Microbiología médica

Grupo 791
Equipo 5 y 3

SARS-CoV-2
Coronavirus
(COVID-19)
Carolina Ramírez Morales
Fernando Ortiz Velázquez
Miriam Itsuri Calderón Castañeda
Elisa Sofía Galicia Arámburu
Historia

MERS-CoV 2019-nCoV
Nueva Jersey
Guangdong Wuhan

31/12 5-7/01
1937 1965 2002 2012
2019 2020

Inglaterra Arabia Saudí China

Bronquitis infecciosa (IBV) SARS-CoV Neumonía

Historia
Comisión de
Salud COVID-19
municipal de
Wuhan NIH Oxford

11-19/01 11/02 25/02 11/03 11/05 02/12

2020 2020 2020 2020 2020 2020

OMS OMS Vacunas

Exámenes de detección
Remdesivir
de síntomas
Reino Unido
EUA Reino Unido Rusia

China China India

Taxonomía
Dominio Riboviria

Reino Orthornavirae

Filo Pisuviricota

Clase Pisoniviricetes

Orden Nidovirales

Suborden Cornidovirineae

Familia Coronaviridae

Subfamilia Orthocoronavirinae

Género Betacoronavirus

Especie SARS-CoV-2
 Taxonomía
Géneros: Especies (IH): Afectados:
Mamíferos
Murciélagos
HCoV229E
Alfacoronavirus Roedores
HCoVNL63 Cerdos
Humanos
HCoVOC43 Murciélagos
HCoVHKU1 Mamíferos
Betacoronavirus
MERS-CoV Humanos
SARS-CoV Otros animales
SARS-CoV-2
Aves
Pollos
Gammacoronavirus
Pavos
Mamíferos
Aves
Pollos
Deltacoronavirus Pavos
Palomas
Patos
Epidemiología
 China
● 31 Diciembre 2019: 26 casos y un
fallecimiento de neumonía con
etiología desconocida.
● Origen → Mercado Huanan de
Wuhan.
● 10, 000 casos confirmados para
finales de enero.
● 17 febrero 2020: 72 436 casos en
las 31 provincias:
○ 42 752 en Wuhan, Hubei
○ 17 237 en otras ciudades de
Hubei
○ 12 447 en otras provincias

Distribución de casos confirmados de COVID-19 en China y en la provincia

de Hubei el 17 de febrero de 2020.
 Mundial
● 13 Enero 2020: Primer caso fuera de China,
en Tailandia.
● 21 de Enero 2020: Primer caso en E.U.
● Para el 5° mes:
○ 214 países
○ 3,935,828 casos confirmados
○ 274,655 defunciones
○ Tasa letalidad 6.9%
● Hacia el año (31-12-20):
○ 218 países
○ 83,260,611 casos confirmados
○ 1,816,120 defunciones

Distribución de casos confirmados de COVID-19 en

el mundo entre Abril-Mayo 2020
 México
● Primer caso: 27 de febrero de
2020.
● 64 días después:
○ 19,224 casos confirmados → 46
años edad promedio, mayor
incidencia en hombres.
○ 1,859 defunciones →
hipertensión, diabetes, obesidad
● 5° mes:
○ 31,522 casos confirmados
○ 3,160 defunciones
○ Mayor prevalencia CDMX, Edo. Casos confirmados en México durante el quinto
México, Baja California, Tabasco, mes de la pandemia.
Sinaloa y Veracruz
 Situación actual
Situación actual en México y el mundo

#18 #5
Estadísticas actuales de México
Distribución de casos confirmados por sexo

Gráfica 1. Distribución de casos confirmados por edad

Gráfica 2. Número de casos confirmados de coronavirus Gráfica 3. Número de defunciones a causa del coronavirus
por país por país

https://es.statista.com/estadisticas/1095779/numero-de-muert https://es.statista.com/estadisticas/1091192/paises-afectados-
es-causadas-por-el-coronavirus-de-wuhan-por-pais/ por-el-coronavirus-de-wuhan-segun-los-casos-confirmados/
 Estructura
- Forma esférica/irregular
- 100-160 nm
- Envuelto
- RNA de cadena sencilla, polaridad positiva
- Grupo IV en la clasificación de Baltimore
- 4 proteínas estructurales: spike (S), E
(envoltura), M (membrana) y N (nucleocápside)
- 16 proteínas no estructurales (NSP) y proteínas
accesorias
Genoma
 Proteínas
estructurales
Proteína S (spike) Proteína E (envoltura)

- Le da al virión la apariencia de una corona. - Compuesta por 76 aminoácidos.

- Compuesta de dos subunidades: S1 y S2. - Viroporina → Formación de poros, aumenta
- Interviene en la unión al receptor ACE2 y la permeabilidad de la célula.
facilita su fusión con la membrana celular. - Necesaria para el ensamblaje, gemación,
formación de la envoltura y apoptosis.
 Proteínas
estructurales
Proteína M (membrana) Proteína N (nucleocápside)
- La más abundante. - La única presente en la nucleocápside.
- Posee triple dominio transmembrana. - Participa en la replicación del material
- Proporciona andamio a partículas virales, genético del virus y en su
estabiliza la proteína N y el núcleo interno empaquetamiento → complejo RNP
de viriones. ribonucleoproteína.
- Necesaria para la retención e incorporación - Promueve la inflamación, disminuye la
de la proteína Spike. respuesta inmune e interfiere en el ciclo
celular.
Proteínas no estructurales
Mecanismo de replicación

1. Unión del virus a la célula

hospedera y entrada
2. Traducción del genoma
viral
3. Transcripción y replicación
del genoma viral
4. Traducción de proteínas
estructurales
5. Ensamblaje y liberación
del virión
1. Unión del virus a la célula hospedera y entrada
2. Traducción del genoma viral y
3. Transcripción y replicación
4. Traducción de proteínas estructurales y
5. Ensamblaje y liberación del virión
Video del ciclo de replicación

https://www.youtube.com/watch?v=AtOxB9UKfRA
Transmisión
- Incubación de 1-14 días
Los coronavirus humanos pueden
permanecer activos en objetos hasta 9 días.
A temperaturas ≥ 30ºC la supervivencia es
más corta.

https://www.semes.org/wp-content/uploads/2020/05/P%C3%ADldora-7-Inc
ubaci%C3%B3n-y-transmisi%C3%B3n_JGC.pdf
 Patogénesis
Vía de entrada Pueden o no haber síntomas,
- A través del tracto desde la ausencia hasta la
respiratorio gravedad de ellos

Característica genómica
- Optimización de la unión
de su proteína espiga al
receptor humano enzima
convertidora de
angiotensina 2 (ECA2)

“Presencia de SARS-COV-2 en semen de hombres con COVID-19: revisión sistemática”

http://www.scielo.org.pe/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1727-558X2021000400012
Patogénesis

ECA2: Enzima convertidora de angiotensina II

- Péptido ubicuo, encontrado en la superficie de
células epiteliales del alvéolo pulmonar, células
del endotelio vascular y en el epitelio vascular
- Función principal en mantener el equilibrio entre
los efectos vasoconstrictores, proinflamatorios,
proliferativos, mediante la degradación de
angiotensina II

SARS-CoV-2 y ECA2
- Desregulación de angiotensina II → potencial
inflamatorio a nivel pulmonar
 Patogénesis

Inflamación sistémica Factores de riesgo

Daño alveolar difuso, - Hipertensión, problemas
insuficiencia orgánica Complicaciones que se cardiovasculares, diabetes, edad
múltiple, vasoconstricción derivan: avanzada, obesidad,
y permeabilidad vascular Miocarditis, enfermedad enfermedades pulmonares
aumentada tromboembólica, crónicas (asma), inmunodepresión
hipercitoquinemia y
complicaciones renales
 Primeras barreras de defensa
Patrones moleculares asociados a
patógenos (PAMPs) Reconocidos por receptores de
RNA del genoma viral, complejos de reconocimiento de patrones (PRRs)
RNA bicatenario formados con el - Principalmente receptores tipo toll
intermediario de replicación (-) y los (TLR) → TLR3, TLR7, TLR8 y
RNAs de polaridad (+) TLR9 -presentes en el endosoma-

Factor de regulador del interferón 3

(IRF3) y factor regulador del interferón 7 Activación de vías de señalización y de
(IRF7): factores de transcripción
son capaces de suprimir la replicación y - Factor nuclear kappa y proteína
diseminación viral en etapas tempranas y, activadora (AP-1) → codifican al TNF,
además, inducir una respuesta inmune citoquinas (IL-1, IL-6 e IL-12) y
adaptativa efectiva quimioquinas (CCL2 y CXCL8)
¡inflamación!
Curso de la enfermedad
FASES
I → Infección inicia en la mucosa del tracto respiratorio,
donde el virus se replica y ocurre la viremia (síntomas
como tos seca, fiebre, a veces vómitos y diarrea).

II → Llega la infección a pulmón, hay tos y fiebre,

puede darse un curso de neumonía. Linfopenia
acentuada. Aquí la infección puede tomar dos cursos:
eliminación del virus y desaparición de síntomas o
puede entrar a un estado crítico.
_________________________________________________
III → Extrema dificultad respiratoria, cuadro
respiratorio inflamatorio sistémico, se puede llegar a un
choque séptico, se elevan los marcadores de
inflamación.
Síntomas. Cuadro clínico
Neumonía → Fiebre, tos, disnea y
opacidades pulmonares bilaterales en
radiología de tórax

Linfopenia → debido a la infección y

destrucción de linfocitos T por el virus.

Síndrome de distrés respiratorio

agudo (SDRA) → la inflamación
alveolar, alteración de la transferencia
alveolar de O2

https://www.elsevier.es/es-revista-revista-medica-clinica-las-condes-202-articulo-cuadro-c
linico-del-covid-19-S0716864020300912
Caso clínico

Secuencia temporal de eventos clínicos en caso de presentación crítica de COVID-19 y embarazo

https://www.elsevier.es/es-revista-revista-medica-clinica-las-condes-202-articulo-covid-19-y-emba
razo-caso-clinico-S0716864021000018
 Cuadro clínico
A) Se observan áreas de relleno alveolar
bilaterales, con pérdida de volumen, que
predominan en el tercio inferior de ambos
pulmones. B) Progresión de las áreas de
relleno alveolar bilaterales en comparación
imagen A.

Imágenes de angiografía TAC de tórax (C-F).

C-E) Ambos pulmones con áreas en vidrio
esmerilado (“glass ground”) características,
asociadas a imágenes de empedrado (“crazy
paving”) y engrosamiento intersticial bilateral
que predominan en tercio medio e inferior y
bases de ambos pulmones, asociadas a
perdida de volumen. F) Imagen de mediastino,
no hay evidencia de TEP. Se observan rellenos
vasculares redondeados normales de la
vasculatura pulmonar.
 Diagnóstico
PCR 97% 80% Pruebas de Ag
Amplificación de Es una prueba rápida
fragmentos de ADN donde se identifica la
mediante ciclos presencia de
consecutivos. proteínas virales que
son producidas por el
virus.

Pruebas de Abs
Está basada en la 95%
detección de
anticuerpos del tipo
IgM e IgG y algunas
IgA
 PCR
Protocolo de Berlin

1. Se le coloca la
muestra de cDNA
2. DNA polimerasa
3. PRIMER´s
4. Deoxinucleotidos
trifosfato
5. PCR Buffer
6. SYBR GREEN

N=No*E^n
Prueba de Abs
Prueba de Ag
Variantes Nomenclatura
de la OMS
Linaje
Pango
Identificada Estado
actual
Fecha de
designación
Mutación

del Alfa B.1.1.7 Reino Unido VBM 21/Sep/21 N501Y

SARS-CoV-2 Beta B.1.351 Sudáfrica VBM 21/Sep/21 E484K

Gamma P.1 Brasil VBM 21/Sep/21 E484K

Delta B.1.617.2 India VBM 14/Abril/21 L452R*

Grupo interagencial por SARS-CoV-2

(SIG)
Epsilon B.1.43 California VBM 21/Sep/21 L452R*
● VOI- Variante de interés
● VOC- Variante de Eta B.1.52 Nigeria VBM 21/Sep/21 E484K
preocupación
● VOHC- Variante de gran
consecuencia Lota B.1.53 2021 VBM 21/Sep/21 S
● VBM- Variante bajo
monitoreo Kappa B.1.617.1 India VBM 21/Sep/21 L452R*
E484Q*

ómicron B.1.1.529 Sudáfrica VOC 26/Nov/21 RBD

Zeta P.2 Brasil VBM 21/Sep/21 E484K

Mu B.1.621 Colombia VBM 21/Sep/21 E484K

 Tratamiento
Terapia antiviral: Terapia con Abs Corticosteroides
monoclonales
-Remdesivir (v.i.)
Atención de apoyo -Molnupiravir -Sotrovimab
- Paxlovid (nirmatrelvir + ritonavir)
 Mecanismo de acción. Antivirales
Remdesivir Molnupiravir Paxlovid
Inhibe la polimerasa del ARN viral. Agente mutagénico para el virus, Nirmatrelvir: inhibe la proteasa
introduciendo mutaciones en su principal para su replicación.
ARN durante la replicación. Ritonavir: inhibe el citocromo P450
y potenciador farmacocinético.
 Mecanismo de acción. Abs
Sotrovimab
Es un anticuerpo monoclonal (mAb) IgG1 humanizado que se une a un epítopo altamente
conservado en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína de la espícula del
SARS-CoV-2.
Al hacerlo, impide que el virus se adhiera y entre en las células del huésped, lo que
bloquea su capacidad de replicación y propagación.
 Efectos adversos y contraindicaciones
Paxlovid Molnupiravir Remdesivir Sotrovimab

Efectos adversos Disgeusia Diarrea Náusea, hematomas en la Fiebre, dificultad para

Diarrea Náuseas piel, dolor o hinchazón respirar, cambios en el
Vómitos Mareos cerca del lugar donde le ritmo cardíaco,
inyectaron la vacuna. cansancio, debilidad o
confusión.

Contraindicaciones Hipersensibilidad, Hipersensibilidad a los Hipersensibilidad a los Pacientes con

insuficiencia hepática componentes, embarazo, componentes. antecedentes de
o renal grave. lactancia, menores de 18 anafilaxia al
Administración con años, pacientes con sotrovimab o a
medicamentos que insuficiencia renal y cualquiera de los
dependen de CYP3A hepática. No se excipientes de la
para su eliminación. recomienda en edades formulación.
reproductivas a menos
que usen un método
anticonceptivo eficaz.
Profilaxis
Vacunas
Vacunas de ARNm:
1 Pfizer-BioNTech y Moderna

2 Vacunas de vector viral:

Janssen de Johnson & Johnson, AstraZeneca y Sputnik V

Vacunas de subunidades proteicas:

3 Novavax

Vacunas de virus inactivado:

4 Sinovac y Sinopharm
Vacunas de ARNm
Las células musculares producen la proteína de la espícula que se encuentra en
el virus del COVID-19. El sistema inmunitario reconoce esta proteína y
comienza a producir anticuerpos.
Vacunas de vector viral
Utilizan un virus inofensivo (vector) para transportar información genética del virus
del COVID-19 a las células del cuerpo. Esto también desencadena una respuesta
inmunitaria.
Vacunas de subunidades proteicas
Contienen proteínas o fragmentos de proteínas del virus que desencadenan
una respuesta inmunitaria.
Vacunas de virus inactivado
Utilizan un virus previamente inactivado o atenuado, no provoca la enfermedad,
pero sí genera una respuesta inmunitaria.
Efectividad
Efectos
secundarios
Refuerzos

-Mejoran la inmunidad, por las variantes, protección prolongada, protección de

grupos de alto riesgo.
 Referencias
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-para-el
Pastrian-Soto, Gabriel. (2020). Bases Genéticas y Moleculares del COVID-19 (SARS-CoV-2). Mecanismos de Patogénesis y de Respuesta Inmune.
International journal of odontostomatology, 14(3), 331-337. https://dx.doi.org/10.4067/S0718-381X2020000300331
Cuestionario
1. ¿Por qué se dice que el RNAm del virus es estructuralmente parecido al RNAm de la
célula hospedera?
2. ¿Cuál es la función del complejo viral replicasa?
3. ¿Cuál es la función de la enzima convertidora de angiotensina II (ECA2) en el organismo?
4. ¿Cuál es la diferencia entre las vacunas de ARN mensajero y las de vector viral?
5. ¿A qué clase según la clasificación de Baltimore pertenece este virus?
GRACIAS