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    PLANNING PGBBS 2023 2024 v02

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    Adrian Presa Melero
    Este documento presenta el plan de asignatura para el curso 2023-2024 de un Máster en Biotecnología y Biomedicina. La asignatura cubre temas de proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas a través de 31 sesiones que incluyen clases magistrales, prácticas de laboratorio y seminarios. Los estudiantes aprenderán sobre técnicas experimentales como electroforesis 2D, espectrometría de masas y secuenciación de ADN, así como el uso de bases de datos biom

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    Este documento presenta el plan de asignatura para el curso 2023-2024 de un Máster en Biotecnología y Biomedicina. La asignatura cubre temas de proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas a través de 31 sesiones que incluyen clases magistrales, prácticas de laboratorio y seminarios. Los estudiantes aprenderán sobre técnicas experimentales como electroforesis 2D, espectrometría de masas y secuenciación de ADN, así como el uso de bases de datos biom

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    MÁSTER UNIVERSITARIO EN BIOTECNOLOGÍA Y BIOMEDICINA

    PROTEÓMICA, GENÓMICA, BIOINFORMÁTICA Y BIOLOGÍA DE SISTEMAS


    PLAN DE LA ASIGNATURA, CURSO 2023-2024

    Sesión 1 (presencial, Aula I-4, A-4). Lunes, 23 de octubre, 16,00-17,30 h. Presentación y comentario
    de la guía docente. Presentación y uso de bases de datos de documentación científica. J.
    Peragón.

    Sesiones 2, 3 y 4 (presencial, Aula 5, B-5). Lunes, 23 de octubre -17,30-19,30 h-, miércoles, 25 de


    octubre -16,00-18,00 h, y jueves, 26 de octubre, de 16,00 a 17,30 h. Técnicas y métodos de
    preparación de muestra, separación (2-D, HPLC-MS, otros), identificación y cuantificación
    en proteómica. Microarrays de proteínas. ProteoRed. J. Peragón.

    Sesión 5 (presencial, Aula 5, B-5). Martes, 24 de octubre, 17,00-19,00 h. Proteínas malplegadas y


    enfermedad. A. Sánchez-Pozo.

    Sesión 6 (presencial, Aula 5, B-5). Martes, 31 de octubre, 16,00-18,00 h. Espectrometría de masas y


    proteómica. Fundamentos y aplicaciones. C. Fuentes.

    Sesión 7 (presencial, Aula 5, B-5). Lunes, 30 de octubre, 16,00-18,00 h. Transcriptómica. A.


    Cañuelo.

    Sesión 8 (presencial, Aula 5, B-5). Jueves, 26 de octubre, 17,30-19,30 h. Diseño computacional de


    fármacos. J. M. Granadino.

    Sesiones 9-12 (presencial, Lab. A2-223C, 9,00-10,30 h -6 y 7 de noviembre-, 12,30 h-14,30 h -13 y
    14 de noviembre-, 15,30 h-19,30 h.). Grupo 1: 6-7 noviembre, Grupo 2: 13-14 noviembre.
    Prácticas de laboratorio. Electroforesis 2-D y efecto del ayuno sobre el proteoma del hígado
    de rata. J. Peragón y A. Cañuelo.

    Sesión 13 (presencial, SCAI UJA y Lab. A2-223C). Grupo 1: miércoles, 8 de noviembre, de 13,00 a
    14,00 h y de 15,30-17,30 h. Grupo 2: miércoles, 15 de noviembre de 15,30-17,30 h y jueves,
    16 de noviembre, de 13,00 a 14,00 h. Técnicas de proteómica basada en nano cromatografía
    líquida (nLC) y análisis de masas (orbiTrap) en los Servicios Centrales de Apoyo a la
    Investigación de la Universidad de Jaén (SCAI UJA). Exposición de trabajos sobre
    aplicaciones de la proteómica. J. Peragón.

    Sesiones 14-18 (presenciales). Grupo 1: lunes, martes, miércoles y jueves, 20-23 de noviembre
    (15,30 h-17,30 h). Grupo 2: lunes, martes, miércoles y jueves, 27-30 de noviembre (15,30 h-
    17,30 h).

    Aula: I-24, A-4, lunes y martes 15,30 h-17,30 h


    Aula: I-33, A-4, miércoles y jueves, 15,30 h-17,30 h

    1
    Introducción a la genómica estructural y funcional. Introducción a las bases de datos
    de genética molecular. Obtención y análisis de secuencias de ADN y proteínas. Otros
    programas informáticos en genética molecular. F.N. Gómez.

    Sesiones 19-23 (presenciales, Aula Aranzadi, Biblioteca, B2-327). Grupo 1: lunes, martes, miércoles
    y jueves, 27-30 de noviembre (15,30 h-17,30 h). Grupo 2: lunes, martes, miércoles y jueves,
    20-23 de noviembre (15,30 h-17,30 h).
    Obtención y análisis de secuencias de ADN y proteínas. Secuenciación práctica de
    ADN. Ensembl, Genome Browser, OMIM, dbSNP, Genecards, GTEX, Google y Lens
    patents, Vista Browser. Estudios de asociación genética: Candidatos y Genome Wide
    Association Studies (GWAS): SNPnexus, análisis de secuenciación de exomas: MendelMD.
    A. Caruz.

    Sesión 24 (presenciales, 20-11-2023 y 21-11-2022 Aula I-4, A-4). Grupos 1 y 2: lunes, 20 de


    noviembre de 2023, de 19,30 a 21,30 h. Martes, 21 de noviembre de 2023, de 17,30 – 19,30.
    Integración de datos biológicos: estadística multivariante. J.R. Avi.

    Sesiones 25-30 (presenciales). Grupos 1 y 2. Miércoles, 22 de noviembre (19:30-21:30 h, Aula I-


    4). Jueves, 23 de noviembre (17,00 – 19,30 h, Aula de formación en TIC, 225 Biblioteca).
    Viernes, 24 de noviembre (18,30-20,30 h, Aula I-14). Lunes, 27 de noviembre (19:30 -
    21:30 h, Aula I-14). Martes, 28 de noviembre, de 17,30 a 19,30 h, Aula I-14. Miércoles, 29
    de noviembre (19:30-21:30 h, Aula I-14).
    Dinámica de los sistemas biológicos. Minería de datos biomédicos. Análisis de datos
    de expresión génica obtenidos por microarrays y RNA-seq. Análisis, modelización y
    caracterización de la expresión génica mediante redes moleculares. F.J. Esteban y E. Vargas.

    Sesión 31 (presencial, Aula 5, B-5). Test de evaluación. Lunes, 04 de diciembre, de 12,00-13,00 h.

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