Guia de Estudio - Compartimientos
Guia de Estudio - Compartimientos
Guia de Estudio - Compartimientos
Part of the secret of life is the immense internal surface of the cell.
Ch. S. Sherrington (1857 – 1952)
1. OBJETIVOS.
Conocer y utilizar el lenguaje adecuado propio de la disciplina para definir, describir y analizar
la organización estructural de los compartimientos intracelulares, la arquitectura molecular de
sus constituyentes y los mecanismos moleculares básicos de su fisiología.
Conocer, explicar y fundamentar los principios básicos de las principales técnicas de análisis
estructural y molecular utilizadas en BCM y conocer su importancia y aplicaciones.
Comprender y describir las relaciones dinámicas que existen entre los distintos compartimientos
intracelulares limitados por membrana y sus consecuencias en la fisiología celular.
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2. TEMAS A ESTUDIAR
Compartimientos intracelulares.
Retículo endoplásmico. Ribosomas.
Complejo de Golgi.
Lisosomas.
Endosomas.
Fagosomas.
Secreción.
Endocitosis y fagocitosis.
Autofagia.
Mecanismos moleculares y regulación del transporte intracelular mediado por vesículas.
Flujo de membranas y tráfico de materiales en la célula.
Bibliografía:
Biología Celular y Molecular. Lodish H., Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M,
Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. 6a. Edición. Editorial Panamericana (y ediciones
anteriores).
La Célula. G. Cooper, 5a. Ed., Marbán.
Molecular Biology of the Cell. Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y
Walter P. 5th Edition, 2006. Garland Publishers (y ediciones anteriores).
3. GUÍA INTRODUCTORIA.
3.1 SINOPSIS
Retículo endoplásmico.
retículo endoplásmico (RE), RE liso, RE rugoso, vesículas secretorias, vía secretora
El retículo endoplásmico es la primera encrucijada en la clasificación de proteínas en la
vía biosintética. En las células de mamífero, las proteínas destinadas a lisosomas,
membrana plasmática y la secreción son sintetizadas en ribosomas adheridos a las
membranas del retículo endoplásmico rugoso y se transfieren a este organelo mientras
están siendo traducidas (en forma co-traduccional).
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Secuencia señal
secuencia señal, microsomas, partícula de reconocimiento de señal, peptidasa de señal
Las proteínas pueden ser transferidas al RE mientras están siendo traducidas o luego de
finalizada su traducción. En los mamíferos son transferidas mientras se traducen. Los
ribosomas que portan las secuencias polipeptídicas nacientes se adhieren a las
membranas del retículo endoplásmico por el reconocimiento de una secuencia en el
extremo N terminal de la proteína que está siendo sintetizada.
Las proteínas integrales de membrana o del RE, del aparato de Golgi y los lisosomas se
insertan en la membrana del RE al inicio de su síntesis. En lugar de ser translocadas a la
luz del RE están proteínas se anclan a la membrana y permanecen como proteínas
integrales.
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Retículo endoplásmico liso
flippasa, biosíntesis de lípidos
Glicosilación de proteinas
M6P, proteínas lisosomales, N- y O-glicosilación
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Distribución de proteínas
secreción constitutiva, secreción regulada, compartimiento endolisosomal
Desde la cara trans del Golgi brotan vesículas de transporte que transfieren proteínas al
espacio extracelular por los procesos de secreción constitutiva y regulada.
Lisosomas
hidrolasas ácidas, lisosomas
Los lisosomas contienen una serie de hidrolasas que degradan proteínas, ácidos
nucleicos, polisacáridos y lípidos y que funcionan de modo óptimo al pH ácido
intralisosomal.
Endocitosis
endosoma temprano, cuerpo multivesicular, endosoma tardío, lisosoma, cuerpo
residual
Las moléculas extracelulares captadas son transportadas a los endosomas, que dan lugar
a lisosomas al incorporar hidrolasas provenientes del aparato de Golgi
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Fagocitosis, autofagia.
fagocitosis, fagosoma, autofagia, autofagosoma
Todas las proteínas (excepto las pocas sintetizadas en las mitocondrias) comienzan su
síntesis en el citosol. Para alcanzar su destino final en la célula deben moverse y fluir a
través de distintos compartimientos. Este destino depende de su propia secuencia
aminoacídica, la cual pueden contener señales de clasificación que la dirigen fuera del
citosol. Muchas proteínas carecen de señales de clasificación, y consecuentemente
permanecen como residentes permanentes en el citosol. Muchas otras sin embargo
poseen señales de clasificación que dirigen su transporte desde el citosol hacia el
núcleo, el retículo endoplásmico, mitocondrias o peroxisomas. El tránsito desde el
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retículo endoplásmico hacia otros compartimientos es dirigido por otras señales de
clasificación. Para entender los principios generales de las señales de clasificación es
importante distinguir tres vías distintas por las cuales las proteínas pueden moverse
entre compartimientos (Fig 3.2.1).
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(1) Transporte controlado a través de los complejos de poros nucleares. El tráfico de
proteínas ocurre entre espacios equivalentes desde el punto de vista topológico (citosol
y núcleo), los cuales se encuentran en continuidad a través de los poros nucleares. El
complejo de poro funciona como una compuerta selectiva que transporta
macromoléculas y ensamblados macromoleculares en forma activa. También permiten
la difusión libre de moléculas más pequeñas.
Una conclusión que puede extraerse de este concepto sobre las proteínas de la superficie
celular es que dado que las luces del retículo endoplásmico y el aparato de Golgi son
equivalentes desde el punto de vista topológico al exterior celular, las porciones de la
cadena polipeptídica expuestas a la luz del retículo endoplásmico estarán expuestas al
exterior celular luego de finalizado su transporte intracelular.
Además del retículo endoplásmico rugoso, las células contienen túbulos ramificados y
anastomosados desprovistos de ribosomas que forman redes densas. Los elementos
tubulares de este retículo endoplásmico liso son continuos en muchos sitios con las
cisternas del retículo endoplásmico rugoso. El retículo endoplásmico es por lo tanto un
sistema continuo de túbulos y cisternas limitados por membrana, el cual en algunas
regiones tiene ribosomas asociados y participa en la síntesis y transporte de proteínas,
mientras otras regiones, desprovistas de ribosomas, se especializan en las otras
funciones ya mencionadas relacionadas con el metaboliso lipídico y glucídico.
Las cisternas son más abundantes en las células que sintetizan grandes cantidades de
proteína de exportación como producto de secreción. Pueden en general disponerse en
pilas paralelas de 2 a 4 µm de largo, o cuando son muy largas pueden formar extensos
sistemas concéntricos. La luz de las cisternas suele ser estrecha, aunque en los
márgenes donde se continúan con elementos tubulares del retículo la luz se amplía
ligeramente.
Figura 3.3. Retículo endoplásmico rugoso (dibujo modificado del clásico original
publicado en The Cell, 2nd ed. D.W. Fawcett, Saunders, PA, 1981) .
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Las neuronas, observadas con microscopio óptico y coloreadas con anilinas básicas se
caracterizan por la presencia de grandes bloques angulares de material basófilo en su
citoplasma, denominados cuerpos o grumos de Nissl. Cuando son analizados con el
microscopio electrónico, se observa que están formados por una disposición ordenada
de cisternas de retículo endoplásmico. A diferencia de las pilas de cisternas observadas
en células epiteliales, las cisternas son fenestradas y están separadas por intervalos de
0,2 a 0,5 µm, en los cuales se observa una gran cantidad de poliribosomas libres.
Además se observan numerosos poliribosomas adheridos a las membranas cisternales.
Los grumos de Nissl de las neuronas difieren del ergastoplasma de las células
glandulares en la separación mayor de las cisternas paralelas y en la gran cantidad de
poliribosomas libres asociados. Mientras que ambos son centros de activa síntesis
proteica, las diferencias en la arquitectura del retículo está indudablemente relacionada
con el destino distinto de las proteínas sintetizadas. En las células glandulares, la
síntesis proteica se asocia fundamentalmente con la secreción, y la mayoría de los
ribosomas se asocian a la membrana del retículo endoplásmico rugoso. En las
neuronas, una gran parte de las proteínas sintetizadas se destinan a la utilización en el
mantenimiento y renovación de los componentes del citoplasma, incluyendo la
membrana plasmática y el pericarion, las dendritas y el usualmente largo axón. Rara vez
puede observarse contenido en la luz del retículo endolásmico.
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3.5 MICROSOMAS
3.6.1 Organización
A causa de su complejidad estructural y su naturaleza altamente dinámica, los
mecanismos que regulan el tráfico de materiales y membranas a través del complejo de
Golgi todavía no han sido totalmente comprendidos. En la vía secretoria este organelo
asegura las modificaciones post-traduccionales de las proteínas de carga por distintas
enzimas de procesamiento que actúan en determinada secuencia. Por lo tanto debe
coordinar el movimiento de la carga en un sentido junto con la disponibilidad de una
línea secuencial de enzimas de procesamiento que actúan modificando la carga a
medida que se desplaza. La mayoría de los procesos de transferencia de materiales
ocurren mediante el brotamiento de vesículas pequeñas desde un compartimiento dador,
seguido por la selección y posterior fusión con un compartimiento aceptor de la carga.
Sin embargo, los mecanismos de transporte vesicular en el complejo de Golgi aún son
objeto de debate. Un concepto importante que ilustra la complejidad del proceso es que
mientras un flujo incesante y a veces masivo de materiales pasa a través del aparato de
Golgi, y tienen lugar las transformaciones de dichos materiales, el aparato de Golgi
mismo debe mantener su integridad como organelo. El concepto de auto-organización
permite formular modelos para comprender los mecanismos que regulan el tráfico de
membranas en este organelo.
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BOX:
[Existen tres mecanismos básicos por los cuales se pueden formar las
estructuras celulares: (i) utilización de un molde previo, el cual es tomado como
modelo de estructura (por ejemplo la doble hélice de ADN); (ii) el auto-
ensamblado, en el que la interacción de las partes componentes de una
estructura lleva a su formación, de modo que el producto final es estable y se
encuentra en equilibrio una vez formado (por ejemplo cápsides virales); (iii)
auto-organización, similar a la anterior pero el producto final no se encuentra
en equilibrio sino que requiere de un aporte constante de energía para
mantenerse ensamblado (el complejo de Golgi y los microtúbulos son buenos
ejemplos de auto-organización)].
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desde el retículo endoplásmico hasta el primer compartimiento del Golgi y es mediado
por vesículas con cubierta COP II. Este modelo no se aplica con la misma simplicidad a
los intercambios de materiales entre distintos compartimientos del Golgi.
Si bien este último modelo es el más completo y el que permite explicar la mayoría de
las evidencias experimentales, este tema aún es objeto de intensa investigación y no se
considera totalmente aclarado.
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Figura 3-6-2 Mecanismos de transporte de materiales en el aparato de Golgi
(esquema adaptado y modificado de Jackson, CL., 2009 J Cell Science, 122:443).
(A) Transporte vesicular. Las vesículas con las proteínas de carga brotan de un
compartimiento dador y se fusionan con el compartimiento siguiente. El transporte
retrógrado vuelve los componentes residentes del Golgi a sus compartimientos
específicos. (B) Maduración cisternal. Las vesículas de transporte retrógrado brotan
desde u compartimiento dador (tardío, trans) hacia un compartimiento aceptor (más
temprano, cis) llevando enzimas de procesamiento residentes del Golgi. La carga
progresa como resultado de la maduración de un compartimiento en otro más maduro,
a la vez que las cisternas se desplazan en dirección trans. (C) Tabicamiento rápido. La
carga, y las enzimas de glicosilación son transportadas al Golgi desde el retículo
endoplásmico en vesículas de transporte. Una vez en el Golgi la carga puede moverse
por transporte vesicular en forma bidireccional, tanto cis a trans como trans a cis. Las
enzimas residentes del Golgi y la carga se clasifican por su asociación preferencial con
distintos entornos lipídicos.
Los lisosomas son organelos citoplásmicos rodeados por membrana que actúan como el
principal compartimiento de degradación en las células eucariotas. Las macromoléculas
endógenas y exógenas pueden ser conducidas a los lisosomas a través de las vías
biosintética y endocítica respectivamente. Además, los lisosomas pueden degradar
proteínas citosólicas, que son transportadas a través de la membrana lisosomal por
carrier específicos.
3.8 ENDOCITOSIS
El endosoma recién constituído pasa a formar parte de una red de túbulos y vesículas
conocida como compartimiento endosómico temprano (o externo, o periférico). El
endosoma temprano es el principal compartimiento de clasificación de la vía endocítica.
Muchos ligandos que han sido endocitados por unión a receptores se disocian de sus
receptores en el endosoma temprando a causa de la acidez de su luz (pH de 6,2) y
muchos de estos receptores son reciclados a la superficie celular.
Desde los endosomas tempranos se emiten vesículas esféricas, algunas con vesículas
más pequeñas en su interior (cuerpos multivesiculares). Estas vesículas se fusionan con
el compartimiento endosómico tardío (o interno, o perinuclear). Este compartimiento
posee un pH de 5,5 y su membrana posee receptores para M6P mediante el cual se fijan
las enzimas lisosomales presentes en este compartimiento. A partir de los endosomas
tardíos se originan los lisosomas (antes denominados lisosomas secundarios),
caracterizados por un pH más ácido (4,6 - 5,0) y la ausencia de receptores para M6P,
por lo que las enzimas lisosomales se encuentran libres en su luz. Por otra parte, la
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actividad fosfatasa lisosomal suele remover los grupos M6P por lo que las enzimas
quedan “atrapadas” en este compartimiento.
Las enzimas lisosomales son sintetizadas en el aparato de Golgi y emigran desde la cara
trans del organelo en pequeñas vesículas de 0,2 - 0,5 µm (antes llamadas lisosomas
primarios). Estas vesículas se unen al compartimiento endosomal tardío (en ocasiones a
los cuerpos multivesiculares), y los receptores de M6P son reciclados al complejo de
Golgi o a la superficie celular.
Los lisosomas no sólo degradan sustancias provenientes del exterior celular, sino que
también pueden digerir organelos y porciones del citoplasma de la propia célula en
vesículas grandes denominadas autofagosomas (autolisosomas, citolisosomas) que se
forman con membranas provenientes probablemente del retículo endoplásmico.
22
3.9 TRANSPORTE INTRACELULAR MEDIADO POR VESÍCULAS.
El transporte mediado por vesículas permite transportar proteínas entre compartimientos
equivalentes desde el punto de vista topológico.
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3.10 VISIÓN GENERAL DEL FLUJO DE MATERIALES EN LOS
COMPARTIMIENTOS INTRACELULARES.
Fig 3.10
1. Las proteínas con una secuencia de importación al retículo endoplásmico (como la
proteínas secretoria de la figura) son sintetizadas hacia la luz del organelo (o pueden
permanecer formando parte de la membrana del RE y ser posteriormente transportadas a
otro compartimiento o a la superficie celular).
2. Las proteínas secretorias son transportadas hacia la cara cis del aparato de Golgi por
vesículas de transporte que brotan del RE revestidas por una cubierta de proteínas COP
II. En esas vesículas viajan proteínas solubles que deben ser secretadas, proteínas de
membrana que se dirigen a otros compartimientos de esta vía, receptores de proteínas
solubles y también proteínas que entran a la vesícula de transporte por error.
3. Las proteínas residentes del RE que han sido transportadas por error al aparato de
Golgi retornan al RE por vesículas de transporte retrógrado que brotan del aparato de
Golgi con cubierta COP I. Estas proteínas poseen la secuencia KDEL distintiva de los
componentes residentes del RE. El receptor de KDEL reconoce la secuencia en el
aparato de Golgi y fija estas proteínas, permitiendo su retorno al RE. La fina
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sensibilidad del receptor KDEL al pH permite que las pequeñas diferencias de pH entre
el aparato de Golgi y el RE expliquen que el receptor fije la proteína en el Golgi y la
libere en el RE.
4. Las cisternas del aparato de Golgi se desplazan físicamente hacia la cara trans del
organelo mediante un proceso denominado maduración cisternal. A medida que las
cisternas se desplazan su contenido va siendo procesado enzimáticamente.
5. Vesículas de transporte retrógrado con cubierta COP I brotan desde los
compartimientos del Golgi hacia otros compartimientos más tempranos permitiendo el
retorno de las enzimas características de ese sector del organelo. Ello permite el trabajo
secuencial de las enzimas y el mantenimiento de la identidad de cada sector.
6. En todas las células brotan vesículas de la cara trans del aparato de Golgi hacia la
superficie celular. Ello permite liberar proteínas al espacio extracelular e incorporar en
la membrana plasmática nuevas proteínas de membrana. El fenómeno se produce en
forma espontánea, por lo cual se denomina secreción constitutiva.
7. En algunos tipos celulares, se sintetizan productos de secreción que son almacenados
en vesículas de transporte en el citoplasma (vesículas secretorias o gránulos secretorios).
Esas vesículas podrán fusionarse con la membrana plasmática luego de la llegada de
una señal apropiada a la célula (hormona, neurotransmisor). El proceso se denomina
secreción regulada.
8. Desde el trans Golgi brotan vesículas con cubierta de clatrina y receptores de M6P
que transportan las hidrolasas lisosomales hacia el compartimiento endosomal tardío.
(Antes estas vesículas se denominaban lisosmas primarios).
9. El proceso de endocitosis, mediante el brotamiento de vesículas con cubierta de
clatrina, determina la formación de un compartimiento endosomal temprano, el cual
constituye el principal compartimiento de clasificación de materiales de esta vía. A
partir de aquí algunos componentes serán reciclados a la membrana plasmática o el
exterior celular y otros pasarán al compartimiento endosomal tardío. En ocasiones el
brotamiento hacia la luz de la membrana de los endosomas tempranos conduce a la
formación de cuerpos multivesiculares, los cuales pueden recibir vesículas con
hidrolasas ácidas provenientes del Golgi por lo que se consideraron antes un tipo
especial de lisosoma.
10. En el endosoma tardío los receptores de M6P se separan de las hidrolasas a causa
del pH más ácido en este compartimiento.
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11. Los receptores son reciclados hacia la cara trans del Golgi o la membrana
plasmática. Las enzimas son transferidas al lisosoma, donde se lleva a cabo el proceso
de digestión y degradación enzimática (antes eran denominados lisosomas secundarios).
Cuando persiste un residuo en el interior que no puede ser digerido y se acumula
durante toda la vida de la célula, los organelos se denominan cuerpo residuales, o
telolisosomas. En el lisosoma no existen receptores de M6P. Además al pH lisosomal
estos receptores no pueden fijar su ligando. Por otra parte, las mismas fosfatasas
lisosomales remueven el dominio M6P de las enzimas.
12. En ocasiones un compartimiento membranoso en forma de medialuna
probablemente derivado del RE rodea un organelo o porción de citoplasma de la propia
célula, y termina incluyéndolo por completo en una vesícula (autofagosoma) que se
fusionará con el lisosoma llevando a la digestión de material de la propia célula.
4.1 Sistemas in vitro libres de células para estudiar componentes y mecanismos del
transporte vesicular.
El transporte vesicular puede ser reconstituído en sistemas libres de células. Esto fue
logrado primero para el estudio de mecanismos de transporte en el aparato de Golgi.
Las pilas de cisternas del aparato de Golgi pueden ser aisladas e incubadas in vitro en
citosol artificial. Cuando se agrega ATP brotan vesículas de transporte que transfieren
proteínas entre las cisternas. Si se marca un oligosacárido unido a una glicoproteína de
modo que pueda ser detectado fácilmente, es posible seguir el proceso de transporte
vesicular entre compartimientos. Para ello se incuban juntas dos pilas de Golgi
pertenecientes a distintas células. La población de cisternas a partir de la cual brotarán
las vesículas, el compartimiento “dador” en este diseño experimental, se aisla a partir de
células mutantes que carecen de la enzima N-acetilglucosamina (N-AcGlc) transferasa I
y que han sido además infectadas con un virus. Debido a la mutación, la principal
proteína viral, que es una glicoproteína, no puede ser glicosilada con NAcGlc en el
aparato de Golgi de las células mutantes. El compartimiento “aceptor” se aisla a partir
de células de tipo silvestre y no infectadas, que contienen por lo tanto NAcGlc
transferesa I pero no expresan la glicoproteína viral. Cuando se incuban juntas ambas
pilas de cisternas, la glicoproteína viral adquiere NAcGlc, indicando que debe haber
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sido transportada entre ambas pilas de cisternas, presumiblemente por vesículas que
brotaron del compartimiento cis “dador” y se fusionaron con el compartimiento medial
del Golgi “aceptor”, o por fusión homotípica de cisternas de ambas pilas.
Fig 4.1
Sistemas similares se han utilizado para estudiar el transporte desde el compartimiento
medial al trans del aparato de Golgi, de la red trans del Golgi a la membrana plasmática,
desde endosomas a lisosomas, desde el compartimiento trans del Golgi a endosomas
tardíos, y para estudiar la fusión homotípica entre compartimientos tales como
endosomas y vesículas secretorias inmaduras.
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centrifugar las muestras en tubos conteniendo gradientes de osmolaridades crecientes.
Para poder fraccionar de esta manera los organelos celulares, la ténica de
homogeneización debe preservar la estructura de las membranas y respetar la
osmolaridad celular.
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El trabajo de de Duve en fraccionamiento subcelular permitió comprender la función de
muchas estructuras celulares al mapear la localización de enzimas en los distintos
organelos. Su trabajo permitió diferenciar e identificar dos organelos cuyas
características estructurales no habían permitido su caracterización por los
microscopistas: el lisosomas y el peroxisoma, y aportó las principales pistas para el
descubrimiento de su función. En 1974 recibió el Premio Nobel de Fisiología y
Medicina en reconocimiento a su trabajo pionero.
Referencia:
Tissue Fractionation Studies. 18. Resolution of mitochondrial fractions from rat liver
into three distinct populations of cytoplasmic particles by means of density equilibration
in various gradients.
H. Beaufay, P. Jacques, P. Baudhuin, 0. Z. Sellinger, J. Berthet and C. de Duve.
Biochem. J. (1964), 92, 184.
(disponible en http://www.biochemj.org/bj/092/0184/0920184.pdf)
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5.2 LA RUTA DE LAS PROTEÍNAS HACIA EL EXTERIOR CELULAR (George
Palade, Premio Nobel de Fisiología y Medicina, 1974).
Además de sintetizar las proteínas que requieren para llevar a cabo sus múltiples
funciones, muchas células también producen y segregan proteínas adicionales que
llevan a cabo diferentes funciones en el exterior celular. El mecanismo de la secreción
de proteínas fascinó muchos biólogos celulares, incluyendo a Palade. Los trabajos de
fraccionamiento subcelular habían mostrado que las proteínas secretorias se
encontraban en compartimientos limitados por membrana asociados con el retículo
endoplásmico, donde se sintetizaban. Sin embasrgo las dificultades en obtener
preparaciones claras que permitieran distinguir entre los distintos organelos celulares
hizo imposible definir la ruta hacia el exterior celular. Para resolver el problema Palade
desarrolló una nueva técnica, la autoradiografía de alta resolución, que permite detectar
moléculas marcadas radioactivamente en micrografías electrónicas. Ello le permitió
seguir el recorrido de proteínas secretorias marcadas dentro de la célula, llevando al
hallazgo fundamental de que las proteínas se transportaban desde el retículo
endoplásmico al aparato de Golgi, y de aquí a la membrana plasmática.
Referencia:
Jamieson, J.D. and Palade, G.E. 1967. Intracellular transport of secretory proteins in the
pancreatic exocrine cell. II. Transport to condensing vacuoles and zymogen granules. J.
Cell Biol. 34: 597-615.
(disponible en http://jcb.rupress.org/content/34/2/597.full.pdf+html)
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Un grupo de alteraciones genéticas conocidas como enfermedades de almacenamiento
lisosómico son debidas a la ausencia de una o más enzimas lisosómicas. Como
resultado, los glicolípiods y componentes extracelulares normalmente degradados por
los lisosomas se acumulan formando grandes inclusiones intracelulares. La enfermedad
de células I es un tipo particularmente severo debido a la incapacidad de transferir
manosa-6-fosfato a las enzimas de destino lisosómico, por lo cual estas enzimas son
secretadas más que transferidas al compartimiento endolisosomal.
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