécula de cuatro carbonos y atraviesa un ciclo de reacciones para finalmente
regenerar la molécula inicial de cuatro carbonos. En el proceso se genera ATP, NADH y
FADH y se libera CO2
4. Fosforilación oxidativa: El NADH y el FADH producido en pasos anteriores depositan
sus electrones en la cadena de transporte de electrones y regresan a sus formas
“vacías”. El movimiento de los electrones por la cadena libera energía que se utiliza
para bombardear protones fuera de la matriz, a través de una enzima llama ATP
sintasa, para generar ATP. Al final de la cadena de trasporte de electrones, el oxígeno
recibe los electrones y recoge protones del medio para formar agua.
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Fosforilación oxidativa y cadena respiratoria
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La cadena transportadora de electrones es una serie de proteínas y moléculas
orgánicas que se encuentran en la membrana interior de la mitocondria. Los electrones pasan
de un miembro de la cadena de transporte al siguiente en una serie de reacciones redox. La
energía liberada en estas reacciones se captura como un gradiente de protones, el cual se
utiliza a su vez para formar ATP en un proceso llamado quimiosmosis. En conjunto forman la
fosforilación oxidativa y sus pasos incluyen:
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ávidas. En estas transferencias de electrones “cuesta abajo” se libera energía y varios de los
complejos de proteína utilizan la energía liberada para bombardear protones desde la matriz
mitocondrial al espacio de intermembrana para formar un gradiente de protones.
El FADH2 no es tan bueno para donar electrones como el NADH, por lo que no
puede transferir sus electrones hacia el complejo I. en su lugar, introduce los
electrones a la cadena de transporte a través del complejo II, el cual no bombea
protones a través de la membrana.
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En la membrana interna de la mitocondria, los iones de H solamente cuentan con un
canal disponible: una proteína transmembranal conocida como ATP sintasa, están en vez de
activarse con agua, se activa con el flujo de iones de H que se desplazan por su gradiente
electroquímico. Este flujo causa que la ATP sintasa gire y catalice la adición de un fosfato a
ADP, con lo que captura la energía del gradiente de protones en forma de ATP.
El proceso en el que la energía del gradiente de protones se utiliza para generar ATP se
llama quimiosmosis. De manera más general, la quimiosmosis se puede referir a cualquier
proceso en el que la energía almacenada en un gradiente de protones se utiliza para hacer un
trabajo.
RENDIMIENTO DEL ATP
En la glucólisis se generan dos moléculas netas de ATP y en el ciclo del ácido cítrico,
otras dos moléculas de ATP (o GTP, que es equivalente desde el punto de vista energético).
46
Fuera de estos cuatro, el resto de las moléculas de ATP se generan en la fosforilación
oxidativa. Según los indicios obtenidos luego de un arduo trabajo experimental, se necesita
que fluyan cuatro iones de H hacia la matriz a través de la ATP sintasa para producir la síntesis
de una molécula de ATP. Cuando los electrones del NADH se mueven a través de la cadena
de transporte se bombean 10 iones de H desde la matriz hacia el espacio intermembrana, por
lo que cada NADH resulta en 2.5 moléculas de ATP, aproximadamente. Los electrones del
FADH2 que se incorporan a la cadena en una etapa posterior, impulsan el bombeo de solo 6
H, lo que lleva a la producción de casi 1.5 ATP
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Metabolismo de los carbohidratos
Carbohidratos de importancia fisiológica
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Los epímeros son resultado de isómeros con variaciones en la configuración –OH y –H
en los átomos de carbono, un ejemplo es la galactosa.
Los disacáridos son azucares compuestos de dos monosacáridos residuales unidos por
un enlace glucosídico. Los disacáridos fisiológicamente importantes son la maltosa, sacarosa y
la lactosa. La hidrolisis de la sacarosa produce una mezcla de glucosa y fructuosa llama azúcar
invertido porque la fructuosa es fuertemente levorrotatoria y cambia la acción
dextrorrotatoria más débil de la sacarosa.
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Ciclo del ácido cítrico
El ciclo del ácido cítrico es la vía final para la oxidación de carbohidratos, lípidos y
proteínas. Su metabolito final común, la Acetil-CoA, reacciona con el oxalacetato para formar
el citrato. Mediante una serie de deshidrogenaciones y descarboxilaciones, el citrato se
degrada, reduciendo las coenzimas, liberando dos CO 2 y regenerando el oxalacetato.
Como resultado de las oxidaciones catalizadas por las deshidrogenasas del ciclo del
ácido cítrico, se producen tres moléculas de NADH y una de FADH 2, por cada molécula de
Acetil-CoA catabolizada en cada ciclo. Estos equivalentes reductores se transfieren a la cadena
respiratoria, donde la reoxidación de cada NADH da como resultado la formación de 2.5 ATP,
de FADH2, y de 1.5 ATP. Además, 1 ATP se forma por la fosforilación a nivel de sustrato,
catalizado por el succinato tiocinasa.
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VITAMINAS INVOLUCRADAS EN EL ACIDO CITRICO
Cuatro de las vitaminas B son esenciales en el ciclo del ácido cítrico y, por tanto, en el
metabolismo:
El ciclo del ácido cítrico no es solo una vía para la oxidación de dos unidades de
carbono, también es la vía principal para la interconversión de metabolitos derivado de la
transaminación y desaminación de aminoácidos, y proporciona los sustratos para la síntesis
de aminoácidos por transaminación, así como para la gluconeogénesis y la síntesis de
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ácidos grasos. Debido a que funciona tanto en procesos oxidativos como de síntesis, es
anfibólico.
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El lactato es el producto final de la glucolisis en condiciones anaerobias y en
los eritrocitos, donde no existen mitocondrias que permitan una mayor
oxidación del piruvato.
LA GLUCOLISIS ESTA REGULADA POR TRES ENZIMAS
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Los iones mercúrico y arsenito reaccionan con los grupos –SH del ácido lipoico e
inhiben la piruvato deshidrogenasa, al igual que la deficiencia de tiamina en la dieta, lo que
permite la acumulación de piruvato.
Las condiciones que implican una afección del metabolismo del piruvato con
frecuencia conducen a acidosis láctica.
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Metabolismo de glucógeno
El glucógeno representa el principal carbohidrato de almacenamiento en el cuerpo,
principalmente en el hígado y el musculo. En el hígado, su función principal es proporcionar
glucosa para los tejidos extrahepáticos. En el musculo, sirve principalmente como una fuente
de combustible metabólico para su uso en el musculo. El musculo carece de la enzima
glucosa-6-fosfatasa y no puede liberar glucosa libre de glucógeno.
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REGULACION POR AMP CICLICO
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Gluconeogénesis y control de la glucosa en sangre
La gluconeogénesis es el proceso de síntesis de glucosa o glucógeno a partir de
precursores que no son carbohidratos. Es de particular importancia cuando los carbohidratos
no están disponibles en la dieta. Los sustratos principales son aminoácidos, lactato, glicerol y
propionato.
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LA GLUCOLISIS Y GLUCONEOGENESIS TIENEN LA MISMA VIA, PERO DIRECCION
OPUESTA
La hexocinasa tiene una Km baja para la glucosa, y en el hígado está saturada y actúa a
una velocidad constante bajo todas las condiciones normales. Por tanto, actúa para garantizar
una tasa adecuada de glucolisis para satisfacer necesidades del hígado. La glucocinasa es una
enzima alostérica con una Km aparente considerablemente mayor para la glucosa, por lo que
su actividad aumenta con el incremento de la concentración de glucosa en la vena porta
hepática.
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Vía de la pentosa fosfato
LAS REACCIONES DE LA VIA DE LA PENTOSA FOSFATO OCURREN EN EL CITOSOL
La vía de la pentosa fosfato es una vía más compleja que la glucolisis. Tres moléculas
de glucosa-6-fosfato dan lugar a tres moléculas de CO 2 y tres azucares de cinco carbonos. La
vía de la pentosa fosfato, presente en el citosol, puede explicar la oxidación completa de la
glucosa, produciendo, el NADPH y el CO2, pero sin el ATP.
La vía tiene una fase oxidativa, que es irreversible y genera el NADPH, y una fase no
oxidativa que es reversible y proporciona precursores de ribosa para la síntesis de
nucleótidos. La vía completa está presente principalmente en aquellos tejidos que tienen un
requisito del NADPH para la síntesis reductiva, por ejemplo, la lipogénesis o la
esteroidogenesis, mientras que la fase no oxidativa está presente en todas las células que
requieren ribosa.
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LA VIA DE LA PENTOSA FOSFATO PROTEGEN A LOS ERITROCITOS
CONTRA LA HEMOLISIS
Las dietas ricas en sacarosa o en los jarabes ricos en fructuosa utilizados en alimentos y
bebidas manufacturadas conducen a grandes cantidades de fructosa que entran en la vena
porta hepática.
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Metabolismo de los lípidos
Lípidos de importancia fisiológica
Los lípidos tienen la propiedad común de ser relativamente insolubles en agua
(hidrófobos) pero solubles en disolventes no polares. Los lípidos anfipáticos también
contienen uno o más grupos polares, por lo que son adecuados como constituyentes de las
membranas en las interfaces lípido-agua.
Los lípidos simples incluyen as grasas y las ceras, que son esteres de ácidos grasos con
varios alcoholes: grasas, esteres de ácidos grasos con glicerol, los aceites son grasas en
estado líquido; ceras, esteres de ácidos grasos con alcoholes monohídricos de mayor peso
molecular.
Los lípidos complejos son esteres de ácidos grasos, que siempre contienen un alcohol,
y uno o más ácidos grasos, pero que también tienen otros grupos, se pueden dividir en tres
grupos: fosfolípidos, contienen un residuo de ácido fosfórico, a menudo tienen bases que
contienen nitrógeno y otros sustituyentes; glucolípidos, contienen un ácido graso,
esfingosina y carbohidratos; otros lípidos complejos, estos incluyen lípidos tales como los
sulfolipidos y los aminolípidos, además de las lipoproteínas.
LOS ACIDOS GRASOS SON ACIDOS CARBOXILICOS ALIFATICOS
61
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LOS GLUCOLIPIDOS SON IMPORTANTES EN TEJIDO NERVIOSO Y MEMBRANA CELULAR
El colesterol está ampliamente distribuido en todas las células del cuerpo, pero sobre
todo en el tejido nervioso. Es un componente principal de la membrana plasmática y de las
lipoproteínas plasmáticas. A menudo se encuentra como éster de colesterilo donde el grupo
hidroxilo en la posición 3 esta esterificado con una larga cadena de ácidos grasos.
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Beta oxidación y cetogénesis
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Varias enzimas, conocidas colectivamente como
“ácidos grasos oxidasas”, se encuentran en la matriz
mitocondrial o en la membrana interna adyacente a la
cadena respiratoria. Estos catalizan la oxidación de
acil-CoA a acetil-CoA a través de la vía de β-oxidación.
El sistema procede de forma cíclico, lo que da como
resultado a la degradación de ácidos grasos largos a
acetil-CoA.
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LA CETOGENESIS OCURRE CUANDO HAY UNA ALTA TASA DE OXIDACION DE LIPIDOS
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acetil-CoA producidas a través de la descomposición de los ácidos grasos se condensan para
formar acetoacetil-CoA mediante una inversión de la reacción de tiolasa.
ASPECTOS CLINICOS
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Transporte y almacenamiento de lípidos
Como los lípidos no polares son insolubles en agua, se combinan con lípidos
anfipáticos y proteínas para formar lipoproteínas miscibles en agua para el transporte entre
los tejidos en el plasma y el sanguíneo acuoso.
LOS LIPIDOS SE TRANSPORTAN EN PLASMA COMO LIPOPROTEINAS
Dado que la grasa es menos densa que el agua, la densidad de una lipoproteína
disminuye a medida que aumenta la proporción de lípido a proteína. Se ha n identificado
cuatro principales grupos de lipoproteínas que son importantes desde el punto de vista
fisiológico:
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EL TRIACILGLICEROL SE TRANSPORTA EN QUILOMICRONES
Por definición, los quilomicrones se encuentran en el quilo formado solo por el sistema
linfático que drena en el intestino. Son responsables del transporte de todos los lípidos de la
dieta a la circulación. Son vehículos de transporte de triacilglicerol desde el hígado a los
tejidos extrahepáticos.
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La termogenina actúa como ruta de conductancia de protones que disipa el potencial
electroquímico a través de la membrana mitocondrial.
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Síntesis, transporte y excreción del colesterol
El colesterol es el precursor de todos los otros esteroides en el cuerpo, por ejemplo, los
corticoesteroides, hormonas sexuales, ácidos biliares y la vitamina D. También juega un papel
estructural importante en las membranas y en la capa externa de las lipoproteínas.
EL COLESTEROL ES BIOSINTETIZADO A PARTIR DE ACETIL-COA
Un poco mas de la mitad del colesterol del cuerpo surge por síntesis (alrededor de
700mg/día), y el resto lo proporciona la dieta promedio. Prácticamente todos los tejidos que
contienen células nucleadas son capaces de sintetizar el colesterol, que se produce en el
retículo endoplasmático y en los compartimentos citosólicos.
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EL COLESTEROL SE TRANSPORTA ENTRE TEJIDOS EN LIPOPROTEÍNAS DEL PLASMA
De 80 a 90% del colesterol absorbido se esterifica con ácidos grasos de cadena larga
en la mucosa intestinal. Del colesterol de quilomicrón, 95% se lleva al hígado en remanentes
de quilomicrón, y la mayor parte del colesterol secretado por el hígado en lipoproteína de
muy baja densidad (VLDL) se retiene durante la formación de lipoproteínas de densidad
intermedia (IDL), y por último de LDL, que es captada por el receptor de LDL en el hígado y
los tejidos extrahepáticos.
El exceso de colesterol se excreta del hígado a través de la bilis como colesterol o sales
biliares. Una gran proporción de las sales biliares es absorbida en la circulación portal y
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devuelta al hígado como parte de la circulación enterohepática. El coprostanol es el principal
esterol en las heces; es sintetizado por las bacterias en la parte baja del intestino a partir del
colesterol.
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Metabolismo de proteínas y aminoácidos
Biosíntesis de aminoácidos no esenciales
Todos los vertebrados pueden formar ciertos aminoácidos a partir de compuestos
intermedios anfibólicos o de otros aminoácidos de la dieta. Los compuestos intermedios y los
aminoácidos a los que dan lugar son: α-cetoglutarato, oxalacetato y 3-fosfoglicerato.
BIOSINTESIS DE AMINOACIDOS NO ESENCIALES
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Catabolismo de proteínas y del nitrógeno de aminoácidos
Los seres humanos degradan de 1% a 2% de su proteína corporal al día, a velocidades
que varían ampliamente entre las proteínas y con el estado fisiológico. Las enzimas
reguladoras clave a menudo tienen vidas medias cortas.
LAS PROTEASAS Y PEPTIDASAS DEGRADAN LAS PROTEINAS HACIA AMINOACIDOS
Las vidas medias de las proteínas hepáticas oscilan entre menos de 30 minutos y
más de 150 horas
Las proteasas intracelulares hidrolizan los enlaces peptídicos internos. Los péptidos
resultantes son luego degradados a aminoácidos por endopeptidasas que hidrolizan enlaces
peptídicos internos, y por aminopeptidasas y carbopeptidasas que eliminan aminoácidos en
sucesión de los extremos amino y carboxilo, respectivamente.
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La posterior degradación de las proteínas marcadas con ubiquitina tiene lugar en el
proteasoma. El proteasoma consiste en un complejo macromolecular cilíndrico de proteínas,
cuyos anillos apilados forman un poro central que alberga los sitios activos de las enzimas
proteolíticas.
BIOSINTESIS DE LA UREA
la urea.
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La transferencia de nitrógeno amino a α-cetoglutarato forma el L-glutamato. La
L-glutamato deshidrogenasa hepática, que puede usar NAD o NADP, libera
La síntesis de 1 mol de urea requiere 3 mol de ATP, 1 mol de ion amonio y aspartato, y
emplea cinco enzimas. De los seis aminoácidos participantes, el N-acetilglutamato funciona
únicamente como activador enzimático. Los otros sirven como portadores de los átomos que
finalmente se convierten en urea.
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Catabolismo de los esqueletos de carbono de los aminoácidos
El exceso de aminoácidos se cataboliza a intermediarios anfibólicos, que sirven como
fuente de energía o para la biosíntesis de carbohidratos y lípidos.
EL CATABOLISMO DE LOS AMINOACIDOS INICIA CON LA TRANSAMINACION
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Ningún nitrógeno de lisina participa en la transaminación. Sin embargo, se logra
el mismo efecto neto por la formación intermedia de sacaropina.
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Temas especiales
Micronutrientes: vitaminas y minerales
Las vitaminas son nutrientes orgánicos con funciones metabólicas esenciales que se
requieren en pequeñas cantidades en la dieta porque no pueden ser sintetizados por el
cuerpo.
Los elementos minerales inorgánicos que tienen una función en el cuerpo se deben
proporcionar en la dieta. Cuando la ingesta es insuficiente, pueden aparecer signos de
deficiencia, por ejemplo, la anemia (hierro) y el cretinismo y el bocio (yodo).
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VITAMINAS SOLUBLES EN LIPIDOS
La vitamina K funciona actuando como cofactor de una carboxilasa que actúa sobre
los residuos de glutamato de las proteínas precursoras de los factores de coagulación.
También es importante en la síntesis de proteínas óseas y otras proteínas de unión al calcio.
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VITAMINAS SOLUBLES EN AGUA
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MINERALES CON FUNCIONES FISIOLOGICAS Y BIOQUIMICAS
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Radicales libres y nutrientes antioxidantes
Los radicales libres son especies moleculares altamente reactivas con un electrón
desapareado. Pueden reaccionar y modificar proteínas, ácidos nucleicos y ácidos grasos en las
membranas celulares y las lipoproteínas plasmáticas.
El daño radical a los lípidos y las proteínas en las lipoproteínas plasmáticas es un factor
en el desarrollo de la aterosclerosis y la enfermedad arterial coronaria; el daño radical a los
ácidos nucleicos puede inducir mutaciones hereditarias y el cáncer; el daño radical a las
proteínas puede conducir al desarrollo de enfermedades autoinmunes.
El daño radical a los ácidos grasos insaturados en las membranas celulares y las
lipoproteínas conduce a la formación de peróxidos lipídicos, luego forman dialdehídos
altamente reactivos que pueden modificar de forma química a las proteínas y a las bases de
ácidos nucleicos. Las proteínas también están sujetas a la modificación química directa por
interacción con los radicales.
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FUENTES DE RADICALES DE OXIGENO EN EL CUERPO
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MECANISMOS DE PROTECCION CONTRA DAÑO DE RADICALES
La protección contra el daño de los radicales se produce por enzimas que eliminan los
iones superóxido y el peróxido de hidrogeno, la reducción enzimática de peróxidos lipídicos
unidos a la oxidación del glutatión, la reacción no enzimática de peróxidos lipídicos con la
vitamina E, y la reacción de radicales con compuestos como vitamina C y E, caroteno,
ubiquinona, ácido úrico y polifenoles dietéticos que forman radicales relativamente estables y
persisten el tiempo suficiente para experimentar reacción a productos no radicales.
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