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Cómo citar: Cuello Navarro, J., Barraza Peña, C. & Escorcia-Gutierrez, J. (2020). Una revisión de los métodos de deep learning
aplicados a la detección automatizada de la retinopatía diabética. Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
Resumen
La retinopatía diabética (RD) es una enfermedad ocular caracterizada por cambios anormales a nivel de la retina, que
se manifiesta con gran frecuencia en personas que padecen diabetes mellitus. El debido seguimiento y tratamiento
puede evitar que la enfermedad afecte gravemente al paciente, sin embargo, debido a la necesidad de contar con
profesional especializado y lo costoso del proceso, puede resultar difícil realizar diagnósticos periódicamente,
corriendo el riesgo de presentar ceguera. Para contribuir a la solución de dicho problema, se han visto en los últimos
años trabajos que emplean tecnología de inteligencia artificial, más precisamente aplicando técnicas de Deep
Learning (DL) para el reconocimiento automatizado de los síntomas de la RD presentes en la retina. En este artículo
se plantean las bases para la detección de la RD, así como las técnicas DL utilizadas por diversos investigadores para
su diagnóstico automatizado y el desempeño de dichos sistemas en este ámbito.
Keywords: Convolutional neural networks; Diabetic retinopathy; Diagnosis; Image classification; Medical image
análisis.
Esta obra está bajo una Licencia Creative Commons Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional.
Revista SEXTANTE, 23, pp. 12 – 27, 2020. ISSN Printed 1909-4337, ISSN Online 2665-3923
Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
visión. (Giancardo et al., 2011, 2012; Rudas & Neovascularización: también llamada isquemia
Torres, 2013) retiniana, ocurre cuando el cierre de los vasos
sanguíneos retinianos genera que el suministro de
Según Mayo Clinic (2018) cualquier persona con oxígeno, que llega a las regiones retinianas, sea
diabetes tipo 1 o 2 puede padecer este trastorno. limitado. (Kowluru & Chan, 2008)
Cuanto más tiempo lleve la persona con diabetes y
cuanto menos se haya controlado el azúcar en la El crecimiento del endotelio vascular intenta
sangre, mayor es la probabilidad de presentar esta compensar la disminución del suministro de
complicación en los ojos. Esta afirmación es oxígeno, lo que da como resultado la formación de
soportada por Ishtiaq et al. (2020) cuando explica la pequeños vasos sanguíneos débiles en la superficie
forma en la que se desarrolla la retinopatía diabética de la retina, lo que conduce a la pérdida de la visión.
en el ojo humano, esto es como sigue, la sangre es (Badar et al., 2020)
transportada a las capas del tejido retiniano por
micro vasos sanguíneos que requieren un nivel de Hemorragias: son producto del colapso de los
azúcar en sangre mantenido y un flujo sanguíneo sin microaneurismas y son visualmente apreciables
obstrucciones. Si una gran cantidad de azúcares, como manchas de sangre sobre la superficie de la
como glucosa o fructosa, se acumulan en la sangre, retina, de tamaño muy superior a las de los
estos vasos sanguíneos comienzan a descomponerse microaneurismas. (Rudas & Torres, 2013)
debido a la distribución inadecuada de oxígeno a las
células. Las anomalías estructurales (ver Figura 2) Exudados duros: son objetos de color amarillo
ocurren como resultado de la disminución de la tasa brillante o blanco en la retina. Estos objetos tienen
metabólica que conduce a la RD. una apariencia cerosa y bordes afilados contra el
fondo de los vasos sanguíneos. Los exudados duros
Los principales síntomas y patologías de la RD se desarrollan debido a la pérdida de sangre de las
incluyen: venas y los exudados tienen forma circular
alrededor de los vasos. (Salamat et al., 2019)
Microaneurismas: son deformaciones en las
paredes de los vasos sanguíneos. (Mookiah et al., Exudados suaves: también llamados manchas de
2013). Son difíciles de detectar con la oftalmoscopia algodón, son infartos de la capa de fibras nerviosas;
convencional si no se tiene experiencia, pero tienen un aspecto más blanquecino. (Mittal &
aparecen como pequeñas manchas rojas con limites Rajam, 2020
nítidos. (Jimenez, 2014)
a)
b)
c)
Figura 2. (a) Imagen de la retina con sus patologías. (b) Hemorragias. (c) Exudados duros.
(d) Exudados suaves.
Fuente: Tomado de (Badar et al., 2020)
4
Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
a) b) c) d)
e)
Figura 3. Imágenes típicas de fondo de retina: (a) Normal, (b) Fase media NPRD, (c) Fase moderada NPRD, (d) Fase severa
NPRD, (e) Retinopatía diabética proliferativa.
Fuente: Tomadas de conjunto de imágenes APTOS 2019 Blindness Detection.
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Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
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Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
Un ejemplo del modelo de una estructura de Kaggle DR Dataset: esta base de datos es
CNN aplicada a las imágenes de fondo de ojo se proporcionada por EyePACS, (n.d.) para colaborar
puede observar en la Figura 4. en la investigación y desarrollo de trabajos
relacionados a la detección y diagnóstico de la RD.
3. Conjuntos de datos de imágenes oculares En total posee 88,702 imágenes, de las cuales
(Datasets) 35,126 son para tareas de entrenamiento y 53,576
son para tareas de pruebas. El enlace para acceder a
En esta sección se mostrará un benchmarking de este dataset es: https://www.kaggle.com/c/diabetic-
los conjuntos de datos de mayor uso en las retinopathy-detection/data
investigaciones y trabajos relacionados a la
detección de la RD por medio de técnicas de DL, DIARETDB0: consiste en 130 imágenes de
junto con una breve descripción característica de fondo de ojo, de las cuales 110 presentan signos de
cada una de las bases de imágenes oculares que se RD y 20 son de ojos sanos. En esta base de datos las
mencionarán. imágenes que pertenecen al grupo de RD contienen
la etiqueta de los signos que presentan, es decir,
ROC (Retinopathy Online Challenge): contiene exudados, microaneurismas, hemorragias y
100 imágenes digitales a color de fondo de ojo con neovascularización. (Tomi Kauppi et al., n.d.) El
microaneurismas en todas las imágenes. Estas enlace para acceder a ella es:
imágenes se encuentran aleatoriamente distribuidas https://www.it.lut.fi/project/imageret/diaretdb0/
y se dividen en 50 imágenes para entrenamiento de
la red y 50 imágenes para pruebas. (Niemeijer et al., DIARETDB1: la base de datos consta de 89
2010) El enlace para acceder a esta base de datos de imágenes de fondo de ojo en color, de las cuales 84
imágenes es http://webeye.ophth.uiowa.edu/ROC/ contienen al menos signos no proliferativos leves
(microaneurismas) de la retinopatía diabética, y 5 se
E-Ophta: este conjunto de datos se divide en 2 consideran normales: que no contienen ningún
categorías: una llamada E-Ophta MA y la otra E- signo de la retinopatía diabética según todos los
Ophta EX. E-Ophta MA posee 148 imágenes con expertos que participaron en la evaluación. Las
microaneurismas y pequeñas hemorragias, y 233 imágenes se capturaron utilizando una cámara de
imágenes sin lesiones; en cambio E-Ophta EX posee fondo de ojo digital con campo de visión de 50
un conjunto de 47 imágenes de fondo de ojo con una grados con diferentes configuraciones de imagen.
segmentación de exudados y 35 imágenes sin Los datos corresponden a una situación práctica
ningún tipo de lesión y que se encuentran buena (no necesariamente típica), donde las
etiquetadas como imágenes normales. (E. imágenes son comparables y pueden usarse para
Decencière et al., 2013) El enlace para acceder a evaluar el desempeño general de los métodos de
este dataset es: http://www.adcis.net/en/third- diagnóstico. (T Kauppi et al., n.d.) El enlace para ir
party/e-ophtha/ a esta base de datos es:
https://www.it.lut.fi/project/imageret/diaretdb1/
Messidor: consta de 1.200 imágenes numéricas Estas métricas de rendimiento son: (ver Tabla 2).
de color de fondo de ojo. Las imágenes se Donde:
capturaron utilizando 8 bits por plano de color a
1440*960, 2240*1488 o 2304*1536 píxeles. Posee TP = Positivos verdaderos (número de píxeles del
800 imágenes con dilatación pupilar (una gota de vaso correctamente clasificados).
tropicamida al 0,5%) y 400 sin dilatación. Todo el TN = Negativo verdadero (número de píxeles de
conjunto de imágenes se encuentra empaquetado en fondo correctamente clasificados)
3 juegos. Cada conjunto está dividido en 4
subconjuntos comprimidos que contienen 100 FP = Falsos positivos (número de píxeles de fondo
imágenes en formato TIFF y un archivo Excel con clasificados incorrectamente).
diagnósticos médicos para cada imagen. (Etienne FN = Falsos negativos (número de píxeles del vaso
Decencière et al., 2014). El enlace de esta base de incorrectamente clasificados).
datos es el siguiente: http://www.adcis.net/en/third-
party/messidor/ 𝑝𝑜 = Probabilidad de acuerdo o clasificación
correcta entre los calificadores.
DRIVE: la base de datos DRIVE se ha 𝑝𝑒 = Probabilidad de acuerdo de azar entre los
establecido para permitir estudios comparativos calificadores.
sobre la segmentación de los vasos sanguíneos en
las imágenes de la retina. Consta de 40 fotografías, 5. Extracción de características y métodos de DL
de las cuales 33 no presentan ningún tipo de RD y 7 como herramienta para el diagnóstico
muestran signos de RD temprana leve. La automatizado de la RD
resolución de las imágenes es de 768*584 píxeles.
En este conjunto de datos 20 imágenes son de De acuerdo a la investigación ejecutada por
entrenamiento y la misma cantidad para pruebas. Randive et al. (2019), para clasificar la RD, cada
(Aggarwal & Khare, 2015). El enlace para acceder imagen del fondo digital está representada por un
a ella es: https://drive.grand-challenge.org/DRIVE/ vector de características visuales llamado Firma. Se
encuentra que los microaneurismas, las
STARE: consta de 400 imágenes. Estas poseen hemorragias, los exudados y las anomalidades
anotaciones de expertos según las características microvasculares intraretinianas aparecen con varios
visibles de cada imagen, las cuales se encuentran vectores significativos de características visuales o
tabuladas en archivos de texto. El enlace para Firmas como son el tamaño, la forma, el color, la
acceder a esta base de datos es el siguiente: intensidad, la textura, la densidad de vasos
https://cecas.clemson.edu/~ahoover/stare/ sanguíneos, el contraste, entre otros.
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Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
Chetoui & Akhloufi, (2020) desarrollaron un fueron sensibilidad de 94% y una especificidad del
algoritmo de DL capaz de detectar signos de RD en 96%.
imágenes del fondo de ojo de la retina. Utilizan los
conjuntos de datos EyePACS, MESSIDOR, Auccahuasi et al. (2020) presentan una
MESSIDOR-2, DIARETDB0, DIARETDB1, metodología para poder reconocer los exudados
STARE, IDRID, E-ophtha y UoA-DR y más de duros, que es la primera manifestación de la
90.000 imágenes para evaluar la eficiencia del retinopatía diabética. Auccahuasi et al. describe una
algoritmo. Además, implementaron un algoritmo de nueva alternativa para el reconocimiento automático
explicabilidad basado en el mapeo de activación de de exudados duros en las imágenes de la retina. Por
clases ponderado por gradiente para mostrar medio de una CNN se trabaja con un conjunto de
visualmente los signos seleccionados por el modelo, datos compuesto por 906 imágenes de exudados
para clasificar las imágenes de la retina como duros y 1.068 imágenes que no corresponden a
positivos para RD. Los resultados obtenidos fueron: exudados duros, que se entrena con un grupo de 400
área bajo la curva (AUC) de 0,986, sensibilidad de imágenes, con una prevalencia de 0,5 con respecto
0,958 y especificidad de 0,971 para EyePACS. Para a la presencia de exudados duros.
MESSIDOR, MESSIDOR-2, DIARETDB0,
DIARETDB1, STARE, IDRID, E-ophtha y UoA- Después de esto se hacen dos comprobaciones al
DR, el AUC es 0.963, 0.979, 0.986, 0.988, 0.964, clasificador, utilizando grupos de imágenes
0.957, 0.984 y 0.990, respectivamente. similares, como el grupo de pruebas y validación,
obteniendo valores de sensibilidad de 0,92% en
Gangwar & Ravi, (2021) exponen un trabajo en ambos casos y valores de especificidad de 0,92% y
el que proponen un hibrido de DL para la detección 0,93% para los grupos de imágenes de prueba y
automática de la RD. Este híbrido se compone de un validación, respectivamente. Se realizaron
bloque personalizado de capas CNN sobre el mediciones adicionales para calcular el Valor
modelo de aprendizaje por transferencia de Predictivo Positivo y el Valor Predictivo Negativo,
Inception-ResNet-v2 previamente entrenado. obteniéndose valores de 0,9207% para el grupo de
Usaron el conjunto de datos MESSIDOR y APTOS imágenes de prueba y 0,93% para el grupo de
2019 (conjunto de datos de Kaggle). Lograron una imágenes de validación. En el caso del Valor
precisión de prueba del 72,33% y el 82,18% en el Predictivo Negativo se obtuvieron valores de
conjunto de datos MESSIDOR y APTOS, 0,9292% para el grupo de imágenes de prueba y
respectivamente. 0,93% para el grupo de imágenes de validación.
Guisela & Pozo, (2019) sugieren analizar e Moreira et al. (2020) formulan el desarrollo de
implementar modelos de redes neuronales CNNs para detectar la RD, y el impacto de la
artificiales supervisadas para la detección de resolución y la red de imágenes en la precisión de la
estructuras vasculares retinianas de fondo de ojo. predicción. Obtiene unos resultados de un área de
Aplicaron una red convolucional basada en la 0,93 bajo la curva característica operativa del
arquitectura U-Net, con ventanas de imagen de 16 x receptor al aumentar la resolución de la arquitectura
16 píxeles. La red convolucional estaba compuesta Inception-V3.
por cuatro capas convolucionales y tres capas
deconvolucionales. Obtuvieron unos resultados de Samper et al. (2020) presentan una metodología
sensibilidad del 74,20%, una especificidad del para la detección y segmentación del disco óptico y
90,70% y una exactitud del 88,22%. los vasos sanguíneos en imágenes de fondo de ojo
de pacientes con RD. Hace uso del conjunto de datos
Merino Hernandez et al. (2019) desarrollaron un DRIVE y logra una precisión (Acc) de 95% y una
algoritmo innovador basado en métodos avanzados especificidad (Sp) de 98% para la segmentación de
de clasificación (Deep Learning y Support Vector los vasos sanguíneos y una precisión de 94,6% y
Machine) que identifica automáticamente las 97.8% en especificidad para la segmentación del
imágenes patológicas de forma eficaz y segura. El disco óptico.
software discrimina automáticamente retinografías
normales y patológicas. Los resultados obtenidos
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Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
Los trabajos mostrados con anterioridad son Las técnicas de Deep Learning han demostrado
muestra del extenso desarrollo e investigación que tener el potencial suficiente para desempeñar
presenta en la actualidad la ciencia de la inteligencia labores que requieran del análisis y procesamiento
artificial (IA) y su rama conocida como aprendizaje de imágenes, en este caso dirigido a un campo de la
profundo (DL, por sus siglas en inglés) aplicada a la medicina como lo es el diagnóstico temprano de la
detección automatizada de la RD. Se observa que enfermedad ocular conocida como Retinopatía
muchos son los investigadores que han logrado Diabética en base a los diversos síntomas que se
exitosos resultados en el proceso de segmentación manifiestan a nivel de la retina. De la misma manera
de las estructuras oculares, detección de anomalías resulta muy viable la utilización de esta novedosa
y patologías presentes en las imágenes de fondo de tecnología en otras áreas de trabajo, sin limitarse
ojo, e incluso han logrado establecer algoritmos los únicamente al campo médico, pudiendo adaptarse
cuales, de forma automática y con unas altas según el objeto de estudio que se tenga.
métricas de rendimiento, logran establecer el grado
de RD que puede presentar un paciente, posterior a Aun así, por más completa que pueda parecer
estos haber sido entrenados con diferentes conjuntos estar, el Deep Learning no ha sido explotado en su
de datos de imágenes oculares mostrados en la totalidad, siendo que existen innumerables
Sección 3. posibilidades para su uso y que, con el correr de los
años y a medida que se estudien las múltiples
Pero el punto de discusión aquí es sobre la funcionalidades que puede brindar, surgirán
comparativa y la forma de interpretar los diferentes modelos capaces de procesar situaciones de
métodos expuestos. Como bien se expresó por los naturaleza más compleja, llegando a contribuir en
autores, los métodos y algoritmos desarrollados en gran medida a las labores de los profesionales en lo
los diferentes estudios e investigaciones fueron que a tiempo, costo y precisión se refiere.
entrenados y probados usando conjuntos de datos
diferentes, las métricas de rendimiento arrojan En lo que respecta al impacto social que puede
resultados con base en esos conjuntos de datos, y generar, es cuestión de familiarizar a los
como bien se sabe, existen conjuntos de datos que profesionales con este tipo de métodos, siendo muy
poseen 30 - 40 imágenes, como es el caso de importante darles a conocer los grandes beneficios
DRIVE, la cual cuenta con 40 imágenes, mientras que presentan los sistemas desarrollados, ya que, en
que existen otros que poseen 400 y más imágenes, el caso de la detección de una enfermedad tan
como Messidor, que posee 1.200. Además existen perjudicial como lo es la Retinopatía Diabética, es
trabajos que no usan todas las métricas de muy importante el impacto que puede generar la
rendimiento al momento de dar sus resultados, implementación de dichos sistemas, permitiendo a
como por ejemplo: el caso de Abràmoff et al. más personas acceder a un diagnóstico confiable y
(2016), el cual en sus resultados brinda la más rápido por un costo más reducido, incremento
especificidad, la sensibilidad, el área bajo la curva y considerable de la cantidad de pacientes
el valor predictivo negativo. Mientras que el trabajo diagnosticados de manera oportuna, lograr evitar
realizado por Saranya Rubini et al. (2019) solo numerosos casos de ceguera y, en consecuente, una
brinda el valor referente a la precisión en la mejoría en la calidad de vida de la población.
detección. Todos estos son agentes que dificultan la
comparativa de resultados, ya que se deben analizar
muchos más factores para poder establecer cuál
trabajo es considerablemente mejor que el otro en
términos de eficiencia y eficacia, de acuerdo con los
números arrojados por las métricas de rendimiento
que brindan los autores en sus producciones.
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Cuello Navarro et al. (2020). Revista Sextante, 23, pp. 12 - 27, 2020.
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