Flora microbiana comensal

y patógena en el ser humano 2

L a microbiología médica se centra en el estudio de las inter­ a la infección (p. ej., la alteración anatomopatológica de las
acciones existentes entre los animales (principalmente el infecciones por el coronavirus responsable del síndrome res-
ser humano) y los microorganismos como las bacterias, los virus, piratorio agudo grave [SRAG] se debe fundamentalmente a
los hongos y los parásitos. Aunque su principal interés radica la respuesta inmunitaria del paciente contra el virus).
en las enfermedades causadas por estas interacciones, también La comprensión de la microbiología médica exige conocer
debe tenerse en cuenta que los microorganismos desempeñan no sólo las diferentes clases de microorganismos existentes,
sino también su predisposición a causar enfermedades. Unas
un papel significativo en la supervivencia del ser humano. La
pocas infecciones se deben a patógenos estrictos (es decir,
población comensal normal de microorganismos participa en
microorganismos que se asocian siempre a enfermedad en el
la metabolización de los productos alimentarios, proporciona ser humano). Algunos ejemplos de patógenos estrictos y la
factores esenciales para el crecimiento, protege frente a las in- enfermedad que provocan son Mycobacterium tuberculosis
fecciones provocadas por gérmenes de alta virulencia y estimula (tuberculosis), Neisseria gonorrhoeae (gonorrea), Francisella
la respuesta inmunitaria. En ausencia de estos microorganismos, tularensis (tularemia), género Plasmodium (paludismo) y
la vida tal como la conocemos sería del todo imposible. el virus de la rabia (rabia). Sin embargo, la mayoría de las
La flora microbiana presente tanto en la superficie como en infecciones se deben a patógenos oportunistas, es decir, unos
el interior del organismo humano se encuentra en un continuo microorganismos que forman parte de la microflora normal del
estado de flujo determinado por factores diversos como la paciente (p. ej., Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Can­
edad, la dieta, el estado hormonal, el estado de salud y la dida albicans). En condiciones normales estos microorganis-
higiene personal. Mientras que el feto humano se desarrolla mos no producen enfermedad, pero sí la provocan cuando son
en un ambiente estéril y protegido, el recién nacido se ve introducidos en localizaciones no protegidas (p. ej., el torrente
expuesto a microorganismos procedentes tanto de la madre sanguíneo o los tejidos). Los factores específicos responsables
como del medio ambiente. Lo primero que colonizan los mi- de la virulencia de los patógenos estrictos y oportunistas se es-
croorganismos es la piel del lactante, seguida de la bucofaringe, tudian en capítulos posteriores. Cuando el sistema inmunitario
el aparato digestivo y otras mucosas. Asimismo, esta población del paciente es defectuoso, el sujeto es más vulnerable a la
de microorganismos experimenta cambios continuos durante enfermedad producida por patógenos oportunistas.
toda la vida de una persona. Los cambios del estado de salud La población microbiana que coloniza el ser humano es
también pueden alterar de forma espectacular el delicado numerosa y diversa. Nuestros conocimientos actuales sobre la
equilibrio que existe entre el ser humano y los microorganis- composición de esta población se basan en métodos de cultivo
mos heterogéneos que subsisten en su interior. Por ejemplo, la exhaustivos; sin embargo, se estima que sólo un pequeño por-
hospitalización de un paciente puede hacer que microorganis- centaje de los microbios se pueden cultivar. Para comprender
mos normalmente no virulentos de la bucofaringe sean sus- mejor la población microbiana se ha iniciado un proyecto a
tituidos por bacilos gramnegativos (p. ej., Klebsiella, Pseudo­ gran escala, llamado Human Microbiome Project (HMP,
monas) que invaden los pulmones y producen la aparición de proyecto microbioma humano), para caracterizar de forma
una neumonía. De igual modo, la proliferación de Clostridium exhaustiva los microbios humanos y analizar su implicación en
difficile en el aparato digestivo se encuentra controlada por las la salud y la enfermedad humana. Actualmente se están ana-
bacterias presentes en el intestino. Sin embargo, en presencia lizando de forma sistemática con técnicas genómicas la piel
de antibióticos se elimina esta microflora indígena y C. difficile y todas las mucosas corporales. La fase inicial de este estudio
es capaz de proliferar y producir diarrea y colitis. finalizó en 2012, y es evidente que el microbioma humano es
La exposición de una persona a un microorganismo puede complejo, está formado por muchos microorganismos que no
ocasionar uno de estos tres resultados. El microorganismo se reconocían previamente, y experimenta cambios dinámicos
­puede: 1) colonizar a la persona de forma transitoria; 2) coloni- en la enfermedad. Si se desea la información más actual sobre
zarla de forma permanente, o 3) provocar una enfermedad. Es este estudio, se debería consultar la página de internet del
importante diferenciar entre colonización y enfermedad. proyecto HMP en http://nihroadmap.nih.gov/hmp/. Para
(Nota: Muchas personas utilizan de manera inapropiada el esta edición de Microbiología médica, la información que
término infección como sinónimo de ambos.) Los microor- se incluye en este capítulo se basa en los datos obtenidos
ganismos que colonizan al ser humano (sea durante un breve de cultivos sistemáticos, pero asumimos que gran parte de
período de tiempo, como horas o días [transitorio], o de forma nuestros conocimientos actuales pueden ser muy distintos
permanente) no alteran las funciones normales del organis- de lo que podemos llegar a conocer en los próximos 5 años.
mo. En cambio, la enfermedad aparece cuando la interacción
entre el microorganismo y el ser humano ocasiona un proceso
anatomopatológico que provoca daños en el huésped humano. Cabeza y aparato respiratorio
Este proceso puede tener su origen en factores microbianos
(p. ej., daño orgánico causado por la proliferación del microor- Boca, orofaringe y nasofaringe
ganismo o la producción de toxinas o enzimas citotóxicas) o Las vías respiratorias superiores están colonizadas por
bien en la respuesta inmunitaria del organismo huésped frente numerosos microorganismos y existen entre 10 y 100 bacterias
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 Flora microbiana comensal y patógena en el ser humano   7

CUADRO 2-1 Oído

Microorganismos que colonizan con más frecuencia El microorganismo que coloniza más a menudo el oído exter-
el aparato respiratorio superior no es Staphylococcus coagulasa-negativo. En esta localización
se han aislado también otros microorganismos que colonizan
Bacterias la piel, así como patógenos potenciales como S. pneumoniae,
Acinetobacter Pseudomonas aeruginosa y especies de la familia Enterobac-
Actinobacillus teriaceae.
Actinomyces
Cardiobacterium Ojo
Corynebacterium La superficie ocular está colonizada por estafilococos nega-
Eikenella tivos para coagulasa, así como por microorganismos poco
Enterobacteriaceae frecuentes que se asocian a la nasofaringe (p. ej., géneros Hae­
Eubacterium mophilus y Neisseria, Streptococcus viridans). La enfermedad
Fusobacterium se relaciona habitualmente con S. pneumoniae, S. aureus,
Haemophilus H. influenzae, N. gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, P. ae­
Kingella ruginosa y Bacillus cereus.
Moraxella
Mycoplasma Vías respiratorias inferiores
Neisseria
Peptostreptococcus La laringe, la tráquea, los bronquiolos y las vías respiratorias
Porphyromonas inferiores suelen ser estériles, aunque puede tener lugar una
Prevotella colonización transitoria por secreciones de las vías respira-
Propionibacterium torias superiores. Por regla general la enfermedad aguda de
Staphylococcus las vías respiratorias inferiores se debe a bacterias orales más
Streptococcus virulentas (como S. pneumoniae, S. aureus y especies de la
Stomatococcus familia Enterobacteriaceae como Klebsiella). La aspiración
Treponema crónica puede ocasionar una enfermedad polimicrobiana
Veillonella en la que predominan los microorganismos anaerobios, en
Hongos especial Peptostreptococcus, cocos anaerobios relacionados
Candida y bacilos anaerobios gramnegativos. Algunos hongos como
C. albicans son una causa infrecuente de enfermedad en
Parásitos las vías respiratorias inferiores, aunque se debe demostrar
Entamoeba la invasión tisular por estos microorganismos para excluir
Trichomonas una colonización simple. Por el contrario, la presencia de
hongos dimórficos (p. ej., Histoplasma, Coccidioides y género
Blastomyces) tiene capacidad diagnóstica debido a que en
esta localización nunca se registra una colonización por estos
anaerobias por cada bacteria aerobia (cuadro 2-1). Las bacte- microorganismos.
rias anaerobias más frecuentes pertenecen al género Peptos­
treptococcus y a otros cocos anaerobios relacionados, Vei­ Tubo digestivo
llonella, Actinomyces y Fusobacterium. Las bacterias aerobias
más frecuentes se incluyen en los géneros Streptococcus, El tubo digestivo se encuentra colonizado por microorganis-
Haemophilus y Neisseria. La proporción relativa de estos mos ya desde el nacimiento, y sigue albergando una variada
microorganismos varía según las diferentes localizaciones población de microbios durante toda la existencia del organis-
anatómicas; por ejemplo, la flora microbiana presente en mo huésped (cuadro 2-2). Aunque la ingestión de alimentos
la superficie de un diente es muy distinta de la flora salival y agua supone cada día una oportunidad de colonización por
o de la existente en los espacios subgingivales. La mayor nuevos microorganismos, la población microbiana permanece
parte de los microorganismos comunes en las vías respira- relativamente estable a no ser que se altere el equilibrio de
torias superiores son relativamente avirulentos y, a no ser la microflora como consecuencia de factores exógenos, como
que sean introducidos en localizaciones normalmente es- un tratamiento antibiótico.
tériles (p. ej., senos paranasales, oído medio, cerebro), pocas
veces se asocian a enfermedad. Sin embargo, también pueden
Esófago
© Elsevier. Fotocopiar sin autorización es un delito.

aparecer microorganismos potencialmente patógenos en las Se pueden aislar levaduras y bacterias orofaríngeas, así como
vías respiratorias superiores, como Streptococcus pyogenes, bacterias que colonizan el estómago, a partir de muestras del
Streptococcus pneumoniae, S. aureus, Neisseria meningitidis, esófago. Sin embargo, aparentemente la mayoría de estos
Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis y Entero- microorganismos son colonizadores temporales que no se
bacteriaceae. El aislamiento de estos microorganismos en establecen de forma permanente en esta localización. Las
muestras de las vías respiratorias superiores no define su bacterias rara vez causan enfermedad en el esófago (eso-
patogenicidad (recuérdese el concepto de colonización frente fagitis); la mayor parte de las infecciones son debidas al
al de enfermedad). Su participación en un proceso patológico género Candida y a virus como el virus del herpes simple o
se debe demostrar por exclusión de otros patógenos. Por el citomegalovirus.
ejemplo, a excepción de S. pyogenes, estos microorganismos
rara vez ocasionan faringitis (aunque pueden ser aislados de Estómago
pacientes aquejados de esta entidad). Algunos microorga­ Puesto que el estómago contiene ácido ­clorhídrico y pepsi­
nismos asociados con frecuencia a infecciones sinusales son nógeno (secretados por las células parietales y principa­
S. pneumoniae, S. aureus, H. influenzae y M. catarrhalis. les que tapizan la mucosa gástrica), los únicos microorga­
8  MICROBIOLOGÍA MÉDICA

CUADRO 2-2 los microorganismos que se encuentran normalmente en el

intestino grueso, con la consiguiente aparición de un síndrome
Microorganismos que colonizan con más frecuencia de malabsorción.
el tubo digestivo
Intestino grueso
Bacterias
El intestino grueso contiene un número más elevado de mi-
Acinetobacter croorganismos que cualquier otra localización corporal en el
Actinomyces
ser humano. Se estima que en las heces pueden existir más
Bacteroides
de 1011 bacterias por gramo y las bacterias anaerobias serían
Bifidobacterium
Campylobacter 1.000 veces más frecuentes que las aerobias. Asimismo, en
Clostridium el intestino grueso también pueden residir diversas levaduras
Corynebacterium y parásitos no patógenos. Las bacterias más frecuentes per-
Enterobacteriaceae tenecen a Bifidobacterium, Eubacterium, Bacteroides, Ente­
Enterococcus rococcus y la familia Enterobacteriaceae. E. coli se halla en
Eubacterium prácticamente todos los seres humanos desde su nacimiento
Fusobacterium hasta su muerte. Aunque este microorganismo representa una
Haemophilus proporción inferior al 1% de la población microbiana intes-
Helicobacter tinal, se considera la bacteria aerobia responsable con mayor
Lactobacillus frecuencia de las enfermedades intraabdominales. De modo
Mobiluncus semejante, aunque Bacteroides fragilis es un miembro poco
Peptostreptococcus destacado de la microflora intestinal, constituye el principal
Porphyromonas microorganismo anaerobio responsable de la aparición de
Prevotella enfermedades intraabdominales. Por el contrario, Eubacte­
Propionibacterium rium y Bifidobacterium son las bacterias que se encuentran
Pseudomonas más a menudo en el intestino grueso, pero rara vez causan
Staphylococcus enfermedad. Estos microorganismos carecen de los distintos
Streptococcus factores de virulencia presentes en B. fragilis.
Veillonella
El tratamiento con antibióticos puede modificar rápida-
Hongos mente la población microbiana y provocar la proliferación
Candida de microorganismos resistentes a estos fármacos, como
Parásitos Enterococcus, Pseudomonas y hongos. C. difficile también
Blastocystis prolifera con rapidez en esta situación y origina una patología
Chilomastix que comprende desde la diarrea hasta la colitis seudomem-
Endolimax branosa. Igualmente, la exposición a otros microorganismos
Entamoeba patógenos intestinales, como Shigella, E. coli enterohemo-
Iodamoeba rrágica y Entamoeba histolytica, puede alterar la microflora
Trichomonas del colon y ocasionar la aparición de enfermedades intes-
tinales significativas.

Aparato genitourinario
nismos presentes son un pequeño número de bacterias con
tolerancia a los ácidos, como las bacterias productoras de En general, la porción anterior de la uretra y la vagina son
ácido láctico (géneros Lactobacillus y Streptococcus) y las únicas localizaciones del aparato genitourinario que están
­Helicobacter pylori. H. pylori es un agente etiológico de gastri­ colonizadas por microorganismos de manera permanente
tis y enfermedad ulcerosa. La población microbiana puede (cuadro 2-3). Aunque la vejiga urinaria puede ser colonizada
sufrir unas notables modificaciones tanto en número co­ de forma transitoria por bacterias que migran desde la uretra
mo en diversidad en los pacientes tratados con fármacos en dirección ascendente, estos microorganismos deben ser
que neutralizan o disminuyen la producción de ácidos gás- eliminados con rapidez por la actividad bactericida de las
tricos. células uroepiteliales y la acción de arrastre de la orina ex-
pulsada. Las restantes estructuras del aparato urinario han de
Intestino delgado ser asimismo estériles (excepto en presencia de enfermedad
o de una anomalía anatómica). De igual modo, el útero debe
En contraste con la porción anterior del aparato digestivo, el
permanecer libre de microorganismos.
intestino delgado está colonizado por numerosas bacterias,
hongos y parásitos. La mayoría de estos microorganismos
son anaerobios, como Peptostreptococcus, Porphyromonas y Uretra anterior
Prevotella. Aunque algunos microorganismos que causan a La población microbiana comensal de la uretra está for-
menudo gastroenteritis (como Salmonella y género Campy­ mada por diversos microorganismos; los más numerosos
lobacter) pueden subsistir como residentes asintomáticos de los cuales son los lactobacilos, los estreptococos y los
a bajas concentraciones, su identificación en el laboratorio estafilococos negativos para coagulasa. Estos microorganis-
habitualmente se asocia a enfermedad. En casos de obs- mos son relativamente avirulentos y rara vez se asocian
trucción intestinal, como tras una intervención quirúrgica a enfermedad en el ser humano. Por el contario, la ure-
abdominal, puede aparecer un trastorno denominado sín- tra puede verse colonizada de forma transitoria por mi-
drome del asa ciega. En estos pacientes, la ectasia del con- croorganismos fecales, como Enterococcus, miembros de la
tenido intestinal origina la colonización y la proliferación de familia Enterobacteriaceae y Candida, todos los cuales son
 Flora microbiana comensal y patógena en el ser humano   9

CUADRO 2-3 CUADRO 2-4

Microorganismos que colonizan con más frecuencia Microorganismos que colonizan con más frecuencia
el aparato genitourinario la piel
Bacterias Bacterias
Actinomyces Acinetobacter
Bacteroides Aerococcus
Bifidobacterium Bacillus
Clostridium Clostridium
Corynebacterium Corynebacterium
Enterobacteriaceae Micrococcus
Enterococcus Peptostreptococcus
Eubacterium Propionibacterium
Fusobacterium Staphylococcus
Gardnerella Streptococcus
Haemophilus Hongos
Lactobacillus
Candida
Mobiluncus
Malassezia
Mycoplasma
Peptostreptococcus
Porphyromonas
Prevotella
Propionibacterium
Staphylococcus del número de lactobacilos y un aumento de Mobiluncus
Streptococcus
y Gardnerella. Trichomonas vaginalis, C. albicans y Can­
Treponema
dida glabrata constituyen, igualmente, agentes etiológicos
Ureaplasma
destacados de vaginitis. Aunque se considera que el virus
Hongos herpes simple y el virus del papiloma no forman parte de
Candida la flora normal del aparato genitourinario, pueden provocar
infecciones persistentes.

Cuello uterino
capaces de invadir el aparato genitourinario, multiplicarse A pesar de que el cuello uterino no suele estar colonizado
en la orina y ocasionar enfermedades significativas. Los por bacterias, N. gonorrhoeae y C. trachomatis son causas im-
microorganismos patógenos, como N. gonorrhoeae y portantes de cervicitis. Actinomyces también puede provocar
C. trachomatis, son una causa frecuente de uretritis y enfermedad en esta localización.
pueden persistir como colonizadores asintomáticos de la
uretra. Independientemente de la presencia o ausencia
de manifestaciones clínicas, el aislamiento de estos dos
microorganismos en las muestras del paciente se debe
considerar significativo. Piel
Aunque un gran número de microorganismos están en
contacto con la superficie cutánea, este ambiente relati-
Vagina vamente hostil no es favorable para la supervivencia de
La población microbiana de la vagina es muy heterogénea y se la mayoría de ellos (v. cuadro 2-4). Los microorganismos
ve influida en gran medida por diversos factores hormonales. que se encuentran con mayor frecuencia en la superficie
Las recién nacidas están colonizadas ya por lactobacilos desde cutánea son bacterias grampositivas (p. ej., Staphylococcus
su nacimiento, los cuales predominan durante aproximada- coagulasa-negativo y, con menos frecuencia, S. aureus, cori-
mente 6 semanas. Después de ese período, los valores de nebacterias y propionibacterias). Clostridium perfringens se
estrógenos maternos han disminuido y la flora vaginal se aísla en la piel de aproximadamente el 20% de las personas
modifica e incluye estafilococos, estreptococos y miembros sanas, y los hongos Candida y Malassezia también pueden
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de la familia Enterobacteriaceae. Cuando en la pubertad se localizarse sobre las superficies cutáneas, en especial en
inicia la producción de estrógenos, se produce otro cambio las localizaciones húmedas. Los estreptococos son capaces
de la flora microbiana. Los lactobacilos reaparecen como de colonizar la piel de forma transitoria, si bien los ácidos
microorganismos predominantes y se aíslan también mu- grasos volátiles producidos por las propionibacterias anae-
chas otras bacterias, como estafilococos (S. aureus con una robias resultan tóxicos para estos microorganismos. Los
frecuencia menor que las especies coagulasa-negativas), es- bacilos gramnegativos, con la excepción de Acinetobacter y
treptococos (incluido el estreptococo del grupo B), Entero­ algunos otros géneros menos frecuentes, generalmente no
coccus, Gardnerella, Mycoplasma, Ureaplasma, miembros de se cultivan de la piel humana. Se pensaba que el entorno
la familia Enterobacteriaceae y diversas bacterias anaerobias. era demasiado hostil para permitir la supervivencia de estos
N. gonorrhoeae constituye una causa frecuente de vaginitis. microorganismos; sin embargo, en el proyecto HMP se ha
En ausencia de este microorganismo, se registra un número visto que los bacilos gramnegativos no cultivables pueden
significativo de casos cuando se altera el equilibrio de la ser los microorganismos más frecuentes de la superficie
flora bacteriana vaginal, lo que ocasiona una disminución cutánea.
10  MICROBIOLOGÍA MÉDICA

PREGUNTAS BIBLIOGRAFÍA
Balows A, Truper H: The prokaryotes, ed 2, New York, 1992, Springer-
Verlag.
1. ¿Cuál es la diferencia entre colonización y enfermedad? Murray P: Human microbiota. In Balows A, et al, editor: Topley and
2. Enumere ejemplos de patógenos estrictos y patógenos Wilson's microbiology and microbial infections, ed 10, London, 2005,
oportunistas. Edward Arnold.
Murray P, Shea Y: Pocket guide to clinical microbiology, ed 3, Washington,
3. ¿Qué factores regulan las poblaciones microbianas DC, 2004, American Society for Microbiology Press.
de los microorganismos que colonizan el ser humano?

Las respuestas a estas preguntas están disponibles en

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