Clase 10 Parte 1

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BIOLOGIA CELULAR Y MOLECULAR

MEDICINA – PRIMER AÑO

Clase 10 parte 1: Regulación

Estructura de un gen Represores:el operón triptófano


Los operones son un sistema en que un
promotor controla la expresión de varias
proteínas a la vez, un gen policistrónico.

Hay una que se codifica con el K, que se


llama UTR( del inglés flanking Explicación imagen: En este caso en
untranslated regions), hay una región que particular tenía que ver con controlar la
no se traduce que va al inicio y una región síntesis de las proteínas que participan en
que no se traduce que va al final, antes la fabricación del triptófano, si había
que se adhiera a la cola poliA. triptófano en el medio, las células
Estas regiones son importantes porque bacterianas bloquean la expresión de
ayudan al ribosoma a ubicar el sitio de estos genes, apareciendo un represor,
inicio de la traducción, el primer AUG. que se ponía en el promotor, en una
región específica que se llamaba
operador, que está dentro del promotor.
Operones: regulación en Esta proteína reconocía la presencia del
procariontes triptófano, bloqueando la expresión del
gen, apareciendo por primera vez las
proteínas represoras, que son
importantes en la regulación de la
expresión génica.

Represores y activadores:
operón lactosa
Los primeros eventos de regulación
fueron estudiados en procariontes, en ¿Si existen represores que bloqueen la
bacterias, para que exista la expresión expresión de un gen, existen activadores
génica en los procariontes, la ARN que faciliten la expresión de un gen? Este
polimerasa necesitaba la ayuda de la es un ejemplo elegante que muestra
proteína sigma, que les decía donde cómo dos moléculas muy distintas
estaba el sitio+1, aunque aparezca esta controlan la expresión de otro operón,
proteína, si hay un represor, la este operón muy estudiado que es el
transcripción no se produce, en este caso operón lactosa, que tiene que ver con la
se habla de un mecanismo de regulación degradación de lactosa.
que se llamaba operones.

Maura M, Constanza V, Valentina V, María Paz F, Carlos U, Vicente F, Bastián M.


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Contexto: tenemos una bacteria que le tengo glucosa, por lo que en presencia de
damos lactosa, la bacteria toma el glucosa el operón está desactivado, ya
disacárido, lo mete al interior y lo rompe que requiere del sigma y de un activador,
transformándolo en sus dos que no está.
monosacáridos, glucosa y galactosa. Y
además tienen una enzima que pueden
transformar galactosa en glucosa porque
la galactosa es un isómero de la glucosa, Caso 2: Tengo una situación en la que si
en resumen, el resultado final es glucosa. le doy lactosa, pero no hay glucosa en el
medio, ¿que necesita la bacteria?
El operón controla la expresión de tres glucosa, por lo tanto tengo que tomar la
proteínas(LACz,x,y): La proteína 1 lactosa y transformarla en glucosa, si hay
transporta glucosa, la 2 rompe la lactosa lactosa, hay que transportarla, degradarla
y la 3 transforma galactosa en glucosa. El y transformarla, por lo que necesito esas
resultado final de este operón es mucha tres proteínas que dependen del
glucosa a partir de lactosa. operador, por lo que tengo que activar el
operón¿como lo activo? con un activador
En el promotor existe un operador, CAP, una proteína que se activa por
además de las secuencias típicas, AMPc.
aparece la secuencia operadora, que al
igual que la anterior se une a un represor, Cuando no hay glucosa se produce un
pero aparecen nuevas secuencias aumento de AMPc(pelota roja), al
reguladoras que se llama secuencia CAP, aparecer AMPc se une a la proteína CAP,
que es donde se une un activador. CAP a su vez se une al
promotor(activador) y como hay lactosa,
el operón se activa, se sintetizan estas
tres proteínas, y puedo obtener glucosa a
través de lactosa.

Caso 3: ¿Qué pasaría si yo no le doy


glucosa y lactosa?
Antes estábamos sin glucosa pero el
operón estaba funcionando porque tenía
lactosa.
Ahora le vamos a quitar la lactosa y si uno
piensa, la bacteria va a decir “no hay
lactosa por lo cual no es necesario
sintetizar estas proteínas que son
Alberts nos presenta la explicación de caras, las cuales me permiten
cómo funciona en una secuencia, pero transformar la lactosa en glucosa, pero
nosotros vamos a explicarlo siguiendo como no hay lactosa no hago nada”.
otra secuencia(números rojos).
El operón se desactiva a pesar de que
Caso 1: Imaginen la siguiente situación, está el activador y esto lo hace un
yo le doy glucosa y lactosa a la bacteria represor llamado el “represor Lac”.
¿la bacteria activará o no el operón? No lo
activa porque ya le estamos dando Se pone el represor Lac en el promotor, el
glucosa, y no va a gastar energia en activador le dice a la polimerasa
producir las tres proteínas necesarias “transcribe” pero el represor le dice “no
para transformar la lactosa, porque ya

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transcribe”, se suman los dos y el Analogía: Uno va a dar una vuelta en


resultado final es no transcriban. auto y para eso tengo que hacer andar el
motor, pero el auto no parte aun teniendo
Caso 4: (No hay lactosa pero le vuelvo todo listo ( los factores de transcripción
a agregar glucosa). que le dijeron a la polimerasa que haga
transcripción) pero el auto está detenido.
Si uno le vuelve a agregar glucosa pero Lo que se necesita es una señal adicional
hay lactosa, disminuye los niveles de para que el auto parta y es llamada
AMPc, es decir que la proteína azul que “activador” el cual no está en el promotor
se pegaba, se soltara. y no afecta directamente a la polimerasa
sino que la afecta a la distancia a través
del repliegue.
Como consecuencia no hay activador
pero está el represor y como resultado
final es que el operón está desactivado. Regulación en eucariontes
Dicho de otra forma para que el operón se ¿Cómo puedo explicar yo que una
active, tiene que haber un activador y que proteína que se une a mucha distancia,
no esté presente el represor. pueda afectar la transcripción de este
gen?
Esto se explica por cómo está organizada
Esto se logra cuando hay lactosa (por que
la cromatina en los eucariontes. La
se necesita energía) y no hay otra fuente
cromatina en eucariontes se organiza de
de energía como la glucosa y es un
forma particular. La cromatina está
control de dos proteínas que se unen al
pegada a la envoltura nuclear y después
promotor (ya sea un activador o un
hace un loops. Es decir, la proteína
represor) y con esto uno puede ahorrar
activadora, el factor de transcripción que
energía en la bacteria, que no va a
actúa a la distancia (que se une a la
sintetizar las proteínas (no necesita por
secuencia enhancer), logra influir en el
que no está el sustrato).
inicio de la transcripción por medio de
estas asas que se organizan sólo en los
• En las bacterias existen represores
núcleos eucariontes.
que se unen al promotor.
• En las bacterias existen activadores
que se unen al promotor para regular.

¿Existen activadores y promotores en


los eucariontes?
Si, pero funcionan de una manera
distintas, ya que no afectan al promotor
proximal sino que se unen a la secuencia
que está en la distancia llamada
“enhancer” (se llama así si estas
secuencias se unen a un activador y si se
Los factores generales de transcripción (o
unen a un represor se llaman
factores basales) son aquellos que se
silenciadores).
unen al promotor proximal. Pero hay otros
No se unen al promotor proximal ya que
factores de transcripción que se unen a
en este se unen un montón de proteínas
secuencias reguladoras, las cuales
que tienen que ver con qué con que la
pueden ser activadoras e inhibidoras.
polimerasa haga transcripción .

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Los factores de transcripción generales le punta y cuando la polimerasa avanza


dicen a la ARN polimerasa que inicie la también lo hace con estos complejos.
transcripción, pero otros factores de Estos complejos desenrollan el sistema,
transcripción que se unen a secuencias acetilando las colas de las histonas y la
reguladoras, pueden dar la “orden” de polimerasa hace la transcripción
inhibir o activar la transcripción. Por ende, correspondiente.
“ganará” la orden que sume más.
Regulación o control
postranscripcional en bacterias
Aquí ya se sintetizó el mensajero. La
pregunta es si se lee o no se lee. La
respuesta no es exacta.

¿Quien le dijo a esos factores que se


ganasen allí? ¿De donde salieron esos A) Para la regulación
factores? postranscripcional recurriremos a
Esos factores están dando vueltas, las bacterias. Se sintetizó un
algunos de los cuales están en el mensajero. La secuencia anterior
citoplasma, y cuando les llega una señal al AUG, la UTR, la que no se
desde fuera, estos factores se activan, traduce y los mensajeros en las
algunos se mueven hacia el núcleo y se bacterias ens muy común que
unen a su secuencia específica. formen una especie de asa. Esta
Por ejemplo, una célula que hace mitosis asa puede ser reconocida por una
¿que necesita una célula para hacer proteína específica que es una
mitosis? Las proteínas que regulan el proteína represora. Esta proteína
ciclo celular son las ciclinas, cuyo gen represora participa en la
está bloqueado. por ende necesita traducción y no en la transcripción.
señales externas que lo activen. Los Después que el mensajero se
factores de crecimiento le dicen a la sintetizó, todavía el mensajero
ciclina que se active. Estos factores de bacteriano tiene que pasar un
crecimiento se unen a proteínas de nuevo nivel de regulación. Esta
membrana, las RTK, las cuales activan proteína se une a esta asa y
una cascada de quinasas hasta que la bloquea al AUG. Al bloquear al
última quinasa fosforila a este factor. Este AUG el ribosomas no encuentra al
factor fosforilado se une al enhancer y vía mensajero y el mensaje no se lee.
mediador, le dice a la polimerasa “parte”.
B) La bacteria fabrica este mensajero
El gen de ciclina para que sea leído y el AUG queda en el asa. Este no
necesita despejarse en la región se puede leer por que es doble
codificante de las histonas, porque está cadena, el ribosomas no puede
enrollado. El complejo de remodelación leer una doble cadena, solo lee
de cromatina y enzimas modificadoras de una monocadena. Cuando la
histonas, le agregan grupos químicos a bacteria está fuera de la célula, los
las histonas, como acetilaciones, gracias mensajeros que produce son
a las acetilasas, las cuales se ubican en la como los de la imagen. Pero
cuando infecta a una célula la

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temperatura aumenta a 37° y el (micro ARN, es el ARN monocatenario


mensajero se abre y en ese que está unido a RISC) de RISC, bloquea
momento se puede leer y generar la traducción, activando una proteína
una proteína. llama slicer, y rompe el ARNm.
Estos son mecanismos de regulación post
transcripcionales en bacterias. No todos Los miARN son fragmentos relativamente
los mensajeros que se fabricaron ya están pequeños ya que no codifican para
listos para ser leídos, sino que tiene que proteínas. El objetivo de esto es generar
pasar por ciertos pasos. pequeños fragmentos de ADN que se
unen a RISC, para que este comience a
buscar mensajeros. En algunos casos, la
Control post - transcripcional en coincidencia no es total, pero aún así es
eucariontes capaz de bloquear la traducción.

RISC y defensa intracelular


contra virus
siARN (ARN de interferencia pequeño).
Cuando un ARN (bicatenario) de origen
vírico se encuentra en el citoplasma, una
proteína llamada dicer, lo rompe. Esta
ruptura genera ARN monocatenario y
estos se asocian a RISC. Una vez
acoplados RISC y el siARN (el ARN
monocatenario de origen vírico), buscan
ARN complementarios (que serían de
origen viral), los reconocen, se unen y
luego los “troza”.

El sistema de regulación RISC (complejo La célula también puede actuar en los


de silenciamiento inducido por ARN) virus que pueden transformarse en ADN,
funciona de la siguiente forma: hay un gen mediante la proteína RITZ (silenciamiento
con toda su estructura genera un de la transcripción inducida por ARN).
mensajero. El mensajero no debería RITZ se une a un siARN monocatenario,
plegarse pero en este caso en particular y espera a que el ADN ingresado por el
el mensajero si se pliega y se genera una virus genere un ARNm, y en ese momento
doble hélice de ARN. lo “troza”.

¿Por qué se podría permitir que se


junten? Porque no hay proteínas que se
ARN no codificantes largos
asocien a él. Cuando se generan estas
doble hebras de ARN, una enzima rompe Existen unas regiones dentro de las
ese pedazo y se queda con un fragmento células que son agregados moleculares
de ARN bicatenario, que RISC (complejo donde hay proteínas amiloides que son
de silenciamiento inducido por RNA) estructuras secundarias de tipo beta
separa, y se queda con una sola de las plegadas e hidrofóbicas, las cuales
hebras. Luego es liberado al citoplasma, y permiten formar una red proteica.
si se encuentra con un ARNm, y este
ARNm es complementario al miARN

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También existen ARN de andamiaje que


son ARN no codificantes de cadena larga
que sirven para traer proteínas, por
ejemplo aquellas que se pueden asociar a
ADN, aprovechando que el ARN se puede
enlazar con el ADN y pueden atraer
proteínas específicas también pueden
atraer proteínas al ADN.

Por ejemplo, el gato de color estudiado en


las clases anteriores, quien posee la
expresión X materno y un gen X paterno,
pero ¿cómo se bloquea? El cromosoma
modifica químicamente las histonas y se
compacta hasta el nivel de
heterocromatina, esto se compacta con
grandes cantidades de enzimas que
producen metilaciones.

Cuando un gen al azar se compacta los


dos genes tiene un gen que tiene Xist, el
que se expresa primero es el que se
bloquea. Xist es un gen que no codifica
para los ARN largos y no posee codón de
inicio ni de término. Por lo que, estos
quedan pegados al cromosoma y
comienzan a atraer a las enzimas que
metilan y comienzan a metilar a las
histonas y el cromosoma comienza a
compactarse.

Maura M, Constanza V, Valentina V, María Paz F, Carlos U, Vicente F, Bastián M.

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