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    Genomica Funcional

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    ISAAC JORDY LLIVISUPA BRAVO
    Este documento describe los métodos utilizados para identificar la funcionalidad genómica del arroz, incluida la genómica funcional, la secuenciación del genoma del arroz y el análisis de la información para comprender la estructura, funcionalidad y evolución del genoma del arroz. También explica los métodos de mutagénesis, como agentes biológicos, físicos y químicos, que han sido cruciales para descubrir y estudiar las funciones de los genes.

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    ISAAC JORDY LLIVISUPA BRAVO
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    Este documento describe los métodos utilizados para identificar la funcionalidad genómica del arroz, incluida la genómica funcional, la secuenciación del genoma del arroz y el análisis de la información para comprender la estructura, funcionalidad y evolución del genoma del arroz. También explica los métodos de mutagénesis, como agentes biológicos, físicos y químicos, que han sido cruciales para descubrir y estudiar las funciones de los genes.

    Descripción original:

    TAREA DE GENOMICA

    Título original

    genomica funcional

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    Este documento describe los métodos utilizados para identificar la funcionalidad genómica del arroz, incluida la genómica funcional, la secuenciación del genoma del arroz y el análisis de la información para comprender la estructura, funcionalidad y evolución del genoma del arroz. También explica los métodos de mutagénesis, como agentes biológicos, físicos y químicos, que han sido cruciales para descubrir y estudiar las funciones de los genes.

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    Genomica Funcional

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    ISAAC JORDY LLIVISUPA BRAVO
    Este documento describe los métodos utilizados para identificar la funcionalidad genómica del arroz, incluida la genómica funcional, la secuenciación del genoma del arroz y el análisis de la información para comprender la estructura, funcionalidad y evolución del genoma del arroz. También explica los métodos de mutagénesis, como agentes biológicos, físicos y químicos, que han sido cruciales para descubrir y estudiar las funciones de los genes.

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    UNIVERSIDAD ESTATAL DE
    MILAGRO

    Career: Biotechnology Engineering

    Semester: 5th semester

    Subject: structural and functional


    genomics

    Teacher: Luis Eduardo Cagua Montaño

    Student: Sully Dayana Calderón


    Barreiro

    Topic: " functional genomic


    composition"

    June 24, 2021


    Introduction

    Technology advances by leaps and bounds over time, so does biotechnology. With the
    growing environmental damage, the living conditions of mass consumption crops have
    been greatly affected, which is why several genetic methods have been developed to
    improve the quality of the products.

    There are a large number of plant species whose complete gene sequence is known,
    this allows the development of new varieties resistant to the different environmental
    factors that affect crops. Genomics encompasses all the knowledge and studies on the
    genome and its applications in useful techniques for the development of new species.
    Functional genomics refers to all the information about the functions that each gene
    performs and this is very useful when developing new species based on an already
    existing one.

    Functional genomics

    La genómica funcional se encarga de recolectar de manera sistemática de toda


    información sobre las funciones de los genes, por medio de aproximaciones
    experimentales de uso global para evaluar la función de los genes usando información
    y elementos de genómica estructural. Se conoce principalmente porque combina
    métodos experimentales con estudios computacionales de la información y resultados
    obtenidos en la secuenciación del genoma.

    Con la genómica funcional se tiene como objetivo esa falta de conocimiento existente
    sobre la secuencia de un gen y sus funciones, para así manifestar cómo se comportan
    los sistemas biológicos. (Guevara S.E. 2006).

    Methods used to identify the genomic functionality of rice

    Los avances de la bioinformática y la tecnología de secuenciación lograron dar a


    conocer los antecedentes genómicos de arroz y sobre las variaciones genómicas de
    miles de cultivares. Con los análisis de esta información se puede obtener
    conocimientos de la estructura, funcionalidad y la evolución del genoma del arroz y a
    su vez permite desarrollar nuevas variedades de arroz por medio de técnicas de
    mejoramiento molecular. (Duitama, J., Silva, A., Sanabria, Y., Cruz, DF, Quintero, C.,
    Ballen, C., Lorieux, M., Scheffler, B., Farmer, A., Torres, E., Oard , J. y Tohme, J. 2015).

    El arroz es uno de los productos alimenticios más importantes alrededor del mundo. La
    planta de arroz también sirve como modelo en biología molecular y en genética ya que
    su genoma es de un pequeño tamaño, por la disponibilidad de su secuencia completa,
    la facilidad de transformación y de regeneración, y la variedad de mutantes. En 2004
    se descubrió la secuencia completa del genoma del arroz, y desde entonces se utiliza
    genómica funcional para identificar las funciones de los aproximadamente 50.000
    genes. (Serrat, X., Esteban, R., Guibourt, N., Moysset, L., Nogués, S. y Lalanne, E.
    2014).

    Mutagenesis

    La mutagénesis ha sido un proceso crucial para el descubrimiento y estudio de las


    funciones génicas. Estas mutantes se pueden desarrollar de forma natural o en
    laboratorios. (Marsch M.N., Zuñiga M.V., Reyes O.J., Salazar M.O., Stefan F. 2009).

    Existen 3 formas para provocar mutaciones, las cuales pueden ser mediante el uso de:

    1) Agentes biológicos (transposones y T-DNA)


    2) Agentes físicos (neutrones rápidos, radiación ultravioleta y rayos X)
    3) Agentes químicos (N -metil-N-nitrosourea (MNU), 1,2: 3,4-diepoxibutano (DEB)
    o metanosulfonato de etilo (EMS))

    Gracias a las técnicas de mutagénesis disponibles actualmente, se puede disminuir


    grandemente los procesos de reproducción y también ayuda a disminuir varios
    problemas agronómicos y ambientales. (Serrat, X., Esteban, R., Guibourt, N., Moysset,
    L., Nogués, S. y Lalanne, E. 2014).

    Conclution

    Con la información recolectada en este documento, puedo concluir que tener


    conocimiento de la función de los genes es importante para realizar estudios sobre la
    especie y para el desarrollo de nuevas especies mediante métodos de edición genética.
    Se espera que conforme continúe avanzando la tecnología, se tenga acceso a más
    secuencias de genomas completas, y esto a su vez ampliar las posibilidades de estudio
    y experimentación con los genes de distintas especies.

    Bibliographic references

    1. Guevara S.E. (2006). Genomics and functional genomics in microbiology.


    Medigraphic Artemisa.
    2. Duitama, J., Silva, A., Sanabria, Y., Cruz, DF, Quintero, C., Ballen, C., Lorieux, M.,
    Scheffler, B., Farmer, A., Torres, E., Oard, J. y Tohme, J. (2015). Whole Genome
    Sequencing of Elite Rice Cultivars as a Comprehensive Information Resource for
    Marker-Assisted Selection.
    3. Serrat, X., Esteban, R., Guibourt, N., Moysset, L., Nogués, S. y Lalanne, E. (2014).
    EMS Mutagenesis in Seed-Derived Mature Rice Calli as a New Method for Rapidly
    Obtaining TILLING Mutant Populations.
    4. Marsch M.N., Zuñiga M.V., Reyes O.J., Salazar M.O., Stefan F. (2009). Functional
    Genomics of Plants: Study of the Development of Flowers and Fruits

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